Transduction; résistance aux antibiotiques médiée

par des phages• Rarement décrit

• Résistance à la méthicilline chez Staphylococcus spp.

• Résistance à l ’érythromycine chez S. epidermidis

• Multirésistance chez E. coli; géne de porine mutée

TransformationTransformation• 44 bacterial species 44 bacterial species including;including;– StreptococcusStreptococcus– EnterococcusEnterococcus– StaphylococcusStaphylococcus– EnterobacteriaceaeEnterobacteriaceae– PseudomonasPseudomonas– AcinetobacterAcinetobacter– HaemophilusHaemophilus– NeisseriaNeisseria

S. pneumoniae de sensibilité diminuée

à la Péni G en France (CNRP)

0,5 0,7 14 5

7

12

1720

25

3236

43

4852 53

48

0

10

20

30

40

50

60

19841985 19861987 198819891990 19911992 19931994 19951996 1997 2001 20022003

n = 44 470 souches

CNRP E. Varon, L. GutmannCNRP P. Geslin

Pneumocoque S Streptocoques R

Pneumocoque R Pneumocoque R

Pneumocoque S

Séquençage des gènes PLP souche R = Structure en mosaïque:

Alternance séquences conservées et séquences divergeant des souches S résultant d’échanges d’ADN entre pneumocoque et streptocoques Péni R, par transformation.

chromosomechromosome

BactérieBactériesensiblesensible

plasmideplasmide

BactérieBactérierésistanterésistante

plasmideplasmide

2 bactéries résistantes2 bactéries résistantes

plasmideplasmide plasmideplasmide

Transfert de plasmideTransfert de plasmide

PLASMIDESPLASMIDES

Biochemical mechanisms of Biochemical mechanisms of antibiotic resistance and antibiotic resistance and their genetic determinantstheir genetic determinants

++

TransposonTransposon

Resistance genesResistance genes

. Aminoglycosides. Aminoglycosides • • ChloramphenicolChloramphenicol. . -lactams-lactams . . GlycopeptidesGlycopeptides• • TrimethoprimTrimethoprim • Sulfamides• Sulfamides. Macrolides. Macrolides. Cyclines. Cyclines. Rifampicin. Rifampicin

Bacterial speciesBacterial species: Gram (+), Gram (-): Gram (+), Gram (-)

TnTnTn

Tn

P1

P2

Chr

Les systèmes de capture de gènes:

les intégronsintI1

attI

sul1qacE∆

resistance gene cassette (R gene)

integrase

Int

3'- conserved segment

attC

P ant

antP

attIintI1 sul1qacE∆R gene attC

intI1intI1

5'CS5'CS 3'CS3'CS

intI1intI1

5'CS5'CS 3'CS3'CS

gene cassette gene cassette

((PP22))PPantant

Integron Integron

ATB 1 ATB 1 ATB2ATB2SulSul

SulSul

qacqacEE

qacqacEE

.... as a source of cross-resistance

Integron Integron Species Enterobacteriaceae

P. aeruginosa, P. putida, P. cepaciaAcinetobacter sp., Alcaligenes spp.Campylobacter spp. ; Shewanella sp.Vibrio cholerae, Vibrio spp.Corynebacterium glutamium,C. striatum, C. casei, C.ammoniagenes Staphylococcus spp,Aerococcus, Brevibacterium

Antibiotic resistance -lactamsAminoglycosidesChloramphenicolErythromycinRifampicinTr imethoprimSulfamidesAntiseptics

Sp Sa Sa

Shewanella algae; Shewanella algae; le réservoirle réservoir de gènes de type de gènes de type qnrAqnrA

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Poirel, Rodriguez-Martinez, Mammeri, Nordmannn AAC 2005