REFORME LMD BIOLOGIE - mesrst.tn · Biologie cellulaire Génétique UF Génétique 1H30 0H45 0H30 3 6 3 6 X ... Cours TD TP Cours Intégré ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime

REPUBLIQUE TUNISIENNE ___****___

Ministère de l’Enseignement Supérieur, de la Recherche Scientifique

et de la Technologie ___****___

DIRECTION GENERALE DE LA RENOVATION UNIVERSITAIRE

REFORME LMD

BIOLOGIE

PPPRRROOOGGGRRRAAAMMMMMMEEESSS EEETTT CCCOOONNNTTTEEENNNUUUSSS DDDEEE LLLAAA LLLIIICCCEEENNNCCCEEE AAAPPPPPPLLLIIIQQQUUUEEEEEE EEENNN

BBBIIIOOOTTTEEECCCHHHNNNOOOLLLOOOGGGIIIEEESSS

PROPOSES PAR LA COMMISSION NATIONALE SECTORIELLE DE BIOLOGIE

Octobre 2009

LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES 2

Table des Matières

OBJECTIFS ET MAQUETTES DE LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES ................................................................................ 3

OBJECTIFS DE LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES.........................................................................................................4 FICHES DE PRESENTATION DE LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES ....................................................................................5

CONTENUS DES PROGRAMMES DE LA LICENCE APPLIQUEE EN BIOTECHNOLOGIES .............................................................................. 27

CONTENUS DES PROGRAMMES DE L 1 (S1 ET S2) ....................................................................................................................28 CONTENUS DES PROGRAMMES DE L 2 (S3 ET S4) ....................................................................................................................55 PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : BIOTECHNOLOGIE APPLIQUEE AU SECTEUR DE LA SANTE (EX: MEDICALE) (S5) .................93 CONTENUS DES PROGRAMMES DU PARCOURS : CONTROLE ET EXPLOITATION DES MICROORGANISMES (S5) .....................................115 CONTENUS DES PROGRAMMES DU PARCOURS : CONTROLE DE QUALITE DES PRODUITS ALIMENTAIRES (S5) .....................................124 PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : BIOTECHNOLOGIE VEGETALE ...............................................................................134 PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : BIOTECHNOLOGIE APPLIQUEE AU SECTEUR PHARMACEUTIQUE....................................142 PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : BIOTECHNOLOGIE MARINE ET AQUACULTURE ..........................................................159 PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : BIOTECHNOLOGIE ANIMALE.................................................................................166 PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : VALORISATION DES BIO RESSOURCES DES MILIEUX ARIDES ..........................................171 PROGRAMMES ET CONTENUS DU PARCOURS : VALORISATION DES RESSOURCES VEGETALES ...........................................................177


OBJECTIFS ET MAQUETTES DE LA LICENCE APPLIQUEE EN

BIOTECHNOLOGIES


Objectifs de la licence appliquée en Biotechnologies

DOMAINE : SCIENCES ET TECHNOLOGIES MENTION : BIOTECHNOLOGIES OBJECTIFS : La licence appliquée en Biotechnologies vise la maîtrise d’un ensemble de connaissances biologiques appliquées à la mise en oeuvre de méthodes et de procédés utilisant

des organismes vivants des cellules vivantes ou des molécules biologiques actives

Ces technologies du vivant sont réalisées dans un objectif de production service recherche

Elles peuvent être appliquées A l’agriculture A l’environnement A l’industrie A la santé


Fiches de Présentation de la licence appliquée en Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies

Universités : Manouba Tunis El Manar Jendouba Monastir Sfax

Etablissements : Institut Supérieur de Biotechnologies de Sidi Thabet, Institut Supérieur de Sciences Biologiques Appliquées, Institut Supérieur de Biotechnologies de Béja, Institut Supérieur de Biotechnologies de Monastir, Institut Supérieur de Biotechnologies de Sfax

Licence Appliquée Biotechnologies

Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies

Licence Appliquée en Biotechnologies - Semestre 1

Volume horaire semestriel (14 semaines) Crédits Coefficients Régime d'examen N

°

Unité d'enseignement Nature

de l'UE Elément constitutif

d'UE (ECUE) Cours TD TP Cours

Intégré ECUE UE ECUE UE Contrôle continu

Régime mixte

C2i 2H 2 2 X Anglais 2H 2 2 X 1 C2i, Langues UT Droit de l'homme 1H30 2

6 2

6 X

Math appliquées 1H30 1H 3 3 X 2 Math Physique UF Physique 1H30 0H45 0H45 3

6 3

6 X

Chimie Générale 1H30 0H30 0H45 3 3 X 3 Chimie UF Chimie Organique 1H30 0H30 0H45 3

6 3

6 X Biologie cellulaire 1H30 0H30 0H45 3 3 X 4 Biologie cellulaire

Génétique UF Génétique 1H30 0H45 0H30 3

6 3

6 X Biologie animale 1H30 1H15 3 3 X 5 Diversité du

vivant UF Biologie végétale 1H30 1H15 3

6 3

6 X


Licence Appliquée en Biotechnologies Universités : Manouba Tunis El Manar Jendouba Monastir Sfax





Volume horaire semestriel (14 semaines) Crédits Coefficients Régime d'examen

N Unité d'enseignement Nature de l'UE

Elément constitutif d'UE (ECUE)

Cours TD TP Cours Intégré ECUE UE ECUE UE Contrôle

continu Régime mixte

C2I 2H 2 2 X Anglais 2H 2 2 X 1

C2I Langues Droit de l'homme

UT Droit de l'homme 1H30 1H30 2

6 2

6 X

Biochimie Structurale 1H30 0H30 1H 3 3 X

2 Biochimie Structurale Techniques d'analyses biochimiques

UF Techniques d'analyses biochimiques

1H 0H30 1H 3 6

3 6

X

Biologie moléculaire 1H30 0h45 0H30 3 3 X 3 Biologie moléculaire Microbiologie UF

Microbiologie 1H30 1h15 3 6 3

6 X

OPT1.1 3 3 X 4 OPTIONNELLE 1 UO OPT1.2 3

6 3

6 X


6 3

6 X








° Unité d'enseignementNature de l'UE




TIC et Multimédia 28H 2 2 X Anglais 28H 2 2 X 1

TIC Langues Gestion

UT Culture de l’entreprise 21H 2

6 2

6 X

Physiologie animale 21 7 14 3 3 X 2

Physiologie animale Biotechnologie Animale

UF Biotechnologie Animale 21 14 3

6 3

6 X

Enzymologie &Génie Enzymatique 21 7 10H

30 3 3 X 3

Enzymologie /Génie Enzymatique Génie des Procédés

UF Génie des Procédés 21 10H

30 7 3 6

3 6

X

Génétique Moléculaire 21 10H

30 7 3 3 X 4

Génétique Moléculaire Génie Génétique

UF Génie Génétique 21 7 10H

30 3 6

3 6

X

OPT 3.1 3 3 X 5 U Optionnelle 3 UO OPT 3.2 3

6 3

6 X








N Unité d'enseignement Natur

e de l'UE




Anglais 28H 2 2 X Culture de l’entreprise 21H 2 X 1 Langues

Bioéthique et biosécurité UT Bioéthique / Biosécurité 28H 2

6 2

6 X

Biochimie Métabolique 21 7 10H30 3 3 X 2

Biochemie Métabolique Microbiologie Industrielle

UF Microbiologie Industrielle 21 17H30 3

6 3

6 X

Physiologie Végétale 21 3h30 14 3 3 X 3 Physiologie Végétale Biotechnologie Végétale UF

Biotechnologie Végétale 21 7 10h30 3 6

3 6

X Opérations Unitaires 21 10h30 7 3 3 X

4 Opérations Unitaires Immunologie et Immunotechnologie

UF Immunologie et Immunotechnologie 21 10h30 7 3

6 3

6 X


6 3

6 X


Programmes du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur de la santé

Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé (ex: B.Médicale))

Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé) - Semestre 5


N° Unité

d'enseignement Nature de l'UE




Langue et communication

2 2 X

Culture de l’Entreprise (Création des entreprises)

1H30 2 X 1

Langue et communication Culture de l’Entreprise Bioinformatique

UT

Bioinformatique 2 2

6

X Génomique et transcriptome

1H30 1H30 0H45 3 X 2 Biotechnologie des

Macromolécules UF Protéomique 1H30 1H30 0H45 3

6

X Cultures cellulaires et tissulaires

1H30 1H15 3 X 3

Biotechnologie cellulaire et applications

UF Technologies cellulaires 1H30 1H15 3

6

X

Identification et typages des bactéries et des virus

1H30 1H15 3 X

3

Biotechnologie des Microorganismes appliquée au secteur Médical

UF Identification et typage des parasites et mycologie

1H30 1H15 3 6 X

Pharmacologie moléculaire

1H30 0H30 0H45 3 X 5 UE optionnelle 5 UO

Toxicologie moléculaire 1H30 0H30 0H45 3 6

X


Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au

secteur de la santé (ex: B.Médicale)) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies

Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé) – Semestre 6



Elément constitutif d'UE (ECUE) Cours TD TP

Cours

intégré

ECUE (le cas

échéant UE

ECUE (le cas

échéantUE Contrôle


1 Stage pratique UF Validation


Programmes du Parcours : Contrôle et Exploitation des Microorganismes Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Contrôle et Exploitation

des Microorganismes) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies

Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle et Exploitation des Microorganismes) - Semestre 5 Volume horaire semestriel

(14 semaines) Crédits Coefficients Régime d'examen N° Unité





Langue et communication 2 2 X Culture de l’Entreprise (Création des entreprises) 1H30 2 X 1

Langue et communication,

Culture de l’Entreprise et

Bioinformatique

UT

Bioinformatique 2 2

6

X Microorganismes pathogènes et maladies émergentes 1H30 0H30 0H45 3 X

2 Microorganismes

d’intérêt médical et pharmaceutique

UF Microorganismes producteurs de molécules d’intérêt 1H30 0H30 0H45 3

6

X

Identification et contrôle de microorganismes pathogènes en Agroalimentaire

1H30 0H30 0H45 3 X 3

Microorganismes spécifiques à l’Industrie

Agroalimentaire

UF Exploitation et Production de Microorganismes utiles en Agroalimentaire

1H30 0H30 0H45 3

6

X

Fermentation microbienne : Technologie et formulation des produits finis

1H30 0H30 0H45 3 X

4 Microorganismes en

Industrie, Agronomie et

Environnement

UF Microbiologie de l’Environnement et Microorganismes d’intérêt agricole

1H30 0H30 0H45 3

6

X

OP. 5-1 3 X 5 UE optionnelle 5 UO OP. 5-2 3

6

X


Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au

secteur de la santé (ex: B.Médicale)) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies

Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle et Exploitation des Microorganismes) - Semestre 6



Elément constitutif d'UE (ECUE) Cours TD TP

Cours

intégré

ECUE (le cas

échéant UE

ECUE (le cas

échéantUE Contrôle




Programmes du Parcours : Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires قبة جودة المواد الغذائيةامر

Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires)

Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires) - Semestre 5


° Unité








Bioinformatique

UT

Bioinformatique 2 2

6

X

Contrôle biochimique 1H30 0H30 0H45 3 X 2

Contrôle des Aَliments et des

Produits Agroalimentaires

UF Contrôle microbiologique 1H30 0H30 0H45 3

6

X

Technologies du Lait et produits dérivés, des matières grasses et des Boissons

1H30 0H30 0H45 3 X

3 Technologies Agroalimentaires UF Technologies des

Céréales, des Produits Carnés et des Produits de la Me

1H30 0H30 0H45 3

6

X

Applications de Management de Qualité 1H30 0H30 2 X

Rhéologie et Techniques d’analyses sensorielles 1H30 0H30 0H30 2 4

Techniques de Contrôle de

Qualité UF

Techniques de qualité de conservation, d’emballage et de conditionnement

1H30 0H30 0H30 2

6

X


6

X


Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Contrôle de Qualité des

Produits Alimentaires) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires) – Semestre 6




Cours TD TP Cours intégré ECUE UE ECUE UE Contrôle


1 Stage pratique UF Stage pratique Validation


Programmes du Parcours : Biotechnologie Végétale Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie Végétale) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies

Licence Appliquée en Biotechnologies (Parcours : Biotechnologie Végétale) - Semestre 5


° Unité








Bioinformatique

UT

Bioinformatique 2 2

6

X

. Biotechnologie végétale et conservation des phytoressources

1H30 0H30 0H45 3 X

2 Biotechnologie

végétale et Biochimie

UF Biochimie végétale et Valorisation des produits végétaux

1H30 0H30 0H45 3

6

X

Eléments de Génétique quantitative et Sélection classique

1H30 0H30 0H45 3 X 3

Génétique et Amélioration des

Plantes UF

Sélection assistée par les Marqueurs Génétiques 1H30 0H30 0H45 3

6

X

Biotechnologie Moléculaire 1H30 0H30 0H45 2 X

4

Biotechnologies basées sur

l’utilisation de l’ADN

UF Typage et Marqueurs Moléculaires 1H30 0H30 0H45 2

6

X

OP. 5-1 3 X 5 UE optionnelle 5 UO OP. 5-2 3 6 X


Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie Végétale) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies




Elément constitutif d'UE (ECUE) Cours TD TP Cours

intégré ECUE UE ECUE UE Contrôle continu

Régime mixte



Programmes du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique (S5) Domaine : Sciences et Technologies

Mention : Biotechnologie Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique

L3 (semestre 5)

Unités d’enseignement Elément constitutif (ECUE) C-CI TD TP h/s H/S Coeff Coef,UE Crédits Régime d’examen

Unité d’enseignement transversale continu mixte

Langues (Français, Anglais) 2h 2 2 X Informatique et statistique appliquée 2h 2 2 X

UE 1: Unité transversale d’enseignements Culture de l’Entreprise (Organisation de

l’entreprise) : 1h.30 2 6

2 X

Unités d’enseignement fondamentales

Industries des médicaments (fabrication, production, contrôle) 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h30 3 3 X UE 2 : Industrie

pharmaceutique Maîtrise environnementale des procédés pharmaceutique 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h30 3

6 3 X

Bioressources pharmaceutiques (animales, végétales et microbiennes) 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h30 3 3 X UE 3 : Biotechnologie

pharmaceutique Médicaments issus de la biotechnologie 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h30 3

6 3 X

Techniques d’analyses et détection rapide microbiologiques 1h 1h45 2h45 38h30 3 3 X UE 4 : Techniques

d’analyses Techniques d’analyse et détection rapide

physicochimiques 1h 1h45 2h45 38h30 3 6

3 X

Unités d’enseignement optionnelles spécifiques ( à choisir obligatoirement 6 crédits ) OPT .1 3 3 X U.OP

OPT.2 3 6

3 X


Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique L3 (semestre 6)








Programmes du Parcours : Biotechnologie marine et aquaculture

Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie marine et aquaculture)


Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie marine et aquaculture) - Semestre 5

Crédits Horaire Régime d’examen UE

Nature de l’UE ECUE ECUE UE Coef C TD TP CI Contrôle


Anglais 2 2 2H X Culture de l’Entreprise (Création d’entreprises) 2 2 1H30 X Unité

Transversale UT Biostatistiques 2

6 2 2H X

Milieu de culture 2 2 0H30 0H45 0H45 X Alimentation en Aquaculture 2 2 0H30 0H45 0H30 X Technologie

Aquacole UF Reproduction contrôlée d’organismes aquatiques 2

6 2 0H30 0H45 0H30

Culture et élevage des invertébrés aquatiques 3 3 1H 1H 0H45 X Culture des organismes aquatiques

UF Culture et élevage des vertébrés aquatiques 3 6 3 1H 1H 0H45 X

Biomolécules aquatiques d’intérêt 3 3 1H 1H 0H45 X Valorisation des

bioressourses aquatiques

UF Exploitation et valorisation des bioressourses aquatiques 3 6 3 1H 1H 0H45 X

OPT 1 3 3 X OPT UO OPT 2 3 6 3 X










1 Stage pratique UF

Validation


Programmes du Parcours : Biotechnologie Animale

Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie Animale) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies

Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie Animale) - Semestre 5

Horaire Régime examen UE Nature

de l’UE ECUE Crédits Coef C TD TP CI Contrôle continu

Régime mixte

Anglais 2 2 2H X Culture de l’Entreprise (Création

d’entreprises) 2 2 1H30 X Unité

Transversale

UT

Biostatistiques 2 2 2H X Biotechnologie moléculaire 3 3 1H30 0H45 0H30 X Biotechnologies

moléculaire et cellulaire

UF Biotechnologie cellulaire et tissulaire 3 3 1H30 0H45 0H30 X

Biotechnologie du développement 3 3 1H30 0H45 0H30 X Biotechnologies de la reproduction et du développement

animal

UF Technologie de la reproduction animale 3 3 1H30 0H45 0H30 X

Biomolécules d’intérêt 3 3 1H30 0H45 0H30 X Exploitation et valorisation des

produits d’origine animale

UF Valorisation des produits et des sous-produits d’origine animale 3 3 1H30 0H45 0H30 X

OPT 1 3 3 X OPT UO OPT 2 3 3 X









1 Stage pratique UF

Validation


Programmes du Parcours : Valorisation des bio ressources des milieux arides

Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Valorisation des bio ressources des milieux arides)


Licence Appliquée en Biotechnologies (Valorisation des bio ressources des milieux arides) - Semestre 5

Horaire Régime examen UE Nature

de l’UE ECUE Crédits Coef C TD TP CI Contrôle continu

Régime mixte

Anglais: préparation à la certification 2 2 2H X Culture de l’Entreprise (Création

d’entreprises) 2 2 1H30 X Unité Transversale UT

Bioinformatique 2 2 1H 1H X Phytoressources en milieu aride 3 3 1H30 1H15 X Valorisation des

Phytoressources UF Biotechnologies végétales 3 3 1H30 1H15 X

Bioressources animales 3 3 1H30 1H15 X Valorisation des ressources Animales

UF Biotechnologies animales 3 3 1H30 1H15 X

Biomolécules d’intérêt industriel 2 3 1H 0H45 X Extraction, analyse et identification de

biomolécules 2 3 1H 0H45 X Exploitation industrielle des Bioressources

UF Génie fermentaire et transformations

alimentaires 2 1H 0H30 0H30 X



Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (valorisation des bio ressources des milieux arides)


Licence Appliquée en Biotechnologies (valorisation des bio ressources des milieux arides) - Semestre 6






1 Stage pratique UF

Validation


Programmes du Parcours : Valorisation des ressources végétales Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Valorisation des ressources

végétales) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies

Licence Appliquée en Biotechnologies (Valorisation des ressources végétales) - Semestre 5

HORAIRE Régime d'examen UNITE D’ENSEIGNEME

NT

Nature de l’UE UNITES D’ENSEIGNEMENT

COURS TD TP Cours intégré

CREDIT COEFFICIENT Contrôle


ECONOMIE D’ENTREPRISE,

NORME ET LEGISLATION UT

LANGUE/ ANGLAIS NORME ET LEGISLATION CULTURE DE L’ENTREPRISE (ECONOMIE ET GESTION COMMERCIALE)

2H 2H 1H30

2 2 2

X

VALORISATION DES

RESSOURCES VEGETALES UF

MICROBIOLOGIE ET FERMENTATION DES VEGETAUX BIOTECHNOLOGIE VEGETALE 2 VALORISATION ENERGETIQUE DE LA PRODUCTION VEGETALE

1H 1H 1H

0H30 0H30 0H30

0H30 0H30

2 2 2

1 1 1

X

BIODIVERSITE VEGETALE TERRESTRE UF

ETUDE ET GESTION DE LA DIVERSITE VEGETALE PLANTES MEDICINALES ET AROMATIQUES

1H30 1H30

1H 0H30

1H

3 3

1.5 1.5

X

REGLEMENTATION &

VALORISATION DES DECHETS

VEGETAUX

UF

REGLEMENTATION ET CONTROLE DE LA QUALITE GESTION ET VALORISATION DES DECHETS VEGETAUX 2

1H30 1H30

1H 1H

1H

3 3

1.5 1.5

X

TECHNOLOGIE & BIOCHIMIE VEGETALES UO

OPT. 1 : BIOCHIMIE APPLIQUEE AUX RESSOURCES VEGETALES OPT. 2 : TECHNOLOGIE ET TRANSFORMATION DES PRODUITS VEGETAUX

1H30 1H30

0H30 1H

0H30 0H30

3 3

1.5 1.5

X


Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Valorisation des ressources végétales)








1 Stage pratique UF

Validation


CONTENUS DES PROGRAMMES DE LA LICENCE APPLIQUEE EN

BIOTECHNOLOGIES


Contenus des programmes de L 1 (S1 et S2)


Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (EU)

et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE

DIVERSITE DU VIVANT

Nombre de crédits………6…… Code UE………………………….

Université :………………………………………………. Etablissement :…………………………………………..

Domaine de la formation : Sciences et Technologie

Mention :…Biotechnologies…et autres mentions des sciences du vivant…….

Diplôme et Parcours LA…Biotechnologies. Parcours : Tous les parcours de la mention LF Parcours :……………………………

Semestre S1

1- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences)

Permettre à l’étudiant d’acquérir une formation de base sur - la diversité et l’importance du règne végétal et du règne animal dans la Biosphère - la morphologie et le développement des végétaux inférieurs et des plantes à fleurs - les Protozoaires, la biologie et la diversité des Métazoaires ( invertébrés et vertébrés)

2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE

concernée) 3-

Niveau du Baccalauréat en sciences expérimentales ou équivalent. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements

Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP Crédits

1- Biologie végétale

1h30

0H

1H15

3

2- Biologie animale

1h30

0H

1H15

3

Total 3H 0H 2H30 6 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires….)

Durée Activités pratiques de l’UE Travaux au

laboratoire Projets Stages Autres (terrain)

Crédits


Total 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE)

1- Biologie végétale : Introduction, les grandes lignes de la classification du règne végétal, étude des angiospermes 2- Biologie animale : Introduction, les protozoaires, les métazoaires : invertébrés et vertébrés 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité)

1- Biologie végétale : Réalisation de coupes anatomiques, reconnaissance des organes et utilisation d’une flore, terrain, histologie, morphologie et anatomie des appareils végétatif et reproducteur des angiospermes. Reproduction sexuée et multiplication végétative 2-Biologie animale : Reconnaissance et classification des différents taxons : étude des Protozoaires, des Spongiaires et des Cnidaires ; étude des Vers, des Mollusques et des Arthropodes ; étude des Vertébrés (Poissons, Amphibiens, Reptiles, Oiseaux et Mammifères) 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) Utilisation de préparations microscopiques Présentation de documents audiovisuels en cours et en TP Sorties sur le terrain ; Collections de référence ; Confection d’herbier Ouvrages de référence : - Initiation à la Biologie Végétale par J. ZAFFRAN édition Ellipse - Biologie végétale – les Cormophytes par R. GORENFLOT et B. DE FOUCAULT édition Dunod - Biologie animale. Structures et Fonctions par J. COUSIN édition Ellipse - Croissance et développement des animaux par J.-Y. PATTIER édition Ellipse 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l’UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées) 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).

Contrôle continu (30%) Examen final (70%) EPREUVES EPREUVES ECUE

Ecrit TP Autres

Pondéra -tion Ecrit Oral TP et

Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE

Coef. de l’UE au sein du

parcours 1-Biologie Végétale

5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

2- Biologie Animale

5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 6


TOTAL 10% 10% 10% 50 20 6 6 6.3- Validation des stages et des projets.... …………………………………………………………………………………………………………..


Annexe 1

Unité d’Enseignement DIVERSITE DU VIVANT

Code UE :……………

ECUE n° 1 BIOLOGIE ANIMALE

Code ECUE :…………… COURS 21H I. Introduction: Diversité du vivant A. Place du règne animal dans le monde vivant B. Diversité et évolution du monde animal C. Principes de la classification: systémique et nomenclature II. Les Protistes à affinité animale: les Protozoaires

A. Présentation générale et particularités (Amibe- Trypanosome- Paramécie) B. Intérêt médical (maladies- épidémies…) et écologique (espèces indicatrices) des

protozoaires C. Etude de cycles biologiques (1ou plus: Leishmaniose par exemple)

III. Biologie et Diversité des Métazoaires

A. Les Invertébrés

1. Spongiaires et Cnidaires: plan d’organisation - diversité- intérêts économique et écologique (exploitation et valorisation)

2. Les vers: Plathelminthes- Némathelminthes – Annélides: plan d’organisation- diversité- intérêts médical (étude de cycles biologiques parasitaires), écologique et biologique

3. Les Mollusques: - Classification et Diversité - Intérêts écologique et économique (espèces comestibles:

exploitation et valorisation) 4. Les Arthropodes:

- Classification et Diversité. - Intérêts médical, agronomique, écologique, économique…:

espèces utiles- nuisibles – venimeuses, bio indicateurs…) 5. Les Echinodermes: présentation générale et intérêt biologique

B. Les Vertébrés

1. Particularités morphologiques et biologiques 2. Diversité (Poissons – Amphibiens – Reptiles – Oiseaux- Mammifères) 3. Intérêt biologique, écologique et économique


TRAVAUX DIRIGES & PRATIQUES 1. Etude des Protozoaires (Amibe – Trypanosome- Paramécie) – des Spongiaires et des

Cnidaires (comparaison et reconnaissance de quelques taxons des côtes tunisiennes) II. Etude des Vers

• Comparer Trématodes – Cestodes- Nématodes et Annélides • Reconnaissance des principaux taxons (Douve- Ténia- Ascaris- Ver de terre…) •

III. Etude des Mollusques • Diversité du groupe- Reconnaissance des espèces fréquentes, comestibles… • Dissection d’un mollusque (escargot ou moule)

IV. Etude des Arthropodes • Diversité du groupe – Reconnaissance: scorpions- myriapodes- araignées et tiques-

insectes à intérêt en agronomie ou autre • Etude du criquet et de quelques larves d’insectes •

V. Etude des Vertébrés I: Poissons – Amphibiens et Reptiles • Classification: poissons cartilagineux et poissons osseux • Classification, diversité et reconnaissance des Amphibiens: grenouilles - crapauds et

têtards • Classification et reconnaissance des Reptiles: tortues- lézards- couleuvres et vipères

VI. Etude des Vertébrés II: Oiseaux et Mammifères • Classification, diversité et reconnaissance de quelques espèces d’oiseaux • Classification, diversité et reconnaissance de quelques espèces de Mammifères


Annexe 1

Unité d’Enseignement DIVERSITE DU VIVANT


ECUE n° 2 BIOLOGIE VEGETALE

Code ECUE :…………… COURS 21H I. Introduction: Importance du règne végétal dans la biosphère II. Les Grandes lignes de la classification et de diversité du règne végétal

D. Les thallophytes (Algues- Champignons- Lichens). E. Les Cormophytes

1. Bryophytes (Mousses) 2. Ptéridophytes 3. Spermaphytes

i. Gymnospermes (Ex. Pin) ii. Angiospermes (mono- et Dicotylédones)

III. Etude des Angiospermes

A. Les caractéristiques propres à la cellule végétale B. Les Tissus végétaux, notamment les méristèmes primaires et secondaires C. L’appareil végétatif (tige- feuille- racine) et adaptations fonctionnelles D. La multiplication végétative E. L’appareil reproducteur et biologie de la reproduction sexuée

TRAVAUX DIRIGES & PRATIQUES (Intégrés)

I. Cellule végétale et tissus végétaux II. Appareil végétatif (morphologie) III. Appareil végétatif (anatomie) IV. Fleur et inflorescence: biologie florale V. Fruits et graines VI. Multiplication végétative naturelle et artificielle




Intitulé de l’UE

CHIMIE




Mention :…Biotechnologies et autres mentions des sciences du vivant……….


Semestre S1


Chimie générale : Connaître la structure des atomes, des liaisons chimiques ainsi que la thermodynamique chimique afin de comprendre la stabilité et les transformations des produits. Chimie organique : connaître les principales fonctions chimiques ainsi que leurs caractéristiques.

5- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée)

6-



1- Chimie générale

1h30

0H30

0H45

3

2- Chimie organique

1h30

0H30

0H45

3

Total 3H 1H 1H30 6 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires….)


laboratoire Projets Stages Autres (terrain)

Crédits


Total

4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE)

1- Chimie générale : Atomistique et liaison chimique, thermodynamique chimique et cinétique chimique 2- Chimie organique : Analyse élémentaire de composés organiques, propriétés chimiques des hydrocarbures, Propriétés des alcools, les amines, les dérivés carbonylés, les acides et leurs dérivés 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité)

1-Chimie générale: Dosages volumétriques (méthodes de calcul, Préparation de solution titrée, Acidimétrie, Manganimétrie, Iodométrie, Argentimétrie 2-Chimie organique : Extraction de produits organiques, Synthèse d’acide salicylique, Identification par chromatographie. 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l’UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées) 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).


Ecrit TP Autres


Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE


parcours 1-Chimie générale

5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

2- Chimie organique

5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 6

TOTAL 10% 10% 10% 50 20 6 6 6.3- Validation des stages et des projets.... …………………………………………………………………………………………………………..


Annexe 1

Unité d’Enseignement CHIMIE 1


ECUE n° 1 CHIMIE GENERALE

Code ECUE :…………… COURS 21 H

I. Atomistique et liaison chimique - Structure des atomes - Classification périodique des éléments - Liaison chimique - Théorie L.C.A.O. - Hybridation sp3, sp2, sp de l’atome de carbone II. Thermodynamique chimique - Système - Variable et fonction d’état - Transfert - Réactions réversibles ou irréversibles - Le premier principe : Transfert de travail et transfert de chaleur - Condition d’équilibre - Le deuxième principe : énoncé, expression et fonction thermodynamique - Loi d’action de masse, constante d’équilibre - Calcul du PH des solutions aqueuses - Etude expérimentale des vitesses de réaction : Réaction d’ordre 1et 2 III. Cinétique chimique - Effet de la température sur la vitesse de réaction - Formule d’ARRHENIUS - Notion de catalyseur

TRAVAUX DIRIGES & PRATIQUES Objectifs : Maîtriser et connaître différents dosages avec des applications concrètes sur les dosages volumétriques 1. Méthode de calcul 2. Préparation de solutions titrées Acide/base, permanganate de potassium, iode, nitrate d’argent 3. Acidimétrie Dosage des sulfites, de l’acidité du vin ou des jus, de l’acidité de la matière grasse 4. Manganimétrie Dosage direct de l’acide oxalique et dosage indirect des sucres réducteurs 5. Iodométrie Degré colorimétrique de l’eau de Javel et Indice d’Iode de la matière grasse 6. Argentimétrie Méthode de Mohr


Annexe 1

Unité d’Enseignement CHIMIE 1


ECUE n° 2 CHIMIE ORGANIQUE

Code ECUE :…………… COURS 21 H

I. Analyse élémentaire d’un composé organique - Formule brute - Formule composée

II. Représentation spatiale d’un carbone saturé

- Représentation de CRAM - Projection de FISHER et de NEWMAN

III. Propriétés chimiques des Hydrocarbures - Alcanes - Alcènes - Alcynes

IV. Propriétés des alcools V. Les amines

VI. Les dérivés carbonylés

- Aldéhydes - Cétones

VII. Les acides et leurs dérivés

TRAVAUX DIRIGES & PRATIQUES

Extraction de produits organiques : Liquide/Liquide Synthèse d’acide salicylique Identification par chromatographie en couche mince




Intitulé de l’UE

BIOLOGIE CELLULAIRE ET GENETIQUE




Mention :…Biotechnologies et autres mentions des sciences du vivant

Diplôme et Parcours LA…Biotechnologies. Parcours : tous les parcours de la mention LF Parcours :……………………………

Semestre S1


Permettre à l’étudiant d’acquérir une formation de base sur la structure des cellules vivantes, les divisions cellulaires (méïose et mitose), l’analyse de la transmission des gènes chez les Procaryotes et les Eucaryotes.




1- Biologie cellulaire

1h30

0h30

0H45

3

2- Génétique

1h30

0h45

0H30

3

Total 3H 1h15 1h15 6 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires….)


laboratoire Projets Stages Autres Crédits



1- Biologie cellulaire : Introduction, membrane plasmique, cytosol, organites, noyau et divisions cellulaires 2- Génétique : Introduction, génétique des procaryotes, génétique des eucaryotes, complémentation fonctionnelle, génétique extrachromosomique. 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité)

1- Biologie cellulaire : Techniques d’étude de la cellule,observation des cellules et des organites, mitose, méïose 2-Génétique : Transformation bactérienne, croisements chez les champignons, croisements chez la Drosophile. 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) Utilisation de préparation microscopiques Présentation de documents audiovisuels en cours et en TP Ouvrages de référence : - La Cellule de PRESCOTT - Introduction à l’analyse génétique de GRIFFITHS et Collaborateurs de BOECK 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux)

Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l’UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées) 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).


Ecrit TP Autre Pondéra

-tion Ecrit Oral TP et Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE


parcours 1-Biologie Cellulaire 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2-Génétique 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

6

Total 10% 10% 10% 50% 20% 6 6


6.3- Validation des stages et des projets.... ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………


Annexe 1

Unité d’Enseignement BIOLOGIE CELLULAIRE & GENETIQUE


ECUE n° 1 BIOLOGIE CELLULAIRE

Code ECUE :……………

COURS 21H I. Introduction A. Propriétés communes à toutes les cellules vivantes B. Structure cellulaire et structure acellulaires (Virus) C. Cellule Procaryotes et cellules Eucaryotes D. Diversité des cellules eucaryotes: cellule végétale- cellule animale- cellules des champignons II. Etude de la membrane plasmique

F. Structure et organisation moléculaire G. Rôle physiologique de la membrane B1. Transport de substances B2. Transfert de l’information H. Différenciation morpho-fonctionnelle de la Membrane

III. Le Cytosol IV. Les organites

A. Ribosomes B. Réticulum endoplasmique C. Appareil de Golgi D. Lysosomes E. Mitochondries F. Peroxysomes et glyoxysomes G. Chloroplastes H. Cytosquelette I. Noyau

V. Division Cellulaire A. Mitose B. Méiose TRAVAUX PRATIQUES ET TRAVAUX DIRIGES

I. Techniques d’étude de la cellule Avec exercices d’application et observation et étude de cellules II Etude et observation des organites II. Mitose III. Méiose


Annexe 1

Unité d’Enseignement BIOLOGIE CELLULAIRE & GENETIQUE


ECUE n° 2 GENETIQUE


COURS 21H I. Introduction à la Génétique A. Rappels de la Mitose et de la Méiose B. Notions de caractères – gènes – allèles - mutations II. Analyse génétique des Procaryotes III. Analyse génétique des Eucaryotes

I. Cas des Haploïdes J. Cas des Diploïdes On traitera la transmission des caractères contrôlés par: 1. un couple d’allèles 2. deux ou plusieurs couples d’allèles.

III. Notions préliminaires de génétiques extra-chromosomique TRAVAUX DIRIGES & TRAVAUX PRATIQUES

1. Transformation bactérienne 2. Réalisation et étude des croisements chez les champignons 3. Analyse et croisements chez la drosophile Des séries d’exercices seront proposées parallèlement aux étudiants comme complément du cours.


Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (EU) et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE

MATHEMATIQUES ET PHYSIQUE


Université :………………………………………………. Etablissement :……………………

……


Mention :…Biotechnologies et autres mentions des sciences du vivant………………


Semestre S1


Mathématiques appliquées : Permettre à l’étudiant en biologie d’acquérir l’essentiel des outils et des techniques mathématiques et statistiques pour savoir traduire et modéliser certains problèmes issus de la Biologie Physique 1 : Permettre à l’étudiant en biologie de comprendre les phénomènes physiques liés au vivant et les principes physiques de fonctionnement des équipements utilisés dans l’observation et l’étude des cellules, des molécules et des organismes




1- Mathématiques appliquées 1H30 1H 3

2-Physique 1 1H30 0H45 0H45 3 Total 3H 1H45 0H45 6

3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires….)

Durée Activités pratiques de l’UE Travaux au Projets Stages Autres Crédits


laboratoire


1- Mathématiques appliquées : Fonction numériques d’une variable réelle, Equations différentielles, Fonctions à plusieurs variables, Calcul matriciel et système d’équations linéaires, Probabilités élémentaires, Statistique. 2- Physique 1 : Mécanique, Electricité et électronique, Optique géométrique, mécanique des fluides. 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité)

Mathématiques appliqués : Pour les applications, l’accent sera mis sur des exemples simples relevés en biologie Physique 1 : 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux)

Régime mixte : Contrôle continu et Examens finaux de l’UE 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).




Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE


parcours 1-Maths appliquées 10% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2-Physique 1 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

6

Total 15% 5% 10% 50% 20%1 6 6




Annexe 1

Unité d’Enseignement MATHEMATIQUES & PHYSIQUE


ECUE n° 1 MATHEMATIQUES APPLIQUEES


COURS 21H Recommandations : L’accent sera mis sur les concepts de base sans trop s’attarder sur les démonstrations Fonctions numériques d’une variable réelle - Rappels : domaine de définition, opérations sur les fonctions (fonctions puissances, polynomiales, rationnelles, trigonométriques, exponentielle et logarithme) - Dérivabilité. Formule de Taylor (à l’ordre 2 ou 3), développements, limites, calculs approchés, exemples et applications - Représentations graphiques - Primitives et intégrales : définitions, méthodes de calculs (changement de variables et intégration par parties) Equations différentielles - Définitions et exemples - Equations différentielles linéaires du premier ordre. Méthodes de résolution. Applications - Equation différentielles linéaires du second ordre à coefficients constants. Méthodes de résolution. Applications Fonctions à plusieurs variables - Définitions et exemples (on se limitera à 2 variables) - Dérivées partielles, recherche d’extremum d’une fonction, gradient et applications. Calcul matriciel et systèmes d’équations linéaires - Définition d’une matrice, opération sur les matrices, inversion d’une matrice carrée - Applications : résolution de systèmes linéaires Probabilités élémentaires - Introduction à l’analyse combinatoire - Espaces de probabilités : illustration par des exemples simples - Probabilités conditionnelles et évènements indépendants - Variables aléatoires discrètes et lois de probabilités usuelles Statistique - Echantillonnage statistique. Représentation de données : séries statistiques, tableaux statistiques - Estimation : définition et propriétés d’un estimateur, estimation ponctuelle et par intervalle - Tests de signification : procédure générale, niveau de signification d’un test, test de comparaison


- Test d’adéquation du Khi-deux.


Annexe 1

Unité d’Enseignement MATHEMATIQUES & PHYSIQUE


ECUE n° 2 PHYSIQUE 1


COURS 21H Mécanique - Cinématique du point : référentiels, trajectoire, vitesse, accélération, relativité du mouvement - Dynamique : notions de forces, principes de la dynamique, travail et énergie, lois de conservation, chocs, oscillateur harmonique. Electricité et électronique - Loi de Coulomb, champ potentiel électrostatique - Moment dipolaire - Action d’un champ extérieur - Eléments de magnétostatique - Notions sur les fonctions de l’électronique Optique géométrique - Lois de Snell-Descartes, systèmes plans, systèmes sphériques - Lentilles, applications : l’œil, la loupe, le microscope Mécanique des fluides - Hydrostatique : pression, statique des fluides, théorème d’Archimède, tension superficielle - Hydrodynamique : différents types d’écoulement, théorème de Bernouilli et applications - Viscosité d’un fluide - Phénomène de diffusion, loi de Fick. TRAVAUX PRATIQUES ET DIRIGES 21H




Intitulé de l’UE

Biochimie structurale et Techniques d’Analyses Physicochimiques

Nombre de crédits…6………… Code UE………………………….

Université :…………………………… Etablissement :…………………………..

Domaine de la formation…Sciences et Technologies

Mention : Biotechnologies et autres mentions des Sciences du vivant

Diplôme et Parcours LA…Toutes les licences habilitées en Sciences du vivant. Parcours :…………………… LF………………………………………………………..Parcours :……………………………

Semestre ……………………..……………………..


Permettre aux étudiants d’acquérir les formations de base sur les structures des biomolécules ; leurs propriétés physicochimiques ainsi que des techniques de caractérisation et d’analyse 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée)

Chimie ; physique et Biologie cellulaire 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements


1- Biochimie structurale 1H30 0H30 1H 3 2- Techniques d’analyse 1H 0H30 1H 3

Total 2H30 1H 2H 6 3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires….)

Durée Activités pratiques de l’UE Travaux sur

terrain Projets Stages Autres Crédits

Total 4- Contenu (descriptifs et plans des cours)


4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE) 1- Propriétés et étude structurale des glucides, des lipides, des protéines et des acides nucléiques. 2- Méthodes d’extraction, de séparation, d’identification et de dosage des molécules biologiques : méthodes spectroscopiques, chromatographiques, électrophorétiques et radioisotopiques. 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité) Selon les disponibilités des institutions, des séances de travaux pratiques seront réalisées si possible de façon intégrée entre les deux ECUE, pour illustrer les enseignements théoriques. A l’occasion d’une même séance, on peut à la fois présenter les propriétés d’une molécule, la purifier, la doser et analyser sa structure, tout en effectuant un choix pertinent entre les différentes méthodes présentées ci-dessus. 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) A préciser par les institutions………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) ……………Mixte……………………………………………………………………………………. ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne




Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE


parcours 1-Biochimie structurale 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2- Techniques d’analyses 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

6

TOTAL 10% 10%

10%

50% 20% 6 6



…………………………………………………………………………………………………………


Annexe 1 Unité d’Enseignement BIOCHIMIE STRUCTURALE

ET TECHNIQUES D’ANALYSES PHYSICOCHIMIQUES Code UE :……………

ECUE n° 1 BIOCHIMIE STRUCTURALE Code ECUE :……………

Plan du Cours

1H30 Cours, 0H30 TD et 1H TP

Objectifs : Renforcer les connaissances de Base des étudiants sur les structures des molécules biologiques ainsi que sur leurs principales caractéristiques.

I- Introduction générale

II- Les glucides - Structure, composition et classification - Propriétés physicochimiques - Identification, dosage et utilisation III- Les lipides - Structure, composition et classification - Propriétés physicochimiques - Identification, dosage et utilisation IV- Les acides aminés et les protéines - Les acides aminés * Structure, composition et classification * Propriétés physicochimiques *Identification, dosage et utilisation - Les protéines

* Structures, composition et fonction * Propriétés physicochimiques * Méthodes d’analyse

V- Les nucléotides et acides nucléiques - Structure des nucléotides - Structure des acides nucléiques - Propriétés physicochimiques des nucléotides et des acides nucléiques - Identification et dosage des nucléotides et des acides nucléiques.


Unité d’Enseignement BIOCHIMIE STRUCTURALE ET TECHNIQUES D’ANALYSES PHYSICOCHIMIQUES

Code UE :…………… ECUE n° 2 TECHNIQUES D’ANALYSES PHYSICOCHIMIQUES DES

BIOMOLECULES Code ECUE :……………

1H Cours, 0H30 TD et 1H TP

Objectifs : Concrétiser les connaissances théoriques de base des étudiants dans le domaine de la Biochimie en leur présentant les techniques d’extraction, de séparation, d’identification et de dosage des molécules biologiques.

Plan du Cours

I- Méthodes d’extraction, de préparation et de fractionnement - Prélèvement - Conservation (congélation et lyophilisation) - Précipitation, dialyse et filtration - Centrifugation et ultracentrifugation II- Méthodes spectroscopiques - Spectre de lumière (UV, visible, IR) - Colorimétrie et spectrophotométrie - Principe de la fluorimétrie III- Méthodes chromatographiques - Principe de la chromatographie - Les différents types de chromatographie IV- Méthodes électrophorétiques - Principe de l’électrophorèse - Les différents types d’électrophorèse - Les différentes méthodes de révélation V- Méthodes isotopiques - Principe de l’utilisation des radio-isotopes - Utilisation et mesure de la radioactivité - Radio-protection.

Enseignements pratiques Objectifs spécifiques des TP: Selon les disponibilités des institutions, des séances de travaux pratiques seront réalisées si possible de façon intégrée entre les deux ECUE, pour illustrer les enseignements théoriques. A l’occasion d’une même séance, on peut à la fois présenter les propriétés d’une molécule, la purifier, la doser et analyser sa structure, tout en effectuant un choix pertinent entre les différentes méthodes présentées ci-dessus.


Contenus des programmes de L 2 (S3 et S4)


Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (UE)

Et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE Enzymologie et Génie enzymatique, Génie de Procédés

Nombre des crédits : 6.... Code UE : ......................

Université : .............................................................. Etablissement : .........................................................

Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention : Biotechnologies Diplôme et parcours Semestre LA : Licence Appliquée Parcours : Tous les Parcours de la Mention Biotechnologie S3 LF Parcours :

1- Objectifs de l’UE (Savoir, aptitudes et compétences)

En ECUE enzymologie et génie enzymatique, l’étudiant devra acquérir les connaissances élémentaires concernant les enzymes, les propriétés des réactions enzymatiques dans le cas la cinétique Michaelienne. Il devra aussi être capable de déterminer leurs paramètres cinétiques en présence ou en absence des effecteurs biologiques et physiques de la réaction enzymatique. Cet enseignement aura aussi pour objectif de faire connaître les méthodes de préparation et d’immobilisation des enzymes pour pouvoir les utiliser en biotechnologie. L’objectif du cours de génie des procédés est de concevoir, calculer et faire fonctionner à l’échelle pilote, l’appareillage dans lequel s’effectuent des transformations physiques, chimiques ou biologiques. en utilisant un ensemble d’opérations et permettant de préparer un (ou des) produit(s) à partir de matières disponibles.


Chimie Générale, Chimie Organique, Biochimie Structurale, Math et Physique

3- Elément constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements


1- Enzymologie et Génie Enzymatique 1h30 0h30 0h45 3

2- Génie des Procédés 1h30 0h45 0h30 3 Total 3 h 1.15 h 1.15 h 6

3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires ….)

Durée Activités pratiques de l’UE Travaux sur

terrain Projets Stages Autres Crédits


Total

4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre

le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE) 1- Catalyse chimique et enzymatique, Cinétique Michaelienne, constantes cinétiques, dosages enzymatiques,

effecteurs enzymatiques, immobilisation des enzymes. 2- Transfert de quantité de mouvement, transfert de matière, transfert de chaleur.

4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objectifs, des contenus des

procédures d’organisation de chaque activité) 1- Acquérir une formation pratique en enzymologie et génie enzymatique de base indispensable en biotechnologie : - maîtriser les conditions expérimentales permettant d’optimiser une réaction enzymatique et déterminer les paramètres cinétiques de l’enzyme. - maîtriser les conditions d’immobilisation d’une enzyme 2- Acquérir une formation pratique dans les méthodes de mesure (pression, viscosité, écoulement, pertes de charge…).

5- Méthodes pédagogiques moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC – possibilités d’enseignement à distance …)

Rétroprojecteur, Data show soutenus par des supports de cours, ppaass ddee ppoossssiibbiilliittééss dd’’eennsseeiiggnneemmeenntt àà ddiissttaannccee. Ouvrages :

1- Biochimie Générale (Jacques-Henry Weil) 10ème édition DUNOD (par exemple) 2- Génie enzymatique, 1998, Loncle et Daniel, Edition : DOIN 3- Génie des procédés : principes fondamentaux du génie des procédés et de la technologie chimique, Henri

Fauduet, Lavoisier 4- Méthodes de Génie des procédés, avril 2004, Bergel, Hermes Sciences Publication 5- Le génie chimique à l’usage du chimiste, Joseph Lieto, Lavoisier

6- Examen et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle

continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux)

.................................................................................................................................................................................

.................................................................................................................................................................................

.................................................................................................................................................................................

6.2- Validation de l’UE (préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de

l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours). Contrôle continu (30%) Examen final ( 70%)

Epreuves Epreuves ECUE Ecrit TP Autres

Pondéra-tion Ecrit TP Autres

Pondéra

-tion

Coef. de l’ECUE

Coef. de l’UE au sein du parcours

1- Enzymologie et Génie Enzymatique 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3

2- Génie des Procédés 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% 6

6

6.3- Validation des stages et des projets …..

Régime mixte


...................................................................................................................................................................

...................................................................................................................................................................

...................................................................................................................................................................

...................................................................................................................................................................


Annexe I Unité d’Enseignement : ENZYMOLOGIE ET GENIE ENZYMATIQUE,

GENIE DE PROCEDES

Code UE : …………………

ECUE 1 : ENZYMOLOGIE ET GENIE ENZYMATIQUE

Code ECUE : …………… Enzymologie (13h) I- Catalyse enzymatique (4h) - Définition - La catalyse enzymatique : état de transition et énergie d’activation ................................................. - Spécificité enzymatique .................................................................................................................... - Les cofacteurs enzymatiques ............................................................................................................ - Classification des enzymes .............................................................................................................. II- Cinétique michaelienne (6h) - Equation de Michaelis - Menten ........................................................................................................ - Les phases de la réaction enzymatique .............................................................................................. - Détermination des constantes cinétiques Km et Vmax...................................................................... - Etape limitante de la réaction et signification du Kcat, efficacité catalytique, unité enzymatique et

activité spécifique - Détermination des constantes cinétiques à partir de représentations graphiques (Représentation de Lineweaver et Burk et Représentation d’Eadie Hofstee et autres représentations graphiques) III- Effecteurs de réaction enzymatique (3h) - Les différents types d’effecteurs de la réaction enzymatique - Les inhibiteurs (compétitifs, non compétitifs, incompétitifs) et détermination des paramètres cinétiques - Influence de la température et du pH Génie enzymatique (8h) I - Nature et origine des enzymes II - Les préparations industrielles des enzymes III - Les méthodes d’immobilisation des enzymes Méthode physique : immobilisation par adsorption Méthode chimique : immobilisation par fixation covalente sur un support. IV - Les applications en biotechnologie (exemples)



Unité d’Enseignement : Enzymologie et Génie enzymatique, Génie de Procédés

Code UE : …………………

ECUE 2 : Génie des procédés

Code ECUE : ……………

Objectifs : Les objectifs de cet enseignement sont de - faire comprendre les mécanismes d’écoulement des fluides, les lois de la diffusion de la matière et de la chaleur ainsi que les mécanismes de transfert de matière et de chaleur entre phases. - faire apprendre à réaliser des mesures de températures et à établir des bilans. - former aux méthodes qui permettent de calculer ou simuler les échanges de chaleur Cours 21H Introduction sur le génie des procédés

I- Transfert de quantité de mouvement (Mécanique des fluides) - Notions générales - Fluides au repos : modèle continu, fluides compressibles et incompressibles, statique des fluides. Cinématique : champs de vitesse, lignes et tubes de courant, conservation de la masse. - Bilans de quantité de mouvement et d'énergie, relation de Bernoulli. - Écoulements laminaires et turbulents : expérience de Reynolds, nombre de Reynolds, couche limite laminaire, écoulements turbulents en conduite. - Mesure des débits : diaphragme – venturi- rotamètre - compteur - normalisation AFNOR. - Perte de charge par frottement et perte de charge singulière. - Puissance à mettre en œuvre pour faire circuler un fluide dans une installation donnée. - Organes de circulation :

o Pompes centrifuges : NPSH et rendement o Pompes volumétriques.

II- Transfert de matière

- Introduction sur les phénomènes de transfert de matière - Nomenclature des systèmes diffusionnismes - Diffusion moléculaire - équations constitutive et générale : Expression de la loi de Fick, coefficient de diffusion. - Diffusion en régime stationnaire : fluides au repos, diffusion en régime laminaire et diffusion dans les solides. - Diffusion en régime non stationnaire - Coefficients de transfert et leur obtention - Transfert de matière entre phases : théorie du film, de la pénétration et du renouvellement de la surface. - Notions communes aux échangeurs de matière. III- Transfert de chaleur

- Les bases : Mesure de température ; Bilans d'énergie ; Coefficients locaux d'échanges ; Notions de résistance thermique ; Coefficient global d'échange - Les mécanismes : Conduction ; application au calorifugeage ; Rayonnement ; applications : pertes thermiques, erreurs concernant la mesure de la température d'un gaz ; Convection forcée et convection libre ; Calcul des coefficients d'échange


- Technologie : Echangeurs de chaleur ; Différence de température moyenne ; Mise en oeuvre de la méthode des unités de transfert ; Méthodes de calculs des appareils d’échange thermique - Etudes d'échangeurs, détermination de coefficients d'échange, simulation de fonctionnement...

TRAVAUX PRATIQUES ET DIRIGES Illustrations et démonstrations pratiques :

• Unités et dimensions utilisées en mécanique des fluides. • Mesure de la pression : les manomètres • Mesure des viscosités. • Régimes d'écoulement. • Débitmètres. • Mesure des pertes de charge par frottement et singulières. • Caractéristiques d'une pompe centrifuge. • Calcul d’un circuit hydraulique




Intitulé de l’UE PHYSIOLOGIE ET BIOTECHNOLOGIE ANIMALES



Domaine de la formation : Sciences et Technologies Mention :…Biotechnologies…………………………. Diplôme et Parcours LA…Biotechnologies. Parcours : Tous les parcours de la mention LF………………………………………………………..Parcours :……………………………

Semestre …S3 …………. …………………..

1- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences) Physiologie animale : Faire acquérir des connaissances de base sur quelques aspects de la physiologie animale en tant que spécialité carrefour qui considère l’être vivant dans son ensemble, intégrant les aspects moléculaires, cellulaires et fonctionnels, en relation avec les autres disciplines biologiques, avec pour finalité une meilleure compréhension des processus vitaux. Biotechnologie animale : Faire acquérir les notions de biologie de la reproduction et d’embryologie, de reproduction assistée et initier à la culture et la manipulation de cellules animales ainsi qu’à la transgenèse animale. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée) Biologie cellulaire, biochimie, biologie animale, génétique, microbiologie, biologie moléculaire 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements


Physiologie animale 1H30 0H30 1H 3 Biotechnologie animale 1H30 - 1H 3

TOTAL 3H 0H30 2H 6 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires….)





Physiologie animale : Milieu intérieur, régulation physiologique, mécanismes nerveux, mécanismes endocriniens, l’axe hypothalamohypophysaire. Biotechnologie animale: Biologie de la reproduction, embryologie, culture de cellules animales, hybridation cellulaire, croissance et différenciation in vitro, reproduction assistée, transgenèse animale. 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité) Physiologie animale : Potentiels d’action, contraction du muscle squelettique et cardiaque, contraction du muscle lisse, régulation hormonale, groupes sanguins et hémostase, expérimentations assistées par ordinateur (EXAO) Biotechnologie animale: Culture cellulaire, fusion cellulaire, insémination artificielle , fécondation in vitro, transfert et congélation d’embryons, greffe de moelle osseuse Visites de laboratoires et de centres spécialisés 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : contrôle continu et examens finaux 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).

Contrôle continu (30%) Examen final ( 70%) Epreuves Epreuves ECUE

Ecrit TP AutresPondéra

-tion Ecrit TP Autres

Pondéra

-tion

Coef. de l’ECUE


1- Physiologie animale 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 1- Biotechnologies animales 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% 6

6

6.3- Validation des stages et des projets.... …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………



LICENCE APPLIQUEE BIOTECHNOLOGIE

Annexe I Unité d’Enseignement : PHYSIOLOGIE ET BIOTECHNOLOGIES

ANIMALES

Code UE : …………………

ECUE 1 : PHYSIOLOGIE ANIMALE


COURS : 21 H I- LE MILIEU INTERIEUR - Les compartiments liquidiens de l'organisme - Notions d’hématologie (Sang, hématopoïèse et Hémostase) - Equilibre acido-basique - Notion d’homéostasie II- LA REGULATION PHYSIOLOGIQUE A- MECANISMES NERVEUX - Propriétés physiologiques des cellules nerveuses et musculaires : Excitabilité, transport et transduction de signaux - Transmission de l’influx nerveux : transmission synaptique, neuro-médiation et neuro-modulation - Action physiologique du système nerveux autonome,

cas de la médullo -surrénale B- MECANISMES ENDOCRINIENS

- Biosynthèse et sécrétion des hormones

- Mécanismes de l’action hormonale : les hormones comme molécules informatives des systèmes endocrine et paracrine

- Transduction de signaux hormonaux - Régulation hormonale

- Bases de l’exploration endocrinienne

C- L’AXE HYPOTHALAMO-HYPOPHYSAIRE

ENSEIGNEMENTS PRATIQUES ET DIRIGES

Les enseignements pratiques porteront sur l’étude - des potentiels d’action - de la contraction du muscle squelettique et cardiaque - de la contraction du muscle lisse


- de la régulation hormonale - des groupes sanguins et de l’hémostase

Prévoir des expérimentations assistées par ordinateur (EXAO)


Unité d’Enseignement : PHYSIOLOGIE ET BIOTECHNOLOGIES

ANIMALES

Code UE : …………………

ECUE 2 : BIOTECHNOLOGIES ANIMALES


COURS : 21 HEURES I- Notions de Biologie de la reproduction et d’embryologie II- Culture de cellules animales: lignées établies et clones cellulaires, cellules souches III- Hybridation cellulaire IV- Croissance et différenciation in vitro V- Reproduction assistée : insémination artificielle, fécondation in vitro, conservation et transfert d’embryon, clonage. VI- Transgenèse animale TRAVAUX PRATIQUES ET DIRIGES

- Culture cellulaire - Fusion cellulaire - Insémination artificielle - Fécondation in vitro - Transfert et congélation d’embryons - Greffe de moelle osseuse

Visites de laboratoires et de centres spécialisés.


Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (UE) et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE

Génétique moléculaire et Génie génétique

Nombre de crédits : 6 Code UE :

Université : Etablissement : Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention : Biotechnologies Diplôme et Parcours : LA Biotechnologies Parcours Tous les parcours LF Parcours

Semestre S3

1- Objectifs de l’UE (savoirs aptitudes et compétences)

Permettre à l’étudiant de connaître et comprendre les concepts et méthodes théoriques et pratiques en génétique moléculaire et en génie génétique.


concernée) Génétique, Biologie moléculaire

3- Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements

Volume horaire Eléments constitutifs Cours TD TP

Crédits

1- Génétique moléculaire 1H30 0H45 0H30 3 2- Génie génétique 1H30 0H30 0H45 3

Total 3H 1H15 1H15 6 3.2-Activités pratiques (Projets, stages, mémoires…)

Durée Activités pratiques

de l’UE Travaux au laboratoire

Projets Stages Autres

Crédits

4- Contenu (descriptif et plan des cours) 4.1-Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE)

1- Génétique moléculaire : Rappels, Test de complémentation fonctionnelle, Les mutations géniques, Les gènes mutateurs et anti-mutateurs, Les mutations et le code génétique, Mutations et épissage des ARN, Les suppresseurs, Régulation de l’expression des gènes,


génétique inverse. 2- Génie génétique : Les outils du génie génétique (définition et outils de base), les techniques de base en génie génétique (préparation des acides nucléiques, techniques de séparation, clonage moléculaire,…)

4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objectifs des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité)

1- Génétique moléculaire : Test de croissance et de complémentation fonctionnelle, Recherche et sélection de mutants chez les bactéries et/ou les phages, Détection de mutations par des techniques moléculaires 2- Génie Génétique : Purification, séparation et/ou amplification des acides nucléiques, Etablissement de banques d’ADN (digestion, ligation, préparation de plasmides recombinants, transformation, sélection de clones recombinants), Hybridation ADN/ADN, Criblage de banques d’ADN , Analyse et établissement de cartes de restriction

5- Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC, possibilités d’enseignement à distance…)

6- Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthodes d’évaluation et régime des examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux)

Régime mixte : contrôle continu et examens finaux

6.2- Validation de l’UE (préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).

Contrôle continu (30%) Examen final ( 70%) Epreuves Epreuves ECUE

Ecrit TP AutresPondéra

-tion Ecrit TP Autres

Pondéra

-tion

Coef. de l’ECUE


1- Génétique Moléculaire 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 2- Génie Génétique 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3 TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% 6

6

6.3- Validation des stages et des projets


Annexe I

Unité d’Enseignement : GENETIQUE MOLECULAIRE ET GENIE GENETIQUE

Code UE : …………………

ECUE 1: GENETIQUE MOLECULAIRE

Code ECUE :………………

Cours 21 H

I- Rappels sur la nature, structure, organisation et fonctionnement du matériel génétique

II- Test de complémentation fonctionnelle Principe et application in vivo Application in vitro

III- Les mutations géniques Définition Classes de mutation Agents mutagènes et mode d’action Gènes mutateurs et gènes anti-mutateurs

IV- Utilisation des mutations pour la détection du code génétique in vivo V- Mutation agissant sur l’épissage des ARN chez les eucaryotes VI- Les suppresseurs

Définition Classes de suppresseurs et mode d’action

VII- Régulation de l’expression des gènes VIII- Notion de génétique inverse

TRAVAUX PRATIQUES ET DIRIGES

- Test de croissance et de complémentation fonctionnelle - Recherche et sélection de mutants chez les bactéries et/ou les phages - Détection de mutations par des techniques moléculaires


Unité d’Enseignement : GENETIQUE MOLECULAIRE ET GENIE GENETIQUE

Code UE : …………………

ECUE 2: GENIE GENETIQUE

Code ECUE :………………

Cours 21 H I- Les outils du génie génétique

1- Définition du génie génétique 2- Les outils de base du génie génétique

2.1- Les enzymes agissant sur les acides nucléiques 2.1.1- Les enzymes de restriction 2.1.2- Les outils enzymatiques autres que les enzymes de restriction 2.2- Les vecteurs 2.2.1- Généralités 2.2.2- Les plasmides 2.2.3- Les phages 2.2.4- Les cosmides 2.2.5- Les vecteurs eucaryotes 2.2.6- Autres types de vecteurs : BAC, PAC, YAC, … 2.2.7- Les vecteurs navettes 2.2.8- Les vecteurs d’expression

II- Techniques de base en génie génétique 1- Préparation des acides nucléiques

1.1- Extraction et purification 1.2- Estimation des quantités d’ADN 1.3- Conservation de l’ADN

2- Rappel des techniques de séparation des acides nucléiques 2.1- Electrophorèse 2.2- Centrifugation

3- Clonage moléculaire 3.1- Principe et stratégies de clonage moléculaire 3.2- Les banques d’ADN

4- Détection et caractérisation des acides nucléiques 4.1- Hybridation moléculaire 4.2- Séquençage de l’ADN

5- Amplification, modification des acides nucléiques 5.1- Amplification enzymatique de l’ADN 5.2- La mutagenèse

6- Autres techniques 6.1- Cartographie à la nucléase S1 6.2- Polymorphisme de la taille des fragments de restriction (RFLP) 6.3- Amplification aléatoire de l’ADN polymorphe (RAPD)

TRAVAUX PRATIQUES ET DIRIGES - Purification, séparation et/ou amplification des acides nucléiques


- Etablissement de banques d’ADN (digestion, ligation, préparation de plasmides recombinants, transformation, sélection de clones recombinants) - Hybridation ADN/ADN, Criblage de banques d’ADN - Analyse et établissement de cartes de restriction


Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (UE) et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE Physiologie et Biotechnologie Végétales


Université : Etablissement : Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention : Biotechnologies Diplôme et Parcours : L.A. Biotechnologies Parcours: Tous les parcours de la mention LF Parcours

Semestre S4


Permettre à l’étudiant d’acquérir une formation de base sur - les mécanismes fondamentaux régissant la croissance et la différenciation chez les

végétaux vasculaires - la culture in vitro des tissus végétaux et leur utilisation dans les différents domaines

de la production végétale, la micropropagation et l'amélioration des plantes - la modification des génomes par fusion somatique ou par transfert dirigé de gènes

d'intérêt pour des applications en agriculture, agro-alimentaire, pharmacie et environnement


concernée) Biologie végétale, Biologie cellulaire et moléculaire, microbiologie, génétique et biochimie



Crédits

1- Physiologie Végétale 1H30 0H15 1H00 3 2- Biotechnologie Végétale 1H30 0H30 0H45 3





Crédit

Total


4- Contenu (descriptif et plan des cours) 4.1-Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE)

1-Physiologie Végétale: relations hydriques et nutrition minérale; photosynthèse; régulateurs de croissance, dormance et physiologie de la floraison. 2- Biotechnologie végétale: culture de tissus végétaux et de cellules végétales in vitro et micropropagation; modification du génome et amélioration des plantes.


1- Physiologie végétale: Physiologie de la germination ; activités photosynthétique et respiratoire ; dosage de l'azote protéique. 2- Biotechnologie végétale : Confection de milieu de culture et repiquage ; culture de méristème ; haplodiplométhodes; transformations moléculaires et visite de centres spécialisés


- Présentation de documents audiovisuels et EXAO - Ouvrages de référence suggérés : * Physiologie végétale : nutrition et métabolisme, par Paul MAZLIAK, éd . Dunod * L'expérimentation en physiologie végétale, par Roger PRAT , éd . Hermann * La culture in vitro et ses applications horticoles, par R.Augé et al . éd. Lavoisier * Amélioration des plantes et biotechnologies, par Y. Demarly et M.Sibi


Régime mixte : contrôle continu et examens finaux 6.2- Validation de l’UE (préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).

Contrôle continu ( 30 % ) Examen final (70% ) Epreuves Pondératio Epreuves Pondératio

ECUE Ecri

t

Autres TP Ecri

t Oral TP

Coef. de

l’ECUE

Coef de l’UE au sein du Parcour

s 1- Physiologie végétale

5 % 5% 5% 5 0 % 25% 10% 50% 3

2-Biotechno logie végétale

5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

6





UNITE D’ENSEIGNEMENT DE PHYSIOLOGIE ET BIOTECHNOLOGIE VEGETALES

L2/S4

ECUE Physiologie Végétale

Cours (21H) :

1- Relations hydriques et nutrition minérale 2- Photosynthèse et respiration 3- Régulateurs de croissance 4- Dormance 5- Floraison

Travaux pratiques et dirigés (18H):

• Graines et germination • Croissance végétale • Photosynthèse • Respiration • Dosage de l’azote protéique Favoriser l’expérimentation assistée par ordinateur.



UNITE D’ENSEIGNEMENT DE PHYSIOLOGIE ET

BIOTECHNOLOGIE VEGETALES L2/S4

ECUE Biotechnologies végétales

Cours (21H) :

I- Multiplication végétative in vitro :

1- Technologie de la culture in vitro 2- Micropropagation : culture des méristèmes et

assainissement, culture de bourgeons, organogenèse adventive et régénération

3- Embryogenèse somatique et semences artificielles 4- Culture de cellules isolées

II- Modification du génome et amélioration des plantes :

1- Variabilité somaclonale et sélection in vitro 2- Haplodiploïdisation : androgenèse et gynogenèse 3- Hybridations interspécifiques et sauvetage d’embryons 4- Culture et fusion des protoplastes 5- Génie génétique et transformation des végétaux : plantes

transgéniques


• Culture in vitro de méristèmes • Androgenèse • Culture de protoplastes • Transformation génétique

Favoriser les visites de laboratoires et de centres spécialisés.


BIOETIQUE ET BIOSECURITE

Objectifs : Sensibiliser les étudiants aux problèmes liés aux développements des technologies en Sciences du Vivant et leur impact sur la santé, la sécurité et l’environnement, en identifiant les approches d’évaluation de risque et en présentant les normes et les législations ainsi que les questions éthiques.

Plan du cours

Introduction

I- Risques Biologiques et Biotechnologiques - Microorganismes pathogènes et armes biologiques - Substances toxiques et cancérigènes - Organismes génétiquement modifiés II- Concept de biosécurité - Principe de précaution - Méthodes d’évaluation de risque - Normes de sécurité

III- Problèmes éthiques et avancées technologiques - Expérimentation animale - Essais cliniques - Reproduction médicalement assistée - Clonage thérapeutique et reproductif - Génétique prédictive - Thérapie génique - Don d’organes IV- Législation en Tunisie et conventions internationales




Intitulé de l’UE

BIOCHIMIE METABOLQUE & MICROBIOLOGIE INDUSTRIELLE Nombre de crédits…6…… Code UE………………………….


Domaine de la formation : Sciences et Technologie Mention :…Biotechnologies…………………………. Diplôme et Parcours LA…Biotechnologies. Parcours : tous les parcours de la mention LF………………………………………………………..Parcours :……………………………

Semestre …S4 …………. …………………..

1- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences) 1- Biochimie métabolique : Permettre à l’étudiant d’acquérir des connaissances sur les principales voies du métabolisme intermédiaire jusqu’au cycle de l’Urée, en faisant ressortir le bilan en ATP. Le métabolisme du glycogène est traité comme modèle de régulation hormonale. 2- Microbiologie industrielle : Présenter à l’étudiant l’intérêt et les sources de micro-organismes industriels, leur multiplication, les méthodes de sélection et d’amélioration ainsi que leurs applications potentielles dans les domaines de la santé, de l’agroalimentaire et de l’environnement. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée) Biochimie structurale - Chimie organique - Biologie cellulaire et génétique - Microbiologie et Biologie moléculaire. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements


1- Biochimie métabolique

1h30 0h30 0H45 3

2- Microbiologie Indus. 1h30 1H15 3 Total 3H 0h30 2H 6

3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires….)




1

1

Total 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE) 1- Biochimie Métabolique : Métabolisme des glucides, des lipides, des acides aminés, bilan énergétique et cycle de l’urée. 2- Microbiologie Industrielle Les microorganismes industriels , Les voies métaboliques et leur régulation , Production des métabolites, Technologie de la fermentation 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité) Biochimie métabolique Microbiologie industrielle: les TP intégrés doivent permettre la mise en évidence de certaines étapes des voies métaboliques étudiées chez des microorganismes industriels 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte :

- Contrôle continu - Examen final

6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).

Contrôle continu Examen final EPREUVES EPREUVES ECUE

Ecrit Oral TP et Autres


Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE


parcours

1-Biochimie métabolique 5 % 5% 5% 50 % 25% 10% 50%

3 2-Microbiologie industrielle 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

6

6.3- Validation des stages et des projets…. Stage en entreprise ou visites d’entreprises……………… …………………………………………………………………………………………………………


……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………


Annexe 1 Unité d’Enseignement…Biochimie Métabolique et Microbiologie Industrielle


ECUE n° 1…Biochimie Métabolique Code ECUE :……………

Plan du Cours

21 h

A- Métabolisme des Glucides 1- Catabolisme du glucose - Formation du Glu- 6- Phosphate (digestion, voie des pentoses phosphates,

glycogénolyse) -la glycolyse (voie d’Embden- Meyerrhoff-Parnas) -décarboxylation oxydative du pyruvate -bilan en NADH de la glycolyse (aérobie et anaérobie)

2 – Cycle tricarboxylique - Entrée du pyruvate dans le cycle de l’acide citrique - différentes étapes enzymatiques du cycle - bilan du cycle de Krebs : énergétique, pouvoir réducteur, métabolites intermédiaires - cycle de Krebs carrefour du métabolisme cellulaire 3- Cycle glyoxylique, néoglucogenèse 4- Métabolisme du glycogène et sa régulation B – Métabolisme des lipides

1- Voies de dégradation des lipides et bilan énergétique

2- Voies de Biosynthèse des lipides

C- Cycle de l’Urée 1- Phases mitochondriale et cytosolique 2- bilan du cycle

D- Métabolisme des acides aminés 1- voie de Biosynthèse des A.A 2- voie de Dégradation des A.A

TP/TD 18h

- Illustrations de certaines réactions des voies métaboliques étudiées et dosages de métabolites intermédiaires ( cholestérol, Glu-6-P, transamination etc.)



ECUE n° 2… MICROBIOLOGIE INDUSTRIELLE

Code ECUE :…………… Cours (21H) I) Les microorganismes industriels II) Les voies métaboliques et leur régulation

1) Cas de métabolites I aires (acides organiques, acides aminés, enzymes)

2) Cas de métabolites II aires (Antibiotiques, polysaccharides, biosurfactants…)

III) Amélioration de la production des métabolites :

1) Par voie génétique : amélioration des souches

2) Par voie fermentaire en régulant les différents paramètres de culture (pH,

température, aération, conduite etc…)

IV) Technologie de fermentation :

1) Introduction

2) Cinétique de croissance microbienne

3) Les modes de conduites de fermentation (Fermentation en batch, en fed batch et en

continu).

4) Bilan des fermentations (Rendement, productivité, taux de croissance, coefficient de

transfert d’oxygène etc.)

5) Opérations en aval des fermentations et récupération des métabolites (extraction,

purification et concentration).

Travaux pratiques (18H) 1) Présentation du fermenteur, préparation et stérilisation


Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (UE) des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE Opérations Unitaires et Immunotechnologie


Université : Etablissement : Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention : Biotechnologies Diplôme et Parcours : L.A. Biotechnologies Parcours: Tous les parcours de la mention LF Parcours

Semestre S4


Permettre à l’étudiant d’acquérir une formation sur - les opérations unitaires d’un procédé de fabrication chimique/biologique allant de la matière première au conditionnement du produit fini : préparation, conditionnement et acheminement des matières premières, transformation des réactifs en produits, séparation, purification et conditionnement des produits - les techniques immunologiques utilisées dans un but de diagnostic d’analyse, de production, de prévention et de traitement: Ces techniques sont basées sur l’application de connaissances immunologiques fondamentales que l’étudiant devra maîtriser


concernée) Chimie, Génie des procédés, Biologie cellulaire et moléculaire, Microbiologie, Génétique et Biochimie, Génie génétique.



Crédits

1- Opérations unitaires 1H30 0H45 0H30 3 2- Immunologie et Immunotechnologies 1H30 0H45 0H30 3





Crédit


Total 4- Contenu (descriptif et plan des cours) 4.1-Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE)

1- Opérations unitaires. Distillation, Séchage, Lyophilisation, Filtration, Décantation, Froid industriel…. 2- Immunologie et immunotechnologie : Les fonctions du système immunitaire, les cellules et les organes de l’immunité, les réponses immunes innée et adaptative, la réaction antigène anticorps, les techniques immunochimiques et cellulaires.


1-Opérations unitaires : Distillation eau/éthanol, Microfiltration et Ultrafiltration, Centrifugation et décantation, Cinétique de séchage. 2- Immunologie et immunotechnologie Purification d’Immunoglobulines et d’anticorps par chromatographie, ELISA, Immuno-empreinte, Immunohistochimie, Immunofluorescence, préparation d’anticorps monoclonaux


- Présentation de documents audiovisuels et EXAO, visites d’usines et de laboratoires


Régime mixte : contrôle continu et examens finaux 6.2- Validation de l’UE (préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).

Contrôle continu ( 30 % ) Examen final (70% ) Epreuves Pondératio Epreuves Pondératio

ECUE Ecrit Autres TP Ecrit Oral TP

Coef. de l’ECUE

Coef de l’UE au sein du

Parcours

1- Opérations unitaires

5 % 5% 5% 50 % 25% 10% 50% 3 6


2-Immunologi

e immunotech

no-logie

5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3




UNITE D’ ENSEIGNEMENT

OPERATION UNITAIRE ET IMMUNOTECHNOLOGIE L2/S4

ECUE Opérations Unitaires

OBJECTIFS: Donner des connaissances permettant le dimensionnement des appareils industriels mettant en oeuvre: la distillation, la concentration, la filtration, le séchage….

Cours (21H) :

1. Introduction aux opérations unitaires du génie des procédés 2. Etude de la distillation.

- Principe de la distillation. - Unité de séparation FLASH - Distillation simple en fonctionnement continu , en Batch , Distillation Fractionnée - Mac Cabe et Thiele , Détermination du N.E.T. Méthode de Ponchon et Savarit - Distillation azéotropique

3. Lyophilisation -Principaux paramètres du cycle de lyophilisation - Automatisation d’un proédé de lyophilisation - Lecture de graphiques de lyophilisation et interprétation - Méthode pour l’établissement d’une recette de lyophilisation - Problèmes particuliers de la lyophilisation: études de cas - Les appareils industriels -Systèmes de chargement et de déchargement des lyophilisateurs industriels

4. Séchage - Théorie du séchage: Terminologie du séchage; Mécanismes intervenant au cours du séchage (transferts de chaleur, courbe de séchage et modélisation); Principe de calcul des sécheurs - Description et dimensionnement des sécheurs de solides poreux ou divisés :Séchage à pression atmosphérique, Séchage sous vide partiel, Séchage à la vapeur d’eau

5. Filtration et séparation sur membrane - Les lois de l’écoulement en milieu poreux - Filtration sur support - Microfiltration tangentielle - Ultrafiltration

6. Décantation statique et centrifuge -Décantation sous l’action de la pesanteur - Décantation centrifuge - Essorage centrifuge en continu et par établissement de cycles

7. Le froid industriel



Distillation eau/Ethanol Centrifugation et Taux de décantation Cinétique d’un séchage d’un solide Microfiltration et Ultrafiltration



UNITE D’ENSEIGNEMENT OPERATION UNITAIRE ET IMMUNOTECHNOLOGIE

L2/S4 ECUE Immunologie et Immunotechnologie

Cours (21H) :

L’utilisation des propriétés des réponses immunes, des anticorps et des techniques immunologiques dans divers domaines de recherche, de contrôle, d’analyse biomédicale et de production doit apparaître à travers les exemples et les applications

Introduction à l’immunologie 1H - Notion d’antigène - Rôles et propriétés du système immunitaire Les organes et les cellules de l’immunité 7H - Les organes lymphoïdes : localisation, structure et fonction - Les différentes cellules immunitaires : morphologie, fonction, marqueurs

de différenciation - La circulation des cellules de l’immunité L’immunité innée 2H - Les barrières naturelles - La réaction inflammatoire L’immunité adaptative 7H - Propriétés : notion de spécificité, diversité et mémoire, application à la

vaccination et la sérothérapie - Les étapes de la réponse : activation, prolifération, différenciation - L’étape effectrice Les anticorps monoclonaux et recombinants 4H - Principe d’obtention - Banques combinatoires d’anticorps et banques de peptides - Application


- Structure et diversité des anticorps : purification des Ig et d’anticorps par chromatographie

- La réaction antigène anticorps et techniques d’étude • Notion d’affinité, d’avidité, de spécificité • La précipitation Ag/AC


• ELISA et Immunoempreinte - Immunohistochimie, Immunofluorescence, Cytométrie de flux - Préparation d’anticorps monoclonaux


Programmes et Contenus du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur de la

santé (ex: Médicale) (S5)


Programmes du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur de la santé

Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé (ex: B.Médicale))

Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé) - Semestre 5


°

Unité d'enseignement Nature

de l'UE Elément constitutif

d'UE (ECUE) Cours TD TP Cours

Intégré ECUE UE ECUE UE Contrôle continu

Régime mixte

Langue et communication

2 2 X

Culture de l’Entreprise (Création des entreprises)

1H30 2 X 1

Langue et communication Culture de l’Entreprise Bioinformatique

UT

Bioinformatique 2 2

6

X Génomique et transcriptome

1H30 1H30 0H45 3 X 2 Biotechnologie des

Macromolécules UF Protéomique 1H30 1H30 0H45 3

6

X Cultures cellulaires et tissulaires

1H30 1H15 3 X 3

Biotechnologie cellulaire et applications

UF Technologies cellulaires 1H30 1H15 3

6

X

Identification et typages des bactéries et des virus

1H30 1H15 3 X

3

Biotechnologie des Microorganismes appliquée au secteur Médical

UF Identification et typage des parasites et mycologie

1H30 1H15 3 6

X

Pharmacologie moléculaire

1H30 0H30 0H45 3 X 5 UE optionnelle 5 UO

Toxicologie moléculaire 1H30 0H30 0H45 3 6

X


Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie appliquée

au secteur de la santé (ex: B.Médicale)) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies

Licence Appliquée en Biotechnologies (Biotechnologie appliquée au secteur de la santé) – Semestre 6



Elément constitutif d'UE (ECUE) Cour

s TD TP Cour

s intég

ré

ECUE (le cas

échéantUE

ECUE (le cas échéan

t

UE Contrôle continu

Régime mixte



Contenus des programmes du Parcours Biotechnologie appliquée au secteur de la santé


Intitulé de l’UE

Biotechnologie Cellulaire et Applications Nombre de crédits…6…… Code UE………………………….

Université :…Monastir …………..…………………. Etablissement :…ISBM………….……………..

Domaine de la formation : Sciences et Technologie Mention :.Licence appliquée en Biotechnologie. Diplôme et Parcours LA…Biotechnologie Parcours : Biotechnologie Appliquée au Secteur Médical LF………………………………………………………..Parcours :……………………………

Semestre …S5 …(L3)………. …………………..

1- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences) Acquérir les notions de bases de la culture cellulaire et tissulaire. Maîtriser les techniques liées à la culture cellulaire appliquées au secteur médical. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée) -Biochimie - Biologie Cellulaire et moléculaire- Immunologie- Microbiologie- physiologie. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements


1- Cultures cellulaires et tissulaires

1h30

1H15

3

2- Technologie Cellulaire

1h30

1H15

3

Total 3H 2H30 6 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires….)



1 1

Total


4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE) 1- Culture Cellulaire et tissulaire : les différents types de culture. Techniques de culture. Cellules souches et culture en bio-réacteur. 2- Technologie cellulaire : diversité cellulaire et tissulaire. Observations, identification, analyses et applications dans le secteur médical. 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité) 1- Culture cellulaire et tissulaire: les TP doivent permettre aux étudiants de se familiariser avec les techniques d’expérimentale de la culture cellulaire et tissulaire. 2-Technologie Cellulaire 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte :

- Contrôle continu - Examen final de l’UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées)





Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE


parcours 1- Culture

cellulaire et Tissulaire

5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3

2- Technologie cellulaire

5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3

TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% 6

6



Annexe 1 Unité d’Enseignement : Biotechnologie Cellulaire et applications


ECUE n° 1 : Cultures cellulaires et tissulaires Code ECUE :……………

Plan du Cours : 21 h

1- Introduction à la culture cellulaire 2- les différents types de cultures cellulaires :

- les cellules primaires - les lignées cellulaires

3- les besoins nutritifs : milieux de culture et additifs 4- le système de banques de cellules 5- Les techniques de culture des cellules - Congélation/décongélation - Détachement des cellules - Repiquage ou passage - Comptage des cellules, tests de prolifération et de viabilité 6- les cellules souches et différentiation cellulaire 7- techniques d’études d’adhésion cellulaire 8- La culture en bio réacteur (homogènes /hétérogènes) TP : - observations microscopiques ( cellules et tissus) - cultures cellulaires

Annexe 2

Unité d’Enseignement : Biotechnologie Cellulaire et applications


ECUE n° 2… Technologies cellulaires Code ECUE :……………


1- Diversité tissulaire et cellulaire 2- Méthodologies :

- techniques histologiques - Techniques cytogénétiques - Techniques immunohistochimiques


- Techniques électrophysiologiques - Techniques de conservation des cellules souches et des semences

3 – Applications biotechnologiques (fécondation in vitro, reproduction in vitro, greffe, clonage…) TP : - réalisation et interprétation d’un caryotype - test immunocytochimique




Intitulé de l’UE

Pharmacologie -Toxicologie Nombre de crédits…6…… Code UE………………………….



Semestre …S5 …(L3)………. …………………..

1- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences) Acquérir les notions de bases de la pharmacologie et de toxicologie et comprendre les mécanismes gérant l’action des molécules a intérêt thérapeutique où à effets toxiques sur l’organisme humain et inversement. Acquérir le savoir faire pour identifier, doser et tester ces molécules. Avoir des connaissances sur les stratégies du développement d’un médicament et les outils biotechnologiques utilisés. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée) Chimie organique -Biochimie - Biologie Cellulaire et moléculaire- Immunologie- Physiologie animale. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements


1- Pharmacologie 1h30 0h30 0H45 3 2- Toxicologie 1h30 0h30 0H45 3

Total 3H 1H 1H30 6 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires….)



1

1

Total


4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE) 1- Pharmacologie : Acquérir les notions de bases de la pharmacologie et comprendre les mécanismes gérant l’action de molécules a intérêt thérapeutique sur l’organisme humain. Acquérir des connaissances sur les stratégies du développement d’un médicament et les outils technologiques utilisés. 2- Toxicologie 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité) 1- Pharmacologie: les TP doivent permettre aux étudiants de se familiariser avec les techniques d’expérimentation pharmacologique sur l’animal. 2-Toxicologie : 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte :

- Contrôle continu 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).




Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE


parcours 1- Pharmaco 40 % 5 % 5 % 50% 3 2- Toxico 40 % 5 % 5 % 50% 3 TOTAL 80 % 10% 10% 100 % 6

6



Annexe 1

Unité d’Enseignement : Pharmacologie - Toxicologie

Code UE :…………… ECUE n° 1…Pharmacologie



Chapitre I : Pharmacologie Générale et stratégie du développement d’un Médicament

(3h)

I- La Pharmacocinétique

II- La Pharmacodynamie

III- Phase de découverte de la molécule active (étude clinique)

Chapitre II : Les Tests d’activités (5h)

I- Les tests d’activités Analgésique

II- Les tests d’activités parasympatholytique

III- Les tests d’activités spasmolytique

IV- Les tests d’activités Anti-inflammatoire

V- Les tests d’activités diurétique

VI- Les tests d’activités Anti-infectieux (antibiotique, antivirale, antifongique)

Chapitre III : Les outils technologiques pour l’identification des molécules à intérêt

thérapeutique (6h)

I- Bioinformatique appliquée à la recherche pharmaceutique

II- La chimie combinatoire (Chimie High Tech)

III- Drug Design

IV- Screening et criblage

Chapitre IV : La Pharmacogénétique et la Pharmacogènomique (6h)

I- Introduction et définitions

II- Polymorphismes génétiques et Médicaments

III- right Drug, right person, right time : la pharmacologie moderne

Travaux Pratiques : Pharmacologie * SEANCE I : Etude des analgésiques (Aspirine / agent algogène : acide acétique) et Etude

de l’activité parasympatholytique (Test de salivation)


* SEANCE II : Etude in vitro d’une activité spasmolytique (organe isolé)

* SEANCE III : Etude de la létalité et de la neurotoxicité d’un médicament : Ondansétron

(Zophren®)

Annexe 2

Unité d’Enseignement : Pharmacologie - Toxicologie

Code UE :…………… ECUE n° 1…Toxicologie



Chapitre 1 : Introduction à la Toxicologie (1h)

Objectifs de la Toxicologie moderne, Domaines de la Toxicologie Médicale Définitions (Toxique, toxine, xénobiotique, concept de la dose, relation dose effet) Classes des toxiques (Médicaments, drogues, toxiques alimentaires, toxiques

agroalimentaires, toxines, produits chimiques, produits de combustions).

Chapitre 2 : Métabolisme et Transport des Xénobiotiques (2h)

Les différents enzymes du métabolisme des xénobiotiques Les transporteurs des xénobiotiques Régulation de l’expression de ces enzymes et transporteurs : mécanismes et

conséquences toxicologiques Les radicaux libres et leur importance en toxicologie ; adduits à l’ADN et aux

protéines : signification et conséquences. Les interrelations substrats endogènes substrats exogènes.

Chapitre 3 : Toxicologie d’organes (6h)

Toxicologie vis-à-vis des différents organes : Foie et système digestif, rein, SNC, coeur, muscle, poumon, peau, sang, système reproducteur, fœtus.

Méthodes d’études de la toxicologie (mise en évidence de la toxicité vis-à-vis de ces différents organes avec évaluation du risque) Immuno-toxicologie Toxicité des produits issus des biotechnologies

Chapitre 4 : Toxicologie in vitro (6h) Les méthodes alternatives Modèles cellulaires, méthodes de culture ; différents types de culture, leur

possibilités et leurs limites Les modèles de peau ; corrélation des expériences in vivo et in vitro : le cas de


l’irritation cutanée et oculaire Modèles cellulaires rénaux Modèles cellulaires hépatiques Les modèles cellulaires pulmonaires Modèle de barrière hématoencéphalique Les lignées immortalisées Etude des effets des toxiques sur la morts cellulaires : apoptose, nécrose,

autophagie Chapitre 5 : Génotoxicologie, Cancérogénèse, Mutagénèse (6h)

L’ADN comme cible de toxiques chimiques :

Les lésions et réparation de l’ADN (macrolésions, microlésions : adduits, dépurination, désamination, liaisons croisées, …) La cancérogenèse chimique Bases anatomopathologiques des concepts de bénignité et de malignité

Les tests de génotoxicité et de mutagenèse et l’évaluation du risque mutagène et cancérogène

TP/TD

L’enseignement dirigé comprendra :

- l’analyse de tests et des résultats (exercices) de mise en évidence de la toxicité néphtotoxicité, hépatotoxicité et de la neurotoxicité en exemple

- l’analyse de tests de mutagenèse et de cancérogenèse

L’enseignement pratique comprendra :

- une approche méthodologique de la toxicologie comprenant l’utilisation des modèles cellulaires

- des approches de génomique, de protéomique et de métabonomique - qu’une initiation à la culture cellulaire de lignées tumorales, (cellules Hep G2) - les tests de mise en évidence de mort cellulaires (Fragmnation de l’ADN,

techniques TUNEL, dosage des caspases) et d’atteintes oxydatives (oxydation de l’ADN et lipoperoxydation)




Intitulé de l’UE

Biotechnologie des Macromolécules Nombre de crédits…6…… Code UE………………………….



Semestre …S5 …(L3)………. …………………..

1- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences) - Maîtriser les méthodologies utilisées pour l’analyse des génomes et les perspectives qu’ouvrent ces approches dans divers domaines (gènes marqueurs de maladies). - Identifier les protéines extraites d’une culture cellulaire ou d’un tissu, leur localisation dans les compartiments cellulaires ainsi que leurs modifications post-traductionnelles en fonction du temps, de l’environnement et de l’état pathologique. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée) Biochimie - Biologie Cellulaire et moléculaire. Génie génétique et génétique Moléculaire. Informatique et bioinformatique. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements


1-Génomique/ trascriptome

1h30

0h30

0H45

3

2- Protéomique

1h30

0h30

0H45

3

Total 3H 1H 1H30 6 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires….)




1

1

Total 4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE) 1- Génomique/ Transcriptome : Langage et méthodologies utilisées pour l’analyse des génomes. Analyse des phénomènes transcriptionnels. 2- Protéomique : Technologies liées aux protéines et Ingéniering 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité) 1- Génomique-transcriptome: Organisation des ateliers 2-Protéomique : Organisation des ateliers . 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte :






Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE


parcours 1-Génomique-

Transcriptome

5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3

2- Protéomique

5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3

TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% 6

6

6.3- Validation des stages et des projets....


Annexe 1

Unité d’Enseignement : Biotechnologie des Macromolécules

Code UE :…………… ECUE n° 1…Génomique - transcriptome



1- Bases de données en génomique : structure du génome procaryote et eucaryote (1h)

2- Un exemple de stratégie de séquençage de génome (1h) 3- Analyse qualitative et quantitative de l’expression génétique (2h)

- méthode SAGE - méthode puce à ADN

4- Recherche de marqueurs et de gènes candidats dans les génomes (2h) 5- Recherche de marqueurs de prédisposition aux maladies chez l’homme (2h) 6- Analyse des phénomènes transcriptionnels : (12)

- Régulation de la transcription : promoteur, facteurs de transcription - Modification de l’ARN : épissage, RNAediting, stabilité - Méthodes d’études structurale et de quantification : Northern blot, RT-PCR, RACE, extension d’amorce, RNase protection.

7- Brevetabilité des gènes et des génomes (1h)

TP/TD : - Informatique et génomes : bases de données et méthodes d’analyse

- recherche de partenaire en double hybride dans la levure - analyse d’une banque

Annexe 2 Unité d’Enseignement : Biotechnologie des Macromolécules


ECUE n° 1…Protéomique Code ECUE :……………


Plan du Cours : Protéomique

1- Introduction (1h) 2- Différentes approches de la protéomique (4h)

- techniques d’extraction - séparation ( chromato, HPLC..) - Séparation par Electrophorèse 2D :


*Isoelectrofocalisation (IEF) *Immobilized pH gradient (IPG) *2ème SDS –PAGE *Révélation des protéines et de leurs modifications Post-

traductionnelles 3- Identification des protéines (3h)

- Identification par Spectrométrie de masse (SM) - Recherche des protéines d’intérêt par analyse d’image

4- Séquençage (3h) - Composition en acides aminés, dégradation d’Edman - Coupures chimiques et enzymatiques des protéines - Consultation des bases de données

5 – Méthodes d’analyse des protéines (8h) - Expression des protéines en systèmes cellulaires : Production des protéines recombinantes (Culture des cellules, Western Blot) - Peptide à activité biologique - Mutagenèse dirigée - Technique de double hybride - Technique de « phage display » 6- Les enjeux de la protéomique (2h) - Recherche de biomarqueurs - Outils thérapeutiques




Intitulé de l’UE

Biotechnologies des Microorganismes appliquées au Secteur Médical Nombre de crédits…6…… Code UE………………………….


Domaine de la formation : Sciences et Technologie Mention : Licence appliquée en Biotechnologie. Diplôme et Parcours LA…Biotechnologie Parcours : Biotechnologie Appliquée au Secteur Médical LF………………………………………………………..Parcours :……………………………

Semestre …S5 …(L3)………. …………………..

1- Objectifs de l’UE (savoirs, aptitudes et compétences) Maîtriser les technologies d’identification et de typage des Bactéries, virus et des parasites impliquées dans les maladies microbiennes en utilisant des méthodes biochimiques, microbiologiques, immunologiques et de biologie et de génétique moléculaire. 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée) Microbiologie - Immunologie -Biochimie - Biologie Cellulaire et moléculaire- Génétique- Physiologie. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements


1-Bactéries et Virus

1h30

1H15

3

2- Parasites et mycoses

1h30

1H15

3

Total 3H 2H30 6 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires….)



1

1 Total


4- Contenu (descriptifs et plans des cours) 4.1- Enseignements (Présenter une description succincte des programmes de chaque ECUE et joindre le programme détaillé à la fiche descriptive de l’UE) Bactéries et virus: Etudier les agents infectieux et les caractériser en utilisant des approches biochimiques, génétiques et moléculaires. Utiliser les outils de biologie moléculaire pour identifier les agents infectieux 2- Parasites : Le cours sera axé sur le diagnostic moléculaire et le typage des parasitoses

humaines les plus répandues en Tunisie et qui ont une répercussion directe sur la santé

publique.

4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité) 1- Bactéries et Virus: les TP doivent permettre aux étudiants de se familiariser avec les techniques d’analyse et de contrôle des virus et des bactéries. 2-Parasites et mycoses: les TP doivent permettre aux étudiants de se familiariser avec les techniques d’analyse et de contrôle des parasites. 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte :






Autres

Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE


parcours 1- Bactéries

/Virus 5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3

2- Parasites/mycoses

5% 5% 5% 50% 25% 10% - 50% 3

TOTAL 10% 10% 10% 50% 20% 6

6




Annexe 1 Unité d’Enseignement :

Biotechnologies des Microorganismes appliquées au Secteur Médical Code UE :……………

ECUE n° 1…Bactéries et Virus Code ECUE :……………


Unité d’enseignement « Identification et typages des bactéries et des virus »

I - Bactériologie Moléculaire

1. Diversité et virulence des bactéries pathogènes : - Les entérobactéries - Les cocci Gram-positif - Les cocci Gram-négatif - Les anaérobies stricts - Les bactéries intracellulaires - Les bactéries particulières (mycobactérium,….)

2. Identification moléculaire - Apport des différentes techniques moléculaires : RFLP-PCR, REP,

séquençages… - Exploitation du diagnostic moléculaire dans l’épidémiologie

bactérienne

II- Virologie Moléculaire

1. Mécanismes généraux de l’infection virale - dans la cellule - dans l’organisme

2. Récepteurs moléculaires des virus : exemples 3. Techniques classiques d’études des virus

- Conditions de prélèvement, de culture et de conservation des virus - Techniques classiques de diagnostic virologique directes (microscopiques) et

indirectes (sérologiques) 4. Techniques moléculaires d’identification des virus

- Apport de la biologie moléculaire - Techniques d’hybridation moléculaire - Différents types de PCR - Génotypages : HIV, hépatites B, C…..

5- Exploitation du diagnostic viral dans l’épidémiologie et la lutte anti-virale - Etudes de quelques cas ( HIV, hépatites, grippe, grippe aviaire….) TP :

- techniques immunosérologiques : ELISA, hémaaglutination, immunoempreinte

- PCR


Annexe 2

Unité d’Enseignement : Biotechnologies des Microorganismes appliquées au Secteur Médical


ECUE n° 1…Les Parasites et les mycoses Code ECUE :……………


Chapitre I : Notions de base en Parasitologie

- Définitions (différents types de parasitisme, spécificité parasitaire)

- Notion de cycle de vie

- Prophylaxie

Chapitre II : Les différents types de parasitoses en Tunisie

Systématique, épidémiologie et cycles évolutifs de :

- les unicellulaires : taxoplasmose et leischmania…..

- les plathelminthes (douves et ténias….)

- les nématodes (ascaris…)

- autres parasites (acariens ….)

Chapitre III : Les Outils de diagnostic des parasites

- Techniques de diagnostic classique (directes et indirectes)

- Techniques de diagnostic moléculaire : Applications à des

parasitoses précises

* apport des technologies moléculaires

* Polymorphisme des parasitoses

- Apport du typage dans une étude éco-épidémiologique

Chapitre IV : Moyens de prévention et luttes

CHAPITRE V : LES MYCOSES

Les aspergilloses


Définition, agents pathogènes, répartition géographique, pouvoir pathogène, facteurs

favorisant l'infestation, mode de contamination, clinique.

Les candidoses

Epidémiologie (Agent pathogène: morphologie et écologie, facteurs de risque), Clinique,

prophylaxie.

TP : Enseignements pratiques

Les travaux pratiques seront une application directe des notions étudiées en cours.

1- Identification directe et indirecte de quelques parasites (morphologie,

immunosérologie, immunoempreinte) et des vecteurs (moustiques, anophèles,

phlébotomes, limnées, tiques….)

2- Identification moléculaire d’un parasite au choix :

- Extraction d’ADN

- Réaction de PCR permettant le diagnostic moléculaire ou le typage génétique du

parasite.

- Analyse, interprétation et discussion des résultats

3- Observation et identification les différentes formes parasitaires et fongiques (œuf, larve,

adulte/conidie) de chaque embranchement.


Contenus des programmes du Parcours : Contrôle et Exploitation des Microorganismes

(S5)


Programmes du Parcours : Contrôle et Exploitation des Microorganismes Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Contrôle et Exploitation

des Microorganismes) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies

Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle et Exploitation des Microorganismes) - Semestre 5 Volume horaire semestriel

(14 semaines) Crédits Coefficients Régime d'examen N°

Unité d'enseignement

Nature de l'UE







Bioinformatique

UT

Bioinformatique 2 2

6

X Microorganismes pathogènes et maladies émergentes

1H30 0H30 0H45 3 X 2

Microorganismes d’intérêt médical et

pharmaceutique UF Microorganismes

producteurs de molécules d’intérêt

1H30 0H30 0H45 3

6

X

Identification et contrôle de microorganismes pathogènes en Agroalimentaire

1H30 0H30 0H45 3 X 3

Microorganismes spécifiques à l’Industrie

Agroalimentaire

UF Exploitation et Production de Microorganismes utiles en Agroalimentaire

1H30 0H30 0H45 3

6

X

Fermentation microbienne : Technologie et formulation des produits finis

1H30 0H30 0H45 3 X

4 Microorganismes en

Industrie, Agronomie et

Environnement

UF Microbiologie de l’Environnement et Microorganismes d’intérêt agricole

1H30 0H30 0H45 3

6

X


6

X


Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie appliquée

au secteur de la santé (ex: B.Médicale)) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies

Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle et Exploitation des Microorganismes) - Semestre 6



Elément constitutif d'UE (ECUE) Cour

s TD TP Cour

s intég

ré

ECUE (le cas

échéantUE

ECUE (le cas échéan

t

UE Contrôle continu

Régime mixte



Contenus des programmes du Parcours : Contrôle et Exploitation des Microorganismes

UE1 : Microorganismes d’Intérêt Médical et Pharmaceutique

ECUE 1. Microorganismes pathogènes et maladies émergentes. I- Introduction

1. Notions d’agents infectieux et de pouvoir pathogène 2. Barrières naturelles et défenses induites de l’organisme hôte

II- Flore microbienne normale

1. Relation entre la flore normale et l’hôte 2. Microorganismes opportunistes 3. Coopération entre les microorganismes

III- Différents types d’agents pathogènes

1. Bactéries pathogènes 2. Champignons pathogènes 3. Parasites 4. Virus 5. Agents transmissibles non conventionnels ou Prions

IV- Mécanismes de pathogénicité microbienne

1. Pénétration des agents microbiens dans l’organisme hôte : différentes portes d’entrée 2. Processus d’invasion et différents modes de transmission 3. Mise en échec des défenses de l’hôte

V- Vecteurs et maladies vectorielles VI- Emergences et ré-émergences de maladies infectieuses

1. Facteurs de risque d’origine anthropique 2. Facteurs de risque naturels 3. Classification des émergences et ré-émergences

VII- Perspectives de lutte (surveillance épidémiologique, coopération internationale, réponse adaptée par vaccins et antiviraux) TP / TD : Manip I. Rappels microbiologiques : Milieux de culture – techniques d’ensemencement – colorations simples et différentielles Manip II. Principes et méthodes du diagnostic microbiologiques Manip III. Mise en évidence des germes de l’aire et de la flore cutanée. Etude de l’efficacité des désinfectants et antiseptiques. Manip. IV. Examen cytobactériologique des urines (ECBU). Séances V et VI : Microorganismes vectoriels et maladies émergentes: Travaux de recherches effectués par les étudiants et exposés.


ECUE 2. Microorganismes Producteurs de Molécules d’Intérêt.

Introduction

1. Rappel : Présentation générale des bactéries - Principales morphologies bactériennes – Principaux métabolismes bactériens - Différentes utilisations des bactéries.

2. Définition de l’industrie de la fermentation. I . Les Molécules d’Intérêt :

1. Microorganismes en industrie : Types de microorganismes en industrie - Caractéristiques d’un microorganisme industriel - Types de produits industriels -Systèmes de culture (système de culture fermé ; système de culture ouvert).

2. Production d’enzymes : Enzymes commerciales - Conversion des stérols. 3. Production de métabolites primaires : Acides aminés - Acides organiques - Alcools

et solvants - Lipides – Polysaccharides - Vitamines et additifs alimentaires. 4. Production de métabolites secondaires : Antibiotiques - Produits pharmacologiques

(Alcaloïdes, immunosuppresseurs) – Insecticides – Arômes. 5. Production d’énergie. 6. Produits de microorganismes génétiquement modifiés : Insuline - Hormone de

croissance humaine – Vaccins - Facteurs de croissance II. Exploitation des Toxines des Microorganismes:

1. Les toxines bactériennes : Définitions, classification, structure, pathogénicité, mécanismes d’action, moyens de lutte. Utilisation des toxines bactériennes en médecine (ex: dystonies, botox, vaccins), utilisation des toxines bactériennes en industrie agroalimentaire (ex: insecticides, vaccination des bovins), utilisation des toxines bactériennes pour le bioterrorisme (ex: l’anthrax).

2. Les Phycotoxines : Définition des toxines de microalgues, origine, classification, toxicité, prévention : installation des réseaux de surveillance, intérêt pharmacologique des phycotoxines (ex: dysfonctionnement des cellules nerveuses, analgésie).

3. Les Mycotoxines : Définition et polymorphisme, toxicité, moyens de préventions. Utilisation des champignons microsopiques toxiques dans l’industrie pharmaceutique (la pénicilline).

4. Toxines des microorganismes : Identification et Caractérisation - Purification des toxines, caractérisation physicochimique et biochimique, impact thérapeutique

TP / TD : 1. Différentes techniques utilisées en Microbiologie et Test d’activité antibactérienne sur

boite de pétri utilisant une souche produisant des bactériocines et dirigés contre des bactéries indicatrices.

2. Réalisation d’antibiogramme (méthode de diffusion et méthode de dilution), détermination de la CMI, détermination de la CMB ; test de Got.

3. Mise au point de la production de quelques enzymes (Galerie API). 4. Extraction, Détection et Dosage des Toxines : (Utilisation de l’HPLC et de la CPG). 5. Utilisation des toxines de microorganismes : (Exposés : Utilisation des toxines

bactériennes, des mycotoxines et des phycotoxines). 6. Etude de quelques caractéristiques physicochimiques et biologiques des toxines

protéiques : (Détermination de la masse, de la structure et de la dose létale 50).


UE2 : Microorganismes spécifiques à l’Industrie Agroalimentaire

ECUE 1. Identification et contrôle de microorganismes pathogènes en Agroalimentaire I. Origine et nature de la flore microbienne des aliments

1. Flore issue des animaux et des végétaux 2. Contamination par les manipulateurs 3. Contamination par l'environnement 4. Contaminants industriels

II. Évolution de la flore

1. Types d'évolution 2. Activité des microorganismes

III. Incidences sanitaires de la présence de microorganismes

1. Accidents liés à la prolifération d'une flore peu ou pas pathogène : « intoxication » 2. Maladies liées à la présence de germes pathogènes 3. Intoxinations

IV. Toxi-infection alimentaire collective (T.I.A.C.)

Différentes toxi-infections alimentaires et TIAC : Salmonelles, Staphylocoques, Clostridium perfringens, Clostridium Botulinum (Botulisme), Bacillus cereus, Campylobacter, Escherichia coli, Listeria…

Travaux Pratiques : TP 1- Méthode de routine pour le dénombrement des Microorganismes

Méthode par comptage des colonies à 30°C TP 2- Dénombrement des Pseudomonas spp. Dans les viandes et les produits à base de

viande TP 3- Dénombrement de Staphylococcus aureus dans les aliments

Méthode par comptage des colonies TP 4- Dénombrement de Bacillus cereus dans les aliments

Méthode par comptage des colonies à 30°C.

ECUE 2. Exploitation et Production de Microorganismes utiles en Agroalimentaire.

I- INTRODUCTION

Définition d’un aliment Les micro-organismes dans les aliments Utilisation des micro-organismes en agro-alimentaire


Mécanismes biochimiques des principales fermentations microbiennes

II- Les fermentations lactiques - Les fermentations lactiques thermophiles - Les fermentations lactiques mésophiles - Les fermentations lactiques avec les levures - Les fermentations lactiques thérapeutiques

III- La fermentation alcoolique

- la production du pain - La production des boissons alcoolisées

IV- La fermentation acétique V- La fermentation propionique VI- Les microorganismes producteurs d’acide citrique, d’autres composés organiques et de compléments alimentaires VII- Les microorganismes en tant qu’aliments

TRAVAUX PRATIQUES : TP N°1 : Rappels des différentes techniques microbiologiques acquises TP N° 2 : Etude des ferments lactiques utilisés dans la fabrication du yaourt TP N°3 : Fermentation alcoolique chez la levure de bière : Suivi de la consommation du glucose et de la production de l’éthanol par la levure TP N° 4 : La fermentation acétique TP N°5 : Les ferments propioniques dans la fabrication des fromages


UE3 : Microorganismes en Industrie, Agronomie et Environnement

ECUE 1. Fermentation microbienne : Technologie et formulation des produits finis.

I. Sources des microorganismes industriels 1. Techniques de screening I et II 2. Conservation des cultures 3. Développement des souches

II. Bioénergétique du métabolisme microbien III. Techniques d’immobilisation des microorganismes

1. Principe de l’immobilisation 2. Principales techniques d’immobilisation : Adsorption – Inclusion – Réticulation -

Encapsulation IV. Techniques avancées de fermentation

1. Batch alimenté à volume variable vs Batch alimenté à volume constant 2. CSTR with Recycle (Continous Strirred Tank Reactor) Culture en continue avec

recyclage 3. SBR (Sequenced Batch Reactor) 4. FES (Fermentation à l’état solide) 5. MBR (Bioréacteur à membrane)

V. Design des Bioréacteurs 1. Configuration des Bioréacteurs 2. Caractéristiques des Bioréacteurs 3. Transfert de matière 4. Transfert de chaleur 5. Forces de cisaillement

VI. Régulation et contrôle du fermenteur 1. Les capteurs 2. Les stratégies de contrôle : contrôle en boucle ouverte / contrôle en boucle fermée 3. Automatisation d’une fermentation 4. Modélisation 5. Downstream Processing et formulation de produits 6. Séparation solide liquide 7. Récupération des constituants intracellulaires 8. Concentration des produits biologiques 9. Purification par chromatographie 10. Formulation de produits 11. Commande et contrôle du Downstream processing

VII. Aspects économiques de fermentation 1. Estimation des coûts 2. Design du procédé.

VIII. Etudes de cas d’application 1. Production d'antibiotiques par biotechnologies 2. Production de la levure boulangère 3. Fabrication des yaourts et des laits fermentés 4. Traitements biologiques des eaux résiduaires 5. Biotechnologies dans la métallurgie extractive


ECUE 2. Microbiologie de l’Environnement et Microorganismes d’Intérêt Agricole

Chapitre I. Analyse des microorganismes dans leur environnement

- Rappel : Systématique bactérienne et phylogénie ; Notion d’espèce - Chronomètres moléculaires - L’ARNr 16S comme marqueur moléculaire pour l’analyse des communautés

microbiennes - Microorganismes cultivables et non cultivables - Méthodes d’analyse des communautés microbiennes, culture-indépendantes (ARISA,

DGGE, TGGE, SSCP, librairies 16s, FISH) - Associations microbiennes dans l’environnement - Marqueurs moléculaires, SNPs et typage

Chapitre II. Monitorage des microorganismes dans l’environnement - Biodiversité et fonctions des microorganismes dans des communautés complexes de

l’environnement - Marquage par des isotopes stables, BrdU - Librairies métagénomiques dans des chromosomes artificiels - Génomique et protéomique de microorganismes d’intérêt environnemental - OGM dans l’environnement - Biocapteurs, biosensors et Biorapporteurs microbiens - Application des biorapporteurs Lux pour l’analyse des contaminations chimiques et

la détection des microorganismes dans divers environnements - Micropuces à ADN

Chapitre III. Technologies microbiennes pour la décontamination de l’environnement - Dégradation, minéralisation et métabolisme microbiens des xénobiotiques - Voies cataboliques des pesticides chimiques - Génome de Pseudomonas putida - Ingénieries des protéines via l’évolution accélérée des gènes (DNA shuffling) - Immobilisation et élimination des métaux lourds : l’opéron mer, métallothionéines

eucaryotiques chez Ralstonia eutropha - Résistance aux radiations et bioremédiation, Deinococcus radiodurans et radionucléides - Dégradation des hydrocarbues

Chapitre IV. Microorganismes et fertilité : Interactions plantes-microbes - Rôle des microorganismes dans les cycles biogéochimiques du sol (cycles du carbone,

azote et phosphate) - Fixation de l’azote, ammonification, nitrification, dénitrification et microorganismes

dénitrifiants dans le sol - Associations plantes-microbes, phyllosphère et rhizosphère - PGPR, production d’hormones et solubilisation du phosphate - Bactéries actinorhiziennes et champignons mycorhiziens

Chapitre V. Contrôle (lutte) biologique des ravageurs des plantes - Notion du contrôle biologique microbien : Biocontrôle - Biocontrôle des bactéries et champignons phytopathogènes - Biopesticides : la cholestérol oxydase de Strepromyces - Bacillus thuringiensis : toxines Cry et VIP et autres facteurs de virulence


Contenus des programmes du Parcours : Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires

(S5)


Programmes du Parcours : Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires اد الغذائيةقبة جودة الموامر

Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires)

Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires) - Semestre 5


° Unité








Bioinformatique

UT

Bioinformatique 2 2

6

X

Contrôle biochimique 1H30 0H30 0H45 3 X 2

Contrôle des Aَliments et des

Produits Agroalimentaires

UF Contrôle microbiologique 1H30 0H30 0H45 3

6

X

Technologies du Lait et produits dérivés, des matières grasses et des Boissons

1H30 0H30 0H45 3 X

3 Technologies Agroalimentaires UF

Technologies des Céréales, des Produits Carnés et des Produits de la Me

1H30 0H30 0H45 3

6

X

Applications de Management de Qualité 1H30 0H30 2 X

Rhéologie et Techniques d’analyses sensorielles 1H30 0H30 0H30 2

4 Techniques de

Contrôle de Qualité

UF Techniques de qualité de conservation, d’emballage et de conditionnement

1H30 0H30 0H30 2

6

X

5 UE optionnelle 5 UO OP. 5-1 3 6 X


OP. 5-2 3 X


Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Contrôle de Qualité des

Produits Alimentaires) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies Licence Appliquée en Biotechnologies (Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires) – Semestre 6








Contenus des Programmes du Parcours : Contrôle de Qualité des Produits Alimentaires

UE1 : Contrôle des Aliments et des Produits Agroalimentaires

ECUE 1. Contrôle Biochimique des Aliments I- L’eau et son importance dans la qualité des aliments

1. Propriétés et disponibilité de l’eau dans les aliments 2. Activité de l’eau et modifications des aliments : altérations chimiques et

enzymatiques, développement des microorganismes 3. Normes sanitaires de l’eau alimentaire

II- contrôle des additifs alimentaires

1. Codification des additifs alimentaires et normes 2. Présentation et rôle de quelques additifs naturels et chimiques : les anti-oxydants, les colorants alimentaires, les gélifiants, les conservateurs, les exhausteurs de goûts..

III- Les glucides dans les aliments 1. Source, rôle nutritionnel et importance dans l'alimentation

2. Propriétés de gélification des glycanes 3. Les farines

IV- Les protéines alimentaires

1. Propriétés techno fonctionnelles : Elasticité, Gélification, émulsification..) 2. sources biologiques et contrôle en qualité nutritionnelle Les protéines animales (lait, œufs, viandes) Les protéines végétales (albumines, prolamines, gluthélines et globulines) Nouvelles sources de protéines alimentaires

V- Les lipides alimentaires

1. Propriétés de solidification des lipides 2. Qualité des huiles : sources (végétales, animales, naturelles, industrielles, OGM..)

méthodes d’étude et normes.

ECUE 2. Contrôle Microbiologique des Aliments I- Les flores microbiennes des aliments : évolution et rôles

1- Origine des micro-organismes peuplant les aliments 2- Devenir et rôle des micro-organismes contaminant les aliments

II- Transformations des aliments par les micro-organismes

1- Relations avec le métabolisme microbien 2- Principales altérations alimentaires d’origine microbienne 3- Utilisation des micro-organismes dans la fabrication d’aliments


III- Infections alimentaires d’origine bactérienne

1- Définitions et caractères généraux 2- Micro-organismes responsables de toxi-infections alimentaires

Micro-organismes agissant principalement par leur pouvoir invasif Micro-organismes agissant par la sécrétion d’une entérotoxine Micro-organismes agissant par la sécrétion d’une toxine neurotrope- le botulisme

3- Les éléments du diagnostic d’une toxi-infection alimentaire collective (TIAC) 4- Surveillance des TIAC

IV- Hygiène alimentaire appliquée à la restauration TRAVAUX PRATIQUES TP N°1 : Principes généraux des analyses microbiologiques des produits alimentaires TP N°2 : Méthodes de quantification des populations contaminantes TP N°3 : Etude des flores d’altération de la qualité marchande des aliments : Flore lipolytique, flore caséolytique, flore mésophyle protéolytique, flore psychrotrophe TP N°4 : Etude des flores d’altération de la qualité marchande des aliments (suite) : Flore susceptible de résister aux traitements thermiques et flore fongique.


UE2 : Technologies Agroalimentaires

ECUE 1. Technologies du Lait et produits dérivés, des matières grasses et des Boissons.

Introduction aux technologies alimentaires I. Technologies du lait et produits dérivés :

1. Composition du lait 2. Critères d’appréciation et de qualité 3. Méthodes de conservation 4. La crème et le beurre : dénominations, shama de fabrication, écrémage,

préparation et maturation, barattage, lavage et malaxage, analyse de contrôle de qualité.

5. Les fromages : définition, technologie de fabrication. 6. Lae Yaourt : présentation, fabrication, variétés et spécificités. 7. Autres produits laitiers.

II. Technologies des matières grasses alimentaires

1. Les lipides : définition, sources et rôles dans l’alimentation. 2. propriétés physico-chimiques et notionnelles des matières grasses. 3. Traitement technologiques des matières grasses : préparation des graisses et des huiles, extraction des huiles végétales, traitement et purification, traitements de modification (fractionnement, transestérification, hydrogénation partielle et totale). 4. Méthodes d’évaluation de la consistance des corps gras. 5. Les substituts de matières grasses et apport énergétique réduit 6. Réglementation des corps gras alimentaires.

III. Technologie des boissons à base de fruits :

1. Le jus de fruit : dénominations et composition 2. Opérations de fabrication : cueillette, préparation des fruits, extraction,

décantation et entreposage, tamisage et centrifugation, clarification, pasteurisation, conditionnement.

TP :

1. Technologies du lait et produits dérivés 2. Technologie des boissons à base de fruits 3. Visites d’usine de fabrication

ECUE 2. Technologies des Céréales, des conserves alimentaires, des Produits Carnés et des Produits de la Mer.


I. Technologie des Céréales : 1. Le blé : présentation, composition … 2. La minoterie. 3. La farine du blé : composition et analyse de contrôle de qualité. 4. Etude du comportement des pâtes : analyse avec l’alvéographe de Chopin, tests

de panification. II. Technologies des Conserves alimentaires :

1. Les conserves en Tunisie : diversité, importance, limites et contraintes … 2. Les niveaux de transformation. 3. Les variantes d’appertisation. 4. Exemple de schéma de fabrication des produits appertisés. 5. Opérations unitaires dans la fabrication de produits appertisés 6. Cycles de stérilisation. 7. Aspects nutritionnels et contrôle de qualité des produits appertisés.

III. Technologies des Produits carnés :

1. Composition et structure du muscle 2. Transformation du muscle en viande 3. La qualité de la viande 4. Fabrication des produits de charcuterie 5. Conservation des produits carnés : conservation par le froid, fumaison, salaison.

IV. Technologies des Produits de la mer

1. Principaux produits de la mer et leur production. 2. Composition et valeur nutritive des produits de la mer 3. Evaluation de la qualité des produits de la mer 4. Techniques de conservation des produits de la mer : conservation par le froid,

appertisation, séchage, salage, fumage.

TP : 1. Techniques des conserves alimentaires et contrôle de qualité 2. Visites d’usines et d’institutions de traitement et de fabrication.


UE3 : Techniques de Contrôle de Qualité

ECUE 1. Applications de Management de Qualité 1ere partie : Introduction

• Les raisons de la mise en place des outils d’amélioration de la qualité selon les Référentiels internationaux • Quels et comment utiliser ces outils ? • L’analyse des données • La recherche des solutions et les améliorations enregistrées • Démarche de mise en place d’un procédé d’amélioration • Applications et approche INTERACTIVE

2eme partie : Les Outils de management de Qualité * Outils de mise en place

• Kaizen - les 5 S • Travail en équipe • Brainstorming • Logique « est & n’est pas » • Fiche d’acquisition des données • Histogramme des fréquences • QQOQCP • Logigramme

* Outils de mise en oeuvre • Diagramme de Pareto • Diagramme causes effets - méthode par familles • Diagramme causes effets - méthode par processus • Diagramme multi-criteres • Matrice de pondération • Typoscopie • Arbre de décision

* Outils d’amélioration • Diagramme de dispersion • Diagramme de progrès • Diagramme événementiel • Diagramme de Gantt • Diagramme polaire • Rapport de projet • Graphique

* Les autres outils : AMDEC - Analyse de la valeur - 6 Sigma… 3eme partie : Cas d’application

A. Cas d’application on line sur internet • La reconnaissance internationale • Le processus de certification : démarche et choix des organismes • Le processus d’accréditation : démarche et choix des programmes

B. Choix d’un ou plusieurs référentiels d’application ISO 9001 - ISO 22000/HACCP - ISO 17025

C. Application des outils étudiés dans le cadre des référentiels choisis 4eme partie : Synthèse et évaluation de la formation


ECUE 2. Rhéologie et Techniques d’analyses

sensorielles. Partie 1 : Analyses sensorielles

1. Introduction générale à l’évaluation sensorielle

a. Sens chimique des saveurs et des odeurs b. L’utilisation des sens pour l’évaluation des propriétés organoleptiques

2. Les différents types de tests a. Les tests de différence b. Les tests comparatifs c. Le profil sensoriel

3. Analyse statistiques et interprétation des résultats 4. Mise en place d’une structure d’analyses sensorielles Partie 2 : Rhéologie 1. Notions de contraintes et de déformation - Définitions : contrainte, déformation,

cisaillement 2. Comportements rhéologiques des fluides : Fluides newtonien, thixotropique,

fluide de Herschel-Bulkley, comportement à seuil 3. Les différents types de Rhéomètres 4. Analyse de la texture

ECUE 3. Techniques de Qualité de Conservation, d’Emballage et de Conditionnement

I. La conservation des Aliments II. Les techniques du froid III. Les traitements thermiques IV. Destruction non thermique des microorganismes V. Le blanchiment VI. La Déshydratation des aliments VII. Techniques d’Emballage et de Conditionnement :

1. Les matériaux d’emballage et de conditionnement, structure et propriétés, coût, compatibilité, conditions de stockage, contrôle de qualité.

2. Emballage actif et intelligent 3. Conditionnement : palettisation, manutention, stockage et emballages pleins. 4. Conditionnement des produits alimentaires finis, présentation, influence sur la

qualité, dates de péremption, étiquetage, systèmes biodégradables. 5. Emballage et conditionnement de produits biologiques à usage industriel, le vrac, le

détail, les conditions de stockage. TP. Visite du centre technique d’Emballage et de conditionnement de Tunis


Programmes et Contenus du Parcours : Biotechnologie Végétale


Programmes du Parcours : Biotechnologie Végétale Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie Végétale) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies



° Unité








Bioinformatique

UT

Bioinformatique 2 2

6

X

. Biotechnologie végétale et conservation des phytoressources

1H30 0H30 0H45 3 X

2 Biotechnologie

végétale et Biochimie

UF Biochimie végétale et Valorisation des produits végétaux

1H30 0H30 0H45 3

6

X

Eléments de Génétique quantitative et Sélection classique

1H30 0H30 0H45 3 X 3

Génétique et Amélioration des

Plantes UF

Sélection assistée par les Marqueurs Génétiques 1H30 0H30 0H45 3

6

X

Biotechnologie Moléculaire 1H30 0H30 0H45 2 X

4

Biotechnologies basées sur

l’utilisation de l’ADN

UF Typage et Marqueurs Moléculaires 1H30 0H30 0H45 2

6

X

OP. 5-1 3 X 5 UE optionnelle 5 UO OP. 5-2 3 6 X


Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Biotechnologie Végétale) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies



N Unité d'enseignement Nature

de l'UE

Elément constitutif d'UE (ECUE) Cours TD TP Cours

intégré ECUE UE ECUE UE Contrôle continu

Régime mixte



Contenus du Parcours : Biotechnologie Végétale

UE1 : Biotechnologie végétale et Biochimie

ECUE 1. Biotechnologie végétale et Conservation des phytoressources

I. Biotechnologie, Evaluation et conservation des ressources phytogénétiques

1. Identification variétale par marqueurs 2. Techniques de culture in vitro et conservation des phytoressources 3. Cryoconservation des phytoressources

II. Amélioré ration des plantes industrielles 1. Haplodiploploidisation et applications en amélioration des plantes (blé, colza,

trournesol, pomme de terre… 2. Fusion des protoplastes et applications : sélection des fusions, induction de la

stérilité mâle cytoplasmique, hybridation intra- et interspécifiques, transfert de l’hérédité cytoplasmique.

3. Transgénèse et applications : a. Transfert des gènes de résistances aux facteurs abiotiques (salinité, sécheresse). b. Transfert des gènes de résistances aux facteurs biotiques (virus, champignons). c. Intérêt de la transgénèse en lutte biologique d. Transfert des gènes de résistances aux herbicides et insecticides e. Gènes de maturation des fruits : stratégies anti-sens. f. Transfert des gènes pour l’amélioration de la qualité industrielle des plantes

(huiles, biocarburants, produits cosmétiques…)

ECUE 2. Biochimie végétale et Valorisation des produits végétaux

Objectif L’objectif de la formation est une connaissance précise de molécules végétales d’usage industriel du point de vue de leur structure, de leurs voies de biosynthèse et de dégradation, de leur rôle dans la plante et de leur exploitation industrielle I- LES GLUCIDES UTILISES EN INDUSTRIE

1. La cellulose : Structure, propriétés et voies de biosynthèse 2. L’amidon : composition chimique, propriétés physiques, enzymes de dégradation et de biosynthèse 3. les extraits sucrants

II-LES PROTEINES VEGETALES 1. Généralités 2. Analyse protéomique

3. quelques exemples de protéines végétales d’intérêt : Les protéines de réserve, les protéines membranaires, les protéines de stress.


III- MATIERE GRASSE VEGETALE 1- Présentation générale et rôle physiologique des lipides. 2- Exploitation des propriétés techno-fonctionnelles et nutritionnelles des huiles

végétales IV- LES PIGMENTS VEGETAUX (Présentation de quelques pigments : localisation, structure, rôle physiologique et leur exploitation industrielle)


UE2 : Génétique et Amélioration des Plantes

ECUE 1. Eléments de Génétique quantitative et Sélection classique.

I. Eléments de statistique et de génétique des populations II. Rôle et place de l’amélioration des plantes dans la science, l’économie et l’autosuffisance alimentaire. III. La reproduction chez les plantes : principe et diversité. IV. Polymorphisme, variation génétique et amélioration des plantes V. Méthodes et techniques de l’amélioration des plantes autogames VI. Méthodes et techniques de l’amélioration des plantes allogames. VI. Amélioration des plantes à multiplication végétative. VII. Quelques exemples d’application.

ECUE 2. Sélection assistée par les Marqueurs Génétiques. I. Importance de la sélection végétale - l’amélioration génétique classique - Impact de la Biologie moléculaire sur la création variétale et la qualité, l’amélioration du rendement, la résistance aux maladies et la protection de l’environnement (moins d’intrants en agriculture) II. Sélection assistée par marqueurs moléculaires

1. Conversion assistée par marquage moléculaire : exemple le gène Bt chez le Maïs 2. Utilisation des marqueurs moléculaires pour l’amélioration qualitative du tabac

(faible teneur en nicotine) 3. Marqueurs moléculaires associés aux gènes de résistances aux maladies

III. Marqueurs moléculaires dans des schémas de sélection IV. Cartographie génétique-Liaison génétique

1. Test statistiques pour la liaison : LODscore 2. cartographie des gènes majeurs 3. QTL : variation d’un caractère quantitatif

V. Amélioration à partir de la cartographie de gènes ou QTL

1. Nombre de gènes impliqués dans la variation d’un caractère quantitatif 2. principe de détection de QTL 3. corrélation aux marqueurs moléculaires


UE3 : Biotechnologies basées sur l’utilisation de l’ADN

ECUE 1. Biotechnologie Moléculaire. A- Les techniques de mutagénèse in vivo I. Mutagénèse dirigée in vivo chez les bactéries

1. Par insertion d'un plasmide suicide par simple recombinaison homologue = mutagénèse dirigée insertionnelle 2. Par délétion/remplacement par double recombinaison homologue à l'aide de vecteurs de remplacement (plasmides thermosensibles intégratifs)

3. Applications de la mutagénèse dirigée II. La mutagénèse aléatoire

1. Les éléments génétiques transposables 2. Applications de la mutagénèse transpositionnelle aléatoire – Le "gene tagging"

B. Technologies transgéniques chez les plantes I. Principe de la transgénèse II. Technologies transgéniques chez les plantes – transgénèse du génome nucléaire

1. Nature du transgène 2. Origine du transgène 3. Propriétés du transgène 4. Stratégies de transfert de gènes chez les plantes 5. Les méthodes de transformation 6. Insertion et expression du transgène 7. Problèmes rencontrés 8. Vérification moléculaire de l'intégration du transgène et de son expression

III. Technologies transgéniques chez les plantes – transgénèse du génome chloroplastique 1. Intérêts de la transgénèse chloroplastique 2. Applications de la transformation des chloroplastes 3. Comparaison entre la transformation nucléaire et celle des chloroplastes 4. Limites de la transgénèse chloroplastique

TD : Analyses d'Articles Scientifiques

ECUE 2. Typage et Marqueurs Moléculaires. I. Introduction :

Notion de diversité génétique, marqueurs génétiques, distances génétiques Définition d’un marqueur génétique. Caractéristiques d’un « bon » marqueur génétique Définition d’un marqueur moléculaire Critères de classification : Critère génétique - Critère moléculaire

II. Rappels sur les outils de la biologie moléculaire

Les enzymes : Les polymérases - Les enzymes de restrictions


L’hybridation L’électrophorèse en gel Le séquençage

III. Apports des marqueurs moléculaires

Utilisation pour l’identification individuelle et variétale Etablissement des relations phylogénétiques Utilisation en cartographie moléculaire Utilisation dans le clonage positionnel

IV. Les marqueurs biochimiques

L’électrophorèse unidimensionnelle des isoenzymes Principe et différentes étapes de la technique Systèmes enzymatiques Méthodes d’interprétation du polymorphisme enzymatique Avantages et inconvénients de la technique

L’électrophorèse bidimensionnelle des protéines dénaturées (2-D-SDS-Page) V. Les marqueurs à ADN

Avantages des marqueurs à ADN Le polymorphisme de longueur des fragments de restriction (RFLP) Les marqueurs de type PCR - Principe de la PCR Les techniques de MAAP (Multiple Arbitrarily Amplicon Profiling) Les marqueurs AFLP Les marqueurs ISSR Les marqueurs SSR : les microsatellites La technique DD- RT – PCR

TP et TD Extraction de l’ADN génomique total d’un végétal Spectrophotométrie et électrophorèse sur gel d’agarose Réaction de PCR Lecture des zymogrammes et des profils électrophorétiques Réalisation d’une matrice de données binaires Calculs des fréquences allèliques et des distances génétiques Etablissement des arbres phylogénétiques à partir des distances génétiques


Programmes et Contenus du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur

pharmaceutique


Programmes du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique (S5) Domaine : Sciences et Technologies

Mention : Biotechnologie Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique

L3 (semestre 5)

Unités d’enseignement Elément constitutif (ECUE) C-CI TD TP h/s H/S Coeff Coef,UE Crédits Régime d’examen

Unité d’enseignement transversale continu mixte

Langues (Français, Anglais) 2h 2 2 X Informatique et statistique appliquée 2h 2 2 X

UE 1: Unité transversale d’enseignements Culture de l’Entreprise (Organisation de

l’entreprise) : 1h.30 2 6

2 X

Unités d’enseignement fondamentales

Industries des médicaments (fabrication, production, contrôle) 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h30 3 3 X UE 2 : Industrie

pharmaceutique Maîtrise environnementale des procédés pharmaceutique 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h30 3

6 3 X

Bioressources pharmaceutiques (animales, végétales et microbiennes) 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h30 3 3 X UE 3 :

Biotechnologie pharmaceutique

Médicaments issus de la biotechnologie 1h30 0h30 0h45/Visite 2h45 38h30 3 6

3 X

Techniques d’analyses et détection rapide microbiologiques 1h 1h45 2h45 38h30 3 3 X UE 4 : Techniques

d’analyses Techniques d’analyse et détection rapide

physicochimiques 1h 1h45 2h45 38h30 3 6

3 X

Unités d’enseignement optionnelles spécifiques ( à choisir obligatoirement 6 crédits ) OPT .1 3 3 X U.OP

OPT.2 3 6

3 X


Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique L3 (semestre 6)








Contenus des Programmes du Parcours : Biotechnologie appliquée au secteur pharmaceutique (S5)



Intitulé de l’UE BIOTECHNOLOGIE PHARMACEUTIQUE

Nombre de crédits…………… Code UE……………………….



Mention :…Biotechnologies………………


Semestre S5


Etudier les bioressources microbiennes, végétales et animales dans l’industrie pharmaceutique et médicale. Connaitre les principales biotechnologies (Génie génétique; Génomique et Protéomique) utilisées dans l'industrie pharmaceutique et les différentes catégories de médicaments biotechnologiques commercialisés ou en stade de recherche.


BIORESSOURCES PHARMACEUTIQUES

- Avoir des connaissances dans la diversité du vivant (taxonomie des microbes, des plantes et des animaux.

- Maîtrise de certaines techniques d’analyses physico-chimiques indispensables à l’étude des biopharmaceutiques Médicaments issus de la biotechnologie

- Avoir des pré-requis relatifs au domaine de l'industrie pharmaceutique - Avoir des connaissances des notions de base de Génétique, Biochimie, Microbiologie,

Biologie Moléculaire, Biologie animale et végétale 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements


1-Bioressources pharmaceutiques

21 h 7 h 10 h 30 3

2- Médicaments issus de la biotechnologie

21 h 7 h 10 h 30 3

Total 42 h 14 h 21 h 6


3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires….)



1-Bioressources pharmaceutiques

0h45/S visite

2- Médicaments issus de la biotechnologie

0h45/S visite


1- Bioressources pharmaceutiques

- Introduction à l’industrie pharmaceutique : définition et principales bioressources de cette industrie (végétales, animales et microbiennes).

- Principaux produits pharmaceutiques - Techniques d’analyse et d’étude des bioressources

2- Médicaments issus de la biotechnologie - Présenter aux étudiants un historique sur l'utilisation des biotechnologies dans l'industrie

pharmaceutique - Connaître l'apport des biotechnologies (Biologie moléculaire, Génie génétique,

Génomique, Protéomique…) dans la conception de nouveaux médicaments - Avoir des connaissances sur les principales catégories de médicaments biotechnologiques 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité)

1- Bioressources pharmaceutiques Etude des cas pratiques d’analyse des principes actifs de microorganismes, de plantes et d’animaux utilisés dans la fabrication des médicaments ou dans le diagnostic. 2- Médicaments issus de la biotechnologie Dans le cadre de cette partie d'enseignement, des visites des étudiants à des industries pharmaceutiques ou à des laboratoires de recherche de médicaments biotechnologiques sont prévues. 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) Diaporama PowerPoint illustrant les techniques d’analyses et des échantillons représentatifs des différents groupes 6-Examens et évaluation des connaissances


6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux)

Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l’UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées) 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).




Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE


parcours 1- 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2- 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

6

Total 10% 10% 10% 50% 20% 6 6

6.3- Validation des stages et des projets.... …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………


Annexe 1

Unité d’Enseignement : BIOTECHNOLOGIE PHARMACEUTIQUE


ECUE n° 1 : Bioressources pharmaceutiques


COURS Partie 1. Plantes médicinales et phytothérapie I Histoique II. Définitions -plantes médicinales (qu’est-ce que la phytothérapie) -drogue végétale - médicaments à base de plantes III. Recherche des plantes a intérêt thérapeutique - criblage biologique systématique (screening botanique) - criblage phytochimique - criblage basé sur des sources bibliographiques informatisées IV. Source des plantes médicinales - plante cueillette - plante de culture - plantes cultivée améliorée - plante industrielle (alimentation, diététique, parfums, cosmétique, savons, textiles) V. Méthodologies de récolte du matériel végétal - culture et récolte des plantes médicinales (époque, condition, procédés) - séchage et conservation VI. Les principes actifs des plantes VII. Les méthodes d'extraction VIII. Précautions d’emploi de la phytothérapie IX. Les plantes utiles en phytothérapie -fiche explicative de chaque plante -liste des plantes dangereuses X. Toxicologie et pharmacologie en phytothérapie XI. Application industrielle Partie 2. Bioressources microbiennes I. Les microorganismes à intérêt pharmaceutique I.1. Identification des microorganismes dans la nature : Techniques de screening I.2. Culture des souches I.3. La conservation des microorganismes I.4. Aspects microbiologiques du « scale up » II. Les principaux produits de la microbiologie industrielle II.1. Les antibiotiques II.2. Les enzymes II.3. Les acides aminés II.4. Les acides organiques II.5. Les composés spéciaux pour la médecine et la santé II.6. Les biopolymères


II.7. Les biosurfactants II.8. Les vitamines et les aromes II.9. Les intermédiaires pour la synthèse organique II.10. Les méthodes de bioconversion III. Les applications biotechnologiques des microorganismes III.1. Les biosensors III.2. Les microarrays III.3. Les biopesticides Partie 3. Bioressources animales I. Définitions

- Bioressources pharmaceutiques - Biopharmaceutiques

II. Rappel sur la diversité des animaux III. Bioressources aquatiques IV. Bioressources terrestres V. Techniques d’étude et d’analyse des bioressources

Annexe 2

Unité d’Enseignement : BIOTECHNOLOGIE PHARMACEUTIQUE


ECUE n°2 : Médicaments issus de la biotechnologie


COURS A/ Historique des biotechnologies dans la production pharmaceutique

- Apport des entreprises de biotechnologies aux grands groupes pharmaceutiques

- Etapes de développement d'un médicament biotechnologique

- Coût de développement et de création d'un médicament biotechnologique

B/ Techniques de mise au point de nouveaux médicaments

- La génomique et l’invention des médicaments originaux

- L'apport de la protéomique dans la conception de nouveaux médicaments

- Le génie génétique

- La technique des cellules hybridomes

C/ Principales catégories des médicaments issus des biotechnologies microbienne,

végétale et animale

- Les hormones


- Les cytokines

- Les facteurs de coagulation

- Les anticorps monoclonaux

- Les vaccins à base d'ADN et les vaccins à base de protéines



Intitulé de l’UE

TECHNIQUES D’ANALYSES

Nombre de crédits…………… Code UE………………………….





Semestre S5


Permettre aux étudiants de maîtriser les méthodes et les techniques rapides d’analyses microbiologiques et physico-chimiques.


TAPC, Microbiologie, chimie et physique. 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements


1- Techniques d’analyses et détection rapide microbiologiques

0 h

14h

24h30

3

2- Techniques d’analyses et détection rapide physicochimiques

0 h

14h

24h30

3

Total 0 h 28h 49h 6 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires….)



1- Techniques d’analyses et détection rapide microbiologiques

1h45/s


2- Techniques d’analyses et détection rapide physicochimiques

1h45/s


1- Introduction à la pharmacopée, comptage des germes aérobies totaux, recherche des microorganismes spécifiés, test de stérilité et qualité microbiologique des préparations pharmaceutiques. 2- Méthodes d’extraction, de préparation et de fractionnement, spectroscopiques, chromatographiques, électrophorétiques et isotopiques. 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité)

1- 2- 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) C’est une UE basée sur des TP et donc les manipulation sont très importantes. Plusieurs types de matériels (pour analyses chimiques, HPLC, CPG ; et microbiologiques, Electrophorèse, systèmes de coloration) seront mis à la disposition des étudiants. 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l’UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées) 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).




Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE


parcours 1- 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2- 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

6

Total 10% 10% 10% 50% 20% 6 6

6.3- Validation des stages et des projets.... …………………………………………………………………………………………………………


Annexe 1

Unité d’Enseignement : TECHNIQUES D’ANALYSES


ECUE n° 1 : Techniques d’analyses et détection rapide microbiologiques


COURS I. Introduction à la pharmacopée I.1. But et signification des méthodes de la pharmacopée II.2. Comparaison entre les pharmacopées européennes et l’ USP II. Comptage des germes aérobies totaux (Ph. Eur., 2.6.12) II.1. Description des testes généraux pour la détermination de l’état microbiologique. II.2. principe II.2.1. Echantillonnage II.2.2. Préparation de l’échantillon II.2.3. Inoculation (au choix)

II.3. Les Milieux de culture utilisés

II.4. Evaluation

II.5. Plan de prélèvement

III. Recherche des microorganismes spécifiés (Ph. Eur., 2.6.13) III.1.Tests décrits III.2. Signification des microorganismes spécifiés III.3. Sélection/Confirmation/Identification III.3.1. Principe III.3.2. Micro-organismes spécifiés : milieux sélectifs (Ph.Eur 2.6.13) III.3.3. Micro-organismes spécifiés : milieux indicateurs III.3.4. Limites (Pharmacopoeial Forum) III.3.5. Position Européenne sur les limites microbiennes IV. Test de stérilité (Ph. Eur., 2.6.1.) IV.1. Principe IV.2. Echantillonnage IV.3. Milieux de cultures utilisées IV.4. Evaluation des résultats IV. Qualité microbiologique des préparations pharmaceutiques (Ph. Eur., 5.1.4.) VI. Attributs microbiologiques (Bioburden) VI.1. Signification des résultats pour les PA/excipients VI.2. Résultats hors spécifications pour les PA/excipients.


Annexe 1

Unité d’Enseignement : TECHNIQUES D’ANALYSES


ECUE n°2 : Techniques d’analyses et détection rapide physicochimiques


COURS I- Méthodes d’extraction, de préparation et de fractionnement

1. Prélèvement 2. Conservation (congélation et lyophilisation) 3. Précipitation, dialyse et filtration 4. Centrifugation et ultracentrifugation

II- Méthodes spectroscopiques 1. Spectre de lumière (UV, visible, IR) 2. Colorimétrie et spectrophotométrie 3. Principe de la fluorimétrie

III- Méthodes chromatographiques 1. Principe de la chromatographie 2. Les différents types de chromatographie

IV- Méthodes électrophorétiques 1. Principe de l’électrophorèse 2. Les différents types d’électrophorèse 3. Les différentes méthodes de révélation

V- Méthodes isotopiques 1. Principe de l’utilisation des radio-isotopes 2. Utilisation et mesure de la radioactivité 3. Radio-protection.

Partie 3. Techniques rapides de détection - Séance 1 : Test ELISA :

♦ Technique directe ♦ Technique Indirecte ♦ Technique Sandwich ♦ Technique Compétitive

Manipulation :ELISA Sandwich - Séance 2 : Immunoblot

- Séance3 : Agglutination de particules de latex - Séance4 : Immunofluorescence :

♦ Technique d’inhibition de l’hémagglutination ♦ Technique de fixation du complément ♦ Technique d’hémolyse en gel

- Séance 5 : manipulation :PCR et révélation ♦ TD : Techniques d’hybridation sans amplification ♦ Hybridation par amplification du signal ♦ PCR et variantes

Différents systèmes de révélation



Intitulé de l’UE

INDUSTRIE PHARMACEUTIQUE

Nombre de crédits…………… Code UE………………………….





Semestre S5


Maîtriser les spécificité techniques minimales dans le domaine de l’industrie pharmaceutique et surtout dans le domaine réglementaire et socioéconomique ainsi que la maîtrise des risque des différents procédés utilisés dans ce domaines.


Connaissance des différents procédés en génie des procédés pharmaceutique et les techniques de contrôle qualité 3-Eléments constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements


1- Industries des médicaments

21 h

7 h

10h30

3

2- Maîtrise environnementale des procédés pharmaceutiques

21 h

7 h

10h30

3

Total 42 h 14 h 21 h 6 3.2- Activités pratiques (Projets, satges, mémoires….)



1- Industries des médicaments

0h45/S visite

2- Maîtrise environnementale des procédés pharmaceutiques

0h45/S visite



1- Industrie des médicaments et Fabrication pharmaceutique 2- Les installations classées ,le transport des matières dangereuses et les déchets et les rejets. 4.2- Activités pratiques de l’UE (Présenter une description succincte des objets, des contenus et des procédures d’organisation de chaque activité)

1- Industries des médicaments Réalité de l’industrie pharmaceutique dans le monde et en Tunisie Liste des industries en Tunisie et coordonnées Présentation du cadre réglementaire dans la mise en place d’un nouveau produit pharmaceutique ; nouvelle molécule et générique Préparation d’un dossier d’AMM Exemple pratique du dossier d’AMM Détails pratique et application de formulations pharmaceutique : aperçu pratique

2- Maîtrise environnementale des procédés pharmaceutiques 5 – Méthodes pédagogiques et moyens didactiques spécifiques à l’UE (méthodes et outils pédagogiques, ouvrages de référence, recours aux TIC- possibilités d’enseignement à distance) DATA show et présentation de cas pratiques Guide de l’enregistrement du ministère de la santé publique Guide ICH pour la préparation du dossier CTD 6-Examens et évaluation des connaissances 6.1- Méthode d’évaluation et régime d’examens (Préciser le régime d’évaluation préconisé : contrôle continu uniquement ou régime mixte : contrôle continu et examens finaux) Régime mixte : Contrôle continu et Examen final de l’UE (Epreuve commune entre ECUE ou Epreuves séparées) 6.2- Validation de l’UE (Préciser les poids des épreuves d’examens pour le calcul de la moyenne de l’ECUE, les coefficients des ECUE et le coefficient de l’UE au sein du parcours).




Pondéra -tion

Coef. de l’ECUE


parcours 1- 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3 2- 5% 5% 5% 50% 25% 10% 50% 3

6

Total 10% 10% 10% 50% 20% 6 6

6.3- Validation des stages et des projets.... ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………


Annexe 1

Unité d’Enseignement : INDUSTRIE PHARMACEUTIQUE


ECUE n° 1 : Industries des médicaments


COURS Partie 1. Industrie des médicaments - Evolution de l’industrie pharmaceutique - Brevets - Licences - Nouveaux produits - Etudes précliniques et cliniques - Mise en marché - Administration Partie 2. Fabrication pharmaceutique - Procédés de production - Théories reliées à la fabrication dans l’industrie pharmaceutique - Théories de pré formulation et formulation industrielles - Optimisation et transposition d’échelles - Contrôle qualité en industrie pharmaceutique :

a) contrôle des matières première et produits finis : sources réglementaires : pharmacopées

b) exemples pratiques de contrôle qualité en industrie pharmaceutique

Annexe2

Unité d’Enseignement : INDUSTRIE PHARMACEUTIQUE


ECUE n° 2 : Maîtrise environnementale des procédés pharmaceutiques


COURS I. Les installations classées - Les organismes officiels dans le domaine de l’environnement - Les principaux organismes professionnels - Contexte réglementaire et le régime juridique des installations classées - Les études (d’impact, des déchets, des dangers) - L’enquête publique - Faire évoluer les ICPE (modifications administratives, mise à jour de l’arrêté préfectoral…)


II. Le transport des matières dangereuses - Réglementation - Les bordereaux de suivi des déchets industriels - Le choix du transporteur - L’enlèvement des déchets sur site (circulation, obligations du chauffeur, le véhicule d’enlèvement…) - Le stockage intermédiaire sur plateforme de regroupement III. Les déchets et les rejets - Définitions - L’obligation d’élimination - La notion de responsabilité - Définir et classer les déchets (définition, codification et nomenclature) - Les étapes de la vie d’un déchet - Comment regrouper les déchets - La gestion des déchets dans un laboratoire pharmaceutique - Les procédés des traitements des déchets (identifier et choisir) - Mettre en place des outils de gestion des déchets


Programmes et Contenus du Parcours : Biotechnologie marine et aquaculture


Programmes du Parcours : Biotechnologie marine et aquaculture




Crédits Horaire Régime d’examen UE

Nature de l’UE ECUE ECUE UE Coef C TD TP CI Contrôle


Anglais 2 2 2H X Culture de l’Entreprise (Création d’entreprises) 2 2 1H30 X Unité

Transversale UT Biostatistiques 2

6 2 2H X

Milieu de culture 2 2 0H30 0H45 0H45 X Alimentation en Aquaculture 2 2 0H30 0H45 0H30 X Technologie

Aquacole UF Reproduction contrôlée d’organismes aquatiques 2

6 2 0H30 0H45 0H30

Culture et élevage des invertébrés aquatiques 3 3 1H 1H 0H45 X Culture des organismes aquatiques

UF Culture et élevage des vertébrés aquatiques 3 6 3 1H 1H 0H45 X

Biomolécules aquatiques d’intérêt 3 3 1H 1H 0H45 X Valorisation des

bioressourses aquatiques

UF Exploitation et valorisation des bioressourses aquatiques 3 6 3 1H 1H 0H45 X

OPT 1 3 3 X OPT UO OPT 2 3 6 3 X







de l'UE




1 Stage pratique UF

Validation


Contenus des Programmes du Parcours : Biotechnologie Marine et Aquaculture

UE 1 Technologie Aquacole

ECUE1 : Milieu de culture A – Approvisionnement en eau 1- Besoins et débits 2 – Caractéristiques physicochimiques 2 – Ouvrages de prise et d’amenée B – Traitement 1 – Epuration 2 – Désinfection 3 – Aération oxygénation C – Recyclage 1 – Objectifs 2 - Procédés ECUE2 : Alimentation en Aquaculture A – Culture des micro algues 1 – Caractéristiques physicochimiques des milieux de culture 2 - Techniques B - Elevage des proies 1 – Milieux d’élevage

2 – Techniques de production 3 - Alimentation C – Utilisation d’Artémia 1 – L’emploi des Nauplii 2 – L’emploi des adultes D – L’aliment artificiel 1 – L’aliment en pâte 2 – L’aliment en granulés E – Le zooplancton 1 – Les techniques de collecte 2 – Les utilisations ECUE3 : Reproduction contrôlée d’organismes aquatiques A – Reproduction contrôlée des Mollusques bivalves


1 – L’écloserie - Les structures

- les techniques - Les espèces produites commercialement 2 – La nurserie - Objectifs - Fonctionnement - Relations avec l’écloserie B – Reproduction contrôlée des crustacés 1 – Obtention des pontes 2 – Elevage larvaire C – Reproduction contrôlée des poissons 1- Acclimatation, stabulation et maturation des géniteurs 2- Obtention des pontes, incubation des œufs et éclosion 3 – Elevage larvaire

UE 2 Culture des organismes aquatiques

ECUE1 : Culture et élevage des invertébrés aquatiques A – Les mollusques

1 - Méthodes et Techniques d’élevage 2 - Espèces élevées

B – Les échinodermes


C – Les crustacés


ECUE2 : Culture et élevage des vertébrés aquatiques A – Les poissons


B – Les tortues marines



UE 3 Valorisation des bioressourses aquatiques

ECUE1 : Biomolécules aquatiques d’intérêt A – Les biomolécules des macroalgues

1. Les alginates 2. Les laminarines 3. Les fucoïdes 4. Les carraghénanes de type kappa 5. Les Carraghénanes de type beta 6. Les Hydrolysats (source d’Oligo-aliments et amendement de terres acides) B – Les biomolécules des microalgues 1. Les Phycoérythrine 2. Les Flavonoïdes (Piègent les radicaux libres) C – Les biomolécules de crustacés 1. Les Chitosane 2. Les Glucosamine et Sulfate de chondroïtine 3. Les Caraténoïdes 4. Les Protéines (enzymes et arômes) D – Les biomolécules de Vertébrés

1. Protéines et enzymes (anti-gel, anti-microbiens, hydrolysat pour les saveurs et les arômes)

2. Les lipides (acides gras riches en Oméga-3 et phospholipides pour le traitement des maladies dégénératives)

ECUE2 : Exploitation et valorisation des bioressourses aquatiques A – Alimentation humaine directe B – Les produits et les sous produits d’origine marine dans l’agroalimentaire 1. Les gélifiants 2. Les émulsifiants 3. Les épaississants 4. Les stabilisants C – Les produits et les sous produits d’origine marine dans l’industrie pharmaceutique et médicale 1. Les anticoagulants 2. Les antiagrégants 3. Les amincissants 4. Les antitumoraux 5. Les antioxydants 6. Les cicatrisants D – Les produits et les sous produits d’origine marine dans la production cosméceutique


E – Les produits et les sous produits d’origine marine en agriculture 1. Engrais et de fertilisants 2. Composés pour l’amendement des sols 3. Biopesticides F – Les produits et les sous produits d’origine marine en alimentation animale

G – Les produits et les sous produits d’origine marine dans la lutte contre la pollution H – Les produits et les sous produits d’origine marine dans la fabrication de bijoux

(perles, corail) I – Les poissons ornementaux pour le marché de l’aquariophilie


Programmes et Contenus du Parcours : Biotechnologie Animale


Programmes du Parcours : Biotechnologie Animale



Horaire Régime examen UE

Nature de

l’UE ECUE Crédits Coef C TD TP CI Contrôle


Anglais 2 2 2H X Création d’entreprises 2 2 1H30 X

Unité Transversale

UT

Biostatistiques 2 2 2H X Biotechnologie moléculaire 3 3 1H30 0H45 0H30 X Biotechnologies

moléculaire et cellulaire

UF Biotechnologie cellulaire et tissulaire 3 3 1H30 0H45 0H30 X

Biotechnologie du développement 3 3 1H30 0H45 0H30 X Biotechnologies de la reproduction et du développement

animal

UF Technologie de la reproduction animale 3 3 1H30 0H45 0H30 X

Biomolécules d’intérêt 3 3 1H30 0H45 0H30 X Exploitation et valorisation des

produits d’origine animale

UF Valorisation des produits et des sous-produits d’origine animale 3 3 1H30 0H45 0H30 X







de l'UE




1 Stage pratique UF

Validation


Contenus des Programmes du Parcours : Biotechnologie Animale

UE1 : Biotechnologies moléculaire et cellulaire

ECU E1 : Biotechnologies moléculaire (transgenèse)

A- Rappels sur la manipulation et l’amplification des gènes 1. ADN recombinant 2. Clonage 3. PCR B- Les techniques de transfert de gènes chez les animaux 1. Le modèle de la transgenèse chez la souris 2. Les constructions génétiques 3. Les méthodes de transfert 4. Les cellules cibles 5. Contrôle de l’intégration et de l’expression des transgènes C- Les applications de la transgenèse animale

1. Augmentation de la production animale 2. Lutte contre les maladies : différents modèles animaux de pathologie humaines 3. L’amélioration de la qualité de la nourriture 4. La réduction de l’impact environnemental 5. Amélioration du bien-être animal 6. Production de médicament chez l’animal transgénique

ECU E 2 : Biotechnologie cellulaire et tissulaire

A- Techniques de culture de cellules animales 1. Milieux de cultures 2. Les conditions d’incubation 3. La congélation et décongélation B- Les lignées de cellules animales 1. Lignées primaires 2. Lignées secondaires

C- Différenciation in vitro et étude des marqueurs de différenciation 1. Modèle de l’hématopoïèse 2. Organogenèse in vitro

D- Teste fonctionnels in vitro 1. Croissance 2. migration 3. Adhésion 4. Apoptose

E- La fusion cellulaire et la production d’anticorps monoclonaux


UE2 : Biotechnologie de la reproduction et du développement animal

ECU E 1 : Biotechnologie du développement

A- Le développement embryonnaire in vitro 1. totipotence cellulaire 2. technologie de la culture embryonnaire (DIV : développement embryonnaire in vitro)

B- Sexage embryonnaire 1. Le tri des spermatozoïdes mâles et femelles 2. le sexage des embryons C- Le clonage embryonnaire 1. La gémellité et la polyembryonie expérimentales 2. Le clonage d’embryons par transfert de noyaux

ECU E 2 : Technologie de la reproduction

1. Technologie du sperme 2. Production d’ovocytes et d’embryons in vivo 3. Production d’embryons in vitro et transfert d’embryons 4. Cryopréservation d’ovocytes et d’embryons 5. Production d’embryons transgéniques

UE3 : Exploitation et valorisation des produits d’origine animale

ECU E 1 : Biomolécules d’intérêt

A- Les sérums 1. de veau fœtal 2. de cheval pour la sérothérapie (antiscorpionique et antitétanique) B- Les anticorps 1. Anticorps pour le diagnostic 2. Anticorps pour la sérothérapie 3. Particularité des anticorps de dromadaire

C- Les molécules à activité biologique 1. Les toxines 2. Autres molécules des venins

ECU E 2 : Valorisation des produits et des sous-produits d’origine animale

A- Les peaux et l’industrie du cuir et du textile B- Les produits et sous produits d’origine animale dans l’industrie agroalimentaire

1. Produits carnés 2. Produits laitiers 3. Approches biotechnologiques pour leur production, leur contrôle et leur conservation


Programmes et Contenus du Parcours : valorisation des bio ressources des milieux

arides


Programmes du Parcours : Valorisation des bioressources des milieux arides

Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Valorisation des bio ressources des milieux arides)


Licence Appliquée en Biotechnologies (Valorisation des bio ressources des milieux arides) - Semestre 5

Horaire Régime examen

UE Nature de l’UE ECUE Crédits Coef C TD TP CI

Contrôle

continu

Régime mixte

Anglais: préparation à la certification 2 2 2H X Culture de l’Entreprise

(Création d’entreprises) 2 2 1H30 X Unité Transversale UT

Bioinformatique 2 2 1H 1H X Phytoressources en milieu aride 3 3 1H30 1H15 X Valorisation des

Phytoressources UF Biotechnologies végétales 3 3 1H30 1H15 X

Bioressources animales 3 3 1H30 1H15 X Valorisation des ressources Animales

UF Biotechnologies animales 3 3 1H30 1H15 X

Biomolécules d’intérêt industriel 2 3 1H 0H45 X Extraction, analyse et identification de

biomolécules 2 3 1H 0H45 X Exploitation industrielle des Bioressources

UF Génie fermentaire et transformations

alimentaires 2 1H 0H30 0H30 X



Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (valorisation des bio ressources des milieux arides)


Licence Appliquée en Biotechnologies (valorisation des bio ressources des milieux arides) - Semestre 6



de l'UE




1 Stage pratique UF

Validation


Contenus des Programmes du Parcours : valorisation des bioressources des milieux arides

UE1 : Valorisation des phytoressources ECU1 : Les phytoressources en milieu aride : diversité et exploitation Contenu du cours :

- Espèces pastorales /parcours - Arboriculture - Cultures oasiennes - Espèces médicales et aromatiques - Algues

Contenu des TPs :

- Reconnaissance (systématique) des espèces et constitution d’un herbier - Sortie sur terrai

ECU2 : Biotechnologies végétales et amélioration Contenu du cours :

- Culture in vitro de cellules et tissus - Modification de génomes et amélioration des plantes : transgénèse, haploïdification,

fusion de protoplastes - Transformation des phytomasse (microbiologique, enzymatique, chimique, …) - Culture algale

Contenu des TPs :

- Culture in vitro de tissues - Culture in vitro d’anthères - Transgénèse végétale - Culture d’une micro-algue

UE2 : Valorisation des ressources animales ECU1 : Ressources animales en milieu aride Contenu du cours :

- Espèces sauvages : Biodiversité et composition spécifique de la faune terrestre : Amphibiens, reptiles, avifaune, mammifères terrestres.

- Intérêt et valorisation de la faune sauvage : valeur patrimoniale et intérêts (scientifique, médical, agronomique, écologique, économique)

- Races domestiques - Ressources halieutiques ( à traiter pour chaque groupe : les espèces d’intérêt

économique – leur localisation – la reproduction - l’exploitation (pêche et/ou Culture) – l’utilisation) : Les éponges et les coraux, les Mollusques (Céphalopodes - Bivalves et Gastéropodes), les Crustacés Décapodes, les poissons cartilagineux, les poissons osseux

Contenu des TPs :

- Systématique des espèces animales - Sortie sur terrain (Reconnaissance des espèces animales) - Visite : station d’aquaculture - Visite d’une ferme d’élevage


ECU2 : Biotechnologies animales Contenu du cours :

- Transgénèse animale - Culture cellulaire et clonage - Reproduction assistée - Cryopreservation - Lutte biologique contre les pestes - Elevage d’animaux rares (exemples : aquaculture, faune sauvage, petits ruminants,

mollusques, ver à soie, …) Contenu des TPs :

- Culture cellulaire et cryopréservation - Fécondation in vitro - Visite de laboratoires spécialisés - Visite d’une ferme/centre d’élevage particulier (exp. faune sauvage, mollusques, ver

de soie,…) - Visite d’un verger/oasis : reconnaissance d’insectes utiles (exp. de lutte biologique)

UE3 : Exploitation industrielle des bioressources ECU1 : Biomolécules d’intérêt industriel Contenu du cours :

- Colorants et teintures - Huiles essentielles, flavonoïdes et alcaloïdes - Huiles alimentaires - Huiles industrielles - Biocarburants - Protéines et glucides d’intérêt industriel

Contenu des TPs :

- Visites d’usines de transformation de produits alimentaires et non alimentaires - Production de bio-éthanol - Production de savon

ECU2 : Extraction analyse et identification de biomolécules Contenu du cours :

- Méthodes d’extraction et de purification (par solvants, CO2 supercritique, hydrodistillation, …)

- Chromatographie (CPG, HPLC, ..) - Electrophorèse - RMN - Spectrophotométrie - Spectrométrie de masse

Contenu des TPs

- Extraction et identification de phénols - Extraction et identification d’huiles essentielles

ECU 3 : Génie fermentaire et transformations alimentaires Contenu du cours :


- Ingénierie de la fermentation - Fermenteurs de laboratoires et industriels - Calcul de paramètres et optimisation de la fermentation - Différents types de fermentations et de ferments

Contenu des TDs/TPs

- Conduite d’une fermentation en bio-réacteur et effets des paramètres du milieu - Visite d’usine


Programmes et Contenus du Parcours : Valorisation des ressources végétales


Programmes du Parcours : Valorisation des ressources végétales Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Valorisation des ressources végétales) Domaine de formation : Sciences et Technologies Mention Biotechnologies


HORAIRE Régime d'examen UNITE D’ENSEIGNEME

NT

Nature de l’UE UNITES D’ENSEIGNEMENT

COURS TD TP Cours intégré

CREDIT COEFFICIENT Contrôle


ECONOMIE D’ENTREPRISE,

NORME ET LEGISLATION UT

LANGUE/ ANGLAIS NORME ET LEGISLATION CULTURE DE L’ENTREPRISE (ECONOMIE ET GESTION COMMERCIALE)

2H 2H 1H30

2 2 2

X

VALORISATION DES

RESSOURCES VEGETALES UF

MICROBIOLOGIE ET FERMENTATION DES VEGETAUX BIOTECHNOLOGIE VEGETALE 2 VALORISATION ENERGETIQUE DE LA PRODUCTION VEGETALE

1H 1H 1H

0H30 0H30 0H30

0H30 0H30

2 2 2

1 1 1

X

BIODIVERSITE VEGETALE

TERRESTRE UF

ETUDE ET GESTION DE LA DIVERSITE VEGETALE PLANTES MEDICINALES ET AROMATIQUES

1H30 1H30

1H 0H30

1H

3 3

1.5 1.5

X

REGLEMENTATION &

VALORISATION DES DECHETS

VEGETAUX

UF

REGLEMENTATION ET CONTROLE DE LA QUALITE GESTION ET VALORISATION DES DECHETS VEGETAUX 2

1H30 1H30

1H 1H

1H

3 3

1.5 1.5

X

TECHNOLOGIE & BIOCHIMIE VEGETALES UO

OPT. 1 : BIOCHIMIE APPLIQUEE AUX RESSOURCES VEGETALES OPT. 2 : TECHNOLOGIE ET TRANSFORMATION DES PRODUITS VEGETAUX

1H30 1H30

0H30 1H

0H30 0H30

3 3

1.5 1.5

X


Universités : Etablissements : Licence Appliquée Biotechnologies (Valorisation des ressources végétales)





de l'UE




1 Stage pratique UF

Validation


Contenus des Programmes du Parcours : Valorisation des ressources végétales

Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (UE)

et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE) Intitulé de l’UE : Langues, Economie, Normes et Législation

Nombre des crédits : 6 Code UE : VRV51 .........

Université : SFAX Etablissement : Faculté des Sciences de Sfax ......... Domaine de formation : Sciences et Technologie ..........................................................

Mention : Sciences du Vivant ...................................

Diplôme et parcours Semestre LA : Licence appliquée…………… Parcours : Valorisation des Ressources Végétales

S5

1- Objectifs de l’UE (Savoir, aptitudes et compétences) Le cours de Langue : Français 1-comprendre : écouter :comprendre avec une relative aisance une interview de type argumentatif,comprendre une gamme étendue d’enregistrement et y reconnaître les différents points de vue échangés ainsi que différencier l’attitude du locuteur ,suivre une interaction d’une certaine longueur sur des sujets complexes voire abstraits. lire : déterminer le registre de langue approprié à a situation de communication, prévoir les procédés d’argumentation appropriés à son intention de communication, s’assurer de la qualité de l’argumentation prévue par la discussion et la consultation d’ouvrages de référence, mettre en correspondance titre,intertitre,et textes correspondants 2- parler : prendre part à une conversation : intervenir assez spontanément et avec précision lors de discussion et débats et lier ses interventions s à celles des interlocuteurs b- S’exprimer oralement en continu : communiquer avec assurance, discourir de manière compréhensible et développer une argumentation avec un certain nombre d’articulateurs, présenter clair développant des points de vue. 3- écrire : Transposer à l’écrit un débat oral mené préalablement en classe, choisir un de des arguments avancés pendant ce débat et le développer par écrit, organiser un développement en plusieurs paragraphes en tenant compte de la situation de communication. Le cours de Normes et Législation : Présenter les normes et les exigences légales à respecter pour obtenir la commercialisation des produits agroalimentaires dans la Tunisie et l’extérieur. • Quelles normes à appliquer et à quels produits ? • Comment obtenir la conformité des produits ? • Que faut-il prendre en considération lors de la mise en circulation d’un nouveau produit ? 2- Pré-requis (définir les UE et les compétences indispensables pour suivre l’UE concernée)

LANGUES : Français - maîtrise du texte explicatif (sujet d’information, explication scientifique ou rapport technique) -maîtrise des techniques du résumé (reconnaissance du type de texte, établissement d’un plan, réalisation) .maîtrise des rédactions non argumentatives -maîtrises des techniques de la prise de notes (marche à suivre, éléments d’organisation Pour le cours de Normes et Législation Chimie Générale, Chimie Organique, Biochimie Structurale, Méthodes d’analyse physicochimiques. 3- Elément constitutifs de l’UE (ECUE) 3.1- Enseignements



1- Langues 2h30 2 2- Economie et gestion commerciale

2h 2

3- Normes et Législation 1h 2 TToottaall 11hh 44hh3300 66

Annexe 1 Unité d’Enseignement : LANGUES, ECONOMIE, NORMES ET

LEGISLATION Code UE : VRV51

ECUE n°1 : Langue (Français) Code ECUE : …………………...

Plan du cours

Séance 1 : remue-méninges sur le sujet (1heure) Séance 2 : compréhension orale (1.30 heure) : écouter un discours argumentatif pour identifier les paramètres de la situation de communication, reconnaître la structure de l’explication. Séance 2 : lecture (2heures) : comprendre et analyser les indices permettant une meilleure compréhension du texte argumentatif (indices d’énonciation, indices d’organisation, indices lexicaux Séance 3 : lecture /étude de la langue:( 2heures) : analyser la situation d’énonciation et d’argumentation, repérer les procédés de l’argumentation Séance 4 : lecture vocabulaire (1 30heure) Séance 5 : lecture /écriture (2heures) Séance 5 : oral : simulation et jeux de rôle (1,30heure) : organisation d’un débat en rapport avec le thème Séance 6 : lecture /grammaire/ écriture (2 heures) :repérer les procédés de l’ argumentation , savoir utiliser les connecteurs logiques Séance 7 : Oral (2heures) : produire un discours argumentatif à l’oral de façon vivante Séance 8 : lecture (1 heure) / orthographe /lecture : savoir accorder le participe passé Séance 9:lecture (2heure) : classer les arguments : argument inductif, argument déductif, raisonnement causal, argument contraignant, argument fondé sur les grandes valeur


Séance 10 : lecture 1 (1heure) : étudier les exemples, justifier leur emploi : Illustration, référence, preuve, Illustration, référence, preuve, témoignage Séance 11 : écriture (1 heure) : écrire un article scientifique en utilisant le discours argumentatif Séance 12 (1heure) : évaluation et remédiation

Annexe 2

Unité d’Enseignement : LANGUES, ECONOMIE, NORMES ET LEGISLATION

Code UE : …VRV51…

ECUE n° 2 : NORMES ET LEGISLATION

Code ECUE : …………………...

Plan du cours (14 H)

Introduction Chapitre 1 : Intérêts de la normalisation dans le secteur agroalimentaire Chapitre 2 : Organisations mondiales et nationales des instances de normalisation et des institutions

de législation Chapitre 3 : Normes de base, génériques et de familles de produits Chapitre 4 : Normes internationales Chapitre 5 : Normes et législation nationales Chapitre 6 : Réalisation pratique de mise en conformité et laboratoires d’essais Chapitre 7 : Implications pour les fabricants


Annexe 3

Unité d’Enseignement : LANGUES, ECONOMIE, NORMES ET LEGISLATION

ECUE n° 3 ECONOMIE ET GESTION COMMERCIALE

Plan du cours

1. Economie générale

- Economie contemporaine

- Règles générales du droit des contrats

- Mercatique - Concepts et études marketing

- Comptabilité et analyse financière

- Management processus et organisation de l’entreprise

- Finances d’entreprise - Gestion et politique financière

- Action commerciale internationale

- Expérience professionnelle

2. Spécialisation « Commercial Produits Végétaux »

- Economie des produits végétaux et produits végétaux

- Les marchés des ressources végétales (l’industrie pharmaceutique, le marché de l’officine,

le marché des établissements cosmétiques, le marché des services de santé…)

En fonction des différents marchés :

- Les produits/services (politique de prix, appels d’offres, publicité des produits de santé,

merchandising…)

- Les approches commerciales (de la prospection à la négociation, de la vente à l’après vente)

Code UE : VRV51

Code ECUE : ……………...


Fiche descriptive d’une unité d’enseignement (UE) Et des éléments constitutifs d’une unité d’enseignement (ECUE)

Intitulé de l’UE

………………Valorisation des ressources végétales …………….

Nombre des crédits : 6 Code UE : VRV52

Université : SFAX………………… Etablissement : Facultés des Sciences de Sfax…..

Domaine de formation : Sciences et Technologies... Mention : Sciences du vivant ..................................... Diplôme et parcours Semestre LA …Licence appliquée ………………Parcours : Valorisation des Ressources Végétales S5 LF ................................................................. Parcours : ..................................................... …………..


L'objectif de cette formation est d'acquérir des connaissances en microbiologie (écologie microbienne, biodégradation des résidus, Symbiose….) en biotechnologie végétale (culture in vitro, suspension cellulaires, la micro propagation….) et sur les techniques de transformations énergétique des végétaux.


Microbiologie, physiologie végétale ................................................................................................................ ............................................................................................................................................................................

3- Elément constitutifs de l’UE (ECUE)

3.1- Enseignements


1- Microbiologie et fermentation des végétaux

1h 0h30 0h30 2

2- Biotechnologie végétale 2 1h 0h30 0h30 2 3- Valorisation énergétique de la production végétale

1h 0h30 2

TToottaall 66

3.2- Activités pratiques (Projets, stages, mémoires ….) DDuurrééee AAccttiivviittééss pprraattiiqquueess ddee

ll’’UUEE TTrraavvaauuxx ssuurr tteerrrraaiinn PPrroojjeettss SSttaaggeess AAuuttrreess CCrrééddiittss

TToottaall

Annexe 1


Unité d’Enseignement : VALORISATION DES RESSOURCES VEGETALES

ECUE n° 1 MICROBIOLOGIE ET FERMENTATION DES VEGETAUX

Plan du cours

- Bioréacteur à cellules immobilisées. Production de biomasse et recyclage de résidus.

- Méthodes de détection d'agents phytopathogènes à l'aide de sondes moléculaires.

- Identification de marqueurs génétiques (ex.: RAPD) aux fins de mise au point de méthodes

de détection d'agents phytopathogènes.

- Mécanismes cellulaires et moléculaires de résistance des plantes à l'infection microbienne.

- Écologie et génétique des interactions sols-plantes-bactéries. Isolement, identification,

caractérisation physiologique et génétique des bactéries associées aux plantes cultivées.

- Agronomie, écologie et physiologie des symbioses Bradyrhizobium et Rhizobium-

légumineuses en cultures pures et intercalaires.

- Étiologie et épidémiologie associées à la mycoflore phytopathogène du sol.

- Écologie microbienne de la rhizosphère: micro-organismes utiles aux plantes. Écologie des

micro-organismes modifiés génétiquement libérés dans l'environnement.

- Biodégradation des résidus lignocellulosiques. Impact d'amendements frais ou compostés

sur la microflore.

- Symbiose Rhizobium-légumineuses: physiologie et génétique des bactéries et des nodosités

(adaptation au froid). Biofertilisants.

- Biomasse des groupes écologiques et activités de la microflore du sol et du compost.

- Biochimie de l'humus. Biodégradation des composés organiques de synthèse.

Code UE : VRV52



Annexe 2


ECUE n° 2 BIOTECHNOLOGIES VÉGÉTALES 2

Plan du cours

1. Quelques procédés biotechnologiques des cultures in vitro

- Bases cellulaires et physiologiques de l'organogenèse in vitro

- Différenciation et dédifférenciation cellulaires

- Aspects moléculaires de la variation somaclonale

2. Place des cultures in vitro dans les schémas de production des plantes

- Micropropagation; caulogenèse; rhizogenèse

- Embryogenèse somatique et semences artificielles

3. Suspensions cellulaires : conservation des souches et production de métabolites

- Souches cellulaires: définition et établissement; cryoconservation

- Stratégies biotechnologiques de production de métabolites secondaires

4. Intégration des cultures in vitro dans les stratégies d'amélioration des plantes

- Bases génétiques de l'amélioration des plantes

- L' haplodiploïdisation et son intégration dans les schémas de sélection

- L'outil proroplaste et l'hybridation somatique

- Notions de base de génie génétique : bases moléculaires de la relation Agrobacterium -

plante et leur exploitation pour la création de plantes transgéniques; construction de vecteurs;

transferts directs; secteurs d'application; législation

5. La micropropagation

6. Les plantes transgéniques et OGM

7. Biotechnologies et Biosécurité


Code UE : VRV52


Annexe 3


ECUE n° 3 VALORISATION ENERGETIQUE DE LA PRODUCTION

VEGETALE

Plan du cours Ressources

1- Ressources : - Cultures dédiées annuelles et pluri-annuelles (Plantes et herbacées – Sylviculture) - Co-produits des cultures dédiées (Pailles et tiges de céréales et oléagineux - Résidus

forestiers) - Autres co-produits et résidus (Agricoles – Industriels – Ménagers - Autres…) Lisiers, Fumiers, Paille combustible, Paille digestible, Cannes de maïs grain, Paille de colza, Paille de tournesol, Sarments, Déchets, Déchets municipaux, Rémanents forestiers, Haies et arbres épars, Connexes de bois, Bois bûche. - Matières organiques (Bois sec, Déchets de bois humides, Lisier, Fumier, Paille de céréale, Déchets ménagers, Boues d’épuration déshydratées, Déchets agro-alimentaires). 2- Technologie de transformation - Voie oléo-chimique (Raffinage chimique et physique, Estérification, Hydrotraitement) - Voie thermochimique (Combustion – Pyrolyse – Gazéification - Valorisation du gaz de synthèse - purification, séparation - procédés catalytiques (FT, MeOH, DME)) - Voie biologique (Réactions enzymatiques – Fermentation - Distillation, purification...) 3- Débouchés - Production directe d’énergie : Chaleur, Vapeur, Électricité, … - Carburants et combustibles : hydrogène, méthane, naphta, essence,s distillats, méthanol, éthanol, DME EMHV ; EEHV, ETBE, bio brut, charbon de bois autres... 4- Valorisation énergétique de la biomasse : La méthanisation, La Combustion, Potentiel chaleur, électricité, carburants, bois énergie, biogaz…


Code UE : VRV52



Intitulé de l’UE

………………Biodiversité Végétale Terrestre…………….





Permettre a l'étudiant d'acquérir une formation de base sur: -les systèmes écologiques et la gestion des ressources phytogénétiques -la valorisation et les techniques de culture des plantes médicinales et aromatiques. .


Botanique et biologie végétale. ......................................................................................................................... ............................................................................................................................................................................


3.1- Enseignements


1- Etude et gestion de la diversité végétale 1h 30 1h 3

2- Plantes médicinales et aromatiques

1h 30 0h 30 1h 3

TToottaall 33HH 11HH 3300 11HH 66



TToottaall


Annexe 1

Unité d’Enseignement : BIODIVERSITE VEGETALE TERRESTRE

ECUE n° 1 ETUDE ET GESTION DE LA BIODIVERSITE

VEGETALE

Plan du cours

Biodiversité

Biologie des extinctions

Dynamique et viabilité des populations menacées

Dynamique des systèmes Ecologiques et Gestion de la biodiversité

Dynamique et modélisation des métapopulations

Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes

Génétique des populations réduites ou morcelées

Gestion des ressources phytogénétiques des populations spontanées et cultivées

Aspects socio-économiques de la conservation et de la gestion des ressources biologiques

Ecologie de la restauration et réintroductions.

Code UE : VRV53



Annexe 2

Unité d’Enseignement : BIODIVERSITE VEGETALE TERRESTRE

ECUE n° 2 PLANTES AROMATIQUES ET MEDICINALES

Plan du cours

1- Botanique des plantes médicinales et aromatiques

1-1. Plantes spontanées

1-2. Plantes cultivées

2- Valorisation médicale des plantes

3- Valorisation aromatique et cosmétique des plantes

4- Culture des plantes médicinales

5- Culture des plantes aromatiques

6- Aspects commerciaux

6-1.Circuits de commercialisation :

6-2. Importations

6-3. Exportations

6-4. Marché International

7- Aspects environnementaux : les plantes médicinales et aromatiques dans leur environnement

8- Gestion durable des ressources phytogénétiques industrielles et médicales

Code UE : VRV53




Intitulé de l’UE

………………Réglementation et valorisation des déchets végétaux …………….



Domaine de formation : Sciences et Technologies... Mention : Sciences du vivant ..................................... Diplôme et parcours Semestre LA …Licence appliquée ……………Parcours : Valorisation des Ressources Végétales S5 LF ................................................................. Parcours : ..................................................... …………..


L'objectif de cette formation est de connaître les réglementations en vigueur en matière de contrôle de qualité. Déterminer les origines des déchets végétaux ainsi que le cadre et les obligations réglementaires.


Economie et gestion, droit de l’homme. ............................................................................................................ ............................................................................................................................................................................


3.1- Enseignements


1- Réglementation et contrôle de la qualité 1h 30 1h 3

2- Gestion et valorisation des déchets végétaux

1h 30 1h 0H30 3

TToottaall 33HH 22HH 00HH3300 66



TToottaall


Annexe 1

Unité d’Enseignement : REGLEMENTATION ET VALORISATION DES DECHETS VEGETAUX

ECUE n° 1 REGLEMENTATION ET CONTROLE DE LA QUALITE

Plan du cours

1. Introduction

2. Marques de distributeurs et marques de filières

3. Risques contractuels

4. Création et partage de la valeur

5. Standard de qualité minimum et marques de filières

6. Conclusion

Code UE : VRV54



Annexe 2

Unité d’Enseignement : REGLEMENTATION ET VALORISATION DES DECHETS VEGETAUX

ECUE n° 2 GESTION ET VALORISATION DES DECHETS

VEGETAUX

Plan du cours 1. Les déchets végétaux Les déchets végétaux regroupent les déchets végétaux issus des tontes de gazon, les feuilles mortes, les tailles d'arbres et d'arbustes, l'élagage, les déchets de jardin des particuliers collectés séparément ou par le biais des déchèteries. 2. Origine des déchets Les déchets végétaux résultent notamment de l'entretien et du renouvellement : - des zones de loisirs, - des espaces verts publics, - des terrains de sport, - des jardins privés, - des collectivités territoriales, - des organismes publics ou parapublics (HLM, universités...), - des sociétés privées d'entretien des espaces verts, - des jardins des particuliers. 3. Cadre et obligations réglementaires 4. Obligations du détenteur* (producteur, collecteur, exploitants d’installation de valorisation, etc) - Collecte et transport - Obligations de l'exploitant d'une installation d'élimination - Installation de compostage - Filières de traitement et de valorisation

- Collecte - Valorisation - Compostage - Méthanisation - Incinération


Code UE : VRV54



Intitulé de l’UE

………………Technologie et biochimie végétale …………….





Il s'agit d'acquérir des connaissances en biochimiques applique aux monde végétale (processus biochimique chez les végétaux, synthèse et structure des métabolites des plantes…) et en transformation des produits végétaux ( utilisation industrielle, extraction et isolement des constituants….)


Biochimie et biologie Végétale ............................................................................................................................................................................

3- Eléments constitutifs de l’UE (ECUE)

3.1- Enseignements


1- Biochimie appliquée aux ressources végétales 1h 30 0h 30 0h 30 3

2- Technologie et transformation des produits végétaux

1h 30 1h 0h 30 3

TToottaall 33HH 11HH3300 11HH 66



TToottaall


Annexe 1

Unité d’Enseignement : TECHNOLOGIE ET BIOCHIMIE VEGETALES

ECUE n° 1 BIOCHIMIE APPLIQUEE AUX RESSOURCES

VEGETALES

Plan du cours

- Compartimentation cellulaire des processus biochimiques chez les végétaux.

- Membranes lipidiques, transporteurs protéiques et translocation cellulaire des métabolites.

- Les protéines comme acteurs clés du métabolisme.

- Synthèse et structure des métabolites typiques des végétaux.

- Principes de base du génie métabolique.

Code UE : VRV 55



Annexe 2

Unité d’Enseignement : TECHNOLOGIE ET BIOCHIMIE VEGETALES

ECUE n° 2 TECHNOLOGIE ET TRANSFORMATION DES PRODUITS VEGETAUX

Plan du cours

- Elaboration des constituants, des structures et des organes d'intérêt économique (organes de réserve, fibres alimentaires et agents de texture d’origine pariétale, bois et fibres papetières ou textiles, produits du métabolisme secondaire)

- Grands types d'utilisation industrielle des végétaux

- Bases biologiques de la conservation des produits végétaux (réfrigération simple et

atmosphère contrôlée, congélation, survie des fleurs coupées)

- Forçage des organes (endive).

- Extraction et isolement de constituants (fibres textiles, sucre de betterave et de canne,

caoutchouc, protéines, lipides, amidon)

- Quelques produits élaborés (farine et pain, malt et bière, raisin et vin)

- Phytopathologie des produits frais.

TP et TD et visites d’entreprises

- Démonstrations et analyses de documents

- Visites d’entreprises

- Rédaction et présentation orale, par groupes de 3 ou 4, d’un dossier scientifique et

technique sur une plante ou un groupe de plantes d’intérêt économique ou sur un thème

se rapportant au programme du module.


Code UE : VRV 55

Documents

REFORME LMD BIOLOGIE - mesrst.tn · Biologie cellulaire Génétique UF Génétique 1H30 0H45 0H30 3 6 3 6 X ... Cours TD TP Cours Intégré ECUE UE ECUE UE Contrôle continu Régime