25
Fingerlandův ústav patologie, LF UK HK Hlavův ústav patologie, 1.LF UK Ústav histologie a embryologie, LF UK HK Šiklův patologicko-anatomický ústav, LF UK Plzeň Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný projekt lékařských fakult UK Aleš Ryška, Jaroslava Dušková, Jaroslav Mokrý, Marie Ludvíková

Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný

Fingerlandův ústav patologie, LF UK HKHlavův ústav patologie, 1.LF UK

Ústav histologie a embryologie, LF UK HKŠiklův patologicko-anatomický ústav, LF UK Plzeň

Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie

- společný projekt lékařských fakult UK

Aleš Ryška, Jaroslava Dušková, Jaroslav Mokrý, Marie Ludvíková

Page 2: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný

Fotografie určitéčásti preparátu neposkytuje ucelený obraz

Page 3: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný

Hlavní výhoda virtuálních slidů = možnost prohlédnout celý preparát

při libovolném zvětšení

Page 4: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný

Jak vzniká virtuálnípreparát

● mikroskop● objektivy (Plan – Apo)● CCD kamera, (scanner)● motorizovaný stolek ● PC + monitor + software● kvalitní preparát na standardním sklíčku● automatický podavač sklíček

Page 5: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný
Page 6: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný
Page 7: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný

Cíle řešení

● digitalizace mikroskopických preparátů z normální histologie a patologie

● převedení sbírky mikroskopických preparátů do podoby virtuálních preparátů

● LF UK v Hradci Králové● 1. LF UK ● LF UK v Plzni ● postupně i další lékařské fakulty UK

Page 8: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný

Postup a způsob řešení

● robotizovaný mikroskop + SW

Page 9: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný

Postup a způsob řešení

● MIRAXSCAN + SW (MiraxScan, MiraxServer a MiraxViewer, Mirax2Axiovision Converter)

● prohlížení, anotace, šipky● převod pro www

Page 10: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný

Postup a způsob řešení

● osloveny všechny LF UK● recentní seznamy preparátů● 2 jednotné databáze - histologická a

patologická● postupné naplňování virtuálními preparáty● průměrný objem dat ~ 1 GB/slide

Page 11: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný

Preparáty na jednotlivých LF

Patologie HistologieVšechny LF 418 313HK 155 82Plzeň 103 841.LF 316 2213.LF 109 165

Page 12: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný

Virtuální preparáty● poznámky, partie hodné zájmu ● lokální server - využití přímo při výuce

Page 13: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný
Page 14: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný
Page 15: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný

Virtuální preparáty

● převedení do strukturované mozaiky obrázků (*.jpg )

● plug-in Macromedia Flash (Zoomify)● zcela volně přístupné● diskový prostor (cca 0,5 TB)●● http://http://www.lfhk.cuni.cz/vipwww.lfhk.cuni.cz/vip

Page 16: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný
Page 17: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný
Page 18: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný
Page 19: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný
Page 20: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný
Page 21: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný
Page 22: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný
Page 23: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný

Další perspektivy projektu

● "virtualizace" dalších preparátů● definitivní naplnění obou databází - 2008 ● sbírka e-learningových materiálů● MIRAXSCAN - umístěn v Hradci Králové● využití v pregrad. i postgraduálním studiu● rozšíření o fluorescenční modul

Page 24: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný
Page 25: Virtuální mikroskopický atlas patologie a histologie - společný