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Techniques de fouille de données en chimie > Philippe JAUFFRET Laboratoire des Systèmes d ’Information Chimique UMR 5076 du CNRS - Montpellier <[email protected]>

Techniques de fouille de données en chimie · 2012-01-18 · • fouille des données ... Prétraitement Fouille de données Analyse des résultats Evaluation ... Compléter la relation

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Techniques de fouille de données en chimie

>

Philippe JAUFFRETLaboratoire des Systèmes d ’Information ChimiqueUMR 5076 du CNRS - Montpellier<[email protected]>

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Sommaire

QUITTER><

• Introduction - définitions

• Fonctions d ’un système de fouille de données

• Fouille de données et OLAP

• Prétraitement des données

• Association

• Classification

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Fouille de données1)

De quoi on parle et pourquoi on en parle ?

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Explosion du volume des données : CA

QUITTER><

1900 2000

500K

1M35 M substances cataloguées5,6 M de réactions (CASREACT)

Nb documents/an

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Pourquoi fouiller les données ?

QUITTER><

Nature, 10 juin 1999

De nouvelles techniques doiventêtre élaborées pour transformerles données en connaissances

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Pourquoi fouiller les données ?

QUITTER><

« To understand is to perceive patterns. »(Sir Isaiah Berlin)

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Pourquoi fouiller les données ?

« Most researchers are accustomed to studying a relatively small data set for a long time, using statistical models to tease out patterns. At some fundamental level that paradigmhas broken down »

(Kihn)

QUITTER><

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Pourquoi fouiller les données ?

La fouille de données apparaîtcomme une évolution naturelle destechnologies de bases de données.

QUITTER><

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Une définition…parmi tant d ’autres

« Data mining is the process of discovering meaningfull new correlations, pattern andtrends by sifting through large amounts of data stored in repositories, using pattern recognition technologies as well as statistical and mathematical techniques »

(Gartner Group)

QUITTER><

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Fouille de données:interdisciplinarité ?

QUITTER><

La fouille de données fait appel a demultiples compétences :

- bases de données- statistiques- théorie de l ’information- apprentissage automatisé- visualisation- connaissance du domaine

d ’application (chimie)

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Extraction de Connaissances à partir de Bases de Données

« Knowledge Discovery in Databases is the process of extracting previously unknown, valid, and actionable information from large databases »

(Cabena 98)

QUITTER><

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La fouille de données est une étape de l ’ECBD (I)

QUITTER><

Sélection donnéesciblées

Préparation des données Echantillon

Fouille de données

ModèlesMotifs

Vérification, Evaluation

Bases dedonnées brutes

L ’ECBD est un processus- itératif- interactif

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La fouille de données est une étape de l ’ECBD (II)

QUITTER><

• fixer les objectifscomprendre le domaine d ’application, et ce qu ’on veut apprendre

• sélectionner l ’échantillonacquisition et intégration

• nettoyer et transformer les donnéesbruit, champs manquants, données aberrantes,…réduction de la dimension, choix de représentation,...

• fouille des donnéeschoix de la méthode adaptée aux objectifs

• vérification et consolidation• utilisation...

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Fouille de données et apprentissage automatisé

QUITTER><

DM ML

domaine

méthodes

Seulement desexemples « positifs »

Exemples positifs:généralisation

Exemples négatifs:spécialisation

Généralisationattribut par attribut

Généralisation globale (par nupletsd ’attributs)

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une terminologie souvent confuse...

• Lexique pour le Data Mining :http://www.twocrows.com/glossary.htm

• Lexique pour l ’apprentissage automatisé :

http://robotics.stanford.edu/~ronnyk/glossary.html

QUITTER><

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2)Fonctions d ’un système

de Fouille de données

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Conceptualisation/Classification

QUITTER><

généraliser des données et les abstraire. Identifier des descripteurs (modèles)permettant de distinguer des classesd ’objets et de décrire des concepts

( Comment établir des classes de solvants utilisables pour la généralisation d ’exemplesde réactions?)

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Prédiction

QUITTER><

prévoir ou estimer la valeur d ’un attribut.

(estimer le rendement d ’une réaction ou la faisabilitéd ’un chemin de synthèse non encore expérimentépar l ’analyse d ’expériences préalables analogues)

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Association

QUITTER><

Identifier des corrélations ou des liensde causes à effet

( pour procéder à la réduction d ’un ester, on utilise souvent NiAlH4 comme réactif; quels groupements protecteurs utiliser dans uncontexte donné ?; etc.)

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Regroupement (cluster)

QUITTER><

regrouper un ensemble d ’objets endifférentes classes, de façon à mettre enévidence une similarité à l ’intérieur desclasses et les différences inter-classes

(Etant donné un ensemble de réactions, est-ilpossible d ’identifier des intervalles de températuresfréquemment utilisées ?)

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Détection des points aberrants

QUITTER><

(une donnée dont un attribut aumoins à une valeur très éloignée decelles des autres données)

Une telle donnée peut provenir d ’uneerreur d ’acquisition; elle peut aussirévéler une exception utile...

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Fonctions multiples

QUITTER><

Utilisation de plusieurs fonctions de fouille simultanément ou succes-sivement

dans GRAMS, le regroupement (selon le rendement)est utilisé pour définir un « seuil de pertinence »Ce seuil est utilisé à son tour pour optimiser laconstruction des réseaux de schémas réactionnels,par généralisation/classification.

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Mesures d ’intérêt

QUITTER><

Un processus de fouille de données est une « boîte noire » qui peut déceler de très nombreux motifs ou« connaissances » dans les données fournies.Il faut filtrer les connaissances apprises.

Une connaissance apprise automatiquement estintéressante si elle est :- facile à comprendre par les utilisateurs- originale ou inattendue- potentiellement utile- fiable sur un échantillon représentatif

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Types de méthodes

QUITTER><

Méthodes prédictives :prédire la valeur de certains attributs en fonction d ’autres attributs

Méthodes descriptives :découvrir des « motifs » permettant de comprendre l ’organisation desdonnées

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3)Fouille de données

et OLAP

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Outils en ligne de traitementanalytique des données

QUITTER><

(un peu hors-sujet ici, mais faut pas mourir idiot…)

OLAP: On-Line Analytical Processing

s ’appliquent plutôt à des « entrepotsde données »

(vs OLTP: On-Line Transaction Processingsur les BD relationelles)

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Qu ’est-ce c ’est qu ’un« entrepôt de données » ?

QUITTER><

(ou Data Warehouse )• Une base de données décisionnelle(vs transactionnelle),pouvant intégrerplusieurs bases de données opérationnelles. • Pas d ’accès répétitifs mais desrequêtes souvent très complexes.• Typiquement, les données sont desdonnées historiques ou consolidées(vs données courantes, opérationnelles)

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Modélisation desentrepôt de données

QUITTER><

comme pour les BD, modèles relationnelsen forme d ’étoiles, de flocons de neige ou deconstellation :

REACTION

Reaction_idCreateur_id

GCR_idCondition_idSolvant_id

Catalyseur_idrdt_sup, inf

ReacteurCommentaires

Catalyseur

Catalyseur_idMolecule_id

Nb_molecules

Condition

Condition_idAtmosphère

pH_min, maxTemp_min, max

Temp_variaDurée_min, max

DiversReflux Solvant

Solvant_idMolecule_id

Nb_molecules

GCR

GCR_idCreateur_idtopo_GCRform_GCR

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Outil typique de visualisation/décision: le cube de données

QUITTER><

Description de systèmes polycycliques

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QUITTER><

• projeter en 2 dimensions

• pivoter le cube

• utiliser une hiérarchie conceptuellepour obtenir des informations plusrésumées (« roll up ») ou pour augmenterle niveau de détails(« drill down »)

Principales fonctionssur les cubes OLAP

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QUITTER><

• Limitée aux variables de type numériqueou catégoriel (mois de l ’année, pays, etc.)

• Bien adapté au domaine de l ’entreprise(comptabilité, gestion, …)

Limitation destechniques OLAP

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4)prétraitement des

données

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Architecture d ’un système defouille de données

QUITTER><

Procédures de prétraitement

Moteur de fouille de données

Procédures d’évaluation

Base deconnaissances

Base de données

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0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

Choix desobjectifs

Prétraitement Fouille dedonnées

Analyse desrésultatsEvaluation

D ’après: Bhattacharyya University of Illinois at Chicago

Coût du prétraitement dansle processus d ’EBCD

QUITTER><

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Critères de qualité des données

QUITTER><

• consistance• complétude• précision• homogénéïté• accessibilité• interprétabilité, ...

La qualité de l ’apprentissage dépend de la qualité des données

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Les étapes du prétraitement

QUITTER><

• le « nettoyage » des donnéescomplètement des données manquantes,élimination des points aberrants, lissage,élimination des doublons,...

• l ’intégrationfusion de diverses sources de données

• les transformationschoix de représentations (interfaces), mises à

l ’échelle, normalisation, etc.

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QUITTER><

• Incomplétude des données :données non disponibles lors de l’acquisitiondonnées non pertinentes dans le contexte de la BD.

• bruit ou erreurs :protocole d’acquisition impréciserreurs de saisie

• Inconsistance :hétérogénéïté des sources de donnéeserreurs de saisie

Les causes d ’erreurs ?

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QUITTER><

• Elimination des données incomplètes

• Complètement automatique (valeur par défaut, valeur moyenne, procédure ad-hoc)

• Complètement manuel

Traitement des données manquantes

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Complètement des données manquantes : valeur par défaut

QUITTER><

dans les BD de réactions, la pression est souvent omise dans la description des conditions réactionnelles :

--> on peut généralement compléter par « pression normale »

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Complètement des données manquantes: procédure ad-hoc

QUITTER><

O

P

NO

O

O

+ +

N

O

27%

toluènereflux

PO+

Compléter la relation d’appariement atomique Ajout des réactants et des produits implicites

P

NO

O

O NO

O

+27%

toluènereflux

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QUITTER><

• Protocole de saisieDans les bases ISIS (MDL), le champs « rendement » indique parfois les rendements extrêmes de plusieurs exemples.

• Modélisation du domainecatalyseurs/réactifs, réactions mono/multi-étapes

• AlgorithmesDans les bases ISIS (MDL), la procédure d ’appariement des atomes est automatisée. On a relevé de nombreux exemples d ’appariements faux (notamment dans les cas de réarrangement)

Origine des bruits dans les BD

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04/01/2003 42

QUITTER><

• détection des données « suspectes »

- tri et partitions- régressions- regroupements (clustering)

• traitement- élimination- lissage- interactif

Traitement des données bruitées

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04/01/2003 43

QUITTER><

toutes les données nécessaires à la fouille ne sont pas nécessairement présentes dans un seul lieu.

applications en structure/activitédonnées physico-chimiques Beilstein+ données structurales CSD

Intégration des données : pourquoi ?

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04/01/2003 44

QUITTER><

jonction : une même entité peut ne pas avoir le même nom dans deux sources de données

homogénéïté : unités de mesures, échelles,...

Intégration des données : difficultés

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04/01/2003 45

QUITTER><

• Pas de fouille sans modèle du domaine (ontologie, schéma conceptuel).

• Une représentation adaptée conditionne l ’efficacité du système

• réduction des attributs : optimisationdu processus de fouille

Transformation des données :modèle et représentation

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QUITTER><

normalisation gaussienne :

V - Vσv

V’ =Moyenne =0Ecart-type =1

normalisation min-max, par échelle décimale, etc.

Transformation des données :normalisation

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04/01/2003 47

QUITTER><

• méthodes paramétriquesPartant d ’un modèle donné, ne

retenir que les attributs reconnus comme pertinents (PCA, régression, etc.)• méthodes non-paramétriques

Pas d ’hypothèses sur les modèles (histogrammes, regroupements, etc.)

Réduction du nombre d ’attributs

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QUITTER><

• Les données étant initialement dans un espace de dimension N, trouver un espace de dimension N’ <N (chaque vecteur directeur est une combinaison linéaire des vecteurs initiaux) tel que la perte d ’information soit minimale

• ne fonctionne qu ’avec des attributs de type numérique• perte potentielle d ’interprétabilité

Analyse par Composantes Principales

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QUITTER><

• identifier une droite modélisant le comportement global de données bi-dimensionnelles

y = ax + bles coefficients a et b sont généralement déterminés par la méthode des moindres carrés.

• ne fonctionne qu ’avec des attributs de type numérique

Analyse par régression linéaire (I)

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QUITTER><

xx

xx

x

xx

xx

xx

x

xx

xx x

x

Ancien X

Ancien Y Nouvel attribut

Analyse par régression linéaire (II)

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04/01/2003 51

QUITTER><

• généralisation de la régression linéaire.Cette fois-ci, y dépend de plusieurs autres variables :

y = a0 + a1x1 + a2x2 + ...

• ne fonctionne qu ’avec des attributs de type numérique

Analyse par régression multi-linéaire

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QUITTER><

• partitionner un espace continu en intervalles. La valeur de l ’attribut devient le numéro de l ’intervalle.

Pb potentiel de pertinence aux frontières

discrétisation

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QUITTER><

• partitionner un ensemble de valeurs en classes. La valeur de l ’attribut devient le descripteur de la classe.

Ne s ’applique pas aux variables uniformément réparties ou globalement trop proches.

Regroupement (clustering)

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QUITTER><

• si une hiérarchie de concepts est disponible pour un attribut, on peut réduire la complexité de la représentation en remplacant une donnée de bas niveau par un concept de plus haut niveau

ex: remplacer la température (numérique) d ’une réaction par l’une des valeurs: {très froid, froid, tempéré, chaud, très chaud}

Hiérarchie de concepts

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QUITTER><

Il ne s ’agit plus de réduire le nombre d ’attributs (la description) mais le nombre de données.La difficulté est de sélectionner un sous-ensemble représentatif de l’ensemble des données. Cela ne peut généralement se faire que si l ’on connaît une partition en classes (l’échantillon doit respecter le pourcentage de chaque classe)

Echantillonage

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04/01/2003 56

5)association

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04/01/2003 57

QUITTER><

• Objectif :établir des associations (corrélations ou relations de causes à effets) entredes données.

• une des fonctions majeures de lafouille de données (très nombreusesapplications…)

ASSOCIATION

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QUITTER><

Comment organiser au mieux les rayons d’un grand magasin ? (en fonction des corrélations observéesdans les factures des clients)

Comment composer un catalogue de façon à ce que sa consultation soit « naturelle » ?

Mais aussi : quel est le meilleur solvant (le plus utilisé)pour un type de réactions donné ? Peut-on corréler laprésence d ’un fragment moléculaire et l ’observation depropriétés physico-chimiques ? Etc.

Associations: quelques exemples

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04/01/2003 59

QUITTER><

L ’affirmation « A⇒B » est-elle utile et fiable ?(A et B étant des prédicats sur les données)

• support: p(A∧B)• confiance: p(B|A) = p(A ∧ B)/p(A)

Ss-populationVérifiant A

« A⇒B » est une associationpertinente si et seulement sison support et sa confiancesont supérieurs à desseuils donnés (minsup et minconf)

Mesures classiques d ’intérêtdes règles d ’association

Ss-populationVérifiant B

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QUITTER><

Idée: un seul indicateur de l’intérêt d’une règle

Conviction(A ⇒ B) = p(A)*p(¬ B)/p(A ∧ ¬B)(« est-ce que A est peu présent sans B » ?)

• Varie entre 1 (si A et B sont indépendants) et +∞ (si A ⇒ B)• Plus la conviction est forte, « meilleure » est la règle

• Moins utilisée que support/confiance, parce que d’interprétation moins intuitive •Repose sur l’équivalence entre :

A⇒B ¬A∨B ¬ (A∧ ¬ B)

Mesure moins utilisée : la conviction

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QUITTER><

Mesures subjectives :

• utilité : peut-on exploiter cetteassociation ?

• caractère inattendu ...

Autres mesures d ’intérêtdes règles d ’association

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QUITTER><

Règles d ’associationet motifs fréquents

Chaque individu de la population peut contenir des motifs de bases prédéfinis : I1, I2, …, In

On cherche à établir des règles d’association du type

{Ij1, …, Ijk} ⇒ {Il1, …,Ilm }

C’est à dire « si un individu contient les motifs Ij1, …, Ijk , alors il contient aussi Il1, …,Ilm , avec une bonne probabilité »

Exemple : Population = factures d’un hypermarchéRègle: {choucroute} ⇒ {knacks, waedele, riesling}

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04/01/2003 63

QUITTER><

Evaluation des règles basées sur les motifs fréquents

Support (A,B ⇒ C,D,E) = % des individus contenant A,B,C,D,E

K-motif fréquent :support (I1, I2, …, Ik ) ≥ minsup

Confiance (A,B ⇒ C,D,E) = p(C,D,E | A,B)

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04/01/2003 64

QUITTER><

principe: pour qu ’un motif (A,B)soit un motif fréquent dans les données, il faut que A et B soient eux-mêmesdes motifs fréquents.

pour qu’un motif (A,B,C)soit fréquent, il faut que (A,B), (A,C), et (B,C)soient des motifs fréquents.

Rechercher tous les motifs fréquents ?

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04/01/2003 65

QUITTER><

Soit M1 l ’ensemble des motifs fréquents observésdans les données (support > seuil); i ← 1M ← M1tant que Mi ≠ ∅

Ci+1 ← ensemble des motifs de « taille » i+1engendrés à partir de MiMi+1 ← restriction de Ci+1 aux motifs fréquentsM ← M ∪ Mii ← i+1

fin tant queretourner (M)

Algorithme « a priori »

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04/01/2003 66

QUITTER><

• La taille des ensembles de candidatscroît exponentiellement avec la tailledes motifs

• Exploration itérative de l ’ensemble des données

Problèmes de l ’algorithme« a priori »

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04/01/2003 67

QUITTER><

exploration « en profondeur d ’abord »de l ’arbre des motifs fréquents

→ convergence (beaucoup) plus rapidevers les « grands » motifs fréquents

optimisations de l ’algorithme« a priori » (I)

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04/01/2003 68

QUITTER><

Utilisation de contextes pour limiter lagénération des candidats

→ permet l ’élagage de l ’arbre decroissance des motifs.

optimisations de l ’algorithme« a priori » (II)

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04/01/2003 69

QUITTER><

R : A ⇒ B,CR’: A,B ⇒ C

Ces 2 règles ont même support.Si conf(R) > minconf, alors R est valide et R’ est redondante

De manière générale, il suffit de considérer les plus grands k-ensembles fréquents, et d’en extraire les règles de condition minimale, si elles existent. Sinon, il faut analyser les sous-ensembles.

Elimination des règles redondantes

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04/01/2003 70

QUITTER><

1) discrétiser les valeurs numériquesen ensembles d ’intervalles(techniques de regroupement)

2) considérer les prédicats :« x est dans l ’intervalle numéro i »

Associations de valeurs numériques

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04/01/2003 71

6)classification

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04/01/2003 72

Classification : objectif

• Établir un modèle ( arbre de décision, jeu de règles, formule, …) permettant de ranger des données dans une des catégories préalablement définies.

QUITTER><

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04/01/2003 73Classification etapprentissage supervisé• Lors d ’un processus de classification,

l ’apprentissage est supervisé : les classes sont connues a priori, et chaque donnée de l ’échantillon d ’apprentissage est assortie d ’un label indiquant la classe à laquelle appartient cette donnée.

• S ’oppose au « clustering » qui met en jeu un apprentissage non supervisé où le but du jeu est de découvrir une classification pertinente

QUITTER><

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04/01/2003 74

Techniques de classification

• Classification bayesienne

• arbres de décision

• k-plus proches voisins

• autres méthodes

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04/01/2003 75

Classification bayesienne

• Méthode probabiliste fondée sur le théorème de Bayes

• Largement utilisée lorsque les attributs décrivant les données sont indépendants, ou lorsque leur inter-relations sont bien connues

• Coûteuse, car nécessitant le calcul de nombreuses probabilités

QUITTER><

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04/01/2003 76

Théorème de Bayes

• On cherche à savoir pour quelle classe Ci la probabilité que X soit classé dans Ci est la meilleure : P(Ci|X) . Pour calculer cette probabilité, on utilise le théorème de Bayes:

P(Ci|X) = P(X|Ci) * P(Ci) / P(X)

• P(Ci|X) : probabilité « a posteriori » de classer X dans Ci (ce que l ’on cherche à maximiser sur l ’ensemble des classes Ci)

• P(X|Ci) : probabilité « a priori » de X sachant Ci (à évaluer d ’après l ’échantillon d ’apprentissage)

• P(Ci) : fréquence de la classe Ci sur l ’échantillon d ’apprentissage

• P(X) : indépendant des classes Ci

QUITTER><

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04/01/2003 77

Approche naïve

• Le problème revient donc à évaluer P(X|Ci) sur l ’échantillon d ’apprentissage

• Si l ’on suppose que tous les attributs xj de X sont indépendants, on a :

• P(X|Ci) = P(x1,x2,…xn|Ci) = P(x1|Ci)*P(x2|Ci)*…*P(xn|Ci)

• dans le cas d ’attributs catégoriels, P(xj|Ci) peut être estimée par la fréquence des individus ayant xj comme valeur du jième

attribut.• Dans le cas d ’attributs continus, P(x1|Ci) est estimée par une

Gaussienne.

QUITTER><

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04/01/2003 78

Un exemple classique :le match de tennis aura-t-il lieu ?

Données disponibles

P(fort| oui) = 3/5P(fort|non) = 3/9P(faible| oui) = 2/5P(faible|non) = 6/9

P(élevée| oui) = 4/5P(élevée|non) = 3/9P(normale| oui) = 2/5P(normale|non) = 6/9

P(chaud| oui) = 2/5P(chaud|non) = 2/9P(doux| oui) = 2/5P(doux|non) = 4/9P(froid| oui) = 1/5P(froid|non) = 3/9

P(pluvieux| oui) = 2/5P(pluvieux|non) = 3/9P(couvert| oui) = 0P(couvert|non) = 4/9P(soleil|oui) = 3/5P(soleil|non) = 2/9

vent

humidité

température

ciel

D ’après T. Mitchell « Machine Learning » McGraw Hill, 1997.

Probabiblités a priori

P(« oui ») = 5/14 P(« non ») = 9/14

ciel temperature humidité vent matchsoleil chaud élevée faible ouisoleil chaud élevée fort ouicouvert chaud élevée faible nonpluvieux doux élevée faible nonpluvieux froid normale faible nonpluvieux froid normale fort ouicouvert froid normale fort nonsoleil doux élevée faible ouisoleil froid normale faible nonpluvieux doux normale faible nonsoleil doux normale fort noncouvert doux élevée fort noncouvert chaud normale faible nonpluvieux doux élevée fort oui

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04/01/2003 79

Un exemple classique :le match de tennis aura-t-il lieu ?

Probabiblités a priori À partir de ces probabilités,on peut décider enfonction de la météo si un match prévu sejouera ou pas. Exemple :

X= (pluvieux, chaud, élevée, faible)

P(X| « oui ») = P(pluvieux | « oui »)* P(chaud | « oui ») * P(élevée | « oui ») * P(faible | « oui ») * P( « oui »)

= 2/5*2/5*4/5*2/5*5/14= 0,018286

P(X| « non ») = P(pluvieux | « non »)* P(chaud | « non ») * P(élevée | « non ») * P(faible | « non ») * P( « non »)

= 3/9*2/9*3/9*6/9*9/14= 0,010582

Il y a de bonnes chancesque ce match soit joué !

P(fort| oui) = 3/5P(fort|non) = 3/9P(faible| oui) = 2/5P(faible|non) = 6/9

P(élevée| oui) = 4/5P(élevée|non) = 3/9P(normale| oui) = 2/5P(normale|non) = 6/9

P(chaud| oui) = 2/5P(chaud|non) = 2/9P(doux| oui) = 2/5P(doux|non) = 4/9P(froid| oui) = 1/5P(froid|non) = 3/9

P(pluvieux| oui) = 2/5P(pluvieux|non) = 3/9P(couvert| oui) = 0P(couvert|non) = 4/9P(soleil|oui) = 3/5P(soleil|non) = 2/9

vent

humidité

température

ciel

P(« oui ») = 5/14 P(« non ») = 9/14

QUITTER><

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04/01/2003 80

Limites de la classification Bayesienne

• L ’approche « naïve » suppose que tous les attributs sont linéairement indépendants

• Si ce n ’est pas le cas, il faut connaître les relations entre les attributs et le modèle (et les calculs) sont plus complexes.

• De toutes manières, le calcul de toutes les probabilités a priori est très coûteux.

• Mais, quand elle est réalisable, la classification Bayesienne est celle qui obtient les meilleurs résultats.

QUITTER><

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04/01/2003 81

Classification par construction d ’un arbre de décision

• Un arbre de décision est une structure de type « organigramme » – chaque nœud interne est un test sur un des attributs– chaque feuille est le label d ’une classe

• La construction d ’un arbre de décision se fait par partitions récursives de l ’échantillon de données en considérant à chaque étape l ’attribut qui « partitionne le mieux » les données

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04/01/2003 82

Exemple : profil d ’unacheteur d ’ordinateur

age income student credit_rating buys_computer...30 high no fair no...30 high no excellent no31...40 high no fair yes40... medium no fair yes40... low yes fair yes40... low yes excellent no31…40 low yes excellent yes..30 medium no fair no...30 low yes fair yes40... medium yes fair yes...30 medium yes excellent yes31…40 medium no excellent yes31…40 high yes fair yes40... medium no excellent no

D ’après J. Ross Quinlan. The effect of noise on concept learning . In Ryszard S. Michalski, Jaime G. Carbonell, and Tom M. Mitchell, editors, Machine Learning: An Artificial Intelligence Approach, volume 2, chapter 6. Morgan Kaufmann, 1986.

Échantillon d ’apprentissage

QUITTER><

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04/01/2003 83

À quoi veut-on arriver ?

age?

student? credit rating?

excellent fairyesno

…30 31…40 40...

yesno noyes yes

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04/01/2003 84

Algo général de construction de l ’arbre de décision

Partition initiale:ensemble des données

Reste-t-il des partitionsoù plusieurs classes sont

présentes ?

Choisir une partition hétérogène

Reste-t-il des critèresde sélection ?

Sélectionner « le meilleur »critère d ’éclatementpour cette partition

Éclater la partition analysée selonle critère choisi

stop

stop

QUITTER><

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04/01/2003 85

Le « meilleur critère » departitionnement ?

• Intuitivement, celui qui sépare le mieux les instances des différentes classes.

• Différentes approches numériques – « gain d ’information » (Quinlan : système ID3)– index GINI (IntelligentMiner IBM)– ...

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04/01/2003 86Arbres de décision etrègles

• Il est facile d ’extraire d ’un arbre de décision des règles du type « si…alors » :

• chaque chemin de la racine à une feuille est représentée par une règle

IF age = “...30” AND student = “no” THEN buys_computer = “no”IF age = “...30” AND student = “yes” THEN buys_computer = “yes”IF age = “31…40” THEN buys_computer = “yes”IF age = “40...” AND credit_rating = “excellent” THEN buys_computer = “yes”IF age = “40...” AND credit_rating = “fair” THEN buys_computer = “no”

QUITTER><

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04/01/2003 87

surspécification

• Si l ’on pousse trop loin le processus de classification sur l ’échantillon d ’apprentissage, les définition des classes obtenues seront de peu d ’utilité car elles ne reconnaîtront plus d ’exemples en dehors de ceux de l ’échantillon.

Arrêter la classification assez tôt !

Valider la classification obtenue

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04/01/2003 88

Validation croisée

• plusieurs méthodes de validation

• la plus utilisée : validation croisée

• découper le jeu de données disponible en– échantillon d ’apprentissage 3/5– échantillon de validation 2/5

• recommencer plusieurs fois en modifiant le découpage

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04/01/2003 89

Avantages de la classification par arbres de décision

• relativement rapide

• conversion immédiate vers un jeu de règles faciles à comprendre et à utiliser

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Classification par la méthode des k plus proches voisins

• toutes les données sont représentées dans un espace vectoriel de dimension n (Rn), munie d ’une distance (distance euclidienne)

• soit à déterminer la classe d ’un vecteur X quelconque. Soient y1, y2, …,yk ses k voisins les plus proches de l ’échantillon d ’apprentissage. X sera rangé dans la classe la plus répandue parmi ces k voisins.

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04/01/2003 91

Importance du facteur k

+

+

+

•Pour k=1, est classé -

•Pour k=5, est classé +

Importance dela phase de validation

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04/01/2003 92

diagrammes de Voronoï

Les surfaces de décisionpour les 1-NN sur R2 sont

appelées diagrammes de Voronoï

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04/01/2003 93

Intérêt et limitations de la méthode kNN

• + Très simple à mettre en œuvre• + Complexité linéaire par rapport à la taille de

l ’échantillon d ’apprentissage

• - Peut nécessiter la normalisation et la pondération des attributs.

• - K est un paramètre de la méthode : critères de choix de k ?

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04/01/2003 94Classification par algorithme génétique

• les règles de classification selon la valeur des attributs peuvent être codées sous forme de chromosomes, et leur pertinence évaluée sur l ’échantillon d ’apprentissage. Elles sont optimisées selon les règles évolutionistes

• Cf. cours AG

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04/01/2003 95Classification par réseaux de neurones

• les réseaux de neurones sont par construction dédiés à la classification

• Cf. cours RN

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04/01/2003 96Autres techniques de classification

• logique floue• raisonnement à partir de cas• espace des versions• ………….

• Ne seront pas présentées ici

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04/01/2003 97

Pour les curieux• Une bible du KDD : « Advances in Knowledge Discovery and Data

Mining », U. M. Fayyad , G. Piatetsky-Shapiro , P. Smyth, R. Uthurusamy (Editors), AAAI Press/The MIT Press, 1996.

• Pour la chimie : H.M. Cartwright « Applications of Artificial Intelligence in Chemistry » Oxford University Press, 1993.

• Un site Web incontournable (mais il en a beaucoup d ’autres) : http://www.kdnuggets.com/

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