Modelos compartimentales

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  • MODELOS COMPARTIMENTALES

    MODELACIN MATEMTICA

    Universidad Nacional de Colombia

    Facultad de Ingeniera

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Muchos fenmenos fsicos como la dispersin de un frmaco en el organismo, la

    propagacin de una enfermedad o la cintica de una reaccin qumica, entre otros,

    pueden ser modelados empleando estructuras compartimentales.

    Estos modelos se caracterizan porque el fenmenos se descompone en partes o

    compartimientos, los cuales interactan entre s a travs de procesos de

    intercambio o flujo. El flujo puede ser un intercambio de partculas, molculas,

    personas, sustancias, etc. El ejemplo ms simple es la estructura

    monocompartimental que describe, p.ej. el proceso de desintegracin radiactiva, en

    la cual una sustancia A se desintegra formando otra (B).

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    INTRODUCCIN

    Adt

    dA

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    El planteamiento de un modelo compartimental se fundamenta en el principio de

    conservacin de masa.

    El caso del modelo compartimental anteriormente planteado supone una velocidad

    de variacin de la masa A proporcional a la magnitud de A, se trata de un

    compartimiento de primer orden:

    n=0

    n=1

    Compartimento lineal

    Compartimento no-

    lineal n=2

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    INTRODUCCIN

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Aunque los compartimentos de primer orden son los ms usados en las diferentes

    aplicaciones, los compartimientos de orden superior son importantes, p.ej. para la

    incorporacin de trminos de saturacin.

    La masa de A variar en el tiempo

    hasta alcanzar el punto de equilibrio,

    es decir hasta cumplir:

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    INTRODUCCIN

    I(t)A

    )( 2AtIdt

    dA

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Los modelos compartimentales se componen de:

    Compartimentos

    Flujos intercompartimentales

    Funciones de incorporacin

    Funciones de descarga

    Incorporacin Eliminacin

    Compartimentos

    Flujo intercompartimental

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    INTRODUCCIN

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Los modelos compartimentales se pueden clasificar en:

    Cerrados: No tienen trminos de incorporacin, como tampoco de eliminacin, es

    decir, solo cuenta con trminos de flujo intercompartimental.

    Abiertos: Cuentan con uno o ms trminos de incorporacin y/o eliminacin.

    Catenarios: Todos los compartimentos estn arreglados en cadena, uno detrs de

    otro, es decir, un compartimiento solo se relaciona con el anterior y el posterior.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    INTRODUCCIN

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Centralizados (mamarios): Existe un compartimento central (padre) conectado

    con otros compartimentos en la periferia (hijos), no existe transferencia de masa

    entre los hijos, solamente entre padre e hijos.

    Ntese que los flujos de masa entre los compartimentos pueden darse en dos

    direcciones, no necesariamente en una, tal como en el caso de los problemas de

    cintica en reacciones qumicas.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    INTRODUCCIN

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Conocer la concentracin del medicamento en el cuerpo

    en cualquier momento despus de su ingestin resulta

    ser una informacin importante cuando se requiere

    administrar dosis adecuadas a un paciente. El estudio de

    la dinmica de un medicamento en el cuerpo se

    denomina farmacocintica. Una forma de modelar

    estos problemas es mediante compartimentos, cada uno

    de los cuales corresponder a algn(os) rgano(s)

    involucrados en el proceso. En cada uno de estos

    compartimentos resulta importante conocer la tasa de

    variacin del medicamento, lo cual se puede hacer

    mediante la ecuacin de balance:

    Tasa Neta= Tasa de Entrada Tasa de Salida

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    INTRODUCCIN

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Considerando un modelo de dos compartimentos: uno que

    representa el tracto gastrointestinal y otro que representa la

    sangre, se pueden plantear dos ecuaciones de balance

    desacopladas as:

    donde la constante k1 muestra la rapidez de transferencia del

    medicamento a la sangre, mientras la constante k2 muestra la rapidez de la accin de riones e hgado en la eliminacin

    del medicamento de la sangre. De que factores dependen

    los valores de estas constantes?

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    CONCENTRACIONES DE QUIMICOS EN EL ORGANISMO HUMANO

    00 )(

    00

    21

    1

    )y(tyk x(t)kdt

    dy(t)

    )x( x(t)I(t) - kdt

    dx(t)

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Asumiendo que el tracto gastrointestinal contiene una

    concentracin inicial del medicamento (A), la cual no es

    reforzada por ninguna dosis adicional, I(t)=0 y:

    donde la primer EDO puede ser solucionada por separacin

    de variables:

    Entonces la segunda expresin ahora puede ser resuelta,

    empleando factor integrante:

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    DOSIS NICA DE UN MEDICAMENTO

    00 )(

    0

    21

    1

    )y(tyk x(t)kdt

    dy(t)

    A)x( x(t)kdt

    dx(t)

    Aex(t) t-k1

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Es de observar que las constantes k1 y k2 dependen no solo del tipo medicamento, sino de la edad y salud del

    paciente, entre otro factores. Tomando entonces los datos

    para estas constantes provistos por una empresa

    farmacutica para un tipo de antihistamina y ciertas

    caractersticas medias de un tipo de paciente:

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    DOSIS NICA DE UN MEDICAMENTO

    )()(

    00 )(

    12

    1

    21

    1

    2

    t-kt-k

    t-k

    eekk

    Akty

    )y( Aetykdt

    dy(t)

    hk

    16931.01

    hk

    10231.02

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Y definido un valor de A=1 unidad de concentracin de

    antihistamnico, se puede trazar la

    siguiente trayectoria de solucin

    dentro del retrato de fase del

    sistema.

    Como se observa la concentracin

    en el tracto digestivo desaparece

    mucho antes que se reduzca a

    cero la concentracin del qumico

    en la sangre.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    DOSIS NICA DE UN MEDICAMENTO

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    LOS RETRATOS DE FASES: UNA FORMA DE CONOCER LA

    SOLUCION SIN SOLUCIONAR EL PROBLEMA

    Espacio de Estado

    Variables de Estado

    Lneas Ceroclinas

    Puntos de Equilibrio

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    LOS RETRATOS DE FASES: UNA FORMA DE CONOCER LA

    SOLUCION SIN SOLUCIONAR EL PROBLEMA

    Punto de Equilibrio

    Punto de Equilibrio

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Ya sea a partir de la solucin analtica planteada, o a partir de una solucin numrica, se puede trazar el comportamiento de la concentracin del antihistamnico en los dos compartimentos estudiados. Este grfico muestra que requieren cerca de 9 h para que el qumico desaparezca del tracto digestivo y ms de 5 das para que su concentracin en la sangre sea mnima.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    DOSIS NICA DE UN MEDICAMENTO

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    En muchos casos se requiere mantener durante un determinado tiempo, una concentracin definida de un medicamento en la sangre, con el fin de permitir su accin en el rgano correspondiente. En este tipo de tratamientos la dosis del medicamento se repite peridicamente buscando sostener la concentracin del qumico en la sangre dentro de unos determinados lmites: uno inferior que garantice el efecto y otro superior que asegure el bienestar del paciente.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    DOSIS REPETIDA DE UN MEDICAMENTO

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    La solucin de este problema, definido por el sistema de ecuaciones diferenciales presentado inicialmente, podra ser solucionado analticamente siempre y cuando la

    funcin I(t) lo permita. Para el caso mostrado, en el cual la dosis es suministrada peridicamente cada 8 h y por cortos perodos de tiempo, la solucin analtica podra plantearse subdividiendo el dominio del tiempo en tramos, para valores de

    I(t)0 y para I(t)=0, en donde el estado final de un periodo es la condicin inicial del siguiente.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    DOSIS REPETIDA DE UN MEDICAMENTO

    )(

    21

    1

    tyk x(t)kdt

    dy(t)

    x(t)kI(t)dt

    dx(t)

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    No obstante resulta un poco ms simple implementar una solucin numrica para este problema, los resultados de aplicar el mtodo de Runge-Kutta de cuarto orden se observan en esta grfica.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    DOSIS REPETIDA DE UN MEDICAMENTO

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Finalmente, se puede observar como en virtud del valor de la constante k2, la dosis administrada al paciente en el caso anterior, puede ser adecuada o perjudicial.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    DOSIS REPETIDA DE UN MEDICAMENTO

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    SOLUCIN NUMERICA:

    RUNGE-KUTTA (EXPLCITO)

    La solucin analtica de un sistema NL de ODEs resulta compleja, as que si se requiere observar la variacin de cada variable en el tiempo [x(t), y(t)], se necesita implementar un procedimiento numrico.

    El Mtodo de Runge-Kutta de cuarto orden es uno de los algoritmos numricos ms empleados para aproximar una solucin discreta de [x(t),y(t)].

    Las expresiones del mtodo de Runge-Kutta de cuarto orden son:

    ),,( tyxfdt

    dx(t) ),,( tyxf

    dt

    dy(t)

    )22(6

    1

    )22(6

    1

    43211

    43211

    kkkkyy

    mmmmxx

    nn

    nn

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    SOLUCIN NUMERICA:

    RUNGE-KUTTA

    n = 0 n = 1 n = 2 n = ... y1

    y2

    yn-1 yn

    x1 x2 xn-1

    xn x0

    y0

    )22(6

    1

    )22(6

    1

    43211

    43211

    kkkkyy

    mmmmxx

    nn

    nn

    ),,(

    )2

    ,2

    ,2

    (

    )2

    ,2

    ,2

    (

    ),,(

    334

    223

    112

    1

    kymxhtfhm

    ky

    mx

    htfhm

    ky

    mx

    htfhm

    yxtfhm

    nnn

    nnn

    nnn

    nnn

    ),,(

    )2

    ,2

    ,2

    (

    )2

    ,2

    ,2

    (

    ),,(

    334

    223

    112

    1

    kymxhtghk

    ky

    mx

    htghk

    ky

    mx

    htghk

    yxtghk

    nnn

    nnn

    nnn

    nnn

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    William Kermack y Anderson McKendrick formularon en 1927 el artculo Contributions to the mathematical theory of epidemics en el Bulletin of Mathematical Biology. En este artculo se presenta un modelo fundamental para el anlisis de la propagacin de enfermedades contagiosas, denominado SIR. Este modelo compartimental divide una poblacin cerrada en tres grupos (compartimientos): Sanos, Infectados y Recuperados. Sanos: es grupo de poblacin susceptible a ser infectada por el agente. Infectados: es el grupo de poblacin afectada por la enfermedad y que esta en posibilidad de transmitir esta a otras personas. Recuperados: es el conjunto de personas que fueron afectados por la enfermedad pero ya no estn en capacidad de transmitir la enfermedad. Si se trata de una enfermedad para la cual el cuerpo genera anticuerpos efectivos, los Recuperados no vuelven al compartimiento de sanos.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    PROPAGACIN DE UNA EPIDEMIA

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Este es un modelo de tres compartimentos, cerrado y no-lineal, conformado por el siguiente sistema de ecuaciones:

    Ntese que siempre se cumple: lo cual ratifica que el total de la poblacin analizada es igual en todo momento, es decir el modelo es cerrado.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    PROPAGACIN DE UNA EPIDEMIA

    Idt

    dR

    ISIdt

    dI

    SIdt

    dS

    0dt

    dR

    dt

    dI

    dt

    dS

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    El trmino a S I define la cantidad de individuos sanos que se infectan, por unidad de tiempo. Este trmino se relaciona con la Ley de accin de masas y se interpreta como la cantidad de potenciales encuentros de individuos sanos con infectados, afectado por un coeficiente que relaciona el nivel de exposicin y la habilidad del agente infeccioso para transportarse de un individuo a otro.

    Por otro lado, el flujo entre el compartimiento de individuos infectados e individuos recuperados se define como b I, donde b se entiende como el inverso del tiempo de recuperacin de un individuo infectado (T).

    Individuos con menos de

    1 da de infeccin

    Individuos con menos de

    T das de infeccin

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    PROPAGACIN DE UNA EPIDEMIA

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Al igual que en casos anteriores, la naturaleza no-lineal del modelo hace compleja la solucin analtica, pero algunos anlisis pueden desarrollarse antes de recurrir a un procedimiento numrico. Se puede considerar una epidemia si se presenta una velocidad de crecimiento de la poblacin infectada positiva, es decir si:

    Umbral epidemiolgico

    Nmero crtico de poblacin Susceptible

    S*

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    PROPAGACIN DE UNA EPIDEMIA

    0 ISIdt

    dI

    1

    SIZ

    *S

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    El modelo SIR, aunque logra emular algunos comportamientos observados en episodios epidmicos registrados, posee algunas limitaciones, asociadas a las hiptesis empleadas para construirlo: La poblacin se considera homognea, no considera estratificacin por edad, estructura social, distribucin geogrfica, etc. No se considera periodo de incubacin del agente infeccioso, es decir, segn el modelo una persona que acaba de contraer la enfermedad se comporta igual que una persona infectada hace mucho ms tiempo. La duracin de la infeccin es el mismo tiempo de duracin de la enfermedad. El modelo esta planteado par una poblacin cerrada, no se consideran nacimientos, migraciones, fallecimientos por causas diferentes a la epidemia, etc.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    PROPAGACIN DE UNA EPIDEMIA

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Ejemplo: La gripe de Hong-Kong, fue una epidemia de influenza tipo A subtipo H3N2, que se inici en Hong-Kong en 1968, infectando alrededor del 15% de la poblacin de Hong-Kong y provocando la muerte de alrededor de un milln de personas. Para finales de 1968 la gripa lleg a Estados Unidos dejando cerca de 38.000 personas muertas. Considerando que la gripe de Hong-Kong tiene un periodo de infeccin de 3 das, que un individuo sano hace contacto con el 0.5% de la poblacin infectada por da y que, de cada 6 contactos con infectados, un individuo susceptible resulta contagiado con el virus, se tiene que:

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    PROPAGACIN DE UNA EPIDEMIA

    3

    1

    1200

    1

    6

    1

    100

    5.0

    Idt

    dR

    ISIdt

    dI

    SIdt

    dS

    3

    1

    3

    1

    1200

    1

    1200

    1

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    PROPAGACIN DE UNA EPIDEMIA

    0

    10

    7900000

    0

    0

    0

    R

    I

    S

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Comportamiento de la poblacin infectada por el virus AH1N1 (Gripe A) en Mxico, entre los meses de marzo a mayo de 2009.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    PROPAGACIN DE UNA EPIDEMIA

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Una variante del modelo SIR es el modelo SEIR. Este modelo incorpora una compartimiento ms, denominado poblacin expuesta, el cual se refiere a los individuos que han adquirido la infeccin, pero an no estn en capacidad de transmitir el virus pues el mismo est en periodo de incubacin. As el sistema de compartimientos y ecuaciones para este caso ser:

    De forma anloga a lo expuesto en relacin al tiempo de infeccin, el coeficiente g se interpreta como el inverso del periodo de incubacin del virus.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    PROPAGACIN DE UNA EPIDEMIA

    Idt

    dR

    IEdt

    dI

    ESIdt

    dE

    SIdt

    dS

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Considerando el caso de la gripe de Hong-Kong, pero ahora con un tiempo de incubacin del virus igual a 2 das, se tiene:

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    PROPAGACIN DE UNA EPIDEMIA

    Idt

    dR

    IEdt

    dI

    ESIdt

    dE

    SIdt

    dS

    3

    1

    3

    1

    2

    1

    2

    1

    1200

    1

    1200

    1

    0

    10

    10

    7900000

    0

    0

    0

    0

    R

    I

    E

    S

  • Karol Cascavita, I.M, MSc. Modelacin Matemtica Universidad Nacional de Colombia

    Normalmente los periodos en los que se analiza la propagacin de una epidemia son reducidos como para tener en cuenta el crecimiento de la poblacin, de aqu que la aproximacin con modelos cerrados es vlida. Sin embargo en algunos casos deben ser adicionados trminos de incorporacin y de eliminacin a los compartimientos, especialmente cuando se desea estudiar el impacto de la vacunacin en las epidemias.

    Porcentaje de neonatos que son vacunados para crear inmunidad contra el agente infeccioso.

    Tasa de natalidad o mortalidad de la poblacin.

    Poblacin total en el tiempo t.

    MODELOS COMPARTIMENTALES:

    PROPAGACIN DE UNA EPIDEMIA

    RIdt

    dR

    IISIdt

    dI

    SISPNdt

    dS

    )1(

    N

    P