�� !"# �� !"#
�� !/�� !"#$%&'3�� !VL,
SL�XCT��� !"#$%&'()*+,
���� !"#$%&'()*�� !"
�� !MS/MS �MSn��
�� !"#$%&' LC/MSD Trap VL
LC/MSD Trap VL�� !"#$%&'("
�� !�� !"#$%&'()*+,-.
�� !"#$%&'()*+,�� !�
�� �� !"#$%&�� '$(!%
�� !"
�� !"#$%&'()LC/MSD Trap SL
LC/MSD Trap SL�� !"#$�� !"
�� !�� !"#$%&'()*+,#
�� !"#$%&'()�� !"#$%
�� !"#$%&'()*+�� !"#
�� !"#$%&'(LC/MSD Trap SL �
�� 5�� ! 11�� !MS/MS�
�� !"LC/MSD Trap XCT
�� !"#$%&LC/MSD Trap XCT ��
�� !"#$%&�� !"#$%&'(
�� !"#$�� �� !"#$ 3��
�� !"#$%&'()*+,LC/MSD
Trap XCT�� !"#$%&'()*+,-
�� !26,000 u/s�� !"#$���
�� !"#$%&�� !"#$%&'(
�� �� !"#$%&'()*
2
�� LC/MSn�� !"#$%
Agilent 1100�� !"# /�� !"#$%&'()*+,*-.�� !"#$%&LC/MSD�� !"#$%& 3�� !"#6 ��� !�� !"#$%&'()*+,-.�� !"#$%&'(��
322.1
323.0
0.00
0.25
0.50
0.75
1.00
1.25x106
Intens.
320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 m/z
2121.8
2122.8
2123.8
0
1
2
3
4x105
Intens.
21242121 2122 2123 2125 2126 m/z
FWHMFWHM
0
500
1000
1500
2000
Intens.
0.0 0.5 1.0 1.5 2.0 2.5 3.0 3.5 4.0 4.5 Time [min]
322.1
621.9
921.8
1321.9
1521.9
2121.8
0.00
0.25
0.50
0.75
1.00
1.25
1.50
x106Intens.
200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 1800 2000 m/z
�� !"#$%&'() *+
�� !"#$%�� !"#$�� !"
�� !"#$%&'()*+,-."#�
�� LC/MSD Trap�� !"#$%&'(
�� !"#$%&'()*+,-./��
�� !"#$%&'()*+,-./��
�� !"#$%&'()*�� !"#$
�� �� !"#$%&'()*+
LC/MSD Trap�� !"#$%&'()*+
�� !"#�� !" !#$%&'()
�� !�� !"#$%&'(')*+%
�� !"#
�� !" LC/MSD Trap�� !"#$%
��
LC/MSD�� !"#$%&'()*+,-
�� !"� LC/MSD Trap VL�� �!"
�� !"LC/MSD Trap XCT�� !"#$
�� !"#$AP-MALDI�� !LC/MSD
Trap XCT�� !"#$%����10-18��
�� !"#$�%&'�� !"#$%&
LC/MSD Trap�� !"#$%&'$()*
�� !"#$%
�� !"#$%&'(LC/MSDTrap XCT��� !"#$%&�� !"#�m/z 200 - 2200 m�� !"#$%&'()*+,
�� !"#8,100 u/s�� !�� !"#
� m/z 322�� ��� MS ��
� m/z 2122�� ��� MS ��
� m/z 200 - 2200�� !"#$MS ��
R = M / delta M @ 50%R = 322.1 / 0.27�� = 6826
�� !�� !"# 0.1 ng/ml-0.5 pgEIC: m/z 309m/z 274 + m/z 281
3
R = M / delta M @ 50%R = 322.1 / 0.27�� = 1185
�� !"#$%&'()*+
�� ! LC/MSD Trap SL �
�� ! LC/MS/MS ��
379.3
397.3
447.2
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
x106Intens.
200 250 300 350 400 450 500 550 m/z
[M + H]+
203.1215.0 243.0
252.9259.1
271.2285.3
295.2
309.2
327.2
379.3
0.0
0.5
1.0
1.5
2.0
x105Intens.
200 220 240 260 280 300 320 340 360 380m/z
CH2
CH3
CH3
CH3
CH3
H3C
HO
H
H
[M + H - H20]+
�� !"#$%&
�� !"#$"%&'()*+,-./�
�� !�� !"#$%&'�� LC/MSn
�� !"#$%&'()*�� !"#$
�� !"#$%&'()*��
��
�� !
� � ! "
ESI�� !"#�� !"#�� !"#
�� !"#
APCI�� �� !"#
�� !"#$%
��
��Syagen�� !" PhotoMateAPPI�� !"#LC/MS�� !"�� !�� !ESI�APCI�� !�� !"#$%&'()$*+
�� D2�APPI MS/MS�� �� !"#$%&'&()*
�� !"
m/z 397�� � MS/MS
�� D2 ��� MS
4
��� !"#$%!"&'()*+,*-
(ESI)
��� !"#$(APCI)
��� !"#$(APPI)
��� !"#
��� !"#$%&'()*+
(AP-MALDI)
�� !"#$%
ESI, APCI, APPI�� !"#$%&'()*
�� !"#$%&'(�� !"#$%&
�� !"#�� !"#$%&'()*+
�� !�� !"#$%&'()*+,-.
�� !"#$%&'()*+$,-./0
�� !�� !"#$%��
�� !"#$%&'()*+,
�� !"#$%&'()*+,
�� !"#$%
�� !"#$%&'()*+, � �� !"#$%&'(% ��� !�� !"#$"%�� !"#$%&�� LC/MS Trap�� !"#$%&
�� !"#$%&'()*+
786.0
480.2
627.1
684.3813.5
942.41056.5
1171.8 1285.8
0.5
1.0
1.5x104
Intens.
0
2000
4000
6000
8000
400 600 800 1000 1200 1400 1600 m/z
Intens.
0.00.2
0.40.60.8
1.01.2
5x10
15 20 25 30 35 Time [min]
200
y4
y5
y6 y7
y8
y9y10
y11
333.1
y31238.7
b3
786.0
786.4
786.9
787.3
0.0
0.5
1.0
1.5
x104Intens.
783 784 785 786 787 788 789 790 791 m/z
�� !"#$%&'()*
�� !"#$%&'()* LC�� !"
��(10-18)�� !"#$%�� �� !
�� !�"#$%�� !"#$%&'()
�� !"#$%�� !"#$%&'()
�� !�� !"#$%�� !"#$%&
�� !"#$%&'()* +,-./01
�MS/MS�� !"#$b-�� y-��
��
AP-MALDI�� !"�� !"#$%
�� !"#$%&'()*Agilent AP-MALDI
�� !"#$%�� !"#$%&'(�
�� (10-18)�� !"#$%&'!()*
�� !"#$�� !MS/MS�� ��
�� ! Spectrum Mill MS�� !"#$
�� !" LC/MSD Trap XCT�� !AP-
MALDI�� !" 2D�� !"#$%&'
�� !AP-MALDI�� !"#$%&'(
�� !�� !" #$%&'()
�� !"#$%&'()(10-18)�� !"#$%��� !"#$%&'(�� !"#$%
�� !"#$%AP-MALDI�� !"#$%�� �� !"#$%&
m/z 786�� EIC
5
m/z 786�� !"#$�� !"#$%&'(
�� !"#$%
�� !"#$%& LC/MSD Trap XCT � 100�� !(attomoles)�� !"#$ A �� LC/MS/MS ��
m/z 100-2000�� !"#
m/z 786�� !"#$%
30.2 - 30.3 min �MS ��
m/z 786� MS/MS��
�� !"#AEGVNDNEEGFFSAR
311
329
MS1
0.0
1.0
8x10Intens.
100 200 300 m/z207
311
MS2 (329)
0.0
0.4
0.8
8x10
100 200 300 m/z
Intens.
147
164
179
190
207
294
MS3 (329 -> 311)
0.00
0.50
1.00
7x10Intens.
100 150 200 250 m/z
162
147
164190
MS4 (329 -> 311 -> 207)
0.0
0.4
0.8
6x10Intens.
150 170 190 m/z
123 149162
165
172
MS5 (329 -> 311 -> 207 -> 190)
0.0
0.4
0.8
4x10Intens.
80 120 160 m/z
�� !"#$%&'()(labetalol)�� !"#$%&'()*�� !
�� !"#$%��MS3�� !"
�� !"(number-of-precursors)�� �� !"#$%&'()*+
��
�� !"#$%&'(
�� !"#$%&'()*+,-./0!
MS�� !"#LC/MSD Trap�� !"#
�� !"#$%#&'()*+,-.��
�� !"#$%&'()*+,-./01
�� !"#�� !"#$%&'(MS/
MS�� !"#$%&'()LC/MSD Trap
SL � XCT�� !"# 5 �(MS5)�� !
� MS/MS�� !"#$
1. � SL � XCT�� �� !"#MS >2� 2. �� SL � XCT�� !"#$6
�� !"#$% ��
�� !"#$% �� !"#$%&'%()*#+,�� !"#$%& 1�
�� !" �� !"#$(C13 �)�� !"#MS/MS ��
�� !"#$% �� !"#$%&'()�� !"#$%&'()
�� !"#$% �� !"#$%&'()*+,-./0MS/MS ��
�� !"#$% 2 �� !"#$%&�� !"#$%&'()*+,�� �� !"#$%&'�� !"#$%&'()*+,
�� !"#$% �� !"#$%&'()*�� !"#$%MS/MS��
�� ! � �� ! �� !"#$%&'()*+,-./0'1�� !"#$%&'()
�� ! � �� ! �� !"#$%&'(�� !"#$%&'!()*+�� !"#$%&'�� !"#$%&�� !"#
�� ! �� !"#$%&'()*+,-./ 1
�� ! �� !"#$%&'()*+,-./01�� !"#$%&� '()MS�� !"#$!"%&'1
�� !"#$%&'()!"
�� !"#$%&�� !"#$%&'()*+,-./�� !"�� !"#$%&'LC/MSD Trap�� !"#$%&'()*+%,�� !�"#$%&'()*+,
147
162
190
208266
MS4 (329 -> 311 -> 294)
0.0
0.4
0.8
6x10
100 200 m/z
165
Intens.
134
MS5 (329 -> 311 -> 294 -> 162)
0
200
400
600
Intens.
133 134 m/z
�� !"#$
LC/MS Trap�� !"�#$%&'LC/MSD
Trap�� !"#$%&'()%*+,-.
�� !"#$%&'�� !"#$%&'
�� !"#$%&'()*"+,-��
�� !"#$%&'()MS�MS/MS�
��
�� !"#$%&'()*+,
LC/MSD Trap XCT�� !"#$%MS1�
�� !"#$%&'()*+,-�� !
�� +1, +2,� +3�� !"#$%&'(
�MS2�� !"#$%&'(�� !"#
�� !�� !"#$%&'()*+,-
�� !"#$%&
�� !"#$%&'()*+
�� !"#$%&'()�� !"#$%
�� !"#$%&'()LC/MSD Trap SL
�XCT�� !"#$%&'�� !"#$
�� !"#$%&�� !"#$%&'(
�� !"
�� !"#$%&'()*+�,-'(./
�� !"#LC/MSD Trap�� !"�smart�
�� �� !"#$%&'()�� !"
�� �� !"#$�� !"#$%&'
�� !"#�� !"#$%&'()*+
�� �� LC�� !"#$�� !"#$
�� !"#$%&'()
��Smartfrag CID�� !"#$�� !"#$(AFW)�� !"�MS/MS�� �� !"#CID�� !"#$%&'
7
359.2
0.00
0.25
0.50
0.75
1.00
1.25
100 150 200 250 300 350 m/z
O
C O
O
H2 H
HCH3
x105Intens.
O
O
CH3
[M+
H]+
136.8146.7
160.7170.7 186.7
196.8
212.8
222.8
236.9 252.9
266.9
276.9287.0
295.0
305.0
313.0
323.0
0.0
0.5
1.0
1.5
x104Intens.
100 150 200 250 300 350 m/z
[M+
H–2
(18)
]+
313.0 341.1
359.1
0.00
0.25
0.50
0.75
1.00
1.25
100 150 200 250 300 350 m/z
x105Intens.
[M+
H]+
[M+
H–1
8]+
�� �!"#$%&MS�m/z 359�� !"!
m/z 359�� !"MS/MS��� CID ��
m/z 359�� !"MS/MS��� !" CID ��(SmartFrag)��� !"#$(AFW)
�� !"#$%&'()*+, MS/MS
��
LC/MSD Trap�� SmartFrag�� !"
�� !"#$%&'()*(AFW)�� !
�� !"#$%&'()*+,-./01
�� !"#$%&%'�� !"MS��
�� !"#$%&
�� !"#$%&
�� MSn�� !"#$%&'(MS��
LC/MSD Trap �� !"#$%&'()*
�� !"#$%&'�� !"#�� !
�� !"#$%&'�� !"#$%&'
�� !"#$%&�� !"#$%&'(
�� !"#$%&'()
�� !"#$
�� !"(Find Compounds)�� !"#
LC/MSn�� !"#$%&'()*+&,
�� !"�#$%�� !" ( F i n d
Compounds)�� :
�� MS�� MSn�� !"#$"%&
�� !"#$%&'( )�*+,
�� !"#$�� !"#$%&'()*
��
�� !"#$%&'()*�� !"#$%
�� !"#$%&'()*+,-./!01
8
�� !"#$%&!'�� !"#$�� !"#$%&' ()*�� !"#$%&�� !"#$%&'()*+,-�� !"MSn
�� !"#$%&'(
�� !"#$%&'()*+,-!./
��� !"�#MSn�� !
��� !"#MS�� !"#$%���MS2
��� !"#$
��� !"#$�� !"�� !"#$%
�� !"MS� MSn ��
18
Intens.x106
x1040
6
4
2
0
1
2
3
4
5
19 20 21 22 23 24 25 Time [min]
��� !"#$%&
�� !"#$(QuantAnalysis)�� !"
�� !" #$%�� !"#$%&'(
�� � �� !�� /�� !"#$%
� �� !"#$%&'()*+,-.��
�� !" #$%�&'�� !"#$%
�� !"#$%�� !"#$%&'(�
�� !"#$%&'�� !"#$%&'
�� !"#$%&�� !"#$%&'(
�� �� !"#$%&'()�� !"
�� !"#$%�� �� !"#$%&
�� !"#$%&'()*+,-./0
�� !"#
�� !"#$%&'"#(�)*+,-.
�� !"#$%�� MS/MS �� !"
�� !"#$%�� !"#$%&'()
�� !"�� !"#$%&'()LC/MSD
�� !"(QuantAnalysis)�� !"#$ (��), �� /�� (�� )�� !"(�� )�� !"#$% � �� !"#$%&'()*+,�-� !"#
Trap �� !"#$%&'()*+,-./
�� LC/MSD Trap �� !�� !"#$
�� �� !"#$%&'�� !"#$
��� !"#$%&
�� !"#$%
�� !"#$%&'()*+,-./0'
�� �!"#$%
�� !"#$%
Visual Basic�� !"#$%&'()*+
�� !"#$%�� !"#$%%&'()
�� !"#$%&'()*�� !"#$
�� !MS�� !"
�� MS�� !"#$%&�� !"#$O-�� !"#�� !
9
132 u�� !"�� !"
MS�� !"#$%
�� !"#$%&'()*!+,-./
Spectrum Mill �� !"#$%&'()�
�� !"#$%&'()*+,%-./0
�� !"#$%&'()*�� !"#$
�� !"#$%&'()*$%+���
�� !"#�� !"#$%&'()*+
�� !"#$%&'()*+,-
Spectrum Mill MS�� !"#$%&'(
�� �� !"#$%&'()*+��
� MS/MS�� !MS/MS�� !
� MS�� !"#$%&�(PMF)
�� MS/MS�� !"#$%&'()*
�� !"�� !"#$%&'()*&+
�� !"#$%&�� !"#$%&'(
�� !"#$%�� !"#$%&'()
�� !"
10
�� MS�� !"#$%��&'�� !"#�� !�� !"#$%&'()*
�� !"#$%&'()
�� !"#$% (Advanced Chemistry
Development)� ACD/SpecManager��
�� MS�� !"#$%&'()MS��
�(MS Processor)�� !"#$%&'(�
��
��� !"#(CODA)�� !"#$%&'
�� !"#$%&
� ChemSketch, �� !"#$%&'()*
��� !"#$%&
��� !"#$%&'(%&)�� !"#
��
��� !"#$MS�� �� !"#MS�
�� !"#
�� !(SpecManager)�� !"#$%&
�(�� NMR, �� , �� -�� !"#$
�� )�� �� !"#$%&'()*+
�� !"#$%&'(
�� MS�� !"#$%&
�� ! Spectrum Mill MS�� !"#$
�� !"#$%&'(%)*+��,-.
�� !"�� !"#$%&'()*+,
�� !"#$Spectrum Mill�� !"#$
��
��� !"#$%&'()
��� !"# De novo��
��� !"#$%&'
��� !��"#
��� !"#$%&'#
�� !"#$%&'()*+,-./01
�� !"#$%&'(
�� !�"#$%
Spectrum Mill�� !"#$%&'( )*
�� !"#$"%&'()*+,-./�
�� !"#$%&'()*+,-�� !
�� MS/MS�� !"#$�� !"#$
�� !"#$%&'&()*+,-./0
De novo�� !"#$%&'()*+,-.
�� !"#
De novo�� !"#$%&'()*+,-
�� !"�#!$%�� !"#$%&'
���� !"#$%&'()*�� !"
�� !"
�� �!"#
Spectrum Mill�� !"#$%&'()*+
�� !"#$%�&'()*+,-.��
�� !"�� !"#$%�� !"#$
�� 2� 5�� !"�� !"#$%&'
��Spectrum Mill�� !"#$%&'(
ICAT��
�� !"#$%&'()*+MS/MS�� !"#$%&
�� � �� !"#$%&'()*+,-. � �� !"#$%&'()*
�� !"#$%&
�� !"#$%&'Spectrum Mill�� !
�� !"#$%&'()*+,-./0-
���� !"#$%&'()*�� !"
�� !"�� !"#$%&'()*+,-
�� !"#$%&''()
�� !"#$%&'(
�� !"#$%&'(�� Spectrum Mill
MS�� !�� !�� !"#$%&'
���� !"#
� .RAW (Thermo Finnigan)
� .wiff (SCIEX LC/MS)
� .pkl (�� )�� !"#$% .pkl (Waters/
Micromass �� )
11
�� !
�� ��
VL 25 pg �� ≥ 25:1SL 5 pg �� ≥ 25:1XCT 1 pg �� ≥ 50:1
MS ��
�� ��
VL 2 (MS/MS) 3SL 5 11XCT 5 11
�� !" (�� !)
�� !"#$%&'()*+,-.-/012��0.2 u��� !"#$%ICC�� !
�� !�� !"#$%!&'()*+
�� !"# (�� !)
�� !"#$%&'()*+,-./0128�� !"#$%��0.2 u���� ICC �
�� !"#$�� !"#$%!&'()*+�� 21�� 3��
�� !"#$%&' (�� !)
�� !"#$(m/z 50 - 2200)�� !"#$%&'()*+,�� 21��3��
�� !
LC/MSD Trap VL&SL LC/MSD Trap XCT�� ! �� �� ! �� �� !
(m/z) (FWHM) (u/s) (FWHM) (u/s)
�� 50-2200 ≤ 0.60 u 13,000 ≤ 0.60 u 26,000�� 50-2200 ≤ 0.45 u 5,500 ≤ 0.35 u 8,100�� 50-2200 ≤ 0.30 u 1,650 ≤ 0.25 u 800�� 200-4000 3-4 27,000 ≤ 3 u 27,000
�� !
VL 2 � SL 0.5 � XCT 0.5 �
��
�� :�� � ZORBAX�� !SB-C18 2.1x30 mm 3.5 µm�� � 25% � 75% �� � 5 mM�� �� � 400 µl/min�� � �� MS/MSMS/MS � �� !�"�(m/z 609)�� !"#$%&'()('*+��� !"# � m/z 175 - 650�� ! � �� (m/z 50 - 2200)�� � ��(0.6 u)
�� !"#
�� !"#Agilent 1100��LC/MSD Trap
�� !"#$%&'()*�� !"#$:
800-820-3278�� !"#$%&'()&*
�� !"#$%&'()*+,-./012
�� !"#$%&'(():
www.agilent.com/chem
Agilent 1100�� LC/MSD Trap�� !"
�� !"# ISO 9001�� !"#$%
�� !"#$%&�� !"#$%&'()�� !
��
©�� !"#$%&'()20032003 � 10� 31�� !"5988-3620CHCN