40
1 Dr. Izet Eminović, doktor bioloških nauka, redovni profesor Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu, uže naučne oblasti: „Biomedicina“ i „Genetika“, – predsjednik Dr. Hilada Nefić, doktor bioloških nauka, redovni profesor Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu, uže naučne oblasti: „Genetika“ i „Klinička biologija“ - član Dr. Kasim Bajrović, doktor bioloških nauka, redovni profesor Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu, uža naučna oblast: „Genetičko inžinjerstvo“, -član VIJEĆU PRIRODNO-MATEMATIČKOG FAKULTETA UNIVERZITETA U SARAJEVU Predmet : Izbor nastavnika u zvanje redovnog profesora za naučnu oblast „Genetika“ na Odsjeku za biologiju Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu – 1 izvršilac sa punim radnim vremenom Rješenjem Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu broj 01/06-1070/2- 2020 od 04. 06. 2020. godine, a na osnovu člana 106. Zakona o visokom obrazovanju („Službene novine Kantona Sarajevo“, broj: 33/17), te člana 104. Statuta Univerziteta u Sarajevu, prijedloga Vijeća Odsjeka za biologiju od 28. 5. 2020. godine i Odlukom Vijeća Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu sa elektronske 61. sjednice, održane 04. 06. 2020. godine imenovani smo u Komisiju za izbor nastavnika u zvanje redovnog profesora za naučne oblasti „Genetika“ na Odsjeku za biologiju Prirodno- matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu. Nakon detaljnog uvida u priloženu dokumentaciju, podnosimo sljedeći I Z V J E Š T A J Komisija konstatira da se, u zakonskom roku, na raspisani Konkurs, objavljen 8. 05. 2020. godine u dnevnom listu Dnevni avaz, na web-stranici Fakulteta i na web-stranici Univerziteta u Sarajevu prijavila samo jedna (1) kandidatkinja: Prof. dr. Amina Kozarić, vanredni profesor na Odsjeku za biologiju Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu. Dopisom broj 01/06-1070/2-2020 od 04.06.2020. godine Obavješteni smo, od Komisije za prijem pristiglih prijava, da je prof. dr. Amina Kozarić uz

VIJEĆU PRIRODNO MATEMATIČKOG FAKULTETA za izbor u naucnonastavna zv… · SKRIPTA I 1. Osobni dokumenti 1.1. Biografija/životopis i Bibliografija (i na CD), str. 1-28. 1.2. Uvjerenje

  • Upload
    others

  • View
    0

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

  • 1

    Dr. Izet Eminović, doktor bioloških nauka, redovni profesor Prirodno-matematičkog fakulteta

    Univerziteta u Sarajevu, uže naučne oblasti: „Biomedicina“ i „Genetika“, – predsjednik

    Dr. Hilada Nefić, doktor bioloških nauka, redovni profesor Prirodno-matematičkog fakulteta

    Univerziteta u Sarajevu, uže naučne oblasti: „Genetika“ i „Klinička biologija“ - član

    Dr. Kasim Bajrović, doktor bioloških nauka, redovni profesor Prirodno-matematičkog fakulteta

    Univerziteta u Sarajevu, uža naučna oblast: „Genetičko inžinjerstvo“, -član

    VIJEĆU PRIRODNO-MATEMATIČKOG FAKULTETA

    UNIVERZITETA U SARAJEVU

    Predmet: Izbor nastavnika u zvanje redovnog profesora za naučnu oblast „Genetika“ na

    Odsjeku za biologiju Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu – 1 izvršilac

    sa punim radnim vremenom

    Rješenjem Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu broj 01/06-1070/2-

    2020 od 04. 06. 2020. godine, a na osnovu člana 106. Zakona o visokom obrazovanju

    („Službene novine Kantona Sarajevo“, broj: 33/17), te člana 104. Statuta Univerziteta u

    Sarajevu, prijedloga Vijeća Odsjeka za biologiju od 28. 5. 2020. godine i Odlukom Vijeća

    Prirodno-matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu sa elektronske 61. sjednice,

    održane 04. 06. 2020. godine imenovani smo u Komisiju za izbor nastavnika u zvanje

    redovnog profesora za naučne oblasti „Genetika“ na Odsjeku za biologiju Prirodno-

    matematičkog fakulteta Univerziteta u Sarajevu.

    Nakon detaljnog uvida u priloženu dokumentaciju, podnosimo sljedeći

    I Z V J E Š T A J

    Komisija konstatira da se, u zakonskom roku, na raspisani Konkurs, objavljen 8. 05. 2020. godine u

    dnevnom listu „Dnevni avaz“, na web-stranici Fakulteta i na web-stranici Univerziteta u Sarajevu

    prijavila samo jedna (1) kandidatkinja:

    Prof. dr. Amina Kozarić, vanredni profesor na Odsjeku za biologiju Prirodno-matematičkog

    fakulteta Univerziteta u Sarajevu. Dopisom broj 01/06-1070/2-2020 od 04.06.2020. godine

    Obavješteni smo, od Komisije za prijem pristiglih prijava, da je prof. dr. Amina Kozarić uz

  • 2

    prijavu u zvanje redovnog profesora dostavila sve tražene priloge, te da blagovremenost i

    potpunost prijave potvrđuje usklađenost prijave sa Konkursom.

    Također, uz prijavu na Konkurs kandidatkinja je dostavila sljedeće dokumente (u formi 3

    knjige/skripte, 205 stranica, 79 stranica i 455 stranica):

    SKRIPTA I 1. Osobni dokumenti

    1.1. Biografija/životopis i Bibliografija (i na CD), str. 1-28. 1.2. Uvjerenje o državljanstvu-ovjerena kopija, str. 30-31. 1.3. Izvod iz matične knjige rođenih-ovjerena kopija, str. 32-33. 1.4. Ovjerena kopija diplome o doktoratu bioloških nauka, str. 34-38. 1.5. Ovjerena kopija diplome o završenom diplomskom studiju, str. 39-44. 1.6. Odluku o izboru u zvanje vanrednog profesora za oblasti „Klinička biologija“ i „Genetika“, str. 45-46. 1.7 Odluku o izboru u zvanje docenta za oblast Biološke nauke, str. 47-50.

    2. Doprinos u podizanju nastavnog i naučnoistraživačkog kadra

    2.1. Potvrde o mentorstvu odbranjenih doktorskih teza (III ciklus), str. 51-55. 2.2. Potvrde o mentorstvu odbranjenih radova II ciklusa, str. 56-72. 2.3. Potvrde o mentorstvu dvije doktorske teze, str. 73-75. 2.4. Učešća u komisijama za ocjenu i odbranu doktorskih disertacija i radova II ciklusa, str. 76-88. 2.5. Dokazi o recenzijama u međunarodnim naučnim časopisima, str. 89-122. 2.6. Priznanja i nagrade, 123-132. 2.7. Pozvana predavanja, str. 133-150. 2.8. Certifikati, edukacije i zahvalnice, 151-175.

    3. Naučno-istraživački projekti i kliničke studije

    3.1. Naučnoistraživački projekti i kliničke studije prije izbora u zvanje vanrednog profesora, str. 175-180. 3.2. Naučnoistraživački projekti i kliničke studije nakon izbora u zvanje vanrednog profesora, str. 180-205.

    4. Metode

    4.1 Nove metode uvedene prije izbora u zvanje vanrednog profesora, str. 206-207. 4.2 Nove metode uvedene nakon izbora u zvanje vanrednog profesora, str. 180-205.

    SKRIPTA II 5. Publikacije prije izbora u vanrednog profesora

    5.1. Lista publikacija na Web of Science, str. 1-4. 5.2. Bibliografija-kopije originalnih publikacija u naučnim časopisima, str. 5-59. 5.3. Kongresna priopćenja u Current Contents Citation Index, str. 60-67.

  • 3

    5.4. Kongresna priopćenja na domaćim i inostranim kongresima, str. 68-79. SKRIPTA III 6. Publikacije nakon izbora u vanrednog profesora

    6.1. Lista publikacija na Web of Science, str. 1-5. 6.2. Bibliografija-kopije originalnih publikacija u naučnim časopisima, str. 6-363. 6.3. Kongresna priopćenja u Current Contents Citation Index, str. 364-383. 6.4. Kongresna priopćenja na domaćim i inostranim kongresima, str. 384-424.

    7. Knjige

    7.1 Dokazi o objavljenoj knjizi prije izbora u zvanje vanrednog profesora, str. 425-432. 7.2 Dokazi o objavljenoj knjizi nakon izbora u zvanje vanrednog profesora, str. 433-455.

    1. BIOGRAFSKI PODACI KANDIDATKINJE

    Amina Kozarić Grbavička 9, 71000 Sarajevo +387-62-621-423 Datum rođenja: 27.04.1980 [email protected] Obrazovanje

    Cleveland Clinic, Cleveland, SAD Fulbright Scholar, US Department of State Taussig Cancer Center, Department of Translational Hematology and Oncology Univerzitet u Beču, Beč, Austrija Dr.rer. nat. - doktorat iz bioloških nauka Vienna Biocenter Internacionalni doktorski studij Tema: Characterization of putative odorant receptors in D. melanogaster. Doktorat odbranjen 13.04.2007. Nagrada za najbolji doktorat Cornell University, Ithaca, New York, SAD Biološke znanosti, diplomirani biolog. Diploma sa visokim priznanjem Tema: Characterization of human and bovine Streptococcus bovis strains using RFLP and PCR. Friends Central School, Wynewood, PA, SAD Diploma srednje škole, sa najvišim priznanjem

    2012-2013 2003-2007 1998-2002

    1998-2002

    mailto:[email protected]

  • 4

    Profesionalne pozicije

    Vanredni profesor Univerzitet u Sarajevu, Prirodno-matemetički fakultet Predmeti: Farmakogenetika, Genetičko savjetovanje i testiranje i Humana genetika. Odgovorna za kreiranje nastavnog plana i programa, i ocijenjivanje studenata. Mentor studentima na I, II i III ciklusu Docent prirodnih znanosti Internacionalni Burch Univerzitet – Predavala Genetiku i Bioinformatiku (magistarski) Internacionalni Univerzitet u Sarajevu, Sarajevo, BiH Predavala Genetiku I, Genetiku II, Molekularnu biologiju I, Molekularnu biologiju II, Tehnike molekularne biologije. Odgovorna za kreiranje nastavnog plana i programa, i ocijenjivanje studenata. Biolog Odjeljenje molekularne dijagnostike i citogenetike, OJ Klinička patologija i citologija. Osnovala laboratorij za molekularnu dijagnostiku i citogenetiku OJ Klinička patologija i citologija KCUS. Odjeljenje i organizaciona jedinica preimenovani 2014 godine u Odjeljenje humane genetike, OJ Klinička patologija, citologija i humana genetika. Lista 103 analize koje sam uspostavila se nalaze u prilogu. Šef odjeljena humane genetike Uspostavila novu laboratoriju 2007 godine koja trenutno radi sljedeće analize (više od 100 citogenetskih i molekularnih analiza):

    Prenatalna citogenetika: QF-PCR, kariotip i FISH. Hematologija: citogenetika (kariotip iz koštane srži). FISH (>

    40 proba i panela za akutne i hronične leukemije, MDS, multipli mijelom i limfom na citološkim preparatima, direktnoj kulturi, kulturi stanica i tkivnim FFPE uzorcima (npr. AML panel od 5 analiza, ALL panel od 2 analize, CLL panel od 5 analiza, Multipli mijelom panel od 6 analiza, FFPE limfom od 6 proba, itd. Molekularne analize (ASO-PCR, real-time PCR, kapilarna elektroforeza, kvantitativni RQ-PCR, MLPA): FLT3 i NPM1 za akutne leukemije, JAK2, CALR, MPL za MPN; Kvantitativni qPCR BCR-ABL1 for CML svakih tri mjeseca za 60 pacijenata; MYD88 za Waldestrom, 8 rezistentnih BCR-ABL1 mutacija; Faktor II i V. FISH i STR profil za transplantacione pacijente i vijabilnost stanica; hemahromatoza.

    Pedijatrija: kariotip, mikrodelecijski FISH, MLPA za mikrodelecijske sindrome, cističnu fibrozu, spinalnu mišićnu atrofiju, razne sindrome, fragilni X, i druge. Hemato-onkološke analize: ALL FISH panel (BCR-ABL1, MLL i AML-ETO), FISH za

    2014- 09/2010-2015 09/2007-2011 06/2007-- 02/2016-

  • 5

    limfome, neuroblastome, tumore mozga i sarkome (npr. C-MYC, N-MYC, EWSR1, itd.). NGS za 50 gena za epilepsiju.

    Ginekologija: Y microdelecija, SRY FISH, kariotip za sterilitet. Patologija: FFPE FISH za razne tipove tumora, npr. MDM2,

    SS18, N-MYC, 1p/19q, itd. Onkologija: Real time PCR za mutacij u BRAF, KRAS, NRAS,

    EGFR, MSI, BRCA1, BRCA2. NGS za kolorektalne-plućne tumore. Genetičko savjetovanje: prenatalno, postnalano,

    pedijatrijsko, itd. Tumorska banka Eksterna validaciju kroz CEQA (GenQA) i UKNEQAS

    Molekularni biolog OJ Klinička mikrobiologija Klinički Centar Univerziteta u Sarajevu PCR dijagnostika za HCV, HPV, HIV i testiranje očinstva

    03/2003-10/2003

    Usavršavanja u naučno-istraživačkom radu i dijagnostici

    Univerzitet u Heidelbergu, Njemačka. Odsjek za neuropatologiju. Molekularna dijagnostika tumora CNS-a. (Erasmus) Department of Translational Hematology and Oncology Research, Taussig Cancer Center, Cleveland Clinic, Cleveland, OH, USA Fulbright Scholar kod Prof.dr. Jaroslaw Maciejewski

    Institut Molekularne Patologije, Beč, Austrija Doktorski studij pod mentorstvom Dr. Barry J. Dickson

    Kreiranje knock-out gena mogućih feromonskih receptora koristeći homolognu rekombinaciju u Drosophila melanogaster

    Karakterizacija uloge mirisnih receptora Or67d u ponašanju parenja kod Drosophila mužjaka i ženki

    Institut za mikrobiologiju, Cornell Univerzitet, Ithaca, New York, SAD Diplomski rad pod mentorstvom Dr. James B. Russell

    Sposobnost lisozima i 2-deoksiglukoze u diferenciranju humanih i kravljih Streptococcus bovis

    Asistent za istraživanje Fiziološka i genetska raznolikost kravljih Streptococcus bovis

    Institut za mikrobiologiju i imunologiju, Cornell Univerzitet, Veterinarski fakultet, Ithaca, New York, SAD Pomoćnik u istraživanju pod mentorstvom Dr. Eric Y. Denkers

    Odgovor Toxoplasma-invaziranih makrofaga pod raznim

    3/2018 2012-2013 10/2003-05/2007 2001-2002 1998-2000 2000-2001

  • 6

    bakterijskim stimulusima

    Institut za mikrobiologiju i imunologiju, Medicinski fakultet Weill Cornell Medical College, New York, NY, SAD Asistent u istraživanju pod vodstvom Dr. Thomas J. Templeton

    Kloniranje Plasmodium falciparum surface protein CCP3 Anotacija Cryptosporidium proteins bazirana na usporedbi sa

    Plasmodium proteinima Trening at the Sveučilišna klinika Vuk Vrhovac Zagreb, Hrvatska. Trening za osnivanje prve sperm banke. Pod mentorstvom dr. Božo Čolak. Trening na University Hospital of Wales in Cardiff, Wales, Velika Britanija. Trening za osnivanje protočne citometrije i interfazne citogenetike limfoma. Pod mentorstvom Mag.sci. Stephen Couzens i Dr. Stefan Dojcinov. Trening na Johns Hopkins University School of Medicine, Cytogenetics Laboratory, Baltimore, MD, SAD. Trening u hematološkoj citogenetici i fluorescentnoj in situ hibridizaciji pod mentorstvom prof.dr. Constance Griffin.. Trening u citogenetskoj laboratoriji, Institut za patologiju, Brigham and Womens Hospital (Harvard Medical School), Boston, MA, SAD. Pod mentorstvom Dr. Stanislawa Weremowicz. Trening na Institutu za humanu genetiku, Medicinski fakultet Beč, Beč, Austrija. Pod mentorstvom Dr. Juergen Neesen. Clinical Cytogenetics Intensive Course, Goldrain, Italija. http://www.goldrain.ch/ Prenatal Genetic Diagnosis, August Goldrain, Italija. http://www.goldrain.ch/ 2nd EACR-OECI Joint Training Course. "Molecular Pathology approach to cancer", Amsterdam, Holandija.

    2000 03/2011 09-10/2009 09-10/2008 11/2007 09/2007 9/2011 9/2010 5/2012

    Mentorstva

  • 7

    Odbranjeni: Diplomski radovi/radovi I ciklusa - 17 Magistarski radovi/radovi II ciklusa - 17 (15 od izbora u vanrednog profesora)

    1. Nejra Korić: Petogodišnje praćenje pacijenata sa akutnom mijeloidnom leukemijom primjenom fluorescentne in situ hibridizacije (FISH). (14.09.2015.)

    2. Adisa Baltić: Učestalost hematoloških oboljenja u Kantonu Sarajevo od 1995 do 2014 godine. (17.07.2016.)

    3. Amina Kugić: Patohistološke karakteristike gastrointestinalnog stromalnog tumora: desetogodišnje praćenje pacijenata u Federaciji Bosne i Hercegovine. (17.07.2016.)

    4. Azra Frkatović: Genetic analysis of E1A binding protein p300 (ep300) expression levels in periapical granulomas and radicular cysts. (08.05.2017.)

    5. Samira Smajlović: Gene expression of CC motif chemokine ligand 5 (CCL5) in chronic inflammatory lesions. (08.05.2017.)

    6. Hana Komić: Frekvencija mutacija u genima Janus kinaza 2 (JAK2) i kalretikulin (CALR) kod pacijanata sa mijeloproliferativnim neoplazmama. (30.09.2017)

    7. Adna Zeljković: Primjena fluorescentne in situ hibridizacije u detekciji MDM2 amplifikacije kod liposarkoma na tkivnim uzorcima. (16.10.2017.)

    8. Džejna-Ema Bajramović: Upotreba fluorescentne in situ hibridizacije na tkivnim uzorcima limfoma. (22.01.2018)

    9. Ahmed Osmanović: Evaluation of Primary culture of Periodontal Ligament Cell Viability in DMEM at Different Time Intervals. (15.03.2018)

    10. Sabina Halilović: measurement of cellular metabolic activity using mtt assay (3-(4, 5-dimethylthiazolyl-2)-2, 5-diphenyltetrazolium bromide) in periodontal ligament cells under different storage conditions. (15.03.2018)

    11. Zana Halilović: Molekularna karakterizacija somatskih mutacija KRAS i NRAS gena kod pacijenata sa karcinomom debelog crijeva. (16.07.2018)

    12. Dragana Stanišić: The overview of registration process and legislature of conducted and ongoing clinical trials in Bosnia and Herzegovina (30.11.2018)

    13. Ammar Omanović: Prevalence of CALR type 2 (c.1092_1143del) and type 2 (c.1154_1155insTTGTC) mutations in general population of Canton Sarajevo. (23.09.2019)

    14. Leila Keškić: Exploitation of synthetic lethal genetic interactions in pancreatic cancer subtypes. (16.04.2019)

    15. Emina Omerović: Detekcija genetičkih aberacija kod pacijenata sa multiplim mijelomom putem fluorescentne in situ hibridizacije. (20.10.2019)

    Doktorske teze/ III ciklus - 3

    1. Senol Dogan: Genomic characterization and discovery of novel therapeutic targets and inhibitors in acute leukemia. (16.12.2015)

    2. Aida Ćatić: A novel cytogenetic and molecular characterization of metanephric adenoma: identification of partner genes involved in translocation t(9;15)(p24;q24) and the frequency of BRAFV600E mutation. (13.07.2017)

    3. Larisa Bešić: The Assessment of age related clonal hematopoiesis in general population of Hadzici and Ilijas. (13.06.2019)

    U toku: Magistarski radovi/radovi II ciklusa - 3

  • 8

    Doktorske teze/ III ciklus - 2 1. Erna Islamagić: Molekularno-genetička osnova rezistencije na inhibitore tirozin

    kinaza kod pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom. Početak 2016- 2. Lejla Mehinović: Molekularna karakterizacija pacijenata sa mijeloidnim

    neoplazmama sa područja Kantona Sarajevo: dvadesetogodišnje praćenje. Početak 2016-

    Učešće u komisijama

    Učešće u većem broju komisija I i II ciklusa studija na Prirodno-matematičkom fakultetu i Internationalnom Burč univerzitetu. Odbrana diplomskih radova/ radova I ciklusa - 11 Odbrana magistarskih radova/radovi II ciklusa - 9 Odbrana doktorskih disertacija/III ciklus - 4

    Nagrade, pohvale i priznanja

    Fulbright Scholar – US Department of State 2012-2013 Nagrada za najbolji doktorat, 11/2007. Vienna Biocenter, Beč, Austrija. Rektorova stipendija, puna školarina za 4 godine, Cornell University,1998-2002. Cornell University Howard Hughes Research stipendija za istraživanje, 2000. European Hematology Association, Copeanhagen, Danska. Dobitnica Short term

    collaboration award 2016. American Society of Hematology Annual Meeting, New Orleans, USA. Dec 06-10,

    2013. Dobitnica Abstract Achievement Award. European Society Human Genetics, Paris, June 2013. Dobitnik Travel award. Gordon Research Conference, Molecular and Cellular Neurobiology, Hong Kong,

    Kina. Nagrada za najbolju poster presentaciju: The Role of Or67d in Drosophila Male Courtship Behavior.

    Nagrada za najbolji poster, Institute of Molecular Pathology Recess. Oktobar, 2006.

    Priznanje za diplomski rad, Cornell University, 2002. Phi Beta Kappa nagrada, 1998. Bausch Laumb nagrada, 1998.

  • 9

    Konferencije i kongresi

    European Society of Human Genetics (ESHG), Gothenburg, 06/2018 godine. European Hematology Association (Europski kongres hematologa), Stockholm,

    06/2017. European Hematology Association (Europski kongres hematologa), Kopenhagen,

    06/2016. 12th Symposium on Myelodysplastic Syndromes. Berlin 05/ 2013. New Frontiers in Myeloid Malignancies, Berlin, Njemačka. 10/2011. 7th ISABS Conference, Bol, Brac, Hrvatska. 20-24/7, 2011. First Congress of Hematology and Transfuziology, Sarajevo, 19-21/5, 2011. Frontiers in Chronic Myeloid Leukemia, Dresden, 03/2010, Njemačka. European Human Genetics Conference, 22-26/05, 2009, Beč, Austrija. Targeted Therapy in CML, 6-8/3, 2009, Paris, Francuska. IAP, International Academy of Pathology, 27th Congress, Atina, Grčka. 11/2008 P53 Workshop and Li Fraumeni Syndrome Workshop, IARC, Lyon, Francuska. 11/2007 12th Regional Drosophila Meeting, 11/ 2006, Beč, Austrija. IMP Recess, October 2005. Poster Presentacija: The role of Or67d in Courtship

    Behavior. Spring Conference, Institute of Molecular Pathology, 03/2005, Beč, Austrija. IMP Recess, 10/2005. Presentacija: The role of Or67d in Courtship Behavior. Beč,

    Austrija. Projekti

    Federalno ministarstvo nauke i obrazovanja

    In vitro ispitivanje vitalnosti kancerogenih ćelijskih linija nakon aplikacije rutenij kompleksa Voditelj projekta. Naučno-istraživački projekat. (2018)

    Detekcija i prisustvo molekularnih biljega klonalne hematopoeze u opštoj populaciji. Naučno-istraživački projekat. Član projekta. (2018)

    Molekularno-genetička osnova rezistencije na inhibitore tirozin kinaza kod pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom. Naučno-istraživački projekat. (2016)

    Osnivanje prve tumorske banka u Bosni i Hercegovini. 2009 godina. Učesnik projekta. Razvojni projekat. (2009)

    Osnivanje prve sperm banke u BiH. Učesnik projekta. Razvojni projekat. 2010. Kantonalno ministarstvo obrazovanja i nauke KS

    Učestalost i kliničko-patološki značaj koegzistentnih (istovremenih) mutacija PIK3CA i PTEN gena u grupi invazivnih karcinoma dojke sa bazalnim fenotipom. Učesnik. 2009.

    Kliničke studije:

    A two stage Phase III, International, Multi-center, Randomized, Controlled,

  • 10

    Open-label study to investigate the pharmacokinetics, efficacy and safety of rituximab SC in comination with CHOP or CVP versus rituximab IV in comination with CHOP or COP in patients with previously untreated follicular lymphoma follwed by maintenance treatment with either rituximab SC or rituximab IV. SABRINA-Follicular lymphoma BO22334. (2012-2013)

    Efficacy and safety of eraxis/Ecalta (anidulafungin) compared to cancidas (caspofungin) in neutropenic patients with invasive Candida infection. Pfizer. (2010)

    MO39107 TeGaR - Studija faze II za ispitivanje sigurnosti i efikasnosti atezolizumaba primljenog u kombinaciji sa obinutuzumabom ili rituximabom, anti-CD20 monoklonskim antitijelom, kod pacijenata s recidivirajućim/refraktornim Mantl ćelijskim limfomom/Waldestrom makroglobulinemijom (WM). (2017-2018)

    Open-label, Non-randomized Phase 2 Study With Safety Run-in Evaluating Efficacy and Safety of PQR309 in Patients with Relapsed or Refractory Lymphoma. PQR-309-002. (2016-2017)

    Randomizirano, dvostruko-slijepo, komparativno ispitivanje boiekvivalentnosti Mabiona CD20 (Mabion SA) u odnosu na Mabteru (rituximab koji proizvodi HOffman La Roche) na paralelnim grupama kod pacijenata oboljelih od difuznog krupnoćelijskog B limfoma. MabionCD20-002NHL. (2017-2018)

    Međunarodni projekti i mreže

    Razvoj novih strategija za eliminaciju BCR-ABL1+ matičnih ćelija kod pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom (projekat sa Prof.dr. Frederik Thoren, Salhgrenska Institut, Gotenborg, Švedska). Voditelj projekta zajedno sa Prof.dr. Thoren. (2019-)

    Establishment of translational research laboratory in Bosnia and Herzegovina: Novel Therapeutic Targets and Inhibitors in Acute Leukemia. Swiss National Science Foundation. 2014-2016. Voditelj projekta. Projekat obustavljen iz birokratskih razloga.

    COST Action CA18233, COST Association European Network for Innovative Diagnosis and Treatment of Chronic Neutropenias. Član. 11/2019-

    COST Action BM1006, Biomedicine And Molecular Biosciences Next Generation Sequencing Data Analysis Network. Član. 2016-

    Klinički centar Univerziteta u Sarajevu

    Desetogodišnji trend u prevalenciji Down sindroma u zemlji u razvoju: uticaj majčine dobi i prenatalnog skininga. Voditelj projekta (2016-2017).

    Osnivanje baze podataka i molekularna karakterizacija pacijenata sa hematoonkološkim oboljenjima u Federaciji Bosne i Hercegovine. Voditelj projekta. (2014-2018)

    Stomatoški fakultet (kolaboracija)

    Kvantitativna analiza potencijalnih lider gena u periapikalnim inflamatornim lezijama. Naučno-istraživački projekat. Učesnik i mentor dva magistarska rada koja su rezultat projekta. 2017-2019 godine.

    Značaj održivosti vitaliteta ćelija periodontalnog ligamenta (PDL) kod avulziranih zuba. Naučno-istraživački projekat. Učesnik i mentor dva magistarska rada koja su rezultat projekta. 2017-2018 godine.

  • 11

    Recenzije u časopisima

    American Journal of Medical Genetics Cancer Medicine Hematology Journal of Pediatric Epilepsy Oncotargets and therapy Bosnian Journal of Basic Medical Sciences Environmental Health and Preventive Medicine Ecotoxicology and Environmental Safety Environmental Research Cancer Management and Research Gastrointestinal Cancer: Targets and Therapy Environment International Oncotargets and therapy

    Pozvana predavanja

    Myeloid malignancies: are they unique? Ludwig Boltzmann Institute for Cancer

    Research. 31.05.2017 Beč, Austrija. Risk of myeloid malignancies of people living in areas contaminated with depleted

    uranium. MPN-EuroNet conferencija. 11.05.2017. Gothenburg, Švedska. Praćenje mutacije kod pacijenata sa MPN: JAK2, CALR i MPL mutacije. Novartis

    Expert Summit. 20-22.4.2018. Jahorina, BiH. Dugoročno praćenje odgovora pacijenata CML pacijenata. 12-14.04.2019. II

    Novartis Expert Summit, Jahorina, BiH. Značaj mutacija kod BCR-ABL1 negativnih MPN pacijenata. MPN Scientific

    Meeting. 07.12.2018 godine. Sarajevo, BiH. Metodologija naučnog istraživanja, Forum mladih hematologa. Sarajevo,

    07.11.2016 godine. Sarajevo, BiH. Prognostičke mutacije u MF. Molecular signatures of primary myelofibrosis: the

    effect on survival and therapy. Continue the Jakavi Journey. Sarajevo, 28.11.2019. Sarajevo, BiH.

    Dijagnostika MPN kao terapijski preduslov. Forum mladih hematologa. 25.11.2017. Sarajevo, BiH.

    Mutacije kod pacijenata sa MPN. Manage the Jakavi Journey. 07.11.2018. Sarajevo, BiH.

    From translational research to clinical application. Udruženje onkologa: godišnji skup. 25.05.2018. Tarčin, BiH.

    Trial design for early phase testing of new agents. Udruženje onkologa: godišnji skup. Tarčin, 26.05.2018. Tarčin, BiH.

    Sveobuhvatno profiliranje genoma: dešifriranje tumorskog koda. Plenarno predavanje. Dvadeset godina Roche. 8.11.2018. Sarajevo, BiH.

    Molekularne karakteristike melanoma. Roche onkološki panel o melanomu: Posvećeni melanomu. Banja Luka, 29-30.11.2019

    Precizna medicina u melanomu. Roche onkološki panel o melanomu: Posvećeni melanomu. Banja Luka, 29-30.11.2019

    Genetics in Pediatric Cardiology. Organizator: Akademija nauka i umjetnosti BiH

  • 12

    09.2012. Dubrovnik, Hrvatska. Genetika srcanog ritma. Organizator: Akademija nauka i umjetnosti BiH. 09.2013

    Sarajevo, BiH. Genetics of colon cancer, BHAAAS. 06/2011 Sarajevo, BiH. Etički aspekti genetičkog testiranja BHAAAS, 06/2011 Sarajevo, BiH. Upotreba FISH kod diagnostike CLL pacijenata. Prvi Kongres Hematologa i

    transfuziologa BiH. 2011 Sarajevo, BiH.

    2. RADOVI KANDIDATKINJE

    Ukupno radova: 89

    Originalni naučni radovi (7 prije izbora, 30 nakon izbora u vanrednog profesora)

    Kongresna priopćenja u Current Contents Citation Index (Web of Science): (4 prije izbora, 9 nakon izbora u vanrednog profesora)

    Kongresna priopćenja (10 prije izbora, 29 nakon izbora u vanrednog profesora)

    Ukupno radova nakon izbora u vanrednog profesora: 68

    Originalni naučni radovi: 30. Od toga 9 radova je u Q1 časopisima, 4 u Q2 časopisima

    Kongresna priopćenja u Current Contents Citation Index (Web of Science): 9. Od toga 8 u Q1 časopisima

    Kongresna priopćenja: 29. Od toga 5 u Q1 časopisima

    2.1. ORIGINALNI NAUČNI RADOVI

    2.1.1. Naučni radovi objavljeni prije izbora u zvanje vanrednog profesora (ukupno 7)

    1. Kurtovic, A., Widmer, Dickson BJ. (2007) A single class of olfactory neurons mediates behavioral responses to a Drosophila sex pheromone. Nature A single class of olfactory neurons mediates

    behavioural responses to a Drosophila male sex pheromone. Nature. 446: 542-546. (IF 45.8; Q1,

    PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Life Science, SCI Expanded, itd).

    2. Keleman K, rontou , Kr ttner , Yu JY, Kurtovic-Kozaric A, Dickson BJ (2012) Dopamine neurons modulate pheromone responses in Drosophila courtship learning. Nature. 489(7414):145-9.

    (IF 45.8; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Life Science, SCI Expanded, itd).

    3. Kurtovic A, Jarvis GN, Mantovani HC, Russell JB. (2003) Ability of lysozyme and 2-deoxyglucose to differentiate human and bovine Streptococcus bovis strains. Journal of Clinical Microbiology 41(8):

    3951-4. (IF 4.59; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Life Science, SCI Expanded, itd).

    4. Jarvis GN, Kurtovic A, Hay AG, Russell JB. (2001) The physiological and genetic diversity of bovine Streptococcus bovis strains. FEMS Microbiology Ecology 35(1): 49-56. (IF 4.1; Q1, PubMed/Medline,

    WoS, SCI Expanded, EBSCHO, Embase, CAS abstracts, itd).

    5. Kurtovic-Kozaric A, Mesihovic-Dinarevic S. (2012) Molecular genetics in pediatric cardiology: applications and current advances. Acta Medica Academica, 43(1): 171-189. (IF 0.23; Q3,

    PubMed/Medline, EBSCOhost, CAB abstracts, CrossRef, itd).

    6. Oruc, L, Gavrankapetanovic F, Kozaric A, Memic A. (2011) Public attitudes towards predictive genetic testing of psychiatric disorders. Medicinski Zurnal 17(2): 95-99. (EBSCOhost)

    7. Kurtovic-Kozaric A, Bilalovic N, Gavrankapetanovic F. (2010) Development of cytogenetics and

  • 13

    molecular diagnostics at the Clinical Center of the University of Sarajevo. Medicinski Zurnal 16(4):

    31-37. (EBSCOhost)

    2.1.2. Naučni radovi nakon izbora u vanrednog profesora

    A. Naučnoistraživački radovi objavljeni u priznatim časopisima od posljednjeg izbora (ukupno 30,

    od toga 9 u Q1, 4 u Q2)

    1. Fagnan A, Bagger F, Piqué-Borràs MR, Ignacimouttou C, Caulier A, Lopez C, Robert E, Uzan B, Gelsi-Boyer V, Aid Z, Thirant C, Moll U, Kurtovic-Kozaric A, Maciejewski JP, Dierks C, Spinelli C,

    ... Thomas Mercher. Human erythroleukemia genetics and transcriptomes identify master transcription

    factors as functional disease drivers. Blood. https://doi.org/10.1182/blood.2019003062. In press. 2020.

    (IF 16.6; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Life Science, SCI, SCI Expanded, itd).

    Akutna eritroleukemija (AML-M6 ili A L) je rijetka agresivna hematološka bolest. Prijašnje studije su

    pokazale da A L leukemijske ćelije često nose kompleskne kariotipove i mutacije u poznatim AML-

    povezanim onkogenima. Da bi bolje definirali molekularne mehanizme koji vode ka eritroidnom

    fenotipu, analizirali smo 33 A L uzorka koja predstavljaju tri genetičke A L podgrupe koje

    uključujuje TP53-mutirane, epigentske modulatore-mutirane (npr. DNMT3A, TET2 or IDH2) i

    nedefinirani slučajevi sa niskim mutacionim burdenom. tablirali smo eritroidna versus mijeloidna

    transkriptom-bazirana polja u kojima, neovisno o molekularnoj podgrupi, većina A L uzoraka je

    pokazala unikatne karakteristike koje su različite od non-M6 AML i mijelodisplastičnog sindroma. iše

    od 25% A L poacijanta, uključujući i genetički nedefinirane uzorke, su pokazali aberantnu ekspresiju

    ključnih transkripcionih regulatora kao što su KI, RG i TO2. ktopična ekspresija ovih faktora u

    mišjim eritroidnim progenitorima je blokirala in vitro eritroidnu diferencijaciju i vodila ka imortalizaciji

    povezanom sa smanjenjem hromatinske dostupnosti u GATA1 vezanim mjestima i funkcionalnu

    interferenciju sa GATA1 aktivnosti. In vivo mišji modeli su pokazali razvoj letalnih eritroidnih,

    miješanih eritroidnih/mijeloidnih ili drugih maligniteta u zavisnosti od ćelijske populacije u kojoj su

    AEL-vezane alteracije bile eksprimirane. Ovi podaci indiciraju da je AEL molekularno heterogena

    bolest sa eritroidnim identitetom koji rezultira iz aberantne aktivnosti ključnih eritroidnih

    transkripcionih faktora u hematološkim matičnim ili progenitorskim ćelijama.

    2. Kurtovic-Kozaric A, Przychodzen B, Singh J, Konarska MM, Clemente MJ, Otrock ZK, Nakashima M, Hsi ED, Yoshida K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Ogawa S, Boultwood J, Makishima

    H, Maciejewski JP, Padgett RA. PRPF8 defects cause missplicing in myeloid malignancies. Leukemia.

    2015 Jan;29(1):126-36. doi: 10.1038/leu.2014.144. PubMed PMID: 24781015. (IF 12.1; Q1,

    PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Life Science, SCI, SCI Expanded, itd).

    Mutacija u splajsozomu su česte u mijeloidnim neoplazmama. Jedan od mutiranih gena, PRPF8, kodira

    najkonzerviranijeg proteina splajsozoma. U ovom radu analizirano je 450 pacijenata i nađeno je 15

    pacijenata sa mutacijama i 24 pacijenta sa hemizigotnom delecijom. 50% ovih mutacija je nađeno kod

    pacijenata sa akutnom mijeloidnom leukemijom, koje su bile povezane sa lošom prognozom. PRPF8

    aberacije su bile povezane sa povećanim brojem mijeloblasta i prstenastim sideroblastima. RNAi

    PRPF8 u K562 staničnim linijama i CD34-pozitivinm primarnim stanicama koštane srži su pokazale

    povećanu proliferativnu sposobnost. RNK duboko sekvenciranje primarnih stanica pacijenata sa PRPF8

    abnormalnostima je pokazao konsistentan defekat u spajsingu-prekrajanju RNK. Analizirali smo iste

    defekte i u kvascu kao modelu, gdje se pokazalo da ovi mutanti imaju zastoj u proof-reading.

  • 14

    3. Kurtovic-Kozaric A, Hasic A, Radich JP, Bijedic V, Nefic H, Eminovic I, Kurtovic S, Colakovic F, Kozaric M, Vranic S, Bovan NS. The reality of cancer treatment in a developing country: the effects of

    delayed TKI treatment on survival, cytogenetic and molecular responses in chronic myeloid leukaemia

    patients. Br J Haematol. 2016 Feb;172(3):420-7. doi: 10.1111/bjh.13843. PubMed PMID: 26554639.

    (IF 5.67; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Clinical Medicine, SCI, SCI Expanded, itd).

    Pacijenti sa rakom u zemljama u razvoju imaju ograničen pristup ciljanim terapijama. Na primjer,

    inhibitori tirozin kinaza (TKI) za hroničnu mijeloidnu leukemiju su često odgođeni. U Bosni, 16%

    paicjenata su dobili odmah TKI terapiju (13 mjeseci od dijagnoze). Primarni cilj je bila analiza completne citogenteske remisije kao i

    velikog molekularnog odgovora nakon 12 mjeseci terapije. Nakon 12 mjeseci terapije, stope ulaska u

    CCyR i MMR na imatinibu su se signifikantno smanjile: CCyR je postignut kod 67% pacijenata u grupi

    koja je dobila odmah lijek, 18% pacijenata u grupi koja je čekala 6-12 mjeseci, i 15% pacijenata u grupi

    koja je čekala >13 mjeseci na početak terapije. MMR stope nakon 12 mjeseci su postignute u 10%

    pacijenata koji su odmah tretirani, 6% pacijenata u 6-12 mjeseci, i 0% u grupi koja je čekala više od 13

    mjeseci na početak terapije. Međutim, CCyR i MMR kod pacijenata na nilotinibu nisu bile povezane sa

    dužinom čekanja. Naši podaci sugeriraju da loši efekti odgođene TKI terapije mogu biti prevaziđene sa

    nilotibom.

    4. Kurtovic-Kozaric A, Kugic A, Hasic A, Beslija S, Ceric T, Pasic A, Vranic S, Kopric D, Iljazovic E, Todorovic Barbuscia J, Kozaric M, Ibisevic N, Keskic L, Kurtovic S. Long-term outcome of GIST

    patients treated with delayed imatinib therapy. Eur J Cancer. 2017 Jun;78:118-121. doi:

    10.1016/j.ejca.2017.03.024. PubMed PMID: 28437709. (IF 6.68; Q1, PubMed/Medline, WoS Core

    Collection, CC Life Science, SCI, SCI Expanded, itd).

    Uvođenje imatinib terapije je signifikantno poboljšao ishod pacijenata sa gastrointestinalnim

    stromalnim tumorom (GI T). Iako imatinib je poboljšao tretman pacijenata sa GI T, dostupnost u

    zemljama u razvoju kao što su Argentina, Brazil ili Bosna je bila ograničena radi finansijskih problema

    i nedostatka pristupa lijeku kroz osiguravajuće fondove. Radi ograničenog broja dostupnih imatinib

    terapija, mnogi GIST pacijenti nisu dobili lijek. Tijekom nekoliko godina, broj imatinib terapija se

    postepeno povećavao, ali nikada dovoljno da svi GIST pacijenti imaju potrebnu terapiju. Radi

    nedostupnosti imatiniba, GIST pacijenti su primili terapiju nakon 1 do 67 mjeseci nakon dijagnoze

    (medijan čekanja je bio 21 mjesec). Pošto ni jedna studija do sada nije sistematski analizirala efekat

    odgođenog tretmana imatinibom, analizirali smo efekat odgođene terapije na ukupno preživljenje,

    vrijeme do progresije i dužinu terapije imatinibom kod GI T pacijenata.

    5. Osmanovic A, Halilovic S, Kurtovic-Kozaric A, Hadziabdic N. Evaluation of periodontal ligament cell viability in different storage media based on human PDL cell culture experiments-A systematic

    review. Dental Traumatology. 2018 Dec;34(6):384-393. doi: 10.1111/edt.12437. Epub 2018 Oct 21.

    PubMed PMID: 30193009. (IF 1.49; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Clinical

    Medicine, SCI, SCI Expanded, itd).

    Najbolji tretman za avulzirani zub je reimplantacija. Ako to nije moguće, potrebno je zub staviti u

    transportni medij koji je potreban za održavanje vijabilnosti stanica perodontalnog ligamenta (PDL).

    Cilj studije je odrediti efikasnost različitih medija koji se koriste za preživljenje PDL stanica

    avulziranih zuba u in vitro uvjetima. Iz 15 studija, devet medija je analizirano u šest vremenskih

    perioda. Za vrijeme do 2 sata, HB , DM M, milk, 10% propolis, 20% propolis, i iaspan su održali

    više od 80% stanica. Za čuvanje do 24 h, iaspan je pokazao najbolje preživljenje od 88.4%, zatim

    DM M (70.9%) i 10% propolis (68.3%). Mlijeko i HB su pokazali sličan procenat (57.2% and

    57.3%, respectively). Mlijeko je još uvijek najdostupnije i najjeftinije za većinu situacija.

  • 15

    6. Catic A, Gurbeta L, Kurtovic-Kozaric A, Mehmedbasic S, Badnjevic A. Application of Neural Networks for classification of Patau, Edwards, Down, Turner and Klinefelter Syndrome based on first

    trimester maternal serum screening data, ultrasonographic findings and patient demographics. BMC

    Med Genomics. 2018 Feb 13;11(1):19. doi: 10.1186/s12920-018-0333-2. PubMed PMID: 29439729.

    (IF 3.06; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Clinical Medicine, SCI, SCI Expanded, itd).

    Upotreba vještačkih neuralnih mreža (ANN) za genomsku klasifikaciju i uspostavu korelacije genoma i fenotipa

    se analizirala intenzivno u zadnjih nekoliko godina. Razlog tome jeste da ANN mogu da aproksimiraju

    kompleksne funkcije, tako da klasifikacija se može uraditi bez potrebe za eksplicitno definiranim input-output

    modelom. Ovaj alat se može koristiti za optimizaciju postojećih metoda za klasifikaciju bolesti i sindroma.

    Koristeći bazu podataka od 2500 trudnica, vrijednosti PAPP-A i β-hCG su mjerene, kao i ultrazvučni markeri

    nuhalnog nabora i prisustvo nazalne kosti. Klasifikacijska sensitivnost je bila 99%. Taačnost feedforward NN je

    bila 89.6%a feedback 98.8%. Rzultati u ovom članku dokazuju da ekspertni dijagnostički sistem baziran na ANN

    može da se koristi za klasifikaciju pet sindroma.

    7. Asic A, Kurtovic-Kozaric A, Besic L, Mehinovic L, Hasic A, Kozaric M, Hukic M, Marjanovic D. Chemical toxicity and radioactivity of depleted uranium: The evidence from in vivo and in vitro

    studies. Environ Res. 2017 Jul;156:665-673. doi: 10.1016/j.envres.2017.04.032. PubMed PMID:

    28472753. (IF 5.01; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC, SCI, SCI Expanded, itd).

    Glavni cilj ovog rada jeste analizirati trenutno stanje hemijskog toksiciteta i radioaktivnosti

    osiromašenog urana (DU) i njegovog efekta na žive sisteme i ćelijske linije. ećina in vivo i in vitro

    studija su koristile životinjske modele što se tiče mogućih efekata uzrokovanih akutnoj ili hroničnoj

    izloženosti DU. rijeme i doza izloženosti, solubilnost DU partikula, kao i isotopi su bili faktori koji su

    uticali na efekte DU. Posebno se obratila pažnja na formiranje mikronukleusa, epigenetske promjene, i

    slično. toga, ovaj pristup predstavlja novu oblast analize DU-povezanih iradijacijskih efekata na

    zdravlje.

    8. Islamagic E, Hasic A, Kurtovic S, Suljovic Hadzimesic E, Mehinovic L, Kozaric M, Kurtovic-Kozaric A. The Efficacy of Generic Imatinib as First- and Second-line Therapy: 3-Year Follow-up of Patients

    With Chronic Myeloid Leukemia. Clin Lymphoma Myeloma Leuk. 2017 Apr;17(4):238-240. doi:

    10.1016/j.clml.2017.02.001. Epub 2017 Feb 16. PubMed PMID: 28283298. (IF 2.27; Q3,

    PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Clinical Medicine, SCI, SCI Expanded, itd).

    Generici imatinib mesilata, prvog inhibitora tirozin kinaza, koji ciljaju fuzioni protein BCR-ABL1, su odobreni u

    mnogim zemljama kao alternativne, jeftine forme tretmana pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom.

    Cilj ove studije je da se evaluariaju dugoročni ishodi pacijenata sa CML-om koji su dobili prvu ili drugu liniju

    terapije sa genericima u Bosni i Hereegovini. Ovo je multicentrična retrospektivna studija pacijeanta koji su

    tretirani sa generičkim imatinibom od septembra 2013 do avgusta 2016 godine. Pacijenti su bili kategorizirani u

    dvije grupe: Grupa 1(n = 27) je uključivala novodijagnosticirane pacijente sa CML-om koji su dobijali prvu linije

    generičkog imatiniba, a Grupa 2 (n = 14) su pacijenti koji su primali prvu liniju Gliveca i prebačeni su na drugu

    liniju imatiniba. Medijan praćenja je bio 16 i 36 mjeseci za Grupu 1 i 2. Nakon 36 mjeseci, ukupno preživljenje za

    Grupu 1 je bilo 85%, a 81% pacijenata je imalo kompletan citogenetski odgovor. Nakon 24 mjeseca, veliki

    molekularni odgovor je bio 48%. Ukupno, 52% pacijenata se prebacilo sa prve linije generika na nilotinib radi

    zatajenja ili nus efekata. U Grupi 2, 93% pacijenata je zadržalo citogenetski i molekularni odgovor nakon 3

    godine poslije prelaska sa Gliveca na genetički imatinib. Naši rezultati pokazuju da generički imatinib nema loš

    uticaj na ishod pacijenata.

    9. Hadziabdic N, Kurtovic-Kozaric A, Frkatovic A, Smajlovic S, Letra A. Quantitative Analysis of CCL5 and ep300 in Periapical Inflammatory Lesions. Acta Med Acad. 2019 Aug;48(2):129-139. doi:

    10.5644/ama2006-124.251. PubMed PMID: 31718213. (IF 0.23; Q3, PubMed/Medline, EBSCOhost,

    CAB abstracts, CrossRef, itd).

  • 16

    In silico bioinformatička analiza je pokazala da ekspresija dva gena, CCL5 (C-C Motif Chemokine

    Receptor 5) i ep300 (Histone acetyltransferase p300) može biti potencijalni novi biomarker za

    diferencijaciju između periapikalnih granuloma i radikularnih cisti. toga, naša hipoteza je bila da

    ekspresija CCL5 i ep300 u periapikalnim lezijama bi mogla klasificirati lezije kao granulome ili ciste.

    Uzorci 122 pacijenta su uključivala 46 periapikalne granulome, 38 radikularnih cisti i 38 zdravih

    gingiva kao kontrola. Real-time PCR analiza transkripata ova dva gena je uspoređena sa DHA kao

    referencom. Klinički parametri, npr. intenzitet inflamacije i veličina lezije, su se mjerile i korelirale sa

    CLL5 i ep300 ekspresijom. ROC i logistička regresija su se koristile da se dijagnostički karakteriziraju

    ΔCt vrijednosti. Granulome i radikularne ciste su imale signifikantno povećanu ekspresiju CLL5 i

    ep300 u poređenju sa kontrolama. Međutim, nije bilo razlike kada su se usporedili granulomi sa

    cistama. ROC analiza je pokazala da CCL5 i ep300 su imale dobru dijagnostičku tačnost, ali nisku za

    razlikovanje između lezija.

    10. Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Komic H, Bilalovic N, Eminovic I, Burekovic A, Uzunovic A, Kurtovic S. The effects of mutational profiles on phenotypic presentation of myeloproliferative

    neoplasm subtypes in Bosnia: 18 year follow-up. Bosn J Basic Med Sci. 2019 Oct 30. doi:

    10.17305/bjbms.2019.4391. PubMed PMID: 31668145. (IF 2.14; Q3, PubMed/Medline, WoS Core

    Collection, CC Clinical Medicine, SCI, SCI Expanded, itd).

    Identifikacija uzajamno nepodudarnih somatskih mutacija koje se mogu naći kod pacijenata sa

    mijeloproliferativnim neoplazmama se pokazala kao moćan alat za analizu evolucije MPN kao bolesti.

    Kliničke karakteristike, genske mutaicje, i preživljenje preko 18 godina su se analizirale kod MPN

    pacijenata. 138 MPN pacijenata je subkategorizirano prema MPN subtipovima: esencijalna

    trombocitopenija (ET, n=41), polycythemia vera (PV, n = 56), primarna mijelofibroza (PMF, n = 10),

    and MPN nekalsificirani (MPN-U, n = 31). Karakteristike pacijenata su uključivale kliničke parametre,

    ukupno preživljenje, mutacioni status gena JAK2, CALR i MPL. Uporedili smo hematološke i kliničke

    osobine JAK2V617F-ET naspram CALR-mutiranim ET naspram JAK2V617F-PV pacijentima.

    JAK2 617F pacijenti su imali više vrijednosti eritrocita, hemoglobina i hematokrita u poređenju sa

    CALR-mutiranim pacijentima. Mutant alel burden kod JAK2V617F-PV i JAK2V617F-ET pacijenata je

    direktno korelirala sa eritrocitima, hemoglobinom i hematokritom, ali inverzno sa brojem trombocita.

    toga, alel burden je indikator kliničkog fenotipa JAK2 617F-MPN pacijenata. Mutacioni status nije

    imao efekta na ukupno preživljenje. U sažetku, JAK2, CALR i MPL geni imaju specifične hematološke

    potpise.

    11. Hadziabdic N, Dzinovic E, Udovicic-Gagula D, Sulejmanagic N, Osmanovic A, Halilovic S, Kurtovic-Kozaric A. Nonsyndromic Examples of Odontogenic Keratocysts: Presentation of Interesting Cases

    with a Literature Review. Case Reports in Dentistry. 2019 Aug 14;2019:9498202. doi:

    10.1155/2019/9498202. eCollection 2019. PubMed PMID: 31511794. (PubMed/Medline, WoS Core

    Collection, SCI Expanded, itd).

    Odontogene keratociste (OKC) se mogu pojaviti u bilo kojem dobu. Uglavnom se pojavljuju u drugoj i

    trećoj dekadi života. U poređenju sa drugim odontogenim cistama, ovaj tip se može naći u oko 5-15%

    slučajeva. Češći je u mandibularnoj regiji i kod muškaraca. HIstološki, OKC se karakteriziraju

    prisustvom eksterne kapsule vezivnog tkiva, sa keratinizirajućim epitelom koji se sastoji iz 5-8 ćelijskih

    ninova sa značajnom palisadizacijom polariziranih bazalih ćelija i sa korugiranim parakeratinim

    nivoom. Ova studija prezentira slučajeve odontogenih keratocisti, sa referencom na zadnju

    klasifikacijom i dilemama. Ovaj projekat se realizira kao deskriptivna studija, sa prikazom slučaja.

    Detaljna histopatološka analiza, terapeutski pristup je prikazan.

    12. Mehinovic L, Islamagic E, Husic-Selimovic A, Kurtovic-Kozaric A, Vukobrat-Bijedic Z, Suljevic D. Evaluation of Diagnostic Efficiency of Alpha-Fetoprotein in Patients with Liver Cirrhosis and

    Hepatocellular Carcinoma: Single-Center Experience. Open Access Maced J Med Sci. 2018 Sep

  • 17

    24;6(9):1668-1673. doi: 10.3889/oamjms.2018.344. eCollection 2018 Sep 25. PubMed PMID:

    30337985. (Pubmed, WoS, EBSCO, Hinari, Google scholar, Mendeley, SCImago Journal & Country

    Rank (SJR)).

    Koncentracija AFP u serumu je dijagnostički alat koji je specifičan za hepatocelularni karcinom (HCC)

    kod pacijenata sa cirozom jetre. Ova studija je imala za cilj da analizira dijagnostičke vrijednosti AFP

    kod HCC i korelira ih sa stadijem bolesti. Uključeno je 50 pacijenata sa cirozom jetre i 50 pacijenata sa

    HCC. ignifikantna razlike je uočena između pacijenata sa cirozom jetre i HCC u vrijednostima AST,

    ALT, GGT, bilirubin, AFP i AP. Pacijenti sa HCC su imali više nivoe AFP u poređenju sa pacijentima

    sa cirozom jetre. eličina površine ispod ROC krive (AUC) je bila 0.877, što pokazuje da je AFP dobar

    biomarker koji zadovoljava dijagnostičke kriterije u razlikovanju pacijeanta sa HCC i cirozom jetre.

    13. Kurtovic-Kozaric A, Vranic S, Kurtovic S, Hasic A, Kozaric M, Granov N, Ceric T. Lack of Access to Targeted Cancer Treatment Modalities in the Developing World in the Era of Precision Medicine: Real-

    Life Lessons From Bosnia. Journal Global Oncology. 2018 Sep;4:1-5. doi:

    10.1200/JGO.2016.008698. Epub 2017 May 4. PubMed PMID: 30241174. (IF 1.79; Q2, Pubmed,

    EBSCO, Hinari, Google scholar, Mendeley, SCImago Journal & Country Rank (SJR).

    Pacijenti sa rakom u zemljama u razvoju imaju ograničen pristup ciljanim terapijama protiv raka.

    Tranzicijska priroda ovih ekonomija je imala uticaja na finansiranje zdravstvene njege, koja je

    rezultirala nedostupnošću ciljanih terapija. Osim tri studije koje su ovdje opisane, ne postoji literatura

    koja opisuje klinički ishod pacijenata tretiranih sa odgođenom ciljanom terapijom. Da bi podigli svijest

    o važnosti i pravovremenom tretamanu pacijenata sa rakom, nekoliko stvari će biti analizirane: 1) nizak

    broj ciljanih terapija za razne tipove raka, 2) odgođeni tretman, 3) nedostupnost dijagnostike.

    14. Bešić L, Muhović I, Mrkulić F, pahić L, Omanović A, Kurtovic-Kozaric A. Meta-analysis of depleted uranium levels in the Middle East region. J Environ Radioact. 2018 Dec;192:67-74. doi:

    10.1016/j.jenvrad.2018.06.004. PubMed PMID: 29890359. (IF 2.35; Q1-Q2, PubMed/Medline, WoS

    Core Collection, CC Clinical Medicine, SCI, SCI Expanded, itd).

    Kontaminacija osiromašenim uranijom tokom rata u Zalivu nije detaljno istražena, posebice moguća

    poveznica sa zdravljem populacije. Autori ove studije su imali za cilj da selektiraju podatke bazirane na

    striktim uključujućim i isključujućim kriterijima. Cilj je bio da se razjasni stopa kontamijacije sa DU

    tokom ratova u Zalivu u formi meta-analize. Autori su pokušali da koreliraju podatke o DU nivoima i

    mogućim efektima na populacije. Komparacija omjera isotopskih aktivnosti 234U/238U i 235U/238U,

    kao i maseni omjer 235U/238U u zraku, vodi, zemlji i hrani u uzorcima iz zemalja Bliskog istoka,

    kontaminacija nije nađena u Alžiru, Izraelu, Afganistanu, Omanu, Kataru, Iranu i Jemenu. Radi

    limitiranog broja pouzdanih podataka o zdravstvenom statusu populacija, nije bilo moguće napraviti

    korelaciju između niova DU i zdravstvenih efekata.

    15. Catic A, Kurtovic-Kozaric A, Johnson SH, Vasmatzis G, Pins MR, Kogan J. A novel cytogenetic and molecular characterization of renal metanephric adenoma: Identification of partner genes involved in

    translocation t(9;15)(p24;q24). Cancer Genetics. 2017 Aug;214-215:9-15. doi:

    10.1016/j.cancergen.2017.03.001. PubMed PMID: 28595733. (IF 2.18; Q2, PubMed/Medline, WoS

    Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd).

    Renalni metanefrični adenom je rijetiki benigni tumor koji je često pogrešno klasificiran kada se koristi

    samo mikroskopske karakteristike. Korektna klasifikacija renalnog tumora je važna za dijagnostički,

    prognostički i terapeutski pristup. Recentni podaci su pokazali da 90% MA ima BRAF V600E

    mutacije, a 10% je nejasno. Našli smo prisustvo t(9;15)(p24;q24) povezanih sa MA. Identificirali smo

    partnere u translokaciji, i to KANK1 gen na hromosomu 9 i NTRK3 gen na hromosomu 15. Mate-pair

    genomsko sekvenciranje je validiralo translokaciju i uključene gene.

  • 18

    16. Besic L, Muhovic I, Asic A, Kurtovic-Kozaric A. Meta-analysis of depleted uranium levels in the Balkan region. J Environ Radioact. 2017 Jun;172:207-217. doi: 10.1016/j.jenvrad.2017.03.013. Epub

    2017 Apr 7. PubMed PMID: 28395154. (IF 2.35; Q1-Q2, PubMed/Medline, WoS Core Collection,

    Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd).

    Kontradiktorni podaci postoje o vezi između prisustva osiromašenog uranija i povećane incidence kod

    vojnika koji su bili u ratovima na Balkanu 1992-1995. Dosta istraživanja je analiziralo vezu između

    osiromašenog uranija u regionu. Cilj ove studije je da se prikupe podaci o prethodno objavljenim

    izvještajima o nivoima osiromašenog urana na Balkanu i prezentirati ga u obliku meta-analize. Testirali

    smo hipotezu da postoji korelacija između nivoa osiromašenog urana i zdravstvenih efekata. Naši

    rezultati sugeriraju da većina mjesta posjeduje prirodni uranij, dok Kosovo izgleda da ima najviše

    zagađenja sa osiromašenim uranom. Rezultati indiciraju da se ne može povući validna korelacija

    između zdravstvenih efekata i osiromašenog urana.

    17. Dogan S, Cilic A, Marjanovic D, Kurtovic-Kozaric A. Detection of cytosine and CpG density in proto-oncogenes and tumor suppressor genes in promoter sequences of acute myeloid leukemia.

    Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids. 2017 Apr 3;36(4):302-316. doi:

    10.1080/15257770.2017.1279738. Epub 2017 Mar 21. PubMed PMID: 28323522. (IF 1.16; Q3-Q4,

    PubMed/Medline, CAS, EBSCOhost, EMBASE, Scopus, Science Citation Index Expanded, Web of

    Science, itd).

    Aberantna metilacija vodi ka razvoju kancera. Iako stopa metilacije izgleda jako varijabilna u genomu,

    uglavnom se očituje kao modifikacija histona, organizacija hromatina, dostupnost DNK ili promotor

    sekvence. U ovoj studiji smo pokazali da C ponavljajuće sekvence koje se sastoje iz dva do sedam

    ponavljajućih citozina imaju različitu gustinu kod proto-onkogena, tumor supresora nego kod

    kontrolnih gena.

    18. Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Malesevic R, Mesanovic S, Jaros T, Stomornjak-Vukadin M, Mackic-Djurovic M, Ibrulj S, Kurtovic-Basic I, Kozaric M. Ten-year trends in prevalence of Down

    syndrome in a developing country: impact of the maternal age and prenatal screening. Eur J Obstet

    Gynecol Reprod Biol. 2016 Nov;206:79-83. doi: 10.1016/j.ejogrb.2016.08.038. Epub 2016 Sep 12.

    PubMed PMID: 27639605. (IF 1.8; Q2, PubMed/Medline, CAS, EBSCOhost, EMBASE, Scopus,

    Science Citation Index Expanded, Web of Science, itd).

    Ova studija analizira trendove prevalence sve rođene kao i živorođene djece sa trisomijom 21 (T21) u

    poređenju sa majčinom dobi i uvođenjem prenatalne dijagnoze u Bosnu i Hercegovinu. Prenatalna

    dijagnostika se uvela u januaru 2008 u 3 bolnice, i analizirana je do 31.12.2015 godine. U ovoj studiji,

    99 fetusa i 330 novorođenčadi je dijagnosticirano sa T21 u trajanju studije. vake godine, 33 T21

    osobe su se rodile i 13 T21 fetusa je dijagnosticirano prenatalno. Incidenca za živorođene T21 u Bosni

    je 1:999. Prevalenca živorođenih T21 je 9.6 na 10.000 porođaja, sa ukupnom prevalencom od 19.1.

    Ukupna T21 prevalenca se eksponencijalno povećala sa starijom dobi majke. Prenatalna T21

    prevalenca je 1.29 na 10,000 porođaja za majke 40 godina). Najčešća indikacija za invazivni prenatalni test je bila ultrazvučni pregled

    zajedno sa biohemijskom analizom seruma, kao i starija dob majke. Prevalenca živorođenih T21 je

    ostala konstantna. Iako povećanje dobi majke u zadnjoj deceniji je uticala na povećanje totale T21

    prevalence, efekat prenatalne dijagnostike na živorođenu djecu je bio minimalan, što dovodi do

    zaključka da prenatalni skrining se treba poboljšati.

    19. Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Stomornjak-Vukadin M, Kurtovic-Basic I, Catibusic F, Kozaric M, Mesihovic-Dinarevic S, Hasanhodzic M, Glamuzina D. Diagnostics of common microdeletion

  • 19

    syndromes using fluorescence in situ hybridization: single center experience in a developing country.

    Bosn J Basic Med Sci. 2016 Mar 3;16(2):121-5. doi: 10.17305/bjbms.2016.994. PubMed PMID:

    26937776. (IF 2.14; Q3, PubMed/Medline, WoS Core Collection, CC Clinical Medicine, SCI, SCI

    Expanded, itd).

    Mikrodelecijski sindromi nastaju zboj hromosomalni delecija od manje od 5 megabaza, a koji se mogu

    detektirati putem fluorescentne in situ hibridizacije (FI H). valuirali smo najčešće mikrodelecije u

    periodu od 01.06.2008 do 01.06.2015 godine u Federaciji Bosne i Hercegovine, uključujući DiGeorge,

    Prader-Willi/Angelman, Wolf-Hirschhorn, and Williams sindrome. Nađena su 4 pacijenta sa DiGeorge

    sindromom, 4 pacijenta sa Prader-Willi/Angelman, 4 pacijenta sa Wolf-Hirschhorn sindromom, and 3

    pacijenta sa Williams sindromom. Izračunata je incidenca za Federaciju BiH. Ovo su prve raportirane

    frekvencije mikrodelecijskih sindroma u FBiH.

    20. Hadziabdic N, Kurtovic-Kozaric A, Pojskic N, Sulejmanagic N, Todorovic L. Gene-expression analysis of matrix metalloproteinases 1 and 2 and their tissue inhibitors in chronic periapical

    inflammatory lesions. J Oral Pathol Med. 2016 Mar;45(3):224-30. doi: 10.1111/jop.12347. PubMed

    PMID: 26293377. (IF 2.14; Q2, PubMed/Medline, WoS, SCI, SCI Expanded, CAS itd).

    Periapikalne inflamatorne lezije su instraživane ranije, ali razumijevanje patogeneze ovih lezija

    (granuloma i radikularnih cisti) na molekularnom nivou je još uvijek diskutabilno. Matriks

    metaloproteinaze (MMP) su enzimi koji su uključeni u razvoj periapikalnih lezija, posebno u

    inflamaciji i destrukciji tkiva. Da bi razumjeli patogenezu peripaikalnih granuloma i radiularnih cisti,

    uradili smo detaljnu analizu genske ekspresije MMP-1, MMP-1 i njihovih tkivnih inhibitora TIMP-1 i

    TIMP-2. Ukupno 149 uzoraka je analizirano putem real-time PCR metode (59 radikularnih cisti, 50

    periapikalnih granuloma i 40 zdravnih uzoraka gingive kao kontrole) za ekspresiju MMP-1, MMP-2,

    TIMP-1 i TIMP-2 gena. Određen je najbolji referentni gen, i to DHA. POkazali smo da β-actin i

    GAPDH nisu najstabilnije referentne kontrole za gensku ekspresiju inflamatornih periapikalnih tkiva i

    zdrave gingive. Našli smo da granulomi i radikularne ciste imaju signifikantno povećanu ekspresiju sva

    četiri analizirana gena, MMP-1, MMP-2, TIMP-1 i TIMP-2 u poređenju sa kontrolama. Međutim, nije

    nađena razlika u ekspresiji između periapikalnih granuloma i radikularnih cisti.

    21. Dogan S, Cilic A, Kurtovic-Kozaric A, Ozturk F. Detection of G-type density in promoter sequence of colon cancer oncogenes and tumor suppressor genes. Bioinformation. 2015 Jun 30;11(6):290-5. doi:

    10.6026/97320630011290. PubMed PMID: 26229289. (PubMed, PubMed Central (PMC), EBSCO,

    SCI Emerging source citation Index, Web of Science).

    Gvanin bogata mjesta su prisutna u humanom genomu. Prethodne studije su pokazale prisustvo G

    bogatih sekvenci i motiva mogu biti važne za funkciju gena i njihovu aktivnost. Fokusirali smo se na

    identifikaciju G bogatih motiva u promotorima i tumor supresorima, gdje smo analizirali 100 najčešćih

    onkogena i tumor supresorskih gena. Sekvenca od 600 nukleotida, od -500 do 100 TSS (transcription

    start site) od onkogena i tumor supresorskih gena su analizirane, gdje je izračunata gustina gvanina. U

    analizu su bile uključene G ponavljajuće sekvence od 2 do 7 G. Rezultati su pokazali da se G gustina

    povećava od -500 do 100 i više kod tumor supresorskih gena. G gustina je imala maksimum u -/+100

    od T . Gustina G je upoređena sa ekspresijom onkogena i tumor supresorskih gena kod pacijenata sa

    kolorektalnim karcinomom (n=174).

    22. Islamagic E, Kurtovic S, Kozaric M, Hadzimesic ES, Hasic A, Mehinovic L, Kurtovic-Kozaric A. The Three Year Follow-up of CML Patients Treated with First-line Generic and First-line Branded Imatinib

    in Bosnia and Herzegovina. International Journal of Hematology and Oncology. 2017;27(1),8-12.

    (IF 1.67; Web of Science, CrossRef, EBSCO, SCI Emerging source citation Index, CAS, Scopus).

    Imatinib mesilat, selektivni BCR-ABL tirozin kinazni inhibitor, je etabliran kao standard u liječenju

  • 20

    pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom. U ovoj studiji, uporedili smo trogodišnje kliničke

    ishode pacijenata koji su dobili prvu liniju Gliveka (Grupa 1) sa pacijentima koji su dobili prvu liniju

    genetičkog imatiniba (Grupa 2) u Bosni i Hercegovini. Na 24 mjeseca nakon početka terapije,

    kompletan citogenetski odgovor i veliki molekularni odgovor su bili slični u dvije grupe (CCyR je bio

    69% v. 70%; MMR je bio 54% vs. 48%). Pacijenti na prvoj liniji generičkog imatiniba su imali veću

    stopu zatajenja u poređenju sa pacijentima koji su tretirani prvom linijom terapije.

    23. Hadziabdic N, Sulejmanagic H, Kurtovic-Kozaric A. (2017) The role of general dental practitioners in the detection of early-stage oral malignancies--A review. Journal of Oral and Maxillofacial Surgery,

    Medicine and Pathology. 29: 363-376. (SiteScore 0.23; Scopus).

    Pošto je rana dijagnoza važna u prognozi oralnog kancera, opći stomatolog mora imati sposobnost da

    prepozna kliničke znake i simptome ove bolesti. Ovaj revijalni članak opisuje ulogu stomatologa u

    prepoznavanju ranih stadija oralnog kancera.

    24. Dogan S, Kurtovic-Kozaric A. Changes of Molecular, Cellular and Biological Activities According to microRNA-mRNA Interactions in Ovarian Cancer. Computational Molecular Biology. 2015;5 (4); 1-8.

    (CrossRef).

    mikroRNK je nekodirajuća RNK sekvenca, 20-22 nukleotida, koja ima funkciju u utišavanju genske

    ekspresije. Promjene u normalnoj mikroRNK ekspresiji vodi ka tumorskoj progesiji. Ova studija je

    urađena da se pojasne promjene u ekspresiji mikroRNK u kanceru ovarija u poređenju sa normalnom

    ekspresijom. U uzorcima tumora, od 680 mikroRNK tipova, 230 je imalo visoku ekspresiju, 295 je

    imalo nisku ekspresiju i 155 nije bilo eksprimirano. Kada smo kategorizirali mikroRNK na osnovu

    povećanja od >50 puta, našli smo 31 visoko i 89 nisko eksprimiranu mikroRNK. Velike razlike u

    aberantnoj ekspresiji su pokazale obim promjena koje imaju mikroRNK. Koristeći Cancerminer alatku,

    našli smo da mRNK mete ovih aberantno ekprimiranih mikroRNK. Našli smo da većina gena koje smo

    pronašli imaju ulogu u ćelijskoj proliferaciji i karcinogenezi.

    25. S Dogan, A Kurtovic-Kozaric, A Hajrovic, M Lisic, E Gokgoz. (2016) Comparison of mll fusion genes expression among the cytogenetics abnormalities of acute myeloid leukemia and their clinical effects. J

    Biom Biostat 7 (312), 2. (PubMed/Medline).

    Mixed-lineage leukemia (MLL) je podtip akutne mijeloidne leukemije sa agresivnijom prognozom od

    drugih podtipova. Translokcije MLL gena sa drugim partner genima formira MLL fuzione proteine kao

    glavne karakteristike MLL leukemije. Dosta studija je demonstriralo da MLL fuzije kao što su MLL-

    AF4, MLL-AF6, MLL-AF9, MLL-AF10, MLL-ENL, MLL-ELL, MLL- P 15 su najčešće

    abnormalnosti koji igraju signifikantnu ulogu u MLL leukemijama.

    26. S Dogan, A Kurtovic-Kozaric, G Karli. (2016) The Detection of Extremely High and Low Expressed Genes by EGEF Algorithm in Invasive Breast Cancer. J Biom Biostat 2016 7 (286), 2. DOI:

    10.4172/2155-6180.1000286 (PubMed/Medline).

    Invazivni rak dojke je heterogena bolest. Analiza ekspresije jedne ili grupe specifičnih gena nije

    dovoljna da se razumije molekularna aktivnost ćelija raka. toga, potrebna je metoda koja daje priliku

    da se uporede slične povišene ili smanjene ekspresije gena. Glavni cilj ovog rada je da se sortiraju

    ekstremno visoko i nisko eksprimirani geni, da se ekstrahuje, uporede i prikupe ti geni. Ekspresioni

    profili 598 uzoraka invazivnog raka dojke i 48 uzoraka normalnog tkiva je analizirano da se napravi

    novi algoritam pod nazivom Extreme Gene Expression Family (EGEF). G F agoritam sortira, grupiše

    i upoređuje najviše i najniže ekpresije gena.

    27. M Karatas, Y Turan, A Kurtovic-Kozaric, S Dogan. (2016) Analysis of Gaucher Disease Responsible Genes in Colorectal Adenocarcinoma. J Biom Biostat 7 (314), 2. (PubMed/Medline).

  • 21

    Gaucher bolest je nasljedna genetička abnormalnost sa defektima u sfingolipidom katabolizmu.

    Mutacije GBA gena koji kodira lisozomalnu β-glucosidazu je glavna karakteristika ove bolesti, a koja

    se takođe može naći u različitim vrstama kancera. Da bi se našla poveznica između ovog oboljenja i

    adenokarcinoma debelog crijeva, genska ekspresija je analizirana tako što se uporedila ekspreija gena u

    adenokarcinomu i Gaucher. Geni GBA, GBA2, GBA3, CARB2 i P AP imaju naviše promjena u

    genskoj ekspresiji.

    28. M Kozaric, M Hukic, A Hasic, A Kozaric, A Kurtovic-Kozaric. (2016) Clinical Significance of Conventional Karyotype and QF-PCR in Detection of Fetal Chromosomal Abnormalities. Journal of

    Fetal Medicine. 4 (1), 7-12 DOI 10.1007/s40556-016-0108-9. (Google Scholar).

    Ova studija upoređuje prednosti dvije metode za detekciju fetalni hromosomalnih aberacija: kariotip i

    QF-PCR, zajedno sa indikacijama za invazivnu prenatalnu dijagnozu. Retrospektivno smo analizirali

    888 amniocenteza sa ili bez kariotipizacije u kombinaciji sa QF-PCR. Uporedili smo rezultate ovih

    analiza sa indikacijama za prenatalno testiranje: starija dob majke, ultrazvučni pregled i serumski

    skrining. Našli smo 39 (4.4%) abnormalnosti, gdje je 59% svih abnormalnosti bilo numeričke, dok je

    41% bilo strukturne abnormalnosti koje se ne mogu detektirati sa QF-PCR. Mnoge sturkturne

    abnormalnosti nemaju kliničku signifikantnost i našli smo da 23% strukturnih abnormalnosti su klinički

    signifikantne ali nedetektabilne putem QF-PCR (0.3% svih amniocenteza). Iako je QF-PCR brza i

    pouzdana metoda za detekciju većine fetalnih aneuploidija, kariotip se treba koristiti ako postoji sumnja

    na druge abnormalosti.

    29. L Mehinović, Z ukobrat-Bijedić, A Husić- elimović, A Kurtović-Kozarić, et al. (2018) Association between alpha-fetoprotein and other serological markers in patients with hepatocellular carcinoma: one

    center's experience. Journal of IMAB–Annual Proceeding Scientific Papers. 24 (3), 2160-2165.

    (Google Scholar, CrossRef).

    U ovoj studiji analizirani su biohemijski parametri u serumu pacijenata sa dijagnozom

    hepatocelularnog karcinoma (HCC) C i B virusne etiologije. vi pacijenti, 31 muškarac i 20 žena, sa

    dijagnozom HCC su tretirani na Kliničkom centru Univerziteta u arajevu. erum alfa-fetoprotein je

    analiziran kao tumorski marker kao i hepatitis markeri kao što su HBs Ag, anti-HBs, anti-HBc, anti-

    HCV and anti-HB. Najveći broj pacijenata (68.62%) je imao cirozu jetre sa C viralnom etiologijom a

    koji su razvili kancer. Ingifikantne razlike u A T i ALT su nađene između muškaraca i žena.

    Pozitivna korelacija je etablirana između AFP i drugih parametara, dok su signifikantne razlike nađene

    između AFP i γGT.

    30. A Kurtovic-Kozaric, L Mehinovic, H Komic, M Kozaric, A Husic-Selimovic, Ziegler M, Liehr T. (2017) Human Cytogenetics Case Report Yet Unreported Heteromorphic Variant in Chromosome 17. J

    Genetics Genomes 1 (101), 2. (Google Scholar, CrossRef).

    Heteromofne varijante kao što su Yq12 se mogu ubaciti u autosomalne hromosome, gdje je do sada

    nađeno da su bili ubačeni u hromosome 1, 7, 11, 13, 14, 15, 21 i 22. Ovdje opisujemo novu iserciju

    Yq12 heterohromatina u hromosom 17. Metode: GTG-, C-banding, fluorescentna in situ hibridizacija

    (FI H), kao i human heterohromatin specifične multicolor FI H probe (HCM-mix). Whole

    chromosome painting (wcp) proba za #17 zajedno sa probom za Yq12 heterohromatin was je

    hibridizirana za uzorak pacijenta. Y mikrodelecije su urađene da se detektuju moguće AZF delecije.

    Muški pacijent je imao normalnu analizu sperme i nije imao delecije AZF regiona. GTG i C bojenje je

    pokazalo dodatni band na 17q21. FISH studije su otkrile da insercija je derivirana od Yq12.

    B. Cjeloviti originalni naučnoistraživački radovi objavljeni u zbornicima međunarodnih skupova–

    Proceedings od posljednjeg izbora (ukupno 9, od toga 8 u Q1)

  • 22

    31. Hadzimesic Suljovic E, Radovic S, Sofo-Hafizovic A, Kurtovic-Kozaric A. (2017) BCL2 and Ki-67 as independent predictors of poor risk IPI group of patients with diffuse large B cell lymphoma.

    Haematologica 102: 286. PB2087. 27.06.2017. (IF: 7.57; Q1, PubMed/Medline, WoS Core

    Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    Analizirani su imunohistohemijski parametri BCL2 i Ki-67 na uzorcima difuznog velikostaničnog

    limfoma koji su se pokazali kao nezavisni prediktori lošeg ishoda pacijenata koji su klinički svrstani u

    IPI rizičnu grupu.

    32. Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Kurtovic S, Hasic A, Bijedic V, Colakovic F, Skobic Bovan N. (2017) Front-line nilotinib is a better choice than front-line imatinib for CML patients with delayed

    treatment: 11 year follow-up. Haematologica 102: 286. PB1837. 27.06.2017. (IF: 7.57; Q1,

    PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    Pacijenti sa hroničnom mijelodnom leukemijom su tretirani sa dvije vrste lijekova, imatinibom i

    nilotinibom. Pacijenti koji su čekali napočetak terapije i terapiju započeli sa nilotinibom su imali bolji

    ishod nego pacijenti koji su započeli terapiju sa imatinibom. Pacijenti su praćeni 11 godina.

    33. Catic A, Sophian A, Mazur L, Kurtovic-Kozaric A, et al. (2017) The frequency of a novel KANK1 and NTRK3 translocation and BRAF(V600E) mutation in patients diagnosed with metanephric

    adenoma utilizing molecular mechanisms. Journal of Clinial Oncology. 35 (15): 1537. 20. 05.2017.

    Poster prezentacija. (IF: 26.3; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI

    Expanded, itd). (P)

    Nova translokacija je nađena u uzorcima metanefričnog tumora, i to između hromosoma 9 i 15.

    Molekularnim metodama je pokazano da je translokacija u KANK1 i NTRK3 genima. Dodatne analize

    su pokazale da metanefrični adenomi koji nemaju ovu translokaciju sadrže BRAF 600 mutaciju.

    34. Kozaric Kurtovic A, Islamagic E, Beslija S, et al. (2017) Long term efficacy of nilotinib as front- and second-line therapy in Bosnia and Herzegovina: Real life experience. Journal of Clinical Oncology.

    35 (15): e18549. (IF: 26.3; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI

    Expanded, itd). (P)

    U ovom radu se analiziraju dugoročni efekti TKI nilotiniba kao prva i druga linija terapije u liječenju

    pacijenata sa hroničnom mijeloidnom leukemijom. Pacijenti imaju bolji ishod ako su liječeni odmah sa

    nilotinibom nego ako su liječeni prvo sa imatinibom a onda sa nilotinibom.

    35. Kurtovic Kozaric A, Kugic A, Kurtovic A, Beslija S, et al. (2016) The effects of delayed imatinib mesylate treatment on outcome in patients with GIST. Journal of Clinical Oncology. 35 (15): e22518.

    (IF: 26.3; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    U ovom radu se analizira efekat odgođenog tretmana sa imatinibom na pacijente sa gastrointestinalnim

    tumorom. fekat čekanja nije jako izražen, te pacijenti koji su čekali na imatinib imaju sličan ishod kao

    i oni koji su ga odmah primili.

    36. Kozaric Kurtovic A, Islamagic E, Radich JP, et al. (2016) The comparison of efficacy between generic and branded imatinib in achievement of overall survival and cytogenetic responses in CML patients in

    Bosnia and Herzegovina. Blood. 128 (22): 5451. 02.12.2016. (IF: 16.6; Q1, PubMed/Medline, WoS

    Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    Komparacija efikasnosti generičkog i brendiranog imatiniba je pokazala sličnost u ukupnom

    preživljenju, citogenetskom odgovoru i molekularnom odgovoru pacijenata sa hroničnom mijeloidnom

    leukemijom.

    37. Mehinovic L, Kozaric A, Dizdarevic A, et al. (2016) Clinical characteristics of acute myeloid leukemia patients from regions contaminated with depleted uranium: 20 year analysis. Haematologica. 101 (1):

    385-386. E941. 06.2016. (IF: 7.57; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents,

  • 23

    SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    Pacijenti sa akutnom mijeloidnom leukemijom imaju lošije kliničke parametre u poređenju sa

    pacijentima koji dolaze iz oblasti pogođenih ratnim dešavanjima (bombardovanje sa artiljerijom koja

    ima osiromašeni uranij).

    38. Kozaric A, Mehinovic L, Kurtovic S. (2016) Clinical characteristics of patients with myeloid neoplasms from regions contaminated with depleted uranium: 20 year analysis. Haematologica.

    101(1): 506-506. E1228. 06.2016. (IF: 7.57; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current

    Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    Pacijenti sa mijeloidnim neoplazmama kao što su AML, MD i MPN imaju lošije kliničke parametre u

    poređenju sa pacijentima koji dolaze iz oblasti pogođenih ratnim dešavanjima (bombardovanje sa

    artiljerijom koja ima osiromašeni uranij).

    39. Catic A, Kurtovic-Kozaric A, Sophian A, et al. (2018) Prevalence of KANK1-NTRK3 fusion in renal metanephric adenomas that lack BRAF mutations. Cancer Genetics. 224:59. 23. 08.2018. (IF 2.18;

    Q2, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    Analiza metanefričnih adenoma koji imaju prisustvo KANK1-NTRK3 a nemaju BRAF mutaciju.

    C. Kongresna priopćenja nakon izbora u zvanje vanrednog profesora (ukupno 29, od toga 5 u Q1)

    40. Dogan S, Kozaric A, Fatih Ozturk. (2015) New Possible Targetable Genes For Future Treatment of MLL Leukemias. NCRI National Cancer Conference. Liverpool, UK. Novembar 9-11, 2015. Oralna

    prezentacija. (O)

    41. Dogan S, Kurtovic-Kozaric A, Marjanovic D, Turan Y. (2015) Differential gene expression and methylation signatures of mixed lineage leukemias. Abstract number: ABS-465-ISABS-2015. Ninth

    ISABS Conference on Forensic, Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individualized

    Medicine, Bol, Island of Brač, Croatia, June 22-26, 2015. (P)

    42. Kozaric M, Godinjak Z, Nefic H, Kurtovic-Kozaric A. (2015) Clinical significance of conventional karyotype and qf-pcr in detection of fetal chromosomal abnormalities: 3-year single centre evaluation”

    Abstract number: ABS-462-ISABS-2015. Ninth ISABS Conference on Forensic, Anthropologic

    Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individualized Medicine, Bol, Island of Brač, Croatia, June 22-

    26, 2015. (P)

    43. Mehinovic L, Kurtovic-Kozaric A, Stomornjak-Vukadin M, Kurtovic-Basic I. (2015) Detection of chromosomal microdeletions and structural rearrangements in the pediatric population using

    conventional karyotyping and fluorescence in situ hibridization. II Symposium of Geneticists in B&H

    with international participation. Biotechnology in Medicine and Agriculture. Banja Luka, 2-3.10.2015.

    (P)

    44. Kurtovic-Basic I, Stomornjak-Vukadin M, Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Konjhodzic R. (2015) Cytogenetics and molecular-cytogenetics diagnostics of triploidy. II Symposium of Geneticists in B&H

    with international participation. Biotechnology in Medicine and Agriculture. Banja Luka, 2-3.10.2015.

    (P)

    45. Komic H, Mehinovic L, Islamagic E, Eminovic E, Kurtovic-Kozaric A. (2017) Detection of Y microdeletion in Bosnian males with fertility disorders. European Journal of Human Genetics. 2017 24

    (1): E-P01.64. Published in: European Journal of Human Genetics volume 26, pages 820–1023 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-018-0248-6?proof=true. (P)

    46. Mehinovic L, Komic H, Dizdarevic-Rekic A, Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A. (2017) Potential risk of

  • 24

    myeloid neoplasms in people living in areas contaminated with depleted uranium. 2017 24 (1): E-

    P07.40. Published in: European Journal of Human Genetics volume 26, pages 820–1023 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-018-0248-6?proof=true. (IF: 4.35; Q1, PubMed/Medline,

    WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    47. Kurtovic-Kozaric A, Komic, Mehinovic L, et al. (2019) Incidence of Y chromosome microdeletions in different world populations: systematic review. European Human Genetic Conference, P01.94B. Poster

    prezentacija. Gothenburg, Švedska. 15-18.06.2019. Published in: European Journal of Human Genetics

    volume 27, pages 1174–1813 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-019-0494-2. (IF: 4.35;

    Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    48. Islamagic E, Kurtovic S, Hasic A, Kurtovic-Kozaric A. (2019) How we treat CML patients in developing countries: 13 years experience. European Human genetic conference, E-P07.01 Gothenburg,

    Švedska. 15-18.06.2019. Published in: European Journal of Human Genetics volume 27, pages 1814–

    1920 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-019-0493-3. (IF: 4.35; Q1, PubMed/Medline,

    WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    49. Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Islamagic E, et al. (2019) Clinicopathological characteristics of patients with myeloid neoplasms: 20 year follow up. European Human genetic conference, E-P07.05

    Gothenburg, Švedska. 15-18.06.2019. Published in: European Journal of Human Genetics volume 27,

    pages 1814–1920 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-019-0493-3. (P)

    50. Komic H, Islamagic E, ... Kurtovic-Kozaric A. (2019) Clinical outcome of patients with JAK2, CALR and MPL positive myeloproliferative neoplasms. European Human genetic conference, E-P07.06

    Gothenburg, Švedska. 15-18.06.2019. Published in: European Journal of Human Genetics volume 27,

    pages 1814–1920 (2019). https://www.nature.com/articles/s41431-019-0493-3. (IF: 4.35; Q1,

    PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    51. Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Malesevic R, et al. (2016) Ten-year trends in prevalence of Down syndrome in a developing country: impact of the maternal age and prenatal screening. European Journal

    of Human Genetics. 24 (1): 59. Poster prezentacija. 21-24.05.2016. Barcelona, Španija. (IF: 4.35; Q1,

    PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    52. Komic H, Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, et al. (2017) Systematic literature review of Y microdeletion in different world populations including case series from Bosnia and Herzegovina. The

    Tenth ISABS Conference on Forensic and Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in

    Individual Medicine. MG29. 19-24.07.2017 Dubrovnik, Hrvatska. Poster prezentacija. (P)

    53. Komic H, Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Kozaric M, Husic-Selimovic A, Liehr T, Ziegler M. (2017) Yet unreported heteromorphic variant in chromosome 17. The Tenth ISABS Conference on

    Forensic and Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in Individual Medicine. MG28. 19-

    24.07.2017 Dubrovnik, Hrvatska. Poster prezentacija. (P)

    54. Komic H, Kurtovic-Kozaric A, Mehinovic L, Kurtovic S, Halilovic Z. (2017) Detection of JAK2 and CALR mutations in patients with myeloproliferative neoplasms from Bosnia and Herzegovina. The

    Tenth ISABS Conference on Forensic and Anthropologic Genetics and Mayo Clinic Lectures in

    Individual Medicine. MG51. 19-24.07.2017 Dubrovnik, Hrvatska. (P)

    55. Kurtovic-Kozaric A, Kugic A, Hasic A, et al. (2017) Impact of CD117 expression on the survival of GIST patients. The Tenth ISABS Conference on Forensic and Anthropologic Genetics and Mayo Clinic

    Lectures in Individual Medicine. MG53. 19-24.07.2017 Dubrovnik, Hrvatska. (P)

    56. Islamagic E, Komic H, Eminovic I, Kurtovic S, Hasic A, Mehinovic L, Halilovic Z, Suljovic Hadzimesic E, Kurtovic-Kozaric A. (2017) Long term clinical outcomes of MPN patients with JAK2,

    CALR and MPL mutations in Bosnia and Herzegovina: 17 years follow-up. European Hematology

    Association, EHA23. 14.06.2018. PB2291. June 14 - 17, 2018. tockholm, Švedska. Online abstrakt.

    (*,5)

  • 25

    57. S Beslija, T Ceric, B Hasanbegovic, Kurtovic-Kozaric A, A Pasic, N Mahic. (2017) Clinical outcomes of delayed start of trastuzumab treatment in patients with early breast cancer: ml25232 study. Annals of

    Oncology 28 (suppl_5). (IF: 14.20; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents,

    SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    58. Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Skobic-Bovan N, Bijedic V. (2017) The efficacy of generic and branded imatinib in CML patients in Bosnia and Herzegovina. 2nd Congress of

    Hematology and Transfusion of B&H. Broj 85. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

    59. Halilovic Z, Muhic A, Bejtovic I, Hanjalic M, Kurtovic-Kozaric A. (2017) Molecular monitoring of BCR-ABL1 transcript in chronic myeloid leukemia patients using quantitative real-time PCR. Broj 87.

    2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

    60. Halilovic Z, Muhic A, Bejtovic I, Hanjalic M, Zahirovic E, Kurtovic-Kozaric A. Chimerism detection after allogeneic transplant of hematopoietic stem cells at the Clinical Center of the University of

    Sarajevo. Broj 88. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo,

    BiH. (O)

    61. Halilovic Z, Muhic A, Bejtovic I, Zahirovic E, Hanjalic M, Kurtovic-Kozaric A. Molecular detection of JAK2 V617F gene mutation in patients with myeloproliferative neoplasms during the period from

    2015 to 2017 in Bosnia and Herzegovina. Broj 89. 2nd Congress of Hematology and Transfusion of

    B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

    62. Halilovic Z, Muhic A, Bejtovic I, Zahirovic E, Hanjalic M, Kurtovic-Kozaric A. Molecular detection of thrombophilia: mutations in genes for Factor II, Factor V, MTHFR, PAI-1, and Factor XIII during

    the period from 2014 to 2017 in Bosnia and Herzegovina. Broj 90. 2nd Congress of Hematology and

    Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

    63. Suljovic Hadzimesic E, Radovic S, Sofo-Hafizovivc A, Obralic N, Bilalovic N, Kozaric A, Dizdarevic A, Kurtovic S, Bijedic V, Skuric-Tomic M. BCL-2 i Ki-67 kao nezavisni prognostički faktori kod

    oboljelih od difuznog B velikostaničnog limfoma nepovoljne IPI-grupe. Broj 91. 2nd Congress of

    Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

    64. Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Bijedic V, Colakovic F, Skobic Bovan N. First-line nilotinib compared to first-line imatinib in CML patients with delayed start of treatment. Broj 99. 2nd

    Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

    65. Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A, Islamagic E, Skobic Bovan N, Bijedic V. Long term efficacy of nilotinib as second line therapy in Bosnia and Herzegovina: Real life experience. Broj 100. 2nd

    Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

    66. Mehinovic L, Komic H, Dizdarevic Rekic A, Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A. Potential risk of myeloid neoplasms in people living in areas contaminated with depleted uranium. Broj 101. 2nd

    Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

    67. Kurtovic S, Kurtovic-Kozaric A, Komic H, Burekovic A. Clinical outcomes of patients with JAK2, CALR or MPL positive myeloproliferative neoplasms in Bosnia and Herzegovina. Broj 102. 2nd

    Congress of Hematology and Transfusion of B&H. 26-28.10.2017. Sarajevo, BiH. (O)

    68. Islamagic E, Kurtovic S, Komic H, Eminovic I, Dizdarevic-Rekic A, Burekovic A, Uzunovic A, Kurtovic-Kozaric A. Mutational signatures affect the phenotypic presentation of disease subtypes in

    MPN patients from Bosnia and Herzegovina. European Hematology Association, EHA23. 15.06.2019.

    PB2234. June 14 - 17, 2019. tockholm, Švedska. Online abstrakt. (*,5)

  • 26

    2.1.3. Osvrt Komisije na originalne naučne radove kandidatkinje

    Radovi kandidatkinje mogu se svrstati u sljedeće skupine:

    1. Radovi o tumorskoj molekularnoj genetici hematoloških neoplazmi, a koji su u svrhu istraživanja uključili

    primjenu različitih metoda: citogenetičkih, molekularnih i genomskih tehnika,

    2. Radovi o prenatalnoj i postnatalnoj genetici , gdje su analizirani pacijenti sa rijetkim oboljenjima

    prenatalno ili postnatalno, koristeći genetičke i molekularne tehnike,

    3. Radovi o genetično-epidemiološkim analizama, gdje su se analizali trendovi povezanosti genetičkih

    markera i bolesti, kao i nedostaci u liječenju pacijenata sa hemato-onkološkim bolestima radi nedostatka

    terapije, a koji su uticali na ishod pacijenata i njihovo praćenje molekularno-genetičkim metodama.

    Prethodno prikazan pregled objavljenih originalnih radova prof. Kozarić nakon izbora u vanrednog

    profesora (njih 30), zatim 9 radova prezentiranih na kongresima koja prate Current Contents Citation Index

    (njih 9), kao i druge radove objavljene na kongresima (njih 29). ećina radova se fokusira na genetičku i

    genomsku analizu hemato-onkoloških tumora, kao što su akutna mijeloidna leukemija, hronična mijeloidna

    leukemija, mijeloproliferativne neoplazme i slično. U radovima su se koristile najnovije metode od

    genomskih analiza kao što su RNA- eq, jednostanične transkirptomske analize, ekzomsko sekvenciranje,

    kao i genetičke metode poput PCR, real time PCR, sekvenciranja, kariotipizacije i FI H. Od navedenih

    radova, 9 od 30 originalnih radova je objavljeno u Q1 časopisima, 8 od 9 radova u Current Contents

    je objavljeno u Q1 časopisima, a 5 od 29 kongresnih radova je objavljeno u Q1 časopisima (ukupno 22

    rada u Q1).

    Posebno značajni radovi su pod brojem 1, 2, 3 i 4, koji se tiču genetičke i genomske karakterizacije

    mijeloidnih oboljenja. Radovi pod brojem 1 i 2 koriste najsavremenije genomske tehnike, eksprimente na

    model organizmima kao što su miš i kvasac, da bi otkrili genomske karakteristike mijeloidnih oboljenja a

    koje bi mogle imati važan značaj u dijagnostici ovih bolesnika. Radovi 3 i 4 se tiču pacijenata u Bosni i

    Hercegovini, gdje se genetički i klinički analiziraju CML i GI T pacijenti koji su čekali na terapiju

    inhibitorima tirozin kinaza. Ove studije su karakteristične za BiH te daju važne podatke o biološkom razvoju

    bolesti tokom perioda čekanja.

    O interesu znanstvene javnosti za radove prof. Kozarić pokazuju podaci o citiranosti u radovima

    drugih autora u različitim bazama podataka što je prikazano u sljedećem poglavlju 2.1.4. Impozantni su

    brojevi citiranosti koji se mjere s nekoliko stotina puta.

    2.1.4. Podaci o citiranosti u referentnim međunarodnim časopisima

    Podaci o citiranosti u referentnim međunarodnim časopisima

    1950-2020 do 2015 od 2015

    Web of Science Ukupno

    Do

    zadnjeg

    izbora

    Od

    zadnjeg

    izbora

    Kurtovic-Kozaric

    A Broj radova 36 4 34

    Broj citata 235 152 132

    Bez samo citata 228 152 125

  • 27

    Kozaric A Broj radova 13 5 9

    Broj citata 4 3 2

    Bez samo citata 4 3 2

    Kurtovic A Broj radova 30 15 16

    Broj citata 494 467 35

    Bez samo citata 493 467 35

    Ukupno Broj citata 733 622 169

    Bez samocitata 725 622 162

    Google scholar Ukupno do 2015 od 2015

    Kurtovic-Kozaric

    A

    1029 375 654

    h-index 12 11

    i10-index 13 12

    2.2. RADOVI PREZENTIRANI NA NAUČNIM SKUPOVIMA

    Oralna prezentacija(O); Poster (P); Učešće s pozivom(*,5); Organizacija kongresa (**, 5)

    2.2.1. Kongresna priopćenja u Current Contents Citation Index (Web of Science) prije izbora u zvanje

    vanrednog profesora (ukupno 4, od toga 3 u Q1, 1 u Q2)

    1. Kurtovic Kozaric A, Makishima H, Przychodzen B, et al. (2103) Novel mutations in spliceosomal gene PRPF8 show ring sideroblast phenotype in patients with myeloid neoplasms. Leukemia Research

    37 (1): S36. (IF: 2.32; Q2, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI

    Expanded, itd). (P)

    2. Kurtovic A, Kozaric A, Kurtovic S, et al. (2014) The effect of delayed TKI treatment on cytogenetics and molecular responses: 8 year follow-up study in Bosnia. Haematologica 99 (1): 345. (IF: 7.57; Q1,

    PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    3. Kurtovic Kozaric A, Makishima H, Przychodzen BP, Singh J, Konarska MM, Otrock ZK, Nakashima M, Hsi ED, Yoshida K, Ogawa S, Maciejewski JP. (2013) PRPF8 Defects Cause Missplicing In

    Myeloid Malignancies. Blood 122(21):2838. Dobitnik Abstract Achievement Award Recepient. (IF:

    16.6; Q1, PubMed/Medline, WoS Core Collection, Current Contents, SCI, SCI Expanded, itd). (P)

    4. Padgett R, Przychodzen B, Kozaric A, et al (2013) Somatic spliceosomal factor mutations in bone marrow neoplasms lead to alterations in alternative splicing patterns that relate to the splicing

    mechanism. RNA 2013: The 18th Annual Meeting of The RNA Society.