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… mas a tecnologia atual so’ permite sequenciar ~ 700 bp de cada vez
(nao existe um “carretel”, ao menos por enquanto)
se ampliássemos esse cromossomo ( ~ 2,5 Mbp ) até que ele medisse 25 metros ...
cada milímetro conteria 100 bp ( 2.500.000 bp / 25.000 mm ).
Uma leitura ( “trace” ) de sequenciador tem ~ 500 bp = 5 mm
Sequenciando um genoma: o tamanho do problema( ver para crer )
5.000 traces p/ sequenciar o crom. 4
genoma completo:~ 3 milhoes de traces
primer walking e’ um metodo caro,e que nao conseguiria seq. 1 Mbp. Mas que em termos logicos seria uma alternativa a metodos aleatorios (wgs)
Como sequenciar um genoma ? Opcao 1: primer walking
Genomic sequencing fails in repetitive regions
WGS
CBC
(modified from Adams et al. 2000; Lander et al. 2001)