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Spettroscopia Raman Quando una radiazione monocromatica di frequenza n o e’ incidente ad un sistema molecolare la luce viene: assorbita se ha energia pari ad una possibile transizione ad un livello energetico superiore (es. Uv-vis, IR); riflessa se non interagisce con la materia; diffusa se interagisce senza causare transizioni energetiche La diffusione della luce e’ uno dei più evidenti effetti ottici, e si verifica perché gli “oggetti” responsabili della diffusione (le molecole) hanno dimensioni molto piccole rispetto alla lunghezza d’onda della radiazione visibile (400 - 800 nm). Riflessione Trasmissione-assorbimento Diffusione

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Spettroscopia Raman

Quando una radiazione monocromatica di frequenza no e’ incidente ad un sistema molecolare

la luce viene: •assorbita se ha energia pari ad una possibile transizione ad un livello energetico superiore (es.

Uv-vis, IR);

•riflessa se non interagisce con la materia;

•diffusa se interagisce senza causare transizioni energetiche

La diffusione della luce e’ uno dei più evidenti effetti ottici, e si verifica perché gli “oggetti”

responsabili della diffusione (le molecole) hanno dimensioni molto piccole rispetto alla

lunghezza d’onda della radiazione visibile (400 - 800 nm).

Riflessione Trasmissione-assorbimento Diffusione

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La spettroscopia Raman e’ una spettroscopia di tipo vibrazionale

ed è basata sul processo di diffusione Raman.

Spettroscopia Raman

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Spettroscopia Raman

La tecnica sfrutta un fenomeno fisico

scoperto nel 1928 dal fisico Indiano C.V.

Raman, che gli valse il premio Nobel nel

1931.

Egli scoprì che una piccola frazione della

radiazione diffusa da certe molecole aveva

energia diversa da quella della radiazione

incidente, e che la differenza di energia era

legata alla struttura chimica delle molecole

responsabili della diffusione: l’effetto Raman,

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una parte ancora più piccola viene

diffusa anelasticamente cedendo (diffusione Raman Stokes) o acquisendo (diffusione Raman anti-Stokes) energia nell'interazione con la molecola,

la maggior parte della radiazione

passa attraverso il campione

un piccola parte della radiazione

diffonde elasticamente in tutte le direzioni

senza perdita di energia, cioè alla stessa frequenza

della radiazione incidente

(diffusione elastica o Rayleigh).

Spettroscopia Raman

hn

hn

hn’

Quando un raggio laser, di lunghezza d’onda λo monocromatica, colpisce una molecola ovvero

un insieme di molecole, la maggior parte della intensità luminosa verrà diffusa in tutto lo spazio

senza cambiamento di lunghezza d’onda. Solo una piccolissima porzione dell’energia luminosa

verrà diffusa con lunghezze d’onda diverse da quella laser.

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Il fenomeno Raman e’ interpretato ammettendo che

il sistema sia eccitato ad un livello molto instabile

(livello virtuale, che non corrisponde a nessun livello stazionario della molecola):

Effetto Raman

Il livello e’ talmente instabile che nel

tempo di 10-14 sec, prima cioe’ che

avvenga un qualsiasi urto, la stessa

radiazione e’ spontaneamente

riemessa ed il sistema ritorna allo stato

fondamentale.

La luce incidente induce il

movimento degli elettroni

di legame.

Tali elettroni in movimento

riemettono luce.

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Diffusione della luce

Considerando l’interazione luce-materia in termini di particelle, possiamo

immaginarla come una

collisione tra i fotoni e le particelle che formano il campione irraggiato.

I fotoni che interagiscono con le particelle del campione

e vengono retrodiffusi possono essere di due tipi:

• se la diffusione avviene per interazione elastica,

cioè senza trasferimento netto di energia, i fotoni

(ovvero la radiazione diffusa) hanno la stessa energia

di quelli incidenti: questo fenomeno è noto come

diffusione Rayleigh e costituisce l’evento più frequente

• se la diffusione è conseguenza di una interazione

anelastica, cioè con trasferimento di energia dal

fotone ad una particella o viceversa, il fotone

diffuso ha energia rispettivamente minore o maggiore

di quello incidente: questo è la diffusione Raman o effetto

Raman, che avviene su un numero assai limitato di

eventi, circa 1 su 106

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Effetto Raman

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Effetto Raman

se la molecola assorbe parte dell’energia del

fotone per passare ad uno stato eccitato, il

fotone riemergerà con un’energia (frequenza)

minore di quella d’incidenza andando a

formare le cosiddette righe Stokes dello

spettro Raman

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Effetto Raman

se invece la molecola si trova già in

uno stato vibrazionale eccitato, a

causa dell'eccitazione termica, può

cedere energia al fotone incidente

che riemergerà dall’urto con

un’energia maggiore andando a

formare le righe anti-Stokes.

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Poiché a temperatura ambiente il livello vibrazionale V0 è più popolato di V1, il passaggio dallo stato vibrazionale fondamentale al primo eccitato è più probabile del passaggio inverso e quindi le linee Stokes sono più intense di

quelle anti-Stokes

La riga con la stessa frequenza della sorgente, derivante dalla diffusione Raleigh

della radiazione incidente, è la componente di gran lunga più intensa dello spettro

Raman e deve essere allontanata.

Spettro Raman

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Nella diffusione Raman, la luce incidente può

avere una qualsiasi frequenza.

La diferenza Dn e’ indipendente

dalla frequenza della luce incidente n.

Sorgente di Eccitazione

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Sorgente di Eccitazione

Gli spostamenti in frequenza della

radiazione diffusa dalla radiazione incidente

sono molto piccoli e di conseguenza la

radiazione incidente deve essere

monocromatica per poterli osservare.

Inoltre l’intensità della radiazione diffusa è

molto bassa, quindi è necessario che il

fascio incidente sia anche molto intenso.

FASCIO MONOCROMATICO

e

INTENSO

Nella diffusione Raman, la luce incidente può

avere una qualsiasi frequenza.

La diferenza Dn e’ indipendente

dalla frequenza della luce incidente n.

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Sorgente di Eccitazione

Si osservano spettri Raman adoperando sorgenti

nel visibile o nell’UV.

Nella maggior parte dei campioni reali, i deboli segnali Raman sono

oscurati dalla fluorescenza di fondo.

In generale, la fluorescenza diminuisce se la lunghezza d'onda

passa dal visibile alla regione del vicino IR (NIR), cioè se

diminuisce l'energia della sorgente di eccitazione. Questo fa sì che,

come sorgenti di eccitazione, si scelgano comunemente il laser o i

diodi laser (che emettono nel rosso lontano e nel NIR, riducendo la

fluorescenza di fondo)

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SpettroRaman

Nello spettro Raman si ha in ordinata

l’intensità di emissione luminosa e

in ascissa la frequenza assoluta in

cm-1 oppure, più comunemente, lo

spostamento Raman o Raman shift, cioè la

differenza in numeri d’onda tra la

radiazione osservata e la radiazione

incidente. 1.E+00

1.E+01

1.E+02

1.E+03

1.E+04

1.E+05

1.E+06

1.E+07

-20 0 20 40 60 80

Raman shift (cm-1)

Inte

nsi

20450 20500 20550 20600

Numeri d'onda (cm-1)

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Lo spettro Raman è quindi uno spettro vibrazionale, come lo

spettro IR, ma da questo differisce per due motivi fondamentali:

Spettroscopia IR e Raman

1. lo spettro Raman viene generato dalla

differenza di due livelli elettronici (la cui

differenza è pari ad un livello vibrazionale); la

sorgente dello spettrometro è perciò nel

visibile, anche se ora sono molto diffuse

sorgenti nel NIR .

2. gli spettri Raman ed IR

differiscono per le regole di

selezione delle transizioni.

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Le due tecniche sono perciò complementari:

nello spettro FT-IR del Dicloro-acetofenone è evidente lo stiramento del legame

C=O a circa 1700 cm-1, che è quasi assente nello spettro FT-Raman.

Spettroscopia IR e Raman

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la polarizzabilità molecolare deve

variare con la distanza internucleare.

Regola di selezione

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Regola di selezione

+

Gli elettroni in una molecola

formano una ”nuvola” di carica

elettronica intorno ai nuclei che

costituiscono lo scheletro

molecolare (figura a).

a

+

E + -

b

Sotto l’effetto del campo elettrico (E) della

radiazione elettromagnetica questa nuvola viene

deformata (figura b) in modo tale che si forma un

momento di dipolo elettrico μ proporzionale al

campo secondo la relazione: m=aE

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Regola di selezione

La polarizzabilita’ e’ una misura della distorsione della nuvola elettronica, ossia della mobilità degli elettroni, in presenza del campo elettrico :

tanto maggiore è la polarizzabilità, tanto piu’ facilmente la nuvola elettronica si orienta secondo la direzione del campo in modo da

generare un momento indotto piu’ grande.

+

E + -

b

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Regola di selezione

+

E + -

b

Per effetto della distorsione determinata nella distribuzione dei loro elettroni

e nella posizione dei loro nuclei,

le molecola apolari possono acquistare un momento dipolare quando sono

poste in un campo elettrico (momento di dipolo indotto)

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la polarizzabilità molecolare deve

variare con la distanza internucleare.

Regola di selezione

Per legami con un forte momento di dipolo (che sono attivi all’IR) la mobilità

per polarizzabilità è generalmente bassa.

Per legami che hanno un debole momento di dipolo, la polarizzabilità è

generalmente alta e gli stati vibrazionali di tale legame sono Raman attivi.

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REGOLA DI SELEZIONE GENERALE PER L’OSSERVAZIONE

DEGLI SPETTRI RAMAN VIBRAZIONALI:

•la polarizzabilità molecolare deve variare con la distanza internucleare.

•La regola di selezione specifica per le transizioni vibrazionali Raman

nell’ambito dell’approssimazione armonica è

Dv = ± 1

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Variazione di dipolo elettrico

Variazione di polarizzabilità

Lo stiramento simmetrico è una

vibrazione inattiva in infrarosso.

Comporta però una variazione della

polarizzabilità per cui questa

vibrazione e‘ Raman attiva.

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Lo stiramento anti-simmetrico è

una vibrazione infrarosso attiva.

E' invece Raman inattiva in

quanto non varia la

polarizzabilità.

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A vantaggio della tecnica Raman

sono il fatto che l’acqua e il vetro non causano interferenze,

diversamente dall’IR, e che le linee dello spettro Raman sono

generalmente più strette e quindi più semplici da identificare.

A vantaggio della tecnica IR

è invece il fatto che gli spettri siano solitamente più ricchi di

segnali e quindi la tecnica risulta di più generale applicazione

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Se la luce di eccitazione utilizzata per un esperimento Raman

coincide con la banda di assorbimento per una transizione

elettronica, si osserva una grande aumento di intensità dello spettro

Raman.

Questa tecnica si chiamata spettroscopia Raman Risonante (RR).

Ne segue che il processo di risonanza Raman è accoppiato al

processo della transizione elettronica con intensificazione del segnale

Raman che può essere anche di ordini di grandezza rispetto alla

spettroscopia Raman.

L’intensificazione del segnale dipende dal coefficiente molare di

assorbimento della banda elettronica e dalla vicinanza della

lunghezza d’onda di eccitazione con la lunghezza d’onda della

transizione elettronica.

Spettroscopia Raman Risonante

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Spettroscopia Raman Risonante

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Questa tecnica trova utilizzo nello studio di biomolecole che

presentano un forte assorbimento nel visibile e nell'ultravioletto.

Possibilità di misurare selettivamente lo spettro di assorbimento di

un cromoforo anche in presenza di un forte background di altre

bande vibrazionali

Spettroscopia Raman Risonante

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Molti aminoacidi hanno transizioni elettroniche con massimi di

assorbimento nella stessa regione dell'assorbimento del gruppo

peptidico.

Perciò, se gli aminoacidi fanno parte di una catena polipeptidica, è

difficile osservarne gli spettri di RR, poiché le loro transizioni

elettroniche hanno un coefficiente di estinzione molare minore di

quella del gruppo peptidico e sono inoltre in numero minore

rispetto ai legami peptidici.

Ne segue che gli aminoacidi che meglio si rivelano in RR

sono quelli che assorbono a l>230 nm e cioè gli aminoacidi

aromatici.

Spettroscopia Raman Risonante

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Gli spettri di RR della Phe, Tyr e Trp,

ottenuti con varie frequenze di eccitazione

sono dominati dai modi dell'anello

benzenico.

Variando semplicemente la lunghezza d'onda della radiazione incidente, che

e' in risonanza con i diversi stati elettronici eccitati, nei tre spettri sono intensificati modi differenti (hanno cioe’ profili di eccitazione differenti).

Perciò e' possibile distinguere le bande

dei diversi cromofori aromatici, anche

in spettri di proteine molto complicate,

semplicemente variando la lunghezza

d'onda della radiazione incidente.

Spettroscopia Raman Risonante

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Spettroscopia Raman Risonante

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Il rapporto tra le intensità

tra le bande, I850/I830,

della tirosina e’ una sonda

sensibile dello stato del

legame ad idrogeno e di

ionizzazione del gruppo

OH della tirosina. Si ha

variazione di intensità del

doppietto a seconda che la

tirosina sia esposta al

solvente o sepolta

all’interno della proteina.

Spettroscopia Raman Risonante

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Il riscaldamento porta alla rottura dei legami a H

delle catene polipeptidiche e delle interazioni

idrofobiche e idrofiliche, comportando una

esposizione della tirosina.

Spettroscopia Raman Risonante

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La spettroscopia Raman e' sicuramente una metodica molto

importante per lo studio del DNA.

Spettri Raman del DNA

Entrambe le spettroscopie Raman convenzionale e

risonante forniscono informazioni strutturali.

Per un esperimento di RR la lunghezza d'onda della

radiazione eccitatrice deve cadere all'interno della

banda di assorbimento della molecola, che per gli acidi

nucleici va tra 200 e 280nm. D'altra parte, pero' in

questa maniera si perdono tutte le informazioni

strutturali provenienti dalle vibrazioni dello scheletro.

E‘ per questa ragione che la maggior parte degli studi

sul DNA e RNA sono stati eseguiti utilizzando

l'effetto Raman classico, adoperando righe eccitatrici

nel visibile.

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La spettroscopia Raman e' sicuramente una metodica molto

importante per lo studio del DNA.

Spettri Raman del DNA

La spettroscopia si è rivelata molto utile per

distinguere i vari tipi di DNA grazie a bande

marker sensibili sia al tipo di base sia alla

conformazione dello zucchero

Le vibrazioni delle basi contengono

informazioni strutturali concernenti le

interazioni di stacking delle basi ed i legami ad

idrogeno fra le basi. Le alterazioni indotte nello

spettro Raman delle basi sono dovute a

cambiamenti conformazionali.

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Spettri Raman del DNA