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Virus manipulateur dans un système hôte-parasitoïde
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Génétique et Evolution des Interactions Durables
Département Génétique et Génomique Evolutive
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-Détournement énergétique
-Interactions transcription, traduction, régulation
-Réponse génétique des populations hôtes:
Evolution résistance
population
indi
vidu
PHENOTYPE
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ETENDU
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L. boulardi
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L. boulardi
Transmission verticale strictement maternelle (taux ≈ 98%)
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L. boulardi
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L. boulardi
Transmission horizontale (taux ≈ 55%)
Signification adaptative de ce phénotype étendu ?
0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5
1
0
Proba 2d oeuf gagne la compétition
ESS de superparasitisme
Conflit d’intérêt
parasitoïde
virus
Mécanismes de la manipulation du comportement ?
• Etude de l’expression différentielle des gènes:– Transcriptome :
• Differential display
• Banque soustractive (thèse S. Patot, en cours)
– Protéome :• Gels bidimensionnels (en cours)
• Recherche de marqueurs moléculaires
Infecté (S) Non infecté (NS)
Protéomique: résultats préliminaires (P. Gibert, H. Henri)
pHi4 7
PM
Transcriptomique
• ADDER (Amplification of Double stranded cDNA End Restriction fragments)
– Production d’une librairie de cDNA représentatifs de la population d’ARNm.
– 192 combinaisons d’amorces : division du transcriptome en sous-parties facilement visualisables sur gel.
Kornmann et al. 2001
Nucleic Acid Research
NS SNS S
Corps entier Appareil reprod.
100
200
300
400
500
-découpage des bandes d’intérêt
-clonage
-séquençage
-comparaison avec les banques de données
=+-N=5300
Vue d’ensemble
Sur-exprimé en présence du virusQuickTime™ and a
TIFF (LZW) decompressorare needed to see this picture.
NS S
band size (bp) Accession # Name Species E-value310 CNS08IXH TCTP Aedes albopictus 4,00E-26314 CNS08IXH TCTP Aedes albopictus 4,00E-26418 AE003502 Calcineurin A Drosophila melanogaster 2,00E-24540 SPTUBBI beta-tubulin Strongylocentrotrus purpuratus 3,00E-78373 AF182715 Actin Lymantria dispar 3,00E-05380 BC005503 ? Mus musculus 2,00E-15392 XM_397469 ? Apis mellifera 9,00E-10243 -247 -154 -261 -154 -209 -201 -381 -291 -461 -445 -
PAS D’HOMOLOGIE AVEC LES SEQUENCES DES BANQUES
Sur-exprimé en présence du virusQuickTime™ and a
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NS S
band size (bp) Accession # Name Species E-value310 CNS08IXH TCTP Aedes albopictus 4,00E-26314 CNS08IXH TCTP Aedes albopictus 4,00E-26418 AE003502 Calcineurin A Drosophila melanogaster 2,00E-24540 SPTUBBI beta-tubulin Strongylocentrotrus purpuratus 3,00E-78373 AF182715 Actin Lymantria dispar 3,00E-05380 BC005503 ? Mus musculus 2,00E-15392 XM_397469 ? Apis mellifera 9,00E-10243 -247 -154 -261 -154 -209 -201 -381 -291 -461 -445 -
Ca++ binding
Réponse au stress induit par un virus
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PHENOTYPE
(superparasitisme)
ETENDU
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population
indi
vidu