YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİgenetik.yeditepe.edu.tr/wp-content/uploads/BOLOGNA-DERS-PAKETI_GENETIK... · 1-Ders Dinleme ve anlamlandırma Standart derslik

1

2017

YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ

MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ

BOLOGNA

LİSANS

GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK PROGRAMI

BİLGİ PAKETİ

BÖLÜM BAŞKANI: PROF. DR. FİKRETTİN ŞAHİN

[email protected] Dahili: 1619

BOLOGNA SORUMLUSU: YARD. DOÇ. DR. HÜSEYİN ÇİMEN

[email protected] Dahili: 3259

mailto:[email protected]


2

YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ

MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ – GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK LİSANS PROGRAMI

BİLGİ PAKETİ (2017)

AMAÇ VE HEDEFLER

Genetik ve Biyomühedislik lisans programın amacı; genetik, biyomühendislik ve biyoteknoloji

alanında teknik ve temel bilgilere sahip, yaratıcı çözüm üreten ve uygulamada öncü bireyler

olarak yurt içi veya yurt dışı akademik, endüstriyel ve resmi kurumlarda liderlik rolünü

üstlenen, etik ve profesyonel sorumluklarının bilincinde Gen Mühendisi ve Biyomühendis

yetiştirmektir.

Moleküler Biyoloji ve Genetik, Biyoinformatik, Nanobiyoteknoloji, Doku Mühendisliği ve

Biyomalzemeler, Kök Hücre Teknolojileri gibi oldukça güncel konularda eğiterek akademi,

sanayi, klinik tıp, adli tıp gibi çeşitli alanlarda çözüm üretebilen ve ülkeye ulusal veya

uluslararası arenada rekabet gücü kazandırabilecek lider ruhlu bireyleri topluma

kazandırmak hedefimizdir.

PROGRAM ÖĞRENME ÇIKTILARI

PÇ01. Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahiptir.

PÇ02.

Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptar, tanımlar

ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunar.

PÇ03.

Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız

olarak deney tasarlar, deney yapar, veri toplar, sonuçları analiz edip ve yorumlar.

PÇ04.

İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da

süreci modern teknikler ile tasarlar.

PÇ05.

Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışır ve sorumluluk alarak karar almada

belirleyicidir.

PÇ06.

Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve

proje üretebilir.

PÇ07.

Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda

farkındalık yaratır.

PÇ08.

Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda

ifade edebilme becerisine sahiptir.

PÇ09.

Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisine

sahiptir.

PÇ10.

Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve

toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisine sahiptir.

3

Eğitim Öğretim Metotları

Öğretme – öğrenme yöntem ve stratejileri, öğrencilerin kendi kendine çalışma, yaşam boyu öğrenme, gözlem yapma, başkasına öğretme, sunma, eleştirel düşünme, takım çalışması, bilişimden etkin yararlanma gibi becerilerini arttıracak şekilde seçilmektedir. Ayrıca, öğretim tarzının farklı kabiliyetleri olan öğrencileri destekleyecek biçimde olmasına dikkat edilir. Programında kullanılan eğitim-öğretim metotları aşağıdaki listede verilmiştir*: (*) Dersin özelliklerine göre burada belirtilen yöntemlerin biri veya birkaçı uygulanabilir.

Eğitim - Öğretim Yöntemleri*

Başlıca öğrenme faaliyetleri Kullanılan Araçlar

1-Ders Dinleme ve anlamlandırma Standart derslik teknolojileri, çoklu ortam araçları, projektör, bilgisayar, tepegöz

2-Tartışmalı Ders Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme, eleştirel düşünme, soru geliştirme

Standart derslik teknolojileri, çoklu ortam araçları, projektör, bilgisayar, tepegöz

3-Özel Destek / Yapısal Örnekler

Önceden planlanmış özel beceriler

4-Rol Yapma / Drama Önceden planlanmış özel beceriler Standart derslik teknolojileri, özel donanım

5-Problem Çözme Önceden planlanmış özel beceriler

6-Vaka Çalışması Önceden planlanmış özel beceriler

7-Beyin Fırtınası Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme, eleştirel düşünme, soru geliştirme, takım çalışması


8-Küçük Grup Tartışması

Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme, eleştirel düşünme, soru geliştirme


9-Gösterim Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme Gözleme imkan verecek gerçek ya da sanal ortam

10-Benzetim Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme, Bilişim becerileri

Gözleme imkan verecek gerçek ya da sanal ortam

11-Seminer Araştırma – yaşam boyu öğrenme, yazma, okuma, Bilişim, Dinleme ve anlamlandırma, yönetsel beceriler

Standart derslik teknolojileri, çoklu ortam araçları, projektör, bilgisayar, tepegöz, özel donanım

12-Grup Çalışması Araştırma – yaşam boyu öğrenme, yazma, okuma, Bilişim, eleştirel düşünme, soru geliştirme, yönetsel beceriler, takım çalışması

İnternet veri tabanları, kütüphane veri tabanları, e-posta, çevrimiçi sohbet, Web tabanlı tartışma forumları

13-Saha / Arazi Çalışması

Gözlem/durumları işleme, Araştırma – yaşam boyu öğrenme, yazma, okuma

14-Laboratuar Gözlem/durumları işleme, Bilişim, yönetsel beceriler, takım çalışması

Özel donanım

15-Ödev Araştırma – yaşam boyu öğrenme, yazma, okuma, Bilişim İnternet veri tabanları, kütüphane veri tabanları, e-posta

16-Sözlü Araştırma – yaşam boyu öğrenme, durumları işleme, soru geliştirme, yorumlama, sunum

17-İnceleme / Anket Çalışması

Araştırma – yaşam boyu öğrenme, yazma, okuma

18-Panel Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme Standart derslik teknolojileri, çoklu ortam araçları, projektör, bilgisayar, tepegöz, özel donanım

19-Konuk Konuşmacı Dinleme ve anlamlandırma, gözlem/durumları işleme

Standart derslik teknolojileri, çoklu ortam araçları, projektör, bilgisayar, tepegöz, özel donanım

20-Öğrenci Topluluğu Faaliyetleri / Projeleri

Gözlem/durumları işleme, eleştirel düşünme, soru geliştirme, takım çalışması, Araştırma – yaşam boyu öğrenme, yazma, okuma, yönetsel beceriler, Önceden planlanmış özel beceriler

(*) Dersin özelliklerine göre burada belirtilen yöntemlerin biri veya birkaçı uygulanabilir.

4

GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ (2017 GÜZ) BİRİNCİ YARIYIL T U L Y A İKİNCİ YARIYIL T U L Y A

GBE 111 Biyoloji I 2 1 3 4 8 GBE 102 Biyoloji II 3 0 0 3 3

MATH 131 Kalkülüs I 3 2 0 4 6 MATH 132 Kalkülüs II 3 2 0 4 6

AFE 131 Akademik İngilizce I 2 2 0 3 4 AFE 132 Akademik İngilizce II 2 2 0 3 4

PHYS 101 Fizik I 3 0 2 4 6 PHYS 102 Fizik II 3 0 2 4 6

CHEM 111 Genel Kimya I 2 2 0 3 6 CHEM 112 Kimya II 2 2 0 3 6

CHEM 113 Genel Kimya Lab 1 0 2 2 5

18 30 19 30

ÜÇÜNCÜ YARIYIL T U L Y A DÖRDÜNCÜ YARIYIL T U L Y A

GBE 203 Mikrobiyoloji 2 1 3 4 7 GBE 212 Klasik ve Moleküler Genetik 2 2 0 3 6

GBE 205 Hücre Biyolojisi 2 1 3 4 6 GBE 216 Klasik ve Moleküler Genetik Lab 0 1 3 2 5

CHEM 205 Organik Kimyaya Giriş ve Biyomakromoleküller

2 2 0 3 6 CHEM 215 Analitik Kimya 3 0 2 4 6

GBE 222 Biyometri: Biyomühendislik Uygulamaları için Nümerik ve İstatiksel Yöntemler

2 2 0 3 6 ECON 294 Ekonomi 3 0 0 3 4

ES 117 Bilgisayarlı Hesaplamaya Giriş 2 0 2 3 5 MATH 241 Diferansiyel Denklemler 3 2 0 4 6

HUM 103 Uygarlık Tarihi 2 0 0 2 3

17 30 18 30

BEŞİNCİ YARIYIL T U L Y A ALTINCI YARIYIL T U L Y A

GBE 301 Biyokimya I 2 1 3 4 7 GBE 302 Biyokimya II 2 1 3 4 9

GBE 321 Biyotermodinamik 2 2 0 3 5 GBE 326 Deneysel Genetik ve Biyomühendislik I: İlkeler

2 0 2 3 6

GBE 341 Gen Mühendisliği Teknikleri I 2 2 0 3 6 GBE 342 Gen Mühendisliği Teknikleri II 2 1 3 4 8

GBE 361 Biyotransport Olayları 2 2 0 3 5 GBE XX1 Kısıtlı Seçmeli I 3 0 0 3 5

TKL 201 Türk Dili I 2 0 0 2 2 TKL 202 Türk Dili II 2 0 0 2 2

FE XX1 Serbest Seçmeli I 3 0 0 3 5

18 30 16 30

YEDİNCİ YARIYIL T U L Y A SEKİZİNCİ YARIYIL T U L Y A

GBE 403 Moleküler Biyoloji I 3 0 0 3 6 GBE 404 Moleküler Biyoloji II 2 1 3 4 5

GBE 415 Deneysel Genetik ve Biyomühendislik II: Tasarım ve Uygulamalar

2 2 0 3 6 GBE 492 Mühendislik Projesi 1 0 4 3 8

GBE XX2 Kısıtlı Seçmeli II 3 0 0 3 5 GBE XX3 Kısıtlı Seçmeli III 3 0 0 3 5

GBE 451 Biyoproses Mühendisliği Teknikleri

3 0 0 3 6 GBE XX4 Kısıtlı Seçmeli IV 3 0 0 3 5

ES 301 Mühendislik Yönetimi 3 0 0 3 4 HTR 302 Atatürk İlkeleri & İnkılap Tarihi II 2 0 0 2 2

HTR 301 Atatürk İlkeleri & İnkılap Tarihi I 2 0 0 2 2 FE XX2 Serbest Seçmeli II 3 0 0 3 5

GBE 400 Yaz Stajı 0 2 0 0 1

17 30 18 30

Mezuniyet için Minimum Gerekenler

Kredi 141

AKTS 240

Ders Sayısı 45

Yaz Stajı Sayısı 1

5

DERS BİLGİLERİ

Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat Kredi AKTS

Biyoloji I GBE 111 1 2 + 1 + 3 4 8

Ön Koşul Dersleri YOK

Dersin Dili İngilizce

Dersin Seviyesi Lisans

Dersin Türü Zorunlu

Dersin Koordinatörü

Yard. Doç. Dr. Hüseyin Çimen

Dersi Verenler Yard. Doç. Dr. Hüseyin Çimen

Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerleri

STAJ YOK

Dersin Amacı

Öğrencilerin hücrenin temel biyolojisi hakkında bilgi sahibi

olmalarını sağlamak ve deneysel yaklaşımlar ile pratik

geliştirilmesini sağlamak.

Dersin İçeriği

İşlevsel gruplar ve biyopolimerler; hücre metabolizması ve

fermentasyon; fotosentez; mitoz ve mayoz; DNA yapısı ve

çoğalması; transkripsiyon; translasyon; gen anlatımının kontrolü.

Ders içeriğine paralel laboratuar deneyleri.

Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları

Öğretim Yöntemleri

Ölçme Yöntemleri

1) Hücre yapısı ve fonksiyonunun temel kavramlarının anlaşılması.

1 1,2 A,C

2) Farklı hücre tiplerinin ve iç yapıların ışık mikroskobu kullanılarak incelenmesi ve yorumlanması.

1,3 1,2,3 A,B,C

3) Yaşam bilimleri laboratuar araçlarının doğru şekilde kullanılması ve deney sonuçlarının yorumlanması.

1,3 1,2,3 A,B,C

4) Moleküler Biyoloji tekniklerini kullanarak DNA izolasyonu ve analizini değerlendirebilmek ve analiz edebilmek.

1,3 1,2,3 A,B,C

Öğretim Yöntemleri:

1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Laboratuar, 4: Vaka Çalışması

Assessment Methods:

A: Sınav, B: Deney, C: Ödev, D: Proje

6

DERS İÇERİĞİ

Hafta Konular Çalışma

Malzemeleri

1 Biyolojiye Giriş; Su ve Çevrenin Sağlığı Ders Kitabı/

İnternet sitesi

2 Karbonun Önemi; Polimer İlkeleri Ders Kitabı/

İnternet sitesi

3 Hücre Turu Ders Kitabı/

İnternet sitesi

4 Membran Yapı ve İşlevi; Metabolizmaya Giriş Ders Kitabı/

İnternet sitesi

5 Hücresel Solunum Ders Kitabı/

İnternet sitesi

6 Ara Sınav I

7 Fotosentez Ders Kitabı/

İnternet sitesi

8 Hücre Çevrimi Ders Kitabı/

İnternet sitesi

9 Mayoz ve Eşeysel Hücre Çevrimi Ders Kitabı/

İnternet sitesi

10 Kalıtımın Moleküler Temeli Ders Kitabı/

İnternet sitesi

11 Genden Proteine Ders Kitabı/

İnternet sitesi

12 Ara Sınav II

13 Gen Anlatımının Kontrolü Ders Kitabı/

İnternet sitesi

14 Virüsler Ders Kitabı/

İnternet sitesi

15 Biyoteknoloji Ders Kitabı/

İnternet sitesi

16 Genomlar ve Evrimleri Ders Kitabı/

İnternet sitesi

KAYNAKLAR

Ders Kitabı “Biology”, Mader & Windelspecht, 11. Baskı (Uluslararası Baskı) With CONNECT

Diğer Kaynaklar CONNECT Ödev sitesi http://connect.mcgraw-hill.com

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları pdf formatında çevrimiçi olarak öğrencilerin indirebilmesi için mevcuttur.

7

Ödevler Laboratuar raporları her hafta toplanmaktadır.

Sınavlar 2 Ara Sınav ve 1 Final

DEĞERLENDİRME SİSTEMİ

YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ

Ara Sınav 2 30

Deney 8 40

Ödev 10 10

Proje

Toplam 100

Final Sınavının Başarıya Oranı 20

Yıl İçinin Başarıya Oranı 80

Toplam 100

Ders Kategorisi Uzmanlık / Alan Dersleri

DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI

No Program Öğrenme Çıktıları

Katkı Düzeyi

1 2 3 4 5

1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma.

X

2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi.

3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi

4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi

X

5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi.

6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi

7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık

8

8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi

9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi

10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi

AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU

Etkinlik Sayısı Süresi (Saat)

Toplam İş Yükü (Saat)

Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42

Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön çalışma, pekiştirme) 14 7 98

Ara Sınav 2 2 4

Deney 8 3 24

Ödev 10 2 20

Proje

Final Sınav 1 3 3

Toplam İş Yükü 191

Toplam İş Yükü / 25 (s) 7,64

Dersin AKTS Kredisi 8

9

DERS BİLGİLERİ


Biyoloji II GBE 102 2 3 + 0 + 0 3 3



Dersin Seviyesi

Lisans



Yard. Doç. Dr. Fatih Kocabaş

Dersi Verenler

Yard. Doç. Dr. Fatih Kocabaş

Dersin Yardımcıları

YOK

STAJ YOK

Dersin Amacı

Öğrencilerin temel biyoloji ve evrim hakkında bilgi sahibi olmasını

sağlamanın yanı sıra dünyadaki hayatın tarihçesi ve tüm yaşam formları

hakkında genel bakış açısı kazandırmak. Moleküler teknikler ve genetik

analizler hakkında bilgi vermek.

Content

Evrimsel biyoloji ve Darvinci bakış açısının özeti; evrimin ve

prokaryotların, mantarların, bitkilerin ve hayvanların ana formlarının özeti;

bitki büyümesi, sinyal yolakları ve biyoteknolojisi; doku çeşitleri ve

yapıları, beslenme, dolaşım sistemi, gaz alışverişi, bağışıklık sistemi

yapısı ve işlevi, endokrin sistem ve hormonal sinyalizasyon ve sinir

sistemi yapısı ve fonksiyonunu kapsayan hayvan fizyolojisi temelleri.



Ölçme Yöntemleri

1) Evrim ve sistematiğin temel kavramlarının anlaşılması.

1 1,2 A,C

2) Biyoloji ve fizyolojinin temel yönlerinin ve prokaryot, mantar, bitki ve hayvanlarda farklı formlarının anlaşılması.

1 1,2 A, C

3) Bitkilerde nesillerin devam edişinin, bitki büyümesinin farklı açılarının ve bitki hormonlarının etkilerinin anlaşılması.

1 1,2 A, C

4) Farklı hayvansal organ sistemlerinin ve özellikle insanlarda nasıl etkileştiklerinin

1 1,2 A, C

10

anlaşılması ve açıklanması.



Ölçme Yöntemleri:


DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Değişen Miras; Populasyonların Evrimi Ders Kitabı/

İnternet sitesi

2 Dünyadaki Yaşamın Tarihi; Filogeni Ders Kitabı/

İnternet sitesi

3 Bakteri ve Arke Ders Kitabı/

İnternet sitesi

4 Protista Ders Kitabı/

İnternet sitesi

5 Mantar Ders Kitabı/

İnternet sitesi

6 Ara Sınav I

7 Bitki Çeşitliliği I; Bitki Çeşitliliği II Ders Kitabı/

İnternet sitesi

8 Bitki Yapısı, Büyümesi & Gelişmesi Ders Kitabı/

İnternet sitesi

9 Bitkilerde Üreme ve Biyoteknoloji Ders Kitabı/

İnternet sitesi

10 Hayvan Çeşitliliğine Giriş, Omurgasızlar; Omurgalılar Ders Kitabı/

İnternet sitesi

11 Hayvan Yapısının ve İşleyişinin İlkeleri Ders Kitabı/

İnternet sitesi

12 Ara Sınav II

13 Hayvanlarda Beslenme; Dolaşım ve Gaz Alışverişi Ders Kitabı/

İnternet sitesi

14 Bağışıklık Sistemi Ders Kitabı/

İnternet sitesi

15 Hormonlar ve Endokrin Sistem Ders Kitabı/

İnternet sitesi

16 Sinir Sistemi; Nöronlar, Sinapslar ve Sinyaller Ders Kitabı/

İnternet sitesi

KAYNAKLAR

Ders Kitabı “Biology”, Mader & Windelspecht, 11. Baskı (Uluslararası Baskı) With CONNECT

Diğer Kaynaklar Ödev İnternet Sitesi http://connect.mcgraw-hill.com

11

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları öğrenciler tarafından pdf formatında indirilebilmektedir.

Ödevler

Sınavlar 2 Ara Sınav ve 1 Final.



Ara Sınav 2 50

Deney

Ödev 10 10

Proje

Toplam 60



Toplam 100

DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri


No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi

1 2 3 4 5


X


3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi.

4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi.


12

6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi.

7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık.

8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi.

9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi.

10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi.


Etkinlikler Sayısı Süresi (Saat)



Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 3 42

Ara Sınav 2 3 6

Deney

Ödev

Proje

Final sınav 1 3 3


Toplam İş Yükü / 25 (s) 3.72


13

DERS BİLGİLERİ


MİKROBİYOLOJİ GBE 203 3 2 + 1 + 3 4 7

Ön Koşul Dersleri GBE 111





Prof. Dr. Fikrettin Şahin

Dersi Verenler Prof. Dr. Fikrettin Şahin


STAJ YOK

Dersin Amacı

Öğrencilerin mikrobiyoloji, temel genetik ve moleküler biyoloji

geçmişi elde etmelerini sağlamak ve deneysel yaklaşımlarla pratik

deneyimlerini geliştirmek

Dersin İçeriği

Mikroorganizmalar, onların tanımlamaları, metabolizma, büyüme

koşulları, mikroorganizmaların kontrolü, mikrobiyal genetik ve

biyoteknolojik uygulamalar. Ders içeriğine paralel olarak

laboratuvar deneyleri.



Ölçme Yöntemleri

1) Mikrobiyoloji ve moleküler biyoloji ile ilgili kavramları anlayabilmek ve temel genetik geçmişi elde etmek

2,3,7,10 1,2 A,C

2) Farklı besiyeri çeşitlerini kullanarak bakteri kültürleri hazırlayabilmek, ekim teknikleri, boyama ve mikroskopta gözlemleme

2,3,10 1,2,3 A,B,C

3)Mikrobiyal metabolizmayı ve onların büyüme koşullarını anlayabilmek, bir biyoreaktörün çalışma prensibini gözlemlemek ve mikroorganizmaların nasıl kontrol edilebileceğini öğrenmek

2,3,10 1,2,3 A,B,C

4)Bakteriden genomik ve plazmid DNA izolasyonunu yapabilmek, agaroz jel elektroforezi, restriksiyon ve transformasyon

2,3,10 1,2,3 A,B,C

14


1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması

Ölçme Yöntemleri: A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1

Kısaca Mikrobiyoloji Tarihi, Mikroplar ve İnsanlara Yararları,

Mikroplar ve İnsan Hastalıkları Ders Kitabı

2

Atomların Yapıları, Atomlar Nasıl Molekül Oluştururlar: Kimyasal

Bağlar, Kimyasal Reaksiyonlar, Inorganik Bileşikler, Organik

Bileşikler

Ders Kitabı

3

Ölçüm Birimleri, Mikroskopi: Aletler, Işık Mikroskobu İçin Örnek

Hazırlanması, Boyama Teknikleri

Ders Kitabı

4

Prokaryotik ve Ökaryotik Hücrelerin Kıyaslanması, Bakteri

Hücrelerinin Boyutu, Şekli ve Düzenlenmesi, Hücre Duvarının

Dışındaki Yapılar,Hücre Duvarının İçindeki Yapılar

Ders Kitabı

5

Ökaryotik Hücre, Kamçı ve Sil, Hücre Duvarı, Glikokaliks, Plazma

Zarı, Sitoplazma ve Organeller, Ökaryotların Evrimi

Ders Kitabı

6

Katabolik ve Anabolik Reaksiyonlar, Enzimler, Enerji Üretimi,

Karbonhidrat Katabolizması

Ders Kitabı

7

Yağ ve Protein Katabolizması, Biyokimyasal Testler ve Bakteri

Tanımlanma

Ders Kitabı

8

Fotosentez, Organizmalar Arasındaki Metabolik Çeşitlilik, Enerji

Kullanımının Metabolik Yolakları, Metabolizma Birleşmesi

Ders Kitabı

9

Büyüme Gereksinimleri, Besiyeri, Saf Kültür Elde Etme, Bakteri

Kültürlerini Saklama, Bakteri Kültürlerinin Büyümesi

Ders Kitabı

10

Mikrobiyal Kontrol Terminolojisi, Mikrobiyal Ölüm Derecesi,

Mikrobiyal Kontrol İçin Fiziksel Yöntemler

Ders Kitabı

11 Mikrobiyal Kontrol İçin Kimyasal Yöntemler Ders Kitabı

12

Genetik Materyalin Yapısı ve Fonksiyonu, Bakteriyel Gen

Ekspresyonunun Düzenlenmesi

Ders Kitabı

13

Mutasyon: Genetik Materyalde Değişim, Genetik Aktarım ve

Rekombinasyon

Ders Kitabı

15

14

Biyoteknolojiye Giriş, Biyoteknoloji Araçları, Genetik Mühendisliği

Teknikleri

Ders Kitabı

15

Genetik Mühendisliği Uygulamaları, Güvenlik Konuları ve Genetik

Mühendisliği Etiği

Ders Kitabı

16

Filogenetik Akrabalık Çalışması, Organizmaların Sınıflandırılması,

Sınıflandırma ve Tanımlama Yöntemleri

Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Mikrobiyolojiye Giriş (Tortora, Funke, Case), Onuncu Baskı

Diğer Kaynaklar Mikrobiyolojide Laboratuvar Deneyleri (Johnson Case) Yedinci Baskı

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin email adreslerine gönderilmektedir.

Ödevler 1 ödev

Sınavlar Laboratuvar Sınavı (Her hafta), 1 Arasınav ve 1 Final



Ara Sınav 1 20

Deney 12 20

Ödev 1 10

Proje

Final Sınavının Başarıya Oranı 1 50

Yıl içinin Başarıya Oranı

Toplam 100



16


1 2 3 4 5

1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma

2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi

X


X


5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi



X




X


Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)




Ara Sınav 1 3 3

Deney 12 3 36

Ödev 1 10 10

Proje

Final Sınavı 1 3 3




17

DERS BİLGİLERİ


Hücre Biyolojisi GBE 205 3 2 + 1 + 3 4 6






Yrd. Doç. Bahar Soğutmaz Özdemir

Dersi Verenler Yrd. Doç. Bahar Soğutmaz Özdemir


STAJ YOK

Dersin Amacı Öğrencilerin temel genetik ve moleküler biyoloji temelini

güçlendirip teorik ve pratik seviyelerini artırmak

Dersin İçeriği

Hücrenin evrimi; ilkel dünyanın şartları ve protohücrenin oluşumu;

hücre yapısının keşfi ve hücresel organizasyonun önemi; hücre

organelleri; hücre zarının yapısı ve işlevi; hücreiçi zar ağları; DNA

paketlemesi; çekirdek; oksijenli solunum ve mitokondri; fotosentez

ve kloroplast; hücre iskeletinin yapısı; hücredışı yapı ve hücre

matrisi; hücrelerarası tanıma ve hücre yapışması; hücre döngüsü

ve hücre bölünmesi; hücrelerarası kimyasal işaretleşme; hücre

farklılaşması; kanser



Ölçme Yöntemleri

prokayotik ve ökaryotik hücre farklarını öğrenir 1 1,2,4 A,C

Genetik hastalıklar hakkında bir derleme hazırlayıp sunarak bilimsel uygulamaları öğrenir.

1,3 1,2,3,4 A,B,C,D

araştırma metodlarını öğrenerek deney tasarımını öğrenir 1,3 1,2,3,4 A,B,C,D

değişik mikroskpları ve kullanımlarını öğrenir 1,3 1,2,3,4 A,B,C,D

moleküler düzeyde hücre kimyası öğrenir 1,3 1,2,3,4 A,B,C,D

sitoskeleton yapısını öğrenir 1,3 1,2,3,4 A,B,C,D

18

hücresel solunum ve metabolizma vede enerjiyi öğrenerek vaka sunumu yapar

1,3,5 1,2,3,4 A,B,C,D

protein sorting ve vezikülar taşımayı öğrenir 1,3 1,2,3,4 A,B,C,D

kanser mekanizmasını kavrar 1,3 1,2,3,4 A,B,C,D

Öğretim Yöntemleri: 1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması


DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 hücrelere giriş Ders Kitabı

2 araştırma metodları Ders Kitabı

3 hücrenin kimyasal içeriği Ders Kitabı

4 protein yapısı Ders Kitabı

5 kromozom yapı ve organizasyonu Ders Kitabı

6 DNA replikasyonö onarım ve rekombinasyonu Ders Kitabı

7 Ara Sınav 1 (Vaka Çalışması) Ders Kitabı

8 metabolizma ve enerji Ders Kitabı

9 DNAdan protein üretimine Ders Kitabı

10 Gen ekspresyon kontrolü Ders Kitabı

11 zar yapısı Ders Kitabı

12 Ara Sınav II Ders Kitabı

13 hücre içi yapılar ve taşıma Ders Kitabı

14 sitoskeleton Ders Kitabı

15 hücreler arası iletişim Ders Kitabı

16 kanser Ders Kitabı

KAYNAKLAR

19

Ders Kitabı

Essential Cell Biology, Alberts&Bray&Hopkin&Johnson&Lewis&Raff&Roberts&Walter Second Edition, Garland Science World of the Cell, The International Edition 7.th Edition Wayne Becker, Lewis Kleinsmith, Jeff Hardin, Gregory Bertoni

Diğer Kaynaklar ders notları ve slaytlar

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler 2 ödev

Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final



Ara Sınav 2 30

Deney 8 30

Ödev 2 10

Proje

Final Sınavının Başarıya Oranı 1 30

Yıl içinin Başarıya Oranı

Toplam 100




1 2 3 4 5


X


3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama,

X

http://www.pearsoned.co.uk/Bookshop/Results.asp?iCurPage=1&Type=1&Author=Wayne+Becker&Download=1&SearchTerm=Wayne+Becker

http://www.pearsoned.co.uk/Bookshop/Results.asp?iCurPage=1&Type=1&Author=+Lewis+Kleinsmith&Download=1&SearchTerm=+Lewis+Kleinsmith

http://www.pearsoned.co.uk/Bookshop/Results.asp?iCurPage=1&Type=1&Author=+Jeff+Hardin&Download=1&SearchTerm=+Jeff+Hardin

http://www.pearsoned.co.uk/Bookshop/Results.asp?iCurPage=1&Type=1&Author=+Gregory+Bertoni&Download=1&SearchTerm=+Gregory+Bertoni

20

sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi



x











Ara Sınav 2 3 6

Deney 8 3 24

Ödev 2 5 10

Proje





21

DERS BİLGİLERİ


Organik Kimya ve Biyomoleküllere Giriş

CHEM 205 3 2 + 2 + 0 3 6






Yard. Doç. Dr. Andrew Harvey

Dersi Verenler Yard. Doç. Dr. Andrew Harvey


Staj YOK

Dersin Amacı

Öğrencilerin, fonksiyonel gruplar ve bunların kimyaları başta olmak

üzere temel organik kimya hakkında bilgi sahibi olmalarını

sağlamak. Fonksiyonel grup kimyası hakkında öğrenilen bilgiyi

yaygın biyomakromoleküllerin yapısı ve fonksiyonu ile birleştirmek.

Dersin İçeriği

Karbon kimyası özeti ve 3 boyutlu yapıların etkisi. Yaygın organik

fonksiyonel grupların kimyası. IUPAC kurallarına göre isimlendirme

ve yapı çizimi ve organik molekül terminolojisi. Yaygın organik

sübstitüsyon ve eliminasyon reaksiyonları. Yaygın organik

moleküllerin sentezi ve verdikleri reaksiyonlar. Nükleik asitler,

proteinler, karbonhidratlar ve lipidler gibi önemli

biyomakromoleküllerin yapı ve fonksiyonları.



Ölçme Yöntemleri

1) Karbon kimyasının temellerini ve yaygın fonksiyonel grupların reaktivitelerini anlama.

1 1,2 A,C

2) Mekanistik mantık temellerinde reaksiyon modellerinin anlaşılması ve yorumlanması.

1 1,2 A, C

3) Spektroskopik dataya dayanarak moleküllerin anlaşılması ve yorumlanması.

1 1,2 A, C

4) Nükleik asitler, proteinler, karbonhidratlar ve lipid de dahil olmak üzere biyomakromoleküllerin yapısının ve reaktivitesinin anlaşılması.

1 1,2 A, C

Öğretim 1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Laboratuar, 4: Vaka Çalışması

22

Yöntemleri:



DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Yapı ve Bağ Oluşumu; Asitler ve Bazlar Ders Kitabı/

İnternet Sitesi

2 Alkenler; Sikloalkenler Ders Kitabı/

İnternet Sitesi

3 Organik Reaksiyonların Özeti; Alkenler ve Alkinler Ders Kitabı/

İnternet Sitesi

4 Alkenlerin ve Alkinlerin Reaksiyonları; Aromatik Bileşikler Ders Kitabı/

İnternet Sitesi

5 Stereokimya Ders Kitabı/

İnternet Sitesi

6 Ara Sınav I

7 Haloalkenler; Nükleofilik Sübstitüsyon ve Eliminasyon Ders Kitabı/

İnternet Sitesi

8 Alkoller, Fenoller ve Tioller Ders Kitabı/

İnternet Sitesi

9 Aldehitler ve Ketonlar: Nükleofilik Eklenme Reaksiyonları Ders Kitabı/

İnternet Sitesi

10 Karboksilik Asitler ve Türevleri Ders Kitabı/

İnternet Sitesi

11 Karbonil α-sübstitüsyon ve kondensasyon reaksiyonları: aminler ve heterohalkalar

Ders Kitabı/ İnternet Sitesi

12 Ara Sınav II

13 Biyomoleküller: Karbonhidratlar Ders Kitabı/

İnternet Sitesi

14 Biyomoleküller: Amino Asitler ve Proteinler Ders Kitabı/

İnternet Sitesi

15 Biyomoleküller: Lipidler; Nükleik Asitler Ders Kitabı/

İnternet Sitesi

16 Yapı Tespiti Ders Kitabı/

İnternet Sitesi

KAYNAKLAR

Ders Kitabı “Fundamentals of Organic Chemistry”, John McMurry, 7. Uluslararası Baskı, ‘OWL Access’ ile

Diğer Kaynaklar OWL ödev sitesi http://owl.cengage.com

23

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları pdf formatında öğrencilerin erişimine açıktır.

Ödevler




Ara Sınav 2 25

Deney

Ödev 10 1

Proje

Toplam 60



Toplam 100




1 2 3 4 5


X





24











Ara Sınav 2 1 2

Deney

Ödev 10 1 10

Proje





25

DERS BİLGİLERİ


Biyometri: Biyomühendislik Uygulamaları için Nümerik ve İstatiksel Yöntemler

GBE 222 3 2 + 2 + 0 3 6

Ön Koşul Dersleri MATH 131





Yrd. Doç. Dr. Emrah Nikerel

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Emrah Nikerel


Dersin Amacı

Biyomühendislik alanında kullanılacak istatistiksel ve nümerik

yöntemlerle ilgili temel kavramlara, teorik temellere giriştir.

emelinde biyoistatistik ve numerik yöntemlerin uygulama alanları

oldukça geniş olmasına rağmen, bu derste özellikle genetikve

biyomühendisliğin çeşitli alanlardaki uygulamalarına

odaklanılmıştır.

Dersin İçeriği

Lineer cebir uygulamaları, lineer olmayan denklem sistemlerinin

nümerik çözümü, biyolojik sistemlerden deneysel bilgi eldesi,

temel istatistiksel kavramlar ve analizler, model tabanlı deney

tasarımı gibi yeni ve temel kavramlara giriş yapılacaktır.



Ölçme Yöntemleri

1) Biyoistatistiğin temelleri ve uygulama alanları hakkında farkındalık kazanır

1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C

2) Temel biyoistatistik yöntemlerini kullanır 1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C

3) Lineer cebirin temelleri ve biyolojik sistemlerdeki uygulamaları hakkında farkındalık kazanır

1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C



Ölçme ve Değerlendirme


26

Yöntemleri:

DERS İÇERİĞİ

Hafta Konular Çalışma Malzemeleri

1 Giriş: Biyolojik sistemlerde biyoistatistik ve lineer cebir uygulamalarına genel bakış

Ders notları ve sunum malzemeleri

2 Lineer denklem sistemleri ve (Homojen) denklem sistemlerinin çözümü

Ders notları ve sunum

malzemeleri

3 Vektör ve Matrix işlemleri, Matrix tersi, Lineer denklem sistemlerinin çözümü, tekil olmayan matrisler


malzemeleri

4 Lineer bağımlılık, bağımsızlık ve germe


malzemeleri

5 Özdeğerler, öz vektörler ve özellikleri


malzemeleri

6 Ara Sınav I

7 Biyolojik sistemlerde uygulamalar


malzemeleri

8 Genel tekrar, ara sınav.


malzemeleri

9 Biyoistatistik bilimine genel bakış, Normal dağılım, güven aralığı.


malzemeleri

10 Hipotez testinin teorisi, tek örnekli t-test, 2 bağımsız örnek için t-test, eşli t-test


malzemeleri

11 ANOVA


malzemeleri

12 Ara Sınav II

13 P-değerlerinin yorumlanması; çoklu karşılaştırma


malzemeleri

14 Korelasyon analizi


malzemeleri

15 Sürekli verilerin modellenmesi: çoklu regresyon


malzemeleri

16 Genel tekrar ve proje sunumları Ders notları ve sunum

27

malzemeleri

KAYNAKLAR

Ders Notu Araştırma makaleleri; ders notları; sunumlar

Diğer Kaynaklar

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar

Dönemin ikinci yarısından itibaren öpencilere o haftaki konuya ilişkin güncel araştırma makalelerinden ödevler verilmektedir. Ayrıca dönem sonunda Trends in Genetics dergisinin reveiw makale formatına uygun bir sonuç raporu yazmaları beklenmektedir.

Ödevler




Ara Sınav 2 50

Deney

Ödev 10 10

Proje

Toplam 60



Toplam 100




1 2 3 4 5


X

28















Ara Sınav 2 1 2

Deney

Ödev 10 1 10

Proje





29

DERS BİLGİLERİ


Klasik ve Moleküler Genetik

GBE 212 4 2 + 2 + 0 3 6






Prof.Dr.Gamze Torun Köse

Dersi Verenler Prof.Dr.Gamze Torun Köse


STAJ YOK

Dersin Amacı Öğrencilerin, klasik ve moleküler genetik konusunda bilgilerini

arttırmayı sağlamak.

Dersin İçeriği

Mitoz ve Mayoz, Mendel Genetiği, Mendel Genetiği Uzantıları,

Gen Bağlanması, Kros Over ve Ökaryotlarda Gen

Haritalandırması, Seks Kromozomları, Kromozom Mutasyonları,

DNA Yapısı ve Analizi, DNA Replikasyonu ve Rekombinasyonu,

Kromozom Yapısı ve DNA Dizilim Organizasyonu, Transkripsiyon,

Translasyon ve Protein, Gen Mutasyonu, DNA Tamiri ve Hareketli

Genler, Bakteri Genetiği, Prokaryotlarda Gen Anlatımı

Regülasyonu, Ökaryotlarda Gen Anlatımı Regülasyonu,

Rekombinant DNA Teknolojisi.



Ölçme Yöntemleri

1) Klasik Genetiği kavrayabilme ve problemleri çözebilme

1,2 1,2 A,C

2) Moleküler Genetiğin temellerini ve tekniklerini öğrenme

1 1,2 A

3) Prokaryot ve Ökaryotlardaki gen regulasyonlarını kavrayabilme

1 1,2 A

4) Rekombinant DNA Teknolojisini öğrenme 1 1,2 A

Öğretim 1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması

30

Yöntemleri:


A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Mitoz ve Mayoz

Ders Kitabı

2 Mendel Genetiği Ders Kitabı

3 Mendel Genetiği Uzantıları Ders Kitabı

4

Gen Bağlanması, Kros Over ve Ökaryotlarda Gen

Haritalandırması,

Seks Kromozomları

Ders Kitabı

5 Kromozom Mutasyonları Ders Kitabı

6

DNA Yapısı ve Analizi

DNA Replikasyonu ve Rekombinasyonu

Ders Kitabı

7

Vize I

Kromozom Yapısı ve DNA Dizilim Organizasyonu

Ders Kitabı

8 Transkripsiyon Ders Kitabı

9 Translasyon ve Protein Ders Kitabı

10 Gen Mutasyonu, DNA Tamiri ve Hareketli Genler Ders Kitabı

11

Bakteri Genetiği,

Prokaryotlarda Gen Anlatımı Regülasyonu

Ders Kitabı

12 Vize II Ders Kitabı

13 Ökaryotlarda Gen Anlatımı Regülasyonu Ders Kitabı

14 Rekombinant DNA Teknolojisi Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Concepts of Genetics- W.S.Klug, M.R.Cummings

31

Diğer Kaynaklar

Molecular biology of the gene-Watson, Baker, Bell, Gann, Levine,

Genetic Engineering- D.S.T. Nicholl

Genes VIII- B.Lewin

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Bazı ders slideları öğrencilere verilmektedir

Ödevler Mendel Genetiği soru kağıtları öğrencilere verilmektedir

Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final verilmektedir



Ara Sınav 2 60

Deney

Ödev

Proje

Final 1 40

Toplam 100


Yıl içinin Başarıya Oranı 60

Toplam 100




1 2 3 4 5




X

32













Ara Sınav 2 4 8

Deney

Ödev 2 5 10

Proje





33

DERS BİLGİLERİ


Klasik ve Moleküler Genetik Laboratuvar

GBE 216

4 0 + 1 + 3 2 5









STAJ YOK

Dersin Amacı Öğrencilerin klasik ve moleküler genetik teknikleri hakkında bilgi

ve deneysel yaklaşımlar ile pratik geliştirmesini sağlamak.

Dersin İçeriği

Monohibrid, Dihibrid ve Geri Çaprazlama, Politen kromozom,

Eşeye bağlılık ve çaprazlama, DNA izolasyonu ve Agaroz Jel

Elektroforezi, PCR ve RFLP, DNA Dizilim Analizi, Total RNA

İzolasyonu, RT-PCR, Kromozom Analizi



Ölçme Yöntemleri

1) Klasik ve Moleküler Genetik tekniklerini kavrayabilme ve pratik yapabilme

1,3 1,2,3 A,B,C

2) Moleküler Genetiğin temelini ve tekniklerini kavrama ve pratik yapabilme

1,3 1,2,3 A,B,C





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

34

1 Mendel Genetiğine giriş

Ders Kitabı

2 Monohibrid, Dihibrid ve Geri Çaprazlama Ders Kitabı

3 Eşeye bağlılık ve çaprazlama Ders Kitabı

4 Politen kromozom Ders Kitabı

5 DNA izolasyonu ve Agaroz Jel Elektroforezi Ders Kitabı

6 PCR ve RFLP Ders Kitabı

7 Vize I Ders Kitabı

8 Total RNA izolasyonu Ders Kitabı

9 RT-PCR Ders Kitabı

10 Kromozom Analizi Ders Kitabı

11 DNA Sekanslama Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Concepts of Genetics- W.S.Klug, M.R.Cummings

Diğer Kaynaklar Molecular biology of the gene-Watson, Baker, Bell, Gann, Levine

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Laboratuvar notları öğrencilere verilmektedir

Ödevler Laboratuvar deneyleri her hafta sonunda rapor olarak öğrenciler tarafından teslim edilmektedir.

Sınavlar 1 Arasınav ve 1 Final verilmektedir.



Ara Sınav 1 30

Rapor 10 15

Quiz 10 15

35

Final 1 40

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5




X













36

Ara Sınav 1 4 4

Raporlar 10 3 30

Ödev 2 2 4





37

DERS BİLGİLERİ


Analitik Kimya CHEM 215 4 3 + 0 + 2 4 6






Prof. Dr. Mustafa Çulha

Dersi Verenler Prof. Dr. Mustafa Çulha


STAJ YOK

Dersin Amacı

Bu ders öğrencinin hem analytik kimyanın biyoloji, tıp,malzeme ve

çevre bilimleri, ve adli konulardaki uygulamalarının ve hem de

toplum üzerindeki etkilerini öğrencilerin anlamaları için

düzenlenmiştir. kapsamını Öğrenciler klasik kimyasal analiz ve

spektroskopik ve kromatografik tekniklerin teori ve uygulamalarını

öğreneceklerdir.

Dersin İçeriği

Numune toplama, standardizasyon, kalibrasyon, istatiksel data

değerlendirme, kimyasal analizde hatalar, kimyasal denge,

spectrokimyasal tekniklere giriş, moleküler soğurma ve floresan

spektroskopisi, titreşimsel spektroskopi, kütle spektroskopisi,

nükleer manyetik rezonans, analitik ayrıştırma yöntemlerine giriş,

yüksek performanslı sıvı kromatografisi, gaz kromatografisi, ve

elektroforez yöntemleri.



Ölçme Yöntemleri

1) Numune toplama, standardizasyon, kalibrasyon ve validasyonu açıklayabilme.

1 1,2 A,C

2) Temel veri analizini hesaplamalarını yapabilme. 1,5 1,2 A,B,C

3) moleküler soğurma ve floresan spektroskopisi, titreşimsel spektroskopi, kütle spektroskopisi, nükleer manyetik rezonans gibi teknikleri ve bu tekniklerin cihazlarının çalışma prensiplerini anlatabilme.

1,5 1,2,3 A,B,C

4) yüksek performanslı sıvı kromatografisi, gaz 1,5 1,2,3 A,B,C

38

kromatografisi, ve elektroforez yöntemleri ve çalışma temellerini açıklaya bilme..

5) Kimyasal çözelti ve pH hesaplamalarını yapabilme. 1,5 1,2,3 A,B,C



DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1

Analitik Kimyanın Doğası

Kimyasallar, Aletler ve Birim Hesaplamaları Ders Kitabı

2 Analitik Kimyada Spreadsheet Kullanımı Ders Kitabı

3 Analitik Kimyada Kullanılan Hesaplamalar Ders Kitabı

4 Numune toplama, standardizasyon, kalibrasyon ve Validasyon Ders Kitabı

5 Kimyasal analizde Hatalar Ders Kitabı

6 Kimyasal analizde Hatalar Ders Kitabı

7 Spektrokimyasal Metodlara Giriş

1. Arasınav

Ders Kitabı

8 Optik Spektrometrede Cihazlar Ders Kitabı

9 Moleküler Soğurma Spektroskopisi Ders Kitabı

10 Moleküler Floresan Spektroskopisi Ders Kitabı

11 Nükleer Manyetik Rezonans (NMR) Ders Kitabı

12 Kütle Spektrskopisi Ders Kitabı

13

Analitik Ayrıştırmaya Giriş

Yüksek Performanslı Sıvı Kromatografisi

Ders Kitabı

14 2. Arasınav Ders Kitabı

15

Elektroforez ve Elektroforezin Türleri

Gaz Kromatografi

Ders Kitabı

16 pH Ölçümü Ders Kitabı

39

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Fundamentals of Analytical Chemistry, Skoog, West, Holler, Crouch, 8th Edition (International Student Edition)

Diğer Kaynaklar

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler




Ara Sınav 2 45

Deney 8 20

Ödev

Proje

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


X


40




X











Ara Sınav 2 3 6

Deney 10 2 20

Ödev 5 2 10

Proje





41

DERS BİLGİLERİ


Biyokimya I GBE 301 5 2 + 1 + 3 4 7

Ön Koşul Dersleri CHEM 205








STAJ YOK

Dersin Amacı

Bu kurs öğrencilerin biyokimyanın ve biyo kimya konularının

önemini ve canlı sistemlerin altında yatan temel proessleri

anlamalarını sağlamak üzere dizayn edilmiştir.

Dersin İçeriği

Hayatın molekülleri; karbohidratların, lipidlerin, proteinlerin ve

nükleik asitlerin yapısı ve işlevleri; genetic bilgi akışı; enzimler ve

enzim kinetiği; zar yapısı ve dinamiği; zar oluşumu ve işlevi;

biyoenerjetiğe giriş.



Ölçme Yöntemleri

1) Karbonhidratların, proteinlerin, lipidlerin ve nükleik asitlerin yapılarını ve fonksiyonları arasındaki ilişkiyi anlayabilme.

1 1,2 A,C

2) DNA yapısını ve genetic bilgi akışını kavrayabilme.

1,4 1,2 A,B,C

3) Protein yapısını ve fonksiyonunu kavrayabilme.

1,4 1,2,3 A,B,C, D

4) Termodinamik kanuları ve biyosistemlerdeki enerji akışını ilişkilendirebilme.

1,4 1,2,3 A,B,C

5) Membran yapısını ve dinamiğini kavrayabilme.

1,4 1,2,3 A,B,C

6) Temel enzim knetiği hesaplamalarını yapabilme.

1,4 1,2,3 A,B,C

42





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Scope of Biochemistry Biyokimyanın kapsamı Ders Kitabı

2 Hayatın Bileşenleri: Sulu Ortamlarda Zayıf Etkileşimler Ders Kitabı

3 Yaşamın Enerjisi Ders Kitabı

4 Nükleik Asitler Ders Kitabı

5 Nükleik Asitler Ders Kitabı

6 Proteinlere Giriş: Birinci Seviye Protein Yapısı Proteinlerin 3 Boyutlu Yapısı 1. T-BOX Sınavı

Ders Kitabı


8 Protienler Hareket Halinde: Kasılma ve Moleküler Hareketler Ders Kitabı

9 Karbonhidratlar Ders Kitabı

10 Karbonhidratlar Ders Kitabı

11 Lipidler, Zarlar, ve Hücresel Taşınım Ders Kitabı

12 Lipidler, Zarlar, ve Hücresel Taşınım Ders Kitabı

13 Enzimler: Biyokatalizörler

2. T-BOX Sınavı

Ders Kitabı



Ders Kitabı


Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Biochemistry, Matthews, Van Holde, Ahern, 4. Baskı (Uluslararası Baskı)

Diğer Kaynaklar

43

MATERYAL PAYLAŞIMI






Ara Sınav ve Quizler 2 45

Deney 10 20

Ödev

Proje

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


X




X


44











Ara Sınav 2 3 6

Deney 10 3 30

Ödev

Proje





45

DERS BİLGİLERİ


Biyotermodinamik GBE 321 5 2 + 2 + 0 3 5

Ön Koşul Dersleri CHEM 112





Prof. Dr. Mustafa Özilgen

Dersi Verenler Prof. Dr. Mustafa Özilgen


Dersin Amacı

Mühendislik termodinamiğinin temel kavramlarınının biyolojik

sistemlere uygulanmasını öğretmek. Üç veya dört öğrenciden

oluşan gruplarla proje yaparak takım çalışması, literatür

araştırması, bilgisayar kullanım bilgisi ve termodinamik analiz

yeteneğini geliştirmek.

Dersin İçeriği Termodinamiğin temel kavramları

Dersin Öğrenme Çıktıları Program öğrenme çıktıları


Ölçme Yöntemleri

Termodinamiğin temel kavramlarının öğrenilmesi

1, 2, 9, 10 1, 2, 4 A, D

Disiplinler arası proje yapımı 1, 2, 4, 5, 6, 7 1, 2, 4 A, D

Gıda ve biyolojik sistemlerle ilgili örnekler 1, 2, 7 1, 2, 4 A, D





DERS İÇERİĞİ

46


Malzemeleri

1 Termodinamiğin gelişim süreci: Neden termodinamik öğrenme

gereksinimi oluştu, termodinamiğin gelişim süreci ve kanunları Ders kitabı

2 Temel kavramlar, enerji, iş, iç enerji Ders kitabı

3 Entropy, özgül ısı, faz değişim ısısı, entropy, enformasyon entropisi, diğer konular

Ders kitabı

4 Thermodynamic properties of biological fluids: Phase equilibria Ders kitabı

5 Rault’s ve Henry’s kanunları Ders kitabı

6 Termodinamik özelliklerin hücresel yapı için hesaplanması Ders kitabı

7 İdeal ve reel akışkanlar, su ve buhar için termodinamik veri kaynaklararı

Ders kitabı + Buhar tablosu

8-10 Termodinamiğin birinci kanununun biyolojik süreçlere

uygulanması Ders kitabı

11-12 Termodinamiğin ikinci kanununun biyolojik süreçlere uygulanması

Ders kitabı

13 Exergy analysis in biological systems Ders kitabı

14 Tekrar Ders kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Özilgen M & Sorgüven E, BioThermodynamics (Drafts of the new

textbook, in press), Taylor & Francis, USA, 2014

Diğer Kaynaklar

Smith MJ, Van Ness HC and Abbott MM, McGraw Hill,

Introduction to Chemical Engineering Thermodynamics, 7th

ed., USA 2005

Thermodynamics, Çengel Y and Boles MA. 6th ed. McGraw Hill,

USA, 2007

Özilgen, M. Endüstrileşme Sürecinde Bilgi Birikiminin Öyküsü, 2nd

ed. Arkadaş Yayınevi, Ankara, 2011

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Önceki yıllara ait sınav soruları + ek döküman

Ödevler Problem seti




47

Ara Sınav 2 40

Deney

Ödev

Proje 1 30

Toplam 70



Toplam 100




1 2 3 4 5


x


x


X


X




X


X



X

48






Ara Sınav 2 7 14

Deney

Ödev

Proje 8 3 24





49

DERS BİLGİLERİ


Gen Mühendisliği Teknikleri I GBE 341 5 2 + 2 + 0 3 6






Yrd. Doç. Dr. Andrew J. Harvey

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Andrew J. Harvey


STAJ YOK

Dersin Amacı Gen mühendisliği teknikleri kullanarak deney tasarlayabilme

becerisi sağlamak

Dersin İçeriği

Mikroskopi; diger yüksek ölçekli teknolojiler, radyoizotopların

kullanımı; enzim analizleri; DNA ve RNA işaretleme; DNA’nın in

vitro manipulasyonu; klonlama, transformasyon teknikleri,

kütüphane oluşturma ve tarama metodları, DNA ve RNA

izolasyonu; restriksiyon enzimleri, vektörler, PCR, geri

transkripsiyon ve cDNA sentezi; RT-PCR, Q-RT-PCR;

immünçökeltme, protein saflaştırması, Western blotlama, Southern

ve Northern blotlama; DNA dizileme; bölge-hedefli mutajenez;

mikrodizinler; RNA interferans ve digger yeni teknikler, özellikle

genetic ve biyomühendislik tasarım problemlerine vurgu.



Ölçme Yöntemleri

1) DNA klonlama stratejileri tasarlayabilme ve rekombinant protein üretebilme

2,3,4,9 1,2,4 A,C

2) Protein lokalizasyonu veya etkileşimi deneyleri tasarlayabilme

2,3,4,9 1,2,4 A,C

3) Mikrodizin veya benzeri deneyleri, PCR primerlerini ve PCR reaksiyonlarını tasarlayabilme

2,3,4,9 1,2,4 A,C

4) Yeni bir vaka ile karşılaşıldığında deneysel fikirleri öne sürebilme

2,3,4,9 1,2,4 A,C

50

5) Mole-gram dönüşümleri, vektör-insert oranları, Dalton-gram dönüşümleri vb hesaplamaları yapabilme; biyoinformatik kaynakları kullanabilme

2,3,4,9 1,2,4 A,C





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1

Gen Mühendisliğine giriş, araçları ve internet ortamındaki

materyaller

Ders notları, dağıtılan belgeler

2

Gen Mühendisliği araçlarına genel bakış: vektörler, enzimler,

ligazlar

PS 1: Rebase, Biology Workbench, NCBI

Ders notları,

dağıtılan

belgeler

3

Gen Mühendisliği araçları: Restricksiyon enzimleri

Jel elektroforezin hatırlatılması; DNA transformasyonu ve

elektroporasyon

Ders notları,

dağıtılan

belgeler

4

PCR, RT-PCR and Q-PCR

Gen Mühendisliği araçları: Vektörler I

Gen Mühendisliği araçları: Vektörler II

PS 2: DH5 ve HB101 suşları – genotip ve metilasyon

Ders notları,

dağıtılan

belgeler

5

Gen Mühendisliği araçları: Ligazlar

Klonlama ve tarama

PS 3: mavi-beyaz vs AmpR taraması – uygulama

Ders notları,

dağıtılan

belgeler

6

KARİYER HAFTASI ETKİNLİKLERİNE KATILIM

ARA SINAV 1

Ders notları,

dağıtılan

belgeler

7

Genomik DNA c Ders notları,

dağıtılan

belgeler

8 cDNA kütüphaneleri Ders notları,

dağıtılan

51

belgeler

9

mikrodizin vs RT-PCR vs Northern blotlama Ders notları,

dağıtılan

belgeler

10

Antisens ve ribozimler; RNA interferans Ders notları,

dağıtılan

belgeler

11

Gen Sekanslaması; bölge hedefli mutajenez (BHM)

Faj gösterimi; klonlanmış DNA’dan ifade

PS 4 : promoter bölgesinde BHM dizaynı

Ders notları,

dağıtılan

belgeler

12

Anlatım vektörleri; protein füzyonları ve saflaştırma

PS 5 : mayada anlatım için klonlama

PS 6 : dokuya özel anlatım için mutant DNA klonlama

Ders notları,

dağıtılan

belgeler

13

Protein-Protein etkileşimleri;

PS 7: His-işaretli protein pürifikasyonu için klonlama

Ders notları,

dağıtılan

belgeler

14

Maya ikili melez analizleri; memeli ikili melezleri

Translasyon sonrası modifikasyonlar

PS 8 : maya ikili melez vaka çalışması

Ders notları,

dağıtılan

belgeler

15

Genel Tekrar

TELAFİ SINAVI

Ders notları,

dağıtılan

belgeler

16 FINAL SINAVI

Ders notları,

dağıtılan

belgeler

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Principles of Gene Manipulation; Sandy B. Primrose, Blackwell

Science, 2001; ISBN 0632059540

Molecular Cloning: A Laboratory Manual (4th edition); Green MR, Cold

Spring Harbor Press, 2012, ISBN 978-1-936113-42-2

52

Diğer Kaynaklar Dağıtılan belgeler; ödevler; mini-sınavlar; teknik veri sayfaları; problem

saati materyalleri

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları

Ödevler Problem Saatlerinde pek çok ödev ve mini-sınav verilmektedir.




Ara Sınav 1 25

Deney

Ödev 4 – 10 25

Proje

Toplam 50



Toplam 100




1 2 3 4 5



x


x


x

53






x







Ara Sınav 1 8 8

Deney

Ödev 10 3 30

Proje





54

DERS BİLGİLERİ

Ders Kodu Yarıyıl T+U+L Saat

Kredi AKTS

Biyotransport Olayları GBE 361

5 2 + 2 + 0 3 5

Ön Koşul Dersleri GBE 222, MATH 241





Yrd. Doç. Dr. Emrah Nikerel

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Emrah Nikerel

Dersin Yardımcıları YOK

STAJ YOK

Dersin Amacı Öğrencilerin, biyolojik sistemlerdeki taşınım olayları hakkında bilgi

edinmelerini sağlama

Dersin İçeriği

Kütle, ısı ve momentum taşınımı; organ sistemlerinde taşınım

olayları; hastalıkta, tedavide ve cihaz geliştirmede taşınım olayları;

boyutsuz sayılar



Ölçme Yöntemleri

1) Farklı taşınım olaylarını ilişkilendirebilmek 1 1,2 A,D

2) Biyolojik sistemlerde biyolojik olayları değerlendirebilme

1 1,2 A,D

3) Kütle denkliği kurabilmek 1 1,2 A,D

4) Bir özelliğin yatışık durumdaki dağılımını bulabilmek

1 1,2 A,D





55

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Biyolojik sistemlerde taşınım olaylarına giriş Ders Kitabı

2 Momentum-ısı-kitle taşınım prensiplerinin ilişkilendirilmesi Ders Kitabı

3 Biyolojik sistemlerde momentum denkliği Ders Kitabı

4 Kan akışı Ders Kitabı

5 Sıvı taşınımı ve korunumuna ilişlin bağıntılar Ders Kitabı

6 Vize I Ders Kitabı

7 Biyolojik sistemlerde akışkan taşınımı Ders Kitabı

8 Biyolojik sistemlerde akışkan taşınımı Ders Kitabı

9 Dolaşımda sıvı taşınımı Ders Kitabı

10 Kütle taşınımının temelleri Ders Kitabı

11 Kütle taşınımında korunum yasaları Ders Kitabı

12 Difüzyon ve Konveksiyon Ders Kitabı

13 Transport in Porous Media Ders Kitabı

14 Transvaskülwr Taşınım Ders Kitabı

15 Tekrar Ders Kitabı

16 Vize II Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Transport Phenomena in Biological Systems, Second Edition Pearson Prentice Hall Bioengineering. 2010. George A Truskey, Fan Yuan, David F. Katz.

Diğer Kaynaklar

MATERYAL PAYLAŞIMI

56

Dökümanlar

Ödevler Ödev olarak problemler verilmektedir

Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final verilmektedir



Ara Sınav 2 50

Deney

Ödev 4 10

Proje

Toplam 60



Toplam 100




1 2 3 4 5


x




X


X



57




x






Ara Sınav 2 2 4

Deney

Ödev

Proje





58

DERS BİLGİLERİ


Biyokimya II GBE 302 6 2 + 1 + 3 4 9






Doç. Dr. Dilek Telci

Dersi Verenler Doç. Dr. Dilek Telci


STAJ YOK

Dersin Amacı Öğrencilerin biyokimyasal metabolik yolaklar hakkında bilgi ve

deneysel yaklaşımlar ile pratik geliştirmesini sağlamak.

Dersin İçeriği

Serbest enerji ilkeleri; hücre metabolizması ve fermentasyon;

glikoliz; TCA döngüsü; oksidatif fosforilasyon; fotosentez; amino

asit metabolizması,nükleik asit metabolizması; yağ asidi

metabolizması. Ders içeriğine paralel laboratuvar deneyleri.



Ölçme Yöntemleri

1) Enerji hesaplarını yapabilme, biyoenerjetiğin temel kavramlarını anlayabilme

1 1,2 A,C

2) Glikoliz, glikojen yıkımı-sentezi yollarını kontrol mekanizmalarıyla yorumlayabilme

1,3 1,2,3 A,B,C

3) Oksidatif fosforilizasyonu ve metabolik önemini açıklayabilme

1,3 1,2,3 A,B,C

4) Yağ metabolizmanın bütünlüğü ve koordinasyonunu kavrayabilme ve yorumlayabilme

1,3 1,2,3 A,B,C

5) Metabolik yolakların hormanlarla regülasyonunu anlayabilme.

1,2 1,2 A



59



DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Metabolizmaya Giriş

Ders Kitabı

2 Karbonhidrat Metabolizması I: Katabolik Yolaklar Ders Kitabı

3 Karbonhidrat Metabolizması I: Katabolik Yolaklar Ders Kitabı

4 Sitrik Asit Siklusu ve Pentoz Fosfat Yolu Ders Kitabı

5 Elektron Transport Zinciri ve Oksidatif Fosforilasyon Ders Kitabı

6 Ara Sınav 1 Ders Kitabı

7 Karbonhidrat Metabolizması II: Anabolik Yolaklar Ders Kitabı

8 Karbonhidrat Metabolizması II: Anabolik Yolaklar Ders Kitabı

9 Fotosentez Ders Kitabı

10

Lipid Metabolizması I: Yağ Asitleri, Triasilgliseroller,

Lipoproteinler

Ders Kitabı

11

Lipid Metabolizması I: Yağ Asitleri, Triasilgliseroller,

Lipoproteinler

Ders Kitabı


13 Lipid Metabolizması II: Zar Lipitleri ve Steroidler Ders Kitabı

14 Nitrojenli Bileşklerin Metabolizması Ders Kitabı

15 Memeli metabolik Yolaklarının hormonal kontrolü I Ders Kitabı

16 Memeli metabolik Yolaklarının hormonal kontrolü II Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Biochemistry, Matthews, Van Holde, Ahern, 4. Baskı (Uluslararası Baskı)

Diğer Kaynaklar

60

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler




Ara Sınav 2 30

Deney 8 35

Ödev

Proje

Toplam 65



Toplam 100




1 2 3 4 5


X



X




61










Ara Sınav 2 3 6

Deney 8 3 24

Ödev

Proje





62

DERS BİLGİLERİ


Kredi AKTS

Deneysel Genetik ve Biyomühendislik I: İlkeler

GBE 326 6 2 + 0 + 2 3 6

Ön Koşul Dersleri PHYS 102, GBE 321





Yrd. Doç. Dr. Ali Özhan Aytekin

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Ali Özhan Aytekin

Dersin Yardımcıları Bölüm bursiyerler

STAJ YOK

Dersin Amacı Biyoproses mühendisliğinin temellerini ve altakım işlemlerinin

öğrencilere aktarılması.

Dersin İçeriği Biyoproses mühendisliği, enzim ve mikrobiyal kinetikler,

biyoreaktörler, altakım işlemleri

Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme

Çıktıları Öğretim

Yöntemleri Ölçme

Yöntemleri

1) Biyoproses mühendisliği kavramı ve uygulamalarının anlatılması

1, 2, 7, 10 1, 2, 3, 4 A, B, C

2) Biyoreaktör tiplerinin anlatılması ve endüstriyel üretimlerdeki önemi

1, 2 1, 2, 4 A, B

3) Alt-ve Üst-akım işlemlerinin biyoproses açısından önemi

1, 2 1, 2, 4 A, B


Ölçme Yöntemleri: A: Sınav , B: Deney , C: Ödev , D: Proje

63

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri Laboratuar Deneyleri

1 Biyoproses mühendisliğine giriş

Ders Kitabı

2 Biyoproses mühendisliği Ders Kitabı

3 Biyoproses mühendisliği Ders Kitabı

4 Biyoproses mühendisliği ve Kinetik Ders Kitabı

5 Kinetik Ders Kitabı

6 Biyoreaktörler ve Ara-Sınav I Ders Kitabı

7 Biyoreaktörler Ders Kitabı Mikroorganizmaların

izolasyonu

8 Biyoreaktörler Ders Kitabı Mikroorganizmaların seçimi

9 Biyoreaktörler Ders Kitabı Enzim kararlılığı ve

optimum koşulları

10 Biyoreaktörler Ders Kitabı Ortam optimizasyonu

11 Alt-Akım işlemleri ve Ara-Sınav II Ders Kitabı

12 Alt-Akım işlemleri Ders Kitabı Hücre Parçalama

13 Alt-Akım işlemleri Ders Kitabı Ayırma ve Saflaştırma

işlemleri

14 Alt-Akım işlemleri Ders Kitabı İmmobilizasyon

15 Alt-Akım işlemleri Ders Kitabı

16 Alt-Akım işlemleri Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Biochemical Engineering Fundamentals, Bailey & Ollis, 4th Ed.

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Gerekli olabilecek olan tablolar ve grafikler öğrencilere fotokopi olarak verilmektedir.

64

Ödevler




Ara Sınav 2 45

Deney 7 20

Ödev

Proje

Toplam 65



Toplam 100




1 2 3 4 5


X


X






X


9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme

65

becerisi


X






Ara Sınav 2 3 6

Deney

Ödev

Proje





66

DERS BİLGİLERİ

Ders Kodu Yarıyıl T+U+LSaat Kredi AKTS

Gen Mühendisliği Teknikleri II GBE 342 6 2 + 1 + 3 4 8






Yrd. Doç. Dr. Andrew J. Harvey

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Andrew J. Harvey


STAJ YOK

Dersin Amacı Gen mühendisliği teknikleri kullanarak pratik deney becerileri

kazandırmak

Dersin İçeriği

Hücre kültürlerinde geçici veya stabil transfeksiyon gibi teknikler;

kök hücrelerin genetic manipulasyonları; hayvan ve insan

klonlama; transgenic hayvan gibi genetic manipulasyonlar;

bitkilerin genetic manipulasyonu; özellikle transgenic teknolojiler ve

farmasötik biyomühendislik ile gen mühendisliği laboratuvar

deneyimine vurgu.



Ölçme Yöntemleri

1) PCR ve klonlama yapabilme becerisi 2,3 1,2,3,4 A,B,C

2) Proteinleri bakteride anlatabilme becerisi 2,3 1,2,3,4 A,B,C

3) Hücre hattı veya kök hücre manipulasyonları tasarlayabilme becerisi

2,3,4,9 1,2,3,4 A,B,C

4) Transgenik hayvanlar veya bitkiler tasarlayabilme becerisi

2,3,4,6,8,9,10

1,2,4 A,B,C,D

5) Yeni vakalarla karşılaşıldığında deneysel fikir üretebilme becerisi

2,3,4,6,8,9,10 1,2,4 A,B,C,D

67

6) Yeni bir ürüne yönelik takım halinde proje önerisi hazırlayabilme becerisi (TÜBİTAK proje öneri formu kullanılır)

2,3,4,6,8,9,10 1,2,4 A,B,C,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1

Hücre kültürü, temel ekipman, malzeme ve teknikler

Hücrelere transfeksiyon

Ders notları, dağıtılan belgeler; laboratuvar manueli

2

Stabil ve indüklenebilir hücre hatları

DENEY 1 (DNA’nın restriksiyon haritası)

Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

3

Stabil ve indüklenebilir hücre hatları (devam)

PS1: Okuma (Yeşil Floresan Proteinler)

DENEY 2 (Klonlama için vektör hazırlanması)

Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

4

Kök hücrelere giriş

PS2: Okuma (embryonik kök hücreler)

DENEY 3 (insert DNA’nın PCR ile hazırlanması)

Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

5

Kök hücrelerin genetik manipulasyonu

PS3: okuma (indüklenmiş pluripotan hücreler)

DENEY 4 (erime sıcaklığı tespiti)

Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

6

Hayvan ve insan klonlama çalışmaları

DENEY 5 (bakteri transformasyonu)

Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

68

manueli

7

ARA SINAV

DENEY 6 (mavi-beyaz taramalar)

Dönem ödevlerinin atanması

Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

8

Transgenik hayvanlar ve biyomühendislik

PS4: Okuma (mikrodizin teknolojisi)

DENEY 7 (RNA izolasyonu)

Dönem Ödevi Çalışması. Bir gen mühendisliğinin endüstriyel

uygulamasının biyoprosesinin tasarlanması

Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

9

Bitkilerin genetik manipulasyonu

PS5: Okuma (RNAi teknolojisi)

DENEY 8 (RNA jel elektroforezi)

Dönem Ödevi Çalışması (devam). Bir gen mühendisliğinin

endüstriyel uygulamasının biyoprosesinin tasarlanması

Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

10

Hayvan ve bitkilerin transgenik uygulamaları – hastalık modelleri

PS5: Okuma (genetiği değiştirilmiş organizmalar)

DENEY 9 (cDNA sentezi)



Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

11

Transgenik teknolojiler – farmasötik uygulamalar

PS 6: Okuma (hayvan hastalık modelleri)

DENEY 10 (gerçek zamanlı RT-PCR)



Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

12

Transgenik uygulamalar – biyodizel

PS 7: Okuma (insülin ve aşı üretimi; biyodizel üretimi)

DENEY 11 (bakteride GST-protein üretimi)



Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

69

13

Genetiği değiştirilmiş organizmalarla ilgili etik ve hukuki durumlar



Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

14



Dönem Ödevi Yazılı Raporun teslim edilmesi

Dönem Ödevlerinin Takım Sunumları

Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

15

Revizyon

MAKE-UP SINAVI

Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

16 FINAL EXAM

Ders notları,

dağıtılan

belgeler;

laboratuvar

manueli

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Principles of Gene Manipulation; Sandy B. Primrose, Blackwell

Science, 2001; ISBN 0632059540

Molecular Cloning: A Laboratory Manual (4th edition); Green MR, Cold

Spring Harbor Press, 2012, ISBN 978-1-936113-42-2

Diğer Kaynaklar Dağıtılan belgeler; ödevler; mini-sınavlar; teknik veri sayfaları; problem

saati materyalleri; laboratuvar manueli

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları Sınav Sonucu Panosu’nda asılmakta, isteyen öğrencilere sınav kağıtları gösterilmektedir.

Ödevler Problem Saatlerinde ve Laboratuvar saatinde pek çok ödev ve mini-sınav verilmektedir; ayrıca öğrencilerin takımlar halinde çalışmalarını gerektiren bir Dönem Ödevi bulunmaktadır.


70



Ara Sınav 1 20

Deney 1 20

Ödev 4 – 10 arası

4

Proje 1 16

Toplam 60



Toplam 100




1 2 3 4 5



x


x


x



x



x


x

10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, x

71

çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi






Ara Sınav 1 6 6

Deney 14 2 28

Ödev 5 3 15

Proje 1 35 35





72

Ders Bilgileri


MOLEKÜLER BİYOLOJİ GBE 403 7 3 + 0 + 0 3 6






Yard Doç Dr HÜSEYİN ÇİMEN

Dersi Verenler Yard Doç Dr HÜSEYİN ÇİMEN

Dersin Yardımcıları Yok

STAJ Yok

Dersin Amacı öğrencilere hücresel fonksiyonları ve fizyolojisinin mekanizmalarını

ve bunların kontrol edilmesini tanıtır.

Dersin İçeriği

hücre kimyası ve biyosentez. proteinler. DNA kromozom ve genom.

DNA replikasyonu-onarımı-rekombinasyonu. Enerji dönüşümü

mitokondri ve kloroplast. Hücre döngüsü ve apoptosis. kanser



Ölçme Yöntemleri

1) hücre içi yapıları ve bunların fonksiyonlarını öğrenir

1, 8, 9 1,2 A,C

2) hücre içinde temel mekanızmaları öğrenir. 1, 8, 9 1,2 A,C

3) kanser ve ilgili misregüle edilen yada fonksiyonel olmayan hücresel meknızmaları anlar

1, 8, 9 1,2 A,C





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 derse giriş Ders Kitabı

73

2 Hücre kimyası ve biyosentez Ders Kitabı

3 proteinler Ders Kitabı

4 DNA ve Kromozomlar vede genom Ders Kitabı

5 DNA Replikasyon, Gen Anlatımı ve onarımı Ders Kitabı

6 DNAdan proteine: hücre nasıl genomu anlatır Ders Kitabı

7 gen anlatımı kontrolü Ders Kitabı

8 enerji dönüşümü mitokondri ve kloroplast Ders Kitabı

9 ARA SINAV I Ders Kitabı

10 hücre kominikasyon mekanizmaları Ders Kitabı

11 sitoskeleton ve genel tekrar Ders Kitabı

12 hücre döngüsü ve apoptosis Ders Kitabı

13 kanser Ders Kitabı

14 ARA SINAV II Ders Kitabı

15 hücre içi bölümler ve protein sıralandırılması Ders Kitabı

16 hücre içi veziküler taşıma ve tekrar Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Molecular Biology of the Cell, Wilson and Hunt, Garland

Science 6th ed

Diğer Kaynaklar

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin eposta adreslerine gönderilmektedir

Ödevler

Sınavlar 2 Ara Sınav and 1 Final Sınavı

74



Ara Sınav 2 60

Deney

Ödev

Proje

Toplam 100



Toplam 100

DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersi



1 2 3 4 5

1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahiptir.

X

2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptar, tanımlar ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunar.

3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlar, deney yapar, veri toplar, sonuçları analiz edip ve yorumlar.

4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlar.

5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışır ve sorumluluk alarak karar almada belirleyicidir.

6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilir.

7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık yaratır.

8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisine sahiptir.

X

9 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisine sahiptir.

X

10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisine sahiptir.

X

75




Ders Süresi (Sınav haftası hariçtir: 14x toplam ders saati) 14 3 42


Ara Sınav 2 3 6

Deney

Ödev

Proje





76

DERS BİLGİLERİ


Kredi AKTS

Deneysel Genetik ve Biyomühendislik II: Tasarım ve Uygulamalar

GBE 415 7 2 + 2 + 0 3 6









STAJ YOK

Dersin Amacı Ekonomi ve biyoproses mühendisliği yaklaşımları ile fabrika

tasarımının anlaşılması.

Dersin İçeriği

Biyoproses mühendisliği, Pazar araştırması, Isı ve Kütle transferi

hesaplamaları, Biyoreaktör ve tank ölçülerinin hesaplanması,

altakım işlemlerinin belirlenmesi, maliyet analizi



Ölçme Yöntemleri

1) Biyolojik üretimler için fabrika tasarımında dikkat edilmesi gereken noktaların verilmesi

2, 4 1, 2, 3, 4 A, D

2) Fabrika tasarımı için yapılması gereken kütle-enerji ve basınç düşüşlerinin hesapları

1, 2, 4 1, 2 A, C, D

3) Belirli bir ürün için pazar araştırmasının yapılması ve fabrika için maliyet analizinin yapılması

7 1, 2, 3 A, C, D


77


A: Sınav , B: Deney , C: Ödev , D: Proje

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri Proje raporlarının

konusu

1 Tasarıma Giriş

Ders Kitabı

2 Maliyet Analizi Ders Kitabı

3 Yapım malzemeleri Ders Kitabı

4 Kütle Dengesi Hesapları Ders Kitabı



7 Kütle ve Enerji Dengesi Hesapları Ders Kitabı Pazar Araştırması

8 Enerji Dengesi Hesapları Ders Kitabı Maliyet Analizi

(Başlangıç)

9 Enerji Dengesi Hesapları Ders Kitabı Üretim Ortamının

Belirlenmesi

10 Basınç kayıpları Ders Kitabı Akış Diagramı

11 Borulama sistemleri ve Ekipmanlar Ders Kitabı Hesaplamalar

(Kütle Dengesi)

12 Borulama sistemleri ve Ekipmanlar Ders Kitabı Hesaplamalar

(Enerji Dengesi)

13 Atık Yönetimi Ders Kitabı Hesaplamalar

(Toplam)

14 Güvenlik Ders Kitabı Hesaplamalar

(Tank ve Biyoreaktör)

15 Ders Kitabı Cihaz Seçimi

16 Ders Kitabı Maliyet Analizi

(Son)

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Chemical Engineering Design, Volume 6, Richardson & Coulson

78

MATERYAL PAYLAŞIMI


Görevler Pazar araştırması raporu, eğitimin başlamasından itibaren ilk 7 hafta içerisinde teslim edilmesi gerekmektedir. Proje raporları, belirlene akış içerisinde 1 hafta içerisinde teslim edilmesi gerekmektedir.

Sınavlar 1 Final verilmektedir.



Ara Sınav

Deney

Ödev 1 25

Proje 7 35

Toplam 60



Toplam 100




1 2 3 4 5


X


X



X


79



X









Ara Sınav 2 3 6

Deney

Ödev

Proje





80

DERS BİLGİLERİ


Biyoproses Mühendisliği Teknikleri

GBE 451 7 3 + 0 + 0 3 6









STAJ YOK

Dersin Amacı Biyoproses mühendisliği uygulamaları ve biyoürünlerin önemi ile

ilgili örnekler ve prensiplerin sunulması.

Dersin İçeriği

Biyoproses mühendisliği, biyoreaktörler, altakım işlemleri,

enzimler, antibiotikler, biyoyakıtlar, organik asitler, monoklonal

antikorlar.



Yöntemleri Ölçme

Yöntemleri

1) Biyoproses mühendisliği ve uygulamalarına özet bir bakış

2, 7, 10 1, 2, 3 A

2) Mikrobiyal temelli biyoürünlerin hazırlanmasında karşılaşılan önemli hususların ve yöntemlerin verilmesi

2, 10 1, 2, 4 A, D

3) Hücre kültürü temelli biyoürünlerin hazırlanmasında karşılaşılan önemli hususların ve yöntemlerin verilmesi.

2, 10 1, 2, 4 A, D





81

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Giriş

Ders Kitabı

2 Biyoproses Mühendisliği Ders Kitabı

3 Mikrobiyal ve Hücre Kültürleri Ders Kitabı

4 Biyoreaktörler Ders Kitabı

5 Alt- ve Üst-akım işlemleri Ders Kitabı

6 Tek Hücre Proteini - Ara Sınav I Ders Kitabı

7 Biyoyakıtlar Ders Kitabı

8 Biyoyakıtlar - Enzimler Ders Kitabı

9 Enzimler Ders Kitabı

10 Antibiyotikler Ders Kitabı

11 Laktik asit ve Asetik asit Ders Kitabı

12 Sitrik asit – Ara Sınav II Ders Kitabı

13 Biyoplastikler ve Biyopolimerler Ders Kitabı

14 Aminoasitler Ders Kitabı

15 Monoklonal antikorlar Ders Kitabı

16 Aşılar Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Biochemical Engineering Fundamentals, Bailey & Ollis, 4th Ed.

MATERYAL PAYLAŞIMI


82

Sınavlar 2 Ara sınav ve 1 Final verilmektedir.



Ara Sınav 2 60

Deney

Ödev

Proje

Toplam 60



Toplam 100




1 2 3 4 5



X






X


83



X






Ara Sınav 2 2 4

Deney

Ödev

Proje





84

DERS BİLGİLERİ


Kredi AKTS

Yaz Stajı GBE 400 7 0 + 2 + 0 1 1

Ön Koşul Dersleri AFE 132, GBE 301, GBE 341





Yrd. Doç. Dr. Bahar Soğutmaz Özdemir

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Bahar Soğutmaz Özdemir


STAJ VAR

Dersin Amacı

Bölüm tarafından onaylanan bir şirkette veya laboratuvarda 20 iş

günü içerisinde genetik ve biyomühendislik uygulamaları

konusunda tecrübe kazanmak.

Dersin İçeriği

Staj raporunda belirtilmesi istendiği üzere öğrenci, profesyonel

çalışma ortamında eğitim görür, çalışma yeri ve alet/techizat

hakkında bilgi toplar ve istenen görevleri yerine getiri.



Yöntemleri Ölçme

Yöntemleri

Şirkette veya laboratuvarda genetik ve biyomühendislik uygulamaları konusunda yeterlilik kazanması

2,3,4,5,9 2,3,4 B, D

Çalışma ortamı, farklı bölümlerarası takım çalışması, üretkenlik konusunda profesyonel bilgi birikimi kazanması

2,3,4,5,9 2,3,4 B, D

Sesli ve yazılı iletişim becerilerin geliştirilmesi 2,3,4,5,9 2,3,4 B, D


Ölçme Yöntemleri: A: Sınav , B: Deney , C: Ödev , D: Proje

DERS İÇERİĞİ

85


1

Çalışma yerinde bulunan danışman tarafından

belirlenir

2


belirlenir

3


belirlenir

4


belirlenir

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar

Sınavlar



Ara Sınav

Deney

Ödev

Proje 1 50

Toplam 50



Toplam 100



86


1 2 3 4 5



x


x


x


x





X







Ara Sınav

Deney

Ödev

Proje 1 5 5

Final Sınavı


Toplam İş Yükü / 25 (s) 1


87

DERS BİLGİLERİ


Moleküler Biyoloji II GBE 404 8 2 + 1 + 3 4 5









STAJ YOK

Dersin Amacı

Öğrencilerin hücre siklus kontrolü, hücre dışı matris ve hücre

yapışması, embriyonik gelişim ve bağışıklık biyolojisi gibi öncelikli

hücre moleküler biyolojisi konularında bilgi ve deneysel

yaklaşımlar ile pratik geliştirmesini sağlamak.

Dersin İçeriği

Hücre siklusu ve hücre ölümü, Hücre bağlantıları-adezyon ve

hücre dışı matris, Bağışıklık Biyolojisi, Üreme hücreleri ve

döllenme, Çok hücreli organizmalarda gelişim, Dokuların

Histolojisi. Ders içeriğine paralel laboratuvar deneyleri.



Ölçme Yöntemleri

1) Hücre siklusu ve ölümünün temel ilkelerini kavramak. 1 1,2 A,C

2) Hücre bağlarının ve adezyonunun çok hücreli organizmaların gelişimindeki, hücre canlılığındaki ve doku bütünlüğündeki önemini anlamak.

1,3 1,2,3 A,B,C

3) Bağışıklık sisteminin oranizmaların yaşamı sürdürmesindeki önemini anlamak.

1,3 1,2,3 A,B,C



88

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Hücre Siklusu ve Ölümü

Ders Kitabı

2 Hücre Siklusu ve Ölümü Ders Kitabı

3 Hücre Bölünmesi Mekanizması Ders Kitabı

4 Hücre Bağları, Adezyon ve Hücre Dışı Matris Ders Kitabı

5 Hücre Bağları, Adezyon ve Hücre Dışı Matris Ders Kitabı

6 Arasınav 1 Ders Kitabı

7 Doğuştan Gelen ve Edinilmiş Bağışıklık Sistemi Ders Kitabı

8 Edinilmiş Bağışıklık Sistemi Ders Kitabı

9 Edinilmiş Bağışıklık Sistemi Ders Kitabı

10 Üreme Hücreleri ve Döllenme Ders Kitabı

11 Arasınav II Ders Kitabı

12 Çok Hücreli Organizmalarda Gelişim Ders Kitabı



15 Dokuların Histolojisi Ders Kitabı

16 Dokuların Histolojisi Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Molecular Biology of the Cell, Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter, 5th edition.

Diğer Kaynaklar Derleme Yayınlar

MATERYAL PAYLAŞIMI

89






Ara Sınav 2 30

Deney 8 35

Ödev

Proje

Toplam 65



Toplam 100




1 2 3 4 5


X


X


X





X

90



X







Ara Sınav 2 3 6

Deney 8 3 24

Ödev

Proje





91

DERS BİLGİLERİ


Mühendislik Projesi GBE 492 8 1 + 0 + 4 3 8

Ön Koşul Dersleri 4. sınıf öğrencisi olmak


Dersin Seviyesi

Lisans



Bölüm fakülte üyeleri

Dersi Verenler

Bölüm fakülte üyeleri


ilgili laborauvarın bölüm bursiyerleri

STAJ YOK

Dersin Amacı

biyomühendislik projesinin tamamlanması için gerekli biyomühendislik

problemin saptanması ve deneylerin tasarlanıp gerçekleştirilmesi

Content

Bir mühendislik / bilim probleminin analiz, tasarım ve gerçeklenmesi,

sonuçların rapor ve seminer olarak sunumu, proje ile ilgili laboratuvar

deneyleri



Ölçme Yöntemleri

1) biyomühendislik alanında bir problemin tanımlar

2, 6, 7, 10 2, 3, 4 A,B.C.D

2) çözüm sunabilmek için projeyi tasarlar 3, 4, 9, 10 2, 3, 4 A,B.C.D

3) laboratuvar deneylerini tasarlar ve yapar 3, 4, 5, 9, 10 2, 3, 4 A,B.C.D

4) bulguları analiz eder ve yazılı vede sözlü olarak sunar

7, 9,10 2, 3, 4 A,B.C.D





92

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 ilgili lab danışmanı ile proje konusu tartışması

2 final projesi için konuların belirlenmesi

3 kaynak araştırması



6 seçilen konu ile alakalı çalişmaların organize edilip tartışılması

7 gerekli iş ve deneylerin belirlenmesi

8 hesaplamalar veya analizler veya deneyler



11 sonuçların yada bulguların değerlendirilmesi

12 tez yazımı

13 tez yazımı

14 gerekli düzeltmeler ve tez teslimi

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Diğer Kaynaklar

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar

Ödevler

Sınavlar

93



Proje raporları 1 60

Final (tez değerlendirilmesi) 1 40

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5



X


X


X


X


X


X



X


X

94






Final sınav 1 10 10




95

DERS BİLGİLERİ


Neurobiyoloji GBE 324 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5




Dersin Türü Zorunlu Seçmeli


Bölüm öğretim görevlileri

Dersi Verenler Bölüm öğretim görevlileri


STAJ YOK

Dersin Amacı Lisans düzeyinde temel nörobiyoloji altyapısı oluşturmak, bunu

takiben güncel gelişmelerle ilgili tartışmalar yapmak

Dersin İçeriği

Sinir hücreleri, sinir hücresi aktivasyonunun reseptör aracılığı ile

kontrolü; G protein bağlı reseptörlerin moleküler biyolojisi; beyin ve

merkezi sinir sistemi; kan-beyin bariyeri; baskılayıcı amino asitler

ve dopamin; öğrenme ve hafızanın hücresel mekanizmaları;

nörodejeneratif hastalıklar; nörodejeneratif hastalıkların modeli

olarak transgenic hayvanlar



Ölçme Yöntemleri

1) Nörobiyloji, öğrenme ve hafızayla ilgili temel bilgiler

1,6 1,2 A

2) Sinir sistemi hastalıklarının modeli olarak transgenik hayvanların kullanımına ilişkin temel bilgiler

1,6 1,2 A

3) Güncel genetik teknikler yanısıra nörorejenerasyonla bağlantılı kök hücre teknolojilerine ait temel bilgiler

1,6 1,2 A

96





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1

Sinir hücreleri ve davranışa giriş (Kısım I ve II)

Ders notları, powerpoint sunumları, ders kitabı

2

Nörositoiskelet; nöronlarda protein sentezi; aksonal taşıma

(Bölüm 4,5)

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

3

Iyon kanalları (Bölüm 6) Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

4

Zar potansiyeli; aksiyon potansiyeli

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

5

Sinaptik ileti

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

6

Sinaptik iletinin modülasyonu (Bölüm 13)

Sinaptik bütünleştirme

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

7

ARA SINAV

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

8

Nöroanatomi – Sinir sisteminin işlevsel organizasyonu

Sinir sisteminin gelişimi - I

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

97

kitabı

9

Sinir sisteminin gelişimi – II

Sinir kök hücreleri ve nörorejeneratif tedaviler

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

10

Akson rehberliği (Bölüm 54)

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

11

Öğrenme ve hafıza (Bölüm 62, 63)

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

12

Öğrenme ve hafızanın hücresel mekanizmaları

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

13

Beynin yaşlanması; nörodejeneratif hastalıklar (Bölüm 58)

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

14

Dil hastalıkları; psikolojik hastalıklar

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

15 Revizyon ve Telafi Sınavı

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

16 Final Sınavı

Ders notları,

powerpoint

sunumları, ders

kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

1. Principles of Neural Science, Kandel, Schwartz, Jessell, McGraw

Hill, 2000, 4th Ed.

98

2. From Neuron to Brain, Nicholls, Martin, Wallace, Fuchs

Diğer Kaynaklar Dağıtılan belgeler

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları Sınav Sonucu Panosu’nda asılmakta, isteyen öğrencilere sınav kağıtları gösterilmektedir.

Ödevler yoktur.




Ara Sınav 1 35

Deney

Ödev 15

Proje

Toplam 50



Toplam 100




1 2 3 4 5


X


X


99





X



X


X






Ara Sınav 1 10 10

Deney

Ödev

Proje





100

DERS BİLGİLERİ


Bitki Genetiği GBE 356 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5

Ön Koşul Dersler YOK





Yrd. Doç. Dr. Andrew Harvey

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Andrew Harvey


STAJ YOK

Dersin Amacı

Genetik manipülasyona odaklı bir şekilde, öğrencilere bitki

biyolojisi ve genetiği hakkında bilgi kazandırmak. Moleküler

teknikler ve bitki biyoteknolojisine uygulanan genetik analizler

hakkında bilgi vermek.

Dersin İçeriği

Bitki biyolojisi hakkında genel bilgi; nükleer ve sitoplazmik

genomların yapıları; gen transfer teknikleri; çiçekli bitkilerin

gelişiminde gen anlatımı ve düzenlenmesi; bitkilerde genetik

mühendisliği; transgenik bitkiler ve biyoteknolojide kullanımları.



Ölçme Yöntemleri

1) Bitki genetiği ve kalıtımının temel kavramlarını anlayabilme

1 1,2 A,C

2) Temel bitki biyolojisini, fizyolojisini ve bunların bitki doku kültürüne uygulamalarını anlayabilme

1 1,2 A, C

3) Bitki DNA vektörlerinin yapılandırılmasını, ayrıca bitki transformasyon amaç ve yöntemlerini, açıklayabilme ve yorumlayabilme

1 1,2 A, C

4) Transgenik bitkilerin analizini açıklayabilme ve değerlendirebilme

1 1,2 A, C


1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Laboratuvar, 4: Vaka Çalışması

101



DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Bitki Genetiği ve Biyoteknolojisine Giriş Ders Kitabı

2 Mendel Genetiği & Bitki Üremesi Ders Kitabı

3 Bitki Yetiştirme Ders Kitabı

4 Bitki Gelişimi & Fizyolojisi Ders Kitabı

5 Bitki Doku Kültürü Ders Kitabı


7 Moleküler Gen Anlatımı Ders Kitabı

8 Rekombinant DNA & Vektörler Ders Kitabı

9 Genler ve İlgilenilen Özellikler Ders Kitabı

10 Bitki Transformasyonu Ders Kitabı

11 Promotörler ve Marker Genler Ders Kitabı


13 Transgenik Bitkilerin Analizi Ders Kitabı

14 Düzenlemeler ve Biyogüvenlik Ders Kitabı

15 Saha Testleri ve Riskler Ders Kitabı

16 Tartışma ve Gelecek Planları Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Stewart, C.N., Jr. (Ed.) 2008. Plant Biotechnology and Genetics: Principles, Techniques and Applications, Wiley and Sons

Diğer Kaynaklar

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Öğrenciler ders notlarını pdf dosyası halinde indirebilir.

Ödevler

Sınavlar 2 Ara sınav ve 1 Final verilmektedir.

102



Ara Sınav 2 30

Deney

Ödev

Proje

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


X



X


X

5 Disiplinler arası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi





10 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin,

X

103

çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi





Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70

Ara Sınav 2 3 6

Deney

Ödev

Proje





104

Ders Bilgileri


İnsan Genetiği GBE 357 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5






Yrd. Doç. Dr. Fatih Kocabaş

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Fatih Kocabaş


STAJ Yok

Dersin Amacı

Bu ders, insan özelliklerinin aktarılışını ve bu aktatışın insan sağlığı

üzerindeki etkileriyle ilgili bilgi katmayı ve Homo sapiens’ in genetik

özelliklerini incelemek için bilimsel ilgi kazandırmayı amaçlar

Dersin İçeriği

Genetiğe Genel Bakış, Hücreler ve Bölünme (Mitoz ve Mayoz

Bölünme), Aktarma Genetiği, Gen kalıtımı, Mendel Kanunları, Çok

Genli Özellikler, Cinsiyet Belirleme Genetiiği, Davranışsal Genetik,

DNA ve Kromozomlar, Yapı, Replikasyon, Gen Anlatımı, Genom

Yapısı, Mutasyonlar, Popülasyon Genetiği, Allel Sıklığı, İnsan Soyu,

Soy Islahı, Bağışıklık ve Kanser Genetiği, Laboratuvarda Genetik,

Genetik Teknolojileri, Genetik Bozukluklar, Genetik Testleri ve

Tedaviler, Reprodüksiyon Teknolojileri, Gen Bilimi, Genomik

Damgalama, Gen Tanımlama, İnsan Genomunun Genetik ve

Fiziksel Haritalandırılması, İnsan Genom Projesi, İnsan Gen

Bozuklukları- Vaka çalışması.



Ölçme Yöntemleri

1) İnsan genomu ve fenotipte değişik özellerin ekspress edilmesi arasındaki ilişkiyi anlamak

3,4 1 A,C

2) Normal ve anormal (gen bozuklukları) özellik aktarımlarının aile ağaçları ve punett karesi üzerinde gösterilmesi ve bunun genetik danışmanlık uygulamalarında kullanılması.

4,7 1,2,4 A,D

105

3) İnsan genetiğinin bağışıklık tepkisini kontrol etmedeki temellerini anlamak ve Onkojenesis’in (Kanser) başlatılması.

7,10 1 A,D

4) Laboratuvar genetik çalışmalarıyla ilgili gelecekteki beklentileri ve düzeltici genetik çalışmalarının gen bozukluklarını üzerindeki etkilerini öğrenmek

10 1,2,4 C,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Genetiğe Genel Bakış Ders Kitabı

2 Hücreler ve Bölünme (Mitoz ve Mayoz Bölünme) Ders Kitabı

3 Aktarma Genetiği Ders Kitabı

4 Mendel Kanunları Ders Kitabı

5 Çok Genli Özellikler, Cinsiyet Belirleme Genetiiği,

Davranışsal Genetik

Ders Kitabı

6 DNA ve Kromozomlar, Yapı, Replikasyon, Gen Anlatımı, Genom Yapısı, Mutasyonlar

Ders Kitabı

7 Popülasyon Genetiği, Allel Sıklığı, İnsan Soyu, Soy Islahı Ders Kitabı

8 ARA SINAV Ders Kitabı

9 Bağışıklık ve Kanser Genetiği Ders Kitabı

10 Laboratuvarda Genetik, Genetik Teknolojileri Ders Kitabı

11 Genetik Bozukluklar, Genetik Testleri ve Tedaviler Ders Kitabı

12 Reprodüksiyon Teknolojileri, Gen Bilimi Ders Kitabı

13 Genomik Damgalama, Gen Tanımlama, İnsan Genomunun Genetik ve Fiziksel Haritalandırılması

Ders Kitabı

14 İnsan Genom Projesi Ders Kitabı

15 İnsan Gen Bozuklukları- Vaka çalışması / SEMİNER REPREZENTASYON

Ders Kitabı

16 FİNAL SINAVI Ders Kitabı

106

KAYNAKLAR

Ders Kitabı 1. Human Genetics – Concepts and Applications. Author -

Ricki Lewis (Available from Library)

Diğer Kaynaklar

2. Concepts of Genetics. Authors - William Klug, Michael

Cummings, Charlotte Spencer, Michael Palladino (Available

from Library)

3. Genes VIII. Author – Benjamin Lewin (Available from

Library)

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin email adreslerine gönderilmektedir

Ödevler Verilen ödevler bir hafta sonra toplanmaktadır




Ara Sınav 1 40

Ödevler 4-6 10

Proje 1 10

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5

107




X


X




X


X



X






Ara Sınav 1 3 3

Deney

Ödev

Proje 1 0.5 0.5


Toplam İş Yükü 118.5



108

DERS BİLGİLERİ


Bitki Doku Kültürü Mühendisliği GBE 373 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5






Yrd. Doç. Dr. Bahar Soğutmaz Özdemir

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Bahar Soğutmaz Özdemir


STAJ YOK

Dersin Amacı

Bitki doku kültüründe kullanılan yeni teknikler, bitki doku kültürü

yöntemleri, bitkilerin genetik mühendisliği ile ilgili bilgi sağlanması

ve uygulama alanlarını tartışılması.

Dersin İçeriği

Bitki doku kültürü teknikleri, bitki transformasyon yöntemleri, klonal

çoğaltma, bitki doku kültüründe kullanılan mühendislik teknikleri:

bilgisayarlı görüntü analizi, bitki çoğaltımında biyoreaktör

teknolojisi, kültürel ortamın mühendisliği ve mekanize bitki üretimi.



Yöntemleri Ölçme

Yöntemleri

1) Bitki doku kültüründe temel kavramların verilmesi

2, 10 1, 2 A, D

2) Bitki çoğaltımı ve genetik mühendisliğindeki önemli hususların ve yöntemlerin verilmesi

2, 7, 9, 10 1, 2, 3, 4 A, D

3) Bitki doku kültürü mühendisliğindeki önemli hususların ve kullanılan yöntemlerin verilmesi

2, 9, 10 1, 2, 4 A, D





109

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Giriş

Ders Kitabı

2 Bitki hücre ve doku kültürü gereksinimleri Ders Kitabı

3

Bitki doku kültürü yöntemleri I (Organogenez,

embriyogenez)

Ders Kitabı

4

Bitki doku kültürü yöntemleri II (embriyo

kurtarma, haploid bitki üretimi, protoplast

füzyonu)

Ders Kitabı

5 Bitki genetik mühendisliği teknikleri Ders Kitabı

6

Bitki genetik mühendisliği meseleleri ve

uygulamaları

Ders Kitabı

7 Ara Sınav Ders Kitabı

8 Bilgisayarlı görüntü analizi Ders Kitabı

9 Bitki üretiminde biyoreaktör teknolojisi Ders Kitabı

10 Kültürel ortamın mühendisliği Ders Kitabı

11 Mekanize bitki üretimi ve deneysel tasarımlar Ders Kitabı

12 Uygulama alanları Ders Kitabı

13 Sunumlar Ders Kitabı

14 Sunumlar Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Plant Tissue Culture Engineering, Gupta DS and Ibaraki Y, 2nd Edition, Springer, 2008. Trigiano RN and Dennis JG (2005) Plant development and biotechnology. CRC Press, USA.

MATERYAL PAYLAŞIMI

110

Dökümanlar Ders notları öğrencilere verilecektir.

Sınavlar 1 Ara Sınav, 1 Sunum ve 1 Final Sınavı



Ara Sınav 1 30

Sunum 1 20

Final Sınavı 1 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5



X






X



X

111


X





Ara Sınav 1 2 2

Sunum 1 1 1

Ders dışı çalışmalar 14 5 70





112


Adli Teknolojiler GBE 376 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5




Dersin Türü Zorunlu seçmeli

Dersin Koordinatörü Yrd. Doç. Dr. Fatih Kocabaş



STAJ YOK

Dersin Amacı adli teknoloji bilimini öğrencilere tanıtmak ve kullanılan temel

teknik ve metodları öğretmek

Content



Ölçme Yöntemleri

1. adli teknolojinin tarihini ve değişik alanlarını öğrenir

9,10 1,2 A,C,D

2. eski ve yeni teknik ve metodları anlar 9,10 1,2 A,C,D

3. grup içinde çalışma yeteneği kazanır ve adli vaka çalışmasını bilgisini kullanarak saptar ve çözer.

2,5,6,7 1,2,4 A,C,D

4. adli bilim insanı bakışıyla suçun ortaya çıkarılmasında temel teknikleri öğrenir

7,9,10 1,2,,4 A,C,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 adli teknolojilere giriş slaytlar ve notlar

2 temel alanlar ve laboratuvarlar slaytlar ve notlar

113

3 parmakizi incelemesi I slaytlar ve notlar

4 parmakizi incelemesi II slaytlar ve notlar

5 temel olay yeri inceleme teknikleri slaytlar ve notlar

6 Ara Sınav I (vaka incelenmesi ödevi) slaytlar ve notlar

7 kanıt takibi analizi slaytlar ve notlar

8 kanıt takibi analizi slaytlar ve notlar

9 kontrol edilen maddelerin analizi I slaytlar ve notlar

10 kontrol edilen maddelerin analizi II slaytlar ve notlar

11 Ara Sınav II slaytlar ve notlar

12 kan kalıntısı analizi slaytlar ve notlar

13 adli seroloji slaytlar ve notlar

14 DNA analizi slaytlar ve notlar

15 alanda yeni teknolojiler slaytlar ve notlar

16 alanda yeni teknolojiler slaytlar ve notlar

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Diğer Kaynaklar ders notları ve slaytlar

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları öğrenciler tarafından pdf formatında indirilebilmektedir.

Ödevler adli teknolojlerin değişik alanları için ödevler




Ara Sınav 2 60

Deney

Ödev 1 10

114

Proje

Final 1 30

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5



x




x


x


x



x


x





115


Ara Sınav (Vaka) 1 8 8

Ara Sınav 1 3 6

Deney 0 0 0

Ödev 1 3 3

Proje

Final sınav 1 3 3



Dersin AKTS Kredisi

5

116

DERS BİLGİLERİ


Kredi AKTS

Protein Kimyası GBE 405 6-7-8 3+0+0 3 5






Yrd. Doç .Dr. Hüseyin Çimen

Dersi Verenler Yrd. Doç .Dr. Hüseyin Çimen


STAJ YOK

Dersin Amacı

Öğrencilere proteinlerin saflaştırılmasının genel özellikleri ve

protein saflaştırmasında kullanacakları kromatografi, liyofilizasyon,

elektroforez, diyaliz, ultrafiltrasyon gibi tekniklerle ilgili bilgilerin

kazandırılması amaçlanmıştır.

Dersin İçeriği

Aminoasitler, protein yapıları, Protein ayrıştırmasında ve saflaştırmasında kullanılan genel ve spesifik metotlar. Proteinlerin dokulardan ekstraksiyonu ve fraksiyonlanması. Ultrasantrifügasyon kromatografik teknikler. Proteomik uygulamalara giriş



Ölçme Yöntemleri

1) Protein saflaştırmanın prensipleri ve aşamaları hakkında ayrıntılı bilgi sahibi olabileceklerdir

1,3, 9,10 1,3,4 A,C

2) Protein kimyası ve aminoasitler hakkında detaylı bilgi kazanır

1,3, 9,10 1,3,4 A,C

3) Protein ayrıştırma ve saflaştırma için kullanılan teknik ve uygulamalar konusunda bilgi sahibi olur.

1,3, 9,10 1,3,4 A,C



117

Ölçme Yöntemleri: A: Sınav,B: Deney, C: Ödev, D: Proje

DERS İÇERİĞİ


1 Giriş: protein kimyasına genel bakış Ders notları ve sunum malzemeleri

2 Protein saflaştırma stratejisi ve amacı Ders notları ve sunum malzemeleri

3 Protein saflaştırmasında kullanılan metotlar Ders notları ve sunum malzemeleri

4 Proteinlerin ekstraksiyonu ve fraksiyonlanması Ders notları ve sunum malzemeleri

5 Protein ekstraktının deriştirilmesi Ders notları ve sunum malzemeleri

6 Ultrasantrifügasyon Ders notları ve sunum malzemeleri

7 Ara Sınav Ders notları ve sunum malzemeleri

8 İyon değişimi kromatografisi Ders notları ve sunum malzemeleri

9 Protein katlanma problem Ders notları ve sunum malzemeleri

10 Jel filtrasyon kromatografisi Ders notları ve sunum malzemeleri

11 Afinite kromatografisi Ders notları ve sunum malzemeleri

12 Elektroforetik yöntemler Ders notları ve sunum malzemeleri

13 HPLC ve proteomik metodlar Ders notları ve sunum malzemeleri

14 İmmünolojik yöntemler Ders notları ve sunum malzemeleri

15 Sunumlar Ders notları ve sunum malzemeleri

16 Genel tekrar ve proje sunumları Ders notları ve sunum malzemeleri

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Araştırma makaleleri; ders notları; sunumlar

Diğer Kaynaklar yoktur

MATERYAL PAYLAŞIMI

118

Dökümanlar

Ödevler Dönemin ikinci yarısından itibaren öğrencilere o haftaki konuya ilişkin güncel araştırma makalelerinden ödevler verilmektedir.

Sınavlar 1 ara sınav, öğrenci sunumları ve 1 Final.



Ara Sınav 1 25

Deney

Ödev

Proje 1 35

Final 1 40

Toplam 100



Toplam 100

DERS KATEGORİSİ Alan Dersleri



1 2 3 4 5

1 Matematik, fen, istatistik ve mühendislik bilgilerini uygulama becerisi. X

2 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci tasarlama becerisi.

3 Biyoteknoloji ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve bilişim araçları kullanarak çözme becerisi.

X


5 Biyoteknoloji alanında etkin iletişim kurabilme ve kendini sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi.

6 Mesleki ahlak ve sosyal sorumluluk bilinci kazanmış, güncel konularda meslek etiğine uygun söz, beyan ve uygulamalarda bulunma becerisi.


119



X

10 Kendini global alanda ingilizce olarak yeterli seviyede yazılı ve sözlü olarak ifade becerisi.

X






Ara Sınav 1 10 10

Deney

Ödev

Proje 1 20 20





120

DERS BİLGİLERİ


Kanser Biyolojisi GBE 414 6-7- 8 3 + 0 + 0 3 5




Dersin Türü Zorunlu seçmeli





STAJ YOK

Dersin Amacı

Öğrencilere kanser gelişimi ve biyolojisi üzerine moleküler

yolakları öğretmek. Öğrencileri kanser tedavisinde kullanılan

moleküler hedefli ilaçlar konusunda bilgilendirmek.

Dersin İçeriği

Moleküler kanser biyolojisini etioloji, kanser gelişimi, genetiği,

tedavisi ve önlenmesi baz alarak açıklamak. Kanserin doğası,

etiolojisi, kanserin oluşma nedenleri (kalıtımsal, kimyasal, viral ve

çevresel faktörler), kanserde oluşan genetik değişiklikler,

onkogenler, tümör baskılayıcı genler, apoptoz ve metastaz .



Ölçme Yöntemleri

1) Kanser oluşumunun ve gelişiminin temel kavramlarını anlar

1,2,9 1,2 A

2) Onkogenlerin ve tümör baskalıyıcı genlerin kanser gelişimindeki kontrol ve etkilerini mekanizmalarıyla yorumlar

1,2,9 1,2,3 A

3) Kanser gelişiminde apoptoz ve yaşam sürdürme sinyal yolaklarının önemini açıklayr

1,2,9 1,2,3 A

4) Metastaz koordinasyonunu kavrayabilme ve kök hücrelerin kanser gelişimindeki önemini yorumlar

1,2,9 1,2,3 A

5) Kanser tedavisinde kullanılan klasik ilaçlar ve hedefli ilaçlar konusunda bilgi edinir.

2,3.7,10 1,2 A

121





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Kanser Biyolojisine Giriş; Kanser gelişimi

Ders Kitabı

2

DNA yapısı ve stabilitesi, mutasyon ve DNA hasarı tamir

mekanismaları

Ders Kitabı

3

DNA yapısı ve stabilitesi, mutasyon ve DNA hasarı tamir

mekanismaları

Ders Kitabı

4 Gen ifadesi regülasyonu Regulation of gene expression Ders Kitabı

5 Büyüme Faktörü Sinyal İletimi Yolağı ve Onkogenler Ders Kitabı

6 Büyüme Faktörü Sinyal İletimi Yolağı ve Onkogenler Ders Kitabı

7 Arasınav I Ders Kitabı

8 Hücre Siklusu Ders Kitabı

9 Hücre Büyümesi Inhibasyonu ve tümör baskılayıcı genler Ders Kitabı

10 Hücre Büyümesi Inhibasyonu ve tümör baskılayıcı genler Ders Kitabı

11 Apoptoz Ders Kitabı

12 Arasınav II Ders Kitabı

13 Kök hücre ve Başkalaşımı Ders Kitabı

14 Kök hücre ve Başkalaşımı Ders Kitabı

15 Metastaz Ders Kitabı

16 Metastaz Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Molecular Biology of Cancer, Lauren Pecorino, 3. baskı.

122

Diğer Kaynaklar Uluslararas dergilerde çıkan son yıllara ayit derleme makaleleri

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler




Ara Sınav 2 50

Deney

Ödev

Proje

Final 1 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


X


X


X

4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir

123

sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlar.




X



X


X




Ders Süresi (Sınav haftası dahil değildir: 14x toplam ders saati)

14 3 42


Ara Sınav 2 3 6

Deney

Ödev

Proje





124

DERS BİLGİLERİ


Kök Hücre Biyolojisi GBE 431 6-7- 8 3 + 0 + 0 3 5





Dersin Koordinatörü Yrd. Doç. Dr. Fatih Kocabaş



STAJ Yok

Dersin Amacı

Bu ders, Kök Hücre Biyolojisin temel bilgilerini vermektedir, aynı zamanda kök

hücre biyolojisinin gelişimsel biyolojiden gelen temellerini ve en son araştırmalarla

bulunan ilerlemeleri kapsamaktadır.

Dersin İçeriği

Hücresel ve Nükleer Yeniden Programlama, Genom Bilimi ve Proteomiks,

Yenileme, Ektoderm Spesifikasyonu ve Farklılaşması, Reprodüksyonda Gamet ve

Vücut Hücresi Biyolojisi, Kök Hücre İmmunolojisi, Endoderm Spesifikasyonu ve

Farklılaşması, Mezoderm Spesifikasyonu ve Farklılaşması, Tedavi Beklentileri,

Epigenetik, Mikroçevre, Biyoloji, Homing ve Migrasyon, Doku Mühendisliği.



Ölçme Yöntemleri

1) Kök Hücre Biyolojisinin temellerini öğrenme ve Gelişimsel Biyolojisinden genişletilmesini anlamak.

1,4 1 A

2) Konvensiyonel biyoloji prensiplerini kök hücre ortamındakilerle ilişkilendirmek

1,6 1,2 A,C

3) Potansiyel Kök Hücre araştırma uygulamaları hakkında bilgi edinme ve etik konularla ilgili bilgi sahibi olmak.

6,10 1,4 A,D

4) Kök hücre araştırma becerileri edinme ve potansiyel araştırma olasılıklarını incelemek

8,10 1,2,4 C,D

125





DERS İÇERİĞİ


1 Hücresel ve Nükleer Yeniden Programlama Ders Kitabı

2 Genom Bilimi ve Proteomiks Ders Kitabı

3 Yenileme Ders Kitabı

4 Ektoderm Spesifikasyonu ve Farklılaşması Ders Kitabı

5 Reprodüksyonda Gamet ve Vücut Hücresi Biyolojisi Ders Kitabı

6 Kök Hücre İmmunolojisi Ders Kitabı

7 ARA SINAV Ders Kitabı

8 Endoderm Spesifikasyonu ve Farklılaşması Ders Kitabı

9 Mezoderm Spesifikasyonu ve Farklılaşması Ders Kitabı

10 Tedavi Beklentileri Ders Kitabı

11 Epigenetik Ders Kitabı

12 Mikroçevre, Biyoloji, Homing ve Migrasyon Ders Kitabı

13 Doku Mühendisliği I Ders Kitabı

14 Doku Mühendisliği II Ders Kitabı

15 SEMİNER PRESENTASYONU

16 FİNAL SINAVI Ders Kitabı

ÖNERİLEN KAYNAKLAR

Ders Kitabı 1. Stembook – Havard Stem Cell Institute

Diğer Kaynaklar 2. Stem Cell Biology – Review articles (Pubmed, NCBI)

126

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler Verilen ödevler bir hafta sonra toplanır.




Ara Sınav 1 40

Deney

Ödevler 4-6 10

Proje 1 10

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


X




X


127


X



X



X






Arasınav 1 3 3

Deney

Ödev

Proje 1 0.5 0.5

Final examination 1 3 3




128

DERS BİLGİLERİ


Hücre ve Doku Kültürü

GBE 432 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5









STAJ YOK

Dersin Amacı Öğrencilerin hücre ve doku kültürü konusunda bilgilerini arttırmayı

sağlamak.

Dersin İçeriği

Hücre ve Doku Kültürü sistemleri; güvenlik testi; tarihçe ve temel

metodoloji; kültür tekniklerinin özelleştirilmesi; temel kültür

koşulları; hücre kültürleri ve primer hücreler; gen transferi

teknikleri; hücre ve doku kültürlerinin moleküler analiz yöntemleri;

kültürlerden DNA, RNA ve protein izolasyonu; raportör gen

deneyleri; apoptoz ve çoğalma analizleri; kök hücresi izolasyonu

ve kültürü; doku mühendisliği, hücrelerin matrisler üzerinde

büyütülmesi ve devam ettirilmesi; gelecekteki beklentiler



Ölçme Yöntemleri

1) Temel hücre kültürü tekniklerini öğrenme 1 1,2 A,D

2) Hücre ve doku kültüründeki güvenlik kurallarını öğrenme

1 1,2 A,D

3) Kök hücre terminolojisini kavrayabilme 1 1,2 A,D



Ölçme A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje

129

Yöntemleri:

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Hücre ve Doku Kültürü Terminolojisi ve Tarihçesi

Ders Kitabı

2 Sterilite (Aseptik teknikler, Sterilizasyon metotları ve Filtrasyon) Ders Kitabı

3 Güvenlik kuralları Ders Kitabı

4 Hücre kültürü laboratuvarı dizaynı ve önemli ekipmanlar Ders Kitabı

5 Kültür ortamı: Besiyeri hazırlanması ve formülasyonları Ders Kitabı

6 Rutin hücre kültürü, hücre çoğalması analizi ve hücre canlılığı Ders Kitabı

7 Primer hücre kültürü (İzolasyon ve karakterizasyonu) Ders Kitabı

8 Vize Ders Kitabı

9 Hücre saklanması (dondurma ve çözme) Ders Kitabı

10 Kök Hücre I Ders Kitabı

11 Kök Hücre II Ders Kitabı

12 Sunum Ders Kitabı



KAYNAKLAR

Ders Kitabı Tissue Culture Techniques – Bernice M.Martin

Diğer Kaynaklar Basic Cell Culture Protocols – C.D.Helgason, C.L.Miller

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları öğrencilere verilmektedir

130

Ödevler Proje sunum konuları ve hazırlık bilgileri öğrencilere verilmektedir

Sınavlar 1 Arasınav, 1 Sunum ve 1 Final verilmektedir



Ara Sınav 1 30

Deney

Ödev

Proje 1 30

Final 1 40

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5





X




8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve

131

bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi








Ara Sınav 1 4 4

Deney

Ödev

Proje 1 20 20





132

DERS BİLGİLERİ


Kredi AKTS

Biyomalzemeler GBE 433 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5









STAJ YOK

Dersin Amacı Öğrencilerin, insan vucudu hasarlarında kullanabilecek

biyomalzemeler konusunda bilgilerini arttırmayı sağlamak.

Dersin İçeriği

Materyallerin Özellikleri: Mekanik Özellikleri, Yüzey Özellikleri,

Yüzey Karakterizasyonu, Tıpta Kullanılan Matreyaller: Polimerler,

Biyoemilebilir Materyaller, Metalik İmplant Materyaller, Seramikler

ve Hidrojeller, Doğal Materyaller, Biyomateryallere Karşı Konakçı

Reaksiyonu ve Değerlendirilmesi, Doku Mühendisliği.



Ölçme Yöntemleri

1) Tıpta kullanılan malzeme çeşitlerini öğrenme 1 1,2 A

2) Malzemelerin özelliklerini öğrenme 1 1,2 A,D

3) Biyomalzemelerin vucutta yaratabileceği reaksiyonları ve bunların değerlendirmesini kavrayabilme

1 1,2 A,D

4) Doku Mühendisliğini kavrama 1 1,2 A,D





133

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Derse giriş ve Sunum konularının tanıtılması

Ders Kitabı

2 Malzeme özellikleri I Ders Kitabı

3 Malzeme özellikleri II Ders Kitabı

4 Tıpta kullanılan malzemelerin sınıflandırması I Ders Kitabı

5 Tıpta kullanılan malzemelerin sınıflandırması II Ders Kitabı

6

Biyomalzemelerin vucutta yaratabileceği reaksiyonlar ve

değerlendirmesi

Ders Kitabı

7 Biyomalzemelerin biyolojik testi Ders Kitabı

8 Biyolojik ortamda biyomalzemelerin bozunması Ders Kitabı

9 Vize Ders Kitabı

10 Tıp, Biyoloji ve Yapay organda malzeme uygulamaları Ders Kitabı

11 Doku Mühendisliği Ders Kitabı




KAYNAKLAR

Ders Kitabı Biomaterials Science – Ratner, Hoffman, Schoen, Lemons

Diğer Kaynaklar Biomaterials: Principles and Applications – J.B.Park and J.D.Bronzino

MATERYAL PAYLAŞIMI



134




Ara Sınav 1 30

Deney

Ödev

Proje 1 30

Final 1 40

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5





X





135








Ara Sınav 1 4 4

Deney

Ödev

Proje 1 20 20





136

DERS BİLGİLERİ


Gen Terapisi GBE 435 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5





Ders Koordinatörü Bölüm öğretim görevlisi

Dersi Veren Bölüm öğretim görevlisi


Staj Yok

Dersin Amaçları

Bu ders gen iletiminin basit prensiplerini ve düzeltici gen terapileri

için programlanan rekombinant genetik stratejileri öğretmeyi

amaçlar.

Dersin içeriği

Gen Terapisine Giriş, Virüssüz Gen Terapisi- Plazmid DNA ve Uygulamaları, Retrovirüs, Lentivirüs Vektörleri ve Entegrasyon Analizi, Adenoviral, Adeno-ilişkili virüs, Herpes Simplex Virüs Vektörleri, Düzenleyici RNA- RNA interferans, DNA Entegrasyon Vektörleri- Transpozonlar ve Integraz. Güvenlik ve Düzenleme konuları, Hedeflenmiş Gen Modifikasyonu ve Gen Terapisi için Homolog Rekombinasyon, Gen Terapide Klinik-Öncesi Çalışmalar için Gen Anahtarları, Merkezi Sinir Sistemi Bozuklukları ve Hemoglobinopati için Gen Terapisi, Birinci Dereceden İmmün Yetmezlikler ve Hemofili için Gen Terapisi, Obezite, Diyabet ve Duschene Kas Distrofisi için Gen Terapisi, Kanser Gen Terapisi ve Otoimmün Bozukluklar, Gen Terapisi için kısa bilgiler.



Ölçme Yöntemleri

1) Gen terapi methodlarının temellerinin öğretilmesi ve düzeltici terapi için özgün genetik stratejiler oluşturma.

2,3 1,2 A,C

2) Genetik mühendislik tekniklerinin öğrenilmesi ve gen terapisi için rekombinant DNA teknolojisi uygulamaları.

1,3,4 1,2 A,C

137

3) Genetik terapi uygulamalarında, etik ve güvenlik bilgileri kazandırmak ve genetik terapi uygulamalarıyla alakalı bilgilerin öğretilmesi

7,10 1 A

4) Gen terapisinin İnsan Sağlık Bozukluklarını düzeltmek üzerine etkilerinin öğretilmesi

3,4,10 1,2,4 A,C,D

Teaching Methods:

1:Ders , 2: Soru-Cevap, 3: Laboratuvar, 4: Vaka Çalışması

Assessment Methods:


DERS İÇERİĞİ

Hafta Konu Çalışma Materyali

1 Gen Terapisine Giriş Ders Kitabı

2 Virüssüz Gen Terapisi- Plazmid DNA ve Uygulamaları Ders Kitabı

3 Retrovirüs, Lentivirüs Vektörleri ve Entegrasyon Analizi Ders Kitabı

4 Adenoviral, Adeno-ilişkili virüs, Herpes Simplex Virüs Vektörleri Ders Kitabı

5 Düzenleyici RNA- RNA interferans Ders Kitabı

6 DNA Entegrasyon Vektörleri- Transpozonlar ve Integraz Ders Kitabı

7 Güvenlik ve Düzenleme konuları Ders Kitabı

8 Ara Sınav Ders Kitabı

9 Hedeflenmiş Gen Modifikasyonu ve Gen Terapisi için Homolog Rekombinasyon

Ders Kitabı

10 Gen Terapide Klinik-Öncesi Çalışmalar için Gen Anahtarları Ders Kitabı

11 Merkezi Sinir Sistemi Bozuklukları ve Hemoglobinopati için Gen Terapisi

Ders Kitabı

12 Birinci Dereceden İmmün Yetmezlikler ve Hemofili için Gen Terapisi

Ders Kitabı

13 Obezite, Diyabet ve Duschene Kas Distrofisi için Gen Terapisi, Kanser Gen Terapisi ve Otoimmün Bozukluklar, Gen Terapisi için kısa bilgiler

Ders Kitabı

14 Kanser Gen Terapisi ve Otoimmün Bozukluklar Ders Kitabı

15 Gen Terapisi için kısa bilgiler /SEMİNER PRESENTASYONU Ders Kitabı

16 Final Sınavı Ders Kitabı

138

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

1. A Guide to Human Gene Therapy. Author – Roland Herzog,

Sergei F Zolotukhin Year 2010, World Scientific Publishers

(Available from Internet)

Diğer Kaynalar

2. The Forever Fix: Gene Therapy and the Boy who saved it.

Authors – Ricki Lewis Year 2013, Griffin Publishing (Available

from Library)

3. Gene Therapy. Author – Giacca Mauro Year 2010, Springer

Verlag Italia Publishers (Available from Internet)

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin e-mail adreslerine gönderilmektedir.

Ödevler Verilen ödevler bir hafta sonra toplanılmaktadır.

Sınavlar 1 Ara Sınav, 1 Final Sınavı



Ara Sınav 1 40

Ödev 4-6 10

Proje 1 10

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5

139


X


X


X


X




X




X






Ara Sınav 1 3 3

Deney

Ödev

Proje 1 0.5 0.5





140

DERS BİLGİLERİ


Kredi AKTS

Genomik ve Proteomik GBE 442 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5






Yrd. Doç. Dr. Hüseyin Çimen

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Hüseyin Çimen


STAJ YOK

Dersin Amacı Öğrencilerin genomiks, proteomiks, biyoenformatik bilgilerini

artırmak.

Dersin İçeriği

Genomik bilgilere giriş, web tabanlı uygulamaları tanıtmak,

proteomik ve kütle spektrometrisi uygulamaları, analiz için örnek

hazırlama yöntemleri, örnek ayrıştırma ve saflaştırma sistemleri.



Ölçme Yöntemleri

Genomik temellerini öğrenme ve veritabalanlarını kullanabilme

1,8,9 1,2 A,C

Proteomik yaklaşımların öğrenilmesi ve deneysel yaklaşımlar

1,8,9 1,2 A,C

Biyoenformatik araçların öğrenilmesi ve yüksek hacimli işlemler

1,8,9 1,2 A,C





141

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri


Ders Kitabı

2 Genomik başlangıç Ders Kitabı

3 Yazılımlar Ders Kitabı

4 Metagenomiks Ders Kitabı

5 Proteomik başlangıç Ders Kitabı

6 Protein kimyasına giriş Ders Kitabı

7 Protein yapı ve analizleri Ders Kitabı

8 Deneysel yaklaşımlar Ders Kitabı

9 Vize Ders Kitabı

10 Kütle spektrometrisi Ders Kitabı

11 Çözünürlük, kütle doğruluğu ve cihazlar Ders Kitabı

12 Biyomolekül analizleri Ders Kitabı

13 Ekspresyon proteomik uygulamaları Ders Kitabı

14 Nicel ve nitel yaklaşımlar Ders Kitabı

15 Biyoenformatik uygulamalar Ders Kitabı

16 Sunum değerlendirmeleri

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Richard Twyman, Principles of Proteomics, Taylor & Francis

Edmond de Hoffmann, Vincent Stroobant, Mass Spectrometry:

Principles and Application, Wiley-Interscience 3 ed.

Diğer Kaynaklar

142

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler




Ara Sınav 1 30

Deney

Ödev

Proje 1 30

Final 1 40

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


X






143



X


X







Ara Sınav 1 4 4

Deney

Ödev

Proje 1 20 20





144

DERS BİLGİLERİ


Kredi AKTS

Biyoinformatiğe Giriş

GBE 444 6-7-8 3+0+0 3 5






Yrd. Doç .Dr. Emrah Nikerel

Dersi Verenler Yrd. Doç .Dr. Emrah Nikerel


STAJ YOK

Dersin Amacı

Biyolojik sistemlerden gelen yüksek hacimli verilerin biyoinformatik

analizi, dizileme ve diğer gen okuma teknikleri hakkında hakkında

anlayış geliştirme.

Dersin İçeriği

Temelinde, biyoinformatik algoritma geliştirme üzerine bir bilim olmakla beraber uygulama alanları oldukça geniştir. Ders bünyesinde, biyolojik verilerden bilgi eldesi, mikrodizin deneyleri, veritabanlarında veri madenciliği, BLAST uygulamaları ve Needleman-Wursch, Smith Waterman algoritmaları, Yeni Nesil Dizileme verilerinin analizi ve –omik deneyler için deney tasarımı gibi yeni ve temel kavramlara giriş yapılacaktır.



Ölçme Yöntemleri

1) Biyoinformatiğin temelleri hakkında farkındalık kazanır

1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C

2) Temel biyoinformatik yöntemlerini kullanır 1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C

3) Biyoinformatiğin uygulama alanları hakkında farkındalık kazanır

1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C



Ölçme Yöntemleri: A: Sınav,B: Deney, C: Ödev, D: Proje

145

DERS İÇERİĞİ


1 Giriş: biyoinformatik bilimine genel bakış Ders notları ve sunum malzemeleri

2 Nükleik asit ve protein dizilerinin analizi, moleküler biyolojinin santral dogması


malzemeleri

3 Dizi hizalama yöntemleri, Needleman-Wunsch algoritması


malzemeleri

4 Insan Genom Projesi, Genom Haritaları ve Diziler. Genom nasıl çalışılır*


malzemeleri

5 Dizileme yöntemlerine bakış: Sanger dizileme metodu, Yeni Nesil Dizileme, Egzom dizileme, Shotgun Dizileme


malzemeleri

6 Dizilemede birleştirme yöntemleri: De Bruijn çizgileri. Varolan algoritmalar/yazılımlar


malzemeleri

7 Kısıtlama haritalama: Çift ve Kısmi Digest Sorunu


malzemeleri

8 Gen ifadesine biyoinformatik yaklaşımlar


malzemeleri

9 Protein katlanma problem


malzemeleri

10 Ara sınav


malzemeleri

11 Mikrodizin analizine giriş


malzemeleri

12 Diferansiyel ekspresyon analizi, istatistik uygulamaları


malzemeleri

13 GO terimi zenginleştirilmesi, mikrodizin verilerinin fonksiyonel araştırılması


malzemeleri

14 Genel tekrar ve proje sunumları


malzemeleri

KAYNAKLAR

146

Ders Kitabı Araştırma makaleleri; ders notları; sunumlar

Diğer Kaynaklar yoktur

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Sınav sonuçları Sonuç Panosuna asılmaktadır ve görmek isteyen öğrencilere sınav kağıdına veya raporuna bakma hakkı verilmektedir.

Ödevler

Dönemin ikinci yarısından itibaren öpencilere o haftaki konuya ilişkin güncel araştırma makalelerinden ödevler verilmektedir. Ayrıca dönem sonunda Trends in Genetics dergisinin reveiw makale formatına uygun bir sonuç raporu yazmaları beklenmektedir.

Sınavlar 1 ara sınav, öğrenci sunumları ve 1 Final.



Ara Sınav - 25

Deney - -

Ödev - -

Proje 1 35

Final 1 40

Toplam 100



Toplam 100

DERS KATEGORİSİ Alan Dersleri



1 2 3 4 5

1 Matematik, fen, istatistik ve mühendislik bilgilerini uygulama becerisi. X

2 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci tasarlama becerisi.

X

3 Biyoteknoloji ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve bilişim

X

147

araçları kullanarak çözme becerisi.


X

5 Biyoteknoloji alanında etkin iletişim kurabilme ve kendini sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi.

X

6 Mesleki ahlak ve sosyal sorumluluk bilinci kazanmış, güncel konularda meslek etiğine uygun söz, beyan ve uygulamalarda bulunma becerisi.



X


X

10 Kendini global alanda ingilizce olarak yeterli seviyede yazılı ve sözlü olarak ifade becerisi.

X






Ara Sınav 1 10 10

Deney

Ödev

Proje 1 20 20





148

DERS BİLGİLERİ


Kredi AKTS

Doku Mühendisliğinde Yenilikler

GBE 472 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5









STAJ YOK

Dersin Amacı Öğrencilerin, doku mühendisliği konusunda bilgilerini arttırmayı

sağlamak.

Dersin İçeriği

Hücre ve Doku Kültürü sistemleri; temel kültür koşulları; hücre

kültürleri ve primer hücreler; kök hücresi izolasyonu ve kültürü;

hücrelerin matrisler üzerinde büyütülmesi ve devam ettirilmesi;

Materyallerin Özellikleri: Mekanik Özellikleri, Yüzey Özellikleri,

Yüzey Karakterizasyonu, Tıpta Kullanılan Materyaller: Polimerler,

Biyoemilebilir Materyaller, Metalik İmplant Materyaller, Seramikler

ve Hidrojeller, Doğal Materyaller, Biyomateryallere Karşı Konakçı

Reaksiyonu ve Değerlendirilmesi, Doku Mühendisliği

uygulamaları.



Ölçme Yöntemleri

1) Hücre kültürünü kavrama 1, 4 1,2 A,D

2) Biyomalzeme çeşitlerini ve özelliklerini öğrenme 1, 4 1,2 A,D

3) Biyomalzemelerin vucutta yaratabileceği reaksiyonları ve bunların değerlendirmesini kavrayabilme

1, 4 1,2 A,D

4) Doku Mühendisliğini kavrama 1, 4 1,2 A,D

149





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri


Ders Kitabı

2

Sterilite, Lab güvenli kuralları, Hücre kültürü lab dizaynı,

Kültür ortamı içerikleri Ders Kitabı

3

Rutin hücre kültürü, Primer hücre kültürü, Hücre saklama

koşulları Ders Kitabı

4 Kök hücre

Ders Kitabı

5 Büyüme faktörleri

Ders Kitabı

6 Malzeme özellikleri

Ders Kitabı

7 Tıpta kullanılan malzemelerin sınıflandırması Ders Kitabı

8

Biyomalzemelerin vucutta yaratabileceği reaksiyonlar ve

değerlendirmesi

Ders Kitabı

9 Biyomalzemelerin biyolojik testi Ders Kitabı

10 Biyolojik ortamda biyomalzemelerin bozunması Ders Kitabı

11 Doku mühendisliği uygulamaları I Ders Kitabı

12 Doku mühendisliği uygulamaları II Ders Kitabı

13 Sunum Makale

14 Sunum Makale

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Tissue Engineering by Bernhard Palsson and Sangeeta Bhatia.,

Prentice Hall

Diğer Kaynaklar Biomaterials Science – Ratner, Hoffman, Schoen, Lemons

150

MATERYAL PAYLAŞIMI






Ara Sınav 1 30

Deney

Ödev

Proje 1 30

Final 1 40

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


X




X

5 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak

151

karar almada belirleyici olma becerisi











Ara Sınav 1 4 4

Deney

Ödev

Proje 1 20 20





152

DERS BİLGİLERİ


Kredi AKTS

Özel Konular: Biyoanalitik Teknikler Konusundaki Gelişmeler

GBE 482 6-7-8 3 + 0 + 0 3 5









STAJ YOK

Dersin Amacı

Bu ders öğrencinin yeleşik ve gelişmekte olan birçok

spektroskopik tekniğinbiyomedikal, biyomühendislik ve moleküler

biyoloji gibi biyoljik bilimlerde ve uygulamalarının öğrenmesini

amaçlamaktadır.

Dersin İçeriği

Nükleer manyetik rezonans, kütle spektroskopisi, X-Ray

kristolografi, UV/Vis, Floresans ve titreşimsel spektroskopinin

temelleri ve bu tekniklerin biyo-bilim ve uygulamalarda

kullanımları, Elektroanalitik ve biyoayrıştırma teknik ve yöntemleri.

Gelişmekte olan mikroakışkan ve fotoniks gibi teknikler.



Ölçme Yöntemleri

1) Numune toplama, standardizasyon, kalibrasyon ve validasyonu açıklayabilme.

3, 6 1,2 A,C, D

2) Temel veri analizini hesaplamalarını yapabilme. 3, 6

1,2 A,C, D

3) moleküler soğurma ve floresan spektroskopisi, titreşimsel spektroskopi, kütle spektroskopisi, nükleer manyetik rezonans gibi teknikleri ve bu tekniklerin cihazlarının çalışma prensiplerini anlatabilme.

3, 6

1,2

A,C, D

4) yüksek performanslı sıvı kromatografisi, gaz kromatografisi, ve elektroforez yöntemleri ve çalışma temellerini açıklaya bilme..

3, 6

1,2 A,C, D

153

5) Kimyasal çözelti ve pH hesaplamalarını yapabilme. 3, 6

1,2 A,C, D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1

Spektrskopiye Giriş

Çeşitli kaynaklar

2 Biyobilimlerde Teknikler

Çeşitli

kaynaklar

3 Moleküler Teknikler: UV/Vis, Floresans, IR ve Raman

Çeşitli

kaynaklar

4 Dikraksiyon Teknikler: X-ray diffraction, Nötron ve Elektron Difraksiyonu

Çeşitli

kaynaklar

5 Biyoayrıştırma Teknikleri: LC, ve Elektroforez

Çeşitli

kaynaklar

6 1. Arasınav Çeşitli

kaynaklar

7 Biyofotoniks ve nanobiyofotoniks

Çeşitli

kaynaklar

8 Biyoanalizde mikroakışkanlar

Çeşitli

kaynaklar

9 Lab-on-a- -TAS)

Çeşitli

kaynaklar

10

Mikroskopik Teknikler: Taramalı Sonda Mikroskopları (SPM),

AFM, STM, NSOM

Çeşitli

kaynaklar

11

Mikroskopik Teknikler: Taramalı Sonda Mikroskopları (SPM),

AFM, STM, NSOM

Çeşitli

kaynaklar

12 Öğrenci sunumları

154





KAYNAKLAR

Ders Kitabı ilgili yayın, derleme ve notlar dönem içerisinde öğrenciye verilecektir.

Diğer Kaynaklar

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler




Ara Sınav ve Quizler 3 60

Deney

Ödev

Proje

Toplam 60



Toplam 100



155


1 2 3 4 5




X




X










Ara Sınav 1 3 3

Deney

Ödev 2 10 20

Proje





156

Dersler ile Program Öğrenme Çıktıları İlişkileri

Dersler PÇ1 PÇ2 PÇ3 PÇ4 PÇ5 PÇ6 PÇ7 PÇ8 PÇ9 PÇ10

Akademik İngilizce I 0 0 0 0 5 0 4 5 5 0

Biyoloji I 5 0 0 5 0 0 0 0 0 0

Genel Kimya I 5 0 0 0 0 5 5 0 0 0

Fizik I 5 5 3 0 5 0 3 0 3 3

Kalkülüs I 5 5 3 5 1 0 5 0 0 0

Akademik İngilizce I 0 0 0 0 5 0 4 5 5 0

Genel Kimya II 5 4 0 4 0 5 4 0 0 0

Genel Kimya Laboratuvar

5 0 0 5 5 5 5 5 3 0

Biyoloji II 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0

Kalkülüs II 5 5 3 5 1 0 5 0 0 0

Fizik II 5 0 3 4 5 1 3 1 3 3

Bilgisayarlı Hesaplamaya Giriş

5 0 0 3 0 0 0 0 4 0

Mikrobiyoloji 0 5 5 0 0 0 5 0 0 5

Hücre Biyolojisi 5 0 5 0 4 0 0 0 0 0

Org.Kim. & Biyomakromoleküllere Giriş

5 0 0 0 0 0 0 0 0 0

Biyometri 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0

Klasik ve Moleküler Genetik

5 5 0 0 0 0 0 0 0 0

Klasik ve Moleküler Genetik Lab.

5 0 5 0 0 0 0 0 0 0

Analitik Kimya 5 0 0 0 5 0 0 0 0 0

Ekonomi 0 0 0 0 5 5 0 0 0 0

Diferansiyel Denklemler

5 5 0 0 0 0 0 0 0 0

Türk Dili I 0 0 0 0 0 0 3 4 5 0

Biyokimya I 5 0 0 5 0 0 0 0 0 0

Biyotermodinamik 5 5 5 5 5 5 1 0 3 5

Gen Mühendisliğinde Teknikler I

0 5 4 5 0 0 0 0 5 0

Biyotransport Olayları 5 0 0 5 2 0 0 0 0 2

Türk Dili II 0 0 0 0 0 0 3 4 5 0

Biyokimya II 5 5 5 0 0 0 0 0 0 0

Deneysel Genetik ve Biyomühendislik I: İlkeler

5 5 0 0 0 0 5 0 0 5

Gen Mühendisliğinde Teknikler II

0 5 5 5 0 5 0 5 5 5

Bitki Genetiği (RE) 5 0 5 5 0 0 0 0 0 5

İnsan Genetiği (RE) 0 0 4 4 0 0 5 0 0 5

Mühendislik Yönetimi 5 5 0 0 0 5 0 0 5 5

Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi I

0 0 0 0 5 0 0 0 5 0

Yaz Stajı 0 3 5 5 5 0 0 0 5 0

Moleküler Biyoloji I 5 0 0 0 0 0 0 4 5 0

Deneysel Genetik ve 5 5 0 5 0 0 5 0 0 0

157

Biyomühendislik II: Tasarım ve Uygulama

Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi II

0 0 0 0 5 0 0 0 5 0

Moleküler Biyoloji II 5 3 5 0 0 0 4 0 4 0

Mühendislik Projesi 0 5 5 5 5 5 5 0 5 5

Nörobiyoloji (RE) 0 0 0 0 5 0 0 0 5 0

Bitki Doku Kültürü Mühendisliği (RE)

0 5 0 0 0 0 5 0 3 5

Adli Teknolojiler (RE) 5 0 0 0 0 5 0 0 0 0

Protein Kimyası (RE) 5 0 3 0 0 0 0 0 5 3

Kanser Biyolojisi (RE) 0 5 0 0 5 3 2 0 3 3

Kök Hücre Biyolojisi (RE)

5 3 5 0 0 0 4 0 4 3

Hücre ve Doku Kültürü (RE)

5 0 0 5 0 5 0 5 0 5

Biyomalzemeler (RE) 5 0 0 5 0 0 0 0 0 0

Gen Terapisi (RE) 5 0 0 5 0 0 0 0 0 0

Genomik ve Proteomik (RE)

5 4 4 4 0 0 5 0 0 5

Biyoinformatiğe Giriş (RE)

5 4 3 4 5 0 0 5 5 3

Doku Mühendisliğinde Yenilikler (RE)

5 0 0 5 0 0 0 0 0 0

Özel Konular: Biyoanalitik teknikler konusundaki Gelişmeler (RE)

5 5 0 0 0 0 5 5 5 5

158

Alınacak Derece:

Yeditepe Üniversitesi Genetik ve Biyomühendislik Bölümü’nde eğitimlerini başarı ile

tamamlayan mezunlara, 240-AKTS lisans eğitim ve öğretimini tamamlayan öğrencilerin,

“Gen Mühendisi ve Biyomühendis” ünvanı verilmekte, bu diploma İngilizce ve Türkçe olarak

hazırlanmakta ve bu ünvana tanınan bütün yetkilerle birlikte alındığı diplomada

belirtilmektedir.

Kabul Koşulları:

Bölüme kayıt yaptırmak isteyen öğrenci, üniversitenin akademik ve yasal mevzuatı

çerçevesinde ÖSYM (Öğrenci Seçme ve Yerleştirme Merkezi) tarafından belirlenen süreçleri

tamamlamak / sınavları başarmış olmak zorundadır. Yurtiçi veya dışında eşdeğer programda

öğrenimine başlamış bir öğrenci yatay geçiş için başvuru yapabilir. Öğrencilerin kabulü

dönem başlamadan, her bir öğrencinin şartları ve başvuru yaptığı derece dikkate alınarak

incelenir ve özel olarak değerlendirilir. Üniversiteye giriş hakkında daha etraflı bilgi Kurum

Tanıtım Kataloğu`nda mevcuttur.

Üniversite tarafından onaylanmış ve bir anlaşma ile sınırları belirlenmiş öğrenci değişim

programları kapsamında yurtdışından gelen öğrenciler İngilizce olarak verilen dersleri

alabilirler. Öğrenci Türkçe dil bilgisi yeterliliğine sahipse Ders Planı`nda belirtilen herhangi bir

Türkçe derse de kayıt yaptırabilir.

Mezunların İstihdam Olanakları ve Üst Kademeye Geçiş: Genetik ve Biyomühendislik

bölümü mezunlarının, akademi, sanayi (ilaç, tarım, gıda, biyomedikal v.b.), klinik ve genetik

tıp ve tanı merkezleri, adli tıp, kamu kuruluşları ile uluslararası araştırma merkezleri ve

laboratuvarlarında iş bulabilmektedirler. Piyasada genetik klinikler, tüp bebek merkezleri ve

uluslararası biyoteknoloji ve biyomedikal şirketlerinin Türkiye temsilciliklerinde gen

mühendislerine ve biyomühendislerine yönelik yoğun bir talep bulunmaktadır.

Lisans eğitimini başarı ile tamamlayan adaylar kendi alanlarında veya ilgili alanlarda, ALES

sınavından geçerli not almaları ve yeterli düzeyde İngilizce dil bilgisine sahip olmaları

koşuluyla lisansüstü ve doktora programlarında öğrenim görebilirler. Genetik ve

Biyomühendislik Bölümü, Üniversitenin Fen Bilimleri Enstitüsü’ne bağlı olarak Biyoteknoloji

Yüksek Lisans Programı ve Doktora eğitimi vermektedir.

Mezuniyet Koşulları:

Lisans eğitim ve öğretimini tamamlayan öğrencilerin (240-AKTS) mezun olabilmeleri için

genel not ortalamasının en az 2.00 olması gereklidir. Mezuniyet genel not ortalaması 4.00

üzerinden hesaplanır; bu ortalama hesaplanırken alınan tüm dersler hesaba katılır.

Öğrencilerden genel not ortalaması 3.50 ya da üstü olanlar "yüksek onur”, 3.00 ile 3.49

arasında olanlar "onur” listesine alınırlar. Buna ek olarak öğrencilerin Genetik ve

Biyomühendislik bölümü tarafından öngörülen 20 günlük stajı tamamlama mecburiyetleri

vardır.

Türk Yüksek Öğretim kurumlarında önceki formal (örgün) öğrenmenin tanınması dikey, yatay

ve üniversite içindeki geçişler Yüksek Öğretim Kurulu'nun belirlemiş olduğu

"YÜKSEKÖĞRETİM KURUMLARINDA ÖNLİSANS VE LİSANS DÜZEYİNDEKİ

PROGRAMLAR ARASINDA GEÇİŞ, ÇİFT ANADAL, YAN DAL İLE KURUMLAR ARASI

159

KREDİ TRANSFERİ YAPILMASI ESASLARINA İLİŞKİN YÖNETMELİK" kapsamında

gerçekleştirilmektedir. Türkiye'de örgün eğitim kurumları dışında formal olmayan sertifikaya

dayalı veya tecrübeye dayalı (in-formal ve non-formal ) öğrenmenin tanınma süreci henüz

başlangıç aşamasındadır. Bu nedenle Yeditepe Üniversitesi'nin tüm programlarında önceki

öğrenmenin tanınması tam olarak başlatılmış değildir.

DERS KATEGORİ LİSTESİ

DESTEK DERSLERİ AKTS

CHEM 111 Genel Kimya I 6

CHEM 112 Kimya II 6

CHEM 113 Genel Kimya Lab. 5

MATH 131 Mühendisler için Analiz I 6

MATH 132 Mühendisler için Analiz II 6

MATH 241 Diferansiyel Denklemler 6

PHYS 101 Fizik I 6

PHYS 102 Fizik II 6

Toplam 47

TEMEL MESLEKİ DERSLER

CHEM 205 Org.Kim. & Biyomakromoleküllere Giriş 5

CHEM 215 Analitik Kimya 6

GBE 111 Biyoloji I 8

GBE 102 Biyoloji II 3

GBE 203 Mikrobiyoloji 7

GBE 205 Hücre Biyolojisi 6

GBE 222 Biyometri 6

GBE 301 Biyokimya I 7

GBE 302 Biyokimya II 9

GBE 321 Biyotermodinamik 5

GBE 403 Moleküler Biyoloji I 6

GBE 404 Moleküler Biyoloji II 5

Toplam 68

UZMANLIK ALAN DERSLERİ

GBE 212 Klasik ve Moleküler Genetik 6

GBE 216 Klasik ve Moleküler Genetik Lab 5

GBE 326 Deneysel Genetik ve Biyomühendislik I: İlkeler 6

GBE 341 Gen Mühendisliğinde Teknikler I 6

GBE 342 Gen Mühendisliğinde Teknikler II 8

GBE 361 Biyotransport Olayları 5

GBE 400 Summer Practice 1

GBE 415 Deneysel Genetik ve Biyomühendislik II: Tasarım ve Uygulama 6

GBE 451 Biyoproses Mühendisliği Teknikleri 6

GBE 492 Mühendislik Projesi 8

GBE 324 Nörobiyoloji (RE) 5

GBE 356 Bitki Genetiği (RE) 5

GBE 357 İnsan Genetiği (RE) 5

GBE 373 Bitki Doku Kültür Mühendisliği 5

GBE 376 Adli Teknolojiler (RE) 5

GBE 405 Protein Kimyası (RE) 5

GBE 414 Kanser Biyolojisi (RE) 5

GBE 431 Kök Hücre Biyolojisi (RE) 5

GBE 432 Hücre ve Doku Kültürü (RE) 5

GBE 433 Biyomalzemeler (RE) 5

GBE 435 Gen Terapisi (RE) 5

GBE 442 Genomik ve Proteomik (RE) 5

GBE 444 Biyoinformatiğe Giriş (RE) 5

GBE 472 Doku Mühendisliğinde Yenilikler (RE) 5

GBE 482 Özel Konular: Biyoanalitik teknikler konusundaki Gelişmeler (RE) 5

Toplam 132

160

BEŞERİ, İLETİŞİM VE YÖNETİM BECERİLERİ DERSLERİ

AFE 131 Akademik İngilizce I 4

AFE 132 Akademik İngilizce II 4

ECON 294 Ekonomi 4

ES 117 Bilgisayarlı Hesaplamaya Giriş 5

ES 301 Mühendislik Yönetimi 4

HUM 103 Uygarlık Tarihi 3

TKL 201 Türk Dili I 2

TKL 202 Türk Dili II 2

HTR 301 Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi I 2

HTR 302 Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi II 2

Toplam 32

BÜTÜN DERSLERİN AKTS TOPLAMI 279

DEĞERLENDİRME VE DERECELEME

Puan Başarı Notu Katsayısı

90-100 AA 4,00 85-89 BA 3,50 80-84 BB 3,00 75-79 CB 2,50 70-74 CC 2,00 60-69 DC 1,50 50-59 DD 1,00 49 and below F 0,00 Diğer Notlar: I Eksik (Incomplete) P Geçer (Pass) X Proje ve Tezler İçin Devam Ediyor (In progress) T Transfer (Transfer) W Dersten Çekilme (Withdrawal) NC Kredisiz (Non-credit) ND Diplomaya Yönelik Olmayan (Nondegree) R Tekrar (Repeat) L İzinli (Leave) ADD Ders Ekleme DR Ders Bırakma AU Dinleyici (Audit) I Notu, geçerli bir mazeret nedeniyle dersin gereği çalışmaları tamamlayamayan

öğrencilere verilir. (I) notunun gerektirdiği eksikliklerin en geç bir sonraki normal dönemin son ders ekleme tarihine kadar tamamlanması gerekir. Eksiklik giderildiğinde öğrenci hakettiği ders notunu alır; başarısızlık halinde ise I, FF’ye dönüşür.

P Notu, not ortalamalarına katılmayan derslerden geçen öğrencilere verilir. X Notu, proje, tez ve benzeri çalışmaları sürdürmekte olan öğrencilere verilir. R Notu, dersin tekrarlandığını gösterir. NC Notu, kredisiz olarak alınan dersler için kullanılır. ND Notu, Yeditepe Üniversitesinden diploma almaya yönelik olmayan ve kredili veya

kredisiz olarak alınan dersler için kullanılır. L Notu, Yönetmelik hükümleri uyarınca izinli olan öğrenciler için kullanılır. T Notu, başka bir bölüm, fakülte ya da üniversiteden transfer olup ilgili yönetim

kurulunca intibakı onaylanan ve not ortalamasına katılmayan derslere veya ÖSS sınavı sonucu ile Üniversiteye yeniden kaydolan öğrencilere, evvelce almış oldukları ve denkliği bölümün önerisiyle ilgili yönetim kurulunca tanınan dersler için verilir.

161

W Notu,son ders bırakma tarihinden sonra minimum ders yükü altında düşmemek koşuluyla, her yıl akademik takvimde belirlenen süre içinde, danışmanın ve öğretim elemanının görüşü alınarak ilgili yönetim kurulu kararıyla bırakılmasına izin verilen derslere verilir.

İletişim Bilgileri :

BÖLÜM BAŞKANI:

Prof. Dr. FİKRETTİN ŞAHİN

Dahili: 1619 [email protected]

AKTS KOORDİNATÖRÜ

Yrd. Doç. Dr. HÜSEYİN ÇİMEN

Dahili: 3259 [email protected]

BÖLÜM SEKRETERİ: DİLEK SEVİNÇ

Tel: +90 216 578 0619, Faks: +90 216 578 0829

Adres: Yeditepe Üniversitesi, 26 Ağustos Yerleşimi, Mühendislik Fakültesi, Genetik ve

Biyomühendislik Bölümü, Kayışdağı, 34755, ATAŞEHİR, İSTANBUL, TURKİYE



162

ÖĞRENCİLERE UYGULANAN ANKETLER Program çıktılarına ulaşma yöntemleri

Program Çıktılarına erişimin ölçülmesinde aşağıda belirtilen yöntemlerin kullanılması

öngörülmüştür.

A. Öğrenciler

1. Ders AKTS işyükü formu

2. Ders Çıktısı Değerlendirme Anketi

3. Ders Değerlendirme formu

B. Stajyer değerlendirme raporu C. Mezun değerlendirme anketi

A. Öğrenciler

1. Ders AKTS işyükü formu TARİH / DATE:……………………………DERSİ AKTS İŞ YÜKÜ FORMU/………………………COURSE ECTS WORKLOAD FORM

1. Ders haftada kaç saat yapıldı?

Bu derse devam yüzdenizi belirtiniz.

…………………… saat

% 100 %90 %80 %70 % %60 %50 %40 %30 %20 %10

2. Bu dersin sınıf içi ders saatleri dışında, dersle ilgili etkinliklerini (quiz, ödev, proje, kütüphane çalışması, laboratuvar, ara sınav ve dönem sonu sınavı gibi) yerine getirmek için haftada ortalama kaç saat ayırıyorsunuz?

Ders saatleri dışında ders için ayrılan haftalık ortalama süre: …………………… saat

3. Bu ders için ön hazırlık ( dersten önce makale-kitap-dergi okuma, kütüphane- internet araştırması vb... genel ders hazırlığı çalışmaları) yaptınız mı?

EVET HAYIR

EVET ise haftalık ön hazırlık saati: …………………… saat

4. Bu ders kapsamında ödev hazırladınız mı ?

(Ders saatleri dışında gerçekleştirilen ve sonuçları dersin öğretim görevlisine sunulan örnek olay incelemeleri/case study, problem/soru çözme çalışmaları vb)

EVET HAYIR

EVET ise hazırlanan ödev sayısı: …………………… adet

Her ödevi oluşturmak için harcadığınız ortalama süre: …………………… saat

(Kütüphane çalışması, grup çalışması, araştırma yapmak, internet taraması vb)

5. Bu ders kapsamında sunum/seminer hazırladınız mı?

EVET HAYIR

EVET ise Hazırlanan sunum/seminer sayısı: …………………… adet

Her sunumu/semineri oluşturmak için harcadığınız ortalama süre: ………… saat


6. Bu ders kapsamında proje veya çizim hazırladınız mı ?

EVET HAYIR

EVET ise hazırladığınız proje/çizim sayısı: ……………………

Her projeyi veya çizimi hazırlamak için harcadığınız ortalama süre: …………………… saat


7. Bu derste küçük sınava (quiz) girdiniz mi?

EVET HAYIR

EVET ise katıldığınız ara sınav (quiz) sayısı: ……………………

Her quize hazırlanmak için harcadığınız ortalama süre: …………………… saat

8. Bu derste ara sınava (vize) girdiniz mi? EVET HAYIR

EVET ise katıldığınız ara sınav sayısı: ……………………

Her ara sınava hazırlanmak için harcadığınız ortalama süre: …………………… saat

163

9. Bu ders kapsamında laboratuar çalışması , sanal mahkeme ya da stüdyo çalışması gibi uygulama çalışmalarına katıldınız mı ?

EVET HAYIR

EVET ise katıldığınız uygulama çalışması sayısı: ……………………

Her uygulama çalışması için harcadığınız ortalama süre: …………………… saat

10. Bu ders kapsamında arazi ve/veya saha çalışmasına, teknik gezilere ya da inceleme gezilerine katıldınız mı ?

EVET HAYIR

EVET ise katıldığınız arazi/ saha/ teknik/ inceleme gezisi veya çalışması sayısı:…………………

Her çalışma/gezi için harcadığınız ortalama süre: …………………… saat

11. Bu derste yarıyıl sonu (final) sınavına girdiniz mi?

(Bu dersten final sınavı yerine proje, rapor, çizim vb. çalışmalar da yapmış olabilirsiniz)

EVET HAYIR

EVET ise yarıyılı sonu sınavına veya final sınavı için sunduğunuz çalışmaya hazırlık için harcadığınız

ortalama süre: …………………… saat

12. Yukarda belirtilmeyen, bu dersle ilgili eklemek istediğiniz farklı bir çalışma, uygulama veya faaliyet var mı?

EVET HAYIR

EVET ise hangi çalışma, uygulama veya

faaliyetler:.........................................................................................................................

Bu faaliyet veya çalışma için bir dönemde ayırdığınız toplam süre: …………………………..saat

164

2. Ders Çıktısı Değerlendirme Anketi

165

3. Ders Değerlendirme formu

B. Stajyer değerlendirme raporu

34 öğrenci katılmıştır. TOTAL (2009) TOTAL (2011)

166

Genetik ve biyomühendislik bilgilerini uygulama

yeteneği kazandım. 3,5 3,4

Deney tasarlama ve yapabilme, deney sonuçlarını

analiz etme ve de yorumlama yeteneği kazandım. 3,7 3,8

Mesleki ve etik sorumluluk bilinci kazandım. 3,5 3,8

Disiplinler arası takımlarda çalışabilme yeteneği

kazandım. 3,3 3,5

Problemlerini tanımlama ve çözme yeteneği

kazandım. 3,5 3,5

Etkin iletişim kurma yeteneği kazandım. 3,6 3,6

Şirkette/Enstitüde var olan laboratuvar

olanaklarından memnunum. 3,3 3,7

Sorumluluk almayı öğrendim. 3,7 3,6

İnisiyatif almayı öğrendim. 3,6 3,5

Edindiğim tecrübe ile planlı çalışma ve zamanı iyi

kullanabilme becerileri sağladı. 3,5 3,5

Yapmış olduğum stajın faydalı olduğunu

düşünüyorum. 3,7 3,8

Takım içerisinde çalışmayı öğrendim 3,6 3,6

Amirlerim ile gereksinim duyduğum etkileşimi

gerçekleştirdim. 3,7 3,9

Genel değerlendirme 3,6 3,6

Derecelendirme: Çok az (1), orta (2), iyi(3), çok iyi

(4) Genel Genel

167

168

169

C. Mezunlar

Derecelendirme: İlgili Değil (İD), Çok az (1), Az (2), orta (3), iyi (4), çok iyi (5)

Genel Eğitim Değerlendirmesi Notlar

Verilen eğitimin İngilizce olmasının faydasını gördüm. 4,8

Yapmış olduğum stajın şimdiki kariyerime olumlu etkisi olduğunu düşünüyorum. 4,5

Okurken yarı zamanlı olarak bir mühendislik işinde çalışmamın şimdiki

kariyerime olumlu etkisi olduğunu düşünüyorum. (Bu grup mezunumuzdan hiç

biri okurken bir işte çalışmadığından, bu soruya hiçbiri cevap vermemiştir). ID

Okurken herhangi bir profesyonel ya da diğer kuruluşun aktif bir üyesi olmamın

şimdiki kariyerime olumlu etkisi olduğunu düşünüyorum. 4,5

Yeditepe Üniversitesi’nden aldığım yüksek lisans derecesinin şimdiki kariyerime

olumlu etkisi olduğunu düşünüyorum. 4,3

Genel Değerlendirme 4,5

b) Eğitsel Altyapının Değerlendirmesi Notlar

Öğretim üyelerinin yeterliliği 4,3

Araştırma görevlilerinin yeterliliği 4,1

Öğrenci-öğretim üyesi iletişiminin bölüm tarafından desteklenmesi 4,3

Aktif (katılımlı) öğrenmenin bölüm tarafından desteklenmesi 4,2

Zaman yönetimi ile ilgili öğretim üyelerinin vurgusu 4,2

Kütüphanenin yeterliliği 3,9

Laboratuvarların yeterliliği 4,2

Bilgisayarların kalitesi ve yeterliliği 4,0

Akademik danışmanın etkinliği ve ulaşılabilirliliği 4,2


Eğitim Amaçlarının Değerlendirilmesi Notlar

Temel bilgi donatımı 4,6

Tasarım yapma ve gerçekleme 4,6

Problem çözebilme 4,6

Güçlü donanım ve yazılım altyapısı 4,6

Laboratuvar kullanma 4,6

Grup çalışması yapabilme 4,6

Yaratıcı olabilme 4,6

Girişimci ruha sahip olabilme 4,5

Sorumluluk sahibi olabilme 4,6

Özgüven sahibi olabilme 4,5

Mesleki ve kişisel gelişimini sürdürebilme 4,5

Etkili iletişim kurabilme 4,5

Rekabet edebilme 4,5

Etik ilkelere bağlılık 4,5

Çevre bilincine bağlılık 4,5

Yazılı ve sözlü sunumda başarı 4,5

Alanında rekabet edebilme 4,4

Bilgisayar ve yazılım araçlarıyla hesapsal yöntemleri uygulama 4,4

Yaratıcı, disiplinlerarası, bağımsız araştırma ve geliştirme yapabilme 4,4

Ulusal ve uluslararası yüksek lisans programlarına girebilme 4,4

170


YENİ MEZUN Değerlendirme Tablosu Notlar

Matematik, Fen ve Mühendislik bilgilerini uygulama yeteneği kazandım. 4,0

Deney (ölçme, araştırma düzeneği vs.) tasarlama ve yapabilme, deney sonuçlarını

analiz etme ve de yorumlama yeteneği kazandım. 4,5

Belirli bir alandaki gereksinimleri karşılayabilecek sistem veya süreç (proses)

tasarlayabilme yeteneği kazandım. 4,5

Disiplinler arası takımlarda çalışabilme yeteneği kazandım. 4,1

Mühendislik problemlerini tanımlama ve çözme yeteneği kazandım. 4,0

Mesleki ve etik sorumluluk bilinci kazandım. 4,1

Etkin iletişim kurma yeteneği kazandım. 4,4

Mühendislik çözümlerininin toplumsal yaşamdaki önemini anlamamı sağlayan

geniş kapsamlı bir eğitim aldım. 4,0

Yaşam boyu öğrenme bilinci ve bu bilinci sürdürme yeteneği kazandım. 4,0

Çağdaş mesleki konular hakkında bilgi sahibi oldum. 4,2

Mühendislik uygulamaları için gereksinim duyulan teknik ve araçları

kullanabilme yeteneği kazandım. 4,2

Aldığım eğitimin kalitesinden memnunum. 4,1

Eğitimin gerçekleştirildiği dersliklerden ortamdan memnunum. 4,1

Bana sunulan laboratuvar olanaklarından memnunum. 4,6

Mezuniyet sonrasında, mesleki açıdan, isteklerimi gerçekleştirebileceğime

inanıyorum. 4,1

Aldığım eğitim planlı çalışma ve zamanı iyi kullanabilme becerileri sağladı. 4,2

Öğretim üyeleri ile gereksinim duyduğum etkileşimi gerçekleştirdim. 4,3

Genel olarak Bölümümden memnunum. 4,5

Yapmış olduğum stajın faydalı olduğunu düşünüyorum. 4,6

Yapmış olduğum mühendislik projesinin faydalı olduğunu düşünüyorum. 4,5

Yapmış olduğum Çift Anadal Programından memnunum.

(sadece 2 öğrenci cevaplamıştır) ID

Yapmış olduğum Yandal Programından memnunum. ID

Genel olarak Mühendislik ve Mimarlık Fakültesi Dekanlığının verdiği hizmetten

memnunum. 4,1

Verilen eğitimin İngilizce olmasından memnunum. 4,6

Üniversitedeki sosyal, sportif ve kültürel olanaklardan memnunum. 4,5

Üniversitedeki bilgisayar olanaklarından memnunum. 4,4

Üniversitedeki kütüphane ve veritabanı olanaklarından memnunum. 4,5

Üniversitedeki yemek olanaklarından memnunum. 3,2

Üniversitedeki servis (ulaşım) olanaklarından memnunum.

(sadece 8 öğrenci cevaplamıştır) 4,5

171

Üniversitedeki yurt olanaklarından memnunum.

(sadece 9 öğrenci cevaplamıştır) 4,1

Üniversitedeki arkadaşlık ortamından memnunum. 4,4

Genel olarak Yeditepe Üniversitesi Rektörlüğü Öğrenci İşlerinin verdiği

hizmetten memnunum. 4,2


172

173

174

175

176

177

178

Documents

YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİgenetik.yeditepe.edu.tr/wp-content/uploads/BOLOGNA-DERS-PAKETI_GENETIK... · 1-Ders Dinleme ve anlamlandırma Standart derslik