Vigilancia de la Infección Respiratoria Aguda en Colombia · IFA / IFD Fuente: Grupo de Virología –SRNL -INS Fuente: Grupo de Virología –SRNL -INS METODOS MOLECULARES

Vigilancia de la Infección Respiratoria Aguda en Colombia

Dirección Redes en Salud Pública

Dirección de Vigilancia y Análisis del Riesgo en Salud Pública

Instituto Nacional de Salud

Introdución

Aproximadamente 4.000.000 de muertes por año son notificados con IRA.(Chonmaitree, 2008)

3,6 millones de casos fatales ocurre en los menores de 5 años. (Chonmaitree,

2008; Lopez A, 2006; Mathers C, 2008).

Principal causa de hospitalización y de administración de antibióticos en

menores de 5 años. (Neuzil y Cols, 2003; Navarro-Mari y Cols, 2003)


Virus Sincitial Respiratorio (A, B)

Parainfluenza virus (1, 2, 3, 4A,B)

Coronavirus (229E, OC43)

Rinovirus (100+ serotipos) & Enterovirus (65 serotipos)

Adenovirus (51+ serotipos)

Virus Respiratorios “ clásicos”


• Metapneumovirus humano, 2002

• SARS coronavirus, 2003

• Coronavirus humanos NL63, 2004; HKU1, 2005

• Bocavirus humanos, 2005

• Mimivirus, 2005

• Adenovirus tipo 14, 2006

• Rinovirus especie C, 2006

• WU & KI polyomavirus, 2007

• Enterovirus 68, 2010

• Nuevo coronavirus, 2012 MERS

Virus respiratorios “emergentes”descubiertos entre 2002-2012


Virus de influenza tipo A y B

Tipo de virus de

influenzaCaracterísticas del virus

Influenza A

• Puede causar epidemias y pandemias.

• Puede infectar a varias especies

• La combinación de dos proteínas en la superficie del virus, la

hemaglutinina (HA) y la neuraminidasa (NA), determina los

subtipos

Hay 16 variedades conocidas de HA

Hay 9 variedades conocidas de NA

Hay 144 (16x9) combinaciones posibles

Influenza B

• Produce casos mayormente leves

• Puede causar epidemias

• Ocurre sólo en seres humanos

Dos linajes (yamagata y Victoria)

Influenza C Ocurre sólo en seres humanos

• A / H3

• A (H1N1)pdm09

• A / H3 sw

• A (H5N1)

• A (H7N9)


¿Como lo hacemos?

Hospitalización (IRAG o IRAGi)

Donde se realiza una vigilancia:

Nacional

Centinela

Ambulatorio (ESI)

vigilamos

IFITécnicas

moleculares

Análisis de datosRT-PCR en tiempo real (protocolo CDC).


¿Por que la vigilancia Virológica?


Antecedentes en Colombia

NIC (WHO Global Influenza

Surveillance Network (GISN)

5 centinelas

1997•Plan anti

pandemia

•40 UPGDs

• IFI en 12 LSPD.

2006

•Pandemia A (H1N1)pdm09

•40 UPGDs

•15 LSPD con IFI, 3 con rRT-PCR

2009

UPGD centinela:•Atención médica ambulatoria y/o de hospitalización•Atención a población menor y mayores de cinco años.•Pertenezcan a la red pública o privada.•Cuenten con recurso humano.•Compromiso institucional y capacidad logística para implementar y desarrollar los procesos operativos y técnicos de la vigilancia de ESI/IRAG

NIC: Centro Nacional de Influenza

UPGD: Unidad primaria generadora de de datos


¿Qué es un NIC?

• Centros Nacionales deInfluenza que hacen partede la red de laboratoriosde la OMS

• En 23 países:• 24 NICs + 6 labs nacionales

= Red Global de Influenza(GISRS).

• RT-PCR / IFI

• 1 CC-OMS (CDC Atlanta,USA)

CC-OMS: Centro colaborador de la orgnización Mundial de la SaludFuente:OPS/OMS


Red de IRA por laboratorio

LSPD con Dx IFI

LSPD que remiten mx

LSP Bogotá

LSPD con Dx rRT-PCR

LSPD CON CAPACIDAD

DIAGNOSTICA VIGIALNCIA

CENTINELA DE ESI - IRAG

Amazonas

Arauca

Antioquia

Atlántico

Bogotá

Boyacá

Caldas

Cundinamarca

Cesar

Huila

Meta

Quindío

Risaralda

Santander

Nariño

Nte. Santander

Valle

DEPARTAMENTOS QUE

REMITEN MUESTRAS AL INS

EN LA VIGILANCIA

CENTINELA DE ESI-IRAG

Guaviare

Tolima

Bolívar (Cartagena)

http://images.google.com.co/imgres?imgurl=http://www.medical-artist.com/assets/images/swine-flu-virus-H1N1-influenza5.jpg&imgrefurl=http://www.medical-artist.com/swine-flu-virus-H1N1-influenza-image&usg=___clP5uO7wpWYuiHE-xV67xCd9fs=&h=444&w=400&sz=39&hl=es&start=64&itbs=1&tbnid=oE-sVM9dAOjCrM:&tbnh=127&tbnw=114&prev=/images?q=virus+H1N1&start=60&hl=es&sa=N&gbv=2&ndsp=20&tbs=isch:1









14 laboratorios departamentales

26 UPGD

Red de laboratorio para la vigilancia de influenza

Flu A : qRT-PCR: (protocolo CDC)

- Gen M: influenza A

- Subtipos (Gen H): (H1N1)pdm09, H3

Virus no Flu (21): qRT-PCR (protocolo CDC)


Capacidad de laboratorio en Colombia

Flu A y B: qRT-PCR: (protocolo CDC)

Virus no Flu (19 ) : qRT-PCR (protocolo CDC)

PCR convencional

Aislamiento viral: Flu (MDCK), VSR (Hep-2),

AdV(H292), hMPV (LLMCK-2)

Envió al CDC: Formulación anual de la vacuna

de Influenza

Estandarización de técnicas moleculares para:

Resistencia a Oseltamivir

Linaje de Influenza B

Estudios: Carga de la enfermedad de influenza –

Efectividad de la vacuna de influenza.


OPS/OMS

Sistema de información regional/global


Circulación de influenza en la region de las Americas

Fuente:OPS/OMS


Circulación de VSR

Fuente:OPS/OMS


Algoritmo de información

Médicos / Instituciones Centinelas

Departamentos (LSP)


Centro Colaborador de Referencia Para la Investigación contra Influenza

CDC de Atlanta, Georgia, USA

Organización Mundial de la Salud

(OMS - Ginebra)/Flunet


Vigilancia virológica

IRA

ESI

(centinela)

IRAG (centinela)

IRAGi

Morbilidad y

mortalidad <5años

ESI: Enfermedad similar a influenza (ambulatorio)IRAG: Infecció Respiratoria Aguda Grave (hospitalizado)IRAG: Infección Respiratoria Aguda Grave inusitada

La recolección de muestras

respiratorias únicamente y

semanalmente (100%) en las

UPGDs seleccionadas para la

vigilancia centinela en los

departamentos priorizados.

Monitorear semanalmente los

agentes virales

Identificar grupos de riesgo

Implementar medidas de salud

pública


• Cálidad de la muestra:

• Bien tomada (Celularidad)

• Bien conservada (Viabilidad viral, Integridad de AN)

• Bien enviada (Oportunidad y bioseguridad)

• Momento de la infección en que se toma la mx:

• Dinámica viral

• Respuesta inmune

El éxito dependera de:

Detección por laboratorio


Ensayos Virológico

Muestras nasofaríngeas

(siete primeros días de inicio

de los síntomas)

CULTIVO CELULAR

METODOS TRADICIONALES

rRT-PCRINMUNOFLUORESCENCIA

IFA / IFD

Fuente: Grupo de Virología –SRNL -INS Fuente: Grupo de Virología –SRNL -INS

METODOS MOLECULARES


Dinámica Viral

Días de infección

Carg

a v

ira

l

inmunofluorescencia

Aislamiento viral


BAJO

VOLUMEN

HISOPO DE MADERA

INCORRECTOCORRECTO

Muestra: Hisopado


Muestra de Aspirado Nasofaringeo

INCORRECTOCORRECTO


CORRECTO INCORRECTO

Muestras de tejidos post-mortem


muestra: sangre total que envían con tejidos

INCORRECTO


En los casos de Enfermedad Similar a Influenza – ESI y/o casos de

Infección Respiratoria Aguda Grave –IRAG: se realiza la recolección de

muestras respiratorias únicamente en las UPGDs seleccionadas para la

vigilancia centinela en los departamentos priorizados. Estas muestras son

procesadas para diagnóstico de Influenza y otros virus respiratorios por la

técnica de inmunofluorescencia y/o rRT-PCR en los respectivos laboratorios

departamentales o distrital de salud pública (LDSP),

Vigilancia Virológica IRA

Los LDSP capacitados para realizar el diagnóstico de Influenza y otros Virus

Respiratorios por la técnica de Inmunofluorescencia (IFI), deben procesar las

muestras de casos captados en la vigilancia centinela de ESI-IRAG y remitir

mensualmente la información de las muestras procesadas y el control de

calidad indirecto al INS.


En un caso fatal con alta sospecha de muerte por algún agente

respiratorio, se recomiendan cortes de tejido del tracto respiratorio en solución

salina refrigerados para análisis virológico con contra muestra en formol

tamponado al 10% para estudio histopatológico y se deben enviar al INS.

Si es sospecha de un caso de IRAG inusitado se debe recolectar muestra y

enviar al INS

Los Departamentos que no tengan capacidad diagnostica solo deben

recolectar muestras que cumplan con la definición de caso IRAG inusitado

o cuando se trate de un caso fatal.

Vigilancia Virológica IRA


Distribución de virus de influenza y otros virus respiratorios. Colombia

sem 36

0%

10%

20%

30%

40%

50%

60%

70%

80%

90%

100%

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51

Po

rce

nta

je d

e p

osi

tivo

s

Nu

mer

o d

e m

ues

tras

po

siti

vas

Otros Bocavirus Coronavirus Rinovirus Metapneumovirus Adenovirus VSR

Parainfluenza Influenza B A(H3) A no subtipificado A(H1N1)pdm09 % Positivos

Fuente: Red Nacional de laboratorios de influenza y otros virus respiratorios


Distribución de influenza (tipos y subtipos). Colombia. 2015

0%

10%

20%

30%

40%

50%

60%

70%

80%

90%

100%

0

5

10

15

20

25

30

1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51

Nú

mero

de c

aso

s p

osit

ivo

s

Semana Epidemiológica

A(H1N1)pdm09 A no subtipificado A(H3) Influenza B % positivos a influenza entre total de muestras



Proporción acumulada de los virus de influenza y otros virus

respiratorios

A(H1N1)pdm095%

A(H3)5%

Flu B1%

Parainfluenza 12%

VSR 51%

Adenovirus7%

Metapneumovirus4%

Rinovirus4%

Coronavirus5%

Bocavirus5% Otros

1%

A(H1N1)pdm09 A no subtipificado A(H3) B Victoria B Yamagata

B linaje no determinado Parainfluenza VSR Adenovirus Metapneumovirus

Rinovirus Coronavirus Bocavirus Otros



0

50

100

150

200

250

300

1 4 7 10 13 16 19 22 25 28 31 34 37 40 43 46 49 52 3 6 9 12 15 18 21 24 27 30 33 36 39 42 45 48 51 2 5 8 11 14 17 20

2013 2014 2015

A(H1N1)pdm09 A no subtipificado A(H3) influenza B Parainfluenza VSR Adenovirus

Metapneumovirus Rinovirus Coronavirus Bocavirus Otros Muestras Negativas

Núm

ero

de m

uestr

as p

ositiv

as

Circulación del virus de influenza y otros virus

respiratorios, Colombia 2010 - 2014

N=6.460 muestras

positivas

26,5% 39,8% 57,3%


Vigilancia de ESI

Fuente:INS


Vigilancia de IRAG

Fuente:INS


Circulación viral en ESI

ESI

2013 2014 2015

Fuente:INS


Circulación viral de IRAG

IRAG

2013 2014 2015

Fuente:INS


Resumen

• Los LDSP que han sido capacitados para realizar el diagnostico deInfluenza y otros Virus Respiratorios por la tecnica deInmunofluorescencia (IFI), deberan procesar las muestras de casoscaptados en la vigilancia centinela de ESI-IRAG, que tengan hasta7 dias de inicio de sintomas, las muestras que tengan mas de 7dias de inicio de sintomas deben ser procedas por LSPDcapacitado para realizar PCR o remitirlas al INS.

Por lo anterior, se debe remitir de inmediato las muestras con resultado

positivo para influenza tipo A y B por IFI al LSPD capacitado para PCR o

al INS, con el fin de realizar la debida subtipificacion del virus de Influenza

tipo A y confirmacion de influenza B


Resumen

• Los LDSP con capacidad de realizar diagnostico molecular de Influenza

A, mediante la tecnica de PCR en tiempo real (rRT-PCR), deberan

procesar las muestras de todos los casos de IRAG con fecha de inicio

de sintomas hasta 10 dias de incio de sintomas , exceptuando los casos

de IRAG inusitado los cuales se deben remitir al INS.

Adicionalmente, las muestras con resultado positivo para Influenza A

que no se puedan subtipificar, es decir, que no correspondan A(H1N1)

pdm09, con el fin identificar otro subtipo del virus de influenza.


Retos en la vigilancia por laboratorios

Mejorar el sistema de información desde el nivel local hasta el nivel

nacional articulada la información de vigilancia epidemiológica con la

información del laboratorio.

Fortalecer la vigilancia virologica y epidemiologica de IRA en cuanto a

captación del caso (ESI/IRAG, IRAGi), recolección, procesamiento,

transporte y notificación y ajuste del caso

Fortalecer la RNL para que el diagnóstico del laboratorio permita la

detección oportuna de la circulación de agentes virales de interés en

salud pública.

Hacer retroalimentación de la información desde el nivel nacional

hasta el nivel local

Descentralizar el diagnóstico molecular influenza a otros laboratorios

del país.


Agradecimientos

A las UPGDs que son la vital para la vigilancia

centinela de IRA en Colombia.

A los Laboratorios de Salud Pública que hacen

parte de la Red Nacional de Influenza y otros

virus respiratorios del país.

A las referentes de Vigilancia epidemiologica de

los LSP, del INS (Diana Malo y Paola Pulido) y a

los referentes de IRA del Minsterio de Salud.

A las estudiantes y compañeras que han hecho y

hacen parte del grupo de influenza y otros virus

respiratorios del INS



PBX: (57-1) 220 77 00

Bogotá, COLOMBIA

www.ins.gov.co

Línea gratuita nacional: 01 8000 113 400

GRACIAS

Dirección de Redes en Salud PúblicaDirección de Vigilancia y Análisis del Riesgo en Salud Publica

Equipo Funcional IRA

Juliana Barbosa – Erika Ospitia

[email protected] - [email protected]

Diana Malo – Paola Pulido

[email protected]

- [email protected]

mailto:[email protected]




Documents

Vigilancia de la Infección Respiratoria Aguda en Colombia · IFA / IFD Fuente: Grupo de Virología –SRNL -INS Fuente: Grupo de Virología –SRNL -INS METODOS MOLECULARES