Módulo I.I – Biologia Molecular e Celular

CARDIOMIOPATIA HIPERTRÓFICA

Margarida Fernandes

Brandon Allan Carolina Medo

João Faria Daniel Carvalho2013/2014

Heterogeneidade génica Descrição da doençaManifestações clínicasHereditariedadeDiagnósticoMappingTratamentosDados populacionaisPateogénese

1. A) QUE INFORMAÇÕES SOBRE HCM SE PODEM OBTER NESTA BASE DE DADOS (OMIM OU GENETESTS)?

O QUE É UM SARCÓMERO?

Autossómica Recessiva.

1. c) Que gene ou genes se associam à doença e qual é a sua localização genómica?

21 genes, entre os quais TNNT2.

1. b) Que tipo de hereditariedade se associa a esta doença?

Proteína Gene LOCUS

Cadeia pesada β - miosina

MYH7 14q12

Proteína C que liga à miosina

MYBPC3 11p11.2

Troponina T cardíaca

TNNT2 1q32

Troponina I cardíaca TNNI3 19q13.4α-Tropomiosina TPM1 15q22.1Cadeia leve miosina reguladora

MYL2 12q24.11

Teletonina TCAP 17q12Troponina C TNNC1 3p21.1Titina TTN 2q31α2-Actina ACTN2 1q43Cadeia leve miosina essencial

MYL3 3p21.2-p21.3

α-Actina ACTC1 15q11-q14Cisteína e Glicina tipo 3

CSRP3 11p15.1

Cadeia pesada da α-miosina

MYH6 14q12

CONTINUAÇÃO 1.C)

1.B) QUE

PROTEÍNAS SÃO

CODIFICADAS POR ESTE OU

ESTES GENES?

Proteína Gene LOCUS

F actin binging protein

CMH20 1p31.1

Calreticulin 3 CALR3 19p13.11

Phospholamban PLN 6q22.31

Junctophilin 2 JPH2 20q13.12

Myozenin 2 MYOZ2 4q26

Vinculin CMH15 10Q22.2

2. RELATIVAMENTE AO GENE ASSOCIADO À DOENÇA EM ESTUDO (CONSIDERAR O GENE TNNT2 NA HCM), PROCURE-O NUMA BASE DE DADOS DE SEQUÊNCIAS GENÓMICAS, ENSEMBL OU NCBI.

2.1. EM QUE CROMOSSOMA ESTÁ ESTE GENE LOCALIZADO, NO GENOMA HUMANO?

2.2. EM QUE ESPÉCIES EXISTEM ORTÓLOGOS DO GENE SELECIONADO ?

55 espécies diferente

s

2.3. Quantos exões/intrões tem?

Este gene contém 16 exões e 15 intrões.

2.3.1. Qual é a estrutura deste gene?

TnC

Ião cálcio

TnT

TnI

2.4. Quantos transcritos alternativos estão descritos para o gene no genoma humano? Em que diferem estes transcritos?

12

3) PROCURE EM BASES DE DADOS (OMIM) AS MUTAÇÕES DO GENE SELECIONADO QUE

SÃO ASSOCIADAS COM FENÓTIPOS PATOLÓGICOS

QUE TIPOS DE MUTAÇÕES ESTÃO IDENTIFICADAS?

Mutações no gene TNNT2:•6 mutações cardiomiopatia dilatada•31 mutações cardiomiopatia hipertrófica•1 variante de efeito desconhecido•5 polimorfismos

EM QUE REGIÕES DO GENE SE LOCALIZAM ESSAS MUTAÇÕES?

4. CONSULTE UMA BASE DE DADOS DE PROTEÍNAS, UNIPROTKB

OU SWISS-PROT/EXPASY. PROCURE A INFORMAÇÃO RELATIVA À PROTEÍNA

CODIFICADA PELO GENE EM ESTUDO.

4.1. A PROTEÍNA CODIFICADA TEM DOMÍNIOS FUNCIONAIS DESCRITOS?

4.2.AS MUTAÇÕES ASSOCIADAS À DOENÇA EM ESTUDO LOCALIZAM-SE EM

ALGUM DOMÍNIO FUNCIONAL RECONHECIDO DA PROTEÍNA?

From:Circ Cardiovasc, Genet.Author manuscript; available in PMC 2010 AugustPublished in final edited form as:Circ Cardiovasc Genet. 2009 August; 2(4): 306–313.Published online 2009 May 15. doi: 10.1161/CIRCGENETICS.108.846733

4.1. A proteína codificada tem domínios funcionais descritos?

5. ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL DA TNNT2

5.EXISTE ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL DESCRITA PARA O PRODUTO DO GENE ?

Troponin C

Troponina I

Troponin T

Ião Cálcio

O arranjo tridimensional por vezes corresponde à estrutura que confere à

proteína uma função biológica específica

5. IMPORTÂNCIA DO CONHECIMENTO DE UMA ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL

6. INTERACTOMA DA PROTEÍNA CODIFICADA PELO GENE ASSOCIADO À DOENÇA

As proteínas que acabou de identificar

têm alguma associação com a

patologia?

6. COM QUE PROTEÍNAS INTERAGE?

6. A REDE DE INTERAÇÕES DETERMINADA ESTÁ CONSERVADA EM OUTROS ORGANISMOS

6. A REDE DE INTERAÇÕES DETERMINADA ESTÁ CONSERVADA EM OUTROS ORGANISMOS

FIM