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SNOMED CT Padrão Terminológico e Ontológico Internacional
Stefan SchulzInstitute of Medical Informatics, Statistics and Documentation
(Medical University of Graz - Austria)
SNOMED CT
Standardized Nomenclature of Medicine – Clinical Terms: Sistema de codificação para todo o conteúdo do prontuário eletrônico
Padrão terminológico global
Manutenção / desenvolvimento: IHTSDO (International Health
Terminology Standards Development Organisation):
Membros: Austrália, Canadá, Chipre, Dinamarca, Estônia, Islândia,
Israel, Lituânia, Malta, Nova Zelândia, Polônia, Cingapura, República
Eslovaca, Eslovenia, Espanha, Suécia, Holanda, Reino Unido, Estados
Unidos
SNOMED: Descenvolvimento
SNOP SNOMED SNOMED II SNOMED 3.0 SNOMED 3.5 SNOMED RT SNOMED CT
1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005
Nomenclatura Patologia
Nomenclatura multiaxial para toda
a medicina
Descriçõeslógicas
Fusão com CTV3
(Reino Unido)
Princípios ontológicos
Context Model
IHTSDO
SNOMED em UMLS
SNOMED CT:
SNOMED CT como vocabulário controlado
SNOMED CT como sistema formal
SNOMED CT como ontologia
SNOMED CT como vocabulário controlado
SNOMED CT como vocabulário controlado
Termos médicos (inclusive sinônimos
e traduções) são conectados com
conceitos (portadores de significado)
z.Zt.311 000
conceitos
z.Zt. 732 000
termos em Inglês
Déficit de versões anteriores da SNOMED
D5-46210 Acute appendicitis, NOS
D5-46100 Appendicitis, NOSG-A231 Acute
M-41000 Acute inflammation, NOSG-C006 InT-59200 Appendix, NOS
G-A231 AcuteM-40000 InflammationG-C006 InT-59200 Appendix, NOS
SNOMED INTERNATIONAL
SNOMED CT como sistema formal
SNOMED CT como sistema formal
taxonomias:especialização
(is-a)
SNOMED CT como sistema formal
Restrições: lógica de descriçãoC1 – Rel – C2 significa:x: instanceOf(x, C1) y: instanceOf(C2) Rel(x,y)ouC1 ⊑ Rel.C2
Relações (Attributos): Associated morphologyFinding site (50 tipos)
Lógica descritiva
SNOMED CT como sistema formal
definierte vs. primitive Konzepte
conceitos definidos conceitos primitivos ⊑
SNOMED CT como Ontologia
SNOMED CT como Ontologia
Ordem de um domínio de acordo com propriedades genéricas e invariáveis
Ontologia: categorias disjuntas com critérios estritos(process, object, substance, quality)
Número restrito de relações (z.B. part-of, has-location, …) „Ontological commitment“: quais são as instâncias?
objetos no mundo (“minha dor de estômago”) objetos de documentação (o que está documentado sobre minha
dor de cabeza conhecimento (o que o médico atualmente sabe sobre
minha dor de cabeça)
Social context (10)CommunityFamilyGroup
(…)Special concept
Namespace conceptNavigational conceptNon-current concept
Specimen (45)Biopsy sampleBody substance sampleCardiovascular sample(…)
Staging and scales (6)Assessment scalesEndometriosis
classificationof American Fertility
Society(…)
Substance (11)Allergen classBiological substanceBody substance (…)
Body structure (10)Acquired body structureAnatomical organizational pattern(…)
Clinical finding (22)Administrative statusesAdverse incident outcome categories
(…)Environment or geographical location
EnvironmentGeogr. and/or political region of the
worldEvent (19)
AbuseAccidental eventBioterrorism related event (…)
Linkage conceptAttributeLink assertion
Observable entityAge AND/OR growth periodBody product observable (…)
Clin. history / examination observable (21)Device observableDrug therapy observableFeature of Entity (…)
Organism (11)AnimalChromistaInfectious agent (…)
Pharmaceutical / biologic product (58)
Alcohol productsAlopecia preparationAlternative medicines
(…)Physical force (21)
AltitudeElectricity
(…)Physical object (8)
DeviceDomestic, office and
garden artefactFastening
(…)Procedure (23)
Administrative procedureCommunity health
procedure(…)
Qualifier value (52)ActionAdditional dosage
instructions(…)
Record artifactRecord organizerRecord type
Situation with explicit context (17)A/N risk factorsCritical incident factors
(…)
SNOMED CT Top
SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas
SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas
SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas
Disorder of appendix (disorder)Disorder of digestive system (disorder)Disease (disorder)Appendicitis (disorder)Disorder of digestive organ (disorder)Disorder of lower gastrointestinal tract (disorder)Disorder of digestive tract (disorder)Disorder of intestine (disorder)Finding by site (finding)Finding of large intestine (finding)Disorder of abdomen (disorder)Disorder of gastrointestinal tract (disorder)General finding of abdomen (finding)Disorder of large intestine (disorder)Disorder by body site (disorder)Disorder of trunk (disorder)Inflammatory disorder (disorder)Acute inflammatory disease (disorder)
Inflammatory disorder of digestive tract (disorder)SNOMED CT Concept (SNOMED RT+CTV3)Abdominal organ finding (finding)Bowel finding (finding)Finding of appendix (finding)Finding of body region (finding)Inflammation of large intestine (disorder)Finding of trunk structure (finding)Disorder of body system (disorder)Inflammation of specific body organs (disorder)Inflammation of specific body structures or tissue (disorder)Inflammation of specific body systems (disorder)Inflammatory disorder of digestive system (disorder)Digestive system finding (finding)Gastrointestinal tract finding (finding)Disorder of body cavity (disorder)Clinical finding (finding)Viscus structure finding (finding)
Root Concept: Acute appendicitis (disorder)The following 36 "Is a" antecedents are present in the SNOMED hierarchy:
Pre- e Póscoordinação
SNOMED CT proporciona síntaxe composicional para gerar expressões complexas
413350009 | finding with explicit context | : { 246090004 | associated finding | = ( 284196006 | burn of skin | : 246112005 | severity | = 24484000 | severe | , 363698007 | finding site | = 321472003 | structure of dermatoglyphic patterns of palm |) , 408729009 | finding context | = 410515003 | known present | , 408731000 | temporal context | = 410512000 | current or specified | , 408732007 | subject relationship context | = 410604004 | subject of record | }
O que SNOMED não é
Um modelo de informação (que especifica o tipo de dados a ser coletados) para um determinado conceito clinico
Uma base de conhecimento a ser consumida por sistemas de apóio a decisão
Necessariamente um sistema de codificação para uso médico
Futuro de SNOMED CT
SNOMED CT usado como base ontológica para CID-11 (a partir de 2015)
Ampliação do grupo de paises-membros (Brasil ? China?, Alemanha? França...?)
Projetos de mapeamento (ICD-0, ICF, ICPC...)
Casos de uso conexão com modelos de informação (HL7-CDA, openEHR,
EN13606)
codificação automatizada utilizando PLN
Recursos
Home Page IHTSDO: www.ihtsdo.org
IHTSDO em Wikipedia: http://en.wikipedia.org/wiki/IHTSDO
SNOMED CT em Wikipedia: http://en.wikipedia.org/wiki/SNOMED_CT
Cliniclue navegador livre: http://www.cliniclue.com/
VetMed navegador web: http://viw2.vetmed.vt.edu/sct/menu.cfm
Outros navegadores: http://www.nlm.nih.gov/research/umls/Snomed/snomed_browsers.html
SNOMED e Modelos de Informação: SemanticHealthNet: http://www.semantichealthnet.eu/
SNOMED via UMLS: https://uts.nlm.nih.gov/home.html
Mais perguntas?Contato: Stefan Schulz: [email protected]