78
SPEKTROSKOPIA NMR PODEJŚCIE PRAKTYCZNE CZĘŚĆ: IV DR INŻ. TOMASZ LASKOWSKI mgr inż. Marcin Płosiński

SPEKTROSKOPIA NMR - Politechnika Gdańska · 2018. 4. 16. · w widmie 13C NMR. 3. 1H-13C HMBC – pozwala na płynne poruszanie się pomiędzy izolowanymi układamispinowymi jąder1H

  • Upload
    others

  • View
    3

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

  • SPEKTROSKOPIA NMRPODEJŚCIE PRAKTYCZNE

    CZĘŚĆ: IV DR INŻ. TOMASZ LASKOWSKImgr inż. Marcin Płosiński

  • PROLOGOS:

    ODSPRZĘGANIE SPINÓW(DECOUPLING)

  • ODSPRZĘGANIE SPINÓW

    Eliminacja zjawiska sprzężenia spinowo-spinowego występującego pomiędzy

    wybranym protonem a jego sąsiadami poprzez selektywne naświetlanie tego protonu.

    Naświetlanie – napromieniowywanie próbki falą elektromagnetyczną o częstotliwości

    rezonansowej wybranego protonu przed rejestracją widma.

    W efekcie:

    1) sygnał rezonansowy protonu naświetlonego nie pojawia się w widmie;

    2) w multipletowości dotychczasowych partnerów sprzężenia naświetlonego

    protonu nie jest zawarta informacja o sprzężeniu z naświetlonym protonem.

  • ppm1.4 1.32.42.62.83.0

    ppm1.4 1.32.42.62.83.0

    O H

    CH3

    H

    H

    AC

    BD

    A

    CB

    D

    CB D

    ODSPRZĘGANIE SPINÓW

  • ppm1.4 1.32.42.62.83.0

    CD

    A

    ppm1.4 1.32.42.62.83.0

    O H

    CH3

    H

    H

    AC

    BD

    A

    CB

    D

    ODSPRZĘGANIE SPINÓW

  • ppm1.4 1.32.42.62.83.0

    BD

    A

    ppm1.4 1.32.42.62.83.0

    O H

    CH3

    H

    H

    AC

    BD

    A

    CB

    D

    ODSPRZĘGANIE SPINÓW

  • ppm1.4 1.32.42.62.83.0

    C

    B

    A

    ppm1.4 1.32.42.62.83.0

    O H

    CH3

    H

    H

    AC

    BD

    A

    CB

    D

    ODSPRZĘGANIE SPINÓW

  • ODSPRZĘGANIE SPINÓW

    ▪ ZALETY1. Decoupling zwalnia z obowiązku określania multipletowości wszystkich

    sygnałów rezonansowych.

    2. Ustalanie sekwencji sprzężeń nie wymaga pomiarów stałych sprzężenia.

    ▪ WADY

    1. Ustalenie sekwencji sprzężeń wymaga przeprowadzenia kilku eksperymentów.

    2. Może zostać przeprowadzone jedynie na protonach znacznie różniących się

    przesunięciem chemicznym.

  • EPEISODION I:

    SPINOWO-SPINOWE SPRZĘŻENIA

    HOMOJĄDROWE w 2D

    COSY – CORRELATED SPECTROSCOPY

    TOCSY – TOTAL CORRELATED SPECTROSCOPY

  • F 2 ( p p m )

    1 . 21 . 41 . 61 . 82 . 02 . 22 . 42 . 62. 83 . 0

    F 1

    ( p pm )

    1 . 4

    1 . 6

    1 . 8

    2 . 0

    2 . 2

    2 . 4

    2 . 6

    2 . 8

    3 . 0

    oś pierwotna (F2)

    oś wtórna (F1)

    diagonala

    sygnał

    korelacyjny

    (crosspeak)

    sygnał

    autokorelacyjny

    widmo 1H

    COSY

  • F 2 ( p p m )

    1 . 21 . 41 . 61 . 82 . 02 . 22 . 42 . 62. 83 . 0

    F 1

    ( p pm )

    1 . 4

    1 . 6

    1 . 8

    2 . 0

    2 . 2

    2 . 4

    2 . 6

    2 . 8

    3 . 0O H

    CH3

    H

    H

    AC

    BD

    AC

    BD

    A

    C

    B

    D

    A,B

    B,A

    COSY

  • F 2 ( p p m )

    1 . 21 . 41 . 61 . 82 . 02 . 22 . 42 . 62. 83 . 0

    F 1

    ( p pm )

    1 . 4

    1 . 6

    1 . 8

    2 . 0

    2 . 2

    2 . 4

    2 . 6

    2 . 8

    3 . 0

    AC

    BD

    A

    C

    B

    D

    A,B

    B,A

    C,B

    B,C

    O H

    CH3

    H

    H

    AC

    BD

    COSY

  • F 2 ( p p m )

    1 . 21 . 41 . 61 . 82 . 02 . 22 . 42 . 62. 83 . 0

    F 1

    ( p pm )

    1 . 4

    1 . 6

    1 . 8

    2 . 0

    2 . 2

    2 . 4

    2 . 6

    2 . 8

    3 . 0

    AC

    BD

    A

    C

    B

    D

    A,B

    B,A

    C,B

    B,C

    B,D

    D,BO H

    CH3

    H

    H

    AC

    BD

    COSY

  • F 2 ( p p m )

    1 . 21 . 41 . 61 . 82 . 02 . 22 . 42 . 62. 83 . 0

    F 1

    ( p pm )

    1 . 4

    1 . 6

    1 . 8

    2 . 0

    2 . 2

    2 . 4

    2 . 6

    2 . 8

    3 . 0

    AC

    BD

    A

    C

    B

    D

    A,B

    B,A

    C,B

    B,C

    B,D

    D,B

    D,C

    C,D

    O H

    CH3

    H

    H

    AC

    BD

    COSY

  • F 2 ( p p m )

    1 . 21 . 41 . 61 . 82 . 02 . 22 . 42 . 62. 83 . 0

    F 1

    ( p pm )

    1 . 4

    1 . 6

    1 . 8

    2 . 0

    2 . 2

    2 . 4

    2 . 6

    2 . 8

    3 . 0

    AC

    BD

    A

    C

    B

    D

    A,B

    B,A

    C,B

    B,C

    B,D

    D,B

    D,C

    C,D

    O H

    CH3

    H

    H

    AC

    BD

    COSY

  • COSY

  • F 2 ( p p m )

    1 . 21 . 41 . 61 . 82 . 02 . 22 . 42 . 62. 83 . 0

    F 1

    ( p pm )

    1 . 4

    1 . 6

    1 . 8

    2 . 0

    2 . 2

    2 . 4

    2 . 6

    2 . 8

    3 . 0

    AC

    BD

    A

    C

    B

    D

    A,B

    B,A

    C,B

    B,C

    B,D

    D,B

    D,C

    C,D

    O H

    CH3

    H

    H

    AC

    BD

    COSY

  • F 2 ( p p m )

    1 . 21 . 41 . 61 . 82 . 02 . 22 . 42 . 62. 83 . 0

    F 1

    ( p pm )

    1 . 4

    1 . 6

    1 . 8

    2 . 0

    2 . 2

    2 . 4

    2 . 6

    2 . 8

    3 . 0

    AC

    BD

    A

    C

    B

    D

    A,B

    B,A

    C,B

    B,C

    B,D

    D,B

    D,C

    C,D

    NIEPRAWIDŁOWA

    OBRÓBKA WIDMA

    COSY

    O H

    CH3

    H

    H

    AC

    BD

  • F 2 ( p p m )

    1 . 21 . 41 . 61 . 82 . 02 . 22 . 42 . 62. 83 . 0

    F 1

    ( p pm )

    1 . 4

    1 . 6

    1 . 8

    2 . 0

    2 . 2

    2 . 4

    2 . 6

    2 . 8

    3 . 0

    F 2 ( p p m )

    1 . 21 . 41 . 61 . 82 . 02 . 22 . 42 . 62. 83 . 0

    F 1

    ( p pm )

    1 . 4

    1 . 6

    1 . 8

    2 . 0

    2 . 2

    2 . 4

    2 . 6

    2 . 8

    3 . 0

    AC

    BD

    A

    C

    B

    D

    A,B

    B,A

    C,B

    B,C

    B,D

    D,B

    D,C

    C,D

    D,AC,A

    INNY

    WARIANT OBRÓBKI

    COSY

    O H

    CH3

    H

    H

    AC

    BD

  • ▪ ZALETY

    1. Bardzo mała różnica przesunięć chemicznych (nakładanie się) sygnałów

    rezonansowych oraz ich nieczytelna multipletowość nie przeszkadzają (za

    bardzo) w interpretacji wyników.

    2. Do ustalenia sekwencji sprzężeń w danym układzie spinowym wystarcza

    przeprowadzenie jednego eksperymentu.

    3. Stosunkowo łatwe (choć nie zawsze) w wykonaniu, obróbce i interpretacji.

    ▪ WADY

    1. Interpretacja skomplikowanych widm COSY drastycznie zwiększa

    zapotrzebowanie mózgu na glukozę.

    2. Niewielka rozdzielczość widm COSY – konieczność stosowania odmian

    eksperymentu COSY (np. DQF-COSY) do badania bardziej złożonych układów.

    COSY

  • COSY

  • TOCSY

  • ▪ ZALETY

    1. Duża ilość sygnałów korelacyjnych.

    2. Możliwość szybkiego określenia przynależności protonów do poszczególnych

    układów spinowych.

    3. Możliwość rozpoznania struktury układów spinowych na podstawie ilości

    sygnałów korelacyjnych bądź obecności sygnałów rezonansowych protonów

    charakterystycznych.

    ▪ WADY

    1. Duża ilość sygnałów korelacyjnych.

    TOCSY

  • COSY

    protony amidowe: 7-8 [ppm];

    sprzężenie skalarne z α

  • TOCSY

    protony amidowe: 7-8 [ppm];

    sprzężenie skalarne z α

  • STASIMON I:

    SPINOWO-SPINOWE SPRZĘŻENIA HETEROJĄDROWE

  • H

    H

    SPRZĘŻENIE 1H-19F

    2JH,F = 40-50 Hz

    4JH,F = 4-5 Hz

    -CH3

    -CH2-

  • dublet

    dublet

    dubletów

    H

    3JH,H

    1JH,C

    1JH,C

    99 %

    1 %

    99 %0,5 % 0,5 %

    widmo 1H NMR:linie satelitarne (sidebands)

    SPRZĘŻENIE 1H-13C

    12C

    1H

    12C

    1H

    13C

    1H

    12C

    1H

    1JH,C = 115-270 Hz

    δ [ppm]

  • ▪1H DECOUPLING; SPRZĘŻENIE 13C-1H PRZEZ JEDNO WIĄZANIE

    SPEKTROSKOPIA 13C NMR

    1JC,H = 110-320 Hz

  • ▪ SPRZĘŻENIE 13C-1H PRZEZ WIELE WIĄZAŃ

    SPEKTROSKOPIA 13C NMR

    2,3JC,H = 0-60 Hz

  • ▪ DEPT (DISTORIONLESS ENHANCEMENT BY POLARIZATION TRANSFER)

    SPEKTROSKOPIA 13C NMR

    CH

    CH2

    CH3

    CHX

    C

  • SPEKTROSKOPIA 13C NMR

    δ [ppm] typ C

    2 – 50 sp3 (alkanowy)

    50 – 90 sp3 (C-O), sp1

    90 – 110 sp3 (O-C-O)

    110 – 150 sp2 (nie: C=O)

    > 160 sp2 (C=O)

  • SPRZĘŻENIE 13C-19F (CIEKAWOSTKA!)

    ▪ WIDMO 13C NMR, 1H-DECOUPLING, BRAK 19F-DECOUPLING

    -CH3-CH2-

    C=O

  • EPEISODION II:

    SPINOWO-SPINOWE SPRZĘŻENIA

    HETEROJĄDROWE w 2D

    HSQC – HETERONUCLEAR SINGLE-QUANTUM COHERENCE

    HMBC – HETERONUCLEAR MULTIPLE BOND CORRELATION

  • HSQC

  • HSQC

  • HMBC

    H1,C2’

    H3’,C1’

    H1’,C3’

  • ▪ KOMPLET EKSPERYMENTÓW gCOSY, gHSQC i gHMBC

    DYWAGACJE STRUKTURALNE

    2

    2

    2 2

    6

    1

    C8H15OCl

    ?

  • ▪ KOMPLET EKSPERYMENTÓW gCOSY, gHSQC i gHMBC

    DYWAGACJE STRUKTURALNE

    3 4

    12

    5

    6

    7 8

    1

    1

    1,2

    2,1

    2

    2

    3

    3

    3,4

    4,3

    4

    5,6

    4

    gCOSY

    5,6

  • ▪ KOMPLET EKSPERYMENTÓW gCOSY, gHSQC i gHMBC

    DYWAGACJE STRUKTURALNE

    3 4

    12

    5

    6

    7 8

    1

    C1

    2,C2

    5/6,C5/C6

    2

    C5/C6

    3

    C44,C4

    1,C1

    4 5,6

    C2

    gHSQC

    C33,C3

  • ▪ KOMPLET EKSPERYMENTÓW gCOSY, gHSQC i gHMBC

    DYWAGACJE STRUKTURALNE

    3 4

    12

    5

    6

    7 8

    1

    C1

    4,C3

    2

    C5/C6

    3

    C4

    2,C1

    1,C2

    4 5,6

    C2

    gHMBC

    C3 3,C4

    4,C22,C4

    1

    3

    2

    45

    6

    7 8

    ?

  • SPEKTROSKOPIA 13C NMR

    δ [ppm] typ C

    2 – 50 sp3 (alkanowy)

    50 – 90 sp3 (C-O), sp1

    90 – 110 sp3 (O-C-O)

    110 – 150 sp2 (nie: C=O)

    > 160 sp2 (C=O)

  • ▪ KOMPLET EKSPERYMENTÓW gCOSY, gHSQC i gHMBC

    DYWAGACJE STRUKTURALNE

    3 4

    12

    5

    6

    7 8

    1

    C1

    4,C3

    2

    C5/C6

    3

    C4

    2,C1

    1,C2

    4 5,6S

    C2

    gHMBC

    C3 3,C4

    4,C22,C4

    1

    3

    2

    45

    6

    7 8

    1,C8

    3,C8C8

    C7

  • ▪ ZALETY I ZASTOSOWANIE

    1. 1H-13C HSQC – pomocne przy rekonstrukcji izolowanych układów spinowych

    jąder 1H (bezlitośnie wskazuje diastereotopowe grupy –CH2–).

    2. 1H-13C HSQC – pozwala na pełne przyporządkowanie sygnałów rezonansowych

    w widmie 13C NMR.

    3. 1H-13C HMBC – pozwala na płynne poruszanie się pomiędzy izolowanymi

    układami spinowymi jąder 1H.

    ▪ WADY

    1. 1H-13C HMBC – nie wszystkie teoretycznie możliwe sygnały korelacyjne

    pojawiają się w widmie. ICH BRAK NIE JEST DOWODEM NA NIEPOPRAWNOŚĆ

    ZAŁOŻONEJ STRUKTURY!

    1H-13C HSQC, 1H-13C HMBC

  • STASIMON II:

    DIPOLOWE SPRZĘŻENIA

    HOMOJĄDROWE

    NOE – NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • Jądrowy efekt Overhausera – zjawisko wzmocnienia (bądź osłabienia) sygnału rezonansowego

    protonu, który znajduje się blisko w przestrzeni protonu naświetlanego.

    δ [ppm]

    H

    C

    H

    Hδ [ppm]

    hv

    NOE

    NOE

    Zasięg efektu Overhausera: ok. 4-5 Å.

    Jego wystąpienie jest dowodem bliskości jąder w przestrzeni.

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • B0

    E

    H0 HA

    δ

    B1

    νA

    νA

    νA

    stan równowagi

    H0HA

    δ

    νA

    νA

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

    Naświetlenie protonu HA powoduje odejście od stanu

    równowagi i wysycenie jego spinu, tj. liczba jąder w

    stanie o niższej energii jest dokładnie równa liczbie

    jąder w stanie o wyższej energii. Sygnał protonu HAznika z widma.

  • B0

    E

    H0 HA

    δ

    B1

    νA

    νA

    νA

    stan równowagi

    νA

    νA

    W2

    RELAKSACJA DWUKWANTOWA, W2 – efektywna w małych cząsteczkach

    droga relaksacji polegająca na powrocie populacji jąder naświetlanych (HA) do

    stanu równowagi przy jednoczesnym „ciągnięciu” ze sobą (wymuszeniu zmiany

    orientacji) spinów jąder sąsiadujących (HO), znajdujących się w stanie o

    wyższej energii.

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • B0

    E

    H0 HA

    δ

    B1

    νA

    νA

    νA

    stan równowagi

    νA

    νA

    W2

    W wyniku powrotu populacji jąder HA do stanu

    równowagi na drodze W2 część jąder HO przechodzi ze

    stanu o wyższej energii do stanu o niższej energii.

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • B0

    E

    H0 HA

    δ

    B1

    νA

    νA

    νA

    stan równowagi

    νA

    νA

    W2

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • B0

    E

    H0 HA

    δ

    B1

    νA

    νA

    νA

    stan równowagi

    νA

    νA

    W2

    Następnie, proton HA po raz kolejny ulega naświetleniu

    i następuje ponowne wysycenie populacji spinów tego

    jądra w próbce. Ponownie, liczba jąder HA w stanie o

    niższej energii jest dokładnie równa liczbie jąder w

    stanie o wyższej energii.

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • B0

    E

    H0 HA

    δ

    B1

    νA

    νA

    νA

    stan równowagi

    νA

    νA

    H0

    HAδ

    H0 HAδ

    widmo różnicowe

    Wreszcie, następuje rejestracja widma 1D i obserwacja

    protonu HO. Ponieważ w populacji istnieje teraz większa

    liczba spinów HO w stanie o niższej energii niźli było ich

    przed naświetlaniem HA, sygnał protonu HO ma większą

    intensywność!!!

    OBSERWUJEMY DODATNI EFEKT OVERHAUSERA.

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • B0

    E

    H0 HA

    δ

    B1

    νA

    νA

    νA

    stan równowagi

    νA

    νA

    W0

    RELAKSACJA ZEROKWANTOWA, W0 – efektywna w dużych cząsteczkach

    droga relaksacji polegająca na powrocie populacji jąder naświetlanych (HA) do

    stanu równowagi przy jednoczesnym „ciągnięciu” ze sobą (wymuszeniu zmiany

    orientacji) spinów jąder sąsiadujących (HO), znajdujących się w stanie o niższej

    energii.

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • B0

    E

    H0 HA

    δ

    B1

    νA

    νA

    νA

    stan równowagi

    νA

    νA

    W0

    W wyniku powrotu populacji jąder HA do stanu

    równowagi na drodze W0 część jąder HO przechodzi ze

    stanu o niższej energii do stanu o wyższej energii.

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • B0

    E

    H0 HA

    δ

    B1

    νA

    νA

    νA

    stan równowagi

    νA

    νA

    W0

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • B0

    E

    H0 HA

    δ

    B1

    νA

    νA

    νA

    stan równowagi

    νA

    νA

    W0

    Następnie, proton HA po raz kolejny ulega naświetleniu

    i następuje ponowne wysycenie populacji spinów tego

    jądra w próbce. Ponownie, liczba jąder HA w stanie o

    niższej energii jest odkładnie równa liczbie jąder w

    stanie o wyższej energii.

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • B0

    E

    H0 HA

    δ

    B1

    νA

    νA

    νA

    stan równowagi

    νA

    νA

    H0HA

    δ

    H0 HAδ

    widmo różnicowe

    Wreszcie, następuje rejestracja widma 1D i obserwacja

    protonu HO. Ponieważ w populacji istnieje teraz

    mniejsza liczba spinów HO w stanie o niższej energii

    niźli było ich przed naświetlaniem HA, sygnał protonu

    HO ma mniejszą intensywność!!!

    OBSERWUJEMY UJEMNY EFEKT OVERHAUSERA.

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • OAcO

    AcOCH

    2OAc

    OC

    O

    CO

    H

    H

    H

    H3

    1

    3

    4

    5

    6

    2

    2''

    1''

    3'

    4'

    2'

    1'NOE

    NOE

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

    widmo NOE

    widmo 1H NMR

    (t-BuO)3SiSH

    H2N(CH2)NH2

    H2O

    i-PrOH

    wymiana chemiczna: NOE < 0 (ujemne)

    ▪ WYMIANA CHEMICZNA

  • ▪ PODSUMOWANIE1. Jeżeli jądra HO oraz HA sąsiadują ze sobą w przestrzeni, to zjawisko odpowiedzialne za wymuszenie

    zmiany orientacji spinu jądra sąsiadującego (HA) w wyniku naświetlania jądra HO nazywa się

    sprzężeniem dipolowym i stanowi podstawę fizyczną efektu Overhausera.

    2. Ww. wymuszenie zmiany orientacji może nastąpić zgodnie z mechanizmem relaksacji dwukwantowej

    (W2) lub zerokwantowej (W0).

    3. Dodatni efekt Overhausera (dodatnie NOE) obserwujemy dla małych cząsteczek (M < 1 kDa), a

    konkretnie dla cząsteczek szybko obracających się w roztworach. Dla małych cząsteczek dominuje

    relaksacja W2.

    4. Ujemny efekt Overhausera (ujemne NOE) obserwujemy dla dużych cząsteczek (M > 2 kDa), a konkretnie

    dla cząsteczek wolno obracających się w roztworach. Dla dużych cząsteczek dominuje relaksacja W0.

    5. Wymiana chemiczna protonów labilnych również generuje sygnały w widmach NOE. Są one zawsze

    ujemne.

    6. Małe cząsteczki, które wolno obracają się w roztworach (np. w wyniku tworzenia agregatów), generują

    ujemne NOE.

    NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT

  • EPEISODION III:

    DIPOLOWE SPRZĘŻENIA

    HOMOJĄDROWE w 2D

    NOESY – NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT SPECTROSCOPY

    ROESY – ROTATING-FRAME OVERHAUSER EFFECT SPECTROSCOPY

  • NOESY/ROESY

    17

    20b

    NOENOE

    12

    NOE

    ▪ PRZYKŁADOWE WIDMO

  • CH3

    O

    OH

    OH

    OH

    H

    OH

    HH

    H

    CH3

    O

    OH

    OH

    H

    OH

    OH

    HH

    HNOE

    NOE

    ▪ ZASTOSOWANIE

    1. Eksperymenty bardzo użyteczne w analizie konformacyjnej.

    2. Wygodna metoda ustalania konfiguracji względnej centrów asymetrii, a niekiedy

    – konfiguracji absolutnej.

    NOESY/ROESY

  • ▪ ZASTOSOWANIE

    1. Eksperymenty bardzo użyteczne w analizie konformacyjnej.

    2. Wygodna metoda ustalania konfiguracji względnej centrów asymetrii, a niekiedy

    – konfiguracji absolutnej.

    3. Wygodna metoda ustalania sekwencji aminokwasów w polipeptydach, a także –

    sekwencji zasad w niewielkich odcinkach kwasów nukleinowych.

    NOESY/ROESY

    NOE (słabe)

    NOE (silne)

  • ▪ ZASTOSOWANIE

    1. Eksperymenty bardzo użyteczne w analizie konformacyjnej.

    2. Wygodna metoda ustalania konfiguracji względnej centrów asymetrii, a niekiedy

    – konfiguracji absolutnej.

    3. Wygodna metoda ustalania sekwencji aminokwasów w polipeptydach, a także –

    sekwencji zasad w niewielkich odcinkach kwasów nukleinowych.

    NOESY/ROESY

  • ▪ ZASTOSOWANIE

    1. Eksperymenty bardzo użyteczne w analizie konformacyjnej.

    2. Wygodna metoda ustalania konfiguracji względnej centrów asymetrii, a niekiedy

    – konfiguracji absolutnej.

    3. Wygodna metoda ustalania sekwencji aminokwasów w polipeptydach, a także –

    sekwencji zasad w niewielkich odcinkach kwasów nukleinowych.

    ▪ WADY

    1. Nie wszystkie teoretycznie możliwe sygnały korelacyjne pojawiają się w widmie.

    ICH BRAK NIE JEST DOWODEM BRAKU BLISKOŚCI JĄDER ATOMOWYCH W

    PRZESTRZENI!

    NOESY/ROESY

  • ▪ CZYM RÓŻNI SIĘ EKSPERYMENT ROESY OD NOESY?

    NOESY/ROESY

    sygnał NOESY ROESY

    diagonala ujemny* ujemny

    małe cząsteczki dodatni dodatni

    średnie cząsteczki BRAK dodatni

    duże cząsteczki ujemny dodatni

    wymiana chemiczna ujemny ujemny

    * W rzeczywistości sygnały korelacyjne w widmach NOESY i ROESY mają fazy względne, ustalane względem

    diagonali. Powyższa tabela jest prawdziwa dla sytuacji, w której diagonala znajduje się w fazie ujemnej (co jest

    ustawiane domyślnie dla wszystkich eksperymentów).

  • ▪ CZYM RÓŻNI SIĘ EKSPERYMENT ROESY OD NOESY?Eksperyment ROESY pozwala na obserwację korelacji w cząsteczkach o dowolnych masach, w

    przeciwieństwie do eksperymentu NOESY, który „nie widzi” cząsteczek o masach z zakresu 1

    kDa < M < 2 kDa (relaksacja dwukwantowa konkuruje wtedy z relaksacją zerokwantową, co

    wygasza sygnał NOE).

    Wadą stosowania eksperymentu ROESY w każdej możliwej okazji jest jego mniejsza czułość dla

    „dużych” cząsteczek, co wymaga stosowania większych stężeń (co nie zawsze jest łatwe).

    NOESY/ROESY

  • NOESY/ROESY

    ▪ POMIAR ODLEGŁOŚCI MIĘDZYATOMOWYCHDla krótkich czasów miksowania (τm) zależność intensywności NOE (I) od odległości między

    atomami (r) da się wyrazić wzorem:

    I = k∙rIS-6

    Stałą k wyznacza się na podstawie wzorca.

  • STASIMON III:

    ZESTAWIENIE WIDM 2D

  • ZESTAWIENIE WIDM 2D

    eksperyment typ korelacji typ sprzężenia

    COSY homojądrowe skalarne*

    TOCSY homojądrowe skalarne*

    HSQC heterojądrowe skalarne*

    HMBC heterojądrowe skalarne*

    NOESY homojądrowe dipolowe**

    ROESY homojądrowe dipolowe**

    * skalarne = spinowo-spinowe;

    ** dipolowe = przez przestrzeń.

  • EKSODOS:

    ZAWIJANIE SYGNAŁÓW

  • pp m204 0608010 012 014 016 018 020 0

    pp m2040608010 012 014 016 018 020 0

    CDCl3

    δ = 205,7 ppm

    δ = 5,7 ppm

    zawinięty sygnał

    C=O

    ZAWIJANIE SYGNAŁÓW

    CH3

    C=O

    Szerokość okna spektralnego – zakres częstotliwości, w którym wykonano pomiar.

    Szerokość okna spektralnego = 200 ppm.

    (CH3)2C=O, 13C NMR

  • pp m2 040608 010 012 014 016 018 0

    pp m204 0608010 012 014 016 018 020 0

    CDCl3

    δ = 205,7 ppm

    δ = 15,7 ppm

    zawinięty sygnał

    C=O

    ZAWIJANIE SYGNAŁÓW

    CH3

    C=O

    Szerokość okna spektralnego – zakres częstotliwości, w którym wykonano pomiar.

    Szerokość okna spektralnego = 190 ppm.

    (CH3)2C=O, 13C NMR

  • pp m204 0608010 012 014 0

    pp m204 0608010 012 014 016 018 020 0

    CDCl3

    δ = 205,7 ppm

    δ = 55,7 ppm

    zawinięty sygnał

    C=O

    ZAWIJANIE SYGNAŁÓW

    CH3

    C=O

    Szerokość okna spektralnego – zakres częstotliwości, w którym wykonano pomiar.

    Szerokość okna spektralnego = 150 ppm.

    (CH3)2C=O, 13C NMR

  • pp m20406 08010 012 0

    pp m204 0608010 012 014 016 018 020 0

    CDCl3

    δ = 205,7 ppm

    ZAWIJANIE SYGNAŁÓW

    CH3

    C=O

    Szerokość okna spektralnego – zakres częstotliwości, w którym wykonano pomiar.

    Szerokość okna spektralnego = 120 ppm.

    (CH3)2C=O, 13C NMR

    brak sygnału

    C=O

  • Uwaga: szerokości okna spektralnego nie należy utożsamiać z szerokością skali wydruku. Te

    dwie wielkości są sobie równe tylko wtedy, jeśli widmo zostało wydrukowane w całym zakresie

    pomiarowym.

    ZAWIJANIE SYGNAŁÓW

    δrzeczywiste = δsygnału zawiniętego + szerokość okna spektralnego

    δsygnału zawiniętego = δrzeczywiste - szerokość okna spektralnego

  • DZIĘKUJĘ ZA UWAGĘ!(...i powodzenia na kolokwium)