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日本医科大学図書館 2001/04/25 改訂: 2019.01.28
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テーマから検索する PubMed 検索マニュアルⅠ
1. はじめに
1-1 PubMed(パブメド)とは?
1-2 PubMed へのアクセス
2. 基本的な利用方法
2-1 検索語の入力
2-2 検索結果の表示
2-3 1論文レコードのデータ詳細画面
2-4 論文入手のためのリンクアイコン
2-5 検索結果表示の変更(Display Settings)
1.はじめに
1-1.PubMed(パブメド)とは?
米国医学図書館(NLM)提供の MEDLINEデータベースを基に OLD MEDLINE(1946-1965遡及進行中)や出版社からの
データを加えた 2,400 万件を越える医学文献データベースです。日本を含む世界約 80 カ国の雑誌文献が提供さ
れています。他にも DNAやゲノムマップなどのデータベースを含みます。無料公開データベースです。
1-2.PubMed へのアクセス
インターネット上からはどこからも利用できます。
図書館ホームページ https://www.nms.ac.jp/sh/library/ からリンクしている PubMedは日医大専用 URL(下記)です。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?myncbishare=toshokan&otool=ijpnmslib
日医大専用 URLよりアクセスしますと、検索結果にリンクアイコン (NMSアイコン) が
表示され、クリックした後の画面で雑誌や学内契約の電子ジャーナルの有無が確認できます。
学内契約の電子ジャーナル本文を読むには、学内 LAN からのアクセスが必要です。
1-3.PubMed の TOPページ
PubMed の使い方
3. 応用的な利用方法
3-1 検索結果の条件設定(Advanced Search
Builder を利用した履歴検索・検索条件の指定)
3-2 検索結果の絞り込み(Filters)
3-3 検索式の確認(Search Details)
3-4 検索結果の出力(Send to)・RSSフィード
サーチボックス
PubMed 各種ツール PubMed 周辺の各機能
MyNCBI(詳細はマニュアルⅹへ)
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2.基本的な利用方法
2-1.検索語の入力
サーチボックスに検索語を入力し、Searchをクリックします。スペースを入れると、AND検索(両方の語を含
む検索)になります。
自動用語マッピング(Automatic Term Mapping)が働き、入力された語を論文タイトルや抄録から探すほか、
MeSH(メッシュ)という MEDLINE用キーワード集の用語に翻訳して自動的に検索が行われます。
2-2.検索結果の表示
検索結果の初期設定は Summary 形式で 20件ずつ、新たに収録された順に表示されます。検索語は太字です。
※1 略誌名の部分にマウスをのせると、正式な雑誌名が表示されます
タイトル
著者名
検索式の詳細確認
検索結果レコード(文献情報)
PubMed ID[レコードの状態]※2
略誌名※1
関連文献
出版年月日; 巻号:ページ.DOI
(冊子体が未発行、電子版のみの文献は
DOIの後に[Epub ahead of print]と
表示されます)
検索結果の出力 検索結果表示の変更
検索結果の
絞り込み
入力をすると、Auto Suggest 機能により
候補語が表示され、検索語を選択すること
もできます。
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※2 レコードの状態(Status tag)について
PubMed には索引付けされた MEDLINE データと、出版社からの提供データ(未索引)があります。
[PubMed - as supplied by publisher] 出版社が電子的なデータを NLMに提供したもの
[PubMed - in process] MEDLINE に収録する予定で索引作業中のデータ
[PubMed - indexed for MEDLINE] MEDLINE に収録されたデータです。MeSHで検索することができます。
[PubMed] MEDLINE 収録対象誌ではない論文や、収録対象誌に掲載された論文であっても、MEDLINE の収載基準か
ら内容的にはずれるため、MEDLINE に収録されなかった論文。
[PubMed - OLDMEDLINE] 1946~1965 年までの OLDMEDLINE の論文です。遡及作業が行われています。
2-3.1論文レコードのデータ詳細画面
検索結果リスト(Summary 形式)からタイトルをクリックし、論文 1 件のみ表示した場合は下記のような
Abstract 形式になります。書誌事項のほかに、著者所属や抄録、電子ジャーナルへのリンク等が表示できます。
2-4.論文入手のためのリンクアイコン
表示させたレコードの電子ジャーナル本文を表示するには、画面に表示されている日本医科大学用のリンクア
イコン(NMSアイコン)をクリックします。詳しくは PubMedマニュアルⅦ「PubMed から電子ジャーナルを使う」
をご参照下さい。
右:学内リソースへの
リンクアイコン
※すべての検索結果に
このアイコンが表示さ
れます
電子ジャーナルへのリンク
抄録 関連文献・関連情報
左:提供元電子ジャーナルへ
のリンクアイコン
学内契約のあるタイトルと、
本文無料公開の場合、本文を
読むことができます
学内リソースへのナビゲート画面
MyNCBIへデータ保存
展開すると、Publication types(資料種類)や MeSH Terms
(データベース MEDLINEへの統制語)等の情報を確認できます。
※レコードにより該当がない場合があります。
電子リソースへのリンクアイコン
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2-5.検索結果表示の変更
検索結果の初期設定は Summary 形式(書誌事項のみ)で、20件ずつ、新たに収録された順に表示されます。
Display Settingsで検索結果表示の変更ができます。検索結果のうち、チェックを入れたレコード、入れなかっ
た場合は全てのレコードが対象になります。
MEDLINE 形式 全項目のタグ付き表示した形式。
EndNoteや RefWorks 等の文献管理ソフトにデータを取り込む際に選択します。
PMID List PubMed IDのみを表示します。
3.応用的な利用方法
3-1.検索結果の条件設定
サーチボックスの下にある「Advanced」をクリックすると、検索履歴の表示とそれを使った検索、検索条件の
指定や限定などさらに進んだ検索を行うことができます。
a.検索履歴を使って検索条件を掛け合わせる(履歴検索)「Advanced → History」
検索件数が予想より多かったり、あるいは少なかったりした場合、History(検索履歴)を使い、検索条件の掛
け合わせを行うことで、件数を調整できます。 掛け合わせには AND(論理積), OR(論理和), NOT(論理差) と
いった論理演算子を用います。
Advancedの表示 検索ボックスの下の Advancedをクリックします。
A AND B A OR B A NOT B
表示形式 表示結果の並び替え
1 ページの
表示件数
選択してから Applyをクリックします 論題名
雑誌名
関連度
新しく収録された順
出版年
筆頭著者
最終著者
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b.検索条件を指定する「Advanced → Builder」
Author、Journal、MeSH、Publication Type など特定の項目で絞り込むことができます。Show Index list は
候補語の件数を確認することができ便利です。
③
③
①
①
②
① 各検索式の「Add」をクリックすると
検索語が枠内に反映されます。
②
③ 最後に Searchをクリックします
④
Builder
① プルダウンから項目を指定し
検索語を入力します。
② Show Index list をクリック
③ プルダウンメニューに候補語
のリストが件数とともにアル
ファベット順に表示されま
す。リストより選択します。
④ Search をクリックします。
⑤ Add to historyをクリックす
ると、文献検索結果の表示を
経ずに検索履歴に直接反映さ
れて、件数だけを調べること
ができます。
History
検索履歴
<検索例>
検索式 #1 diabetes mellitus type 2
検索式 #2 diabetes complications
これらの検索式の掛け合わせ( #1 AND #2 )の
結果を調べる。
⑤
② さらに別の検索式の式番号(#)をクリックすると「AND(OR,NOT)
in builder」(論理演算子)が表示され、(AND,OR,NOT)と共に
Builderに自動入力されます
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3-2. 検索結果の絞り込み
Summary 形式の画面左側にあるフィルターを使用すると、論文の各項目(資料種類・言語・年齢・性別等)で
限定して、検索結果を絞り込むことができます。Show additional filtersで項目の追加・削除もできます。
3-3. 検索式の確認
検索結果(Summary形式)の画面右下の Search Detailsでは、その検索がどのように行われているかを確認す
ることができます。See more をクリックすると検索式の詳細画面が表示されます。思った検索結果が得られない
場合、検索式を編集(追加や削除)して Searchをクリックすると、再検索できます。
C
D
C
A
B D
また、 URLアイコンをクリックすると、
最近の検索式が表示され、ブックマーク
をすることで検索の再現ができます。式
番号は保存されません。
限定したい項目を
クリック
チェックされた項目でフィルターに限定さ
れている状態です。Clear all ですべて、
clearでひとつずつ解除できます。
性別
主題
コメントあり
サブセット
拡大図
論文の種類
本文の有無
発行年月日
ヒトか動物か
本文言語
年齢
検索フィールド
を
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3-4.検索結果の出力
a. Send to 機能
検索結果の文献情報(レコード)を出力し、さまざまな形式で保存することができます。
保存したい文献をチェックし、Send to をクリックすると、メニューが表示されます。選ばない場合には検索
結果の全データが出力対象になります。なお、印刷はブラウザの印刷機能で行います。
ファイルのダウンロード
USB メモリなどへ出力できます。
▼をクリックして、「Format」で保存形式、
「Sort by」で並び順を選択します。
文献管理ソフト(EndNoteや RefWorks など)へ
取りこむときは、MEDLINE形式を選択します。
検索結果を一時的に保存し、最後にまとめて
印刷・保存することができます。
(8時間・500件まで)
メール送信することができます。
①▼をクリックして、“表示形式”、“ソート順”、
“文献数”が設定できます。上限は 200件です。
Abstract形式では、チェックボックスにチェッ
クすると、MeSH や Publication Type を送信す
ることができます。
② E-mail の宛先を入力し、Subject に主題を入
力し、E-mail をクリックします。
メール送信
文献管理ソフト(EndNoteや RefWorks等)
にデータを保存できます。
文献管理ソフトに保存
自著の文献管理
MyNCBI のアカウントが必要です。
詳しくは PubMed マニュアル X
(My NCBI)をご覧ください。
データの一時保存
コレクション作成
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b. RSSフィード
参考文献
岩下愛, 山下ユミ. 図解 PubMed の使い方:インターネットで医学文献を探す. 第 6 版. 東京:日本医学図書館協会;2013.
東京大学医学図書館 PubMed の使い方(2014.4)
http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdf
表示の一例
検索式を再現し、設定した期限で検索結果を得ることがで
きます。(利用するには RSSリーダーのインストールが必要
です。Internet Explorer の ver.7以降は RSS搭載です)
検索ボックス下の「RSS Feed」をクリックします。
RSS Settings で表示件数、タイトルを入力し、
Create RSSをクリックします。
XMLをクリックして表示された URLをコピーし、
RSSリーダーに登録します。