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日本医科大学図書館 2001/04/25 改訂: 2019.01.28 1 テーマから検索する PubMed 検索マニュアルⅠ 1. はじめに 1-1 PubMed(パブメド)とは? 1-2 PubMed へのアクセス 2. 基本的な利用方法 2-1 検索語の入力 2-2 検索結果の表示 2-3 1 論文レコードのデータ詳細画面 2-4 論文入手のためのリンクアイコン 2-5 検索結果表示の変更(Display Settings) 1.はじめに 1-1.PubMed(パブメド)とは? 米国医学図書館(NLM)提供の MEDLINE データベースを基に OLD MEDLINE(1946-1965 遡及進行中)や出版社からの データを加えた 2,400 万件を越える医学文献データベースです。日本を含む世界約 80 カ国の雑誌文献が提供さ れています。他にも DNA やゲノムマップなどのデータベースを含みます。無料公開データベースです。 1-2.PubMed へのアクセス インターネット上からはどこからも利用できます。 図書館ホームページ https://www.nms.ac.jp/sh/library/ からリンクしている PubMed は日医大専用 URL(下記)です。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?myncbishare=toshokan&otool=ijpnmslib 日医大専用 URL よりアクセスしますと、検索結果にリンクアイコン (NMS アイコン) 表示され、クリックした後の画面で雑誌や学内契約の電子ジャーナルの有無が確認できます。 学内契約の電子ジャーナル本文を読むには、学内 LAN からのアクセスが必要です。 1-3.PubMed の TOP ページ PubMed の使い方 3. 応用的な利用方法 3-1 検索結果の条件設定(Advanced Search Builder を利用した履歴検索・検索条件の指定) 3-2 検索結果の絞り込み(Filters) 3-3 検索式の確認(Search Details) 3-4 検索結果の出力(Send to)・RSSフィード サーチボックス PubMed 各種ツール PubMed 周辺の各機能 MyNCBI(詳細はマニュアルⅹへ)

日本医科大学図書館 2001/04/25 改訂: 2019.01.28 … › sh › library › manual5 › pubmed › pubmed...Abstract形式 になります。 書誌 事項のほかに、著者所属や抄録、電子ジャーナルへのリンク等が表示できます。

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日本医科大学図書館 2001/04/25 改訂: 2019.01.28

1

テーマから検索する PubMed 検索マニュアルⅠ

1. はじめに

1-1 PubMed(パブメド)とは?

1-2 PubMed へのアクセス

2. 基本的な利用方法

2-1 検索語の入力

2-2 検索結果の表示

2-3 1論文レコードのデータ詳細画面

2-4 論文入手のためのリンクアイコン

2-5 検索結果表示の変更(Display Settings)

1.はじめに

1-1.PubMed(パブメド)とは?

米国医学図書館(NLM)提供の MEDLINEデータベースを基に OLD MEDLINE(1946-1965遡及進行中)や出版社からの

データを加えた 2,400 万件を越える医学文献データベースです。日本を含む世界約 80 カ国の雑誌文献が提供さ

れています。他にも DNAやゲノムマップなどのデータベースを含みます。無料公開データベースです。

1-2.PubMed へのアクセス

インターネット上からはどこからも利用できます。

図書館ホームページ https://www.nms.ac.jp/sh/library/ からリンクしている PubMedは日医大専用 URL(下記)です。

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?myncbishare=toshokan&otool=ijpnmslib

日医大専用 URLよりアクセスしますと、検索結果にリンクアイコン (NMSアイコン) が

表示され、クリックした後の画面で雑誌や学内契約の電子ジャーナルの有無が確認できます。

学内契約の電子ジャーナル本文を読むには、学内 LAN からのアクセスが必要です。

1-3.PubMed の TOPページ

PubMed の使い方

3. 応用的な利用方法

3-1 検索結果の条件設定(Advanced Search

Builder を利用した履歴検索・検索条件の指定)

3-2 検索結果の絞り込み(Filters)

3-3 検索式の確認(Search Details)

3-4 検索結果の出力(Send to)・RSSフィード

サーチボックス

PubMed 各種ツール PubMed 周辺の各機能

MyNCBI(詳細はマニュアルⅹへ)

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2.基本的な利用方法

2-1.検索語の入力

サーチボックスに検索語を入力し、Searchをクリックします。スペースを入れると、AND検索(両方の語を含

む検索)になります。

自動用語マッピング(Automatic Term Mapping)が働き、入力された語を論文タイトルや抄録から探すほか、

MeSH(メッシュ)という MEDLINE用キーワード集の用語に翻訳して自動的に検索が行われます。

2-2.検索結果の表示

検索結果の初期設定は Summary 形式で 20件ずつ、新たに収録された順に表示されます。検索語は太字です。

※1 略誌名の部分にマウスをのせると、正式な雑誌名が表示されます

タイトル

著者名

検索式の詳細確認

検索結果レコード(文献情報)

PubMed ID[レコードの状態]※2

略誌名※1

関連文献

出版年月日; 巻号:ページ.DOI

(冊子体が未発行、電子版のみの文献は

DOIの後に[Epub ahead of print]と

表示されます)

検索結果の出力 検索結果表示の変更

検索結果の

絞り込み

入力をすると、Auto Suggest 機能により

候補語が表示され、検索語を選択すること

もできます。

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※2 レコードの状態(Status tag)について

PubMed には索引付けされた MEDLINE データと、出版社からの提供データ(未索引)があります。

[PubMed - as supplied by publisher] 出版社が電子的なデータを NLMに提供したもの

[PubMed - in process] MEDLINE に収録する予定で索引作業中のデータ

[PubMed - indexed for MEDLINE] MEDLINE に収録されたデータです。MeSHで検索することができます。

[PubMed] MEDLINE 収録対象誌ではない論文や、収録対象誌に掲載された論文であっても、MEDLINE の収載基準か

ら内容的にはずれるため、MEDLINE に収録されなかった論文。

[PubMed - OLDMEDLINE] 1946~1965 年までの OLDMEDLINE の論文です。遡及作業が行われています。

2-3.1論文レコードのデータ詳細画面

検索結果リスト(Summary 形式)からタイトルをクリックし、論文 1 件のみ表示した場合は下記のような

Abstract 形式になります。書誌事項のほかに、著者所属や抄録、電子ジャーナルへのリンク等が表示できます。

2-4.論文入手のためのリンクアイコン

表示させたレコードの電子ジャーナル本文を表示するには、画面に表示されている日本医科大学用のリンクア

イコン(NMSアイコン)をクリックします。詳しくは PubMedマニュアルⅦ「PubMed から電子ジャーナルを使う」

をご参照下さい。

右:学内リソースへの

リンクアイコン

※すべての検索結果に

このアイコンが表示さ

れます

電子ジャーナルへのリンク

抄録 関連文献・関連情報

左:提供元電子ジャーナルへ

のリンクアイコン

学内契約のあるタイトルと、

本文無料公開の場合、本文を

読むことができます

学内リソースへのナビゲート画面

MyNCBIへデータ保存

展開すると、Publication types(資料種類)や MeSH Terms

(データベース MEDLINEへの統制語)等の情報を確認できます。

※レコードにより該当がない場合があります。

電子リソースへのリンクアイコン

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2-5.検索結果表示の変更

検索結果の初期設定は Summary 形式(書誌事項のみ)で、20件ずつ、新たに収録された順に表示されます。

Display Settingsで検索結果表示の変更ができます。検索結果のうち、チェックを入れたレコード、入れなかっ

た場合は全てのレコードが対象になります。

MEDLINE 形式 全項目のタグ付き表示した形式。

EndNoteや RefWorks 等の文献管理ソフトにデータを取り込む際に選択します。

PMID List PubMed IDのみを表示します。

3.応用的な利用方法

3-1.検索結果の条件設定

サーチボックスの下にある「Advanced」をクリックすると、検索履歴の表示とそれを使った検索、検索条件の

指定や限定などさらに進んだ検索を行うことができます。

a.検索履歴を使って検索条件を掛け合わせる(履歴検索)「Advanced → History」

検索件数が予想より多かったり、あるいは少なかったりした場合、History(検索履歴)を使い、検索条件の掛

け合わせを行うことで、件数を調整できます。 掛け合わせには AND(論理積), OR(論理和), NOT(論理差) と

いった論理演算子を用います。

Advancedの表示 検索ボックスの下の Advancedをクリックします。

A AND B A OR B A NOT B

表示形式 表示結果の並び替え

1 ページの

表示件数

選択してから Applyをクリックします 論題名

雑誌名

関連度

新しく収録された順

出版年

筆頭著者

最終著者

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日本医科大学図書館 2001/04/25 改訂: 2019.01.28

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b.検索条件を指定する「Advanced → Builder」

Author、Journal、MeSH、Publication Type など特定の項目で絞り込むことができます。Show Index list は

候補語の件数を確認することができ便利です。

① 各検索式の「Add」をクリックすると

検索語が枠内に反映されます。

③ 最後に Searchをクリックします

Builder

① プルダウンから項目を指定し

検索語を入力します。

② Show Index list をクリック

③ プルダウンメニューに候補語

のリストが件数とともにアル

ファベット順に表示されま

す。リストより選択します。

④ Search をクリックします。

⑤ Add to historyをクリックす

ると、文献検索結果の表示を

経ずに検索履歴に直接反映さ

れて、件数だけを調べること

ができます。

History

検索履歴

<検索例>

検索式 #1 diabetes mellitus type 2

検索式 #2 diabetes complications

これらの検索式の掛け合わせ( #1 AND #2 )の

結果を調べる。

② さらに別の検索式の式番号(#)をクリックすると「AND(OR,NOT)

in builder」(論理演算子)が表示され、(AND,OR,NOT)と共に

Builderに自動入力されます

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3-2. 検索結果の絞り込み

Summary 形式の画面左側にあるフィルターを使用すると、論文の各項目(資料種類・言語・年齢・性別等)で

限定して、検索結果を絞り込むことができます。Show additional filtersで項目の追加・削除もできます。

3-3. 検索式の確認

検索結果(Summary形式)の画面右下の Search Detailsでは、その検索がどのように行われているかを確認す

ることができます。See more をクリックすると検索式の詳細画面が表示されます。思った検索結果が得られない

場合、検索式を編集(追加や削除)して Searchをクリックすると、再検索できます。

A

B D

また、 URLアイコンをクリックすると、

最近の検索式が表示され、ブックマーク

をすることで検索の再現ができます。式

番号は保存されません。

限定したい項目を

クリック

チェックされた項目でフィルターに限定さ

れている状態です。Clear all ですべて、

clearでひとつずつ解除できます。

性別

主題

コメントあり

サブセット

拡大図

論文の種類

本文の有無

発行年月日

ヒトか動物か

本文言語

年齢

検索フィールド

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3-4.検索結果の出力

a. Send to 機能

検索結果の文献情報(レコード)を出力し、さまざまな形式で保存することができます。

保存したい文献をチェックし、Send to をクリックすると、メニューが表示されます。選ばない場合には検索

結果の全データが出力対象になります。なお、印刷はブラウザの印刷機能で行います。

ファイルのダウンロード

USB メモリなどへ出力できます。

▼をクリックして、「Format」で保存形式、

「Sort by」で並び順を選択します。

文献管理ソフト(EndNoteや RefWorks など)へ

取りこむときは、MEDLINE形式を選択します。

検索結果を一時的に保存し、最後にまとめて

印刷・保存することができます。

(8時間・500件まで)

メール送信することができます。

①▼をクリックして、“表示形式”、“ソート順”、

“文献数”が設定できます。上限は 200件です。

Abstract形式では、チェックボックスにチェッ

クすると、MeSH や Publication Type を送信す

ることができます。

② E-mail の宛先を入力し、Subject に主題を入

力し、E-mail をクリックします。

メール送信

文献管理ソフト(EndNoteや RefWorks等)

にデータを保存できます。

文献管理ソフトに保存

自著の文献管理

MyNCBI のアカウントが必要です。

詳しくは PubMed マニュアル X

(My NCBI)をご覧ください。

データの一時保存

コレクション作成

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b. RSSフィード

参考文献

岩下愛, 山下ユミ. 図解 PubMed の使い方:インターネットで医学文献を探す. 第 6 版. 東京:日本医学図書館協会;2013.

東京大学医学図書館 PubMed の使い方(2014.4)

http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdf

表示の一例

検索式を再現し、設定した期限で検索結果を得ることがで

きます。(利用するには RSSリーダーのインストールが必要

です。Internet Explorer の ver.7以降は RSS搭載です)

検索ボックス下の「RSS Feed」をクリックします。

RSS Settings で表示件数、タイトルを入力し、

Create RSSをクリックします。

XMLをクリックして表示された URLをコピーし、

RSSリーダーに登録します。