Termofilik Bacillus - Ankara Üniversitesicv.ankara.edu.tr/duzenleme/kisisel/dosyalar/...5 Son be yılda verdiği lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler: Akademik Yıl/Dönem Dersin

1

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

Adı Soyadı : Prof. Dr. Arzu ÇÖLERİ CİHAN

Doğum Tarihi : 10 Kasım 1976

Medeni durumu : Evli, iki çocuk annesi

Araştırma konuları : Mikrobiyoloji, Biyoteknoloji, Moleküler Biyoloji,

Bakteriyel Taksonomi, Enzimoloji

İletişim Bilgileri

Yazışma adresi : Ankara Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü

06100, Tandoğan, Ankara, TÜRKİYE

Telefon : +90(312)2126720 (Ofis: 1095, Lab:1158)

Fax : +90(312)2232395

E-mail : [email protected]; [email protected]

Öğrenim Durumu :

Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl

Lisans Biyoloji Bölümü Ankara Üniversitesi

Fen Fakültesi 1998

Y. Lisans Biyoloji ABD /Moleküler Biyoloji Ankara Üniversitesi

Fen Bilimleri Enstitüsü 2002

Doktora Biyoloji ABD /Moleküler Biyoloji Ankara Üniversitesi

Fen Bilimleri Enstitüsü 2007

Yüksek Lisans Tez Başlığı:

Türkiye Kaynaklı Klinik Enterococcus’ların Antibiyotik Dirençliliği

Doktora Tezi Başlığı:

Bazı Termofilik Bacillus Türlerinin Termostabil -Glukozidaz Üretim Kapasiteleri ve

Enzim/lerin Kısmi Karakterizasyonu

Yabancı dil: İngilizce (ÜDS Mart 2007 puanı: 83.750)

Akademik/meslekte deneyim:

Görev Unvanı Görev Yeri Yıl

Biyolog Bayındır Hastanesi, Ankara 1998-2002

Ar.Gör. Ankara Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü 2002-2007

Ar.Gör.Dr. Ankara Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü 2007-2012

Doç. Dr. (Ünvan) Ankara Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü 26.06.2012

Doç. Dr. (Kadro) Ankara Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü 2013-2018

Prof. Dr. Ankara Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü 2018-devam

2

Diğer akademik faaliyetler:

Son 5 Yılda Uluslararası İndekslere Kayıtlı Makale/Derleme İçin Yapılan

Danışmanlık Sayısı 8

Son 5 Yılda Uluslararası İndekslere Kayıtlı Dergilerde Yapılan Editörlük Sayısı -

Son Bir Yılda Projeler İçin Yapılan Danışmanlık Sayısı 1

Kendi Yayınları Dışında Yayınlara Alınan Toplam Atıf Sayısı (web of Science’a

göre, 26.09.2018), 140

Yayınların h-indeksi 10

Danışmanlık Yapılan Öğrenci Sayısı

Tamamlanan Devam Eden

Tezsiz Yüksek Lisans 1 3

Tezli Yüksek Lisans 1 1

Doktora 2 4

Tamamlanan Tezsiz Yüksek Lisans/Tezli Yüksek Lisans/Doktora Tezleri:

1) Melih KOÇ, “Geobacillus Türlerinde Termostabil Lipaz Üretimi”A.Ü. Fen Bilimleri

Enstitüsü, Tezli Yüksek Lisans, Ocak 2013.

2) Seçil Saran OKTAŞ, “Rekombinant Aşılar Ve Kullanım Alanları” A.Ü. Fen Bilimleri

Enstitüsü, Tezsiz Yüksek Lisans, Kasım 2015.

3) Ayşe Hümeyra TAŞKIN KAFA, “Karbonik Anhidraz Enziminin Deinococcus

radiodurans'dan Klonlanması, Ekspresyonu ve Biyokimyasal Karakterizasyonu” A.Ü.

Fen Bilimleri Enstitüsü, Doktora, Aralık 2016.

4) Tuğba KILIÇ, “Yüksek Miktarda Biyofilm Oluşturan Termofilik Basillerin Çeşitli

Yüzeylerdeki Biyofilm Yapılarının Analizi ve Biyofilmin Giderimi ile Biyokorozyonun

Önlenmesi” A.Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Doktora , Aralık 2016.

Yönetilmekte Olan Tezsiz Yüksek Lisans/Tezli Yüksek Lisans/Doktora Tezleri:

1) Duygu Ekin ERTÜRK, A. Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Tezsiz Yüksek Lisans

2) Fatih USTA, A. Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Tezsiz Yüksek Lisans

3) Hazal BAYRAM, A. Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Tezsiz Yüksek Lisans

4) Ayşe Büşra KARAKAYA, A. Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Tezli Yüksek Lisans (Ders aşamasında)

5) Ayşim Bengü KÜÇÜKAKKAŞLAR, A. Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Doktora (Ders

aşamasında)

6) Başar KARACA, “Farklı Çevresel Koşulların Süt Ürünleri Endüstrisinde Sorun Teşkil

Eden Geobacillus ve Anoxybacillus Biyofilmleri Üzerine Olan Etkilerinin ve Biyogiderim

Mekanizmalarının Belirlenmesi” A. Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Doktora (Tez aşamasında)

7) Ergin ŞAHİN, “Kırım Kongo Kanamalı Ateşi Virüsü İçin Bir Bir DNA Tabanlı Aşı

Geliştirilmesi” A. Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Doktora (Tez aşamasında)

3

8) Emine YILDIZ DERABAY “Yeni türler oldukları öngörülen amilaz üreticisi termofilik

Anoxybacillus izolatlarının fenotipik, kemotaksonomik ve moleküler taksonomik

yaklaşımlar kullanılarak teşhisi”A. Ü. Biyoteknoloji Enstitüsü, Doktora (Tez

aşamasında)

Projelerde Yaptığı Görevler:

1- Arzu Çöleri Cihan, Birgül Özcan, Sencer Buzrul, Başar Karaca. “Süt Endüstrisinde

Termofilik Basillerin Biyofilm Oluşumlarının ve Biyofilm-Spor Giderimlerinin

Mikrobiyolojik, Mikroskopik ve Moleküler Biyolojik Tekniklerle İncelenmesi”

TÜBİTAK 1001 Araştırma Projesi, KBAG, Proje no: 116Z422, 2017-2020 (36 ay,

devam ediyor), Proje yürütücüsü.

2- Özlem Yıldırım, Naznoosh Shomalı Moghaddam, Nergiz Demirtaş” Karadeniz

bölgesinden toplanan bazı yenilebilir mantar türlerinin biyokimyasal içerikleri ve

biyolojik aktivitelerinin değerlendirilmesi” TÜBİTAK 3001 Araştırma Projesi,

KBAG, Proje no: 116Z125, 2017-2019 (18 ay, devam ediyor), Proje

danışmanı.

3- Arzu Çöleri Cihan, Emine Derebay Yıldız, Başar Karaca, Ergin Şahin. “Termofilik

Anoxybacillus türlerinde α–amilaz genlerinde yapısal ve işlevsel genomik

çalışmalar.” Ankara Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi, Hızlı Destek

projesi, Proje no: 16H-04300019, 2016-2017 (1 yıl, tamamlandı), Proje

yürütücüsü.

4- Arzu Çöleri Cihan, Birgül Özcan. “Yeni türler oldukları öngörülen α-amilaz üreticisi

termofilik Anoxybacillus izolatlarının fenotipik, kemotaksonomik ve moleküler

taksonomik yaklaşımlar kullanılarak teşhisi”. TÜBİTAK 3001 Araştırma Projesi,

SBAG, Proje no 115R001, 2015-2017 (18 ay, tamamlandı), Proje yürütücüsü.

5- Arzu Çöleri Cihan, Cumhur Çökmüş, Tuğba, Kılıç, Melih Koç, Beste Özel. "Termofilik

basillerin çeşitli yüzeylerde biyofilm oluşturmaları ve biyofilm yapılarının

giderimiyle biyokorozyonun önlenmesi ". Ankara Üniversitesi Bilimsel Araştırma

Projeleri Birimi, Proje no: 14B-0430003, 2014-2016 (2 yıl, tamamlandı), Proje

yürütücüsü.

6- Arzu Çöleri Cihan, Cumhur Çökmüş, Tuğba, Kılıç, Beste Özel. "Termofilik basillerde

biyofilm oluşumu ve giderimi". Ankara Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri

Birimi, Hızlı Destek projesi, Proje no: 14H-0430007, 2014-2015 (1 yıl,

tamamlandı), Proje yürütücüsü.

7- Hakan Akbulut, Fikri İçli, Y. Murat ELÇİN, Arzu Çöleri Cihan. Kanser tedavisinde

mezenkimal kök hücre aracılı intihar gen tedavisi. TÜBİTAK Projesi, SBAG-

111S241, 2011-2013 (30 ay, tamamlandı), Yardımcı araştırıcı.

8- Cumhur Çökmüş, Arzu Çöleri Cihan, Nilgün Tekin, Melih KOÇ. Türkiye’den izole

edilen Bacillus ve Geobacillus cinsi izolatların alkalen proteaz ve lipaz üretim

kapasitelerinin belirlenmesi ve izolatların taksonomik sınıflandırılması. Ankara

Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi, Proje no: 11B4240003, 2011-

2013 (2 yıl, tamamlandı), Yardımcı araştırıcı.

9- Cumhur Çökmüş, Arzu Çöleri. Türkiye’den izole edilen çok sayıda termofilik Bacillus

spp. izolatının polifazik bir yaklaşımla taksonomik analizi ve termostabil α-

glukozidaz üreten yeni türlerin fenotipik ve moleküler genetik yöntemlerle

tanımlanması. TÜBİTAK Alt Yapı Destekleme Projesi, Proje no: TBAG/HD-320

(107T286), 2007-2008 (1 yıl, tamamlandı), Yardımcı araştırıcı.

4

10- Hakan Akbulut, Fikri İçli, Arzu Çöleri, Günce Şahin. Kanserde Viral Vektörlerle

Hedefe Yönlendirilmiş Kemoimmünoterapi. TÜBİTAK Projesi, Proje no: SBAG

105S093-75, 2006-2009 (3 yıl, tamamlandı), Bursiyer

11- Cumhur Çökmüş, Arzu Çöleri. Termofilik Bacillus türlerine ait termostabil -

glukozidaz enzim/lerinin karakterizasyonu. TÜBİTAK Alt Yapı Destekleme Projesi,

Proje no: TBAG-HD126 (105T039), 2005-2006 (1 yıl, tamamlandı), Yardımcı

araştırıcı.

12- Cumhur Çökmüş, Serpil Takaç, Nilgün Tekin, Arzu Çöleri. Türkiye kaynaklı Bacillus

spp.’lerin alkalen proteaz üretim kapasiteleri ve enzim/lerin kısmen

karakterizasyonu. Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü Projesi, Proje no:

2004-133, 2004-2007 (3 yıl, tamamlandı), Yardımcı araştırıcı.

Diğer Görevler:

Bilim Danışmanlığı Eğitimi TÜBİTAK Bilim İnsanı Destekleme Dairesi, Moleküler

Biyoloji Uygulaması Alanında Bilim Danışmanlığı

Eğitmeni (18-30 Haziran 2012)

Görevlendirme A. Ü. Tıp Fakültesi Tıbbi Onkoloji Gen Tedavisi

Araştırma Laboratuvarı’nda (TÜBİTAK SBAG-

111S241) Proje Süresince Görevlendirmeyle Çalışma,

(03.01.2012)

Denetleme Kurulu Asıl Üyeliği Biyoteknoloji Derneği (2010-devam)

Yedek Üyelik Sağlık Bakanlığı, Temel Sağlık Hizmetleri Genel

Müdürlüğü, Ruhsatlandırma ve Değerlendirme

Komisyonu (2008-2009)

Görevlendirme A. Ü. Tıp Fakültesi Tıbbi Onkoloji Gen Tedavisi

Araştırma Laboratuvarı’nda (TÜBİTAK, TBAG-HD126

(105T039)) Proje Süresince Görevlendirmeyle

Çalışma, (10.04.2006)

Görevlendirme Biyoloji Bölümü’nün Yeni Web Sayfasının

Oluşturulması (13.11.2012)

İdari Görev A. Ü. Fen Faültesi B.yoloji Bölüm Başkan Yardımcılığı

(08.11.2017)

Bilimsel Kuruluşlara Üyelikler:

Biyoteknoloji Derneği Üyeliği (2009-devam)

Ödüller ve Burslar:

1- TÜBİTAK Tarafından Uluslararası Bilimsel Yayınlara Verilen Teşvik Ödülleri

(Aralık/Şubat 2010, Kasım 2013)

2- “Kanserde Viral Vektörlerle Hedefe Yönlendirilmiş Kemoimmünoterapi” Adlı TÜBİTAK

Araştırma Projesi (Proje no: SBAG-105S093-75) Kapsamında, 3 yıl Süreyle Yurt İçi Doktora ve Doktora Sonrası Araştırma Bursu (2006-2009)

5

Son beş yılda verdiği lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler:

Akademik

Yıl/Dönem

Dersin

Kodu Dersin Adı Dersin Grubu

Lisans/

Lisansüstü

2012-2013

Bahar

BİY 210 Genel Mikrobiyoloji II B grubu Lisans

BİY 260 Genel Mikrobiyoloji Lab II B grubu Lisans

BİY 208 Moleküler Biyoloji II C grubu Lisans

804543 Moleküler Genetik - Lisansüstü

804556 Biyoteknolojide Gen

Manipulasyonları - Lisansüstü

2013-2014

Güz

BİY 101

Genel Biyoloji I

I. Eğitim A-B-C

grupları (4/12)

ve

II. Eğitim D

grubu (1/4)

Lisans

BİY 151 Genel Biyoloji I Laboratuvarı

I. ve II. Eğitim

(B ve D grubu) Lisans




2013-2014

Bahar



804543 Moleküler Genetik - Lisansütü



6

Akademik

Yıl/Dönem

Dersin

Kodu Dersin Adı Dersin Grubu

Lisans/

Lisansüstü

2014-2015

Güz

BİY 101

Genel Biyoloji I

I. Eğitim A-B

grupları (2/8) ve

II. Eğitim D

grubu (1/4)

Lisans

BİY 151 Genel Biyoloji I Laboratuvarı B grubu (1/2) Lisans

BİY 209 Genel Mikrobiyoloji I I. ve II. Eğitim

(A ve D grubu) Lisans

BİY 259 Genel Mikrobiyoloji I Lab I. ve II. Eğitim


BİY 431 Sağlık Mikrobiyolojisi I. ve II. Eğitim


MDM

101

Medical Microbiology - Lisans




2015-2016

Güz

BİY 209 Genel Mikrobiyoloji I B grubu Lisans

BİY 259 Genel Mikrobiyoloji Lab I B grubu Lisans



MDM

101




2015-2016

Bahar



BİY 440 Mikrobiyal Biyoteknoloji I. ve II. Eğitim





2016-2017

Güz

BİY 209 Genel Mikrobiyoloji I B grubu Lisans

BİY 259 Genel Mikrobiyoloji Lab I B grubu Lisans



MDM

101


804592 Mikroorganizmalarda Teşhis

Yöntemleri - Lisansüstü



2016-2017

Bahar



BİY 440 Mikrobiyal Biyoteknoloji - Lisans




7

ESERLER

A. Uluslararası hakemli dergilerde yayımlanan makaleler:

YAYINLARI

SCI, SSCI, AHCI indekslerine giren dergilerde yayınlanan uluslararası makaleler

Not: Corresponding yazar olunan yayınlar “*” ile işaretlenmiştir.

A1. Cihan A.C., Yildiz D.,E. Sahin, E., Mutlu, O. “Introduction of novel thermostable α-

amylases from genus Anoxybacillus and proposing to group

the Bacillaceae related α-amylases under five individual GH13 subfamilies”

World J Microbiol Biotechnol.) 34: 95, doi: https://doi.org/10.1007/s11274-018-2478-8, 2018. *

A2. Cihan, A. C., Karaca, B., Ozel P.B., and Kilic, T. “Determination of the biofilm

production capacities and characteristics of members belonging to Bacillaceae

family” World J Microbiol Biotechnol. 33:118, 1-13, 2017. *

A3. Kilic, T., Karaca, B., Ozel B.P1, Ozcan B., Cumhur C., Cihan A.C. “Biofilm

characteristics and evaluation of the sanitation procedures of thermophilic

Aeribacillus pallidus E334 biofilms” Biofouling, 33:4, 352-367, 2017. *

A4. Tekin, N., Cihan, A. C., Karaca, B., and Cokmus, C,. “A Comparative Study:

Taxonomic Grouping of Alkaline Protease Producing Bacilli” Polish Journal of

Microbiology, 66(1), 39-56, 2017.

A5. Aktaş, S. H., Akbulut, H, Elçin A.E, Parmaksız M., Keskin A.A., Cihan A.Ç., Elçin,

Y.M, İçli F. Baculoviral vector loaded mesenchymal stem cells as efficient gene

therapy tools for cancer treatment” Turk. J. Biol., doi:10.3906/biy-1601-76. 40,

1601-1676, 2016.

A6. Koc, M., Cokmus, C., Cihan, A. C. “The genotypic diversity and lipase production of

some thermophilic bacilli from different genera.” Brazilian Journal of

Microbiology. 46, 1065-1076. doi:10.1590/S1517-838246420140942, 2015.*

A7. Cihan, A. C., Cokmus, C., Koc, M., Ozcan, B. “Anoxybacillus calidus sp. nov., a novel

thermophilic bacterium isolated from a soil near a thermal power plant.” Int J

Syst Evol Microbiol. doi: 10.1099/ijs.0.056549-0. 64, 211-219, 2014. *

A8. Cihan, A. C., Koc, M., Ozcan, B, Tekin, N., and Cokmus, C,. “Thermolongibacillus

altinsuensis gen. nov., sp. nov. and Thermolongibacillus kozakliensis sp. nov.,

novel aerobic thermophilic long bacilli isolated from hot springs.” Int J Syst Evol

Microbiol. doi: 10.1099/ijs.0.053280-0. 64, 187-197, 2014. *

A9. Cihan, A. C. “Taxonomic Classification of Anoxybacillus Isolates from Geothermal

Regions in Turkey by 16S rRNA Gene Sequences and ARDRA, ITS-PCR, Rep-PCR

Analyses.” Polish Journal of Microbiology, 62, 149-163, 2013. *

A10. Tekin, N., Cihan, A.Ç, Takaç, Z.S., Tüzün, C.Y., Tunç, K. and Çökmüş, C. “Alkaline

protease production of Bacillus cohnii APT5.” Turk. J. Biol., 36, 430-440, 2012.

A11. Ozcan, B., Ozyilmaz, G., Cihan, A., Cokmus, C., and Caliskan, M. “Phylogenetic

analysis and characterization of lipolytic activity of halophilic archaeal ısolates.”

Microbiology, doi:10.1134/S0026261712020105, 81, (2), 186-194, 2012.

A12. Cihan, A.C., Tekin, N., Ozcan, B., and Cokmus, C. “ The genetic diversity of genus

Bacillus and the related genera revealed by 16S rRNA gene sequences and

8

ARDRA analyses isolated from geothermal regions of Turkey.” Brazilian J. Microbiol., 43 (1), 309-324, 2012. *

A13. Cihan, A.C., Benli, M., and Cokmus, C. “Purification and characterization of

intracellular and extracellular α-glucosidases from Geobacillus toebii strain

E134.” Cell Biochem. Funct., doi: 10.1002/cbf.1820, 30(1), 69-81, 2012. *

A14. Cihan, A.C., Ozcan, B., Tekin, N., and Cokmus, C. “Phylogenetic diversity of

isolates belonging to genera Geobacillus and Aeribacillus isolated from different

geothermal regions of Turkey.” World J. Microbiol. Biotechnol., doi:

10.1007/s11274-011-0742-2, 27, 2683-2696, 2011. *

A15. Ozcan, B., Esen, M., Calıskan, M., Mothana, R.A., Cihan, A.C. and Yolcu, H.

“Antimicrobial and antioxidant activities of the various extracts of Verbascum

pinetorum Boiss. O. Kuntze (Scrophulariaceae).” Eur. Rev. Med. Pharmacol. Sci.,

15, 900-905, 2011.

A16. Cihan, A.C., Ozcan, B, and Cokmus, C.” Anoxybacillus salavatliensis sp. nov., an α-

glucosidase producing, thermophilic bacterium isolated from Salavatli, Turkey.”

J. Basic Microbiol., doi: 10.1002/jobm.201000115, 51(2), 136-146, 2011.

A17. Cihan, A.C., Ozcan, B., Tekin, N., and Cokmus, C. “Geobacillus thermodenitrificans

subsp. calidus, subsp. nov., a thermophilic and α-glucosidase producing

bacterium isolated from Kizilcahamam, Turkey.” J. Gen. Appl. Microbiol., 57(2),

83-92, 2011. *

A18. Ozcan, B., Esen, M., Sangun, M.K., Coleri, A., and Caliskan, M. “Effective

antibacterial and antioxidant properties of methanolic extract of Laurus nobilis

seed oil.” J. Environ. Biol., 31(5), 637-641, 2010.

A19. Ozcan, B., Esen, M., Coleri, A., Yolcu, H., and Caliskan, M. “In vitro antimicrobial

and antioxidant activities of various extracts of Salvia microstegia (Boiss.) et.

bal. from Antakya, Turkey.” Fresen. Environ. Bull., 18(5a), 658-662, 2009.

A20. Coleri, A. Cokmus, C., Ozcan, B., Akkoc, N., and Akcelik, M. “Isolations of α-

glucosidase-producing thermophilic bacilli from hot springs of Turkey.”

Microbiology, 78(1), 56-66, 2009, (Doktora tezinden).

A21. Cihan, A.C., Cokmus, C., Ozcan, B. “Characterization of thermostable α-

glucosidases from newly isolated Geobacillus sp. A333 and thermophilic

bacterium A343.” World J. Microbiol. Biotechnol., 25(12), 2205-2217, 2009

(Doktora tezinden).

A22. Ozcan, B., Ozcengiz, G., Coleri, A., and Cokmus, C. “Diversity of halophilic

Archaea from six hypersaline environments in Turkey.” J. Microbiol. Biotechnol.,

17(6), 985-992, 2007.

A23. Ozcan, B., Cokmus, C., Coleri, A., and Calıskan, M. “Characterization of extremely

halophilic Archaea isolated from saline environment in different parts of Turkey.”

Microbiology, 75(6), 739-746, 2006.

A24. Coleri, A., Cokmus, C., Ozcan, B., Akcelik, M., and Tukel, C. “Determination of

antibiotic resistance and resistance plasmids in clinical Enterococcus species.” J.

Gen. Appl. Microbiol., 50(4), 213-219, 2004 (Yüksek lisans tezinden).*

9

Senato tarafından kabul edilen ve SCI, SSCI, AHCI indeksleri dışındaki diğer

uluslararası alan indekslerinde taranan bilimsel hakemli dergilerde yayınlanan

makaleler

Not: Corresponding yazar olunan yayınlar “*” ile işaretlenmiştir.

A25. Ozdemir, C. S., Cihan, A. C., Kilic, T. and Cokmus, C,. “Optimization of

thermostable alpha-amylase production from Geobacillus sp. D413” Journal of

Microbiology, Biotechnology and Food Sciences. doi:

10.15414/jmbfs.2016.6.1.689-694. 6(1), 689-694, 2016.

A26. Ozel, P.B, Kilic, T., Karaca B., Yildiz, E.D., Cokmus, C. and Cihan, A.C. “Productive

biofilms from mesophilic to thermophilic endospore-forming bacilli for industrial

applications” Journal of Microbiology, Biotechnology and Food Sciences. doi:

10.15414/jmbfs.2017.7.1.14-21. 7(1), 14-21. 2017. *

B. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings)

basılan bildiriler:

B1. Karaca B., Cihan A.C., Karakaya AB, “Extracellular DNA in Geobacillus and

Anoxybacillus”, Biofilms 8, Denmark, P10, page 69, 27-29 May 2018

B2. Karaca B., Karakaya AB, Cihan A.C. “Effects of Milk Fat Content and Abiotic Surfaces

on Geobacillus biofilms Biofılms” Biofilms 8, Denmark, P148, page 107, 27-29

May 2018

B3. Cihan A.C., Karaca, B., Karakaya A.B., Akata I, Altuner E.M. “Antibiofilm effects of

three macrofungi (Morchella angusticeps, Trametes versicolor, Lactarious

delicious) on Enterococcus faecalis” 1st International Congress on Medical and

Aromatic Plants, Konya, ID-812, pages 908-909, 10-12 May 2017

B4. Cihan A.C., Karaca, B., Altuner E.M., Akata I, Yıldırım O. “Synergism between

Lactarious delicious and vancomycin against vancomycin-resistant

Enterococcus faecium” 1st International Congress on Medical and Aromatic

Plants, Konya, ID-815, pages 912-913, 10-12 May 2017

B5. Karaca, B., Moghaddam N.S., Karakaya A.B., Cihan A.C., Yıldırım O. “Evaluation of

Pleurotus ostreatus extracts for its potential antibiofilm activity”

1st International Congress on Medical and Aromatic Plants, Konya, ID-817,

pages 916-917, 10-12 May 2017

B6. Sahin, E., Cihan A.C, Ozkul A. “In Vitro Expression Of Cchfv

Surface Glycoprotein Gc Via A Plasmid Vector Generated As Dna Based

Vaccine, Oral presentation, International Conference On Crimean Congo

Haemorrhagic Fever, in Thessaloniki, Greece, 10-12 September 2017

B7. Akbulut H., Aktas S.H., Elcin A.E., Parmaksiz M., Keskin A.A, Cihan A.C, Elcin Y.M.,

and Icli M. “Mesenchymal stem cell directed baculoviral gene therapy of colon cancer.“

2016 ASCO (American Society of Clinical Oncology) Annual Meeting, McCormick

Place, Chicago, Illinois, USA, (J. Clin. Oncol., 34, 2016, suppl; abstr e14573), 3-

7th June 2016.

B8. Kilic T., Ozel P.B., Karaca B., Ozcan B., and Cihan, A.C. “Determination of biofilm

characteristics and evaluation of the sanitation procedures on biofilms of

thermophilic Aeribacillus pallidus” Biofilms 7, Porto, P3:17, 26th-28th June

2016

10

B9. Ozel P.B., Kilic T., Karaca B., Cokmus C, and Cihan, A.C. “Brevibacillus thermoruber

B93: a remarkable biofilm producing strain for further industrial applications”

Biofilms 7, Porto, P2:31, 26th-28th June 2016

B10. Taşkın Kafa A.H., Kuzucu M., Çankaya M., Cihan A.Ç. “Purification, partial

biochemical characterization and determination of activity at different pH

values of carbonic anhydrase gamma from Deinococcus radiodurans’’ 4th

International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey, P5, page

48, Middle East Technical University, Ankara, TURKEY, 27-29 November

2015.

B11. Tekin, N., Cihan, A.C., and Cokmus C. “Taxonomic classification and alkaline

protease production capacities of the alkaliphilic endospore-forming bacilli from

Turkey”. 15th EUROPEAN CONGRESS on BIOTECHNOLOGY of the European

Federation of Biotechnology-ECB15, İstanbul, TURKEY, 23-26 September

2012

B12. Cihan, A.C., Cokmus, C., and Ozcan., B. “Screening of thermophilic bacilli isolated

from hot springs in Turkey for α-glucosidase production and characterization of

enzymes.” International Symposium on Biotechnology: Developments and

Trends (BIOTECH METU 2009), page 33, Middle East Technical University,

Ankara, TURKEY, 27-30 September 2009

B13. Ozcan, B., Ozyilmaz, G., Cokmus, C., Caliskan, M., Coleri, A., and Gulyanar, S.

“Characterization of lipolytic activity of selected Archaeal isolates and

phylogenetic analysis of these isolates.” International Symposium on

Biotechnology: Developments and Trends (BIOTECH METU 2009), page 78,

Middle East Technical University, Ankara, TURKEY, 27-30 September 2009,

B14. Akbulut, H., Coleri, A., Acikgoz, N., Sahin, G., Ozkal, P., Tang, Y., Icli, F., and

Deisseroth, A. “Effect of GM-CSF on tumor-specific immune response and

antitumoral efficacy when combined with suicide gene therapy.” 45th Annual

Meeting of the American Society of Clinical Oncology (ASCO), Orlando, FL USA,

(J. Clin. Oncol., 2009 ASCO Proceedings, 27(15S), e14610), 29 May-2 June

2009.

C. Yazılan uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler:

C1. Cihan, A.C., Ozcan, B., Tekin, N., and Cokmus, C. “Characterization of a

thermostable α-glucosidase from Geobacillus thermodenitrificans F84a.” Current

Research, Technology and Education Topics in Applied Microbiology and Microbial

Biotechnology, Ed., Antonio Mendez Vilas, Formatex Research Center, Badajoz,

Spain, Microbiology Book Series-Number 2, Vol. 2, Chapter 87, pages 945-955, ISBN (13): 978-84-614-6195-0, December 2010 Edition. *

D. Ulusal hakemli dergilerde yayımlanan makaleler:

D1. Çöleri, A. ve Çökmüş. C. “Enterokok türlerinde glikopeptid grubu antibiyotiklere

direncin moleküler mekanizmaları ve gen aktarım yolları” Derleme, Refik

Saydam Hıfzısıhha Merkezi Başkanlığı, Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi,

65(2), 87-96, 2008. *

E. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitaplarında basılan bildiriler:

11

E1. Özcan, B., Tor, Ü., Cihan, A. ve Cokmus, C. “Haloarkeal Proteaz Üretiminin

Optimizasyonu ve Enzim Aktivitesinin Karakterizasyonu” 18. Ulusal Biyoteknoloji

Kongresi, P-EB-6, sayfa 87, Poster sunumu, KONYA, 18-19 Aralık 2015.

E2. Biber, A., Ertürk, D.E, Barlas, E., Cihan, A.C., Özcan, B., Akçelik, N. Ve Çökmüş, C.

“Çankırı Tuz Mağarasından İzole Edilen Halofilik Arkelerin Fenotipik ve Genotipik

Karakterizasyonu” 21. Ulusal Biyoloji Kongresi, sayfa 1199-1200, Poster

sunumu, Ege Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, İZMİR, 3-7 Eylül

2012

E3. Çalışkan, S., Cihan, A.C. ve Çökmüş, C. “Geobacillus sp. Tarafından Termostabil α-

Amilaz Üretimi” 21. Ulusal Biyoloji Kongresi, sayfa 1194-1195, Poster sunumu,

Ege Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, İZMİR, 3-7 Eylül 2012

E4. Tekin, N., Cihan, A.Ç. ve Çökmüş, C. “Türkiye’den izole edilen alkalen proteaz

üreticisi alkalifilik izolatların fenotipik testler, 16S rDNA dizi analizleri ve 16S

rDNA genlerinin restriksiyon enzim kesimlerine göre taksonomik olarak

tanımlanması.” 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, sayfa 291, Sözlü bildiri,

ANTALYA, 13-16 Aralık 2009

E5. Tekin, N., Çöleri, A. ve Çökmüş C. “Türkiye kaynaklı Bacillus spp.’lerin alkalen

proteaz üretim kapasiteleri ve enzimlerin kısmi karakterizasyonu.” 19. Ulusal

Biyoloji Kongresi, Sözlü bildiri, sayfa 109, Karadeniz Teknik Üniversitesi, Fen

Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü, TRABZON, 23-27 Haziran 2008

E6. Çöleri, A. ve Çökmüş, C. “Türkiye’den izole edilen bazı termofilik Bacillus türlerinin

termostabil -glukozidaz üretim kapasiteleri.” 18. Ulusal Biyoloji Kongresi,

Poster sunumu, sayfa 211, Adnan Menderes Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi,

Biyoloji Bölümü, Kuşadası, AYDIN, 26-30 Haziran 2006

E7. Çöleri, A. ve Çökmüş, C. “Türkiye kaynaklı klinik Enterococcus’ların antibiyotik

dirençliliği.” 16. Ulusal Biyoloji Kongresi, Poster sunumu, sayfa 101, İnönü

Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü, MALATYA, 4-7 Eylül 2002

F. Diğer yayınlar:

F1. Cihan, A.Ç. “Bölüm 12: Mikrobiyal Evrim ve Sistematik”, Brock Mikroorganizmaların

Biyolojisi, Ed. C. Çökmüş, (Brock Biology of Microorganisms, Madigan, M.T.,

Martinko, J.M., Bender, K.S., Bukley, D.H., Stahl, D.A. (2015) 14th edition.

Pearson Education, Inc., USA) 14. baskıdan çeviri, Palme Yayıncılık, Ankara, 346-378, 2016.

F2. Cihan, A.Ç. “Bölüm 4: Moleküler Mikrobiyoloji”, Brock Mikroorganizmaların Biyolojisi,

Ed. C. Çökmüş, (Brock Biology of Microorganisms, Madigan, M.T., Martinko, J.M.,

Bender, K.S., Bukley, D.H., Stahl, D.A. (2015) 14th edition. Pearson Education, Inc., USA) 14. baskıdan çeviri, Palme Yayıncılık, Ankara, 107-142, 2016.

F3. Cihan, A.Ç. “Bölüm 4: Endüstriyel Mikroorganizmalar”, Endüstriyel Mikrobiyolojiye

Giriş, Ed. İ. Turhan, (Industrial Microbiology: An Introduction, Waites, M.J.

Morgan N.L., Rockey, J.S., Higton G. (2015). John Wiley and Sons Limited, UK) Çevirilen sayfalar: 75-85, Palme Yayıncılık, Ankara, 2015.

F4. Cihan, A.Ç. “Bölüm 11: Mikrobiyal Evrim ve Sistematik”, Brock Mikroorganizmaların

Biyolojisi, Ed. C. Çökmüş, (Brock Biology of Microorganisms, Madigan, M.T.,

Martinko, J.M. (2006) 11th edition. Prentice Hall, USA) 11. baskıdan çeviri, sayfa

299-328, Palme Yayıncılık, Ankara, 2010.

12

G. Kurslar ve Sertifikalar:

G1. 15-30 Mayıs 2017 Tarihleri Arasında Düzenlenen Ankara Üniversitesi Eğiticilerin

Eğitimi Sertifika Programı (30 Haziran 2017)

G2. TÜBİTAK-Gen Mühendisliği ve Biyoteknoloji Araştırma Enstitüsü (Gebze) “Enzim

Saflaştırmada Temel Yöntemler VIII. Uygulamalı Lisansüstü Eğitim Kursu”

(4-8 Temmuz 2005).

G3. Gazi Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü “Moleküler Biyolojide

Kullanılan Yöntemler Kursu” (16-20 Ekim 2000)

G4. Gazi Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi İlköğretim Sınıf Öğretmenliği Sertifikası

(1997-1998)

G5. Milli Eğitim Bakanlığı Bilgisayar Programcılığı Sertifikası (Kasım 1996-Haziran

1997)

G6. KOSGEB Ankara Siteler Müdürlüğü “Uygulamalı Girişimcilik Eğitimi” Sertifikası

(19.12.2017-22.12.2017)

H. Özgeçmiş ve Eserler Listesinde Belirtilen Yayınlara Yapılan Atıflar:

(Web of Science‘a göre, 26.09.2018)

Yayınlara yapılan toplam atıf sayısı : 176

Kendi yayınları dışında yapılan atıf sayısı : 140

Yayınların h-indeksi : 10

I. Uluslararası Hakemli Dergilerdeki Hakemlikler ve Editörlük:

Hakemlikler:

Dergi adı: Brazilian Journal of Microbiology

I1. Manuscript no: BJM-4286-05-17 IMBF (17.05.2011)

I2. Manuscript no: BJM-4731-07-27 EMB (27.07.2011)




I6. Manuscript no: BJM-5944-01-30 BP (30.01.2012)

I7. Manuscript no: BJM-6143-03-13 IMFB (13.03.2012)


I9. Manuscript no: BJM-5335-04-12 FMFSQ (12.04.2012)


I11. Manuscript no: BJM-6679-07-10 IMFB (10.07.2012)

Dergi adı: African Journal of Biotechnology

I12. Manuscript no: AJB–11-1140 (24.05.2011)

I13. Manuscript no: AJB–11-1574 (20.02.2012)

Dergi adı: African Journal of Microbiology Research

I14. Manuscript no: AJMR-11-1320 (22.11.2011)

I15. Manuscript no: AJMR-11-1207 (22.11.2011)

Dergi adı: Agricultural Science Research Journal

I16: Manuscript no: MS:ARJ-12-014 (19.01.1012)

13

Dergi adı: Journal of Basic Microbiology

I17: Manuscript no: jomb.201200077.R1 (29.05.2012)

Dergi adı: Turkish Journal of Biology

I18: Manuscript no: TJB-1211-25 (16.12.2012)

Dergi adı: Turkish Journal of Zoology

I19: Manuscript no: ZOO-1205-3 (20.08.2013)

Dergi adı: World Journal of Microbiology and Biotechnology

I20: Manuscript no: WIBI-D-13-01885R1-2 (14.11-29.12.2013)

Dergi adı: Turkish Journal of Medical Sciences

I21: Manuscript no: SAG-1405-85 (11.08.2014)


I22: Manuscript no: SAG-1403-28 (02.10.2014)


I23: Manuscript no: SAG-1404-63 (11.08-23.10.2014)


I24: Manuscript no: SAG-1406-70 (10.09-10.10.2014)

Dergi adı: Turkish Journal of Biochemistry

I25: Manuscript no: TJB.2016.0123 (25.10.2016)

Dergi Adı: The Journal of Microbiology,

Biotechnology and Foof Sciences

I26: Manuscript no: JMBFS-1162 (04.06.2017)

Editörlük:

I27: The Journal of Biomedicine and Biotechnology, Special Issue on the topic

"Microbial enzymes and its applications in industries and medicine", Guest

Editor (14.11.2012)

I28: Communications Faculty of Sciences University of Ankara Series C: Biology

Area Editor in Molecular Biology (2015-2018)

Düzenleme tarihi: 19.10.2018

Documents

Termofilik Bacillus - Ankara Üniversitesicv.ankara.edu.tr/duzenleme/kisisel/dosyalar/...5 Son be yılda verdiği lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler: Akademik Yıl/Dönem Dersin