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Pharmazeutische Biologie – Grundlagen der Biochemie – Prof. Dr. Theo Dingermann Institut für Pharmazeutische Biologie Goethe-Universität Frankfurt [email protected] Montag, 5. Dezember 11

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Pharmazeutische Biologie– Grundlagen der Biochemie –

Prof. Dr. Theo DingermannInstitut für Pharmazeutische Biologie

Goethe-Universität [email protected]

Montag, 5. Dezember 11

… chirale Moleküle

α-Aminogruppe

α-C-Atom α-Carboxylgruppe

Seitenkette

Aminosäure...

L-Alanin D-Alanin

COOHCHH2NCH3

COOHHC NH2CH3

Montag, 5. Dezember 11

… zwitterionisch

Aminosäure...

geringer pH hoher pHphysiologischer pH

COOHCHH3NCH3

COOCHH3NCH3

COOCHH2NCH3

–+ +

Montag, 5. Dezember 11

… die Bausteine der Proteine

Aminosäure...

• es gibt 20 proteinogene Aminosäuren• Proteine: polymerisierte Aminosäuren

Seitenkette

• Die Eigenschaften von Aminosäure-Seitenketten bestimmen die Eigenschaften der gebildeten Proteine

• Besteht ein Protein 100 Aminosäuren, gibt es 20100 = 10130 Kombinationsmöglichkeiten

COOCHH3NCH3

–+

Montag, 5. Dezember 11

Unpolare, aliphatische Seitenketten

Proteinogene Aminosäuren

COOHCOOHCHH2NCH3

COOHCHH2NH

COOHCHH2NCHCH3H3C

COOHCHH2NCH2CHCH3H3C

Glycin ValinAlanin ProlinIsoleucinLeucin

COOHCHH2N

HCCH2

CH3

CH3

HNCH

Montag, 5. Dezember 11

Polare, aliphatische Seitenketten

Proteinogene Aminosäuren

ThreoninSerin

COOHCHH2N

HCCH3

OH

COOHCHH2NCH2OH

COOHCHH2NCH2SH

Cystein

COOHCHH2NCH2

SCH2

CH3Methionin

COOHCHH2NCH2COH2N

COOHCHH2NCH2CH2COH2N

GlutaminAsparagin

Montag, 5. Dezember 11

Negativ geladene Seitenketten

Proteinogene Aminosäuren

ThreoninSerin

COOHCHH2N

HCCH3

OH

COOHCHH2NCH2OH

COOHCHH2NCH2SH

Cystein

COOHCHH2NCH2

SCH2

CH3Methionin

COOHCHH2NCH2COH2N

COOHCHH2NCH2CH2COH2N

GlutaminAsparagin

Montag, 5. Dezember 11

Polare, aliphatische Seitenketten

Proteinogene Aminosäuren

ThreoninSerin

COOHCHH2N

HCCH3

OH

COOHCHH2NCH2OH

COOHCHH2NCH2SH

Cystein

COOHCHH2NCH2

SCH2

CH3Methionin

COOHCHH2NCH2COH2N

COOHCHH2NCH2CH2COH2N

GlutaminAsparagin

Montag, 5. Dezember 11

Negativ geladene Seitenketten

Proteinogene Aminosäuren

COOHCHH2NCH2COOH

COOHCHH2NCH2CH2COOH

Asparaginsäure Glutaminsäure

Montag, 5. Dezember 11

Proteinogene AminosäurenPositiv geladene Seitenketten

COOHCHCH2CH2

CH2NH2

H2N

CH2

COOHCHCH2CH2CH2NH

H2N

C NHNH2

Arginin Lysin Histidin

COOHCHCH2

H2N

N

NH

Montag, 5. Dezember 11

Proteinogene AminosäurenAromatische Seitenketten

COOHCHH2NCH2

COOHCHH2NCH2

OH

COOHCHH2NCH2

Phenylalanin Tyrosin Tryptophan

NH

Montag, 5. Dezember 11

bei physiologischem pH-Wert (ca. pH 7,4)

Proteinogene Aminosäuren

α-COOH 1,7-2,6 –COO–

α-NH2 8,9-10,6 –NH3+

β-COOH Asp 3,9 –COO–

γ-COOH Glu 4,3 –COO–

ε-NH2 Lys 10,5 –NH3+

Guanidino- Arg 12,5 –NH3+

–SH Cys 8,3 –SH–OH Tyr 10,1 –OHImidazol- His 6,0

Fkt. Gruppe Aminosäure pKa Ladung

Montag, 5. Dezember 11

Proteinogene Aminosäure

Metabolite bzw. Substrate im Stoffwechsel•Vorstufen für Neurotransmitter und Hormone•Vorstufen für Hormone•Vorstufen für Alkaloide (in Pflanzen)

Montag, 5. Dezember 11

Beispiel: Neurotransmitter

Proteinogene Aminosäure

"biogene Amine"

Glutaminsäure

COOHCHH2NCH2CH2COOH CO2

γ-AminobuttersäureGABA

CH2H2NCH2CH2COOH

Decarboxylierung

Montag, 5. Dezember 11

Proteinogene AminosäureBeispiel: Neurotransmitter

"biogene Amine"

CH2CH2

H2N

N

NH

COOHCHCH2

H2N

N

NHCO2

Histidin Histamin

Decarboxylierung

Montag, 5. Dezember 11

Beispiel: Alkaloide

Proteinogene Aminosäure

"Indolalkaloide"

COOH

NH2NH

Tryptophan CO2

Decarboxylierung

Tryptamin

NH2NH

Montag, 5. Dezember 11

Es gibt Aminosäuren, die nie in Proteinen vorkommen !

Nichtproteinogene Aminosäuren

Nichtproteinogene Aminosäuren sind•Metabolite bzw. Substrate im Stoffwechsel•Bestandteile bakterieller Zellwände (D-Aminosäuren)•Bestandteile von Antibiotika•Vorstufen für Neutrotransmitter•Vorstufen für Gewebshormone

Montag, 5. Dezember 11

Nichtproteinogene AminosäurenBeispiel: Neurotransmitter bzw. Hormone

COOHCHH2NCH2

OH

COOHCHH2NCH2

OHHO

CH2H2NCH

OHHO

HOCH2H2NCH2

OHHO

CH2HNCH

OHHO

HO

CH3

Oxidation MethylierungHydroxylierungDecarboxylierung

L-Tyrosin L-Dopa L-Dopamin Noradrenalin Adrenalin

Montag, 5. Dezember 11

Nichtproteinogene AminosäurenBeispiel: Neurotransmitter bzw. Hormone

HO

COOHCHH2NCH2

5-Hydroxytryptophan

NH CO2

H2NCH2

5-Hydroxytryptamin(Serotonin)

NHHO

CH2Decarboxylierung

Montag, 5. Dezember 11

Nichtproteinogene AminosäurenBeispiel: Metabolite im Primärstoffwechsel

COOHCHCH2CH2CH2NH2

H2NCOOHCHCH2CH2CH2NH

H2N

C NHNH2

H2N CNH2

O

HarnstoffOrnithinL-Arginin

Montag, 5. Dezember 11

Manche Aminosäuren sind für Tiere essentiell

Glycin ValinAlanin LeucinSerin IsoleucinCystein Threoninabh. von Methionin-ZufuhrGlutaminsäure, Glutamin PhenylalaninAsparaginsäure, Asparagin TryptophanProlin MethioninArginin Lysinfür Säuglinge essentiellHistidinfür Säuglinge essentiellTyrosinabh. von Phenylalanin-Zufuhr

nicht essentiell essentiell

Montag, 5. Dezember 11