PUBLISKAIS GADA PĀRSKATS

1

VALSTS ZINĀTNISKAIS INSTITŪTS

ATVASINĀTA PUBLISKA PERSONA

LATVIJAS BIOMEDICĪNAS PĒTĪJUMU UN STUDIJU

CENTRS

PUBLISKAIS GADA PĀRSKATS

2020

APSTIPRINU

Direktors

_____________ N.Rostoks

2021. gada 28. maijā

Rīga 2021

2

SATURS

1. PAMATINFORMĀCIJA ....................................................................................... 3

1.1. Juridiskais statuss un struktūra ........................................................................ 3

1.2. Galvenās funkcijas un uzdevumi..................................................................... 5

1.3. Galvenie zinātnes virzieni ............................................................................... 6

1.4. Stratēģiskie ilgtermiņa un vidējā termiņa mērķi ............................................. 7

2. ZINĀTNISKĀS DARBĪBAS REZULTĀTI .......................................................... 9

2.1. Īstenotie pētījumu projekti .............................................................................. 9

2.1.1. LZP Fundamentālie un lietišķie pētījumu projekti ................................... 9

2.1.2. Valsts pētījumu programmas projekti .................................................... 15

2.1.3. Starptautiskie pētniecības un attīstības projekti, tai skaitā nacionālais

līdzfinansējums ..................................................................................................... 18

2.1.4. Valsts vai pašvaldības budžeta iestāžu finansētie projekti .................... 20

2.1.5. ERAF projekti ........................................................................................ 20

2.1.6. Starptautiskie un vietējie pētniecības projektu līgumdarbi ................... 29

2.2. Zinātniskās publikācijas ................................................................................ 30

2.2.1. Zinātniskās publikācijas, kas iekļautas Web of Science vai SCOPUS... 30

2.2.2. Citas zinātniskās publikācijas ................................................................ 44

2.3. Intelektuālā īpašuma aizsardzība ................................................................... 44

2.3.1. Reģistrētie un uzturētie starptautiskie patenti ....................................... 44

2.3.2. Reģistrētie un uzturētie Latvijas patenti ................................................ 45

2.3.3. Pieteiktie starptautiskie patenti.............................................................. 46

2.3.4. Pieteiktie Latvijas patenti ...................................................................... 46

2.5. Akadēmisko un kvalifikācijas darbu izstrāde................................................ 47

2.5.1. Izstrādātie un aizstāvētie promocijas darbi ........................................... 47

2.5.2. Izstrādātie un aizstāvētie maģistra darbi ............................................... 47

2.5.3. Izstrādātie un aizstāvētie bakalaura darbi ............................................ 47

2.6. Organizētās konferences, kursi, semināri un vieslektoru uzstāšanās BMC .. 47

2.7. Cita institūtam būtiska informācija ............................................................... 48

3. FINANŠU RESURSI UN TO IZLIETOJUMS .................................................... 53

4. PERSONĀLS ....................................................................................................... 55

5. ATTĪSTĪBAS PERSPEKTĪVAS 2021.GADĀ .................................................... 56

3

1. PAMATINFORMĀCIJA

1.1. Juridiskais statuss un struktūra

Valsts zinātniskais institūts Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs

saskaņā ar 2006.gada 28.decembra MK noteikumiem Nr.1076 „Grozījumi Zinātniskās

darbības likumā” un LR IZM 2007.gada 10.janvāra lēmumu Nr.15.1-04/04 Valsts

aģentūra „Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs” kļuva par atvasinātu

publisku personu. BMC ir reģistrēts LR IZM Zinātnisko institūciju reģistrā ar

reģistrācijas Nr.181002 un atrodas LR IZM ministra pārraudzībā. BMC darbība

pamatojas uz Zinātniskās darbības likumu un BMC nolikumu, ar kuru saskaņā BMC

pārvalda zinātnieku koleģiāla institūcija – zinātniskā padome un direktors. Zinātnisko

padomi uz pieciem gadiem ievēlē BMC zinātnieku pilnsapulce, direktoru uz pieciem

gadiem ievēlē zinātniskā padome. 2020.gadā BMC tika ievēlēta jauna Zinātniskā

padome un par tās priekšsēdētāju tika ievēlēts D.biol. Jānis Kloviņš. 2020.gadā notika

arī direktora vēlēšanas, kuru rezultātā uz nākamajiem pieciem gadiem par direktoru tika

ievēlēts Dr.biol. Nils Rostoks.

2020.gadā BMC struktūrā izmaiņas nav notikušas.

4

1.attēls BMC struktūra

Zinātniskā padome

Direktors

Zinātniskais direktors

Cilvēka ģenētika un slimību

patoģenēzes mehānismi

Cilvēka ģenētikas un molekulārās medicīnas grupa

Medicīniskās ģenētikas un mitohondriju

pētījumu grupa

Molekulārās mikrobioloģijas

grupa

Ar G-proteīnu saistīto receptoru

funkcionālās izpētes grupa

Vēža izpēte

Vēža šūnu bioloģijas un melanomas

pētniecības grupa

Vēža biomarķietu un imunoterapijas

grupa

Vēža gēnu terapijas grupa

Strukturālā bioloģija,

biotehnoloģija un virusoloģija

Strukturālās bioloģijas grupa

Augu virusoloģijas grupa

Antibakteriālu un pretvēža līdzekļu

atlases grupa

Studiju direktors Servisa centri

Genoma centrs

Rekombinanto biotehnoloģiju servisa centrs

Šūnu kultūru un mikroskopijas servisa centrs

Laboratorijas dzīvnieku servisa

centrs

Bioinformātikas servisa centrs

Direktora vietnieks finanšu un

administratīvajos jautājumos

Projektu un attīstības daļa

Finanšu un grāmatvedības

daļa

Saimnieciskā un tehniskā

nodrošinājuma daļa

Iepirkumu un sagādes daļa

Lietvedība

Personāla un darba aizsardzības

speciālists

Starptautiskā konsultatīvā

padome

Studentu padome

5

1.2. Galvenās funkcijas un uzdevumi

BMC savu darbību veic saskaņā ar BMC nolikumu, kurā ir definētas šādas BMC

funkcijas:

zinātniskās darbības īstenošanu molekulārajā bioloģijā, ģenētikā, bioķīmijā,

biomedicīnā, biotehnoloģijā un citās zinātņu nozarēs;

zinātnes un augstākās izglītības integrētas attīstības veicināšanu bioloģijas,

ķīmijas, medicīnas un citās zinātņu nozarēs;

pakalpojumu un līgumpētījumu nodrošināšanu Latvijas un ārvalstu

pasūtītājiem;

valsts un starptautisku pētījumu projektu un pētniecības programmu

sagatavošanu, pieteikšanu un īstenošanu;

priekšlikumu sagatavošanu un sniegšanu valsts prioritāšu veidošanā zinātnē,

augstākajā izglītībā un inovācijās;

zinātniskās ekspertīzes veikšanu un Latvijas interešu pārstāvēšanu

starptautiskajās institūcijās atbilstoši BMC kompetencei;

laboratoriskās diagnostikas pakalpojumu sniegšanu un jaunu diagnostikas

līdzekļu un individualizētas terapijas izstrādi.

Lai īstenotu noteiktās funkcijas, BMC veic šādus uzdevumus:

īsteno fundamentālos un lietišķos pētījumus, kas saistīti ar molekulāro

bioloģiju, ģenētiku, bioķīmiju, biomedicīnu, biotehnoloģiju un citām zinātņu

nozarēm;

iesaistās studiju procesā un nodrošina visu līmeņu studentu apmācību

sadarbībā ar Latvijas un ārvalstu augstskolām;

veicina zinātnisko pētījumu rezultātu praktisku izmantošanu, izstrādājot

jaunas tehnoloģijas un produktus, t.sk. bioloģiski aktīvas vielas,

biotehnoloģijas produktus un medicīniskos diagnostikas līdzekļus.

attīsta sadarbību ar citām zinātniskajām institūcijām, iesaistās organizācijās,

biedrībās un asociācijās;

izstrādā un īsteno programmas un pasākumus zinātniskās kvalifikācijas

celšanai;

organizē zinātniskas konferences, seminārus un lekcijas;

izdod informatīvus materiālus;

veido bioloģisko materiālu kolekcijas (biobankas), kā arī klīniskās un

ģenētiskās informācijas datu bāzes;

uztur un attīsta laboratorisko izmeklējumu metodoloģisko, materiāli tehnisko

bāzi un kvalitātes vadības sistēmas medicīnā un citās nozarēs, veic

laboratoriskās diagnostikas pakalpojumus;

veic citos zinātnisko darbību regulējošajos normatīvajos aktos noteiktos

uzdevumus.

6

1.3. Galvenie zinātnes virzieni

BMC Attīstības stratēģijā 2015.-2020.gadam ir definēti trīs galvenie zinātniskie

virzieni:

cilvēka ģenētika un slimību izpēte;

vēža izpēte;

biotehnoloģija, struktūrbioloģija un virusoloģija.

Cilvēka ģenētikas un slimību izpētes virziena ietvaros BMC tiek veikti

genoma, epigenoma, mikrobioma un ar slimību patoģenēzi asociēto mehānismu izpēte,

dažādu biomarķieru atklāšana un molekulāri diagnostisko testu izstrāde. Būtiski

panākumi pēdējo gadu laikā ir sasniegti, izveidojot unikālu biobanku, Valsts

iedzīvotāju genoma datubāzi (turpmāk - VIGDB), kas apkopo vairāk nekā 35 000

dalībniekus no Latvijas populācijas un pacientus no dažādām slimību kohortām. Šī

biobanka kalpo kā galvenais resurss ģenētisko pētījumu ekspansijai BMC, kā arī bāze

inovatīviem un integrētiem pētījumiem. Kopumā šajā virzienā pētījumu veikšanu

nodrošina 4 zinātnieku grupas. Prof. Jāņa Kloviņa vadībā, kombinējot ģenētikas,

farmakogenomikas un funkcionālos pētījumus tiek izzināti slimību patoģenēzes un zāļu

iedarbības mehānismus metabolajām un endokrīnajām slimībā. Dr. Innas Iņaškinas

grupa nodrošina medicīniskās ģenētikas izpēti, kā arī veic ar mitohondrijiem saistīto

procesu pētīšanu koncentrējoties uz slimību attīstības mehānismu noskaidrošanu

molekulārajā līmenī. Dr. Renātes Rankas grupa veic medicīniski svarīgu

mikroorganismu dažādu bioloģisko funkciju molekulāro mehānismu izpēte ar īpašu

uzsvaru uz patogēnu-saimniekorganisma mijiedarbības procesiem tādām slimībām kā

tuberkuloze un dažādām ērču pārnēsātām infekcijas slimībām. Dr. Dāvida Fridmaņa

grupa ir orientēta uz G-proteīnus saistošo receptoru molekulāro un funkcionālo izpēti,

ka arī ir uzsākusi dažādas ar mikrobioma izpēti saistītas aktivitātes. Kopumā BMC

galvenais stratēģiskais mērķis šajā jomā ir sasaistīt augstas kvalitātes fundamentālo

izpēti ar klīniskajiem pētījumiem, lai atklātos slimību etioloģijas mehānismus un jaunos

zāļu mērķus un biomarķierus ieviestu klīniskajā praksē.

Vēža izpētes virzienā BMC tiek veikti gan fundamentāli pētījumi, kuru mērķis

ir padziļināt izpratni par vēža veidošanās un zāļu rezistences molekulārajiem

mehānismiem, gan arī praktiskas ievirzes pētījumi, kuru mērķis ir identificēt vēža

biomarķierus un zāļu mērķus, izstrādāt biomarķieru testus un jaunas ārstēšanas pieejas.

Pašlaik šajā virzienā aktīvi darbojas trīs pētnieku grupas. Dr. Linē vadītās Vēža

biomarķieru grupas galvenais pētījumu virziens ir «šķidro biopsiju» izstrāde

neinvazīvai audzēju diagnostikai, slimības gaitas prognozēšanai, savlaicīgai recidīvu

noteikšanai un terapijas izvēlei. Kā biomarķieru avots «šķidro biopsiju» izstrādei tiek

izmantotas ekstracelulārās vezikulas (EVs), kā arī šūnu brīvā DNS un RNS. Vienlaikus

grupa veic arī vēža producēto EV funkcionālo izpēti un izstrādā jaunus ārstēšanas

līdzekļus, izmantojot EVs kā nesējus terapeitisko aģentu piegādei audzēju šūnās.

Melanomas izpētes grupa Dr. Pjanovas vadībā nodarbojas ar melanomas ģenētiku -

augsta un vidēja līdz zema riska melanomas jutības gēnu identificēšanu, kā arī

imūnmodulatoru un onkolītisko vīrusu terapijas darbības mehānismu izpēti ar mērķi

paaugstināt to efektivitāti. Dr. Zajakinas vadītā Vēža gēnu terapijas grupa specializējas

jaunu gēnu terapijas vektoru izstrādē. Šī grupa ir izstrādājusi efektīvu alfa-vīrusu

vektoru sistēmu īslaicīgai intratumorālai terapeitisko gēnu piegādei un pašlaik to

7

pielieto dažādu citokīnu gēnu piegādei audzēja mikrovidē un pēta iespējas alfa-vīrusu

terapiju kombinēt ar ķīmijterapiju un imūnterapiju. Visi šie pētījumi tiek veikti ciešā

sadarbībā ar Latvijas lielākajām slimnīcām un plašu ārvalstu sadarbības partneru tīklu.

Biotehnoloģija ir viens no BMC vēsturiski visattīstītākajiem virzieniem, kurš

pēdējās desmitgades laikā ir būtiski papildināts ar struktūrbioloģiju. Abi virzieni ir cieši

saistīti, jo proteīnu struktūru noteikšanai tiek izmantoti biotehnoloģiski producēti

proteīni, savukārt iegūtās struktūras nereti norāda uz iespējām radīt jaunus

biotehnoloģiskus produktus. Ar vīrusveidīgo daļiņu tehnoloģijas palīdzību K. Tāra, A.

Kazāka un A. Zeltiņa grupās tiek izstrādātas vakcīnas pret tādām infekciozām cilvēku

saslimšanām kā Laimas slimība, gripa un Denges drudzis, kā arī dažādas veterinārās

vakcīnas pret neinfekciozām saslimšanām – atopisko dermatītu, alerģijām un

hroniskām sāpēm. Dažas no veterinārajām vakcīnām, kas ir tapušas sadarbībā ar

Šveices un Apvienotās Karalistes pētniekiem jau atrodas tehnoloģijas pārneses stadijā

un drīzumā varētu tikt ieviestas ražošanā. Strukturālajā bioloģijā liela uzmanība tiek

pievērsta vienpavediena RNS bakteriofāgu proteīnu izpētei, īpaši to vīrusveidīgo daļiņu

struktūru noskaidrošanā un racionālā modificēšanā jaunu vakcīnu dizainam. Citi

strukturālās bioloģijas virzieni ir vērsti uz jaunu zāļvielu racionālu dizainu pret

dažādiem mērķproteīniem, tajā skaitā ogļskābes anhidrāzēm un trimetilamīnu

producējošiem bakteriāliem enzīmiem. Laimas slimības izraisošās baktērijas Borrelia

burgdorferi virsmas proteīnu strukturālā izpēte savienojumā ar RNS fāgu vīrusveidīgo

daļiņu izpēti ir rezultējusies vairāku vakcīnu kandidātu izveidē, kuru efektivitāte ir

apliecināta dzīvnieku modeļos.

1.4. Stratēģiskie ilgtermiņa un vidējā termiņa mērķi

BMC Attīstības stratēģijā 2015.-2020.gadam ir noteikti ilgtermiņa un vidējā

termiņa mērķi BMC pētniecības programmas, institucionālā attīstības plāna,

cilvēkresursu attīstības plāna, infrastruktūras un starpinstitucionālās sadarbības

attīstības plāna, izglītības un publicitātes plāna ietvaros.

Pētniecības programmas ietvaros tiks veikti zinātniski pētnieciskais darbs piecu

zinātnisko virzienu ietvaros, veicinot katra virziena attīstību un rezultativitāti.

Institucionālā attīstības plāna ietvaros plānots strādāt pie BMC:

starptautiskās konkurētspējas paaugstināšanas, veicinot starptautisku

sadarbības projektu skaita pieaugumu;

pasākumiem akadēmiskās integritātes un ētikas normu ievērošanai;

zināšanu pārneses un inovāciju procesa pilnveides, veicinot legālo

aspektu konsolidāciju sadarbības projektos un inovāciju kapacitātes

palielināšanu, t.sk. zinātnisko pētījumu rezultātu komerciālizāciju;

institucionālās pārvaldības efektivitātes uzlabošanu.

Cilvēkresursu attīstības plāna ietvaros plānots strādāt pie pasākumiem

cilvēkresursu piesaistei un mobilitātes veicināšanai, atbalstot jaunas zinātniskā

personāla paaudzes veidošanos no piesaistītajiem studentiem un ārvalstu zinātnieku

piesaisti.

Infrastruktūras un starpinstitucionālas sadarbības attīstības plāna ietvaros

plānots strādāt pie:

8

jau esošo infrastruktūras objektu attīstības, turpinot pētniecības servisu

centru pilnveidi gan attīstot to pārvaldības modeļus, gan cilvēkresursu

profesionālo pilnveidi, kā arī izveidojot atvērtās tipa laboratorijas;

jauno infrastruktūras objektu attīstības atbilstoši Latvijas Viedās

specializācijas prioritātēm, kas sevī ietver gan BMC laboratoriju

telpiskā plānojuma un pārvaldes koncepta izstrādi, gan radioloģijas

laboratoriju kompleksa izveidi, gan personalizētās medicīnas, inovatīvo

terapiju un diagnostikas kompleksa izstrādi;

starpinstitucionālās sadarbības stiprināšanā izveidojot un attīstot

Struktūrbioloģijas centru, personalizētās medicīnas konsorciju un

nacionālo biobankas tīklu, kā arī vienota un koordinēta zinātniskās

infrastruktūras attīstības stratēģijas izveides Latvijā.

Izglītības un publicitātes plāna ietvaros plānots strādāt pie:

BMC integrācijas apmācības procesa organizēšanā augstākās izglītības

iestādēs, veicinot sadarbību ar augstākās izglītības iestādēm gan

bakalaura, gan maģistra, gan doktora studiju programmu izstrādē,

īstenošanā un studējošo praktiskā apmācībā;

Starptautisku kursu un konferenču organizēšanas, kā arī publicitātes gan

vietējā, gan starptautiskā mērogā paplašināšanas.

9

2. ZINĀTNISKĀS DARBĪBAS REZULTĀTI

2.1. Īstenotie pētījumu projekti

BMC zinātniskās pētniecības darbība ir balstīta gan uz Latvijas, gan

starptautiska mēroga zinātniskās pētniecības projektu īstenošanu. 2020.gadā no

starptautisku mēroga projektiem tika uzsākta divu jaunu ERA-NET projektu īstenošana

un viena jauna Horizon 2020 projekta īstenošana.

Latvijas mēroga projekti 2020.gadā piedzīvoja strauju pieagumu, jo BMC ļoti

veiksmīgi startēja Valsts pētījumu programmas “Covid-19 seku mazināšanai”

izsludinātajā konkursā, kura ietvaros ieguva iespēju īstenot divus projektus kā

vadošajam partnerim, bet vēl četros projektos piedalīties kā sadarbības partnerim. Kā

arī BMC veiksmīgi startēja Latvijas Zinātnes padomes (turpmāk – LZP) izsludinātajos

Fundamentālo un lietišķo pētījumu projektu (turpmāk – FLPP) konkursos, kuros

kopumā ieguva iespēju realizēt trīspadsmit projektus. 2020.gadā BMC aktīvi piedalījās

ERAF 1.1.1.1.pasākuma “Praktiskas ievirzes pētījumi” 4.kārtas projektu konkursā,

kura ietvaros tika apstiprināti pieci BMC projekti, kuru īstenošana tiks uzsākta

2021.gadā. Tāpar arī BMC piedalījās ERAF 1.1.1.2.pasākuma “Pēcdoktotorantūras

pētniecības atbalsts” 4.projektu atlases kārtas konkursā, kur ieguva tiesības sākot ar

2021.gadu īstenot trīs jaunus pēcdoktorantūras projektus.

BMC 2020.gadā uzsāka viena jauna ERAF 1.1.1.1.pasākuma “Praktiskas

ievirzes pētījumi” 3.kārtas projekta īstenošanu, četru jaunu ERAF 1.1.1.2.pasākuma

“Pēcdoktotorantūras pētniecības atbalsts” projektu istenošanu, divu jaunu ERAF

1.2.1.2. pasākuma "Atbalsts tehnoloģiju pārneses sistēmas pilnveidošanai" projektu

īstenošanu, kā arī jau 2019.gadā apstiprinātu piecu jaunu LZP FLPP projektu

īstenošanu.

2020.gadā turpināja VIGDB projekta īstenošanu, ERA-NET, Horizon 2020,

ERAF 1.1.1.1.pasākuma “Praktiskas ievirzes pētījumi” 1.kārtas un 2.kārtas projektu

īstenošanu, ERAF 1.1.1.2.pasākuma “Pēcdoktotorantūras pētniecības atbalsts” 1.kārtas

un 2.kārtas projektu īstenošanu, ERAF 1.1.1.4.pasākuma “P&A infrastruktūras

attīstīšana viedās specializācijas jomās un zinātnisko institūciju institucionālās

kapacitātes stiprināšana” projekta īstenošanu, ERAF 1.1.1.5.pasākuma “Atbalsts

starptautiskās sadarbības projektiem pētniecībā un inovācijās” 2.kārtas projekta

īstenošanu, ERAF 1.2.1.2. pasākuma "Atbalsts tehnoloģiju pārneses sistēmas

pilnveidošanai" 1.kārtas projekta īstenošanu, LZP FLPP 2018.gada konkursa projektu

īstenošanu.

2.1.1. LZP Fundamentālie un lietišķie pētījumu projekti

1. Projekts Nr. lzp-2018/1-0156 „Hemokīnu receptoru CCR1, CCR2 un EBV

infekcijas izpēte jaunu marķieru meklējumiem, kurus būtu iespējams pielietot

augsta progresijas riska hroniskas limfocitārās leikēmijas prognozēšanai”

Vadošais partneris – Rīgas Stradiņa universitāte

BMC projekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol. A.Leončiks

Īstenošanas laiks – 01.09.2018.-31.08.2021.

Pētnieciskais darbs LZP projekta FLPP-0156 ietvaros tika veikts divos galvenos

virzienos. 2020.gadā tika analizēta 15 Bērkita limfomas un 2 LCL limfoidālo šūnu

10

līniju CCR1, CCR2, CCR3, CCR5 kemokīna receptoru un EBNA2, LMP1, LMP2A

EBV vīrusa latences gēnu proteīnu ekspresija izmantojot imunoblota metodi. Otrs

darba virziens bija saistīts ar vairāk kā 30 CLL leikēmijas pacientu perifēro asins

mononukleāro šūnu CCR1 kemokīna receptora otrā eksona genoma reģiona PCR

amplifikāciju, iegūtās DNS klonēšanu E.coli vektorā un sekojošu gēnu sekvenēšanu,

lai analizētu mutāciju variantus, kas ļautu noteikt likumsakarības starp slimības

agresivitātes rādītājiem un CCR1 eksona nukleotīdu polimorfismu.

2. Projekts Nr. lzp-2018/1-0180 „Mitohondriālās DNS mutāciju un variantu ar

nezināmu efektu raksturošana un analīze, izmantojot transmitohondriālos

citoplazmatiskos hibrīdu šūnu modeļus”

Projekta vadītāja - vadošā pētniece Dr.biol. I.Iņaškina


2020. gadā turpinājās pacientu, ar aizdomām par mitohondriālajām saslimšanām,

iesaiste projektā. Iesaistītajiem indivīdiem tika veikta pilna garuma mtDNS analīze, kā

arī citi ģenētiskie izmeklējumi, pēc nepieciešamības (kopiju skaita, heteroplazmijas

līmeņa un delēciju noteikšana), tika veikta arī enzīmu kompleksu aktivitātes noteikšana

perifērajās asinīs. Turpinājās transmitohondriālo hibrīdu šūnu, kas satur patoloģiskas

mtDNS mutācijas, OXPHOS sistēmas analīze. Tika uzsākta cilvēka ādas fibroblastu

iegūšana un kultivēšana, kā arī kontroles grupas veidošana. Turpinājās darbs pie

transmitohondriālo hibrīdu šūnu transkriptoma profilu analīzes un validācijas.

3. Projekts Nr. lzp-2018/1-0208 „Audzēju makrofāgu funkcionālā

programmēšana ar vīrusu imūnterapijas vektoriem krūts vēža modelī”

Projekta vadītāja - vadošā pētniece Dr.biol. A.Zajakina


Projekta gaitā tika izstrādāts 3D šūnu kultūras modelis audzēju makrofāgu (TAM)

mērķtiecīgai programmēšanai. Alfavīrusu vektori, kas ražo pārprogrammēšanas

citokīnus (TNF-alfa, IFN-gamma, IL-12) un efektoru molekulas (anti TGF-beta

peptīdi), tika pielietoti, lai aktivizētu TAM pretvēža īpašības 3D audzēja šūnu vidē,

izmantojot heterotipiskas sferoidālas krūts vēža sistēmas. Pašlaik tiek pētīti TAM

programmēšanas nosacījumi un papildu faktori, kuri nosaka vēža šūnu migrāciju TAM

klātbūtnē. Projekta rezultātiem ir liela zinātniska nozīme vēža izpētes jomā un jaunu

imūnterapijas stratēģju izveidē. Projekta rezultāti tika prezentēti starptautiskajā

konferencē “Perspective technologies

of vaccination and immunotherapy, October 27-29, 2020.

4. Projekts Nr. lzp-2018/1-0269 „Prostatas vēža šūnu producētās ekstracelulārās

vezikulas kā šķidrās biopsijas un terapijas mērķi”

Projekta vadītāja - vadošā pētniece Dr.biol. A.Linē

Sadarbības partneris – Rīgas Stradiņa univeristāte


Tika izstrādāti jauni reaģenti prostatas vēža producēto EV subpopulāciju izolēšanai

no pacientu bioloģiskajiem šķidrumiem – pirmkārt, skrīnējot raugu virsmas displeja

bibliotēku, tika meklētas nanovielas (nanobodies), kas spēj selektīvi saistīties ar

prostatas vēža producētajām EVs. Otrkārt, tika optimizēta metodika anti-PSMA un

CD63 antivielu konjugācijai ar magnētiskām nanodaļiņām un parādīts, ka ar to

11

palīdzību ir iespējams izolēt specifiskas EV subpopulācijas no cilvēku asins un urīna

paraugiem. Vienlaikus, tika izstrādāts jauns modelis hipoksisko vēža šūnu producēto

EV vizualizēšanai un funkcionālajiem pētījumiem.

5. Projekts Nr. lzp-2018/1-0395 „Dzimte, dzimums un statuss dzelzs laikmetā

Latvijas teritorijā (7. – 12. gadsimts)”

Vadošais partneris – Latvijas Universitāte

BMC projekta vadītāja - vadošā pētniece Dr.biol. R.Ranka


Ir veikta senās DNS izdalīšana no vairākiem arheoloģiskiem kaulu un zobu

paraugiem, kas iegūti arheoloģisko izrakumu laikā dzelzs laikmeta apbedījumos

Latvijā. Izmantojot dažādus bioinformātikas analīzes rīkus un metodes, atsevišķos

gadījumos ir izdevies noteikt indivīda dzimumu un mtDNS haplogrupu. Atsevišķos

zobu paraugos ir veikta mikrobioma analīze un noteikta iespējamo seno patogēnu un

mutes mikroorganismu klātbūtne.

6. Projekts Nr. lzp-2018/2-0059 „Ārvides un ģenētisko faktoru mijiedarbība

vairogdziedzera autoimūno slimību imunoloģiskās attīstības mehānismos”

Vadošais partneris – Rīgas Stradiņa universitāte

BMC projekta vadītāja - vadošā pētniece Dr.biol. V.Rovīte


Veika genotipēšana visiem projekta laikā iegūtajiem autoimūno vairogdziedzeru

pacientu un kontroles grupas paraugiem, papildus atlasīti un genotipēti arī autoimūno

vairogdziedzeru pacientu paraugi no biobankas. Papildus viriem genotipētajiem

paraugiem atlasīti un sagatavoti paraugi selēna un selēna proteīnu analīzēm, kas veiktas

projekta ietvaros. Veicot iegūto datu statistisko analīzi atklāti vairāki lokusi, kas saistīti

ar autoimūno saslimšanu attīstības risku un selēna līmeni organismā, pašlaik tiek veikta

manuskripta sagatavošana.

7. Projekts Nr. lzp-2018/2-0088 „Farmakokinētikas matemātiskais modelis

metformīna terapijas personalizētai optimizācijai”

Projekta vadītājs - vadošā pētnieka v.i. Dr.sc.ing. E.Stalidzāns

Sadarbības patneris – Latvijas Universitāte


Izstrādāts fizioloģijā balstīts metformīna farmakokinētikas modelis cilvēka audiem,

modeļa parametrus ņemot no metformīna koncentrācijas dinamikas mērījumiem

atbilstošajos peles audos. Modelis apraksta metformīna koncentrācijas dinamiku

plazmā, eritrocītos, zarnās, aknās, nierēs, muskuļos, smadzenēs, sirdī, kuņģī, plaušās

un taukaudos. Izstrādātais modelis nākotnē var tikt pielietots transportieru ietekmes uz

metformīna farmakokinētiku modelēšanai.

8. Projekts Nr. lzp-2018/2-0171 „Ētiski un sociāli atbildīga pētniecības biobanku

pārvaldība Latvijā: sabiedrības, donoru un zinātnieku viedokļu analīze”


BMC projekta vadītāja - vadošā pētniece Dr.biol. V.Rovīte


12

Apkopoti projekta laikā iegūtie dati no sabiedrības, biobankas donoru un zinātnieku

aptaujām un kvalitatīvajām intervijām. Sagatavoti pētījuma ziņojumi par pētīto interešu

grupu viedokli atteicībā uz biobanku pārvaldību Latvijā un sagatavotas vadlīnijas

rīcībpolitikas veidošanai biobanku pārvaldības jomā Latvijā. Publicēta viena

starptautiska mērroga un viena nacionāla līmeņa publikācijas.

9. Projekts Nr. lzp-2019/1-0075 „Vispārējā un mastīta uzņēmības ģenētiskā fona

raksturošana vietējās izcelsmes atgremotājšķirnēm Latvijā”

Vadošais partneris – Latvijas Lauksaimniecības universitāte

BMC projekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol. D.Fridmanis


Šī projekta ietvaros tika veikta ģimenes koka analīze visiem reģistrētajiem

Latvijas atgremotāju šķirņu dzīvniekiem un ģenētisko resursu centros noglabāto

sēklas paraugu donoriem. Šo analīžu rezultātā tika identificēti 32 dzīvnieki – 8 no

katras šķirnes un 4 no katra dzimuma, no kuriem tika ievākti asins vai ģenētisko

resursu centru donoru gadījumā iegūti spermas paraugi. No šiem paraugiem tika

izdalīts ģenētiskais materiāls un veikta pilna genoma sekvencēšana.

10. Projekts Nr. lzp-2019/1-0116 „Cilvēka asins mikrobioma izcelsmes un izmaiņu

izpēte un tā saistība ar hroniskajām slimībām”

Projekta vadītājs – vadošais pētnieks Dr.biol. J.Kloviņš


Uzsākta veselu brīvprātīgo un arī kairināto zarnu sindroma pacientu iesaiste

pētījumā un nepieciešamo bioloģisko paraugu un saistīto datu ievākšana. Veikta

pirmo iesaistīto indivīdu bioloģisko paraugu apstrāde: 16S rRNS V3-V4 amplikonu,

visa metagenoma un transkriptoma bibliotēku sagatavošana, sekvenēšana un datu

pirmapstrāde. Ir uzsākta iekaisīgu zarnu slimību un 2.tipa cukura diabēta pacientu

atlase no Valsts iedzīvotāju genoma datubāzes.

11. Projekts Nr. lzp-2019/1-0131 „Uz augu vīrusiem balstītu vakcīnu iegūšanas

bakteriālo platformu izstrāde”

Projekta vadītājs – vadošais pētnieks Dr.biol. A.Zeltiņš


Konstruētas piecas uz augu vīrusiem līdzīgajām daļinām (VLP) balstītas

bakteriālās ekspresijas sistēmas. Eksprerimentālās vakcīnas attīrītas no

rekombinanto baktēriju biomasas, raksturotas un sagatavotas peļu imunizācijām.

Publicēts viens apskata raksts (Viruses) un viens eksperimentālos rezultātus

apkopojošs raksts par augu VLP struktūras ietekmi uz vakcīnu imunogenicitāti

(Journal of Controlled Release).

12. Projekts Nr. lzp-2019/1-0142 „Augstas kapacitātes ārpusšūnu vezikulu

izdalīšana ar plūsmas lauka frakcionēšanas metodi mikrofluīdikā”

Vadošais partneris – Latvijas Universitates Cietvielu fizikas institūts

BMC projekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol. A.Ābols


Ir notestēti vairāki alternatīvi materiāli no kā izgatavot ārpusšūnas vezikulu

(EV) izdalīšanas mikroiekārtas. Tika optimizēti 3 mikroiekārtas pagatavošanas

13

protokoli no PDMS un testētas to hermētisms un mikroplūsmas, kā arī to spēja

sadalīt mikrodaļiņas pielietojot komerciālas silikona lodītes.

13. Projekts Nr. lzp-2019/1-0225 „Multidisciplinārs pētījums par sadzīvē iegūtas

sepses pacientiem izdzīvotājiem Latvijā”


BMC projekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol. J.Kloviņš


Projekts ir saņēmis pozitīvu Centrālās medicīnas ētikas atzinumu (16.12.2020,

Nr. 01-29.1/6358). Uzsākta anonimizēto Veselības aprūpes kvalitātes un

efektivitātes publiskās monitorēšanas sistēmas datu ieguve un analīze, lai vērtētu

sepses un septiska šoka gadījumu ilgtermiņa iznākumus, kā arī tiek turpināta datu

vākšana par sepses un septiska šoka pacientu klīnisko gaitu P.Stradiņa Klīniskajā

universitātes slimnīcā.

14. Projekts Nr. lzp-2020/2-0082 „Netradicionālo raugu Kluyveromyces marxianus

evolucionāra adaptācija uz etiķskābes stresu un adaptācijas mehānismu izpēte”

Vadošais partneris – Latvijas Lauksaimniecības universitāte



Projekta ietvaros tika veikta padziļināta literatūras izpēte un izstrādāts detalizēts

eksperimentu plāns. Paralēli šīm darbībām tika veikta sadarbības partnera

darbinieku apmācība paraugu ievākšanas un atbilstošas uzglabāšanas jautājumos.

15. Projekts Nr. lzp-2020/2-0369 „Bakteriofāga-izcelsmes dsRNS kā potenciāls

līdzeklis pret koronovīrusu”

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. D.Pjanova


Projekta ietvaros sagatavoti protokoli darbam in vitro šūnu kultūrās. Kā modeli

izmantojot plaušu adenokarcinomas šūnu līniju A549, novērtēta Larifan citotoksiskā

ietekme uz minētajām šūnām, lai līdzīgas analīzes veiktu jau epitēlija šūnās, kas ir

galvenais šī projekta mērķa objekts. Kārtoti regulatorie (vīrusa iegāde u.c.) jautājumi

darbam ar infekcioziem vīrusiem.

16. Projekts Nr. lzp-2020/2-0371 „Vistu vanagu (Accipiter gentilis) ģenētiskais

raksturojums Rīgā - savvaļas populāciju genomikas pētījumu uzsākšana”

Projekta vadītājs – pētniece Dr.biol. I.Kalniņa


Projekts tiek galvenokārt fokusēts uz neinvazīvi ievāktu paraugu izmantošanu,

ko bieži raksturo zema kvalitāte. Ņemot vērā, ka šādu paraugu, piemēram, mesto

putnu spalvu, apstrāde ir saistīta ar dažādiem sarežģījumiem, pirmais solis projekta

īstenošanā bija DNS izolēšanas protokola sagatavošana pēc literatūrā pieejamajiem

datiem un metožu izmēģinājums praksē. Pēc iegūtajiem datiem tika izvēlēts

optimizēts protokols, kas pamatojas uz QIAamp DNA mini reaģentu komplekta

darba plūsmu ar vairākām modifikācijām, tostarp izmaiņām paraugu līzes un

eluācijas soļos. Paralēli, pamatojoties uz esošo paraugu kolekciju, izveidots plāns

14

jaunu paraugu ievākšanai pavasara sezonā, kas varētu papildināt pētījumu ietvaros

iegūstamo informāciju.

17. Projekts Nr. lzp-2020/2-0372 „GPCR funkcionālo pētījumu virziena

stiprināšana, uzlabojot jauno peptīdu ligandu identifikācijas sistēmu”

Projekta vadītājs – vadošais pētnieks Dr.biol. D.Fridmanis


Projekta ietvaros tika veikti sagatavošanas darbi, lai verificētu izstrādātās Ar G-

proteīnu saistīto receptoru ligandu selekcijas sistēmas efektivitāti. Šo darbu ietvaros

tik radīta jauna randomizētu ligandu ekspresijas plazmīda un ataudzēta atbilstošā

celma rauga kultūra.

18. Projekts Nr. lzp-2020/2-0373 „ No kukaiņu zarnu trakta mikrofloras izolētu DNS

bakteriofāgu raksturošana”

Projekta vadītājs – vadošais pētnieks Dr.biol. A.Dišlers


Divu 2008. gadā no kukaiņiem izolētu siphoviridae DNS bakteriofāgu – (1)

Hafnia alvei fāga un (2) Lactococcus lactis fāga DNS sekvences datu apstrāde un

sagatavošana iesniegšanai GenBank datu bāzē. H.alvei fāga avots - Apis mellifera

un L.lactis fāga avots - Acronicta megacephala. Kolekcijā esošo citu no kukaiņiem

izolēto siphoviridae grupas fāgu gatavošana DNS sekvences analīzei.

19. Projekts Nr. lzp-2020/2-0374 „Ģenētisko mehānismu identifikācija personām ar

izolētu aukslēju šķeltni, izmantojot pilna genoma sekvenēšanu”

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.med. B.Lāce


2020. gadā no Valsts iedzīvotāju genoma datubāzes tika atlasīti personu, ar

izolētu aukslēju šķeltni, paraugi, kuriem paredzēts veikt pilna genoma

sekvencēšanas analīzi, tika veikta to kvalitātes kontrole.

20. Projekts Nr. lzp-2020/2-0376 „Cilvēka C hepatīta vīrusa patogenitātes saistība ar

vīrusa RNS atkarīgās RNS polimerāzes fermentatīvajām īpašībām”

Projekta vadītājs - pētnieks Dr.biol. J.Jansons

Sadarbības patneris – Rīgas Stradiņa universitāte


2020. gadā tika veikts darbs pie HCV NS5B proteīnu variantu ekspresijas

konstrukciju bibliotēkas veidošanas, klonējot NS5B sekvences no no pacientiem ar

patoloģisku un pastāvīgi normālu aknu enzīmu līmeni. Paralēli tika izstrādātas

topošo in vitro un in vivo eksperimentu ar NS5B variantiem detalizētās shēmas.

21. Projekts Nr. lzp-2020/2-0378 „Potenciālo Laima slimības vakcīnas kandidātu

strukturāls un imunoloģisks raksturojums”

Projekta vadītājs – pētnieks Dr.biol. K.Brangulis


Ņemot vērā projekta mērķi, - veikt Borrelia burgdorferi virsmas proteīnu

strukturālu, funkcionālu un immunoloģisku raksturojumu, projekta ietvaros tika

veikta izvēlēto proteīnu kodējošo gēnu amplifikācija, klonēšana un ekspresija

15

Escherichia coli šūnās, lai iegūtos proteīnus tālākajā prosesā attīrītu, kristalizētu un

raksturotu to imunoloģiskās īpašības.

22. Projekts Nr. lzp-2020/2-0380 „ Mikrobioma ārpusšūnu vezikulu satura un tā

ietekme uz vēža attīstību izpēte pielietojot zarnas uz čipa sistēmu”

Projekta vadītājs – vadošais pētnieks Dr.biol. A.Ābols

Sadarbības patneris – Latvijas Universitātes Cietvielu fizikas institūts


Tika pasūtīti sekvenēšanas reaģentu komplekti mikrobiotas ārpusšūnu vezikulu

sekvenēšanai. Kā arī veicām literatūras izpēti un protokolu izstrādi Caco2 un

HUVEC šūnu audzēšanai orgānu uz čipu sistēmās un mikrobiotas izdalīšanu no

fēcēm saglabājot anaerobās baktērijas.

2.1.2. Valsts pētījumu programmas projekti

1. Projekts Nr. VPP-COVID-2020/1-0004 „Drošu tehnoloģiju integrācija

aizsardzībai pret Covid-19 veselības aprūpes un augsta riska zonās”

Vadošais partneris – Rīgas Tehniskā universitāte

Sadarbības partneri – Rēzeknes Tehnoloģiju akadēmija, Latvijas Universitāte,

Elektronikas un datorzinātņu institūts, Latvijas Organiskās sintēzes institūts,

Latvijas Universitātes Cietvielu fizikas institūts, Rīgas Stradiņa universitāte,

Latvijas Valsts koksnes ķīmijas institūts

BMC projekta vadītājs - vadošā pētniece Dr.biol. A.Zajakina


Zinātnieku grupa no BMC strādāja projekta WP5 aktivitātes ietvaros, kurā

galvenais uzdevums bija izpētīt dažādu materiālu antivirālas īpašības. Potenciālas

dezinfekcijas vielas, antivirālie nanopārklājumi, UV starojuma avoti, kā arī jaunie

dabiskie tekstīlmateriāli, kurus izstrādāja konsorcijas dalībnieki, tika testēti, izmantojot

speciāli izveidotu rekombinantā RNS vīrusa testa sistēmu ar luciferāzes reportera gēnu.

Darba gaitā tika izpētītas materiālu virucidālās īpašības un tika atlasīti potenciāli

kandidāti talākiem pētījumiem. Projekta rezultātiem ir liela zinātniska un praktiska

nozīme aizsardzībai pret SARS-CoV19 un citiem patogēniem vīrusiem. Darba rezultāti

tika nopublicēti zinātniskā žurnālā Polymers, pieņemti prezentācijai vietejā konferencē,

kā arī tika iesniegti Latvijas patenta pieteikuma ietvaros.

2. Projekts Nr. VPP-COVID-2020/1-0008 „ Multidisciplināra pieeja COVID19 un

citu nākotnes epidēmiju monitorēšanai, kontrolei un ierobežošanai Latvijā”


Sadarbības partneri – Rīgas Stradiņa universitāte, Elektronikas un datorzinātņu

institūts, Rīgas Tehniskā universitāte, Pārtikas drošības, dzīvnieku veselības un

vides zinātniskais institūts BIOR, Latvijas Lauksaimniecības universitāte



16

Šī uz SARS-CoV-2 radīto seku novēršanu vērstā projekta ietvaros tika

izstrādāta un praksē aprobēts metožu kompleks vīrus nukleīnskābes noteikšanai

notekūdeņu paraugos. Šo metožu kompleksa pielietošana praksē regulāra dažādu

pašvaldību monitoringa ietvaros sniegs iespēju agrīni identificēt apdzīvotās teritorijas

kuras skāris slimības uzliesmojums. Iegūtie rezultāti arī apstiprināja, ka šāda pieeja ir

pielietojama arī citu infekciju ierosinātāju monitoringam un balstoties uz iegūtajiem

rezultātiem tika izstrādāts rekomendāciju kopums un rīcībās plāns šīs pieejas ieviešanai

praksē.

3. Projekts Nr. VPP-COVID-2020/1-0014 „Jaunu terapeitisko un profilaktisko

līdzekļu izstrāde pret COVID-19 un koronavīrusiem”

Projekta vadītājs – vadošais pētnieks Dr.biol. K.Tārs

Vadošais partneris – BMC

Sadarbības partneri – Latvijas Organiskās sintēzes institūts, Latvijas Universitāte,

Latvijas Universitātes Cietvielu fizikas institūts, Rīgas Tehniskā universitāte


Sadarbībā ar LU Cietvielu fizikas institūtu izveidots plaušu-uz-čipa modelis,

noderīgs turpmākajiem SARS-CoV-2 pētījumiem. Sadarbībā ar Latvijas Organiskās

sintēzes institūtu un Apvienotās Karalistes firmu “GenieBiotech” izveidotas jaunas

biokonjugācijas metodes, kuras sekmīgi pielietotas uz vīrusveidīgajām daļiņām bāzētas

Covid-19 vakcīnas kandidātu izveidē. Sadarbībā ar Latvijas Organiskās sintēzes

institūtu un Latvijas Universitāti izveidoti 5 preparāti, augsti aktīvi pret SARS-CoV-2

vīrusa metiltransferāzēm Nsp10/1 un Nsp10/14.

4. Projekts Nr. VPP-COVID-2020/1-0016 „COVID-19 saistīto paraugu biobankas

un asociēto datu integrētās platformas izveide Latvijā”


Vadošais partneris – BMC

Sadarbības partneri – Rīgas Stradiņa universitāte, Rīgas Tehniskā universitāte,

Latvijas Universitāte


Projekta galvenais mērķis bija atbalstīt aktivitātes, kas ierobežotu vīrusa

izplatīšanos, veicināt jaunu biomarķieru un ārstēšanas mērķu identificēšanu un jaunas

starptautiskas sadarbības izveidi. Neskatoties uz daudziem infekcijas slimību specifikas

izaicinājumiem, ir izveidoti augstas kvalitātes, labi pārvaldīta un droša biobanka un

datu apmaiņas resurss, kas Latvijā plaši izmantots COVID-19 pētniecībai. Biobanka

satur bioloģiskos materiālus un klīnisko informāciju no vairāk nekā 600 COVID-19

pacientiem un lielu daudzumu datu no dažādām molekulāriem un bioķīmiskiem

analīzēm. Ar slimnīcu, diagnostikas laboratoriju un pieredzējušu biobanku speciālistu

palīdzību ir izveidotas ļoti efektīvas pacietnu rekrutēšanas shēmas, lai iesaistītu

pacientus ar dažādu smaguma pakāpes COVID-19 simptomiem. Kopumā no katra

pacienta tika iegūti vismaz sešu veidu bioloģiskie paraugi, kas tika savākti un apstrādāti

BSL-2 laboratorijās, nodrošinot vairāk kā 60 paraugu un to alikvotu pieejamību no katra

pacienta. Šie paraugi tika analizēti, iegūstot cilvēka genoma datus, informāciju par

vīrusu genomiem un mikrobiomu metagenomiskās secības. Rūpīgi izvēlētiem COVID-

19 pacientiem tika veikta bagātīga citokīnu un citu bioķīmisko biomarķieru analīze, ko

papildināja RNS ekspresijas un asins metaboloma dati. Lai nodrošinātu visu ar COVID-

17

19 saistīto klīnisko un analītisko datu pieejamību pētniecībai un izmantošanai veselības

aprūpes praksē, tika izveidota integrēta datu platforma. Šī platforma satur gan primāros

datus, gan daudzus standarta analīzes rīkus, kā arī nodrošina piekļuvi sekundārajiem

datiem, tostarp darba vidi drošai COVID-19 specifisko datu koplietošanai. Visbeidzot,

mēs izveidojām sadarbību ar galvenajām starptautiskām iniciatīvām COVID-19 izpētē

un nodrošinājām datu deponēšanu to datubāzēs. Vēl viena šī projekta iezīme ir

koordinēta pētniecības un veselības aprūpes iestāžu sadarbības tīkla izveide Latvijā.

5. Projekts Nr. VPP-COVID-2020/1-0023 „Covid-19 infekcijas klīniskās,

bioķīmiskās, imūnģenētiskās paradigmas, un to korelācija ar sociāli

demogrāfiskiem, etioloģiskiem, patoģenētiskiem, diagnostiskiem, terapeitiski

un prognostiski nozīmīgiem vadlīnijās iekļaujamajiem faktoriem”


Sadarbības partneri – Latvijas Universitāte

BMC projekta vadītājs - vadošā pētniece Dr.biol. A.Linē, vadošā pētniece Dr.biol.

V.Rovīte


Tika izstrādāts jauna veida multiepitopu antivielu tests, kas dod iespēju vienlaicīgi

noteikt antivielas pret 30 SARS-CoV-2 proteīnu fragmentiem. Izmantojot šo testu, tika

izanalizētas IgG, IgA un IgM antivielu atbildes pret šiem antigēniem ~150 COVID-19

pacientu asins paraugos, kas ņemti dažādos laika posmos. Iegūtie rezultāti parādīja, ka

pacientiem ar vidēji smagu un smagu slimības gaitu IgG antivielas pret vairākiem

SARS-CoV-2 antigēniem veidojas agrāk un to līmenis ir augstāks, kā pacientiem ar

vieglu slimības gaitu. Rezultāti tika apkopti publikācijā, ko paredzēts iesniegt žurnālā

Frontiers in immunology un prezentēti LU 79. konferencē.

Izstrādāta un opitimizēta metode perifēro mononukleāro šūnu atdalīšanai no asinīm

un uzglabāšanai vienas šūnas RNS sekvencēšanai. Sadarbībā ar MGI Latvia ieviesta

Latvijas un pasaules mērogā jauna metode, kas balstās uz DNBelab C4 Single-Cell

metodoloģiju. Ieviestā metode izmantota COVID-19 pacientu imūnšūnu vienas šūnas

RNS sekvencēšanai, kuras rezultātā atklātas konkrētu citokīnu līmeņu izmaiņas

COVID-19 pacientu asinīs.

6. Projekts Nr. VPP-COVID-2020/1-0025 „Jaunās tehnoloģijas Covid-19

pacientu tēmētai monitorēšani, testēšanai un terapijai (3-T Project)”

Vadošais partneris – Paula Stradiņā Klīniskā universitātes slimnīca

Sadarbības partneri – Latvijas Universitāte

BMC projekta vadītājs - vadošā pētniece Dr.biol. R.Ranka


Ir veikta COVID-19 ātrā antigēna testa izstrāde, izmantojot iegūtās peļu

poliklonālās anti-RBD antivielas. Tika pārbaudītas daudzas antivielu kombinācijas un

reakcijas parametri. Testa veiktspējas novērtēšanai ir izmantoti siekalu paraugi no

pacientiem ar apstiprinātu COVID-19 diagnozi. Iegūtie rezultāti parādīja, ka testam ir

augsta diagnostiskā jutība saslimšanas sākumstadijā.

18

2.1.3. Starptautiskie pētniecības un attīstības projekti, tai skaitā nacionālais

līdzfinansējums

1. Horizon 2020 projekts Nr. 857572 „ INTEGRATION OF KNOWLEDGE AND

BIOBANK RESOURCES IN COMPREHENSIVE TRANSLATIONAL

APPROACH FOR PERSONALIZED PREVENTION AND TREATMENT OF

METABOLIC DISORDERS” (INTEGROMED)



Projekta pirmā gada laikā notika projekta partneru prof. Eran Segal (Veicmana

zinātnes institūts, Izraēla), prof. Charlotte Ling (Lundas Universitāte, Zviedrija) un

prof. Ewan Pearson (Dandī Universitāte, Lielbritānija) vizīte Latvijā, kuras laikā BMC

zinātnieki tika iepazīstināti par aktuālajiem sasniegumiem translācijas medicīnā un 2.

tipa cukura diabēta izpētē. 2020. gada oktobrī tiešsaitē notika 3 dienu projekta seminārs

''Klīnisko datu pārvaldība no biobanku un zinātnieku skatupunkta'', kurā piedalījās ap

70 dalībnieku no vairākām Eiropas valstīm, lektori no projekta partneru organizācijām,

BBMRI-ERIC un Microsoft. Papildus tam, INTEGROMED projekta ietvaros Latvijas

Biomedicīnas pētījumu un studiju centra zinātnieki ir organizējuši dažādus publiskus

pasākumus, gan festivāla LAMPA ietvaros, gan sadarbībā ar Rīgas Stradiņu

Universitātes medicīnas studentiem par mikrobioma pētniecību, biobanku

piedāvātajiem resursiem un jaunāko zinātnes atziņu izmantošanu praksē. Ir izstrādāta

un publicēta projekta mājaslapa (www.integromed.net), kā arī iegūts Centrālās

medicīnas ētikas komitejas atzinums, kas ļauj projeka ietvaros izmantot jau citos

projektos iegūtos datus jaunu metožu apgūšanai un izstrādei sadarbībā ar projekta

partneriem. BMC zinātnieki kopā ar Lundas Universitātes zinātniekiem 2020. gadā

nopublicēja pētījuma rezultātus Science Translational Medicine žurnālā par

metformīna terapijas efektivitātes un tolerances epiģenētiskajiem marķieriem.

2. Horizon 2020 projekts Nr. 951724 „Beyond 1M Genomes” (B1MG), sadarbības

projekts

BMC projekta vadītājs –pētnieka v.i. S.Mežinska

Īstenošanas ilgums – 01.09.2020.-31.08.2023.

Projekta WP2 ietvaros noteik darbs pie ētikas ietvara veidošanas pārrobežu

projektiem genoma izpētes jomā. Tiek analizētas dažādās Eiropas valstīs spēkā esošās

ētikas rīcībpolitikas un to piemērošana ES 1+ miljona genomu deklarācijas istenošanai.

Tiek izstrādāti minimālie standarti informētajai piekrišanai un dažādu grupu

iekļaušanai pētījumos - nepilgadīgie, personas, kuras nespēj sniegt piekrišanu,

neaizsargātas iedzīvotuāju grupas, kā arī mirušas personas.

3. ERA-NET projekts „Exploitation of extracellular vesicles for precision

diagnostics of prostate cancer (PROSCANEXO)”, sadarbības projekts

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol.A.Linē


Tika turpināts darbs pie ddPCR testu izstrādes prostatas vēža diagnostikai. Iepriekš

izveidotais RNS biomarķieru panelis tika paplašināts, tajā iekļaujot jaunus kandidātus,

http://www.integromed.net/

19

kas identificēti ekstracelulārajās vezikulās iekļauto RNS sekvenēšanas pētījumos, un

turpināts darbs pie RNS biomarķieru kvantificēšanai prostatas vēža pacientu urīnā,

izmantojot ddPCR. Tika sagatavots apskata raksts: Martín-Gracia B, Martín-Barreiro

A, Cuestas-Ayllón C, Grazú V, Line A, Llorente A, M de la Fuente J, Moros M.

Nanoparticle-based biosensors for detection of extracellular vesicles in liquid biopsies.

J Mater Chem B. 2020 Aug 12;8(31):6710-6738. doi: 10.1039/d0tb00861c.

4. ERA-NET projekts „Establishing an algorithm for the early diagnosis and

follow-up of patients with pancreatic neuroendocrine tumours (NExT)”,

sadarbības projekts

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. V.Rovīte


Iegūta ētikas komitejas atļauja paraugu ievākšanai Latvijā atbilstoši NEXT

konsorcija prasībām. Optimizēta nākamās paaudzes sekvencēšanas un bioinformātikas

analīzes metodes transkriptoma analīzei no aizkuņģa dziedera neiroendokrīno audzēju

organoīdu kultūrām un parafīnblokos ieslēgtiem audzēju audiem.

5. ERA-NET projekts „Nanoparticle Transfer Through Endothelial Barrier

(NanoTENDO)”, sadarbības projekts

Projekta vadītājs – vadošais pētnieks Dr.biol. J.Jansons


2020. gadā tika veikti dendrimēru nanodaļiņu un terapijas līdzekļu kompleksu

izveidošanas eksperimenti un iegūto kompleksu stabilitātes un citu īpašību testēšanā in

vitro eksperimentos. Balstoties uz rezultātiem, par Alcheimera slimības ārstēšanas

līdzekli tika izvelēts siRNA preparāts, kas specifiski izsauc ar slimības attīstību

saistīto MAPT gēnu noklusēšanu. Ir izstrādāta stratēģijā dendrimēru un pārnēsājamo

vielu iezīmēšanai ar fluorescentiem marķieriem, kas ļauj pētīt ievadīto zaļu izplatīšanu

organismā un spēju šķērsot asins-smadzeņu barjeru dzīvnieku eksperimentos.

Sakara ar Covi19 situāciju Spānijā un Polijā eksperimentu grafiks tika būtiski

kavēts, līdz ar to projekta partneri vienojas par projekta izpildes termiņa pagarināšanu.

6. ERA-NET projekts „Oligomer-Focused Screening and Individualized

Therapeutics to target Neurodegenerative Disorders (OligoFIT)”, sadarbības

projekts



Uzkonstruēta nejaušu peptīdu sekvenču saturošu fāga MS2 vīrusveidīgo daļiņu

(VLP) bibliotēka alfa-sinukleīna oligomēru antigēnu mimētiķu atlasei. Veikta alfa-

sinukleīna oligomēru mimētiķu atlase ar komerciālajām antivielām un M13 fāga

displeja palīdzību. Paralēli, uzkonstruēti vairāki fāga AP205 VLP varianti ar alfa-

sinukleīna peptīdiem.

7. EUREKA Eurostars-2 projekts „Challenging African Swine Fever outbreaks

with innovative VLP-based vaccines (ASF-INNOVAC)”, sadarbības projekts



20

Uzkonstruēti fāga AP205 vīrusveidīgo daļiņu (VLP) varianti ar ģenētiski

sapludinātām Āfrikas cūku mēra vīrusa (ASFV) p10, p11.5, p12 un p54 proteīnu

sekvencēm. Uzproducēti, refoldēti un attīrīti ASFV p30 un CD2v proteīni turpmākajai

ķīmiskajai piesaistei pie dažādām VLP.

2.1.4. Valsts vai pašvaldības budžeta iestāžu finansētie projekti

1. Iedzīvotāju genoma datubāzes projekta īstenošana

Projekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol. J.Kloviņš


Periodā no 01.01.2020. līdz 31.12.2020. kopumā VIGDB tika iegūti bioloģiskie

paraugi no 1975 gēnu donoriem.

Ievākto audu paraugu un fenotipiskās informācijas sadalījums pa medicīnas

iestādēm:

Paula Stradiņa Klīniskā universitātes slimnīca 165

Rīgas Austrumu klīniskā universitātes slimnīca 1002

Bērnu Klīniskās universitātes slimnīca 118

Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs 521

Latvijas Infektoloģijas centrs 124

Citas ārstniecības iestādes 45

Audu paraugu un fenotipiskās informācijas ievākšanai VIGDB vajadzībām laika

posmā no 01.01.2020. līdz 31.12.2020. bija spēkā esoši 37 uzņēmuma līgums ar

medicīnas darbiniekiem par projekta koordināciju, paraugu un fenotipiskās

informācijas vākšanu un paraugu transportēšanu, kā arī par specifisku paraugu

pirmreizējo apstrādi.

2.1.5. ERAF projekti

1. ERAF Nr. 1.1.1.1/16/A/044 “Babezioze Latvijā: epidemioloģiskie un

diagnostiskie pētījumi riska novērtēšanai”

Projekta vadītājs - vadošā pētniece Dr.biol. R.Ranka


Ir veikta visu Babesia-pozitīvo klīnisko paraugu un ar to saistīto datu apkopošana

un analīze, lai novērtētu suņu babeiozes izplatību Latvijā. Ir pabeigta molekulārās

metodes izstrādāšana, kas ļauj vienlaicīgi noteikt Babesia un Anaplasma infekciju

dzīvnieku klīniskos paraugos. Ir veikta datu apkopošana un analīze par Babesia,

Borrelia, Anaplasma, Rickettsia un ērču encefalīta vīrusa prevalenci dažādās ērču sugās

Latvijā, kā arī vairāku manuskriptu sagatavošana publicēšanai.

2. ERAF Nr. 1.1.1.1/16/A/054 “Gripas vīrusa hemaglutinīna stalka peptīda

diagnostiskais un imunoprotektīvais potenciāls: jaunu vakcīnu prototipu

izstrāde”

21

Projekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol. A.Kazāks


Tika veikta aktivitātēs 1.3-1.5 iegūto datu apkopošana un sagatavošana

publicēšanai. Projekta gaitā tika izstrādāta jauna metode himēro VLP iegūšanai, kur

ģenētiskā sapludināšana ir kombinēta ar ķīmisko piesaisti, kas ļauj vienā daļiņā iekļaut

vienlaicīgi vairākus antigēnus. Attiecīgais manuskripts tika iesniegts un pieņemts

publicēšanai žurnālā Vaccines.

3. ERAF Nr. 1.1.1.1/16/A/101 “Apbedījuma vides mikrobioma nozīme

biomolekulārajā arheoloģijā un senās tuberkulozes izpētes procesos”

Projekta vadītājs - vadošā pētniece Dr.biol. R.Ranka

Sadarbības partneris – Latvijas Universitāte


Ir izvērtētas senās DNS datu kopas no arheologisko kaulu, zobu un zobakmens

paraugiem, kā arī no apbedījuma vides paraugiem. Ir veikta senā zobakmens

mikrobioma datu salīdzināšana ar mūsdienu mutes mikrobiomu. Ir veikta visā projekta

laikā iegūto datu analīze un rezultātu apkopošana. Ir veikta manuskriptu sagatavošana

iesniegšanai starptautiski citējamos žurnālos.

4. ERAF Nr. 1.1.1.1/16/A/104 “Jaunu RNS fāgu vīrusveidīgo daļiņu iegūšana un

raksturošana”

Projekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol. K.Tārs


Uzrakstīti un nopublicēti projektā paredzētie divi pēdējie zinātniskie raksti par

jauno RNS fāgu vŗusveidīgo daļiņu (VLP) trīsdimensionālajām struktūrām un jauno

VLP toleranci pret ģenētiski sapludinātu antigēnu ievietošanu.

5. ERAF Nr. 1.1.1.1/16/A/107 “Jaunu antimikrobiālu līdzekļu atlase pret

grampozitīvo baktēriju sortāzi A”

Projekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol. A.Leončiks


Projekta pēdējā izpildes gada ietvaros tika pabeigti visi iepriekš iesākties darbi ar

perspektīvākajiem sortāzes A inhibitoriem, lai raksturotu un salīdzinātu to bioloģiskās

un farmakokinētiskās spējas, kādas nepieciešamas zāļu vielu kandidātiem. Veikto

pārbaužu rezultātā tika atlasīti trīs labākie SrtA enzīma inhibitoru kandidāti ar augstu

antimikrobiālu potenciālu. Kā iepriekš tas tika plānots, tika sagatavoti un iesniegti divi

manuskripti publicēšanai zinātniskos žurnālos.

6. ERAF Nr. 1.1.1.1/16/A/211 Jaunu luminiscentu savienojumu molekulārais

dizains diagnostikas mērķiem

Projekta vadošais partneris – Daugavpils Universitāte

BMC projekta vadītājs - vadošā pētniece Dr.biol. D.Pjanova


22

Projekta ietvaros tika analizēta jaunsintezētu benzatrona atvasinājumu ietekme uz

dzīvām šūnām un savienojumu lokalizācija šūnā, kā arī savienojumu spektrālo īpašību

izmaiņas dažādās labdabīgās un ļaundabīgās šūnās. Visiem analizētajiem

savienojumiem piemita labas spektrālās īpašības (stabila, spoža fluorescence), tie

nebija toksiski šūnām un, galvenokārt, iekrāsoja dažādus membrānas saturošus

veidojumus šūnā (plazmatisko membrānu, Goldži aparātu, endoplasmatisko tīklu,

mitohondrijus). Analizētie savienojumi pierādīja sevi, kā labas fluorescējošas

krāsvielas eksperimentos ar dzīvām šūnām, kur nepieciešams nespecifiski iekrāsot

šūnas. Pārbaudītas arī analizēto krāsvielu spektrālās izmaiņas dažādās audzēja šūnās un

atrastas atšķirības starp krāsvielu spektrālajām īpašībām starp normālu fibroblastu un

melanomas šūnu plazmatiskajām membrānām, norādot, ka analizēto krāsvielu

spektrālos mērījumus var izmantot membrānu funkcionālā stāvokļa analīzei. Šī iespēja

gan būtu jāpārbauda plašākā pētījumā.

7. ERAF Nr. 1.1.1.1/16/A/272 “H.pylori eradikācijas kursa ilglaicīgā ietekme uz

zarnu trakta mikrobiomu un skrīnēšanas sistēmas izstrāde paplašināta

spektra beta laktamāzes kodējošo gēnu noteikšanai feču paraugos”

Projekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol. D.Fridmanis

Sadarbības partneris – Latvijas Universitāte


Šī projekta noslēgumā tika pabeigta visu Klīniskās un Profilaktiskās Medicīnas

Institūta un Rīgas Austrumu Klīniskās Universitātes slimnīcas Biobankas paraugu

ievākšana. Šo darbu rezultātā tika ievākti atlikušie 700 paraugi. Ģenētiskās analīzes

darbu ietvaros tika piebeigta iegūto 16S rRNS sekvencēšanas datu analīze, kā rezultātā

tika sagatavota un žurnālam “Helicobacter” nosūtīta publikācija par ilglaicīgo

antibiotiku terapijas ietekmi uz zarnu trakta mikroorganisma populācijas struktūru.

Paralēli šīm darbībām tika veikta pēdējo 30 validācijas paraugkopas paraugu visa

metagenoma sekvencēšana. Iegūtie dati tika analizēti un salīdzināti ar iepriekš

iegūtajiem ESBL sekvencēšanas datu analīzes rezultātiem, kā rezultātā tapa publikācija

par ilglaicīgo antibiotiku terapijas ietekmi uz zarnu trakta mikroorganisma rezistomu,

kas tika nosūtīta uz žurnālu “Journal of Medical Microbiology”.

8. ERAF Nr. 1.1.1.1/18/A/026 “Ribes ģints augu, Cecidophyopsis pumpurērču un

upeņu reversijas vīrusa izpēte ilgtspējīgai Ribes ģints ogulāju rezistences

selekcijai un audzēšanai”

Vadošais partneris – Dārzkopības institūts

BMC projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. I.Baļķe


Izstrādāti pielietojuma protokoli pumpurērču ITS/5.8S reģiona amplifikācijai un

klonēšanai, kā arī veikta Ribes augu Ce un P rezistences gēnu identifikācijas metožu

pilnveidošana. Nosekvenētas sagatavotās 2019. gada maijā ievākto upeņu (šķirne

‘Mara Eglite’) invadēto un kontroles paraugu 12 NGS bibliotēkas un četras 2019. gada

maijā ievākto vēreņu (Ribes alpinum) NGS bibliotēkas uz DNBSEQ-G400, kā rezultātā

pēc gēnu transkripcijas satistiskās analīzes, 1. inficēto augu grupā tika identificēti 573

gēnu transkripti (ar paaugstinātu ekspresijas līmeni tika atlasīti 10 gēni, bet ar

23

pazeminātu - trīs gēni), 2. inficēto augu grupā – 769 gēnu transkripti (paaugstināta

ekspresija bija 14 gēniem, bet pazemināta – pieciem), bet 3. inficēto augu grupā – 574

gēnu transkripti (paaugstināta ekspresija bija 21 gēnam, bet pazemināta 17 gēniem).

Papildus RNA-seq datu analīzē 2019. gada maijā ievākto upeņu (šķirne ‘Mara Eglite’)

paraugos tika identificēts, līdz šim Latvijā neidentificēts vīruss, Upeņu asociētais

rhabdovīruss 1 [Black currant-associated rhabdovirus 1 (BCaRV)].

9. ERAF Nr. 1.1.1.1/18/A/084 “Ekstracelulārajās vezikulās ietvertā cilvēka un

mikrobioma transkiptoma klīniskā nozīme”

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. A.Linē

Sadarbības partneris – SIA GenEra


Tika iesākts darbs pie jaunu pacientu iesaistīšanas pētījumā un biobankas

paplašināšanas, kā arī turpināts darbs pie ekstracelulāro vezikulu (EV) izolēšanas no

vēža pacientu asins un urīna paraugiem, EV preparātu kvalitātes kontroles un RNS

bibliotēku konstruēšanas un sekvenēšanas. Rezultātā tika identificēta virkne potenciālo

prostatas vēža RNS biomarķieru, kas ir paaugstināti ekspresēti audzēja audos, ir

detektējami pirms-operācijas EVs, bet samazinās pēc-operācijas EV paraugos, kas

liecina par to, ka prostatas vēzis ir galvenais avots, no kurienes tās nonāk bioloģiskajos

šķidrumos. Šādi RNS biomarķieri var būt noderīgi prostatas vēža diagnostikai un

monitoringam un tika iesākta to validēšana neatkarīgā paraugu kopā, izmantojot

ddPCR. Tika sagatavots apskata raksts: Leja M, Linē A. Early detection of gastric

cancer beyond endoscopy - new methods. Best Practice & Research Clinical

Gastroenterology, in press, doi: 10.1016/j.bpg.2021.101731 un rezultāti ziņoti

virtuālajā EV simpozijā, ko organizēja Tartu Universitāte.

10. ERAF Nr. 1.1.1.1/18/A/089 “Molekulārie RNS faktori hipofīzes adenomas

attīstībā”

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. V.Rovīte



Noslēgta hipofīzes adenomu audzēju materiālu trankriptoma un mazo nekodējošo

RNS sekvencēšana, veikta bioiformātiskā datu analīze, kurā identificēti marķieri, kas

pašlaik tiek funkcionāli raksturoti audzēju šūnu kultūrās. Tuprināta primāro audzēju

kultūru iegūšana un apstrāde ar oktreotīdu un kaberigolīnu, izstrādāta metode prinmāro

šūnu kultūru transkriotma sekvencēšanai.

11. ERAF Nr. 1.1.1.1/18/A/092 “miRNS nozīme saimniekorganisma-zarnu

mikrobioma mijiedarbībā metformīna terapijas kontekstā uz metabolisma

traucējumu fona”




Projekta ietvaros 2020. gadā ir veikta miRNS sekvenēšana, lai iegūtu informāciju

par miRNS kompozīcijas izmaiņām metformīna terapijas un dzimuma ietekmē,

izmantojot peļu fēču paraugus, kuri iegūti dzīvnieku eksperimenta ietvaros, kur ar

24

diētas palīdzību tika ierosināts otrā tipa cukura diabēts, kam sekoja 10 nedēļas ilga

metformīna terapija. Turpmākai miRNS analīzei ir sagatavoti dažāda veida zarnu

paraugi. Lai varētu veikt izpēti arī cilvēkos, norisinājās pētījuma dalībnieku iesaiste un

paraugu ievākšana, kā arī tika uzsākta to bioloģiskā materiāla apstrāde un fēču

metagenoma sekvenēšana.

12. ERAF Nr. 1.1.1.1/18/A/096 “Reto pārmantoto slimību izraisošo faktoru izpēte,

izmantojot pilna genoma sekvencēšanas pieeju”

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. I.Iņaškina

Sadarbības partneris – SIA Latvia MGI Tech


ERAF 096 projekta ietvaros 2020. gadā turpinājās pacientu, kas cieš no retajām

pārmantotajām slimībām, un viņu radinieku iesaiste Valsts iedzīvotāju genoma

datubāzē (DNS, audu paraugi un fenopitiskie dati). Atlasītiem pacientiem tika veikta

pilna genoma sekvencēšana, iegūto datu analīze, anotēšana un interpretācija. Dati par

atrastajiem retajiem ģenētiskajiem variantiem un ar tiem saistītajām diagnozēm tika

iesniegti prezentēšanai starptautiskās konferencēs RSU Research Week 2021:

Knowledge for Use in Practice un LU 79th Scientific Conference.

13. ERAF Nr. 1.1.1.1/18/A/097 “Retu nezināmas izcelsmes neiromuskulāro

slimību funkcionālā un ģenētiskā izpēte”

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. I.Iņaškina



2020. gadā tika nopirkti un piegādāti transgēnie dzīvnieki (peles), kas atbilst

mutācijai Y247H cilvēka MYBPC1 gēnā un uzsākta to pavairošana, lai iegūtu pētījuma

mērķiem atbilstošu un stabilu dzīvnieku koloniju. Tika veikta dažādu muskuļu tipu

transkriptoma profilu analīze, izmantojot paraugus no MYBPC1 E248K peļu modeļa,

iegūtie dati tika validēti, izmantojot digital droplet PCR metodi. Projekta ietvaros

turpinājās pacientu, kas cieš no retajām neiromuskulārajām slimībām, un viņu

radinieku iesaiste Valsts iedzīvotāju genoma datubāzē. Atlasītiem pacientiem tika

veikta pilna genoma sekvencēšana, iegūto datu analīze, anotēšana un interpretācija.

Iegūtie dati publicēti zinātniskā raksta formā, žurnālā Neuromuscular Disorders

(doi:10.1016/j.nmd.2020.03.010).

14. ERAF Nr. 1.1.1.1/18/A/099 “Melanomas atjaunošanās bioloģija pēc mērķētas

terapijas pielietošanas pret BRAF mutāciju”

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. D.Pjanova


Projekta ietvaros tika meklētas audzēju (ar fokusu uz melanomu) šūnu īpašības,

kas saistīta ar rezistences rašanos pret mērķēto terapiju. Pētījumos galvenokārt

izmantojām SK-MEL28 BRAF (V600E) mutētu melanomas šūnu līniju, ko

apstrādājām ar BRAF kināzes inhibitoru Vemurafenib. Hipotēze, ko testējām postulēja,

ka ektopiski ekspresēti mejotiskie un CT (cancer testis, CT) gēni aiztur audzēja šūnas

to dalīšanās cikla metafāzē, kā rezultātā rodas tetraploīdas šūnas, kas caur

25

reprogrammēšanos iegūst rezistenci pret terapiju. Lai gan retos gadījumos novērojām

“mitotisko izslīdēšanu” un poliploīdu šūnu rašanos, secinājām, ka “mitotiskā

izslīdēšana” nav galvenais rezistences avots pēc melanomas šūnu apstrādes ar

Vemurafenib pretatā iedarbībai ar genotoksiskiem faktoriem. Taču novērojām, ka

melanomas šūnu apstrāde ar Vemurafenib noved pie pagarinātās šūnas dalīšanās cikla

profāzes un BRAF mutētās melanomās mejotisko gēnu ekspresija ir izteiktāka nekā

melanomās ar savvaļas tipa BRAF gēnu. Apstiprinājums šim novērojumam tika gūts

arī izmantojot bioinformātikas pieeju. Salīdzinot gēnu ekspresiju starp BRAF mutētiem

nevusiem, primārajām melanomām un progresējošām melanomām, mejotisko gēnu

ekspresija tika atrasta visās paraugkopās. Mejotisko gēnu loma audzēju progresijā ir

lauciņš turpmākiem pētījumiem.

15. ERAF Nr. 1.1.1.1/19/A/036 “Sekretorā IgA un zarnu mikrobioma

mijiedarbība un dinamika antidiabētiskās terapijas laikā”




Uzsākta 2.tipa cukura diabēta pacientu un veselu kontroļu iesaistīšana pētījumā un

nepieciešamo paraugu ievākšana zarnu mikrobioma un tā frakciju tālākajai analīzei.

Veikta pēc sIgA piesaistes atkarīgas baktēriju šūnu šķirošanas metodes optimizācija, kā

arī uzsākta bioloģisko paraugu sagatavošana funkcionālajai analīzei.

16. ERAF Nr. 1.1.1.2/VIAA/1/16/128 “Uzturā lietoto kūpinājumu ietekme uz

zarnu mikrobiomu”

Projekta vadītājs - pētniece Dr.biol. I.Kalniņa


Paralēli kūpinājumu ietekmes uz zarnu mirkobioma sastāvu izvērtēšanai, projekta

ietvaros tika ievākta detalizēta informācija par dalībnieku fenotipu, kas ļāva paplašināt

datu analīzi. Papildus datu analīze atklāja būtisku saistību starp dalībnieka lipīdu profilu

un mikroorganismu sabiedrību kompozīciju. Kopumā vidēji 8 % no variācijas lipīdu

profilā var tikt attiecinātas uz izmaiņām zarnu mikrobioma sastāvā. Piemēram,

probiotiskās baktērijas no Bifidobacteria, Akkermansia un Lactococcus ģintīm

asociējās ar veselībai labevēlīgu cirkulējošo lipīdu profilu, ko raksturo zems kopējā

holesterīna, zema blīvuma holesterīna līmenis un augstāks augsta blīvuma holesterīna

līmenis. Dati tika prezentēti tiešsaistes konferencē e-ECE2020 postera formā

"Variation in relative abundance of gut bacteria correlates with lipid profiles in adults"

(Postera ID: 3231). Funkcionālo pētījumu ietvaros tika veikta metabolītu profila

noteikšana, veicot NMR analīzi, un tika īstenots pilotpētījums anaerobo

mikroorganismu audzēšanas metožu apgūšanai.

17. ERAF Nr. 1.1.1.2/VIAA/1/16/135 “sRNAflow - rīks mazo RNS sekvenēšanas

datu analīzei bioloģiskajos šķidrumos”

Projekta vadītājs - pētnieks Dr.biol. P.Zajakins


26

Veiksmīgi pabeigta pētījuma gaitā izveidots programmatūras rīks ar draudzīgu

lietotāja saskarni, kas orientēa uz mazo RNS analīzi un apmierina īpašās vajadzības

paraugiem, kas iegūti no bioloģiskiem šķidrumiem. Tiek piedāvāti risinājumi mazo

RNS tipu klasifikācijai, mazo RNS anotāciju pārklāšanās problēmai un paraugos esošo

mazo RNS avotu identificēšanai. Programmatūra ir veiksmīgi konteinerizēta un

publicēta GitHub (https://github.com/zajakin/sRNAflow) un DockerHub krātuvēs

saskaņā ar GPL3 licenci.

18. ERAF Nr. 1.1.1.2/VIAA/1/16/144 “Laima slimības ierosinātāja Borrelia

burgdorferi ārējo virsmas proteīnu strukturālie un funkcionālie pētījumi, lai

noteiktu patoģenēzes mehānismus ar nolūku izveidot jaunu vakcīnu”

Projekta vadītājs - pētnieks Dr.biol. K.Brangulis


Projekta noslēguma fāzē tika paredzēts noteikt Borrelia burgdorferi ārējās virsmas

proteīnu 3-d struktūras izmantojot renntgenstaru kristalogrāfiju, kas rezultētos vismaz

divās publikācijās. Šajā periodā tika publicētas 4 publikācijas un noteiktas 7 dažādu

Laima slimības ierosinātāja B. burgdorferi ārējās virsmas proteīnu 3-d struktūras.

19. ERAF Nr. 1.1.1.2/VIAA/1/16/203 “Ekstracelulāro vezikulu modificēšana

tumorsuppresoro miRNS nogādāšanai vēža šūnās”

Projekta vadītājs – vadošais pētnieks Dr.biol. A.Ābols


Tika izveidota modificēta cilmes šūnu līnija, kas producē ārpusšūn uvezikulas, ka

satur miRNS-206 un antivelu saistošu proteīnu uz to virsmas. Tika parādīts ka šīs

vezikulas spēj inhibēt MCF7 šūnu proliferāciju caur ER signālceļa nomākšanu, kā tas

tika paredzēts. Rezultāti tika prezentēti starptautiskā LU konferencē un tika sarakstīts

starptautiski citējams apskatraksts par modificētu cilmes šūnu vezikulu pielietošanu

vēža terapijā.

20. ERAF Nr. 1.1.1.2/VIAA/2/18/285 “Sistēmu un molekulārās bioloģijas metožu

pielietošana augu izcelsmes enzīmu identificēšanai un to raksturošanai

pielietojumam rūpnieciskos procesos”

Projekta vadītājs - pētnieks P.Tomašiunas


Tika iegūti rauga celmi, kuri ekspresē augu izcelsmes antocianīna sintāzi un flavona

3-hidroksilāzi, flavanoīda 3'5'hidroksilāzes enzīmus. Visu rekombinanto enzīmu

ekspresijai tika noteikti optimālie apstākļi. Turpinājās darbs pie uz rauga bāzētas

platformas izveides antocianīna sintēzes ceļa gēnu variantu bioķīmiskajai testēšanai

optimālai metabolītu plūsmai.

21. ERAF Nr. 1.1.1.2/VIAA/2/18/286 “Jaunu augu izcelsmes enzīmu ekspresijas

mikroorganismos optimizēšana to biotehnoloģiskiem pielietojumiem”

Projekta vadītājs - pētniece K.Kukk


https://github.com/zajakin/sRNAflow

27

Tika veikta antocianīnu sintēzes ceļa olbaltumvielu 5 ’secību pavairošana no

cigoriņiem, rudzupuķēm, mellenēm un purva mellenēm. Apvienojot 5’- fragmentus ar

iepriekš identificētajiem 3’- fragmentiem, tika iegūtas vairākas iespējamās pilna

garuma secības. Papildus, tika uzrakstīts detalizēts protokols “Kā iegūt secības, kas

kodē augu proteīnus, kuriem nav pieejami genoma dati”.

22. ERAF Nr. 1.1.1.2/VIAA/2/18/287 “Otrā tipa cukura diabēta klīnisko

apakštipu identificēšana un farmakoģenētikas pielietojamība personalizētas

antidiabētiskās terapijas izstrādē”

Projekta vadītājs - pētnieks Dr.biol.R.Pečulis


Veikta paraugkopu paplašināšana un fenotipu precizēšana visa genoma asociācijas

analīzei. Asociācijas analīzēs iegūtie rezultāti sagatavoti un publicēti divos starptautiski

citējamos žurnālos ar nosaukumiem: "Association between symptoms of depression,

diabetes complications and vascular risk factors in four European cohorts of individuals

with type 1 diabetes – InterDiane Consortium" (Diabetes Research and Clinical

Practice, ietekmes faktors 4.23) un "Novel susceptibility loci identified in a genome-

wide association study of type 2 diabetes complications in population of Latvia" (BMC

Medical Genomics, ietekmes faktors 2,57).

23. ERAF Nr. 1.1.1.2/VIAA/3/19/460 “Cilvēka asins un zarnu trakta mikrobiomu

sastāva asociācija ar vispārējo veselības stāvokli un mirstību Latvijas

populācijā”

Projekta vadītājs – vadošais pētnieks Dr.biol. D.Fridmanis


Projekta sākuma stadijā tika uzsākts darbs medicīnas ētikas komisijas pieteikuma

sagatavošanas, tā ietvaros tika apzināti partnera kolekcijā esošie paraugi un apkopota

pieejamā klīniskā un fenotipiskā informācija. Paralēli šīm darbībām tika veikta paraugu

atlase un padziļināta literatūras izpēte par piemērotākajām asins mikrobioma

izdalīšanas metodēm un nepieciešamajām izdalīšanas procesa kontrolēm. Pēc šo

darbību paveikšanas tika izstrādāta asins mikrobioma izdalīšanas metode un sagādāti

visi pētījuma pirmajai – fēču analīzes fāzei nepieciešamie materiāli. Pēc atbilstošo

materiālu saņemšanas tika veikti pirmie fēču paraugu apstrādes un sekvencēšanas

bibliotēku sagatave izmēģinājuma eksperimenti kā arī uzsākti pirmie asins mikrobioma

izdalīšanas eksperimenti.

24. ERAF Nr. 1.1.1.2/VIAA/3/19/462 “Daudzziedu airenes raibuma vīrusa kodēto

proteīnu struktūru un funkcionālā izpēte”

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. I.Baļķe


Ar rengenstaru difrakcijas metodi noteikta 3D struktūra Daudzziedu airenes

raibuma vīrusa serīna proteāzes katalītiskā centra mutantam bez transmembranālā

domēna (SPcm), kā arī veikta tās 3D struktūras salīdzināšana ar katalītiski aktīvās

proteāzes 3D struktūru ar un bez kofaktora. Izveidotas SPcm un P10 protīna preparatīva

28

daudzuma attīrīšanas metodes kristalizācijas eksperimentiem 3D struktūras

noteikšanai. Uzsāks darbs pie 3D struktūras noteikšanai piemērotu kristālu iegūšas P10

proteīnam.

25. ERAF Nr. 1.1.1.2/VIAA/3/19/463 “"Mitotiskās izslīdēšanas” loma amoeboīdu

metastātisku šūnu izcelsmē pret terapiju rezistentos audzējos”

Projekta vadītājs – pētniece Dr.biol. K.Salmiņa


Pētīta mitotiskā izslīdēšana un tai sekojoša šūnu poliploidizācija audzēja šūnu

līnijās MDA-MB231 un SK-MEL28 pēc apstrādes ar pretvēža terapijas līdzekļiem

(doksorubicīnu, vemurafenibu). Noteikts šūnas cikls, klonogenitāte un ataugšana, kā arī

meijotisko gēnu (MOS, DMC1, REC8, RAD51 un SPO11) ekspresija. Projektā iegūtie

rezultāti arī ietverti divās zinātniskajās publikācijās: eksperimentālā rakstā par

mitotiskās izslīdēšanas un ekstranukleārā DNS lomu vēža rezistencē

(https://doi.org/10.3390/ijms21082779); un apskata rakstā par paradoksāliem

procesiem, kas saistīti ar vēža rezistenci

(https://doi.org/10.1016/j.semcancer.2020.12.009).

26. ERAF Nr. 1.1.1.2/VIAA/3/19/464 “Cilvēka ogļskābes anhidrāžu strukturālie

un kinētiskie pētījumi jaunu zāļvielu izstrādnei”

Projekta vadītājs – pētnieks Dr.biol. J.Leitāns


Veikta hCA Va enzīma attīrīšanas sistēmas izveide un optimizācija, kā arī veiktas

pirmējās reakcijas kristalizācijas apstākļu noteikšanai. Veikta hCA IX enzīma

kokristalizācija ar dažādiem sulfonamidu klases inhibitoriem, datu ievākšana no

proteīnu kristāliem un 3D struktūras aprēķins.

27. ERAF Nr.1.1.1.5/18/I/006 “Atbalsts Latvijas Biomedicīnas pētījumu un

studiju centra integrācijai Eiropas Pētniecības telpā un infrastruktūras

objektos”



2020.gadā tika turpināti informācijas un atbalsta pasākumi, kā arī sagatavoti jauni

projektu iesniegumi “Horizon 2020” gan pamata, gan apakšprogrammās. 2018.gadā

kopumā ir sagatavoti 18 projektu iesniegumi dažādos uzsaukumos, no kuriem 1 ir

piešķirts finansējums projekta īstenošanai, savukārt vēl 6 ir novērtēti virs kvalitātes

sliekšņa.

BBMRI-ERIC ietvaros nacionālā mezgla pārstāvji ir turpinājuši informēt biobankas

veidojošās institūcijas Latvijā par šīs jomas aktualitātēm pasaulē. Tika turpināta dalība

BBMRI-ERIC IT, ELSI un QM darba grupās. BBMRI.LV pārstāvji piedalījās Vadības

komisijas tiešsaistes sanāksmēs, Europe Biobank Week 2020 virtuālajā konferencē.

2020.gadā tika noslēgta Vienošanās ar Rīgas Stradiņa universitāti par dalību

BBMRI.LV.

https://doi.org/10.3390/ijms21082779

https://doi.org/10.1016/j.semcancer.2020.12.009

29

Instruct-ERIC ietvaros tika noslēgta Vienošanās ar Latvijas Organiskās sintēzes

institūtu dalībai nacionālajā strukturālās bioloģijas infratsruktūras tīklā Instract-LV, kā

arī Instruct-LV pārstāvji piedalījās Instruct-ERIC organizētajās sanāksmēs.

28. ERAF Nr.1.1.1.4/17/I/009 “Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centra

infrastruktūras attīstība pētniecības un tehnoloģiju pārneses kapacitātes

stiprināšanai biomedicīnas un biotehnoloģijas jomās”

Projekta vadītājs – direktors Dr.biol. Jānis Kloviņš


2020.gadā Šūnu kultūru un mikroskopijas servisa centrs tika papildināts ar jaunu

zinātnisko aparatūru, kas nepieciešama BSL3 laboratorijas izveidei. Kā arī tika uzsākta

biobankas un bioloģisko materiālu apstrādes laboratorijām nepieciešamo telpu izbūve.

29. ERAF Nr. KC-PI-2017/23 “Personalizēts krūts vēža molekulārās diagnostikas

tests zāļu izvēlei un slimības gaitas novērošanai”



Tika turpināta krūts vēža pacienšu iesaistīšana pētījumā, klīniskās informācijas

apkopošana un atkārtoto asins paraugu vākšana iepriekš iesaistītajām pacientēm. Tika

izstrādāta tehnoloģija somatisko mutāciju noteikšanai krūts vēža audos un noskaidroti

tās analītiskās veiktspējas rādītāji, kā arī iesākts darbs pie personalizētu šķidro biopsiju

testu izstrādes slimības gaitas monitoringam. Tika izvērtēti dažādi intelektuālā īpašuma

aizsardzības modeļi un iesākts darbs pie testu protokola gala varianta izveides un

pierādījumu apkopošanas par testu klīnisko lietderību.

30. ERAF Nr. KC-PI-2020/23 “Anti-miostatīna vakcīnas izstrāde mājlopu muskuļu

masas palielināšanai”



Uzproducēts, refoldēts un attīrīts peļu miostatīna proteīns. Iegūtais miostatīns ar

ķīmiskās konjugācijas palīdzību piesaistīts pie divu dažādu bakteriofāgu vīrusveidīgo

daļiņu (VLP) virsmas.

31. ERAF Nr. KC-PI-2020/30 “Dinamiska cilvēka mikrobioma datu platforma un

interpretācijas rīks personalizētām veselības rekomendācijām”



Sagatavots iepirkuma nolikums iepirkumam "Tehniski ekonomiskās priekšizpētes

un komercializācijas stratēģijas izstrādes pakalpojums". Sadarbībā ar SIA

„InnoMatrix” veikta Tehniski ekonomiskās priekšizpētes un Komercializācijas

stratēģijas izstrāde. Uzsākta projekta 2. kārta realizācija - brīvprātīgo dalībnieku

iesaiste, bioloģiskā materiāla un dzīvesveida datu apkopošana.

2.1.6. Starptautiskie un vietējie pētniecības projektu līgumdarbi

1. Research and Technology Transfer Agreement, pasūtītājs – Saiba GmbH.

30

2. Research and Technology Transfer Agreement, pasūtītājs – Saiba Animal Health

AG.

3. Master Service Agreement, pasūtītājs – Allergy Therapeutics GmbH.

4. Contract on performance of scientific research and delivery of its findings,

pasūtītājs – ViroGen Corporation.

5. Research and Technology Transfer Agreement, pasūtītājs – HYPOPET AG.


pasūtītājs – Institute of Experimental Botany of the Czech Academy.


pasūtītājs – TargEDys SA.


pasūtītājs – TBD-Biodiscovery.

9. Pētījums par SARS-CoV-2 vīrusa epidemioloģiju un filoģenēzi Latvijā, pasūtītājs

– LR Izglītības un zinātnes ministrija.

10. Mezenhimālo cilmes šūnu izolēšana, pavairošana un raksturošana biomateriālu

pētniecībai, pasūtītājs – Rīgas Tehniskā universitāte.

11. Pakalpojuma līgums par pētniecības pakalpojumiem, pasūtītājs – SIA GenEra.

12. Molekulār-ģenētisko analīžu veikšana LLU vajadzībām projekta R124 ietvaros,

pasūtītājs – Latvijas Lauksaimniecības universitāte.

13. PCR produktu analīzes pakalpojuma līgums, pasūtītājs – Latvijas Lauksaimniecības

universitāte.

14. Sanger sekvencēšanas pakalpojums, pasūtītājs – Latvijas Universitāte.

15. Sintezēti biotinizēti DNS fragmenti ar noteiktu garumu, pasūtītājs – Latvijas

Universitāte.

16. Zinātniskās laboratorijas pakalpojumi, pasūtītājs – Latvijas Universitāte.

17. Augu izcelsmes mikrobioloģisko paraugu ITS 1-2 variablā reģiona augstas

efektivitātes DNS sekvencēšana, izmantojot nākamās paaudzes sekvencēšanas

tehnoloģiju, pasūtītājs – Latvijas Universitāte.

18. Dzīvnieku laboratorijas pakalpojumu nodrošināšana pētījuma veikšanai ar

laboratorijas pelēm, pasūtītājs – Rīgas Stradiņa universitāte.

19. Pakalpojuma līgums par attīrītu sekvencēšanas produktu analīzi, pasūtītājs – Rīgas

Stradiņa universitāte.

20. Par pakalpojuma sniegšanu 16S rRNS gēna V3-V4 rajona NGS noteikšanu,

pasūtītājs – Paula Stradiņā Klīniskā unoversitātes slimnīca.

21. Pakalpojuma līgums par ar ģenētisko analīzi saistītiem pētniecības pakalpojumiem,

pasūtītājs – Daugavpils Universitāte.

22. Palpojuma līgums par pētniecības pakalpojumiem, pasūtītājs – SIA RECOLO.

2.2. Zinātniskās publikācijas

2.2.1. Zinātniskās publikācijas, kas iekļautas Web of Science vai SCOPUS

1. Brangulis, K., Akopjana, I., Petrovskis, I., Kazaks, A., Jekabsons, A., Jaudzems, K.,

Viksna, A., Bertins, M., Tars, K. Structural analysis of Borrelia burgdorferi

periplasmic lipoprotein BB0365 involved in Lyme disease infection (2020) FEBS

Letters, 594 (2), pp. 317-326. PMID: 31486526

2. Ērenpreisa, J. Jānis oļģerts çrenpreiss and his school of cancer research:

Commemorating the 90th anniversary [Jānis oļģerts ērenpreiss un viņa vēža

31

pētījumu skola: Atceroties 90. gadadienu] (2020) Proceedings of the Latvian

Academy of Sciences, Section B: Natural, Exact, and Applied Sciences, 73 (6), pp.

533-537.

3. Jaudzems, K., Kurbatska, V., Jekabsons, A., Bobrovs, R., Rudevica, Z., Leonchiks,

A. Targeting Bacterial Sortase A with Covalent Inhibitors: 27 New Starting Points

for Structure-Based Hit-to-Lead Optimization (2020) ACS Infectious Diseases, 6

(2), pp. 186-194. PMID: 31724850

4. Yin, S., Wang, N., Riabov, V., Mossel, D.M., Larionova, I., Schledzewski, K.,

Trofimova, O., Sevastyanova, T., Zajakina, A., Schmuttermaier, C., Gratchev, A.,

Flatley, A., Kremmer, E., Zavyalova, M., Cherdyntseva, N., Simon-Keller, K.,

Marx, A., Klüter, H., Goerdt, S., Kzhyshkowska, J. SI-CLP inhibits the growth of

mouse mammary adenocarcinoma by preventing recruitment of tumor-associated

macrophages (2020) International Journal of Cancer, 146 (5), pp. 1396-1408. PMID:

31525266

5. Brangulis, K., Akopjana, I., Petrovskis, I., Kazaks, A., Zelencova, D., Jekabsons, A.,

Jaudzems, K., Tars, K. BBE31 from the Lyme disease agent Borrelia burgdorferi,

known to play an important role in successful colonization of the mammalian host,

shows the ability to bind glutathione (2020) Biochimica et Biophysica Acta -

General Subjects, 1864 (3), art. no. 129499 PMID: 31785327

6. Zakšauskas, A., Čapkauskaitė, E., Jezepčikas, L., Linkuvienė, V., Paketurytė, V.,

Smirnov, A., Leitans, J., Kazaks, A., Dvinskis, E., Manakova, E., Gražulis, S., Tars,

K., Matulis, D. Halogenated and di-substituted benzenesulfonamides as selective

inhibitors of carbonic anhydrase isoforms (2020) European Journal of Medicinal

Chemistry, 185, art. no. 111825. PMID: 31740053

7. Zrelovs, N., Cernooka, E., Dislers, A., Kazaks, A. Isolation and characterization of

the novel Virgibacillus-infecting bacteriophage Mimir87 (2020) Archives of

Virology, 165 (3), pp. 737-741. PMID: 31875246

8. Veinalde, R. Evaluation of Oncolytic Virus-Induced Therapeutic Tumor

Vaccination Effects in Murine Tumor Models (2020) Methods in Molecular

Biology, 2058, pp. 213-227. PMID: 31486040

9. Pole, I., Trofimova, J., Norvaisa, I., Supply, P., Skenders, G., Nodieva, A., Ozere,

I., Riekstina, V., Igumnova, V., Storozenko, J., Jansone, I., Viksna, L., Ranka, R.

Analysis of Mycobacterium tuberculosis genetic lineages circulating in Riga and

Riga region, Latvia, isolated between 2008 and 2012 (2020) Infection, Genetics and

Evolution, 78, art. no. 104126. PMID: 31783188

10. Fachal, L., Aschard, H., Beesley, J., Barnes, D.R., Allen, J., Kar, S., Pooley, K.A.,

Dennis, J., Michailidou, K., Turman, C., Soucy, P., Lemaçon, A., Lush, M., Tyrer,

J.P., Ghoussaini, M., Marjaneh, M.M., Jiang, X., Agata, S., Aittomäki, K., Alonso,

M.R., Andrulis, I.L., Anton-Culver, H., Antonenkova, N.N., Arason, A., Arndt, V.,

Aronson, K.J., Arun, B.K., Auber, B., Auer, P.L., Azzollini, J., Balmaña, J.,

Barkardottir, R.B., Barrowdale, D., Beeghly-Fadiel, A., Benitez, J., Bermisheva, M.,

Białkowska, K., Blanco, A.M., Blomqvist, C., Blot, W., Bogdanova, N.V., Bojesen,

S.E., Bolla, M.K., Bonanni, B., Borg, A., Bosse, K., Brauch, H., Brenner, H.,

Briceno, I., Brock, I.W., Brooks-Wilson, A., Brüning, T., Burwinkel, B., Buys, S.S.,

Cai, Q., Caldés, T., Caligo, M.A., Camp, N.J., Campbell, I., Canzian, F., Carroll,

J.S., Carter, B.D., Castelao, J.E., Chiquette, J., Christiansen, H., Chung, W.K., Claes,

K.B.M., Clarke, C.L., Mari, V., Berthet, P., Castera, L., Vaur, D., Lallaoui, H.,

32

Bignon, Y.-J., Uhrhammer, N., Bonadona, V., Lasset, C., Révillion, F., Vennin, P.,

Muller, D., Gomes, D.M., Ingster, O., Coupier, I., Pujol, P., Collonge-Rame, M.-A.,

Mortemousque, I., Bera, O., Rose, M., Baurand, A., Bertolone, G., Faivre, L.,

Dreyfus, H., Leroux, D., Venat-Bouvet, L., Bézieau, S., Delnatte, C., Chiesa, J.,

Gilbert-Dussardier, B., Gesta, P., Prieur, F.P., Bronner, M., Sokolowska, J., Coulet,

F., Boutry-Kryza, N., Calender, A., Giraud, S., Leone, M., Fert-Ferrer, S., Stoppa-

Lyonnet, D., Jiao, Y., Lesueur, F.L., Mebirouk, N., Barouk-Simonet, E., Bubien, V.,

Longy, M., Sevenet, N., Gladieff, L., Toulas, C., Reimineras, A., Sobol, H.,

Paillerets, B.B.-D., Cabaret, O., Caron, O., Guillaud-Bataille, M., Rouleau, E.,

Belotti, M., Buecher, B., Caputo, S., Colas, C., Pauw, A.D., Fourme, E., Gauthier-

Villars, M., Golmard, L., Moncoutier, V., Saule, C., Donaldson, A., Murray, A.,

Brady, A., Brewer, C., Pottinger, C., Miller, C., Gallagher, D., Gregory, H., Cook,

J., Eason, J., Adlard, J., Barwell, J., Ong, K.-R., Snape, K., Walker, L., Izatt, L.,

Side, L., Tischkowitz, M., Rogers, M.T., Porteous, M.E., Ahmed, M., Morrison, P.J.,

Brennan, P., Eeles, R., Davidson, R., Collée, J.M., Cornelissen, S., Couch, F.J., Cox,

A., Cross, S.S., Cybulski, C., Czene, K., Daly, M.B., de la Hoya, M., Devilee, P.,

Diez, O., Ding, Y.C., Dite, G.S., Domchek, S.M., Dörk, T., dos-Santos-Silva, I.,

Droit, A., Dubois, S., Dumont, M., Duran, M., Durcan, L., Dwek, M., Eccles, D.M.,

Engel, C., Eriksson, M., Evans, D.G., Fasching, P.A., Fletcher, O., Floris, G., Flyger,

H., Foretova, L., Foulkes, W.D., Friedman, E., Fritschi, L., Frost, D., Gabrielson,

M., Gago-Dominguez, M., Gambino, G., Ganz, P.A., Gapstur, S.M., Garber, J.,

García-Sáenz, J.A., Gaudet, M.M., Georgoulias, V., Giles, G.G., Glendon, G.,

Godwin, A.K., Goldberg, M.S., Goldgar, D.E., González-Neira, A., Tibiletti, M.G.,

Greene, M.H., Grip, M., Gronwald, J., Grundy, A., Guénel, P., Hahnen, E., Haiman,

C.A., Håkansson, N., Hall, P., Hamann, U., Harrington, P.A., Hartikainen, J.M.,

Hartman, M., He, W., Healey, C.S., Heemskerk-Gerritsen, B.A.M., Heyworth, J.,

Hillemanns, P., Hogervorst, F.B.L., Hollestelle, A., Hooning, M.J., Hopper, J.L.,

Howell, A., Huang, G., Hulick, P.J., Imyanitov, E.N., Sexton, A., Christian, A.,

Trainer, A., Spigelman, A., Fellows, A., Shelling, A., Fazio, A.D., Blackburn, A.,

Crook, A., Meiser, B., Patterson, B., Clarke, C., Saunders, C., Hunt, C., Scott, C.,

Amor, D., Marsh, D., Edkins, E., Salisbury, E., Haan, E., Neidermayr, E., Macrea,

F., Farshid, G., Lindeman, G., Trench, G., Mann, G., Giles, G., Gill, G., Thorne, H.,

Campbell, I., Hickie, I., Winship, I., Flanagan, J., Kollias, J., Visvader, J., Stone, J.,

Taylor, J., Burke, J., Saunus, J., Forbes, J., Hopper, J., Beesley, J., Kirk, J., French,

J., Tucker, K., Wu, K., Phillips, K., Lipton, L., Andrews, L., Lobb, L., Walker, L.,

Kentwell, M., Spurdle, M., Cummings, M., Gleeson, M., Harris, M., Jenkins, M.,

Young, M.A., Delatycki, M., Wallis, M., Burgess, M., Price, M., Brown, M.,

Southey, M., Bogwitz, M., Field, M., Friedlander, M., Gattas, M., Saleh, M.,

Hayward, N., Pachter, N., Cohen, P., Duijf, P., James, P., Simpson, P., Fong, P.,

Butow, P., Williams, R., Kefford, R., Scott, R., Milne, R., Balleine, R., Dawson, S.–

J., Lok, S., O’Connell, S., Greening, S., Nightingale, S., Edwards, S., Fox, S.,

McLachlan, S.-A., Lakhani, S., Antill, Y., Aalfs, C., Meijers-Heijboer, H., van

Engelen, K., Gille, H., Boere, I., Collée, M., van Deurzen, C., Hooning, M., Obdeijn,

I.-M., van den Ouweland, A., Seynaeve, C., Siesling, S., Verloop, J., van Asperen,

C., Devilee, P., van Cronenburg, T., Blok, R., de Boer, M., Garcia, E.G., Adank, M.,

Hogervorst, F., Jenner, D., van Leeuwen, F., Rookus, M., Russell, N., Schmidt, M.,

van den Belt-Dusebout, S., Kets, C., Mensenkamp, A., de Bock, T., van der Hout,

33

A., Mourits, M., Oosterwijk, J., Ausems, M., Koudijs, M., Clarke, C., Marsh, D.,

Scott, R., Baxter, R., Yip, D., Carpenter, J., Davis, A., Pathmanathan, N., Simpson,

P., Graham, D., Sachchithananthan, M., Isaacs, C., Iwasaki, M., Jager, A.,

Jakimovska, M., Jakubowska, A., James, P.A., Janavicius, R., Jankowitz, R.C.,

John, E.M., Johnson, N., Jones, M.E., Jukkola-Vuorinen, A., Jung, A., Kaaks, R.,

Kang, D., Kapoor, P.M., Karlan, B.Y., Keeman, R., Kerin, M.J., Khusnutdinova, E.,

Kiiski, J.I., Kirk, J., Kitahara, C.M., Ko, Y.-D., Konstantopoulou, I., Kosma, V.-M.,

Koutros, S., Kubelka-Sabit, K., Kwong, A., Kyriacou, K., Laitman, Y., Lambrechts,

D., Lee, E., Leslie, G., Lester, J., Lesueur, F., Lindblom, A., Lo, W.-Y., Long, J.,

Lophatananon, A., Loud, J.T., Lubiński, J., MacInnis, R.J., Maishman, T., Makalic,

E., Mannermaa, A., Manoochehri, M., Manoukian, S., Margolin, S., Martinez, M.E.,

Matsuo, K., Maurer, T., Mavroudis, D., Mayes, R., McGuffog, L., McLean, C.,

Mebirouk, N., Meindl, A., Miller, A., Miller, N., Montagna, M., Moreno, F., Muir,

K., Mulligan, A.M., Muñoz-Garzon, V.M., Muranen, T.A., Narod, S.A., Nassir, R.,

Nathanson, K.L., Neuhausen, S.L., Nevanlinna, H., Neven, P., Nielsen, F.C.,

Nikitina-Zake, L., Norman, A., Offit, K., Olah, E., Olopade, O.I., Olsson, H., Orr,

N., Osorio, A., Pankratz, V.S., Papp, J., Park, S.K., Park-Simon, T.-W., Parsons,

M.T., Paul, J., Pedersen, I.S., Peissel, B., Peshkin, B., Peterlongo, P., Peto, J.,

Plaseska-Karanfilska, D., Prajzendanc, K., Prentice, R., Presneau, N., Prokofyeva,

D., Pujana, M.A., Pylkäs, K., Radice, P., Ramus, S.J., Rantala, J., Rau-Murthy, R.,

Rennert, G., Risch, H.A., Robson, M., Romero, A., Rossing, M., Saloustros, E.,

Sánchez-Herrero, E., Sandler, D.P., Santamariña, M., Saunders, C., Sawyer, E.J.,

Scheuner, M.T., Schmidt, D.F., Schmutzler, R.K., Schneeweiss, A., Schoemaker,

M.J., Schöttker, B., Schürmann, P., Scott, C., Scott, R.J., Senter, L., Seynaeve, C.M.,

Shah, M., Sharma, P., Shen, C.-Y., Shu, X.-O., Singer, C.F., Slavin, T.P.,

Smichkoska, S., Southey, M.C., Spinelli, J.J., Spurdle, A.B., Stone, J., Stoppa-

Lyonnet, D., Sutter, C., Swerdlow, A.J., Tamimi, R.M., Tan, Y.Y., Tapper, W.J.,

Taylor, J.A., Teixeira, M.R., Tengström, M., Teo, S.H., Terry, M.B., Teulé, A.,

Thomassen, M., Thull, D.L., Tischkowitz, M., Toland, A.E., Tollenaar, R.A.E.M.,

Tomlinson, I., Torres, D., Torres-Mejía, G., Troester, M.A., Truong, T., Tung, N.,

Tzardi, M., Ulmer, H.-U., Vachon, C.M., van Asperen, C.J., van der Kolk, L.E., van

Rensburg, E.J., Vega, A., Viel, A., Vijai, J., Vogel, M.J., Wang, Q., Wappenschmidt,

B., Weinberg, C.R., Weitzel, J.N., Wendt, C., Wildiers, H., Winqvist, R., Wolk, A.,

Wu, A.H., Yannoukakos, D., Zhang, Y., Zheng, W., Hunter, D., Pharoah, P.D.P.,

Chang-Claude, J., García-Closas, M., Schmidt, M.K., Milne, R.L., Kristensen, V.N.,

French, J.D., Edwards, S.L., Antoniou, A.C., Chenevix-Trench, G., Simard, J.,

Easton, D.F., Kraft, P., Dunning, A.M., Fine-mapping of 150 breast cancer risk

regions identifies 191 likely target genes (2020) Nature Genetics, 52 (1), pp. 56-73.

PMID: 31911677

11. Peculis, R., Balcere, I., Radovica-Spalvina, I., Konrade, I., Caune, O., Megnis, K.,

Rovite, V., Stukens, J., Nazarovs, J., Breiksa, A., Kiecis, A., Silamikelis, I., Pirags,

V., Klovins, J. Case report: Recurrent pituitary adenoma has increased load of

somatic variants (2020) BMC Endocrine Disorders, 20 (1), art. no. 17, . PMID:

31996211

12. Aleinikova, D., Pole, I., Kimsis, J., Skangale, A., Bobrikova, O., Kazelnika, R.,

Jansone, I., Norvaisa, I., Ozere, I., Ranka, R. Application of whole-genome

34

sequencing in a case study of renal tuberculosis in a child (2020) BMC infectious

diseases, 20 (1), p. 105. PMID: 32024474

13. Kalnins, G., Cesle, E.-E., Jansons, J., Liepins, J., Filimonenko, A., Tars, K.

Encapsulation mechanisms and structural studies of GRM2 bacterial

microcompartment particles (2020) Nature Communications , 11 (1), art. no. 388,

PMID: 31959751

14. Kirsteina, A., Akopjana, I., Bogans, J., Lieknina, I., Jansons, J., Skrastina, D.,

Kazaka, T., Tars, K., Isakova-Sivak, I., Mezhenskaya, D., Kotomina, T.,

Matyushenko, V., Rudenko, L., Kazaks, A. Construction and immunogenicity of a

novel multivalent vaccine prototype based on conserved influenza virus antigens

(2020) Vaccines, 8 (2), art. no. 197. PMID: 32344753

15. Jansons, J., Bayurova, E., Skrastina, D., Kurlanda, A., Fridrihsone, I., Kostyushev,

D., Kostyusheva, A., Artyuhov, A., Dashinimaev, E., Avdoshina, D., Kondrashova,

A., Valuev-Elliston, V., Latyshev, O., Eliseeva, O., Petkov, S., Abakumov, M.,

Hippe, L., Kholodnyuk, I., Starodubova, E., Gorodnicheva, T., Ivanov, A.,

Gordeychuk, I., Isaguliants, M. Expression of the reverse transcriptase domain of

telomerase reverse transcriptase induces lytic cellular response in dna-immunized

mice and limits tumorigenic and metastatic potential of murine adenocarcinoma 4t1

cells (2020) Vaccines 8 (2), art. no. 318, pp. 1-42. PMID: 32570805

16. Eklund, N., Andrianarisoa, N.H., Van Enckevort, E., Anton, G., Debucquoy, A.,

Müller, H., Zaharenko, L., Engels, C., Ebert, L., Neumann, M., Geeraert, J., T'Joen,

V., Demski, H., Caboux, É., Proynova, R., Parodi, B., Mate, S., Van Iperen, E.,

Merino-Martinez, R., Quinlan, P.R., Holub, P., Silander, K. Extending the Minimum

Information about BIobank Data Sharing Terminology to Describe Samples, Sample

Donors, and Events (2020) Biopreservation and Biobanking, 18 (3), pp. 155-164.

PMID: 32302498

17. Parfejevs, V., Sagini, K., Buss, A., Sobolevska, K., Llorente, A., Riekstina, U.,

Abols, A. Adult Stem Cell-Derived Extracellular Vesicles in Cancer Treatment:

Opportunities and Challenges (2020) Cells, 9 (5) PMID: 32397238

18. Brangulis, K., Akopjana, I., Petrovskis, I., Kazaks, A., Tars, K. Structural analysis

of the outer surface proteins from Borrelia burgdorferi paralogous gene family 54

that are thought to be the key players in the pathogenesis of Lyme disease (2020)

Journal of Structural Biology, 210 (2), art. no. 107490 PMID: 32135236

19. Sokolovska, J., Dekante, A., Baumane, L., Pahirko, L., Valeinis, J., Dislere, K.,

Rovite, V., Pirags, V., Sjakste, N. Nitric oxide metabolism is impaired by type 1

diabetes and diabetic nephropathy (2020) Biomedical Reports, 12 (5), pp. 251-258.

PMID: 32257188

20. Storni, F., Cabral-Miranda, G., Roesti, E., Zha, L., Engeroff, P., Zeltins, A., Cragg,

M., Vogel, M., Bachmann, M.F. A Single Monoclonal Antibody against the Peanut

Allergen Ara h 2 Protects against Systemic and Local Peanut Allergy (2020)

International Archives of Allergy and Immunology, 181 (5), pp. 334-341. PMID:

32155619

21. Adriaenssens, E.M., Sullivan, M.B., Knezevic, P., van Zyl, L.J., Sarkar, B.L., Dutilh,

B.E., Alfenas-Zerbini, P., Łobocka, M., Tong, Y., Brister, J.R., Moreno Switt, A.I.,

Klumpp, J., Aziz, R.K., Barylski, J., Uchiyama, J., Edwards, R.A., Kropinski, A.M.,

Petty, N.K., Clokie, M.R.J., Kushkina, A.I., Morozova, V.V., Duffy, S., Gillis, A.,

Rumnieks, J., Kurtböke, İ., Chanishvili, N., Goodridge, L., Wittmann, J., Lavigne,

35

R., Jang, H.B., Prangishvili, D., Enault, F., Turner, D., Poranen, M.M., Oksanen,

H.M., Krupovic, M. Taxonomy of prokaryotic viruses: 2018-2019 update from the

ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee (2020) Archives of Virology,

165 (5), pp. 1253-1260. PMID: 32162068

22. Marcinkiewicz, A.L., Yang, X., Lederman, P.L., Yates, J., Chen, W.-H., Bottazzi,

M.E., Mantis, N.J., Kraiczy, P., Pal, U., Tars, K., Lin, Y.-P. The factor H-binding

site of cspz as a protective target against multistrain, tick-transmitted lyme disease

(2020) Infection and Immunity, 88 (5), art. no. e00956-19 PMID: 32122944

23. Salmina, K., Bojko, A., Inashkina, I., Staniak, K., Dudkowska, M., Podlesniy, P.,

Rumnieks, F., Vainshelbaum, N.M., Pjanova, D., Sikora, E., Erenpreisa, J. “Mitotic

Slippage” and Extranuclear DNA in Cancer Chemoresistance: A Focus on

Telomeres (2020) International Journal of Molecular Sciences, 21 (8), art. no. 2779.

PMID: 32316332

24. Hargunani, P., Tadge, N., Ceruso, M., Leitans, J., Kazaks, A., Tars, K., Gratteri, P.,

Supuran, C.T., Nocentini, A., Toraskar, M.P. Aryl-4,5-dihydro-1H-pyrazole-1-

carboxamide derivatives bearing a sulfonamide moiety show single-digit

nanomolar-to-subnanomolar inhibition constants against the tumor-associated

human carbonic anhydrases IX and XII (2020) International Journal of Molecular

Sciences, 21 (7), art. no. 2621 PMID: 32283813

25. Andersen, P.I., Ianevski, A., Lysvand, H., Vitkauskiene, A., Oksenych, V., Bjørås,

M., Telling, K., Lutsar, I., Dumpis, U., Irie, Y., Tenson, T., Kantele, A., Kainov,

D.E. Discovery and development of safe-in-man broad-spectrum antiviral agents

(2020) International Journal of Infectious Diseases, 93, pp. 268-276. PMID:

32081774

26. Storni, F., Zeltins, A., Balke, I., Heath, M.D., Kramer, M.F., Skinner, M.A., Zha, L.,

Roesti, E., Engeroff, P., Muri, L., von Werdt, D., Gruber, T., Cragg, M., Mlynarczyk,

M., Kündig, T.M., Vogel, M., Bachmann, M.F. Vaccine against peanut allergy based

on engineered virus-like particles displaying single major peanut allergens (2020)

Journal of Allergy and Clinical Immunology, 145 (4), pp. 1240-1253.e3. PMID:

31866435

27. Gibson, D.A., Esnal-Zufiaurre, A., Bajo-Santos, C., Collins, F., Critchley, H.O.D.,

Saunders, P.T.K. Profiling the expression and function of oestrogen receptor isoform

ER46 in human endometrial tissues and uterine natural killer cells (2020) Human

Reproduction, 35 (3), pp. 641-651. PMID: 32108901

28. Kozirovskis, V., Zandberga, E., Magone, M., Purkalne, G., Line, A., Vikmanis, U.

High expression of gli1 is associated with better survival in advanced sclc (2020)

Experimental Oncology, 42 (1), pp. 75-77.. PMID: 32231190

29. Zhang, H., Ahearn, T.U., Lecarpentier, J., Barnes, D., Beesley, J., Qi, G., Jiang, X.,

O’Mara, T.A., Zhao, N., Bolla, M.K., Dunning, A.M., Dennis, J., Wang, Q., Ful,

Z.A., Aittomäki, K., Andrulis, I.L., Anton-Culver, H., Arndt, V., Aronson, K.J.,

Arun, B.K., Auer, P.L., Azzollini, J., Barrowdale, D., Becher, H., Beckmann, M.W.,

Behrens, S., Benitez, J., Bermisheva, M., Bialkowska, K., Blanco, A., Blomqvist,

C., Bogdanova, N.V., Bojesen, S.E., Bonanni, B., Bondavalli, D., Borg, A., Brauch,

H., Brenner, H., Briceno, I., Broeks, A., Brucker, S.Y., Brüning, T., Burwinkel, B.,

Buys, S.S., Byers, H., Caldés, T., Caligo, M.A., Calvello, M., Campa, D., Castelao,

J.E., Chang-Claude, J., Chanock, S.J., Christiaens, M., Christiansen, H., Chung,

W.K., Claes, K.B.M., Clarke, C.L., Cornelissen, S., Couch, F.J., Cox, A., Cross,

36

S.S., Czene, K., Daly, M.B., Devilee, P., Diez, O., Domchek, S.M., Dörk, T., Dwek,

M., Eccles, D.M., Ekici, A.B., Evans, D.G., Fasching, P.A., Figueroa, J., Foretova,

L., Fostira, F., Friedman, E., Frost, D., Gago-Dominguez, M., Gapstur, S.M., Garber,

J., García-Sáenz, J.A., Gaudet, M.M., Gayther, S.A., Giles, G.G., Godwin, A.K.,

Goldberg, M.S., Goldgar, D.E., González-Neira, A., Greene, M.H., Gronwald, J.,

Guénel, P., Häberle, L., Hahnen, E., Haiman, C.A., Hake, C.R., Hall, P., Hamann,

U., Harkness, E.F., Heemskerk-Gerritsen, B.A.M., Hillemanns, P., Hogervorst,

F.B.L., Holleczek, B., Hollestelle, A., Hooning, M.J., Hoover, R.N., Hopper, J.L.,

Howell, A., Huebner, H., Hulick, P.J., Imyanitov, E.N., Isaacs, C., Izatt, L., Jager,

A., Jakimovska, M., Jakubowska, A., James, P., Janavicius, R., Janni, W., John,

E.M., Jones, M.E., Jung, A., Kaaks, R., Kapoor, P.M., Karlan, B.Y., Keeman, R.,

Khan, S., Khusnutdinova, E., Kitahara, C.M., Ko, Y.-D., Konstantopoulou, I.,

Koppert, L.B., Koutros, S., Kristensen, V.N., Laenkholm, A.-V., Lambrechts, D.,

Larsson, S.C., Laurent-Puig, P., Lazaro, C., Lazarova, E., Lejbkowicz, F., Leslie, G.,

Lesueur, F., Lindblom, A., Lissowska, J., Lo, W.-Y., Loud, J.T., Lubinski, J.,

Lukomska, A., MacInnis, R.J., Mannermaa, A., Manoochehri, M., Manoukian, S.,

Margolin, S., Martinez, M.E., Matricardi, L., McGuffog, L., McLean, C., Mebirouk,

N., Meindl, A., Menon, U., Miller, A., Mingazheva, E., Montagna, M., Mulligan,

A.M., Mulot, C., Muranen, T.A., Nathanson, K.L., Neuhausen, S.L., Nevanlinna,

H., Neven, P., Newman, W.G., Nielsen, F.C., Nikitina-Zake, L., Nodora, J., Offit,

K., Olah, E., Olopade, O.I., Olsson, H., Orr, N., Papi, L., Papp, J., Park-Simon, T.-

W., Parsons, M.T., Peissel, B., Peixoto, A., Peshkin, B., Peterlongo, P., Peto, J.,

Phillips, K.-A., Piedmonte, M., Plaseska-Karanfilska, D., Prajzendanc, K., Prentice,

R., Prokofyeva, D., Rack, B., Radice, P., Ramus, S.J., Rantala, J., Rashid, M.U.,

Rennert, G., Rennert, H.S., Risch, H.A., Romero, A., Rookus, M.A., Rübner, M.,

Rüdiger, T., Saloustros, E., Sampson, S., Sandler, D.P., Sawyer, E.J., Scheuner,

M.T., Schmutzler, R.K., Schneeweiss, A., Schoemaker, M.J., Schöttker, B.,

Schürmann, P., Senter, L., Sharma, P., Sherman, M.E., Shu, X.-O., Singer, C.F.,

Smichkoska, S., Soucy, P., Southey, M.C., Spinelli, J.J., Stone, J., Stoppa-Lyonnet,

D., Swerdlow, A.J., Szabo, C.I., Tamimi, R.M., Tapper, W.J., Taylor, J.A., Teixeira,

M.R., Terry, M.B., Thomassen, M., Thull, D.L., Tischkowitz, M., Toland, A.E.,

Tollenaar, R.A.E.M., Tomlinson, I., Torres, D., Troester, M.A., Truong, T., Tung,

N., Untch, M., Vachon, C.M., van den Ouweland, A.M.W., van der Kolk, L.E., van

Veen, E.M., vanRensburg, E.J., Vega, A., Wappenschmidt, B., Weinberg, C.R.,

Weitzel, J.N., Wildiers, H., Winqvist, R., Wolk, A., Yang, X.R., Yannoukakos, D.,

Zheng, W., Zorn, K.K., Milne, R.L., Kraft, P., Simard, J., Pharoah, P.D.P.,

Michailidou, K., Antoniou, A.C., Schmidt, M.K., Chenevix-Trench, G., Easton,

D.F., Chatterjee, N., García-Closas, M., kConFab Investigators, ABCTB

Investigators, EMBRACE Study, GEMO Study Collaborators. Genome-wide

association study identifies 32 novel breast cancer susceptibility loci from overall

and subtype-specific analyses (2020) Nature Genetics, 52 (6), pp. 572-581. PMID:

32424353

30. Patel, V.L., Busch, E.L., Friebel, T.M., Cronin, A., Leslie, G., McGuffog, L., Adlard,

J., Agata, S., Agnarsson, B.A., Ahmed, M., Aittom, K., Alducci, E., Andrulis, I.L.,

Arason, A., Arnold, N., Artioli, G., Arver, B., Auber, B., Azzollini, J., Balmaña, J.,

Barkardottir, R.B., Barnes, D.R., Barroso, A., Barrowdale, D., Belotti, M., Benitez,

J., Bertelsen, B., Blok, M.J., Bodrogi, I., Bonadona, V., Bonanni, B., Bondavalli, D.,

37

Boonen, S.E., Borde, J., Borg, A., Bradbury, A.R., Brady, A., Brewer, C., Brunet,

J., Buecher, B., Buys, S.S., Cabezas-Camarero, S., Caldes, T., Caliebe, A., Caligo,

M.A., Calvello, M., Campbell, I.G., Carnevali, I., Carrasco, E., Chan, T.L., Chu,

A.T.W., Chung, W.K., Claes, K.B.M., Cook, J., Cortesi, L., Couch, F.J., Daly, M.B.,

Damante, G., Darder, E., Davidson, R., De La Hoya, M., Della Puppa, L., Dennis,

J., Díez, O., Ding, Y.C., Ditsch, N., Domchek, S.M., Donaldson, A., Dworniczak,

B., Easton, D.F., Eccles, D.M., Eeles, R.A., Ehrencrona, H., Ejlertsen, B., Engel, C.,

Evans, D.G., Faivre, L., Faust, U., Feliubadalo, L.Foretova, L., Fostira, F.,

Fountzilas, G., Frost, D., García-Barberan, V., Garre, P., Gauthier-Villars, M.,

Geczi, L., Gehrig, A., Gerdes, A.-M., Gesta, P., Giannini, G., Glendon, G., Godwin,

A.K., Goldgar, D.E., Greene, M.H., Gutierrez-Barrera, A.M., Hahnen, E., Hamann,

U., Hauke, J., Herold, N., Hogervorst, F.B.L., Honisch, E., Hopper, J.L., Hulick,

P.J., Izatt, L., Jager, A., James, P., Janavicius, R., Jensen, U.B., Jensen, T.D.,

Johannsson, O.Th., John, E.M., Joseph, V., Kang, E., Kast, K., Kiiski, J.I., Kim, S.-

W., Kim, Z., Ko, K.-P., Konstantopoulou, I., Kramer, G., Krogh, L., Kruse, T.A.,

Kwong, A., Larsen, M., Lasset, C., Lautrup, C., Lazaro, C., Lee, J., Lee, J.W., Lee,

M.H., Lemke, J., Lesueur, F., Liljegren, A., Lindblom, A., Llovet, P., Lopez-

Fernandez, A., Lopez-Perolio, I., Lorca, V., Loud, J.T., Ma, E.S.K., Mai, P.L.,

Manoukian, S., Mari, V., Martin, L., Matricardi, L., Mebirouk, N., Medici, V.,

Meijers-Heijboer, H.E.J., Meindl, A., Mensenkamp, A.R., Miller, C., Gomes, D.M.,

Montagna, M., Mooij, T.M., Moserle, L., Mouret-Fourme, E., Mulligan, A.M.,

Nathanson, K.L., Navratilova, M., Nevanlinna, H., Niederacher, D., Cilius Nielsen,

F.C., Nikitina-Zake, L., Offit, K., Olah, E., Olopade, O.I., Ong, K.-R., Osorio, A.,

Ott, C.-E., Palli, D., Park, S.K., Parsons, M.T., Pedersen, I.S., Peissel, B., Peixoto,

A., Perez-Segura, P., Peterlongo, P., Petersen, A.H., Porteous, M.E., Pujana, M.A.,

Radice, P., Ramser, J., Rantala, J., Rashid, M.U., Rhiem, K., Rizzolo, P., Robson,

M.E., Rookus, M.A., Rossing, C.M., Ruddy, K.J., Santos, C., Saule, C., Scarpitta,

R., Schmutzler, R.K., Schuster, H., Senter, L., Seynaeve, C.M., Shah, P.D., Sharma,

P., Shin, V.Y., Silvestri, V., Simard, J., Singer, C.F., Skytte, A.-B., Snape, K.,

Solano, A.R., Soucy, P., Southey, M.C., Spurdle, A.B., Steele, L., Steinemann, D.,

Stoppa-Lyonnet, D., Stradella, A., Sunde, L., Sutter, C., Tan, Y.Y., Teixeira, M.R.,

Teo, S.H., Thomassen, M., Tibiletti, M.G., Tischkowitz, M., Tognazzo, S., Toland,

A.E., Tommasi, S., Torres, D., Toss, A., Trainer, A.H., Tung, N., Van Asperen, C.J.,

Van Der Baan, F.H., Van Der Kolk, L.E., Van Der Luijt, R.B., Van Hest, L.P.,

Varesco, L., Varon-Mateeva, R., Viel, A., Vierstrate, J., Villa, R., Von Wachenfeldt,

A., Wagner, P., Wang-Gohrke, S., Wappenschmidt, B., Weitzel, J.N., Wieme, G.,

Yadav, S., Yannoukakos, D., Yoon, S.-Y., Zanzottera, C., Zorn, K.K., D’Amico,

A.V., Freedman, M.L., Pomerantz, M.M., Chenevix-Trench, G., Antoniou, A.C.,

Neuhausen, S.L., Ottini, L., Nielsen, H.R., Rebbeck, T.R., Association of genomic

domains in BRCA1 and BRCA2 with prostate cancer risk and aggressiveness

(2020)Cancer Research, 80 (3), pp. 624-638. PMID: 31723001

31. Balke, I., Zeltins, A. Recent advances in the use of plant virus-like particles as

vaccines (2020) Viruses, 12 (3), art. no. 270. PMID: 32121192

32. Kalniņš, M., Bērziņš, A., Gudrā, D., Megnis, K., Fridmanis, D., Danilko, P., Muter,

O. Selective enrichment of heterotrophic nitrifiers Alcaligenaceae and alcanivorax

spp. From industrial wastewaters (2020) AIMS Microbiology, 6 (1), pp. 32-42.

PMID: 32226913

38

33. Stavusis, J., Micule, I., Wright, N.T., Straub, V., Topf, A., Panadés-de Oliveira, L.,

Domínguez-González, C., Inashkina, I., Kidere, D., Chrestian, N., Lace, B. Collagen

VI-related limb-girdle syndrome caused by frequent mutation in COL6A3 gene with

conflicting reports of pathogenicity (2020) Neuromuscular Disorders, 30 (6), pp.

483-491. PMID: 32448721

34. Peculis, R., Mandrika, I., Petrovska, R., Dortane, R., Megnis, K., Nazarovs, J.,

Balcere, I., Stukens, J., Konrade, I., Pirags, V., Klovins, J., Rovite, V. Pituispheres

Contain Genetic Variants Characteristic to Pituitary Adenoma Tumor Tissue (2020)

Frontiers in Endocrinology, 11, art. no. 313 PMID: 32528411

35. Zrelovs, N., Dislers, A., Kazaks, A. Novel Erwinia persicina Infecting Phage

Midgardsormr38 Within the Context of Temperate Erwinia Phages (2020) Frontiers

in Microbiology, 11, art. no. 1245. PMID: 32636815

36. Gudra, D., Pupola, D., Skenders, G., Leja, M., Radovica-Spalvina, I., Gorskis, H.,

Vangravs, R., Fridmanis, D. Lack of significant differences between gastrointestinal

tract microbial population structure of Helicobacter pylori-infected subjects before

and 2 years after a single eradication event (2020) Helicobacter, 25 (5), art. no.

e12748. PMID: 32776403

37. Sokolovska, J., Stefanovics, J., Gersone, G., Pahirko, L., Valeinis, J., Kalva-

Vaivode, S., Rovite, V., Blumfelds, L., Pirags, V., Tretjakovs, P. Angiopoietin 2 and

Neuropeptide y are Associated with Diabetic Kidney Disease in Type 1 Diabetes

Mellitus (2020) Experimental and Clinical Endocrinology and Diabetes, 128 (10),

pp. 654-662. PMID: 31958847

38. Pjanova, D., Ruklisa, D., Kregere, E., Azarjana, K., Ozola, A., Cema, I. Features

associated with melanoma metastasis in Latvia (2020) Oncology Letters, 20 (4), art.

no. 11978. PMID: 32863930

39. Barnes, D.R., Rookus, M.A., McGuffog, L., Leslie, G., Mooij, T.M., Dennis, J.,

Mavaddat, N., Adlard, J., Ahmed, M., Aittomäki, K., Andrieu, N., Andrulis, I.L.,

Arnold, N., Arun, B.K., Azzollini, J., Balmaña, J., Barkardottir, R.B., Barrowdale,

D., Benitez, J., Berthet, P., Białkowska, K., Blanco, A.M., Blok, M.J., Bonanni, B.,

Boonen, S.E., Borg, Å., Bozsik, A., Bradbury, A.R., Brennan, P., Brewer, C.,

Brunet, J., Buys, S.S., Caldés, T., Caligo, M.A., Campbell, I., Christensen, L.L.,

Chung, W.K., Claes, K.B.M., Colas, C., Collonge-Rame, M.-A., Cook, J., Daly,

M.B., Davidson, R., de la Hoya, M., de Putter, R., Delnatte, C., Devilee, P., Diez,

O., Ding, Y.C., Domchek, S.M., Dorfling, C.M., Dumont, M., Eeles, R., Ejlertsen,

B., Engel, C., Evans, D.G., Faivre, L., Foretova, L., Fostira, F., Friedlander, M.,

Friedman, E., Frost, D., Ganz, P.A., Garber, J., Gehrig, A., Gerdes, A.-M., Gesta, P.,

Giraud, S., Glendon, G., Godwin, A.K., Goldgar, D.E., González-Neira, A., Greene,

M.H., Gschwantler-Kaulich, D., Hahnen, E., Hamann, U., Hanson, H., Hentschel,

J., Hogervorst, F.B.L., Hooning, M.J., Horvath, J., Hu, C., Hulick, P.J., Imyanitov,

E.N., Isaacs, C., Izatt, L., Izquierdo, A., Jakubowska, A., James, P.A., Janavicius,

R., John, E.M., Joseph, V., Karlan, B.Y., Kast, K., Koudijs, M., Kruse, T.A., Kwong,

A., Laitman, Y., Lasset, C., Lazaro, C., Lester, J., Lesueur, F., Liljegren, A., Loud,

J.T., Lubiński, J., Mai, P.L., Manoukian, S., Mari, V., Mebirouk, N., Meijers-

Heijboer, H.E.J., Meindl, A., Mensenkamp, A.R., Miller, A., Montagna, M.,

Mouret-Fourme, E., Mukherjee, S., Mulligan, A.M., Nathanson, K.L., Neuhausen,

S.L., Nevanlinna, H., Niederacher, D., Nielsen, F.C., Nikitina-Zake, L., Noguès, C.,

Olah, E., Olopade, O.I., Ong, K.-R., O'Shaughnessy-Kirwan, A., Osorio, A., Ott, C.-

39

E., Papi, L., Park, S.K., Parsons, M.T., Pedersen, I.S., Peissel, B., Peixoto, A.,

Peterlongo, P., Pfeiler, G., Phillips, K.-A., Prajzendanc, K., Pujana, M.A., Radice,

P., Ramser, J., Ramus, S.J., Rantala, J., Rennert, G., Risch, H.A., Robson, M.,

Rønlund, K., Salani, R., Schuster, H., Senter, L., Shah, P.D., Sharma, P., Side, L.E.,

Singer, C.F., Slavin, T.P., Soucy, P., Southey, M.C., Spurdle, A.B., Steinemann, D.,

Steinsnyder, Z., Stoppa-Lyonnet, D., Sutter, C., Tan, Y.Y., Teixeira, M.R., Teo,

S.H., Thull, D.L., Tischkowitz, M., Tognazzo, S., Toland, A.E., Trainer, A.H., Tung,

N., van Engelen, K., van Rensburg, E.J., Vega, A., Vierstraete, J., Wagner, G.,

Walker, L., Wang-Gohrke, S., Wappenschmidt, B., Weitzel, J.N., Yadav, S., Yang,

X., Yannoukakos, D., Zimbalatti, D., Offit, K., Thomassen, M., Couch, F.J.,

Schmutzler, R.K., Simard, J., Easton, D.F., Chenevix-Trench, G., Antoniou, A.C.,

GEMO Study Collaborators, EMBRACE Collaborators, kConFab Investigators,

HEBON Investigators, GENEPSO Investigators, Consortium of Investigators of

Modifiers of BRCA and BRCA2. Polygenic risk scores and breast and epithelial

ovarian cancer risks for carriers of BRCA1 and BRCA2 pathogenic variants (2020)

Genetics in Medicine, 22 (10), pp. 1653-1666. PMID: 32665703

40. García-Calzón, S., Perfilyev, A., Martinell, M., Ustinova, M., Kalamajski, S.,

Franks, P.W., Bacos, K., Elbere, I., Pihlajamäki, J., Volkov, P., Vaag, A., Groop, L.,

Maziarz, M., Klovins, J., Ahlqvist, E., Ling, C. Epigenetic markers associated with

metformin response and intolerance in drug-naïve patients with type 2 diabetes

(2020) Science Translational Medicine, 12 (561), art. no. eaaz1803. PMID:

32938793

41. Rumnieks, J., Lieknina, I., Kalninš, G., Sišovs, M., Akopjana, I., Bogans, J., Tars,

K. Three-dimensional structure of 22 uncultured ssrna bacteriophages: Flexibility of

the coat protein fold and variations in particle shapes (2020) Science Advances, 6

(36), art. no. eabc0023. PMID: 32917600

42. Bojko, A., Staniak, K., Czarnecka-Herok, J., Sunderland, P., Dudkowska, M.,

Śliwińska, M.A., Salmina, K., Sikora, E. Improved autophagic flux in escapers from

doxorubicin-induced senescence/polyploidy of breast cancer cells (2020)

International Journal of Molecular Sciences, 21 (17), art. no. 6084, pp. 1-22. PMID:

32846959

43. Vedmedovska, N., Bokucava, D., Kivite-Urtane, A., Rovite, V., Zake-Nikitina, L.,

Klovins, J., Fodina, V., Donders, G.G.G. The correlation between abnormal uterine

artery flow in the first trimester and genetic thrombophilic alteration: a prospective

case-controlled pilot study (2020) Diagnostics, 10 (9), art. no. 654. PMID: 32878173

44. Liekniņa, I., Černova, D., Rūmnieks, J., Tārs, K. Novel ssRNA phage VLP platform

for displaying foreign epitopes by genetic fusion (2020) Vaccine, 38 (38), pp. 6019-

6026. PMID: 32713683

45. Martín-Gracia, B., Martín-Barreiro, A., Cuestas-Ayllón, C., Grazú, V., Line, A.,

Llorente, A., De La Fuente, J.M., Moros, M. Nanoparticle-based biosensors for

detection of extracellular vesicles in liquid biopsies (2020) Journal of Materials

Chemistry B, 8 (31), pp. 6710-6738. PMID: 32627783

46. Ustinova, M., Ansone, L., Silamikelis, I., Rovite, V., Elbere, I., Silamikele, L.,

Kalnina, I., Fridmanis, D., Sokolovska, J., Konrade, I., Pirags, V., Klovins, J. Whole-

blood transcriptome profiling reveals signatures of metformin and its therapeutic

response (2020) PLoS ONE, 15 (8 August), art. no. e0237400. PMID: 32780768

40

47. Mezinska, S., Kaleja, J., Mileiko, I., Santare, D., Rovite, V., Tzivian, L. Public

awareness of and attitudes towards research biobanks in Latvia (2020) BMC

Medical Ethics, 21 (1), art. no. 65. PMID: 32736554

48. Capligina, V., Seleznova, M., Akopjana, S., Freimane, L., Lazovska, M., Krumins,

R., Kivrane, A., Namina, A., Aleinikova, D., Kimsis, J., Kazarina, A., Igumnova,

V., Bormane, A., Ranka, R. Large-scale countrywide screening for tick-borne

pathogens in field-collected ticks in Latvia during 2017-2019 (2020) Parasites and

Vectors, 13 (1), art. no. 351. PMID: 32665019

49. Feng, H., Gusev, A., Pasaniuc, B., Wu, L., Long, J., Abu-full, Z., Aittomäki, K.,

Andrulis, I.L., Anton-Culver, H., Antoniou, A.C., Arason, A., Arndt, V., Aronson,

K.J., Arun, B.K., Asseryanis, E., Auer, P.L., Azzollini, J., Balmaña, J., Barkardottir,

R.B., Barnes, D.R., Barrowdale, D., Beckmann, M.W., Behrens, S., Benitez, J.,

Bermisheva, M., Białkowska, K., Blanco, A., Blomqvist, C., Boeckx, B.,

Bogdanova, N.V., Bojesen, S.E., Bolla, M.K., Bonanni, B., Borg, A., Brauch, H.,

Brenner, H., Briceno, I., Broeks, A., Brüning, T., Burwinkel, B., Cai, Q., Caldés, T.,

Caligo, M.A., Campbell, I., Canisius, S., Campa, D., Carter, B.D., Carter, J.,

Castelao, J.E., Chang-Claude, J., Chanock, S.J., Christiansen, H., Chung, W.K.,

Claes, K.B.M., Clarke, C.L., Couch, F.J., Cox, A., Cross, S.S., Cybulski, C., Czene,

K., Daly, M.B., de la Hoya, M., De Leeneer, K., Dennis, J., Devilee, P., Diez, O.,

Domchek, S.M., Dörk, T., dos-Santos-Silva, I., Dunning, A.M., Dwek, M., Eccles,

D.M., Ejlertsen, B., Ellberg, C., Engel, C., Eriksson, M., Fasching, P.A., Fletcher,

O., Flyger, H., Fostira, F., Friedman, E., Fritschi, L., Frost, D., Gabrielson, M., Ganz,

P.A., Gapstur, S.M., Garber, J., García-Closas, M., García-Sáenz, J.A., Gaudet,

M.M., Giles, G.G., Glendon, G., Godwin, A.K., Goldberg, M.S., Goldgar, D.E.,

González-Neira, A., Greene, M.H., Gronwald, J., Guénel, P., Haiman, C.A., Hall,

P., Hamann, U., Hake, C., He, W., Heyworth, J., Hogervorst, F.B.L., Hollestelle, A.,

Hooning, M.J., Hoover, R.N., Hopper, J.L., Huang, G., Hulick, P.J., Humphreys, K.,

Imyanitov, E.N., Isaacs, C., Jakimovska, M., Jakubowska, A., James, P., Janavicius,

R., Jankowitz, R.C., John, E.M., Johnson, N., Joseph, V., Jung, A., Karlan, B.Y.,

Khusnutdinova, E., Kiiski, J.I., Konstantopoulou, I., Kristensen, V.N., Laitman, Y.,

Lambrechts, D., Lazaro, C., Leroux, D., Leslie, G., Lester, J., Lesueur, F., Lindor,

N., Lindström, S., Lo, W.-Y., Loud, J.T., Lubiński, J., Makalic, E., Mannermaa, A.,

Manoochehri, M., Manoukian, S., Margolin, S., Martens, J.W.M., Martinez, M.E.,

Matricardi, L., Maurer, T., Mavroudis, D., McGuffog, L., Meindl, A., Menon, U.,

Michailidou, K., Kapoor, P.M., Miller, A., Montagna, M., Moreno, F., Moserle, L.,

Mulligan, A.M., Muranen, T.A., Nathanson, K.L., Neuhausen, S.L., Nevanlinna, H.,

Nevelsteen, I., Nielsen, F.C., Nikitina-Zake, L., Offit, K., Olah, E., Olopade, O.I.,

Olsson, H., Osorio, A., Papp, J., Park-Simon, T.-W., Parsons, M.T., Pedersen, I.S.,

Peixoto, A., Peterlongo, P., Peto, J., Pharoah, P.D.P., Phillips, K.-A., Plaseska-

Karanfilska, D., Poppe, B., Pradhan, N., Prajzendanc, K., Presneau, N., Punie, K.,

Pylkäs, K., Radice, P., Rantala, J., Rashid, M.U., Rennert, G., Risch, H.A., Robson,

M., Romero, A., Saloustros, E., Sandler, D.P., Santos, C., Sawyer, E.J., Schmidt,

M.K., Schmidt, D.F., Schmutzler, R.K., Schoemaker, M.J., Scott, R.J., Sharma, P.,

Shu, X.-O., Simard, J., Singer, C.F., Skytte, A.-B., Soucy, P., Southey, M.C.,

Spinelli, J.J., Spurdle, A.B., Stone, J., Swerdlow, A.J., Tapper, W.J., Taylor, J.A.,

Teixeira, M.R., Terry, M.B., Teulé, A., Thomassen, M., Thöne, K., Thull, D.L.,

Tischkowitz, M., Toland, A.E., Tollenaar, R.A.E.M., Torres, D., Truong, T., Tung,

41

N., Vachon, C.M., van Asperen, C.J., van den Ouweland, A.M.W., van Rensburg,

E.J., Vega, A., Viel, A., Vieiro-Balo, P., Wang, Q., Wappenschmidt, B., Weinberg,

C.R., Weitzel, J.N., Wendt, C., Winqvist, R., Yang, X.R., Yannoukakos, D., Ziogas,

A., Milne, R.L., Easton, D.F., Chenevix-Trench, G., Zheng, W., Kraft, P., Jiang, X.,

GEMO Study Collaborators, EMBRACE Collaborators, GC-HBOC study

Collaborators, ABCTB Investigators, HEBON Investigators, BCFR Investigators,

OCGN Investigators. Transcriptome-wide association study of breast cancer risk by

estrogen-receptor status (2020) Genetic Epidemiology, 44 (5), pp. 442-468. PMID:

32115800

50. Tars, K. SsRNA phages: Life cycle, structure and applications (2020)

Biocommunication of Phages, pp. 261-292.

51. Malniece, I., Grasmane, A., Inashkina, I., Stavusis, J., Kreile, M., Miklasevics, E.,

Gailite, L. The fetal phenotype of noonan syndrome caused by severe, cancer-related

PTPN11 variants (2020) American Journal of Case Reports, 21, art. no. e922468,

pp. e922468-1-e922468-6. PMID: 32794475

52. Zalizko, P., Stefanovics, J., Sokolovska, J., Paramonova, N., Klavina, E., Erts, R.,

Rovite, V., Klovins, J., Pukitis, A. Thiopurine S-methyltransferase genetic

polymorphisms in adult patients with inflammatory bowel diseases in the Latvian

population (2020) Therapeutic Advances in Gastroenterology, 13. PMID: 32704308

53. Fridmanis, J., Bobrovs, R., Brangulis, K., Tārs, K., Jaudzems, K. Structural and

functional analysis of bba03, borrelia burgdorferi competitive advantage promoting

outer surface lipoprotein (2020) Pathogens, 9 (10), art. no. 826, pp. 1-13. PMID:

33050189

54. Silvestri, V., Leslie, G., Barnes, D.R., Agnarsson, B.A., Aittomäki, K., Alducci, E.,

Andrulis, I.L., Barkardottir, R.B., Barroso, A., Barrowdale, D., Benitez, J., Bonanni,

B., Borg, A., Buys, S.S., Caldés, T., Caligo, M.A., Capalbo, C., Campbell, I., Chung,

W.K., Claes, K.B.M., Colonna, S.V., Cortesi, L., Couch, F.J., De La Hoya, M., Diez,

O., Ding, Y.C., Domchek, S., Easton, D.F., Ejlertsen, B., Engel, C., Evans, D.G.,

Feliubadalò, L., Foretova, L., Fostira, F., Géczi, L., Gerdes, A.-M., Glendon, G.,

Godwin, A.K., Goldgar, D.E., Hahnen, E., Hogervorst, F.B.L., Hopper, J.L., Hulick,

P.J., Isaacs, C., Izquierdo, A., James, P.A., Janavicius, R., Jensen, U.B., John, E.M.,

Joseph, V., Konstantopoulou, I., Kurian, A.W., Kwong, A., Landucci, E., Lesueur,

F., Loud, J.T., MacHackova, E., Mai, P.L., Majidzadeh-A, K., Manoukian, S.,

Montagna, M., Moserle, L., Mulligan, A.M., Nathanson, K.L., Nevanlinna, H.,

Ngeow Yuen Ye, J., Nikitina-Zake, L., Offit, K., Olah, E., Olopade, O.I., Osorio, A.,

Papi, L., Park, S.K., Pedersen, I.S., Perez-Segura, P., Petersen, A.H., Pinto, P.,

Porfirio, B., Pujana, M.A., Radice, P., Rantala, J., Rashid, M.U., Rosenzweig, B.,

Rossing, M., Santamarinã, M., Schmutzler, R.K., Senter, L., Simard, J., Singer, C.F.,

Solano, A.R., Southey, M.C., Steele, L., Steinsnyder, Z., Stoppa-Lyonnet, D., Tan,

Y.Y., Teixeira, M.R., Teo, S.H., Terry, M.B., Thomassen, M., Toland, A.E., Torres-

Esquius, S., Tung, N., Van Asperen, C.J., Vega, A., Viel, A., Vierstraete, J.,

Wappenschmidt, B., Weitzel, J.N., Wieme, G., Yoon, S.-Y., Zorn, K.K., McGuffog,

L., Parsons, M.T., Hamann, U., Greene, M.H., Kirk, J.A., Neuhausen, S.L.,

Rebbeck, T.R., Tischkowitz, M., Chenevix-Trench, G., Antoniou, A.C., Friedman,

E., Ottini, L. Characterization of the Cancer Spectrum in Men with Germline

BRCA1 and BRCA2 Pathogenic Variants: Results from the Consortium of

42

Investigators of Modifiers of BRCA1/2 (CIMBA) (2020) JAMA Oncology, 6 (8),

pp. 1218-1230. PMID: 32614418

55. Kamitaki, N., Sekar, A., Handsaker, R.E., de Rivera, H., Tooley, K., Morris, D.L.,

Taylor, K.E., Whelan, C.W., Tombleson, P., Loohuis, L.M.O., Ripke, S., Neale,

B.M., Corvin, A., Walters, J.T.R., Farh, K.-H., Holmans, P.A., Lee, P., Bulik-

Sullivan, B., Collier, D.A., Huang, H., Pers, T.H., Agartz, I., Agerbo, E., Albus, M.,

Alexander, M., Amin, F., Bacanu, S.A., Begemann, M., Belliveau, R.A., Jr, Bene,

J., Bergen, S.E., Bevilacqua, E., Bigdeli, T.B., Black, D.W., Bruggeman, R.,

Buccola, N.G., Buckner, R.L., Byerley, W., Cahn, W., Cai, G., Cairns, M.J.,

Campion, D., Cantor, R.M., Carr, V.J., Carrera, N., Catts, S.V., Chambert, K.D.,

Chan, R.C.K., Chen, R.Y.L., Chen, E.Y.H., Cheng, W., Cheung, E.F.C., Chong,

S.A., Cloninger, C.R., Cohen, D., Cohen, N., Cormican, P., Craddock, N., Crespo-

Facorro, B., Crowley, J.J., Curtis, D., Davidson, M., Davis, K.L., Degenhardt, F.,

Del Favero, J., DeLisi, L.E., Demontis, D., Dikeos, D., Dinan, T., Djurovic, S.,

Donohoe, G., Drapeau, E., Duan, J., Dudbridge, F., Durmishi, N., Eichhammer, P.,

Eriksson, J., Escott-Price, V., Essioux, L., Fanous, A.H., Farrell, M.S., Frank, J.,

Franke, L., Freedman, R., Freimer, N.B., Friedl, M., Friedman, J.I., Fromer, M.,

Genovese, G., Georgieva, L., Gershon, E.S., Giegling, I., Giusti-Rodríguez, P.,

Godard, S., Goldstein, J.I., Golimbet, V., Gopal, S., Gratten, J., de Haan, L., Mitjans,

M., Hamshere, M.L., Hansen, M., Hansen, T., Haroutunian, V., Hartmann, A.M.,

Henskens, F.A., Herms, S., Hirschhorn, J.N., Hoffmann, P., Hofman, A.,

Hollegaard, M.V., Hougaard, D.M., Ikeda, M., Joa, I., Julià, A., Kahn, R.S.,

Kalaydjieva, L., Karachanak-Yankova, S., Karjalainen, J., Kavanagh, D., Keller,

M.C., Kelly, B.J., Kennedy, J.L., Khrunin, A., Kim, Y., Klovins, J., Knowles, J.A.,

Konte, B., Kucinskas, V., Kucinskiene, Z.A., Kuzelova-Ptackova, H., Kähler, A.K.,

Laurent, C., Keong, J.L.C., Lee, S.H., Legge, S.E., Lerer, B., Li, M., Li, T., Liang,

K.-Y., Lieberman, J., Limborska, S., Loughland, C.M., Jan Lubinski, Lönnqvist, J.,

Macek, M., Jr, Magnusson, P.K.E., Maher, B.S., Maier, W., Mallet, J., Marsal, S.,

Mattheisen, M., Mattingsdal, M., McCarley, R.W., McDonald, C., McIntosh, A.M.,

Meier, S., Meijer, C.J., Melegh, B., Melle, I., Mesholam-Gately, R.I., Metspalu, A.,

Michie, P.T., Milani, L., Milanova, V., Mokrab, Y., Morris, D.W., Mors, O.,

Murphy, K.C., Murray, R.M., Myin-Germeys, I., Müller-Myhsok, B., Nelis, M.,

Nenadic, I., Nertney, D.A., Nestadt, G., Nicodemus, K.K., Nikitina-Zake, L.,

Nisenbaum, L., Nordin, A., O’Callaghan, E., O’Dushlaine, C., O’Neill, F.A., Oh, S.-

Y., Olincy, A., Olsen, L., Van Os, J., Pantelis, C., Papadimitriou, G.N., Steixner,

A.A., Parkhomenko, E., Pato, M.T., Paunio, T., Pejovic-Milovancevic, M., Perkins,

D.O., Pietiläinen, O., Pimm, J., Pocklington, A.J., Powell, J., Price, A., Pulver, A.E.,

Purcell, S.M., Quested, D., Rasmussen, H.B., Reichenberg, A., Reimers, M.A.,

Richards, A.L., Roffman, J.L., Roussos, P., Ruderfer, D.M., Salomaa, V., Sanders,

A.R., Schall, U., Schubert, C.R., Schulze, T.G., Schwab, S.G., Scolnick, E.M., Scott,

R.J., Seidman, L.J., Shi, J., Sigurdsson, E., Silagadze, T., Silverman, J.M., Sim, K.,

Slominsky, P., Smoller, J.W., So, H.-C., Spencer, C.C.A., Stahl, E.A., Stefansson,

H., Steinberg, S., Stogmann, E., Straub, R.E., Strengman, E., Strohmaier, J., Stroup,

T.S., Subramaniam, M., Suvisaari, J., Svrakic, D.M., Szatkiewicz, J.P., Söderman,

E., Thirumalai, S., Toncheva, D., Tooney, P.A., Tosato, S., Veijola, J., Waddington,

J., Walsh, D., Wang, D., Wang, Q., Webb, B.T., Weiser, M., Wildenauer, D.B.,

Williams, N.M., Williams, S., Witt, S.H., Wolen, A.R., Wong, E.H.M., Wormley,

43

B.K., Wu, J.Q., Xi, H.S., Zai, C.C., Zheng, X., Zimprich, F., Wray, N.R., Stefansson,

K., Visscher, P.M., Adolfsson, R., Andreassen, O.A., Blackwood, D.H.R., Bramon,

E., Buxbaum, J.D., Børglum, A.D., Cichon, S., Darvasi, A., Domenici, E.,

Ehrenreich, H., Esko, T., Gejman, P.V., Gill, M., Gurling, H., Hultman, C.M., Iwata,

N., Jablensky, A.V., Jönsson, E.G., Kendler, K.S., Kirov, G., Knight, J., Lencz, T.,

Levinson, D.F., Li, Q.S., Liu, J., Malhotra, A.K., McCarroll, S.A., McQuillin, A.,

Moran, J.L., Mortensen, P.B., Mowry, B.J., Nöthen, M.M., Ophoff, R.A., Owen,

M.J., Palotie, A., Pato, C.N., Petryshen, T.L., Posthuma, D., Rietschel, M., Riley,

B.P., Dan Rujescu, Sham, P.C., Sklar, P., Clair, D.S., Weinberger, D.R., Wendland,

J.R., Werge, T., Daly, M.J., Sullivan, P.F., O’Donovan, M.C., Boehnke, M.,

Kimberly, R.P., Kaufman, K.M., Harley, J.B., Langefeld, C.D., Seidman, C.E., Pato,

M.T., Pato, C.N., Ophoff, R.A., Graham, R.R., Criswell, L.A., Vyse, T.J.,

McCarroll, S.A., Lin, K., Linszen, D.H., Mata, I., McIntosh, A.M., Murray, R.M.,

Ophoff, R.A., Van Os, J., Powell, J., Rujescu, D., Walshe, M., Weisbrod, M.,

Wiersma, D., Donnelly, P., Barroso, I., Blackwell, J.M., Bramon, E., Brown, M.A.,

Casas, J.P., Corvin, A., Deloukas, P., Duncanson, A., Jankowski, J., Markus, H.S.,

Mathew, C.G., Palmer, C.N.A., Plomin, R., Rautanen, A., Sawcer, S.J., Trembath,

R.C., Viswanathan, A.C., Wood, N.W., Spencer, C.C.A., Band, G., Bellenguez, C.,

Donnelly, P., Freeman, C., Giannoulatou, E., Hellenthal, G., Pearson, R., Pirinen,

M., Strange, A., Su, Z., Vukcevic, D., Langford, C., Barroso, I., Blackburn, H.,

Bumpstead, S.J., Deloukas, P., Dronov, S., Edkins, S., Gillman, M., Gray, E.,

Gwilliam, R., Hammond, N., Hunt, S.E., Jayakumar, A., Liddle, J., McCann, O.T.,

Potter, S.C., Ravindrarajah, R., Ricketts, M., Tashakkori-Ghanbaria, A., Waller, M.,

Weston, P., Whittaker, P., Widaa, S., Mathew, C.G., Blackwell, J.M., Brown, M.A.,

Corvin, A., McCarthy, M.I., Spencer, C.C.A., Psychosis Endophenotypes

International Consortium, Wellcome Trust Case-Control Consortium 2, Psychosis

Endophenotype International Consortium, Wellcome Trust Case-Control

Consortium 2, Schizophrenia Working Group of the Psychiatric Genomics

Consortium. Complement genes contribute sex-biased vulnerability in diverse

disorders(2020) Nature, 582 (7813), pp. 577-581.PMID: 32499649

56. Dudutienė, V., Zubrienė, A., Kairys, V., Smirnov, A., Smirnovienė, J., Leitans, J.,

Kazaks, A., Tars, K., Manakova, L., Gražulis, S., Matulis, D. Isoform-Selective

Enzyme Inhibitors by Exploring Pocket Size According to the Lock-and-Key

Principle (2020) Biophysical Journal, 119 (8), pp. 1513-1524. PMID: 32971003

57. Seleznova, M., Kivrane, A., Namina, A., Krumins, R., Aleinikova, D., Lazovska,

M., Akopjana, S., Capligina, V., Ranka, R. Babesiosis in Latvian domestic dogs,

2016–2019 (2020) Ticks and Tick-borne Diseases, 11 (5), art. no. 101459. PMID:

32723644

58. Ahola, A.J., Radzeviciene, L., Zaharenko, L., Bulum, T., Skrebinska, S., Prakapiene,

E., Blaslov, K., Roso, V., Rovite, V., Pirags, V., Duvnjak, L., Sokolovska, J.,

Verkauskiene, R., Forsblom, C. Association between symptoms of depression,

diabetes complications and vascular risk factors in four European cohorts of

individuals with type 1 diabetes – InterDiane Consortium (2020) Diabetes Research

and Clinical Practice, 170, art. no. 108495. PMID: 33058955

59. Kimsis, J., Pole, I., Norvaisa, I., Dumpis, U., Ranka, R. Characterization of

Mycobacterium chimaera in a heater-cooler unit in Latvia (2020) Infection Control

and Hospital Epidemiology. PMID: 33040750

44

60. Lamsters, K., Ustinova, M., Birzniece, L., Silamiķelis, I., Gaidelene, J., Karušs, J.,

Krievāns, M., Kasparinskis, R., Fridmanis, D., Muter, O. Bacterial and archaeal

community structure in benthic sediments from glacial lakes at the Múlajökull

Glacier, central Iceland (2020) Polar Biology, 43 (12), pp. 2085-2099.

61. Bankina, B., Bimšteine, G., Neusa-Luca, I., Kaneps, J., Roga, A., Fridmanis, D.

Wheat stem base diseases and their causal agents (2020) IOP Conference Series:

Earth and Environmental Science, 578 (1), art. no. 012001

62. Anatskaya, O.V., Vinogradov, A.E., Vainshelbaum, N.M., Giuliani, A., Erenpreisa,

J. Phylostratic shift of whole‐genome duplications in normal mammalian tissues

towards unicellularity is driven by developmental bivalent genes and reveals a link

to cancer (2020) International Journal of Molecular Sciences, 21 (22), art. no. 8759,

pp. 1-22. PMID: 33228223

63. Zrelovs, N., Dislers, A., Kazaks, A. Motley Crew: Overview of the Currently

Available Phage Diversity (2020) Frontiers in Microbiology, 11, art. no. 579452.

PMID: 33193205

64. Elbere, I., Silamikelis, I., Dindune, I.I., Kalnina, I., Ustinova, M., Zaharenko, L.,

Silamikele, L., Rovite, V., Gudra, D., Konrade, I., Sokolovska, J., Pirags, V.,

Klovins, J. Baseline gut microbiome composition predicts metformin therapy short-

term efficacy in newly diagnosed type 2 diabetes patients (2020) PLoS ONE, 15 (10

October), art. no. e0241338. PMID: 33125401

65. Cardelli, M., Doorn, R.V., Larcher, L., Donato, M.D., Piacenza, F., Pierpaoli, E.,

Giacconi, R., Malavolta, M., Rachakonda, S., Gruis, N.A., Molven, A., Andresen,

P.A., Pjanova, D., Van Den Oord, J.J., Provinciali, M., Nagore, E., Kumar, R.

Association of HERV-K and LINE-1 hypomethylation with reduced disease-free

survival in melanoma patients (2020) Epigenomics, 12 (19), pp. 1689-1706. PMID:

33125285

2.2.2. Citas zinātniskās publikācijas

1. Pjanova, D., Vainshelbaum, M.N., Salmina, K., Erenpreisa, J. The Role of the

Meiotic Component in Reproduction of B-RAF-Mutated Melanoma: A Review and

“Brainstorming” Session (2020) Melanoma

2.3. Intelektuālā īpašuma aizsardzība

2020. gadā ir turpināta jau esošu Latvijas un starptautisko patentu uzturēšana,

kā ari turpinājās iepriekšējos gados iesniegto patentu pieteikumu lietvedības process.

Jauni patentu pieteikumi 2020.gadā netika iesniegti.

2.3.1. Reģistrētie un uzturētie starptautiskie patenti

1. European Patent EP3091083, A kit for detecting mutation or polymorphism in the

human mitochondrial DNA. Inventors: Jankevics E., Inaskina I., Pelnena D.,

Stavusis J., Pliss L. Uzturēts līdz: 05.2020.

45

2.3.2. Reģistrētie un uzturētie Latvijas patenti

1. Latvijas patents Nr.14204, Heterologas proteīnu sekvences eksponējošu kartupeļu

vīrusam PVY līdzīgo daļiņu iegūšana un izmantošana, Zeltiņš A., Kalniciema I.,

Skrastiņa D., Ose V., Pumpēns P., uzturēts 2011.-2021.

2. Latvijas patents Nr.14884, 1,4-Dihidropiridīn-4-il-piridīnija atvasinājumi kā jauni

adenozīna A2A receptora agoallostēriskie modulatori, Duburs G., Kloviņš J.,

Brūvere I., Petrovska R., Mandrika I., Ignatoviča V., Bisenieks E., Uldriķis J.,

Poikāns J., Vīgante B, iesniegts 17.01.2013., uzturēts 2014.-2021.

3. Latvijas patents Nr.14945, Ekspresijas sistēma HBc-preS1 vīrusveidīgo daļiņu

iegūšanai, Dišlers A., Petrovskis I., Liekniņa I., Bērza I, Bogans J., Akopjana I.,

Sominska I., Pumpēns P., iesniegts 21.06.2013., uzturēts 2015.-2021.

4. Latvijas patents Nr.14982, 3’-Aril- un heterilaizvietotās 2-akrilamidocikloheks-1-

ēn-karbonskābes kā hidroksikarbonskābju receptoru saimes (HCA2) jauna ligandu

grupa, Loža E., Bobiļeva O., Bokaldere R., Gailīte V., Kaula I., Ikaunieks M.,

Mandrika I., Petrauska R, Kloviņš J., Duburs G., Bisenieks E., iesniegts

10.10.2013., uzturēts 2015.-2021.

5. Latvijas patens Nr.15002, Heterociklā aizvietoti[(2-karboksi vai

metoksikarbonil)fenilkarbamoil-metil-(vai trimetilēn)]piridīnija vai izohinolīnija

bromīdi kā hidroksikarbonskābju receptoru saimes(HCA2) jauna ligandu klase,

Vīgante B., Luntēna I., Kalme Z., Bisenieks E., Poikāns J., Petrauska R., Mandrika

I., Kloviņš J., Loža E., Brūvere I., Duburs G., Uldriķis J., iesniegts 29.10.2013.,

uzturēts 2015.-2021.

6. Latvijas patents Nr.15004, 5-(4-Hlorobutil)-pirano[2,3-d]pirimidīn-

2,4,7(3H)trions un 5-alkil-2-tiokso-1H-pirano[2,3-d]pirimidīn-4,7-dioni kā

niacīna receptoru saimes (HCA2 un HCA3)jauni ligandi un sintoni jaunu ligandu

iegūšanai, Vīgante B., Brūvere I., Bisenieks E., Mandrika I., Petrauska R., Kloviņš

J., Poikāns J., Uldriķis J., Duburs G., iesniegts 08.11.2013., uzturēts 2015.-2021.

7. Latvijas patents Nr.15007, Kartupeļu vīrusam PVM līdzīgo daļiņu iegūšana, Zeltiņš

A., Kalnciema I., Ose-Klinklāva V, Baļķe I., iesniegts 22.10.2013., uzturēts 2015.-

2021.

8. Latvijas patents Nr.15006, Daudzziedu airenes raibuma vīrusam līdzīgo daļiņu

iegūšana, A.Zeltiņš, I. Baļķe, G. Reseviča, V. Ose-Klinklāva, A.Kazāks,

J.Freivalds, iesniegts 02.08.2013., uzturēts 2015.-2021.

9. Latvijas patents Nr.15018, Upeņu reversijas vīrusa antigēnu iegūšana, A.Zeltiņš,

I.Baļķe, J.Šaripo, I. Moročko-Bičevska, D.Skrastiņa, iesniegts 09.12.2013., uzturēts

2015.-2021.

10. Latvijas patents Nr.15033, Paņēmiens izvēlēta materiāla piešūšanai HBV core

proteīna veidotajām nanodaļiņām, R. Renhofa, A. Kazāks, A.Dišlers, L.Jackeviča,

V. Ose-Klinklāva, P. Pumpēns, iesniegts 01.2014., uzturēts 2015.-2021.

11. Latvijas patents Nr.15034, Modificēti HBV core nanokonteineri kā universāla

platforma bioloģiska materiāla eksponēšanai, R. Renhofa, I. Cielēns, A. Strods, G.

Kalniņš, D.Priede, V. Ose-Klinklāva, P. Pumpēns, iesniegts 01.2014., uzturēts

2015.-2021.

12. Latvijas patents Nr.14987, Anti-HCV individuālas terapeitiskas vakcīnas prototips,

I. Sominska, J.Jansons, P.Pumpēns, I.Petrovskis, D.Skrastiņa, G.Sudmale, iesniegts

25.09.2013., uzturēts 2015-2021.

46

13. Latvijas patents Nr.15035, Rekombinanta himēriska polipeptīda kDNS, kas satur

melanokortīna otrā tipa receptora (MC2R) un melanokortīnu receptoru

palīgproteīna (MRAP) secības, un tās izmantošana aktīvo vielu testēšanai un

terapeitiskiem mērķiem, D.Fridmanis, J.Kloviņš, I.Mandrika, R.Petrovska, A.Roga,

iesniegts 27.12.2013., uzturēts 2015.-2021.

14. Latvijas patents Nr.15022, Viena nukleotīda polimorfismu komplekts paaugstināta

vai pazemināta augsta blīvuma lipoproteīna holesterola līmeņa asinīs ģenētiskās

predisponētības noteikšanai, I.Radoviča, D.Fridmanis, L.Ņikitina-Zaķe, J.Kloviņš,

iesniegts 12.12.2013., uzturēts 2015.-2021.

15. Latvijas patents Nr.15190, Paņēmiens tukšu un ar nukleīnskābēm pildītu hepatīta

B vīrusa core-proteīna kapsīdu iegūšanai, Liekniņa I., Petrovskis I., Sominska I.,

Bogans J., Akopjana I., Pumpēns P., Dišlers A., iesniegts 31.07.2015., uzturēts

2021.

2.3.3. Pieteiktie starptautiskie patenti

2020.gadā netika pieteikti jauni starptautiskie patenti.

2.3.4. Pieteiktie Latvijas patenti

2020.gadā netika pieteikti jauni Latvijas patenti.

47

2.5. Akadēmisko un kvalifikācijas darbu izstrāde

2.5.1. Izstrādātie un aizstāvētie promocijas darbi

1. Gints Kalniņš “Bakteriālo trimetilamīnu producējošo enzīmu strukturālie un

funkcionālie pētījumi”, zinātniskais vadītājs – Dr.biol. J.Kloviņš.

2.5.2. Izstrādātie un aizstāvētie maģistra darbi

1. R.Raimonds „Visa genoma asociācijas pētījumā identificēti četri riska polimorfismi

un izveidots poligēnā riska modelis 2. tipa diabēta pacientiem Latvijas populācijā”,

darba vadītājs – Dr.biol. R.Pečulis

2. I.Verhovcova „Bakteriofāga izcelsmes dsRNS (Larifan) ietekme uz melanomas

augšanu peļu audzēju modeļos”, darba vadītājs – Dr.biol. D.Pjanova

3. A.Rudņickiha „Ekstracelulāro vezikulu ietvertās mikrobiālās RNS atklāšana

cilvēku asins un urīna paraugos”, darba vadītājs – Dr.biol. A.Linē

4. A.Kivrāne “LC–MS–MS metodes izstrāde četru pirmās izvēles prettuberkulozes

zāļu vielu un to galveno metabolītu noteikšanai cilvēka asins plazmā”, darba

vadītājs – Dr.chem. S.Grīnberga

5. D.M.Zaķe “Fizioloģijā balstīta metformīna matemātiskā modeļa izveide pelei un

cilvēkam”, darba vadītājs – Dr.sc.ing. E.Stalidzāns

6. Ņ.Zrelovs “Trīs no antarktiskās ledus-brīvas augsnes jaunizdalīto Caudovirales

kārtas bakteriofāgu raksturošana”, darba vadītājs – Dr.biol. A.Kazāks

7. L.Freimane “Ar novecošanos saistītu biomarķieru un mtDNS mutāciju izpēte

multirezistentās tuberkulozes pacientiem”, darba vadītājs – Dr.biol. R.Ranka

8. A.Bušs “Personalizēta krūts vēža molekulārā diagnostikas testa izstrāde individuāli

pielāgotai ārstniecības terapijai un slimības gaitas novērošanai”, darba vadītājs –

Dr.biol. A.Linē

9. E.E.Česle “GRM2 tipa bakteriālo mikrokompartmentu daļiņu raksturojums”, darba

vadītājs – Dr.biol. G.Kalniņš

2.5.3. Izstrādātie un aizstāvētie bakalaura darbi

1. R.Ludviga „Daudzziedu airenes raibuma vīrusa serīna proteāzes strukturālie

pētījumi”, darba vadītājs – Dr.biol. A.Zeltiņš, Dr.biol. I.Baļķe

2. D.Livčāne „Patogēnas mtDNS mutācijas saturošu citoplazmatisko hibrīdu šūnu

modeļu izveide un raksturošana”, darba vadītājs – Mg.biol. D.Kidere

3. E.Kleina „Oksidatīvās fosforilēšanas sistēmas funkcionalitātes novērtēšana,

izmantojot citoplazmātisko hibrīdu šūnu modeļus”, darba vadītājs – Mg.biol.

D.Kidere

4. F.Rūmnieks „Pericentriskā heterohromatīna loma genoma telpiskajā organizācijā

un regulācijā krūts vēža šūnās”, darba vadītājs – Dr.habil.med. J.Ērenpreisa

2.6. Organizētās konferences, kursi, semināri un vieslektoru uzstāšanās BMC

1. “Vēža paradoksi un jauns vēža hemorezistences mehānisms”, 14.02.2020.

48

2. “Ētiski un sociāli atbildīga pētniecības biobanku pārvaldība Baltijas valstīs”,

29.10.2020.

2.7. Cita institūtam būtiska informācija

2020.gada 7.janvārī Latvijas Nacionālajā bibliotēkā tika atklāta izstāde “Zinātne

Latvijai”, kurā apkopoti stāsti par 12 mūsdienu Latvijas zinātniekiem un viņu

sasniegumiem, starp kuriem ir arī BMC vadošā pētniece Dr.biol. Dace Pjanova. Visi

šie stāst apkopoti 2020.gada Latvijas zinātnes kalendārā.

2020.gada 6.februārī Latvijas Zinātņu akadēmijā norisinājās 2019.gada

nozīmīgāko sasniegumu zinātnē autoru un autoru kolektīvu apbalvošanas ceremonija,

kurā piedalījās izcilāko sasniegumu autori un autoru kolektīvi, valsts un valdības

amatpersonas, uzņēmēji, akadēmisko aprindu, zinātnisko institūciju un sabiedrības

pārstāvji. Par vienu no nozīmīgākajiem sasniegumiem zinātnē tika atzīts Latvijas

Biomedicīnas pētījumu un studiju centra

pētnieku Mg.biol. Jāņa Stāvuša, Dr.med.

Baibas Lāces, Mg.biol. Ditas Kideres,

Dr.biol. Innas Iņaškinas atklājums “Jaunu

specifisku mutāciju lēnā miozīnu saistošā

proteīna C gēna atklāšana un saistīšana ar

jaunu, līdz šim neaprakstītu pārmantotu

neiromuskulāro fenotipu – miogēnu tremoru

un miopātiju”. Apbalvošanas ceremonijā tika

godināti arī LZA prezidenta Atzinības raksta

saņēmēji, to vidu arī Latvijas Biomedicīnas

pētījumu un studiju centra pētnieki. LZA

prezidenta Atzinības raksta saņēmēji -

pētījuma par jauniem 2. tipa cukura diabēta

terapijas mehānismiem un efektivitātes

marķieriem pacientu zarnu mikrobiomā

Mg.biol. Ilze Elbere, Mg.biol. Monta

Ustinova, Mg.biol. Ivars Silamiķelis,

Mg.biol. Laila Silamiķele, LZA korespondētājlocekle Ilze Konrāde, LZA akadēmiķis

Valdis Pīrāgs, LZA akadēmiķis Jānis Kloviņš.

Sadarbības ietvaros ar zinātnisko

iekārtu, aprīkojuma un reaģentu ražotāju

MGI Tech Co un nodibinājumu Mammoth

Foundation Latvijas Biomedicīnas pētījumu

un studiju centrs saņēmis dāvinājumā iekārtu

High-Throughput Automated Extraction and

Liquid Handling Workstation MGISP-960.

Šī iekārta nodrošinās 96 bioloģisko paraugu

vienlaicīgu un automatizētu apstrādi, kas līdz šim tika veikta manuāli, tādējādi būtiski

palielinot veikto analīžu precizitāti un samazinot paraugu apstrādei nepieciešamo laiku.

Iekārta paredzēta zinātniskajai izpētei un sniegs būtisku atbalstu SARS-CoV-2 vīrusa,

kā arī COVID-19 pacientu ģenētiskā materiāla izpētei Latvijā. Tāpat iekārta tiks

izmantota arī citu zinātnisku projektu realizēšanai, kas saistīti ar dažādu slimību izpēti

49

Latvijā (piemēram, 2. tipa cukura diabēts, kairināto zarnu sindroms, iekaisīgu zarnu

slimības, sepse, bērnu ļaundabīgie audzēji,

akromegālija u.c.).

2020.gada 31.augustā BMC apmeklēja

valsts prezidents Egils Levits, kurš savā

apmeklējuma laikā gan uzrunāja BMC

darbiniekus, gan ekskursijā apskatīja BMC telpas

un tubāk iepazinās ar BMC pētījumiem. Ieskats

vizītē pieejams šeit -

https://www.youtube.com/watch?v=BmB1Q1JQR18.

Arī 2020.gadā BMC piedalījās sarunu festivālā “Lampa”. Šī gada tēma –

Lavtgijas Mikrobioma projekts – vai esam tam gatavi? Ar pilnu diskusiju var iepazīties

šeit - https://youtu.be/Ma-6N7w-mow.

2020.gadā BMC darbi plaši atsopoguļota dažādos sabiedrisko mediju

raidījumos un ziņu rakstos:

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/29.01.2020-pierada-zarnu-trakta-bakteriju-ietekmi-

efektivakai-diabeta-

arste.id178602/?fbclid=IwAR3f0sTEbK1lG1IccIgfGUTcQ1boGZwA9ZvKa8xz

UZHmrOhXlN1RzvIBon0

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/03.02.2020-latvija-atklaj-jaunu-slimibu-un-genu-

mutacijas-kas-to-

izraisa.id179046/?fbclid=IwAR13yVwEHUVqLb3wUubharWOrT_DV1y6hxvO

cn9CeK_5b4xKJUX1yarnp8I

Raidījums “Zināmais nezināmajā”, piedalās pētnieks G.Kalniņš -

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/zinamais-nezinamaja/latvijas-petnieki-fiksejusi-

bakteriju-sunas-sastavdalas--

mikrono.a126974/?fbclid=IwAR0dCqL0oeizhurwSYwcs0LzZO0qQNJribS5c-

VlnvRUjAq_Yeg074YVOIg

Raidījums “Kā dzīvot labāk”, piedalās vadošais pētnieks K.Tārs -

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/ka-labak-dziivot/koronaviruss-turpina-izplatities.-

ieteikumi-lai-no-ta-izvairitos.a127024/

Raidījums “Ziņas ASAP”, piedalās vadošais pētnieks K.Tārs -

https://xtv.lv/rigatv24/video/mKrpYdaAG0W-

kaspars_tars_par_koronavirusa_izcelsmi

Raidījums “Aizliegtais paņēmies”, piedalās vadošais pētnieks K.Tārs -

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/02.03.2020-aizliegtais-panemiens.-

koronaviruss.id181502/

Raidījums “Rīta Panorāma”, piedalās vadošais pētnieks K.Tārs -

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/05.03.2020-lza-notiks-akademiska-diskusija-par-

koronavirusu-covid-19.-inter.id181711/

Žurnāls “Ir”, intervija ar direktoru J.Kloviņu - https://ir.lv/2020/03/11/virusu-

elegance/

Portāls “TVNET”, intervija ar vadošo pētnieku K.Tāru -

https://www.tvnet.lv/6921664/virusi-met-izaicinajumu-cilvecei

https://www.youtube.com/watch?v=BmB1Q1JQR18

https://youtu.be/Ma-6N7w-mow

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/29.01.2020-pierada-zarnu-trakta-bakteriju-ietekmi-efektivakai-diabeta-arste.id178602/?fbclid=IwAR3f0sTEbK1lG1IccIgfGUTcQ1boGZwA9ZvKa8xzUZHmrOhXlN1RzvIBon0




https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/03.02.2020-latvija-atklaj-jaunu-slimibu-un-genu-mutacijas-kas-to-izraisa.id179046/?fbclid=IwAR13yVwEHUVqLb3wUubharWOrT_DV1y6hxvOcn9CeK_5b4xKJUX1yarnp8I




https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/zinamais-nezinamaja/latvijas-petnieki-fiksejusi-bakteriju-sunas-sastavdalas--mikrono.a126974/?fbclid=IwAR0dCqL0oeizhurwSYwcs0LzZO0qQNJribS5c-VlnvRUjAq_Yeg074YVOIg




https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/ka-labak-dziivot/koronaviruss-turpina-izplatities.-ieteikumi-lai-no-ta-izvairitos.a127024/

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/ka-labak-dziivot/koronaviruss-turpina-izplatities.-ieteikumi-lai-no-ta-izvairitos.a127024/

https://xtv.lv/rigatv24/video/mKrpYdaAG0W-kaspars_tars_par_koronavirusa_izcelsmi

https://xtv.lv/rigatv24/video/mKrpYdaAG0W-kaspars_tars_par_koronavirusa_izcelsmi

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/02.03.2020-aizliegtais-panemiens.-koronaviruss.id181502/

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/02.03.2020-aizliegtais-panemiens.-koronaviruss.id181502/

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/05.03.2020-lza-notiks-akademiska-diskusija-par-koronavirusu-covid-19.-inter.id181711/

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/05.03.2020-lza-notiks-akademiska-diskusija-par-koronavirusu-covid-19.-inter.id181711/

https://ir.lv/2020/03/11/virusu-elegance/

https://ir.lv/2020/03/11/virusu-elegance/

https://www.tvnet.lv/6921664/virusi-met-izaicinajumu-cilvecei?utm_source=twitter.com&utm_medium=social&utm_campaign=share-buttons&utm_content=6921664&fbclid=IwAR0U-6wS8Wg8WQdvWFqaLB_zAZlD3vAZtVNFxB86J2P5FF1o2VKMeLSjwws

50

Raidījums “Nākotnes pieturas”, piedalās vadošais pētnieks K.Tārs -

https://lr2.lsm.lv/lv/raksts/nakotnes-pietura/kaspars-tars-cina-ar-covid-

19.a127767/

Raidījums “900 sekundes” - https://tv3play.skaties.lv/900-sekundes-10374269

Raidījums “Dzīvīte brīvdienās”, piedalās vadošais pētnieks A.Zeltiņš, pētniece

I.Baļķe un pētnieks G.Kalniņš -

https://www.youtube.com/watch?time_continue=62&v=nn8A9RkUZL8&feature

=emb_logo

Raidījums “Zināmais neziāmajā”, piedalās direktors J.Kloviņš un vadošais

pētnieks K.Tārs - https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/zinamais-nezinamaja/latvijas-

zinatnieku-iesaiste-covid-19-vakcinas-izstrade-un-

virus.a128332/?fbclid=IwAR1dNuyOdSxI42tFvYX4YaRCHbgsRfrhOG1tvTyFI

hNJ6PCuqoASM8pqJGQ

Raidījums “Aculiecinieks”, piedalās vadošais pētnieks K.Tārs -

https://www.lsm.lv/raksts/dzive--stils/tehnologijas-un-zinatne/vakcinu-

konstruktori-latvijas-zinatnieki-mekle-vakcinu-pret-covid-19.a354379/

Raidījums “Uz līnijas”, piedalās vadošais pētnieks K.Tārs -

https://xtv.lv/rigatv24/video/6VvNjg4v7M8-

kaspars_tars_par_covid_19_antivielu_testiem

Raidījums “Uz līnijas”, piedalās direktors J.Kloviņš -

https://xtv.lv/rigatv24/video/WR973K0E7nO-15_04_2020_uz_linijas


https://xtv.lv/rigatv24/video/8blGbOnbpn3-07_04_2020_uz_linijas

Raidījums “COVID aktualitātes Latvijas reģionos”, piedalās zinātniskais asistents

Ņ.Zrelovs - https://www.youtube.com/watch?v=gJBlvMU6dTs

Raidījums “Dr.Apinis. Jautā ārstam!”, piedalās pētniece M.Ustinova -

https://xtv.lv/rigatv24/video/6VvNjgad7M8

16_04_2020_dr_apinis_jauta_arstam

Raidījums “Krustpunktā”, piedalās direktors J.Kloviņš -

https://replay.lsm.lv/lv/ieraksts/lr/128966/biomedicinas-petijumu-un-studiju-

centra-direktors-janis-klovins-ir-jaiet-ekperimentu-cels

Portāls “TVNET”, intervija ar direktoru J.Kloviņu -

https://www.tvnet.lv/6953866/ko-par-virusu-atklaj-genu-mutacijas

Portāls “LSM.lv” - https://www.lsm.lv/raksts/dzive--stils/tehnologijas-un-

zinatne/latvijas-zinatnieki-atklaj-12-unikalas-covid-19-mutacijas-ko-tas-nozime-

un-ko-tas-dod.a356374/

Raidījums “TV3 ziņas”, piedalās direktors J.Kloviņš -

https://skaties.lv/zinas/latvija/latvijas-biomedicinas-petijumu-centrs-iesaistijies-

virusa-gaitas-analize/

Raidījums “Aculiecinieks”, piedalās direktors J.Kloviņš -

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/25.04.2020-aculiecinieks.-autopsija-covid-

19.id185935/

Riadījums “Viens pret viens”, piedalās vadošais pētnieks K.Tārs -

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/05.05.2020-11.-gundars-reders-kaspars-tars.id186845/

Portāls “LSM.lv”, intervija ar direktoru J.Kloviņu -

https://www.lsm.lv/raksts/dzive--stils/tehnologijas-un-zinatne/kadus-covid-19-

https://lr2.lsm.lv/lv/raksts/nakotnes-pietura/kaspars-tars-cina-ar-covid-19.a127767/

https://lr2.lsm.lv/lv/raksts/nakotnes-pietura/kaspars-tars-cina-ar-covid-19.a127767/

https://tv3play.skaties.lv/900-sekundes-10374269

https://www.youtube.com/watch?time_continue=62&v=nn8A9RkUZL8&feature=emb_logo

https://www.youtube.com/watch?time_continue=62&v=nn8A9RkUZL8&feature=emb_logo

http://biomed.lu.lv/%22/%22/%22/%22https:/lr1.lsm.lv/lv/raksts/zinamais-nezinamaja/latvijas-zinatnieku-iesaiste-covid-19-vakcinas-izstrade-un-virus.a128332/?fbclid=IwAR1dNuyOdSxI42tFvYX4YaRCHbgsRfrhOG1tvTyFIhNJ6PCuqoASM8pqJGQ////////%22////%22//%22/%22




https://www.lsm.lv/raksts/dzive--stils/tehnologijas-un-zinatne/vakcinu-konstruktori-latvijas-zinatnieki-mekle-vakcinu-pret-covid-19.a354379/

https://www.lsm.lv/raksts/dzive--stils/tehnologijas-un-zinatne/vakcinu-konstruktori-latvijas-zinatnieki-mekle-vakcinu-pret-covid-19.a354379/

https://xtv.lv/rigatv24/video/6VvNjg4v7M8-kaspars_tars_par_covid_19_antivielu_testiem

https://xtv.lv/rigatv24/video/6VvNjg4v7M8-kaspars_tars_par_covid_19_antivielu_testiem

https://xtv.lv/rigatv24/video/WR973K0E7nO-15_04_2020_uz_linijas

https://xtv.lv/rigatv24/video/8blGbOnbpn3-07_04_2020_uz_linijas

https://www.youtube.com/watch?v=gJBlvMU6dTs

https://xtv.lv/rigatv24/video/6VvNjgad7M8%2016_04_2020_dr_apinis_jauta_arstam

https://xtv.lv/rigatv24/video/6VvNjgad7M8%2016_04_2020_dr_apinis_jauta_arstam

https://replay.lsm.lv/lv/ieraksts/lr/128966/biomedicinas-petijumu-un-studiju-centra-direktors-janis-klovins-ir-jaiet-ekperimentu-cels

https://replay.lsm.lv/lv/ieraksts/lr/128966/biomedicinas-petijumu-un-studiju-centra-direktors-janis-klovins-ir-jaiet-ekperimentu-cels

https://www.tvnet.lv/6953866/ko-par-virusu-atklaj-genu-mutacijas

https://www.lsm.lv/raksts/dzive--stils/tehnologijas-un-zinatne/latvijas-zinatnieki-atklaj-12-unikalas-covid-19-mutacijas-ko-tas-nozime-un-ko-tas-dod.a356374/



https://skaties.lv/zinas/latvija/latvijas-biomedicinas-petijumu-centrs-iesaistijies-virusa-gaitas-analize/

https://skaties.lv/zinas/latvija/latvijas-biomedicinas-petijumu-centrs-iesaistijies-virusa-gaitas-analize/

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/25.04.2020-aculiecinieks.-autopsija-covid-19.id185935/

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/25.04.2020-aculiecinieks.-autopsija-covid-19.id185935/

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/05.05.2020-11.-gundars-reders-kaspars-tars.id186845/

https://www.lsm.lv/raksts/dzive--stils/tehnologijas-un-zinatne/kadus-covid-19-petijumus-varetu-attistit-par-valsts-atveletajiem-5-miljoniem.a359102/?fbclid=IwAR2J2gp6699PnA4vPrQK2lAhohTlNMHizbHX6QsJF1wylJA-kCvM4ull6fA

51

petijumus-varetu-attistit-par-valsts-atveletajiem-5-

miljoniem.a359102/?fbclid=IwAR2J2gp6699PnA4vPrQK2lAhohTlNMHizbHX6

QsJF1wylJA-kCvM4ull6fA

Raidījums “Zināmais nezināmajā”, piedalās direktors J.Kloviņš -

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/zinamais-nezinamaja/sobrid-vairak-prieksrocibas-un-

atbalsts-ir-ar-covid-19-saistitie.a130406/

Raidījums “Zūmeri” - https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/30.05.2020-

zumeri.id188848/?fbclid=IwAR29fHId8XbvbkktRkrOHjsKqKf5rSmquu0pOPw

Md8AkfuqOoD9XX-k12Wg

Raidījums “Iziņas impulss”, piedalās vadošais pētnieks K.Tārs, vadošais pētnieks

D.Fridmanis, zinātniskais asistents Ņ.Zrelovs -

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/04.06.2020-izzinas-impulss-4.-serija.id189286/

Portāls “Delfi”, intervija ar vadošo pētnieku K.Tāru -

https://www.delfi.lv/campus/raksti/ta-vienkarsi-izfantazet-jaunu-virusu-nav-

iespejams-saruna-ar-kasparu-taru?id=52275711

Raidījums “Kur tas suns apraksts?”, piedalās vadošais pētnieks K.Tārs -

https://xtv.lv/rigatv24/video/mKrpY6naN0W-

07_07_2020_kur_tas_suns_aprakts_1_dala;

https://xtv.lv/rigatv24/video/MV9N60MBG4X-

07_07_2020_kur_tas_suns_aprakts_2_dala

Portāls “Delfi” - https://www.delfi.lv/campus/raksti/jauna-asinsrite-latvijas-

zinatne-pirmo-bioinformatikas-stipendijas-ieguveju-sasniegumi?id=52287413

Raidījums “Labrīt”, piedalās direktors J.Kloviņš -

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/labriit/covid-19-petijumu-programmas-merki-

ierobezot-virusa-izplatibu-at.a132291/

Raidījums “Rīta Panorāma”, piedalās direktors J.Kloviņš -

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/31.07.2020-intervija-ar-jani-klovinu-un-ingmaru-

puki.id193283/

Portāls “Delfi” - https://www.delfi.lv/campus/raksti/zinatniekiem-davina-

lieljaudas-datu-tiklu-cinai-ar-vezi-un-covid-19?id=52340697

Portāls “Delfi” - https://www.delfi.lv/news/national/politics/valsts-prezidents-

zinatne-jaiegulda-nauda-un-rezultati-naks.d?id=52425849

Raidījums “Monopols”, piedalās direktors J.Kloviņš -

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/monopols/molekularas-biologijas-profesors-janis-

klovins.a133535/

Portāls “Brīvā Latvija”, intervija ar vadošo pētnieku A.Zeltiņu -

https://www.brivalatvija.lv/sakumlapa/ka-top-covid-19-vakcina-

latvija?pcversion=ok&fbclid=IwAR1qAhZn8yvBzrthF8eGcU6BwAxi0dqskS1v-

LjMbF3L0F2x3azYi5xQhjI

Portāls “LA.LV”, intervija ar vadošo pētnieku K.Tāru - https://www.la.lv/sis-nav-

pedejais-koronaviruss

Portāls “LA.LV” - https://www.la.lv/latvija-konstatetas-247-dazadas-jauna-

koronavirusa-mutacijas-ko-vel-atklajusi-zinatnieki-par-situaciju-latvija

Raidījums “De Facto” - https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/04.10.2020-vai-latvija-ir-slepta-

covid-19-izplatiba.id198594/




https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/zinamais-nezinamaja/sobrid-vairak-prieksrocibas-un-atbalsts-ir-ar-covid-19-saistitie.a130406/

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/zinamais-nezinamaja/sobrid-vairak-prieksrocibas-un-atbalsts-ir-ar-covid-19-saistitie.a130406/

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/30.05.2020-zumeri.id188848/?fbclid=IwAR29fHId8XbvbkktRkrOHjsKqKf5rSmquu0pOPwMd8AkfuqOoD9XX-k12Wg



https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/04.06.2020-izzinas-impulss-4.-serija.id189286/

https://www.delfi.lv/campus/raksti/ta-vienkarsi-izfantazet-jaunu-virusu-nav-iespejams-saruna-ar-kasparu-taru?id=52275711

https://www.delfi.lv/campus/raksti/ta-vienkarsi-izfantazet-jaunu-virusu-nav-iespejams-saruna-ar-kasparu-taru?id=52275711

https://xtv.lv/rigatv24/video/mKrpY6naN0W-07_07_2020_kur_tas_suns_aprakts_1_dala

https://xtv.lv/rigatv24/video/mKrpY6naN0W-07_07_2020_kur_tas_suns_aprakts_1_dala

https://xtv.lv/rigatv24/video/MV9N60MBG4X-07_07_2020_kur_tas_suns_aprakts_2_dala

https://xtv.lv/rigatv24/video/MV9N60MBG4X-07_07_2020_kur_tas_suns_aprakts_2_dala

https://www.delfi.lv/campus/raksti/jauna-asinsrite-latvijas-zinatne-pirmo-bioinformatikas-stipendijas-ieguveju-sasniegumi?id=52287413

https://www.delfi.lv/campus/raksti/jauna-asinsrite-latvijas-zinatne-pirmo-bioinformatikas-stipendijas-ieguveju-sasniegumi?id=52287413

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/labriit/covid-19-petijumu-programmas-merki-ierobezot-virusa-izplatibu-at.a132291/

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/labriit/covid-19-petijumu-programmas-merki-ierobezot-virusa-izplatibu-at.a132291/

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/31.07.2020-intervija-ar-jani-klovinu-un-ingmaru-puki.id193283/

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/31.07.2020-intervija-ar-jani-klovinu-un-ingmaru-puki.id193283/

https://www.delfi.lv/campus/raksti/zinatniekiem-davina-lieljaudas-datu-tiklu-cinai-ar-vezi-un-covid-19?id=52340697

https://www.delfi.lv/campus/raksti/zinatniekiem-davina-lieljaudas-datu-tiklu-cinai-ar-vezi-un-covid-19?id=52340697

https://www.delfi.lv/news/national/politics/valsts-prezidents-zinatne-jaiegulda-nauda-un-rezultati-naks.d?id=52425849

https://www.delfi.lv/news/national/politics/valsts-prezidents-zinatne-jaiegulda-nauda-un-rezultati-naks.d?id=52425849

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/monopols/molekularas-biologijas-profesors-janis-klovins.a133535/

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/monopols/molekularas-biologijas-profesors-janis-klovins.a133535/

https://www.brivalatvija.lv/sakumlapa/ka-top-covid-19-vakcina-latvija?pcversion=ok&fbclid=IwAR1qAhZn8yvBzrthF8eGcU6BwAxi0dqskS1v-LjMbF3L0F2x3azYi5xQhjI



https://www.la.lv/sis-nav-pedejais-koronaviruss

https://www.la.lv/sis-nav-pedejais-koronaviruss

https://www.la.lv/latvija-konstatetas-247-dazadas-jauna-koronavirusa-mutacijas-ko-vel-atklajusi-zinatnieki-par-situaciju-latvija

https://www.la.lv/latvija-konstatetas-247-dazadas-jauna-koronavirusa-mutacijas-ko-vel-atklajusi-zinatnieki-par-situaciju-latvija

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/04.10.2020-vai-latvija-ir-slepta-covid-19-izplatiba.id198594/

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/04.10.2020-vai-latvija-ir-slepta-covid-19-izplatiba.id198594/

52

Raidījums “Globuss”, piedalās vadošais pētnieks K.Tārs -

https://xtv.lv/rigatv24/video/MV9N6R3dN4X-16_10_2020_globuss_1_dala

Raidījums “Zināmais nezināmajā” - https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/zinamais-

nezinamaja/nobela-premija-medicina-pieskirta-par-c-hepatita-

petijumiem.a135463/?highlight=T%C4%81rs

Raidījums “Delfi TV ar Jāni Domburu”, piedalās vadošais pētnieks K.Tārs -

https://www.delfi.lv/delfi-tv-ar-jani-domburu/pilnie-raidijumi/delfi-tv-ar-jani-

domburu-zinatnieku-diskusija-ka-sakaut-covid-19-pilns-ieraksts.d?id=52577141

Raidījums “Zināmais nezināmajā”, piedalās vadošais pētnieks K.Tārs -

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/zinamais-nezinamaja/spanu-gripa-pirms-simts-gadiem-

un-covid-19-musdienas-cik-lidzigi.a135807/

Raidījums “Aizliegtais paņēmiens”, piedalās direktors J.Kloviņš -

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/26.10.2020-aizliegtais-panemiens.-operacija-covid-19-

un-imunitate.id200416/

Raidījums “Pēcpusdiena”, intervija ar vadošo pētnieku K.Tāru -

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/pecpusdiena/vakcina-pret-covid-19-notiek-jau-

vienosanas-ar-razotajiem-par-pi.a136588/?highlight=tars

Raidījums LR4, piedalās vadošais pētnieks D.Fridmanis -

https://lr4.lsm.lv/lv/raksts/aleksandr-studija/david-fridmanis-nado-idti-

vpered.a136840/

Žurnāls “Patiesā dzīve”, intervija ar direktoru J.Kloviņu -

https://jauns.lv/raksts/par-veselibu/414722-bistamas-speles-ar-geniem-kadus-

noslepumus-glaba-genetika

Žurnāls “Ieva”, intervija ar direktoru J.Kloviņu -

https://www.santa.lv/raksts/ieva/zinatnieks-janis-klovins-bakterijas-ir-

visjaudigakie-organismi-uz-sis-zemes-37286/

Raidījums “Nākotnes pietura”, piedalās vadošā pētniece R.Ranka -

https://lr2.lsm.lv/lv/raksts/nakotnes-pietura/renates-rankas-interesu-loka-seno-

infekcijas-slimibu-izpete.a137422/?fbclid=IwAR3v8eeqnwPdtAhzTCHi0-

r4EqpraypcViE6UTEVjhgp6u-1uV_t-eWUbpk


https://xtv.lv/rigatv24/video/4OW7q5E67vY-17_12_2020_uz_linijas

Portāls “TVNET”, komentē direktors J.Kloviņš -

https://www.tvnet.lv/7139969/klovins-cilvecei-ir-loti-paveicies-ka-vakcinas-

izstradatas-tik-atri

Raidījums “Šodienas jautājums”, piedalās Zinātniskās padomes priekšsēdētājs

J.Kloviņš - https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/22.12.2020-sodienas-jautajums-jaunais-

covid-19-paveids.id205985/

Raidījums “Panorāma”, piedalās Zinātniskās padomes priekšsēdētājs J.Kloviņš -

https://www.lsm.lv/raksts/zinas/latvija/zinatnieki-mekles-jauna-koronavirusa-

paveidu-

latvija.a386317/?utm_source=inbox&utm_campaign=news&utm_medium=Front

Page

https://xtv.lv/rigatv24/video/MV9N6R3dN4X-16_10_2020_globuss_1_dala

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/zinamais-nezinamaja/nobela-premija-medicina-pieskirta-par-c-hepatita-petijumiem.a135463/?highlight=T%C4%81rs



https://www.delfi.lv/delfi-tv-ar-jani-domburu/pilnie-raidijumi/delfi-tv-ar-jani-domburu-zinatnieku-diskusija-ka-sakaut-covid-19-pilns-ieraksts.d?id=52577141

https://www.delfi.lv/delfi-tv-ar-jani-domburu/pilnie-raidijumi/delfi-tv-ar-jani-domburu-zinatnieku-diskusija-ka-sakaut-covid-19-pilns-ieraksts.d?id=52577141

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/zinamais-nezinamaja/spanu-gripa-pirms-simts-gadiem-un-covid-19-musdienas-cik-lidzigi.a135807/

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/zinamais-nezinamaja/spanu-gripa-pirms-simts-gadiem-un-covid-19-musdienas-cik-lidzigi.a135807/

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/26.10.2020-aizliegtais-panemiens.-operacija-covid-19-un-imunitate.id200416/

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/26.10.2020-aizliegtais-panemiens.-operacija-covid-19-un-imunitate.id200416/

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/pecpusdiena/vakcina-pret-covid-19-notiek-jau-vienosanas-ar-razotajiem-par-pi.a136588/?highlight=tars

https://lr1.lsm.lv/lv/raksts/pecpusdiena/vakcina-pret-covid-19-notiek-jau-vienosanas-ar-razotajiem-par-pi.a136588/?highlight=tars

https://lr4.lsm.lv/lv/raksts/aleksandr-studija/david-fridmanis-nado-idti-vpered.a136840/

https://lr4.lsm.lv/lv/raksts/aleksandr-studija/david-fridmanis-nado-idti-vpered.a136840/

https://jauns.lv/raksts/par-veselibu/414722-bistamas-speles-ar-geniem-kadus-noslepumus-glaba-genetika

https://jauns.lv/raksts/par-veselibu/414722-bistamas-speles-ar-geniem-kadus-noslepumus-glaba-genetika

https://www.santa.lv/raksts/ieva/zinatnieks-janis-klovins-bakterijas-ir-visjaudigakie-organismi-uz-sis-zemes-37286/

https://www.santa.lv/raksts/ieva/zinatnieks-janis-klovins-bakterijas-ir-visjaudigakie-organismi-uz-sis-zemes-37286/

https://lr2.lsm.lv/lv/raksts/nakotnes-pietura/renates-rankas-interesu-loka-seno-infekcijas-slimibu-izpete.a137422/?fbclid=IwAR3v8eeqnwPdtAhzTCHi0-r4EqpraypcViE6UTEVjhgp6u-1uV_t-eWUbpk



https://xtv.lv/rigatv24/video/4OW7q5E67vY-17_12_2020_uz_linijas

https://www.tvnet.lv/7139969/klovins-cilvecei-ir-loti-paveicies-ka-vakcinas-izstradatas-tik-atri

https://www.tvnet.lv/7139969/klovins-cilvecei-ir-loti-paveicies-ka-vakcinas-izstradatas-tik-atri

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/22.12.2020-sodienas-jautajums-jaunais-covid-19-paveids.id205985/

https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/22.12.2020-sodienas-jautajums-jaunais-covid-19-paveids.id205985/

https://www.lsm.lv/raksts/zinas/latvija/zinatnieki-mekles-jauna-koronavirusa-paveidu-latvija.a386317/?utm_source=inbox&utm_campaign=news&utm_medium=FrontPage




53

3. FINANŠU RESURSI UN TO IZLIETOJUMS

2020. gadā lielākais finanšu ieņēmumu avots ir ES struktūrfondu finansējums,

kam tālāk seko LZP FLPP projektu finansējums un Valsts pētījumu programmas. Jau

ceturto gadu pēc kārtas valsts piešķirtais zinātniskās darbības bāzes finansējums ir ar

samazinājumu salīdzinājumā ar iepriekšējo gadu. 2020.gadā kopumā ir vērojams

līgumpētījumu pieaugums summējot gan vietējā, gan starptautiskā mērogā pesaistīto

finansējumu. Sīkāku finansējuma sadalījumu pa finansējuma avotiem var aplūkot

1.tabulā.

1. tabula BMC zinātniskās darbības finansējums, EUR

Ieņēmumu veids

Gads

2017 2018 2019 2020

Finansējums (kopā) 4991.8 5649.3 4751.1 6192.7

Valsts budžeta finansējums (kopā) 4572.0 5429.0 3823.8 5682.9

Eiropas Savienības struktūrfondu finansējums

zinātniskajai darbībai (kopā) 2379.4 3689.4 2237.2 2279.5

ES 2014-2020: ERAF 1.1.1.1.pasākums 1437.7 1757.4 1824.1 1585.9

ES 2014-2020: ERAF 1.1.1.2.pasākums 101.7 235.9 320.6 408.5

ES 2014-2020: ERAF 1.1.1.4.pasākums 840.0 1497.8 0 182.2

ES 2014-2020: ERAF 1.1.1.5.pasākums 54.3 64.1 72.9

ES 2014-2020: ERAF 1.2.1.2.pasākums 0 144 28.4 30.0

NFI projektu finansējums 172.1 0 0 0

LZP granti un cits LZP finansējums 149.4 429.1 502.8 827.9

Zinātniskās darbības bāzes finansējums 1147.2 1062.3 894.8 866.1

Valsts pētījumu programmu finansējums 282.3 50.0 0.0 1271.3

Pārējais valsts budžeta finansējums 441.6 198.2 189.0 438.1

Finansējums no starptautiskiem avotiem (kopā) 332.1 130.70 873.90 256.10

7.IP, Horizon 2020 un cits starptautiskais

finansējums 126.7 20.7 628.5 46.3

Ieņēmumi no līgumdarbiem ar ārvalstu juridiskām

personām 205.4 110.0 245.4 209.8

Ieņēmumi no līgumdarbiem ar Latvijas

Republikas juridiskām personām 46.5 49.6 22.5 201.1

Cits finansējums zinātniskai darbībai (kopā) 41.2 40.0 30.9 52.6

Ieņēmumi no citām saimnieciskām darbībām 41.2 40.0 30.9 52.6

54

2.tabulā var aplūkot BMC finansējuma izlietojumu.

2. tabula BMC finansējuma izlietojums, EUR

Nr.p.k. Finansiālie rādītāji

Iepriekšējā

gadā (faktiskā

izpilde)

Pārskata gadā

(faktiskā

izpilde)

1. Finanšu resursi izdevumu segšanai (kopā) 4 751 225 6 192 704

1.1. Dotācijas 3 827 371 5 611 762

1.2. Maksas pakalpojumi un citi pašu ieņēmumi 313 700 556 270

1.3. Ārvalstu finanšu palīdzība 610 054 24 672

1.4. Ziedojumi un dāvinājumi 0 0

2. Izdevumi (kopā) 4 834 884 5 542 558

2.1 Uzturēšanas izdevumi (kopā) 4 349 152 5 341 057

2.1.1. Kārtējie izdevumi 4 275 625 4 757 478

2.1.2. Procentu izdevumi 6 545

2.1.3. Subsīdijas, dotācijas un sociālie pabalsti 0 0

2.1.4. Kārtējie maksājumi Eiropas Kopienas budžetā un

straptautiskā sadarbība

0 0

2.1.5. Uzturēšanas izdevumu transferti 73 521 583 034

2.2. Izdevumi kapitālieguldījumiem 485 732 201 501

55

4. PERSONĀLS

2020.gadā nodarbināti darbinieki 116,73 PLE apjomā, no kuriem:

vēlētais zinātniskais personāls - 73,25 PLE;

zinātiskā personāla v.i. – 1,19 PLE;

zinātnes teniskais personāls – 25,10 PLE;

zinātni apkalpojošais personāls – 18,38 PLE.

Vēlēto zinātnisko personālu sastāda 24 vadošie pētnieki, 39 pētnieki un 49

zinātniskie asistenti. Vēlētā zinātniskā personāla sastāvā ir 47 darbinieki ar doktora

zinātnisko grādu.

Zinātniskā personāla vidējais vecums ir 41,32 gadi, zinātnes tehniskā personāla

vidējais vecums ir 31,40 gadi un zinātnes apkalpojošā personāla vidējais vecums ir

51,30 gadi.

56

5. ATTĪSTĪBAS PERSPEKTĪVAS 2021.GADĀ

2021.gadā tiks turpināts darbs pie BMC Attīstības stratēģijas 2015.-2020.gadam

īstenošanas, kas saskaņā ar Izglītības un zinātnes ministrijas aicinājumu un BMC

Zinātniskās padomes lēmumu ir pagarināta līdz 2021.gada 31.decembrim. 2021.gada

laikā plānots izstrādāt nākamo gadu BMC attīstības stratēģiju atbilstoši valsts līmeņa

politikas plānošabas dokumentiem 2021.-2027.gadam.

1. Pētniecības programmas īstenošana

2021. gadā saskaņā tiks turpināts darbs pie trīs pētniecības virzienu īstenošanas

- cilvēka ģenētika un slimību patoģenēzes mehānismi; vēža izpēte; strukturālā

bioloģija, biotehnoloģija un virusoloģija.

BMC zinātniskajās grupās tiks turpināti iepriekšējos gados uzsāktie zinātniskie

projekti ERAF 1.1.1.1.pasākuma “Prakstiskas ievirzes pētījumi”, ERAF

1.1.1.2.pasākuma “Pēcdoktorantūras pētniecības atbalsts”, ERAF 1.2.1.2.pasākuma

“Atbalsts tehnoloģiju pārneses sistēmas pilnveidošanai”, LZP FLPP, ERA-NET

ietvaros.

2021.gadā tiks izsākta piecu ERAF 1.1.1.1. pasākuma “Praktiskas ievirzes

pētījumi” 4.kārtas projektu īstenošana, trīs ERAF 1.1.1.2.pasākuma “Pēcdoktorantūras

pētniecības atbalsts” 4.kārtas projektu īstenošana, četru jaunu LZP FLPP projektu

īstenošana, kā arī divu Norvēģijas finanšu instrumenta projekta īstenošana.

2021.gadā plānotas arī vairāki jauni vietēja mēroga projekta konkursi, kuros

BMC plāno iesniegt jaunus projektu iesniegumus - gan ERAF 1.1.1.1.pasākuma

“Prakstiskas ievirzes pētījumi” 5.kārtas projektu konkurss, gan LZP FLPP projektu

2021.gada konkurss. 2021. gadā tiks turpināts darbs arī pie jaunu starptautisko projektu

pieteikumu sagatavošanas, tai skaitā Horizon Europe un citu grantu shēmās sadarbībā

ar Latvijas un citu valstu zinātniskajām institūcijām.

2. Institucionālā attīstība

2021.gada plānots attīstīt un stiprināt BMC zinātnisko ekselenci, balstoties uz

iepriekšējos gados apstiprināto projektu tēmām.

2021.gadā plānots stiprināt BMC informācijas tehnoloģiju darbību, uzlabojot

centralizēto IT drošības politiku, piesaistot speciālistus kopējai IT darbības

uzlabošanai.

2021.gadā plānots turpināt darbu pie BMC sabiedriskā tēla uzlabošanas un

atpazīstamības veidošanas.

Starptautiskās konkurētspējas paaugstināšanai plānots turpināt un attīstīt

sadarbību ar vietējiem un ārzemju partneriem, lai nodrošinātu precīzu līgumdarbu

izpildi.

3. Cilvēkresursu attīstība

Jauna zinātniskā personāla piesaistei plānots turpināt atbalstīt perspektīvos

studentus, nodarbinot tos BMC īstenotajos pētniecības projektos, spējīgāko atalgošanai

paredzot finansējumu no BMC pieejamajiem finanšu līdzekļiem.

Esošā personāla profesionālajai izaugsmei tiks veicināta doktorantūras

studentu, kā arī jau doktorantūras studiju beigušo, bet vēl doktora grādu neiegūto

darbinieku stimulēšana doktora darba aizstāvēšanai, tādējādi sekmējot jauno zinātnieku

īpatsvara pieaugumu BMC. Paredzams, ka 2021. gadā tiks uzsākta darbības

57

programmas "Izaugsme un nodarbinātība" 8.2.2. specifiskā atbalsta mērķa "Stiprināt

augstākās izglītības institūciju akadēmisko personālu stratēģiskās specializācijas

jomās" trešā projektu iesniegumu atlases kārta. BMC ir ieinteresēts sadarboties ar

Latvijas universitātēm doktorantu nodarbinātības jomā, tādējādi nodrošinot

doktorantiem izcilu pētniecības infrastruktūru un pieredzējušus zinātnisko darbu

vadītājus

4. Infrastruktūras un starpinstitucionālās sadarbības attīstība

2021.gadā BMC plāno noslēgt ERAF 1.1.1.4.pasākuma “P&A infrastruktūras

attīstīšana viedās specializācijas jomās un zinātnisko institūciju institucionālās

kapacitātes stiprināšana” projekta īstenošanu, kura ietvaros tiks pabeigts darbs pie

Genoma centra infrastruktūras attīstības – gan jaunu, tam speciāli pielāgotu telpu

izbūves, gan zinātnisko iekārtu iegādes.

2021.gadā tiks turpināts stiprināt starnstitucionālo sadarbību gan studiju, gan

zinātniski pētniecisko projektu, gan zinātniskās infrastruktūras jomā.

5. Izglītība un publicitāte

2021. gadā paredzēts turpināt bakalauru, maģistratūras un doktorantūras

studentu zinātnisko darbu izstrādes nodrošināšanu BMC speciālistu vadībā.

Documents

PUBLISKAIS GADA PĀRSKATS