1
EVALUACIÓN DIAGNÓSTICA DE LA CASUÍSTICA DE ENFERMEDADES AVIARES
EN TRES LABORATORIOS DEL ICA EN EL PERIODO 2009 - 2011
ALEXANDER SOTO PATARROYO
Trabajo de Investigación para optar al Título de Magíster en Ciencias Pecuarias
con Énfasis en Avicultura
Director
NÉSTOR ALFONSO MOSSOS CAMPOS
Phd. En Microbiología Aviar
Codirector
DIEGO ORTIZ ORTEGA
Phd. En Ciencias Salud Animal y Producción
UNIVERSIDAD DEL TOLIMA
FACULTAD DE MEDICINA VETERINARIA Y ZOOTECNIA
MAESTRÍA EN CIENCIAS PECUARIAS
IBAGUÉ- TOLIMA
2013
2
3
RESUMEN
Con el objeto de sistematizar la información de la casuística aviar contenida en las
tablas de retención documental de los laboratorios de las ciudades de Ibagué, Tuluá y
Bogotá del Instituto Colombiano Agropecuario – ICA, se consolidó dicha información en
una base de datos en formato de hoja de cálculo electrónica y se sometió a procesos
de gestión masiva a través delos software estadísticos XLSTAT; Epidemiológico, EPI-
INFO y de mapeo y análisis de datos geoFiguras, DIVA-GIS. El análisis descriptivo de
la recopilación de información de la vigilancia pasiva arrojó información de frecuencias
y proporciones que indican la imperiosa necesidad de rediseñar y socializar el
diligenciamiento del Formulario Único de recepción de Muestras, haciendo estricta su
elaboración si se instaura el procedimiento virtual.
Los tipos de muestras que se envían al laboratorio son la base para el diagnóstico
concluyente de los casos, por lo tanto la socialización de los protocolos de recolección
y envío debe garantizar que estas lleguen en óptimas condiciones para el sometimiento
a las pruebas. La información recopilada por los laboratorios es muy valiosa y puede
ser procesada fácilmente con potentes sistemas de análisis que permitirían, como lo
sugieren los resultados del presente estudio, el apoyo en la toma de decisiones en
programas de control de las enfermedades de las aves y servir como modelo para las
actividades con otras especies de interés zootécnico.
Palabras Claves: Casuística, epidemiología, vigilancia pasiva.
4
ABSTRACT
In order to systematize all the information collected on the poultry diagnosis kept on
tables of documental retention from the laboratories of the Instituto Colombiano
Agropecuario – ICA, from Ibagué, Tuluá and Bogotá, the information was consolidated
on a electronic data base and in a worksheet format and subjected to mass
management processes of through the statistic software XLSTAT, Epidemiologic; EPI-
INFO, mapping and geographical data analysis, DIVA-GIS. The descriptive analysis of
the collected information yielded the frequencies and the proportions on the passive
surveillance systems that indicate an urgent need to redesign construct and socialize a
new data collection format to replace the Single Form of the Sample Reception
Construction of this tool is necessary to launch the online data filing processing system.
The types of samples that are sent to the laboratories are the most important clue for a
conclusive diagnosis of the cases, hence socializing of the delivery collection protocols
should ensure that they reach optimal conditions to be submitted to analyze. The
information collected by the laboratories is very valuable and can be processed easily
with powerful analysis systems that would allow, as the results of the present study
suggests, the support needed for a of decision´s making in the control programs of
poultry diseases and could be a useful model to be followed with other animal species
of commercial interest.
Key Words: Casuistry, Epidemiology, Passive Surveillance.
5
CONTENIDO
Pág.
INTRODUCCIÓN
15
1. MARCO TEÓRICO 17
1.1 ANTECEDENTES 21
1.2 TÉCNICAS DIAGNOSTICAS DE LABORATORIO 23
1.3 HISTOPATOLOGÍA 27
1.4 CULTIVOS BACTERIOLÓGICOS 28
1.5 ENFERMEDADES AVIARES DE CONTROL OFICIAL COLOMBIANO 28
1.5.1 Newcastle– Enc. 28
1.5.2 Influenza Aviar – I.A. 33
1.5.3 Salmonelosis
37
2. MATERIALES Y MÉTODOS
41
3. RESULTADOS Y DISCUSIÓN. 43
3.1 ESTADÍSTICA DESCRIPTIVA 43
3.1.1 Recepción de casos 43
3.1.2 Fecha de Ingreso 44
3.1.3 Identificación de usuarios 45
3.1.4 Ubicación geográfica 47
3.1.5 Motivo de solicitud 48
3.1.6 Tipo de explotación avícola 50
3.1.7 Síntomas. 51
3.1.8 Necropsias 54
3.1.9 Diagnóstico Presuntivo 56
3.1.10 Vacunas 62
6
Pág.
3.1.11 Muestras 68
3.1.12 Sexo y edad de las muestras. 70
3.1.13 Sueros 70
3.2 TEJIDOS 74
3.3 POLLITO 79
3.4 HISOPO CLOACAL. 81
3.5 HISOPO TRAQUEAL 85
3.6 AVE 92
3.7 HECES 96
3.8 LABORATORIO DE ENVÍO 98
3.9 TRATAMIENTO 99
3.10 POBLACIÓN 99
3.11 PRUEBAS DE LABORATORIO 100
3.12 NEWCASTLE –ENC 101
3.13 BRONQUITIS INFECCIOSA AVIAR – IBV 102
3.14 LARINGOTRAQUEITIS INFECCIOSA AVIAR – ILT 103
3.15 GUMBORO – BURSITIS INFECCIOSA AVIAR – IBD 104
3.16 INFLUENZA AVIAR – IA 105
3.17 MYCOPLASMA 108
3.18 SALMONELLA 109
3.19 PASTEURELLA 111
3.20 AEMOPHILUS GALLINARUM – CORIZA 112
3.21 E. COLI 113
3.22 ASPERGILLUS 115
3.23 ANTIBIOGRAMA 116
3.24 PARASITOLOGÍA 117
3.25 HISTOPATOLOGÍA 118
3.26 ESTADÍSTICA ANALÍTICA 120
3.27 NEWCASTLE – ENC 121
7
Pág.
3.28 BRONQUITIS INFECCIOSA - IBV 127
3.29 GUMBORO 129
3.30 LARINGOTRAQUEITIS INFECCIOSA – ILT
131
4. CONCLUSIONES Y RECOMENDACIONES
145
REFERENCIAS
149
ANEXOS 157
8
LISTA DE TABLAS
Pág.
Tabla 1. Relación del ingreso de casos a los LNDV- ICA 43
Tabla 2. Descripción del ingreso de casos por trimestre a los LND – ICA. 44
Tabla 3. Identificación del tipo de usuarios de los LDV – ICA. 45
Tabla 4. Relación de los departamentos de origen de los casos. 47
Tabla 5. Descripción del motivo de solicitud. 49
Tabla 6. Tipos de explotación que hicieron uso de los LDV – ICA. 50
Tabla 7. Presencia de síntomas de los casos recibidos en los LND – ICA. 51
Tabla 8. Presencia de síntomas por tipo de sistema afectado. 52
Tabla 9. Combinaciones de sintomatología por sistemas. 53
Tabla 10. Realización de necropsias en los casos enviados a los LDV – ICA. 55
Tabla 11. Presencia de lesiones por sistema afectado. 56
Tabla 12. Diagnósticos presuntivos de los casos recibidos en los LDV – ICA. 57
Tabla 13. Reporte de ENC como diagnóstico presuntivo. 61
Tabla 14. Aplicación de vacunas en explotación de engorde. 63
Tabla 15. Descripción del tipo de vacuna para la explotación postura en etapa
de levante.
64
Tabla 16. Descripción del tipo de vacuna para la explotación Postura en
etapa de producción.
65
Tabla 17. Aplicación de vacunas en explotación de reproductoras. 66
Tabla 18. Descripción del tipo de vacuna para el traspatio. 67
Tabla 19. Descripción del tipo de vacuna para otras especies. 67
Tabla 20. Combinaciones de los tipos de muestras enviadas a los LDV – ICA. 68
Tabla 21. Relación del sexo en las muestras de suero sanguíneo. 70
Tabla 22. Descripción de edades en las muestras de sueros. 71
Tabla 23. Intervalos para la edad en días del suero sanguíneo. 73
Tabla 24. Intervalos para la edad en semanas del suero sanguíneo. 74
9
Pág.
Tabla 25. Relación del sexo en las muestras de tejidos. 74
Tabla 26. Descripción de edades en las muestras de sueros. 75
Tabla 27. Intervalos para la edad en días de tejidos. 77
Tabla 28. Intervalos para la edad en semanas de tejidos. 77
Tabla 29. Descripción de edades en las muestras de tejidos. 78
Tabla 30. Relación del sexo en las muestras de pollitos. 79
Tabla 31. Descripción de edades en las muestras de pollito. 80
Tabla 32. Intervalos para la edad en días de pollitos. 80
Tabla 33. Relación del sexo en las muestras de hisopo cloacal. 82
Tabla 34. Descripción de edades en las muestras de hisopos cloacales. 82
Tabla 35. Intervalos para la edad en días de hisopo cloacal. 84
Tabla 36. Descripción de edades en las muestras de hisopos cloacales. 84
Tabla 37. Relación del sexo en las muestras de hisopo traqueal. 85
Tabla 38. Descripción de edades en las muestras de hisopos traqueales. 86
Tabla 39. Intervalos para la edad en semanas de hisopo traqueal. 86
Tabla 40. Descripción de edades en las muestras de hisopos cloacales. 87
Tabla 41. Relación del sexo en las muestras de ave. 89
Tabla 42. Descripción de edades en las muestras de ave. 89
Tabla 43. Intervalos para la edad en días de ave. 91
Tabla 44. Intervalos para la edad en semanas de ave. 91
Tabla 45. Relación del sexo en las muestras de heces. 92
Tabla 46. Descripción de edades en las muestras de heces. 93
Tabla 47. Intervalos para la edad en semanas para heces. 94
Tabla 48. Descripción de edades en las muestras de heces. 95
Tabla 49. Participación de los departamentos en el ingreso de casos a los
LDV – ICA.
96
Tabla 50. Implementación de tratamientos. 98
Tabla 51. Reporte de población total de los lugares de procedencia. 99
Tabla 52. Intervalos de la población total. 100
10
Pág.
Tabla 53. Laboratorios y pruebas realizadas para ENC. 101
Tabla 54. Resultados de las pruebas realizadas para ENC. 102
Tabla 55. Laboratorios y pruebas realizadas para IBV. 103
Tabla 56. Resultados de las pruebas realizadas para IBV. 103
Tabla 57. Laboratorios y pruebas realizadas para ILT. 104
Tabla 58. Resultados de las pruebas realizadas para ILT. 105
Tabla 59. Laboratorios y pruebas realizadas para Gumboro. 106
Tabla 60. Resultados de las pruebas realizadas para Gumboro. 106
Tabla 61. Laboratorios y pruebas realizadas para Influenza. 107
Tabla 62. Resultados de las pruebas realizadas para Influenza. 107
Tabla 63. Laboratorios y pruebas realizadas para Micoplasma. 108
Tabla 64. Resultados de las pruebas realizadas para Micoplasma. 109
Tabla 65. Laboratorios y pruebas realizadas para Salmonella. 110
Tabla 66. Resultados de las pruebas realizadas para Salmonella. 110
Tabla 67. Laboratorios y pruebas realizadas para Pasteurella. 111
Tabla 68. Resultados de las pruebas realizadas para Pasteurella. 112
Tabla 69. Laboratorios y pruebas realizadas para Haemophilus. 112
Tabla 70. Resultados de las pruebas realizadas para Haemophilus. 113
Tabla 71. Laboratorios y pruebas realizadas para E. Coli. 114
Tabla 72. Resultados de las pruebas realizadas para E. Coli. 114
Tabla 73. Laboratorios y pruebas realizadas paraAspergillus. 115
Tabla 74. Resultados de las pruebas realizadas para Aspergillus. 116
Tabla 75. Relación de antibiogramas realizados en los LDV – ICA. 116
Tabla 76. Laboratorios y pruebas realizadas para parasitología. 117
Tabla 77. Resultados de las pruebas realizadas para parasitología. 118
Tabla 78. Realización de estudios de histopatología. 119
Tabla 79. Resumen de valores de las tablas de contingencia para virología
ENC
121
11
Pág.
Tabla 80. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a
las pruebas virológicas para ENC en función de sus resultados
122
Tabla 81. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a
las pruebas virológicas para ENC en función de sus resultados excluyendo el
suero
123
Tabla 82. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas
Moleculares ENC
124
Tabla 83. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a
las pruebas moleculares para ENC en función de sus resultados
125
Tabla 84. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas
Serológicas ENC
126
Tabla 85. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a
las pruebas serológicas para ENC en función de sus resultados.
126
Tabla 86. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas
Moleculares IBV
127
Tabla 87. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas
Serológicas IBV
128
Tabla 88. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a
las pruebas serológicos para IBV en función de sus resultados
129
Tabla 89.Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas
Moleculares Gumboro
130
Tabla 90. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas
Moleculares Gumboro
130
Tabla 91.Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas
Virológicas ILT.
131
Tabla 92. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas
Moleculares ILT.
132
Tabla 93. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas
Serológicas ILT
132
12
Pág.
Tabla 94. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a
las pruebas serológicos para ILT en función de sus resultados.
133
Tabla 95. Resumen de valores de las tablas de contingencia para cultivo
bacteriológico de Salmonella
134
Tabla 96. Resumen de valores de las tablas de contingencia para cultivo
bacteriológico de Salmonella
134
13
LISTA DE FIGURAS
Pág.
Figura 1. Proceso diagnóstico de la enfermedad de Newcastle en LNDV 30
Figura 2. Diagnósticos presuntivos de los casos recibidos en los LDV – ICA 60
Figura 3. Porcentaje de aplicación de vacunas para la explotación de
engorde.
62
Figura 4. Distribución de la edad en semanas días para el suero sanguíneo 72
Figura 5. Distribución de la edad en para el suero sanguíneo 73
Figura 6. Distribución de la edad en semanas días para tejidos. 76
Figura 7. Distribución de la edad en semanas para tejidos 76
Figura 8. Distribución de la edad en semanas para tejidos. 78
Figura 9. Distribución de la edad en semanas para pollito. 81
Figura 10. Distribución de la edad en semanas días para hisopo cloacal 83
Figura 11. Distribución de la edad en para hisopo cloacal. 83
Figura 12. Distribución de la edad en semanas para hisopo cloacal 85
Figura 13. Distribución de la edad en días para hisopo traqueal. 87
Figura 14. Distribución de la edad en semanas para hisopo traqueal 88
Figura 15. Distribución de la edad en días para ave 90
Figura 16. Distribución de la edad en semanas para ave. 90
Figura 17. Distribución de la edad en días para heces. 93
Figura 18. Distribución de la edad en semanas para heces. 94
Figura 19. Distribución de la edad en semanas para heces. 95
Figura 20. Porcentaje de muestras procesadas por LDV – ICA. 97
Figura 21. Distribución de la población total de aves. 99
Figura 22. Lesiones encontradas en la histopatología. 119
Figura 23. Distribución de los Resultados positivos a ENC en las pruebas de
virología, moleculares y serológicas
135
14
Pág.
Figura 24. Distribución de los Resultados positivos a IBV en las pruebas
moleculares y serológicas.
136
Figura 25. Distribución de los Resultados positivos a ILT en las pruebas de
virología, moleculares y serológicas.
137
Figura 26. Distribución de los Resultados positivos a Gumboro en las pruebas
moleculares y serológicas.
138
Figura 27. Distribución de los resultados positivos al cultivo bacteriológico de
Salmonella.
139
Figura 28. Distribución de los resultados positivos al cultivo bacteriológico de
E. Coli.
140
Figura 29. Predicción del riesgo a ENC por pruebas virológicas. 142
Figura 30. Predicción del riesgo a ENC por pruebas moleculares. 143
Figura 31. Predicción del riesgo a ENC por pruebas serológicas. 144
15
INTRODUCCIÓN
El gobierno nacional reestructuró el Instituto Colombiano Agropecuario - ICA en 1994 y
desde entonces le adjudicó la responsabilidad exclusiva de conservar la sanidad animal
y vegetal entre otras funciones específicas Olarte, (2009) como producto de dicha
reestructuración el sistema de información y vigilancia epidemiológica aviar del ICA ha
compartido con las demás especies animales dos subsistemas generales: la vigilancia
epidemiológica activa que se encarga de buscar la presencia o no de enfermedades
declaradas de control oficial a través de muestreo programado y la vigilancia
epidemiológica pasiva que realiza acciones de control de una problemática sanitaria a
través de la notificación de signos clínicos.
Este documento muestra un análisis de los datos epidemiológicos obtenidos durante el
ingreso de muestras para diagnóstico de enfermedades aviares en tres de los
Laboratorios de Diagnóstico Veterinario (LDV) del ICA, que incluyeron los Laboratorios
de Bogotá, Tuluá e Ibagué. Los datos fueron extraídos de los Formularios Únicos de
Recepción de Muestras (FURM) o forma 3-877 (Anexo A).
El ICA cuenta con 25 laboratorios de diagnóstico veterinario, procesa muestras para el
diagnóstico de diversas enfermedades y presta dicho servicio a la comunidad. Aunque
los programas de vigilancia del ICA son coordinados por parte de la oficina de
epidemiologia, el gran volumen de información obtenida a través de la vigilancia pasiva
requiere mayor atención en su análisis y es de gran importancia para obtener índices
del comportamiento de las enfermedades y así establecer un punto de partida que
permita conocer el estado sanitario de las aves y establecer posibles inferencias del
orden nacional. Todo dirigido al establecimiento de nuevas estrategias de control de las
enfermedades de importancia zootécnica y/o de interés público.
A través del procesamiento de datos masivos depositados en bases de datos creadas
en hojas de cálculo por software específico, se obtuvieron resultados de tipo
16
descriptivo, analítico y de mapeo o distribución geográfica. Así, se presentan las cifras
epidemiológicas básicas y se intenta revelar posibles asociaciones entre variables
como el Tipo de Muestra y el Tipo de enfermedad. En esta última categoría fueron
escogidas las variables Newcastle, Bronquitis infecciosa, Laringotraqueitis, Gumboro,
Salmonella y E. Coli.
En varios de los procesos del análisis fue necesario filtrar la base de datos para
obtener datos más confiables para el procesamiento. Se encontró que en el
diligenciamiento del FURM hay ausencia de una gran cantidad de datos valiosos,
necesarios para alimentar el software y para aumentar la significancia estadística en los
resultados de asociación y en la potencia de las conclusiones. Se concluye que la baja
captura de información por parte de los funcionarios en los ítems del formato reduce la
contundencia de los resultados, por lo tanto se sugiere rediseñar el FURM y capacitar a
los responsables del diligenciamiento pues este proceso es rutina laboral de los
laboratorios lo cual constituye el pilar fundamental para dar respuesta a hipótesis o
preguntas científicas y sustentar programas de control sanitario a todo nivel.
17
1. MARCO TEÓRICO
El documento 3468 del Consejo Nacional de Política Económica y Social CONPES,
(2007) describe el panorama sanitario del sector avícola colombiano y deja en
perspectiva la necesidad de conocer el estado real de las enfermedades con o sin
control oficial y el presupuesto con el cual se debe intervenir la cadena avícola. Todos
los gremios vinculados al desarrollo de la avicultura buscan mejores parámetros
sanitarios que permitan proyectar la industria hacia nuevos mercados en el marco de
una estrategia global para el abastecimiento de alimento para la población humana.
Estos parámetros no han sido publicados en algún estudio que indique la verdadera
situación sanitaria aviar del país respecto a los agentes patógenos en general o la
identificación de los factores de riesgo y sus posibles asociaciones con la presencia de
enfermedad, por lo tanto, la cuantificación y priorización permitiría generar estrategias
más efectivas para prevenir o mitigar la presencia de las enfermedades aviares.
La vigilancia y control epidemiológico de las enfermedades aviares por parte del ICA ha
combinado coherentemente planificación y ejecución con recursos financieros
limitados. La meta, lograr los objetivos institucionales en las fechas establecidas
Congreso de la Republica, (2008) obteniendo puntos de referencia con datos confiables
que permitan formular las estrategias efectivas para conseguirlos.
La toma de decisiones para elaborar o re-direccionar los programas de salud animal de
índole nacional debe basarse en datos verídicos. El Plan Estratégico para el Nuevo ICA
2007 – 2012 sugiere en el proyecto 1.1, integrar los LNDV con el sistema de Medidas
Sanitarias y Fitosanitarias para apoyar los programas sanitarios y el comercio
internacional.
En la Resolución 1762 de 15 de Junio de 2012 Instituto Colombiano Agropecuario,
(2012), se fija el plazo para que todos los laboratorios de diagnóstico veterinario
particulares en el país se registren ante el ICA. Con los datos que ellos aporten
18
Resolución 1599, Parágrafo del Artículo 15 se enriquecerá la base de datos para
establecer un perfil de la realidad sanitaria animal colombiana. Una vez procesados y
obtenidas las frecuencias y otros parámetros, se podrán diseñar mapas
epidemiológicos dinámicos e identificar cuáles son los agentes patógenos que afectan
por zonas la distribución pecuaria nacional y establecer posibles inferencias que
permitan un nuevo direccionamiento de las medidas de control de las enfermedades
que resulten de importancia zootécnica o de interés público.
En las resoluciones ICA, 1937 y 3655 se define la ejecución de los
proyectos de erradicación de la enfermedad de Newcastle (ENC) e
incluyen la vigilancia activa para la prevención de la aparición de la
Influenza aviar (IA) y preservar el estatus sanitario de país libre. La
Enfermedad de Newcastle aparece en la lista de la OIE para ser
reportada en su presentación de alta patogenicidad y su diagnóstico es
óptimo (Perozo, 2008, p. 161).
En Colombia se han diagnosticado otras enfermedades aviares de gran impacto
económico como Salmonelosis, Bronquitis Infecciosa, Neumovirus, y Micoplasma.
Reportes de la presencia de Laringotraqueitis Infecciosa en el Valle de Cauca Villate, et
al., (1971) en la década del setenta no ha tenido seguimiento, al menos publicado,
encontrando resultados de laboratorio positivos arrojados por el LNDV del ICA.
Todos los países en América Latina tienen en sus organigramas estatales una entidad
encargada de la sanidad animal, responsable de fijar políticas referentes a vencer las
barreras sanitarias reguladas por la OIE y la Organización mundial del Comercio- OMS
para en última instancia, fortalecer el mercadeo de productos de origen animal. En el
Brasil esta entidad hace parte del Ministerio de Agricultura, Pecuaria y Abastecimiento -
MAPA. Allí se ha elaborado un manual de legislación muy completo en el cual se
fundamenta el programa nacional de salud animal en detalladas normas técnicas de
vigilancia para las enfermedades de Newcastle e Influenza Aviar. Es una impecable
guía digna de emular en los países latinoamericanos teniendo en cuenta los resultados
19
recientes de la industria avícola brasilera que coloca a este país como el primer
exportador mundial de aves comerciales de consumo. Mapa, (2009). Aunque cuenta
con los Laboratorios Nacionales Agropecuarios – LANAGROS, se apoya en una red de
laboratorios de diagnóstico conformada por entidades privadas acreditadas para
realizar pruebas específicas que cada uno de ellos certifica ante el MAPA y son
responsables de expedir resultados oficiales. En el año 2003 este país fue declarado
libre del virus de la enfermedad de Newcastle velogénico en granjas comerciales. Entre
los años 2003 y 2005 se realizó un estudio para verificar el estatus adquirido
determinando el muestreo (por región) utilizando la fórmula:
[ ( )
] ⌈
⌉
Donde C, es el grado de confianza, M es el número de aves (en condición
de riesgo), N es el número de animales infectados y SENS es el grado de
sensibilidad de la prueba escogida que para este estudio fue un kit de
ELISA comercial. Con esta fórmula, los mismos investigadores concluyen
en otro estudio paralelo que determinar la prevalencia de la enfermedad
(entre tres regiones avícolas evaluadas) está condicionado por la
densidad animal, la proximidad de aves de otras especies y sistemas de
producción de escasa bioseguridad. (Orsi & col, 2010, p. 41).
El Servicio Nacional de Sanidad Agraria- SENASA es la oficina del Ministerio de
Agricultura en el Perú, encargada de controlar y difundir la política del sector. En su
página web detallan el sistema de vigilancia epidemiológica donde como estrategia,
habilitan una línea telefónica gratuita para la notificación (vigilancia pasiva) de las
enfermedades y enfocan sus esfuerzos en el control de la movilización de los animales.
Senasa, (2012). Sin embargo, dado el gran número de enfermedades de notificación
obligatoria (19 en aves) y un único laboratorio de diagnóstico, hace difícil la tarea para
garantizar resultados oportunos y por lo tanto un panorama real de su estatus
zoosanitario.
20
En Chile, la enfermedad de Newcastle es considerada exótica según el
programa de vigilancia epidemiológica de ese país ejecutado por la
Secretaria Agrícola y Ganadera - SAG. Ministerio de Agricultura de Chile,
(2006). De su página web, se puede obtener un manual para el manejo
de las enfermedades aviares. El control vacunal para Newcastle es
sugerido pero están prohibidas la vacunas para la Influenza y se puede
observar el gran despliegue informativo para prevenir el ingreso de esta
enfermedad la cual tambien consideran exótica. La Salmonella y el
Micoplasma tienen un programa de control instaurado desde el año 2009
el cual divide en estratos (comercial y reproductoras), la inclusión e
identificación de patotipos definidos. En este país existe una estrategia de
recepción y registro de las muestras que ingresan, por organigrama, al
subdepartmento de laboratorios y estación de cuarentena pecuaria cuyo
objetivo es distribuirlas a las distintas unidades técnicas para su análisis,
asegurando la trazabilidad de la información. Esta dependencia genera
información valiosa para la división de proteción pecuaria. Estudios de
riesgo asociado al aumento de la prevalencia de la enfermedad de
Newcastle por la importacion de avestruces estuvieron apoyados en
pruebas de HI y ELISA para demostrar que los resultados de los análisis
por la sensibilidad de las pruebas, son bajos. El indice de confianza fue
estimado por la combinacion de las pruebas realizadas en distintas
etapas del proceso normal de la importacion de los animales. (Burbano,
Van Schaik, Erns, & Rojas, 2004, p.155)
Al ente ministerial en Mexico se le conoce con el nombre de Secretaría de
Agricultura, Ganaderia, Desarrollo Rural, Pesca y Alimentación –
SAGARPA. A esta dependencia del poder ejecutivo federal esta
subordinada la oficina del Sevicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y
Calidad Agroalimentaria – SENASICA. Las normas oficiales mejicanas
contemplan una amplia gama de procesos en la cadena de la industria
21
avícola, tales como la creación del Sistema de Vigilancia Epidemiológica
– SIVE, una dependencia de la Comisión México-Estados Unidos para la
prevención de la fiebre aftosa y otras enfermedades exóticas de los
animales (CPA), que ejecuta campañas contra las enfermedades
(Newcastle, Influenza y Salmonelosis en aves) y busca decalarar zonas
libres, integrar laboratorios en materia zoosanitaria y el transporte no sólo
de animales, sus productos y subproductos sino de los farmacos,
biológicos, quimicos y alimentos comprometidos en el proceso productivo.
(Sagarpa, 2008, p. 38).
Recientemente México ha puesto en marcha el Dispositivo Nacional de
Emergencia – DINESA para erradicar el brote de Influenza Aviar
diagnosticado del tipo AH7N3 en el estado de Jalisco Senasica, (2012).
Pruebas confirmatorias en 31 granjas predieron la alarma aun cuando
este patotipo no afecta la salud humana, el esfuerzo honesto es la mejor
herramienta para mostrar al mundo un compromiso de respuesta ante la
preocupante amenaza sustentada en la noticia lanzada por la OMS sobre
la creación de cinco mutaciones genéticas del virus AH5N1 en el Centro
Erasmus, Holanda. (Rivera, 2012). La detección temprana de
enfermedades exóticas para prevenir su establecimiento ha hecho la
diferencia para que no se vuelvan endémicas si se comparan los
resultados de USA, Chile, Japon, Corea del sur y Malasia con los de
Vietnam, China e Indonesia. (Jimenez, 2007, p.1)
1.1 ANTECEDENTES
Motivados por identificar los microorganismos y los mecanismos que tienen para
causar trastornos en el equilibrio fisiológico de las especies que atacan, se han
desarrollado técnicas de laboratorio con protocolos estandarizados para su diagnóstico.
22
En 1676 el comerciante holandés Leeuwanhoeck, observó a través de sus
lentespulidos pequeñas estructuras que podían moverse y las llamó animálculos.
Desde esa época, pasando por Pasteur, Koch, Rayer, Hesse y Petri, muchos son los
avances hasta llegar al aislamiento de la penicilina en plena mitad del siglo XX a cargo
de Florey y Chang. Pruebas bioquímicas han sido aplicadas en forma de test a medios
biológicos para identificar directa o indirectamente la presencia de microorganismos
tras interpretar una determinada reacción que generalmente consiste en la activación
de una vía metabólica a partir del uso o no de un sustrato incorporado en el medio de
cultivo.
La primera referencia sobre la existencia de los virus se debe al botánico ruso
Ivanovski (1892). El término virus fue acuñado por el microbiólogo holandés Martinus
Beijerinck. En la década del 30 del siglo pasado, el uso de filtros de tamaño de poro
inferior y las técnicas de cultivo celular in vitro, permitió la obtención de gran variedad
de estos agentes. Con la ultra-centrifugación y finalmente con el microscopio
electrónico y la difracción de rayos X se logra por fin visualizar a los virus. La técnica
más revolucionaria en este campo ha sido sin duda la reacción en cadena de la
polimerasa conocida como PCR por sus siglas en inglés, desarrollada por Mullis (1986)
por la cual le fue otorgado el Nobel de química.
El avance en la identificación y manipulación de microorganismos de alta virulencia y
patogenicidad ha clasificado por bioseguridad los agentes biológicos en cuatro grupos
según su peligrosidad hacia el hombre y de esta manera está referido el nivel de
contención en los laboratorios. El LDV del ICA ubicado en Bogotá cuenta con la
asesoría del National Veterinary Laboratory Services (NVLS) de referencia de la OIE y
el Laboratorio de Virología Aviar de la Universidad de Liverpool para avalar su
categoría de nivel tres.
23
1.2 TÉCNICAS DIAGNOSTICAS DE LABORATORIO
HI = Inhibición de la Hemaglutinación.
El procedimiento de preparación de la prueba requiere de glóbulos rojos de cada
especie. Para ser válidos en las pruebas de la especie gallus gallus se deben obtener
de aves libres de patógenos criadas apropiadamente para este propósito. La muestra
de sangre total debe ser mezclada con anticoagulante luego centrifugada para
descartar el suero y lavar los eritrocitos con solución buffer tipo PBS.
La titulación se obtiene utilizando la fórmula:
= Volumen a tomar de Antígeno.
= Titulo en Unidades Hemaglutinantes
= Volumen a preparar
= Unidades Hemaglutinantes recomendadas por la OIE. El ICA utiliza 8 UH
Con esta titulación se establece que las muestras serológicas analizadas para la
vigilancia activa de Newcastle en Colombia no deben superar la dilución 128 para aves
vacunadas con cepas vivas y de 256 para aquellas vacunadas con oleosas.
Los eritrocitos son aglutinados por los anticuerpos en 2 etapas: En la primera el
anticuerpo se une físicamente al antígeno en los eritrocitos. Proceso denominado
sensibilización. La segunda etapa ocurre cuando los eritrocitos acoplados a los
anticuerpos, aglomeran en una estructura de enrejado que constituye la aglutinación.
En algunas reacciones antígeno-anticuerpo las 2 etapas ocurren casi simultáneamente,
mientras que en otras sólo ocurre la primera etapa de la reacción, es decir, hay
24
sensibilización de los eritrocitos por anticuerpos no aglutinantes. La asociación y
disociación del complejo antígeno-anticuerpo se rige por la ley de acción de masas,
esta es una reacción reversible: definida en la fórmula:
( )
( )
Dónde:
A= Antígeno
Ac = Anticuerpo
K = Constante de equilibrio o afinidad de la reacción
El valor K es directamente proporcional a la formación del complejo A-Ac
e inverso a la velocidad de disociación, Esta constante es afectada por las
concentraciones de A y Ac y por las condiciones físicas de las técnicas
utilizadas durante el desarrollo de la prueba, tales como; pH, temperatura,
fuerza iónica y tiempo de incubación. Se debe tener en cuenta que hay
factores que impiden que la segunda fase de la reacción de aglutinación
tales como; Las características del anticuerpo, localización y número de
sitios antigénicos, fuerzas que mantienen la distancia entre los eritrocitos,
uso de albúmina sérica bovina, uso de enzimas, efecto de dosis y efecto
de moléculas con carga positiva. (Valdés & Bencomo, 2001, p.18).
Con esta prueba se detecta ENC, IA, EDS y con la variante indirecta, BIH.
ELISA. El Ensayo por Inmunoabsorción Ligado a Enzimas por sus siglas en inglés,
es una prueba de alta precisión que combina la especificidad de los anticuerpos con
la sensibilidad enzimática. Los componentes de esta prueba son: El substrato, el
conjugado (Anti-Anticuerpo), la muestra y el cromógeno, quienes a través de un
protocolo estandarizado permite una reacción colorimétrica que es leída por un
25
software especialmente diseñado. Hay cuatro tipos o variantes según el objetivo a
revelar:
• Anticuerpos marcados:
- ELISA Directo
- ELISA Indirecto
- ELISA sándwich
ƒ Doble (DAS)
ƒ Heterólogo (HADAS)
• Antígenos marcados
- ELISA competitivo
Por tener la característica de ser altamente sensible y por lo tanto arrojar falsos
positivos es clasificada como prueba tamiz que debe ser confirmada con pruebas
específicas.
Los kits comerciales ofrecen gran variedad de reactivos para detectar una igual
variedad de agentes patógenos haciendo de esta prueba una de las más populares en
los laboratorios. Muy utilizada en la avicultura entre otras cosas para obtener las líneas
base de los lotes.
AGID. Siglas en inglés que traducen Inmunodifusión en Gel de Agar (Agarosa al
0.9%). Es una prueba catalogada como indirecta pues detecta los anticuerpos en los
sueros y las yemas de los huevos. Es un figurado múltiple en forma de roseta que
enfrenta tres sueros distintos con el antígeno ubicado en el centro. Esta prueba deja
en reaccionar 48 horas a temperatura ambiente y es considerada positiva cuando se
ve una barra o línea entre los dos orificios enfrentados. El lector de estas pruebas
debe ser un profesional experto y calificado para dar fallos. Es la prueba Gold
Estándar para IA.
26
PCR – Reacción en Cadena de la Polimerasa
Por sí sola no es una técnica de diagnóstico. Consiste en amplificar el material genético
a través de un aparato llamado termociclador que resume automáticamente lo que en
sus inicios era una técnica manual que sometía el material genético a cambios de
temperaturas y tiempos determinados para conformar un ciclo utilizando reactivos para
abrir las cadenas del ácido nucleico, alinear los cebadores en un punto específico y
polimerizar (copiar) el segmento. Este proceso se repite por muchos ciclos hasta
obtener la multiplicación suficiente de material que deberá ser identificado por un
método de secuenciación el cual permite conocer base a base el contenido genético de
un fragmento de ADN. Hasta ahora no se puede trabajar sobre ARN con esta técnica
por lo cual se debe aplicar una variante denominada Transcriptasa Reversa para
obtener ADN.
La variante denominada PCR en tiempo real se rotula como qPCR o qRT-PCR para
diferenciarla del convencional. El resultado de esta técnica es más rápido ya que
entrega una lectura realizada por un sensor de fluorescencia que mide la tasa de
generación de uno o más productos específicos tras cada ciclo de amplificación al
interpretar su longitud de onda.
Esta técnica ofrece una respuesta rápida de diagnóstico en la ruta crítica de vigilancia
pasiva para Newcastle identificando el virus a través de Gen de Matriz y el tipo cuando
se hace sobre el Gen de Fusión.
Aislamiento
Esta prueba intenta cultivar un virus vivo para identificarlo. Las muestras utilizadas
pueden ser hisopados de mucosas, macerado de tejidos, fómites, sueros o substrato
con material orgánico. Algunas muestras deben conservar los virus por lo tanto al
medio en el que se transporta se agrega un antibiótico de amplio espectro para eliminar
la competencia conservando la temperatura que debe estar entre 4 y 5 ºC. Luego de
27
centrifugar y microfiltrar se colecta el material. Una forma de asilar virus es utilizar
células blanco específicas donde el virus replica y se manifiesta. Otra es utilizar huevos
fértiles de 9 a 11 días que han sido seleccionados y marcados previamente con ayuda
del ovoscopio para inocularlos. La marca es el sitio donde se debe perforar para
alcanzar la cavidad alantoidea y tener la certeza de depositar el inóculo correctamente.
El orificio es tapado para continuar con el proceso de incubación a 37 ºC durante 6 días
más. Una revisión a las 24 horas determina la viabilidad de los embriones tras la
manipulación descartando las muertes. Se vuelve a revisar cada 24 horas y lo que se
encuentre con síntomas a partir de aquí se refrigera a 4 ºC para extraer el líquido
alantoideo. Una muestra de este líquido para HI puede detectar virus hemaglutinantes
que en avicultura son; ENC, IA y Metaneumovirus.
Esta es la prueba Gold Estándar para la ENC luego de tres pases lo cual suma 15
huevos por prueba de donde el material recolectado servirá para la prueba IPIC.
IPIC = Índice de Patogenicidad Intracerebral
Esta es una técnica invasiva donde se inocula dentro del cerebro el material del
aislamiento en pollos SPF recién nacidos para observar su evolución. Esta prueba es
recomendada por la OIE solo en casos cuyas circunstancias lo requieran. Para
clasificar el tipo de ENC se observa cada 24 horas la evolución de las aves inoculadas
de un día de nacidas y se determina que si no presenta sinología clínica equivale a
cero (0), si presenta es uno (1) y las muertas o agonizantes que deben ser sacrificadas
se puntúan con dos (2). Este proceso dura 8 días y se utilizan diez aves por prueba.
1.3 HISTOPATOLOGÍA
Es el estudio de muestras obtenidas generalmente de necropsias realizadas con o sin
reporte de lesiones. Esta prueba requiere de microscopios de luz compuesta y
soluciones de contraste o tinciones para los cortes de muestras previamente fijadas en
28
placas de vidrio. Esta técnica es una herramienta que sigue vigente a pesar del tiempo
debido principalmente a la rapidez del resultado y que puede emitir un diagnostico
concluyente cuando un agente patógeno se manifiesta particularmente y/o ha inducido
cambios específicos en las estructuras. Cuando las lesiones no son tan evidentes,
estos cambios histológicos observados sólo sugieren presencia de enfermedad.
1.4 CULTIVOS BACTERIOLÓGICOS
Para determinar un tipo de bacteria específica, se elabora una secuencia de cultivos
para todas aquellas que crecen en determinados tipos de medio y se van descartando
según el que colonicen. Generalmente las bacterias son agentes oportunistas
responsables de infecciones secundarias pero hay algunas como la Salmonella que
debe ser plenamente identificada. Por lo tanto el cultivo de este agente patógeno solo
es un paso poco relevante y no concluyente en el caso de las aves ya que son apenas
cuatro patotipos (entre más de dos mil), que presentan interés zootécnico y que deben
ser tipificados por otras técnicas que revelen su identidad.
1.5 ENFERMEDADES AVIARES DE CONTROL OFICIAL COLOMBIANO
1.5.1 Newcastle– Enc. La enfermedad de Newcastle es una enfermedad
contagiosa de distribución mundial que provoca pérdidas económicas en
aves domésticas de corral, especialmente en pollos. Los reportes
universales de la enfermedad son únicamente superados por la fiebre
aftosa Alzamora, (2007). Es causada por el paramixovirus serotipo 1
(APMV-1), que pertenece al género avulavirus de la familia de los
Paramyxoviridae, orden mononegavirales Mayo, (2002). Las cepas de
virus de Newcastle pueden ser clasificadas como altamente virulentas,
intermedias o no virulentas en función de su patogenicidad en las
pruebas con huevos fértiles o en pollos (Alexander, 2003; Asahara, 1978,
p.239).
29
El genoma del virus es una hebra simple de RNA de 15kb con sentido
negativo que contiene 6 genes en el orden 3’-NP-P-M-F-HN-L-5’ los
cuales codifican para 6 proteínas denominadas; nucleoproteína,
fosfoproteína, proteína de la matriz, proteína de fusión, proteína
hemaglutinina-neuraminidasa, proteína-polimerasa respectivamente
(Yussoff & Siang Tan, 2001).
Para que un aislamiento del virus de Newcastle sea considerado virulento
y calificar para ser notificada a la OIE, debe presentar; Índice de
patogenicidad intracerebral (IPIC) mayor a 0.7 la cual está íntimamente
relacionada entre otros factores, con la secuencia de aminoácidos del
sitio de clivaje de la glicoproteína F y al tamaño de la glicoproteína HN y/o
presentar múltiples aminoácidos básicos en el extremo C-terminal de la
proteína F2 y fenilalanina en el residuo 117, que es el extremo N-terminal
de la proteína F1 OIE, (2004). Con base en este criterio existen cepas no
virulentas como las del patotipo lentogénicas y virulentas donde se
incluyen las de los patotipos mesogénico y velogénico, pudiendo estas
últimas ser neurotrópicas o viscerotrópicas. El análisis filogenético de la
secuencia de F permite llevar a cabo los estudios de epidemiología
molecular, predicción del patotipo y genotipificación (Seal, 1995; Aldous,
2003; Wakamatsu, 2006). Estos patotipos surgen de la necesidad de
diferenciar las distintas formas clínicas de la enfermedad causadas por
cepas que son indistinguibles serológicamente (Perozo & Villegas, 2008).
El diagnóstico clínico de ENC es difícil de realizar aun presuntivamente,
sobre todo si es producida por cepas de virus que solo afectan el aparato
respiratorio, sin producir lesiones nerviosas y digestivas, Reynolds,
(1994), debe diferenciarse de otras enfermedades respiratorias como
Bronquitis Infecciosa y Laringotraqueitis. Sin embargo, los signos
característicos y las lesiones asociadas con los patotipos virulentos dará
lugar a la sospecha de la enfermedad Organización Mundial de la Salud,
30
(2004).El diagnóstico diferencial de la enfermedad de Newcastle
altamente patógena comprende otras causas de septicemia, enteritis,
afección respiratoria y/o signos neurológicos. En las aves de corral estas
enfermedades incluyen al cólera aviar, influenza aviar altamente
patógena, laringotraqueitis, la forma diftérica de la viruela aviar,
psitacosis, micoplasmosis, bronquitis infecciosa, aspergilosis, y problemas
de manejo tales como la privación de agua o alimento, y la mala
ventilación. En aves domésticas, las enfermedades a considerar incluyen
la psitacosis, enfermedad de Pacheco, salmonelosis, adenovirus, y las
deficiencias nutricionales, así como otras infecciones por paramixovirus
(Mossos, 2010, p.14).
La enfermedad de Newcastle se diagnostica mediante el aislamiento del virus en
embriones de pollo SPF, por serología mediante la prueba de inhibición de la
hemaglutinación (HI), pruebas moleculares en tiempo real RT-PCR y secuenciación
(Figura 1).
Figura 1. Proceso diagnóstico de la enfermedad de Newcastle en LNDV
Fuente. El autor
31
Los aislamientos de virus de Newcastle se replican en embriones SPF y el tiempo
medio de muerte (TTM) para matar el embrión, varía dependiendo de su virulencia
(Miller P.J., 2010).
La capacidad de los virus de aglutinar los eritrocitos se ha convertido en
una herramienta útil para conocer el nivel de anticuerpos en las muestras
de suero mediante la prueba de HI, los monitoreos serológicos permiten
evaluar la respuesta inmune después de la vacunación y correlacionar los
resultados con cualquier nivel dado de protección, Viamontes, (2003) y
predecir cuál será el resultado clínico de los lotes de aves ante una
exposición viral Angulo, (2009).Al interpretar los resultados de estas
pruebas, se debe enfocar sistemáticamente el problema para que sea una
prueba de ayuda diagnóstica. (Mossos, 2010, p.14).
Panda, (2006) señala que las pruebas moleculares permiten predecir el patotipo de una
cepa sin inocular pollos y la conclusión de presencia y virulencia del agente puede
lograrse técnicamente en menos de tres días.
Villegas y Perozo, (2008) enfatizan como absolutamente necesario para implementar
controles de la enfermedad; el diagnóstico, la caracterización biológica y molecular
(genotipificación).
Otra prueba es el aislamiento del virus de tejidos de animales infectados o
sospechosos de la enfermedad Organización Mundial de Salud Animal-
OIE, 2004 y Kuiken, (1999) en estudios con cormoranes en Canadá,
recomienda utilizar una prueba de tamizaje o screening que no esté
basada o dependa sólo del aislamiento viral con actividad
hemoaglutinante. La técnica de aislamiento fue utilizada en Indonesia
para aislar un virus velogénico y establecer un virus de referencia interior
para el futuro de los estudios epidemiológicos, patológicos y moleculares.
32
También son utilizados los índices de patogenicidad: tiempo medio de
muerte embrionaria e intracerebral (Adi, 2010; De Noguera, 2002, p.60).
La prueba de RT-PCR acompañada de secuenciación de nucleótidos
representa un aporte para la vigilancia epidemiológica de la Enfermedad
de Newcastle Perozo, (2006) y Miller, (2010), afirma que la diversidad
genómica de la enfermedad de Newcastle aumenta la posibilidad de
diagnósticos fallidos y da lugar a infecciones no identificadas. Es
necesaria la vigilancia epidemiológica constante y proactiva, y la
caracterización de las cepas circulantes en el mundo (Fuller, 2009, p.37).
Investigaciones recientes han podido detectar virus mediante el uso del
PCR de la enfermedad de Newcastle obtenido de las placas de tejidos de
casos clínicos para estudio histopatológico. Esta prueba hace posible
utilizar como recurso en algunos casos, contra muestras hasta ahora no
incluidas dentro de los protocolos de diagnóstico para esta patología.
(Wamatsu, King, Seal & Brown, 2007, p. 333)
Debido a los grandes volumenes de información en cuanto a la lectura e
interpretación de los resultados de los aislamientos virales y las fallas en
su detección, se ha incluido a la bioinformática como herramienta para la
alineación filogenética y el análisis comparativo de nucleótidos con el fin
de determinar qué aspectos permiten al virus escapar al diagnóstico en
algunos casos y haciendo que la eficacia de la prueba no sea del 100% .
(Rogeria de Almeida, Pires, Patarroyo, Vidigal, Borem, 2007, p.227).
Una variante hallada para el diagnóstico serológico de la enfermedad de
Newcastle en ratites comerciales (Avestruces y Ñandues) en la prueba de
HI, es la utilización de caolín para eliminar los inhibidores inespecíficos de
la hemaglutinación que estas aves presentan con el objetivo de reducir
los falsos positivos. (Carrasco, et al., 2008, p.13)
33
Para garantizar un resultado en las pruebas serológicas cuando estas no
se pueden correr dentro del tiempo que la muestra a temperatura
ambiente o refrigerada es óptima, se debe recurrir al proceso de inactivar
los sueros con choques térmicos propuesto por Cunningham, (1971.). Sin
embargo, aunque esta técnica es utilizada en muchos laboratorios se
debe tener en cuenta que el congelamiento prolongado en tubos de
ensayo hace que las proteínas se depositen en el fondo y durante la
reconstitución tienden a desnaturalizarse. Para evitar esta perdida, se
sugiere agregar una parte igual de glicerina neutra para evitar el
congelamiento y como efecto agregado, reducir la contaminación
bacteriana. (Camargo y Guimarães. 1980). Otro estudio de conservación
a largo plazo de sueros es la de recolectar en papel filtro y posteriormente
congelar. (Guimaraes, et al., 1986, p. 129).
1.5.2 Influenza Aviar - IA. A IA es una de las enfermedades zoonóticas que genera
muchas inquietudes en la comunidad científica. Esta enfermedad ha recibido muchas
denominaciones por lo cual se recomendó en el primer simposio internacional que
fuera designada como Influenza Aviar Altamente Patógena – IAAP, sin embargo el
término utilizado actualmente por la OIE, (2007) es el de Gripa Aviar Notificable – GAN.
El virus de IA es de tipo RNA de la familia Orthomyxoviridae.
Antigénicamente existen cuatro tipos A, B, C y Thogotovirus. El tipo A
involucra todos los virus que afectan a las aves domésticas, corredoras y
silvestres. Son huéspedes del virus especies de aves de ornato y
canoras. El tipo A también se puede encontrar en humanos, cerdos,
caballos y, ocasionalmente, en otros mamíferos. (Alexander, 1993, p.
287).
Los virus del tipo A están divididos en subtipos, considerando que
cuentan con 2 glicoproteínas de superficie: la hemaglutinina (H) y la
neuraminidasa (N). En el año 2005 se reportó el antígeno H16 Fouchier,
34
et al., (2005). Sumado a los 9N exhibe gran multiplicidad antigénica,
capacidad de mutación y variedad de virulencia puesto que puede
configurar cualquiera de los 16 subtipos H en cualquiera de los 9 subtipos
N. Linzitto, Espinosa, Rodríguez y Rodríguez, (2005). La Hemaglutinina
está asociada a la clasificación de alta patogenicidad en algunos subtipos
de IA H5 y H7 debido a la presencia de proteasas tipo Furina en las aves,
responsables dela proteólisis. Por su parte, el papel principal de la
neuraminidasa es el de favorecer la diseminación viral. (Saif, et al., 2007,
p. 136).
El virus es subtipado en el laboratorio mediante antisueros
monoespecíficos preparados frente a los antígenos aislados de cada uno
de los subtipos de hemaglutinina y de neuraminidasa de los virus tipo A,
los cuales pueden utilizarse en pruebas de inmunodifusión.
Alternativamente, el virus recién aislado puede examinarse mediante
pruebas de inhibición de la hemaglutinación y de la neuraminidasa frente
a una serie de anticuerpos policlonales contra un amplio rango de cepas
de todos los subtipos N. En los últimos años, los métodos empleados
para la determinación de la virulencia de una cepa en las aves han
evolucionado y existe una mayor comprensión de las bases moleculares
de la patogenicidad pero todavía implican la inoculación del virus
infeccioso de un mínimo de ocho gallinas susceptibles de 4-8 semanas de
edad; las cepas se consideran muy virulentas si causan más del 75% de
mortalidad en 10 días o tienen un índice de patogenicidad intravenosa
(IPIV) mayor de 1.2. (OIE. 2007, p. 580).
Los subtipos de virus influenza que han sido confirmados en humanos
productores de pandemia, son: el H1N1, causando la Gripe Española, el
H2N2 la gripe asiática y el H3N2 causando la gripe de Hong Kong. Los
subtipos H5N1, H7N7, H9N2, H7N2, H7N3, han sido asociados
últimamente con infección de gripe aviar en humanos. Hasta el momento
35
no se ha podido sustentar la transmisión del virus de la IA entre humanos,
sin embargo, relatos clínicos de pacientes diagnosticados revelan que no
tuvieron contacto con animales de granja (Vranjac, 2006, p.40).
Al infectar animales que viven cerca a los humanos tenemos una
situación en la cual infecciones dobles con virus humano y no humano
originan un resultado impredecible de nuevas cepas con composiciones
genéticas muy diferentes. Este reordenamiento de genes, puede ser
pequeño y se conoce como “drift antigénico” o mayor al que se le conoce
como "hiftantigénico" (solo identificadas en el tipo A) y puede darse
también entre dos cepas de origen humano. (Gatherer, 2009, p.174).
Las aves infectadas por el virus AH5N1, siendo excretado en grandes cantidades en
las heces, el virus puede sobrevivir allí por lo menos 35 días a 4°C. Puede sobrevivir
por largos períodos en tejidos de aves enfermas y en el agua, puede sobrevivir hasta
cuatro días a 22°C e indefinidamente en congelación.
Las zoonosis emergentes son una preocupación de los gobiernos por que han
estimado graves consecuencias en la salud pública, traduciendo su impacto en factores
socioeconómicos Olea y Andrea, (2005). El boletín Weekly Epidemiological Record-
Releve Epidemiologique Hebdomadaire, publicado en línea por la Organización
Mundial de la Salud, muestra los resultados del primer análisis epidemiológico del total
de casos de infección por H5N1confirmados por diagnóstico de laboratorio durante el
periodo 2003 – 2006. La conclusión más importante, fue la característica estable dela
tasa de letalidad de la enfermedad.
En la Conferencia Hemisférica de Vigilancia y Prevención de la Influenza
Aviar sesionada en Brasilia en 2005, se firmaron alianzas entre el sector
público y privado a nivel global para prevenir el riesgo de aparición de una
pandemia que amenaza catástrofe. El diagnóstico clínico y los hallazgos
patológicos son criterios suficientes para tomar decisiones de cuarentenar
36
un área como medida de control de urgencia antes de ser confirmada por
pruebas de laboratorio. En consecuencia, los gobiernos deben estar
preparados para atender las enfermedades emergentes, producto de los
cambios antropogénicos de la biosfera. Cabello y Cabello, (2008). Los
laboratorios oficiales deben estar en capacidad de realizar las pruebas
serológicas, detección de antígenos y aislamiento viral. Los métodos se
encuentran descritos en el manual de pruebas diagnósticas y vacunas
para los animales terrestres, de la OIE, Capítulo OIE, (2004). El
diagnóstico de IA se puede realizar a través de cuatro métodos. (Berrio,
2004, p.13).
Aislamiento viral (cultivo). Constituye el gold standard o prueba reina para la
notificación a la OIE. Es la inoculación en la cavidad alantoidea de embriones de
pollo específicamente libres de patógenos (por sus siglas en inglés SPF) o
embriones específicamente libres de anticuerpos (por sus siglas en inglés SAN). La
desventaja es el tiempo requerido para ofrecer resultados, lo que limita su
utilidad clínica. Esta técnica además permite reconocer subtipos y evaluar
resistencia a fármacos.
Detección de proteínas virales. Son test de inmunofluorescencia y ensayo
inmunoenzimático (ELISA de captura) fáciles y rápidos. Menos sensibles que el
cultivo, pero el resultado se obtiene en menos de una hora, por lo que permite
iniciar tratamiento. Algunos permiten identificar a ambos géneros de influenza.
Detección de ácido nucleico viral. Se realiza una amplificación del material viral por
medio de la técnica de PCR. También permite identificar subtipos.
Serología. Por ser un virus hemoaglutinante se realiza la detección del ascenso de
anticuerpos. Con técnicas de inmunodifusión en gel de agar – AGID, ELISA e
inhibición de la hemaglutinación Reconoce ambos géneros del virus, pero no es útil
en la tomas de decisiones.
37
La FAO recomienda a los laboratorios nacionales tener la capacidad para:
- Identificar el antígeno Neuraminidasa mediante pruebas de inhibición (IN)
- Prueba de patogenicidad a los aislamientos virales
- PCR en tiempo real
Según la FAO, (2006) además se solicita a los países, a adquirir e implementar la
tecnología necesaria en caso de emergencia cuando el volumen de muestras lo exija y
contar con el apoyo de laboratorios de referencia.
En el año 2005 se crea la OFFLU, Una poderosa red virtual de información creada
conjuntamente por la FAO y la OIE uniendo esfuerzos para prevenir, detectar y
controlar la Influenza en los animales. Involucra grupos de expertos interdisciplinarios
donde la OMS participa como observador de las actividades a las que se puede
acceder en su sitio web, www.ufflu.net.
Desde 1997, en Colombia se han procesado 25 mil sueros con la técnica de
inmunodifusión en agar-gel y han sido negativos, por lo tanto, el país se auto declara
libre de IA ante la OIE.
1.5.3 Salmonelosis. Los microorganismos del género Salmonella son
bacilos gram negativos pertenecientes a la familia Enterobacteriaceae.
Más de 2300 serovares del género están reconocidos como especies
distintas y dados los mecanismos de recombinaciones genéticas hoy
conocidos, se presume que esta cifra siga multiplicándose en los
próximos años, así como sus transferencias de genes, que entre otros
mecanismos son los responsables de la resistencia a los distintos
antimicrobianos (Flórez, 2005,p.1).
38
Son restrictivos para el comercio internacional y en Colombia, los
serotipos de importancia en salud pública por su toxiinfección alimentaria
se registran entre otros Typhymuriom y Enteritide, y en la avicultura los
serotipos: Pullorum (Pullorosis) y Gallinarum(tifosis). El aumento de la
incidencia de Salmonella spp, es de gran impacto y se ha relacionado con
un incremento de la diseminación de los microorganismos a través de las
cadenas productivas animales (bovinos, cerdos, pollos asaderos y en
especial gallinas ponedoras). Las canales de aves frecuentemente
pueden estar infectadas con el microorganismo; los huevos se pueden
contaminar por transmisión vertical (trans-ovárica), bien puede ser
durante la postura o durante la manipulación o en el almacenamiento
(Uribe, 2006, p.151).
Mucha investigación se ha dirigido hacia la inmunización de gallinas y pavos. La
mayoría de los reportes tienen en común el uso de bacterinas que generan
controversia dentro de la comunidad científica por interferir con su diagnosis a través
de pruebas serológicas; sin embargo, la persistencia por refinar este método es la
respuesta de las aves al recuperarse de la enfermedad sin una posterior reinfección.
Según Pachón, (2009) Salmonella presenta tres antígenos, Flagelar (H), Somática (O)
y de Virulencia o Envoltura o Superficie (Vi) que sirven para su clasificación antigénica
es una equivalencia numérica de la anterior designación por fórmulas del esquema de
Kauffman-White.
En general, es negativa a las pruebas de ureasa, indol, lactosa y
sacarosa y positiva a las pruebas de descarboxilación de lisina y ornitina.
Así mismo, generalmente producen ácido sulfhídrico (H2S), aunque
existen variantes atípicas con reacciones positivas a lactosa o no
descarboxilación de lisina (Velilla, Terzolo & Feingold, 2006, p.98).
39
En las actividades de campo se utiliza la prueba rápida en placa y la confirmación se
hace en cultivos específicos como lo indica el manual de la OIE. Para el proyecto de
vigilancia activa de la Salmonella, el ICA estandarizó la técnica de extracción de ADN
genómico y plasmídico, empleando cepas de referencia para este fin.
El diagnóstico definitivo es la identificación a través de la tipificación y las muestras son
por lo general sangre, higado, vesicula biliar, ovarios, alimento, camas, meconio y
embriones.
Los signos clinicos de S. pullorum son inapetencia, somnolencia y acumulacion de
excretas blancas en la cloaca. En la necropsia de pollos jovenes pueden aparecer
focos blanco amarillentos en corazón, pulmones, higado, estomago, ciego y pancreas.
En los riñones hay congestiion y pueden verse uratos. En los adultos se encuentran
lesiones en los folículos ováricos, impactación del oviductos y peritonitis.
Las lesiones microscopicas aparecen como focos necróticos en el higado con
infiltración linfocitaria, necrosis focal del miocardio y pulmón. Tambien puede
presentarse enteritis catarral.
Se debe hacer un diagnóstico diferencial con Salmonella gallinarum, Salmonella
paratífica, aspergilus, mycolasma sinoviae y bronquitis infecciosa.
Los signos clinicos de S. gallinarum similares a los de S. Pullorum pero el color de la
diarrea sule ser verde o verde amarillenta.
En la necropsia no se observan cambios cuando la infección es hiperaguda. Es común
encontrar hipertrofia en hígado, bazo y riñones. El hígado puede cambiar de color.
Focos miliares blancuzcos en hígado y miocardio. En algunos animales jóvenes
también se observan en pulmones, corazón y molleja. Es posible encontrar peritonitis,
óvulos deformados y hemorrágicos. Al microscopio se observan focos necróticos en
hígado (con infiltración linfocitaria), miocardio y pulmón.
40
El diagnóstico para S. gallinarun y S. Pullorum se hace por cultivo y serología
(aglutinación rápida en placa o lenta en tubo). El primero tiene tres métodos:
a) Medios de enriquecimiento selectivos como selenito F o Caldo tetrationato
b) Medios diferenciales como Agar Mac Conkey
c) Tipificación con Agar TSI (Hierro Triple Azúcar, pos sus siglas en inglés)
41
2. MATERIALES Y MÉTODOS
La base de datos utilizada para el presente estudio fue construida en hoja de cálculo
trascribiendo desde los archivos físicos de los casos ingresados durante el periodo
2009 - 2011 a los laboratorios seleccionados, contenidos en el formato único de
recepción de muestras - FURM el cual es diligenciado en cada laboratorio ya sea con
la información de los diferentes formatos oficiales (3-106, 3-108, etc) utilizados como
parte del protocolo al recoger las muestras y se encuentran en el link DOC MANAGER
de la página web del ICA o en la ventanilla de recepción de cada laboratorio cuando el
usuario solicitante los aporta.
Una vez ingresados los datos se procedió a validar la información con pruebas de
filtrado y revisión de inconsistencias consolidando las variables que en su totalidad
resultaron para el presente trabajo del tipo categórico. Para obtener la descripción
estadística se utilizó la herramienta complementaria de Excel, XLSLAT, programa que
por su integración modular realiza ágil y eficazmente esta labor generando las
diferentes salidas graficas necesarias para la lectura de los resultados extraídas desde
las tablas.
Los análisis de asociación y predicción fueron procesados con el paquete gratuito de
dominio público EPI-INFO (TM) 3.5.4 diseñado para profesionales de la salud pública
que implique manejo de datos epidemiológicos. Con este software se elaboraron las
tablas de contingencia y su desarrollo implícito del análisis de correspondencias
múltiples necesarias estimó el grado de asociación de las diferentes variables que
presentaban interés estadístico.
Las salidas de las tablas de contingencia incluyen los valores marginales y los
intervalos de confianza que ofrecen las bases para el direccionamiento de la
interpretación.
42
La regresión logística de este paquete estadístico arrojó resultados que sugieren el
comportamiento conductual de las variables condicionadas a través de los ajustes o
variantes de las formulas del chi cuadrado que en este caso es el Test Exacto de
Fischer.
Los mapas de distribución se realizaron con DIVA-GIS v 7.5 software gratuito para
aprovechar el potencial de esta herramienta informática y maximizar las ventajas que
brinda la extensa y georeferenciada base de datos. Este software incluye 19 variables
climáticas con información de los últimos 50 años para vincularlos como factores
predictivos en la aparición de las enfermedades según el procesamiento de las
variables.
43
3. RESULTADOS Y DISCUSIÓN.
3.1 ESTADÍSTICA DESCRIPTIVA
La casuística aviar de los tres Laboratorios de Diagnóstico Veterinario del ICA – LDV
escogidos (CEISA-Bogotá, Tuluá e Ibagué), recopilada durante el periodo 2009-2011
fue tabulada en hoja de cálculo ingresando la información del Formato Único de
Recepción de Muestras – FURM (Anexo A) y los resultados de las pruebas de
laboratorios correspondientes solicitadas en cada caso. De esta manera se
consideraron como variables aquellas categorías de datos que se presentan a
continuación:
3.1.1 Recepción de casos. Durante el período comprendido entre los años 2009 y
2011 el total de casos de la vigilancia pasiva ingresados en los tres LDV correspondió a
2204 (Tabla 1). De estos, la mayor concentración estuvo en el laboratorio de Bogotá
(CEISA) con el 60,80% ya que allí son remitidas muestras de todo el territorio nacional
para correr pruebas especiales. En el laboratorio de Tuluá existe una gran
concentración de casos (31,20%) por la dotación de equipos y en Ibagué el porcentaje
fue considerablemente menor (8,00%).
Tabla 1. Relación del ingreso de casos a los LNDV – ICA
OFICINA RECEPTORA
OFICINAS FRECUENCIA PORCENTAJE
CEISA 1340 60,80%
IBAGUE 177 8,00%
TULUA 687 31,20%
Total 2204 100,00%
Fuente. El autor
44
3.1.2 Fecha de Ingreso. El mayor porcentaje de ingreso de casos se presentó en el
año 2010 especialmente durante el tercer trimestre y en el primer trimestre del 2011
(12,11%) y el más bajo el último trimestre de 2011 (4,54%) (Tabla 2).
Tabla 2. Descripción del ingreso de casos por trimestre a los LND – ICA.
FECHA
TRIMESTRES FRECUENCIA PORCENTAJE
1-2009 142 6,44%
2-2009 189 8,58%
3-2009 157 7,12%
4-2009 137 6,22%
1-2010 264 11,98%
2-2010 183 8,30%
3-2010 267 12,11%
4-2010 266 12,07%
1-2011 245 11,12%
2-2011 128 5,81%
3-2011 126 5,72%
4-2011 100 4,54%
Total 2204 100,00%
Fuente. El autor
La tabla muestra que la menor frecuencia de casos que llegaron a los LNDV se
presentó en el año 2011, reflejando la tendencia hacia la disminución en la utilización
de los laboratorios del ICA como medio de diagnóstico en el sector avícola. Se puede
pensar que esta tendencia pudiera estar relacionada con las campañas de
implementación de medidas de bioseguridad en las granjas avícolas que garantizan la
baja incidencia de enfermedades o que algún factor como las condiciones climáticas en
45
este año no favoreció la aparición de las mismas o por alguna característica inherente a
los usuarios.
3.1.3 Identificación de usuarios. La tabla 3 corresponde a la identificación de los
usuarios y muestras de los 2204 casos que llegaron a los laboratorios del ICA durante
los años 2009 – 2011, los cuales fueron solicitados por 882 usuarios, 699 de ellos, es
decir, el 79,25% hicieron uso del servicio una única vez. Las solicitudes que los
usuarios hicieron hasta por 4 veces consolidan el 95,58%del total. Todo lo anterior
indica que la gran mayoría de casos corresponden a usuarios ocasionales. Pueden
identificarse usuarios que utilizaron el servicio de los laboratorios regularmente
teniendo en cuenta el tamaño y tipo de la explotación, de ellos los más relevantes son
Avícola Colombiana S.A., ALAVI S.A. y Nutriavícola Colombiana S.A. con más de 100
solicitudes durante el periodo cada uno de ellos.
Tabla 3. Identificación del tipo de usuarios de los LDV – ICA.
USUARIOS
Usuario No.
Solicitudes
Frecuencia Proporción Prop.
Acumulada
USUARIOS 1 SOLICITUD 1 699 79,25% 79,25%
USUARIOS 2 SOLICITUDES 2 102 11,56% 90,82%
USUARIOS 3 SOLICITUDES 3 26 2,95% 93,76%
USUARIOS 4 SOLICITUDES 4 16 1,81% 95,58%
USUARIOS 5 SOLICITUDES 5 6 0,68% 96,26%
USUARIOS 6 SOLICITUDES 6 3 0,34% 96,60%
USUARIOS 7 SOLICITUDES 7 2 0,23% 96,83%
USUARIOS 8 SOLICITUDES 8 2 0,23% 97,05%
USUARIOS 9 SOLICITUDES 9 3 0,34% 97,39%
GUSTAVO ESPINOZA 10 1 0,11% 97,51%
46
USUARIOS
Usuario No.
Solicitudes
Frecuencia Proporción Prop.
Acumulada
USUARIOS 11 SOLICITUDES 11 3 0,34% 97,85%
USUARIOS 12 SOLICITUDES 12 3 0,34% 98,19%
PURO POLLO S.A. 13 1 0,11% 98,30%
ICA TULUA 15 1 0,11% 98,41%
EDGAR OROZCO 16 1 0,11% 98,53%
INCUBACOL 19 1 0,11% 98,64%
COLAVES 21 1 0,11% 98,75%
AGROAVICOLA SAN
MARINO
25 1 0,11% 98,87%
PAVOS DEL CAMPO S.A. 28 1 0,11% 98,98%
HUEVOS ORO 36 1 0,11% 99,09%
ACODENSA 37 1 0,11% 99,21%
POLLOS BUCANERO 42 1 0,11% 99,32%
VETIPLUS S.A. 48 1 0,11% 99,43%
PRODUCTORA NACIONAL
AVICOLA COLOMBIANA S.A.
56 1 0,11% 99,55%
POLLOS SAVICOL S.A. 76 1 0,11% 99,66%
AVICOLA COLOMBIANA S.A. 106 1 0,11% 99,77%
ALAVI S.A. 179 1 0,11% 99,89%
NUTRIAVICOLA
COLOMBIANA S.A
258 1 0,11% 100,00%
Total 882 100,00% 100,00%
Fuente. El autor
47
3.1.4 Ubicación geográfica. En la tabla 4 se relacionan los departamentos donde se
encuentran los usuarios que enviaron muestras a los LNDV del ICA durante el período
2009 – 2011 para su respectivo procesamiento.
Tabla 4. Relación de los departamentos de origen de los casos.
DEPARTAMENTO
DEPARTAMENTO FRECUENCIA PORCENTAJE
AMAZONAS 1 0,05%
ANTIOQUIA 31 1,41%
ARAUCA 10 0,45%
ATLANTICO 77 3,49%
BOLIVAR 11 0,50%
BOYACA 17 0,77%
CALDAS 25 1,13%
CAQUETA 5 0,23%
CASANARE 34 1,54%
CAUCA 181 8,21%
CESAR 21 0,95%
CHOCO 4 0,18%
CORDOBA 30 1,36%
CUNDINAMARCA 292 13,25%
GUAJIRA 11 0,50%
GUAVIARE 1 0,05%
HUILA 70 3,18%
MAGDALENA 5 0,23%
META 28 1,27%
NARIÑO 26 1,18%
NORTE DE SANTANDER 20 0,91%
48
DEPARTAMENTO
DEPARTAMENTO FRECUENCIA PORCENTAJE
PUTUMAYO 15 0,68%
QUINDIO 53 2,40%
SANTANDER 79 3,58%
SUCRE 6 0,27%
TOLIMA 308 13,97%
VALLE 810 36,75%
VAUPES 1 0,05%
VICHADA 2 0,09%
Total 2204 100,00%
Fuente. El autor
Durante el período 2009 – 2011, 30 de los departamentos de Colombia enviaron
solicitudes a los LNDV del ICA, aunque hay una indiscutible concentración en los
departamentos de mayor desarrollo avícola. El Valle del Cauca con el 36,75%
representado en 810 casos es el departamento que más hace uso del servicio de
laboratorios prestado por el ICA, seguido por Tolima (13,97%), Cundinamarca (13,25%)
y Cauca (8,21%), este último a pesar de no ser un departamento de concentración
avícola, supera lo observado en Santander con sólo 79 solicitudes (3,58%) y sí se
encuentra en una región de importancia avícola (Tabla 4).
3.1.5 Motivo de solicitud. La tabla 5clasifica los motivos por los cuales se solicita el
servicio de los laboratorios del ICA por parte de los distintos tipos de usuarios.
49
Tabla 5. Descripción del motivo de solicitud.
MOTIVO DE SOLICITUD
MOTIVO FRECUENCIA PORCENTAJE
COMPRAVENTA 4 0,18%
CUARENTENA 10 0,45%
DIAG/DIFERENCIAL 126 5,72%
DIAGNOSTICO 1577 71,55%
EXPORTACION 13 0,59%
IMP/CUARENTENA 203 9,21%
MOVILIZACION 33 1,50%
PERFIL 32 1,45%
RESA 206 9,35%
Total 2204 100,00%
Fuente. El autor
El principal motivo de solicitud evidentemente es el diagnóstico abarcando el 71% del
número de casos, seguido con una gran diferencia por el programa Red de Seguridad
Alimentaria-RESA (9,35%), la importación con un valor de 9,21%, el diagnóstico
diferencial tiene el 5,72%, mientras que la movilización y los perfiles vacunales
representan el 1,50% y el 1,45% respectivamente (Figura 5 ). Los motivos por los
cuales se utilizan en menor cantidad los servicios de laboratorio son por compraventa,
cuarentena y exportación de aves. En cuanto al FURM es necesario que la casilla que
corresponde al motivo de solicitud sea más explícita para hacer una mejor
caracterización, es decir, especificar el fin real de la solicitud para discriminar el ítem
diagnóstico que pude ser entre otros: control de calidad, perfiles de anticuerpos
vacunales, comprobar enfermedad sin signos clínicos, etc.
50
3.1.6 Tipo de explotación avícola. Los tipos de explotación que hicieron uso del servicio
de laboratorio prestado por el ICA durante el período en estudio se presentan en la
tabla 6.
Tabla 6. Tipos de explotación que hicieron uso de los LDV – ICA.
Fuente. El autor
El tipo de explotación que tiene mayor representación en el país es la postura en ciclo
completo pues contempla 824 casos de los 2204 en total, es decir, el 37,43%. La
siguiente explotación en importancia es el engorde con 21,42%.El traspatio tuvo una
participación significativa en el uso de los laboratorios correspondiente al 16,92%
gracias a las notificaciones pasivas y al programa RESA. Las solicitudes de
reproductoras fueron el 14,25% con 314 casos, mientras que la categoría otras
especies presentó solamente el 6,17%. La explotación que tiene menor representación
en sector avícola son las aves de postura de levante, pues obtuvieron sólo el 0,41%. Es
de resaltar que el 3,40% de los formularios de solicitud no reporta el tipo de explotación
a la que corresponde, lo que evidencia fallas en el diligenciamiento de estos.
EXPLOTACIÓN
EXPLOTACIÓN FRECUENCIA PORCENTAJE
ENGORDE 471 21,37%
NO REPORTA 75 3,40%
OTRAS ESPECIES 136 6,17%
POSTURA CC 824 37,39%
POSTURA LEV 11 0,50%
REPRODUCTORAS 314 14,25%
TRASPATIO 373 16,92%
Total 2204 100,00%
51
3.1.7 Síntomas. El principal motivo para enviar muestras al laboratorio tras la atención
de la notificación del caso, es la aparición de síntomas. Reportar o no la sinología en el
FURM depende del motivo de la solicitud. Esto quiere decir que no aplica en las
solicitudes remitidas en ausencia de síntomas. Ejemplo de esto son las importaciones o
exportaciones de aves, donde el objetivo del examen de laboratorio es demostrar la
salubridad de un lote asintomático dentro en un modelo de estación cuarentenaria.
Este punto del FURM debe ser re categorizado para poder clasificar la información
eficientemente.
Como lo muestra la tabla 7 se presentaron síntomas en 835 casos, no reportaron
presencia de síntomas en 871 casos y no aplicaba su reporte en 498 del total.
Tabla 7. Presencia de síntomas de los casos recibidos en los LND – ICA.
SÍNTOMAS
FRECUENCIA PORCENTAJE
NO APLICA 498 22,60%
CON SINTOMAS 871 39,52%
SIN SINTOMAS 835 37,89%
Total 2204 100,00%
Fuente. El autor
Que el 37,89% de los casos no presenten síntomas hace pensar que el motivo de
solicitud debe ser discriminado para determinar categorías que revelen la conducta de
los usuarios.
El porcentaje de los casos que presentaron sintomatología y los que no presentaron se
reparte casi en partes iguales donde se espera que sea mayor la presencia de
52
síntomas tal como está planteado el sistema de vigilancia por parte del ICA. El restante
23% corresponde a los casos en que no aplica el reporte de síntomas.
En la tabla 8 se muestran las frecuencias absolutas de los sistemas afectados en los
871 casos que presentaron sintomatología.
Tabla 8. Presencia de síntomas por tipo de sistema afectado.
SINTOMATOLOGÍA
NE
UR
OL
OG
ICO
S
RE
SP
IRA
TO
RIO
S
DIG
ES
TIV
OS
RE
PR
OD
UC
TIV
OS
SIS
TE
MA
OS
EO
ED
EM
A
SI 250 667 311 125 30 12
NO 621 204 560 746 841 859
Total 871 871 871 871 871 871
Fuente. El autor
Se observa que los síntomas respiratorios se presentan en mayor proporción en el
76,58% del total de casos, le siguen los de tipo digestivo con el 35,71% y neurológico
con 28,70%, mientras que los síntomas reproductivos fueron el 14,35%. Los síntomas
que se presentaron con menor frecuencia fueron los que afectan al sistema óseo
(3,44%) y el edema (1,38%).
La tabla 9 discrimina las afectaciones en los diferentes sistemas orgánicos de las aves.
Podemos ver que el 36,62% presentó únicamente síntomas respiratorios, mientras
que en 121 casos (13,89%) hubo combinación de síntomas respiratorios y digestivos.
Los sistemas nervioso y respiratorio se presentaron juntos en un 8,84%. Se
53
presentaron únicamente síntomas neurológicos en el 6,66% de los 871 casos, en tanto
que hubo presencia de síntomas nerviosos, digestivos y respiratorios en 57 casos, es
decir, 6,54%
Todo lo anterior muestra que el sistema respiratorio de las aves constituye el órgano
más comprometido en los casos de diagnóstico de enfermedad solicitado en los tres
laboratorios del ICA. Esta condición puede estar asociada al componente genético,
sistemas de manejo y condiciones climáticas.
Tabla 9. Combinaciones de sintomatología por sistemas.
SINTOMATOLOGÍA
RE
SP
IRA
TO
RIO
S
NE
UR
OL
ÓG
ICO
S
DIG
ES
TIV
OS
RE
PR
OD
UC
TIV
OS
Ó
SE
OS
ED
EM
A
FR
EC
UE
NC
IA
PO
RC
EN
TA
JE
X X X 1 0,11%
X X X 1 0,11%
X X 1 0,11%
X X X 1 0,11%
X X X 1 0,11%
X 1 0,11%
X X 2 0,23%
X X 3 0,34%
X X 3 0,34%
X X X 3 0,34%
X X 3 0,34%
54
Fuente. El autor
3.1.8 Necropsias. Para corroborar la sintomatología observada en las aves durante la
visita de campo se recomienda realizar necropsias que permitan la identificación de las
lesiones macroscópicas que apoyen la presunción diagnóstica. En varios casos se
observó que los propietarios, sobre todo los que poseen aves de traspatio, se negaron
al sacrificio para tal fin. En la tabla 10 se presentan los resultados de la variable
necropsias.
SINTOMATOLOGÍA
RE
SP
IRA
TO
RIO
S NE
UR
OL
ÓG
IC
OS
D
IGE
ST
IVO
S
RE
PR
OD
UC
TI
VO
S
ÓS
EO
S
ED
EM
A
FR
EC
UE
NC
IA
PO
RC
EN
TA
JE
X X X 4 0,46%
X X X 5 0,57%
X X 7 0,80%
X X X X 8 0,92%
X 13 1,49%
X 14 1,61%
X X X 16 1,84%
X X 25 2,87%
X X 28 3,21%
X 47 5,40%
X X 48 5,51%
X X X 57 6,54%
X 58 6,66%
X X 77 8,84%
X X 121 13,89%
X 319 36,62%
55
Tabla 10. Realización de necropsias en los casos enviados a los LDV – ICA.
NECROPSIAS
FRECUENCIA PORCENTAJE
PRESENTA
LESIONES
741 33,62%
SIN LESIONES 88 3,99%
NO APLICA 1126 51,09%
NO SE REALIZÓ 249 11,30%
Total 2204 100,00%
Fuente. El autor
En necesario aclarar que en algunos casos no se practicaron necropsias por estar
condicionadas al motivo de la solicitud para las cuales no aplica este procedimiento
excluyendo así al 51,09% del total. A estos se suman el 11,30% de los casos en que no
se realizó el procedimiento en los cuales debiera reportarse el por qué para buscar una
estrategia que permita esta práctica. Se realizaron 839 necropsias que corresponde al
37,61% de los 2204 casos, de estos, el 33,62% presentaron lesiones y el 3,99%
restante no presentaron.
El análisis de las 741 necropsias que presentaron lesiones, extraídos de la tabla
11donde los resultados presentados, relaciona los sistemas afectados tomando los
datos absolutos de la base de datos, es decir, se contabilizaron las afectaciones
cuando el reporte era único o estuviera(n) involucrado(s) otro(s) sistema(s).
56
Tabla 11. Presencia de lesiones por sistema afectado.
LESIONES A LA NECROPSIA
SISTEMAS AFECTADOS
RE
SP
IRA
TO
RIO
CA
RD
IO
VA
SC
UL
AR
DIG
ES
TIV
O
NE
RV
IOS
O
UR
INA
RIO
RE
PR
OD
UC
TIV
O
PIE
L
ÓS
EO
HE
MA
TO
PO
YE
TIC
O
ED
EM
A
No
presenta
177 673 335 664 647 643 732 720 588 733
Presenta 564 68 406 77 94 98 9 21 153 8
Total 741 741 741 741 741 741 741 741 741 741
Fuente. El autor
El sistema más afectado fue el respiratorio, pues en el 76,11% de los casos en que se
realizó necropsia se hallaron lesiones. Otro sistema que se vio afectado en la gran
mayoría de las necropsias es el digestivo con 54,79%. Los hallazgos menos
representativos estuvieron en el sistema óseo (2,83%), en piel (1,21%) y el edema que
es una lesión comúnmente reportada en aves de corral apenas fue reportada en el
1,08% de los casos. Es posible que el mejoramiento genético haya incidido en su
disminución.
3.1.9 Diagnóstico Presuntivo. El reporte de la sintomatología presentada, apoyada
algunas veces en las lesiones halladas a la necropsia, generó gran variedad de
diagnósticos presuntivos presentados en la tabla 12.
57
Tabla 12. Diagnósticos presuntivos de los casos recibidos en los LDV – ICA.
DIAGNÓSTICO PRESUNTIVO
DIAGNÓSTICO FRECUENCIA PORCENTAJE
ASPERGILOSIS 1 0,05%
BRONQUITIS – COLIBACILOSIS 1 0,05%
BRONQUITIS - LARINGOTRAQUEITIS –
MICOPLASMOSIS
1 0,05%
BRONQUITIS - MICOPLASMOSIS 1 0,05%
BRONQUITIS –NEWCASTLE 1 0,05%
CARCINOMA DE ESTOMAGO 1 0,05%
CLOSTRIDIUM PERFRINGENS 1 0,05%
COCCIDIA 1 0,05%
CUERPO EXTRAÑO 1 0,05%
ENCEFALOMIELITIS 1 0,05%
GUMBORO - MAREK - LARINGOTRAQUEITIS -
BRONQUITIS
1 0,05%
LEUCOSIS 1 0,05%
MICOPLASMOSIS - STAPHILOCOCO –
STREPTOCOCO
1 0,05%
NEWCASTLE - BRONQUITIS – COLIBACILOSIS 1 0,05%
NEWCASTLE - BRONQUITIS - LARINGOTRAQUEITIS -
GUMBORO
1 0,05%
NEWCASTLE - BRONQUITIS- GUMBORO 1 0,05%
NEWCASTLE - BRONQUITIS- INFLUENZA 1 0,05%
NEWCASTLE - COLIBACILOSIS 1 0,05%
NEWCASTLE - COLIBACILOSIS - MICOPLASMOSIS 1 0,05%
NEWCASTLE - ENCEFALOMIELITIS 1 0,05%
NEWCASTLE - STAPHILOCOCOS 1 0,05%
58
DIAGNÓSTICO PRESUNTIVO
DIAGNÓSTICO FRECUENCIA PORCENTAJE
NEWCASTLE - GUMBORO – BRONQUITIS 1 0,05%
NEWCASTLE - INFLUENZA – BRONQUITIS 1 0,05%
NEWCASTLE - LARINGOTRAQUEITIS – BRONQUITIS 1 0,05%
NEWCASTLE - LARINGOTRAQUEITIS - BRONQUITIS-
INFLUENZA
1 0,05%
NEWCASTLE - LARINGOTRAQUEITIS - SALMONELLA
– INFLUENZA
1 0,05%
NEWCASTLE– LEUCOSIS 1 0,05%
NEWCASTLE– MAREK 1 0,05%
NEWCASTLE - SALMONELLA – COLIBACILOSIS 1 0,05%
NEWCASTLE -INFLUENZA - BRONQUITIS -
LARINGOTRAQUEITIS
1 0,05%
PASTEURELLA - COLIBACILOSIS 1 0,05%
PASTEURELLA - HAEMOPHILUS – MICOPLASMOSIS 1 0,05%
PASTEURELLA - MICOPLASMOSIS 1 0,05%
PSEUDOMONA 1 0,05%
REOVIRUS 1 0,05%
REOVIRUS-MICOPLASMOSIS 1 0,05%
SALMONELLA - COLIBACILOSIS 1 0,05%
SALMONELLA – GUMBORO 1 0,05%
STAPHILOCOCOS 1 0,05%
STAPHILOCOCOS - PSEUDOMONA 1 0,05%
BRONQUITIS – SALMONELLA 2 0,09%
CORIZA 2 0,09%
DESNUTRICION 2 0,09%
LARINGOTRAQUEITIS - BRONQUITIS 2 0,09%
MICOPLASMOSIS 2 0,09%
59
NEUMOVIRUS – BRONQUITIS 2 0,09%
DIAGNÓSTICO PRESUNTIVO
DIAGNÓSTICO FRECUENCIA PORCENTAJE
NEWCASTLE - BRONQUITIS -GUMBORO 2 0,09%
NEWCASTLE - BRONQUITIS INFECCIOSA –
MICOPLASMOSIS
2 0,09%
NEWCASTLE– CORIZA 2 0,09%
NEWCASTLE– HISTOMONIASIS 2 0,09%
NEWCASTLE - INFLUENZA – SALMONELLA 2 0,09%
VIRUELA 2 0,09%
BRONQUITIS – GUMBORO 3 0,14%
BRONQUITIS - LARINGOTRAQUEITIS 3 0,14%
INFLUENZA 3 0,14%
INTOXICACION 3 0,14%
NEWCASTLE - BRONQUITIS – GUMBORO 3 0,14%
NEWCASTLE - BRONQUITIS – INFLUENZA 3 0,14%
MAREK – VIRUELA 4 0,18%
NEWCASTLE– GUMBORO 4 0,18%
NEWCASTLE- BRONQUITIS 4 0,18%
PASTEURELLA 4 0,18%
NEWCASTLE - LARINGOTRAQUEITIS-
INFLUENZA
5 0,23%
NEWCASTLE - BRONQUITIS – LARINGOTRAQUEITIS 6 0,27%
NEWCASTLE - LARINGOTRAQUEITIS 7 0,32%
SALMONELLA 8 0,36%
NEWCASTLE– SALMONELLA 9 0,41%
COLIBACILOSIS 11 0,50%
GUMBORO 15 0,68%
BRONQUITIS 23 1,04%
60
NEWCASTLE– INFLUENZA 54 2,45%
LARINGOTRAQUEITIS 80 3,63%
DIAGNÓSTICO PRESUNTIVO
DIAGNÓSTICO FRECUENCIA PORCENTAJE
NEWCASTLE– BRONQUITIS 137 6,22%
NO REPORTA 219 9,94%
INCONGRUENTE 298 13,52%
NEWCASTLE 430 19,51%
NO APLICA 804 36,48%
Total 2204 100,00%
Fuente. El autor
Esta variable también depende del motivo de solicitud y son muchos los casos que
llegan a los LDV del ICA en los cuales no aplica su reporte, por esta razón se filtró la
base de datos del estudio y arrojó que estos corresponden al 36,48% del total como lo
muestra el Figura 2.
Figura 2. Diagnósticos presuntivos de los casos recibidos en los LDV – ICA
Fuente. El autor
9,94%
36,48%
13,52%
27,00%
11,30%
1,54%
0,23%
40,06%
Diagnóstico Presuntivo NO REPORTA
NO APLICA
INCONGRUENTES
UNICOS
DOBLES
TRIPLES
CUADRUPLES
61
Se observó que el 13,52% del total de casos corresponde a diagnósticos
incongruentes. Si esta proporción se obtuviera de los casos en los que debían ser
reportados (1400) esta cifra sería del 21.29%. Entre otros están aquellos que no tenían
el nombre de una enfermedad como tal o llevaban escrito el nombre de una prueba.
Sumado a esto, se encontró que del total de los casos el 9,94% (15.64% de los que
debían reportar) de los formularios no reportó ningún diagnóstico presuntivo. Este
punto es crítico si se tiene en cuenta que el análisis de la situación de campo por parte
del profesional es fundamental en la conclusión de un diagnóstico.
Frecuencias de diagnósticos únicos fueron del 27% (incluyendo el de ENC con
19,51%), dobles del 11.30% (incluyendo la asociación ENC-IBV con 6,27%). Con tres
diagnósticos asociados se encontró 1.54% de los casos y el 0,23% con cuatro
diferentes diagnósticos presuntivos.
El 31,26% de los casos la enfermedad de Newcastle estuvo comprometida como
diagnóstico presuntivo, es decir en conteo absoluto. De estos, el 19,51% fue reportada
como único diagnóstico presuntivo, el restante 11,75% hace referencia a Newcastle
asociado a otros posibles diagnósticos (Tabla 13).
Tabla 13. Reporte de ENC como diagnóstico presuntivo.
DIAGNÓSTICO PRESUNTIVO DE ENC
ENC ABSOLUTA 31.26%
ENC REPORTE UNICO 19.51%
ENC ASOCIADA 11.75%
Fuente. El autor
La asociación con Influenza Aviar se reportó en 67 casos y en tres ocasiones como
único diagnóstico presuntivo, siendo el país libre de esta enfermedad.
62
Una enfermedad de importancia por su aparición en nuevas zonas del país es la
Laringotraqueitis y aparece como diagnóstico presuntivo en el 3,63% de los casos.
Estas presunciones deben tenerse en cuenta cuando provienen de zonas donde no se
ha presentado la enfermedad.
3.1.10 Vacunas. Las vacunas son un factor importante a tener en cuenta a la hora de
hacer la interpretación de los resultados de las pruebas serológicas, por lo anterior, es
información primordial que debe ser registrada en los formatos de recepción de
muestras, pero en el período analizado ocurrió lo contrario, pues en los casos
analizados en este estudio el reporte es escaso dentro del FURM. El análisis de esta
variable se realizó por tipo de explotación dado que cada una de ellas tiene un plan de
vacunas particular. Iniciando con las granjas de pollo de engorde consolidada en la
Figura 3observamos que el 55.72% del total casos registrados en el período 2009 -
2011 les fue aplicada la vacuna viva de Newcastle (263 casos) y la vacuna de la cual
se reporta menos uso es la oleosa de esta misma enfermedad, sólo 31 casos (Figura
3).
Figura 3. Porcentaje de aplicación de vacunas para la explotación de engorde.
Fuente. El autor
El uso de vacuna recombinante de Newcastle no es utilizada o al menos no se reporta
su uso en ningún caso. Se debe tener en cuenta que este tipo de vacuna en teoría no
0%
20%
40%
60%
80%
100%
55,72%
6,57%
18,01% 20,13%
44,28%
93,43%
81,99% 79,87%
VACUNAS EN FASE DE ENGORDE
VACUNA
NO VACUNA
63
muestra anticuerpos y por lo tanto no serán detectados en pruebas de este tipo. El uso
de las vacunas de Gumboro y Bronquitis Infecciosa corresponde al 20,13% y 18,01%,
respectivamente mostrando un índice bajo en el manejo de estas enfermedades que
son endémicas y de alta incidencia en nuestro medio.
La aplicación de la vacuna contra ENC está reglamentada por el ICA y se debe
socializar esta resolución en campañas que ayuden a la correcta a la aplicación,
manejo del biológico, registro y control de resultados en las explotaciones que lo
ameriten.
La tabla 14 recoge las conductas de la aplicación general de vacunas en explotaciones
de engorde durante el periodo 2009 – 2011, se presentaron 472 casos de los cuales
200 no tuvieron ninguna vacuna o no fue reportada su aplicación.
En 143 casos fue aplicada sólo la vacuna viva de Newcastle y en 4 casos sólo la
oleosa. Únicamente en 56 de los casos se aplicó la vacuna contra las tres
enfermedades y se hizo uso de los cuatro tipos de vacunas en 9 casos.
Tabla 14. Aplicación de vacunas en explotación de engorde.
VACUNAS EN FASE DE ENGORDE
VIVA ENC OLEOSA ENC IBV GUMBORO FRECUENCIA
X 143
X X 27
X X 14
200
X 1
X 4
X X X 3
64
X X X X 9
VACUNAS EN FASE DE ENGORDE
VIVA ENC OLEOSA ENC IBV GUMBORO FRECUENCIA
X X 11
X X 2
X X X 1
X X 1
Fuente. El autor
En la Tabla 15 se muestran los 834 casos de aves en postura ingresados en los LNDV
del ICA durante el período comprendido entre los años 2009 a 2011. La vacuna que
más se aplicó en la etapa de levante es la de Bronquitis Infecciosa con 229 casos, la
que menos se usa es la vacuna oleosa de Newcastle.
Tabla 15. Descripción del tipo de vacuna para la explotación postura en etapa de
levante.
VACUNAS EN POSTURA LEVANTE
VIV
A E
NC
OL
EO
SA
EN
C
IBV
GU
MB
OR
O
VIR
UE
LA
CO
RIZ
A
CO
LE
RA
EN
CE
FA
L
OM
IEL
ITIS
VACUNA 206 17 229 119 81 83 67 47
NO VACUNA 628 817 605 715 753 751 767 787
Total 834 834 834 834 834 834 834 834
Fuente. El autor
Los casos de aves de postura en levante que no aparecen como vacunadas fueron
557.De ellos sólo 65 reportaban estar vacunadas con vacuna viva contra Newcastle y
65
contra la enfermedad de Bronquitis Infecciosa, en 58 casos hay reporte de vacuna de
IBV y 44 tienen el plan vacunal completo.
En la etapa de producción se aplica la vacuna contra la enfermedad de Newcastle,
principalmente es utilizada la cepa viva, esta fue aplicada en 148 de 834 casos (Tabla
16).
Tabla 16. Descripción del tipo de vacuna para la explotación Postura en etapa de
producción.
VACUNAS EN FASE DE POSTURA - PRODUCCION
VIVA ENC OLEOSA ENC
VACUNA 148 6
NO VACUNA 686 828
Total 834 834
Fuente. El autor
El número total de granjas de reproductoras correspondió a 314 casos, de las cuales
295 no reportan ningún tipo de vacuna, mientras que sólo en 4 casos hay reporte del
plan vacunal completo. En 10 ocasiones fue aplicada la vacuna viva de ENC en
producción (Tabla 17). En este punto es importante resaltar que las granjas de
reproductoras que pertenecen a grandes empresas con estándares rigurosos de
bioseguridad no están reportando la información completa en el FURM, en donde no
aparece un esquema de vacunación, lo que podría llevar a pensar que no se aplican
vacunas o que este formato no es un documento confiable.
66
Tabla 17. Aplicación de vacunas en explotación de reproductoras.
VACUNAS EN REPRODUCTORAS
VIV
A E
NC
LE
V
OL
EO
SA
EN
C L
EV
CO
CC
IDIA
AR
TR
ITIS
GU
MB
OR
O
VIR
UE
LA
IBV
MY
CO
PL
AS
MA
PA
ST
EU
RE
LL
A
SA
LM
ON
EL
LA
EN
CE
FA
LO
MIE
LIT
I
S
AN
EM
IA
VIV
A E
NC
PR
OD
FR
EC
UE
NC
IA
295
X X X X X X X X X X X 1
X 10
X X X X X X 1
X 1
X X X X X X X X X X X X 2
X 1
X X 1
X X X X X X X X X X X X X 2
Total 314
Fuente. El autor
De los 373 casos de traspatio registrados durante el período 2009 – 2011, solamente el
2,68% de las aves de combate fue vacunado con la vacuna viva de la enfermedad de
Newcastle, el 0,27% con la vacuna oleosa y el 0,80% contra Viruela. El 7,51% de las
aves criollas fue vacunada con la vacuna viva de Newcastle y el 0,80% con la oleosa
(Tabla 18).
67
Tabla 18. Descripción del tipo de vacuna para el traspatio.
VACUNAS EN TRASPATIO
EXPLOTACIÓN VARIABLE CATEGORÍAS FRECUENCIAS PORCENTAJE
VACUNAS
COMBATE
VIVA ENC NO VACUNA 363 97,32%
VACUNA 10 2,68%
OLEOSA
ENC
NO VACUNA 372 99,73%
VACUNA 1 0,27%
VIRUELA NO VACUNA 370 99,20%
VACUNA 3 0,80%
VACUNAS
TRASPATIO
VIVA ENC NO VACUNA 345 92,49%
VACUNA 28 7,51%
OLEOSA
ENC
NO VACUNA 370 99,20%
VACUNA 3 0,80%
Fuente. El autor
Los casos de otras especies mostradas en la Tabla 19 que fueron recibidas en los LDV
del ICA durante el período en estudio fueron 136,de los cuales 9 reportaron estar
vacunadas contra la enfermedad de Newcastle y las 127 restantes no fue reportada
otra vacuna.
Tabla19. Descripción del tipo de vacuna para otras especies.
VACUNAS EN OTRAS ESPECIES
FRECUENCIA PORCENTAJE
NO VACUNA 127 93,38%
VACUNA 9 6,62%
Total 136 100,00%
Fuente. El autor
68
El porcentaje de otras especies que fueron vacunadas es de 6,62%, las no vacunadas
corresponden al 93,38%. La variedad de especies de aves generó un gran listado
debido a que no se tiene una guía para la clasificación de las mismas. La sugerencia es
ceñirse a la tabla taxonómica.
3.1.11 Muestras. El siguiente análisis hace referencia a los diferentes tipos de muestras
recibidas en los LDV durante el período 2009 – 2011. En el Figura 6 se consolidan las
muestras de forma absoluta en virtud a que un solo caso puede ingresar una o más
muestras según la solicitud de exámenes requeridos. En este estudio se contabilizaron
2933 muestras ingresadas para los 2204 casos registrados.
La tabla 20 muestra la distribución de las frecuencias de las muestras y sus
combinaciones.
Tabla 20. Combinaciones de los tipos de muestras enviadas a los LDV – ICA.
MUESTRAS
SUERO TEJIDO POLLITO
H.
CLOACAL
H.
TRAQUEAL AVE HECES Frec. %
X X X 1 0.05%
X
X
1 0.05%
X X
X 1 0.05%
X
X
1 0.05%
X
X X 1 0.05%
X X X
1 0.05%
X X
X
X
2 0.09%
X X
X
3 0.14%
X
X
3 0.14%
X
X
7 0.32%
X
X 7 0.32%
X
X
8 0.36%
69
MUESTRAS
SUERO TEJIDO POLLITO
H.
CLOACAL
H.
TRAQUEAL AVE HECES Frec. %
X
X
10 0.45%
X
X X
18 0.82%
X X
X
19 0.86%
X
X
19 0.86%
X X
25 1.13%
X
X X
33 1.50%
X
X
41 1.86%
X X
X X
58 2.63%
X X
X
60 2.72%
X
61 2.77%
X
72 3.27%
X
137 6.22%
X 137 6.22%
X X
153 6.94%
X
219 9.94%
X
488 22.14%
X 618 28.04%
Total 993 856 223 330 232 153 146 2204 100.00%
Gran
Total 2933
Fuente. El autor
En 618 de los casos fue enviada como muestra única el suero sanguíneo, los tejidos en
488 casos y el pollito vivo en 219. Presentaron frecuencias iguales las heces y las aves
con 137 casos cada una de ellas. Los hisopos cloacales fueron enviados en 72 de los
casos y los hisopos traqueales en 61.
70
La combinación (doble) más frecuente es el suero con tejidos en 153 ocasiones. Suero,
tejidos e hisopos se enviaron conjuntamente en 58 casos, el suero junto a los hisopos
en 33 y los 2 tipos de hisopos en 25 ocasiones. Una observación importante es que
algunos casos recopilados de los laboratorios seleccionados no tenían reporte de
muestras y en consecuencia sin resultados, de tal manera que fueron excluidos del
estudio. Este hallazgo sugiere que hubo fallas en el registro o en el archivo de estos
casos.
3.1.12 Sexo y edad de las muestras. Con cada muestra se debe reportar el sexo y la
edad correspondiente. Se expresa en días o semanas dependiendo del tipo de
explotación. Se han separado las categorías por tipo de muestra y se realizó un análisis
descriptivo que contiene la distribución de cada una de acuerdo a el sexo del pollo
(cualitativo) y las distribuciones de las edades (cuantitativo) en las cuales se presentan
las edades mínimas, máximas, medias y desviaciones estándar de cada una, tanto
edades por día como por semana.
3.1.13 Sueros
Tabla 21. Relación del sexo en las muestras de suero sanguíneo.
SUERO SANGUíNEO
SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE
HEMBRA 431 43,49%
MACHO 48 4,64%
MIXTO 101 10,19%
NR 413 41,68%
Total 993 100,00%
Fuente. El autor
71
Los resultados de la tabla 21 muestran que los sueros sanguíneos en su gran mayoría
correspondieron a las hembras con 431 casos de los 993 recibidos en los LDV.
También se observa que un gran número de casos (413) no reportó el sexo del cual
provenían.
La relación de las proporciones encontrada entre hembras y machos deja claro que las
explotaciones de postura (huevo fértil y de plato) son las que más muestras envían a
los LDV. Los casos en que los sueros pertenecían a lotes mixtos (10%) corresponden
en su gran mayoría al ingreso de pollito de un día, provenientes de las importaciones,
exportaciones o para el análisis de control de calidad de algunas empresas. Cerca del
42% de los casos no reportaron el sexo al cual pertenecían las muestras de suero y
refleja la escasa gestión del formato.
De los 993 casos de muestra en sueros se presentaron 204, los promedios de las
edades fueron de 32 días y medio y 23 semanas aproximadamente con edades entre
1 y 84 días y 3 y 182 semanas. Aunque las edades en días fueron más homogéneas
comparadas con las reportadas en semanas, se presentaron coeficientes de variación
altos lo que significa que existe variabilidad importante en las edades de los animales
muestreados reflejados en la Tabla 22.
Tabla 22. Descripción de edades en las muestras de sueros.
EDAD EN MUESTRAS DE SUEROS
Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación
típica
Coef.
Variación
DIA 204 1,00 84,00 32,47 15,66 48,22
SEM 549 3 182 28,49 23,07 0,81
Fuente. El autor
72
Al observar la distribución de las edades se puede notar que se comportan de maneras
distintas cuando se miden en días y cuando se miden en semanas como lo muestras
los histogramas (Figuras 7 y 8). En el caso de días las edades se distribuyen de forma
casi simétrica y por esa razón el valor promedio se encuentra centrado en el rango de 2
a 84 días de edad (Tabla 23). Este resultado es importante ya que el promedio de edad
sería un segmento representativo para los análisis y resultados de los estudios
epidemiológicos realizados con estas muestras.
Por otro lado en semanas existe una total asimetría, aproximándose más a un
decaimiento exponencial de las edades. Las muestras de sueros se acumulan en las
edades más jóvenes lo que genera un sesgo de la información. La mayoría de las
edades (71.67%) se encuentran entre 1 y 32 semanas y media (Tabla 24). Esta
variabilidad afecta el análisis ya que el promedio no sería un buen representante de la
media, además el sesgo de la distribución muestra que existen algunos datos que no
son comunes en estos casos de edad (edades muy altas). Esto refleja que la inclusión
de aves de ornato como loros, guacamayas y otros alejan el promedio de edad en
semanas por su longevidad y deben ser recategorizados.
Figura 4. Distribución de la edad en semanas días para el suero sanguíneo
Fuente. El autor
0%
5%
10%
15%
20%
25%
30%
35%
40%
45%
0 20 40 60 80
Frec
uen
cia
rela
tiva
DIA
Edad de sueros en dias
73
Figura 5. Distribución de la edad en para el suero sanguíneo
Fuente. El autor
Tabla 23. Intervalos para la edad en días del suero sanguíneo.
INTERVALOS EDAD EN DÍAS
Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa
1 15 28 0,14
15 29 43 0,21
29 43 88 0,43
43 57 41 0,20
57 71 1 0,00
71 85 3 0,01
Fuente. El autor
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
70%
80%
0 50 100 150 200
Frec
uen
cia
rela
tiva
SEM
Edad de sueros en semanas
74
Tabla 24. Intervalos para la edad en semanas del suero sanguíneo.
INTERVALOS EDAD EN SEMANAS
Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa
1 32,5 388 0,71
32,5 64 116 0,21
64 95,5 39 0,07
95,5 127 0 0,00
127 158,5 5 0,01
158,5 190 1 0,00
Fuente. El autor
3.2 TEJIDOS
El total de muestras de tejido enviados durante el período en estudio a los LDV del ICA
fue de 853, de las cuales el 39.86% corresponde a casos que no reportaron el sexo al
que pertenecen (Tabla 25).
Tabla 25. Relación del sexo en las muestras de tejidos.
TEJIDOS
SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE
HEMBRA 254 29,78
MACHO 66 7,74
MIXTO 193 22,63
NR 340 39,86
Total 853 100,00
Fuente. El autor
75
El porcentaje de muestras de tejidos ingresados provenientes de las hembras
corresponde al 29,78%, luego los denominados mixtos con 22,63% y por último, los
tejidos provenientes de machos con el 7,74% del total.
El número de muestras de tejidos de aves cuya edad fue reportada en días es de 333,
de las cuales la edad mínima correspondió a 1 día y la máxima a 57 días, la edad
promedio es de 20,17 días y la desviación corresponde a 17,35. El coeficiente de
variación es equivalente a 86,01%, lo que nos indica que hay mucha variabilidad entre
las edades (Tabla 26).
Tabla 26. Descripción de edades en las muestras de sueros.
EDAD EN MUESTRAS DE TEJIDOS
Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación
típica
Coef.
variación
DIA 333 1,00 57,00 20,17 17,35 86,01
SEM 361 1 196 23,14 21,15 0,91
Fuente. El autor
En los resultados arrojados en las tablas 27 y 28 representados en los histogramas
(Figuras 9 y 10) las edades se encontraron entre 1 y 57 días, y 1 y 196 semanas con
promedios de 20 días y 23 semanas aproximadamente. Estos promedios se
encuentran sesgados hacia la edad mínima en ambos caso, es decir, lejos de la
máxima edad pero notoriamente hay más sesgo en la edad por semanas que en días.
76
Figura 6. Distribución de la edad en semanas días para tejidos.
Fuente. El autor
Figura 7. Distribución de la edad en semanas para tejidos
Fuente. El autor
0
0,05
0,1
0,15
0,2
0,25
0,3
0,35
0,4
0,45
0 10 20 30 40 50 60 70
Frec
uen
cia
rela
tiva
DIA
Edad de tejido en dias
0
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
0,6
0,7
0,8
0 50 100 150 200 250
Frec
uen
cia
rela
tiva
SEM
Edad de tejido en semanas
77
Tabla 27. Intervalos para la edad en días de tejidos.
INTERVALOS EDAD EN DÍAS
Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa
1 11 143 0,43
11 21 19 0,06
21 31 54 0,16
31 41 64 0,19
41 51 48 0,14
51 61 5 0,02
Fuente. El autor
Tabla 28. Intervalos para la edad en semanas de tejidos.
INTERVALOS EDAD EN SEMANAS
Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa
1 34,2 284 0,78
34,2 67,3 61 0,17
67,3 100,5 13 0,36
100,5 133,7 2 0,05
133,7 166,8 0 0,00
166,8 200 1 0,03
Fuente. El autor
Verificando la tabla de frecuencia para la edad por semanas se encontró que
efectivamente existe una edad entre 166 y 200 semanas que esta “halando” la
distribución de estas.
Se decide extraer dos datos, 160 y 120 semanas correspondientes a un ave de
combate y un criollo respectivamente, buscando así describir de manera más precisa la
78
distribución de la información recolectada. En este punto vuelve a ser evidente que el
FURM al no permitir discriminar las distintas explotaciones y solicitar la información
acorde a estas, hace imposible obtener una clasificación y posterior estudio de las
producciones. Los resultados en la nueva información (sin datos atípicos) se presentan
en la tabla 29.
Tabla 29. Descripción de edades en las muestras de tejidos.
EDAD EN MUESTRAS DE TEJIDOS
Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación
típica
Coeficiente
variación
SEM 359 1 104 22,39 18,43 0,82
Fuente. El autor
Sin los datos atípicos, disminuye un poco la variabilidad de la información Además
como se observa en el histograma (Figura 11), se ve de forma más clara la distribución
de las edades con un comportamiento exponencial decreciente en las frecuencias de
las edades encontradas. El valor promedio disminuyó tan solo en 1 semana.
Figura 8. Distribución de la edad en semanas para tejidos.
Fuente. El autor
0
0,05
0,1
0,15
0,2
0,25
0,3
0,35
0,4
0,45
0,5
0 20 40 60 80 100 120
Frec
uen
cia
rela
tiva
SEM
Edad en semanas (sin datos atipicos)
79
3.3 POLLITO
Cuando se desea llevar control epidemiológico en exportaciones, importaciones, control
de calidad del material genético o se sospecha de algún daño en comunidades
extensas de pollos recién nacidos, es común recibir como muestra los pollitos de
edades muy pequeñas. El número de muestras de pollitos enviados a los LDV durante
el 2009 – 2011 corresponde a 223, de los cuales el 52.02% son catalogados como
mixto representando la mayoría del sexo reportado. Aquí el número de edades no
reportadas disminuye con respecto a otro tipo de muestras anteriormente analizadas
aunque sigue siendo representativa como lo muestra la Tabla 30.
Tabla 30. Relación del sexo en las muestras de pollitos.
POLLITO
SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE
HEMBRA 51 22,87%
MACHO 7 3,14%
MIXTO 116 52,02%
NR 49 21,97%
Total 223 100,00%
Fuente. El autor
La Tabla 31 muestra que la edad máxima de las muestras de pollitos fue de 10 días, el
promedio de 1,52 evidencia que hay tendencia de los datos hacia las edades menores
lejos del valor extremo mayor. Esta distancia es producida por algún tipo de datos
atípicos o dispersión muy grande, que es lo que en realidad se espera.
80
Tabla 31. Descripción de edades en las muestras de pollito.
EDAD EN MUESTRAS DE POLLITO
Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación
típica
Coef.
variación
DIA 204 1,00 10,00 1,52 1,50 98,00
Fuente. El autor
La distribución de las edades está concentrada en el primer intervalo (1 – 3 días) y en
los demás la cantidad de datos está repartida en valores muy similares, que se
encuentran entre 5 y 11 días (Tabla 32).
Tabla 32. Intervalos para la edad en días de pollitos.
INTERVALOS EDAD EN DÍAS
Límite
inferior
Límite
superior
Frecuencia Frecuencia
relativa
1 3 175 0,86
3 5 18 0,09
5 7 6 0,03
7 9 2 0,01
9 11 3 0,01
Fuente. El autor
Sin embargo, a pesar de que la dispersión es del 98% existe información apreciada
entre 3 y 10 días, que no se toma como atípico porque es normal esta distribución de
edades en estos casos como lo podemos apreciar en el histograma (Figura 12).
81
Figura 9. Distribución de la edad en semanas para pollito.
Fuente. El autor
3.4 HISOPO CLOACAL.
En las muestras de hisopo cloacal tomadas durante el periodo de estudio se
encontraron 330 reportadas en el FURM (Tabla 33) de los cuales el 50,91%, no
reportaron el sexo. De los que si fueron reportados, 100 son muestras provenientes de
hembras que corresponden al 30% del total. Un pequeño 6,36% reportó que la muestra
provenía de machos y 41 casos (12.42) reportaron sexo mixto.
0%
5%
10%
15%
20%
25%
30%
35%
40%
45%
0 2 4 6 8 10 12
Po
rcen
taje
DIA
POLLITO EDAD EN DÍAS
82
Tabla 33. Relación del sexo en las muestras de hisopo cloacal.
HISOPO CLOACAL
SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE
HEMBRA 100 30,30%
MACHO 21 6,36%
MIXTO 41 12,42%
NR 168 50,91%
Total 330 100,00%
Fuente. El autor
Las edades se distribuyeron entre 4 y 48 días y entre 4 y 918 semanas. Este último
puede notarse representa un ave de bastante edad, de lo cual se puede deducir que es
algún tipo de especie exótica (Tabla 34).
Tabla 34. Descripción de edades en las muestras de hisopos cloacales.
EDAD EN MUESTRAS DE HISOPOS CLOACALES
Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación
típica
Coef.
variación
DIA 75 4,00 48,00 32,15 12,35 0,38
SEM 196 4 918 38,237 93,162 2,44
Fuente. El autor
El promedio de edades se obtuvo de 32 días y 38 semanas aproximadamente con lo
cual se puede intuir que la edad resaltada anteriormente (918 semanas) se encuentra
muy lejos de la media, siendo así un valor atípico. Esto se puede corroborar
observando las dispersiones ya que en días se tiene una dispersión de 38% sobre 75
individuos mientras que en semanas la dispersión supera el 200%. A continuación se
verán los histogramas correspondientes (Figuras 13 y 14):
83
Figura 10. Distribución de la edad en semanas días para hisopo cloacal
Fuente. El autor
Figura 11. Distribución de la edad en para hisopo cloacal.
Fuente. El autor
Como se afirmó, la edad por semanas presenta un bache de más de 300 semanas
ocasionado por datos muy grandes en comparación al total, mientras que la distribución
de los días es mucho más homogénea. Observemos la tabla de frecuencias de las
edades por días para estudiar esta situación:
0
0,05
0,1
0,15
0,2
0,25
0,3
0,35
0,4
0,45
0,5
0 10 20 30 40 50 60
Frec
uen
cia
rela
tiva
DIA
Edad de hisopo cloacal en dias
0
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
0,6
0,7
0,8
0,9
1
0 200 400 600 800 1000
Frec
uen
cia
rela
tiva
SEM
Edad de hisopo cloacal en semanas
84
Tabla 35. Intervalos para la edad en días de hisopo cloacal.
Fuente. El autor
Las frecuencias encontradas están casi en su totalidad entre 1 y 154 semanas, tan solo
2 entre 154 y 460 y otras 2 con valores muy superiores (Tabla 35).
Revisando los datos originales, se encontraron 3 edades muy superiores a las demás
que fueron de 364, 864 y 918 semanas. Para lograr una descripción más precisa, es
conveniente extraer estos tres puntos y repasar el comportamiento de los otros 193:
Tabla 36. Descripción de edades en las muestras de hisopos cloacales.
EDAD EN MUESTRAS DE HISOPO CLOACAL
Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación típica Coef.
Variación
SEM 193 4 156 27,712 23,834 0,86
Fuente. El autor
Como se predijo, con los 193 datos restantes la edad máxima es de 156 semanas y la
variabilidad es ahora casi aceptable (86%) sobre este conjunto de datos. El histograma
(Figura 15) muestra cómo se distribuyen las edades en este rango disminuyendo las
INTERVALO EDAD EN DÍAS
Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa Densidad
1,00 154,17 192 0,980 0,006
154,17 307,33 1 0,005 0,000
307,33 460,50 1 0,005 0,000
460,50 613,67 0 0,000 0,000
613,67 766,83 0 0,000 0,000
766,83 920,00 2 0,010 0,000
85
frecuencias de manera progresiva lo que nos permite capturar como se encuentran los
datos sobre el total.
Figura 12. Distribución de la edad en semanas para hisopo cloacal
Fuente. El autor
3.5 HISOPO TRAQUEAL
El total de muestras de hisopos traqueales fue de 232, de las cuales
144correspondiente al 62%, no reportaron el sexo del cual provenían, las muestras de
hembras son 49, de mixtos 35 y de machos solamente 4 (Tabla 37).
Tabla 37. Relación del sexo en las muestras de hisopo traqueal.
HISOPO TRAQUEAL
SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE
HEMBRA 49 21,12
MACHO 4 1,72
MIXTO 35 15,09
NR 144 62,07
Total 232 100,00
Fuente. El autor
0
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
0,6
0,7
0 50 100 150
Frec
uen
cia
rela
tiva
SEM
Edad de hisopo cloacal por semana (sin datos atipicos)
86
De los 232 casos con muestra de hisopo traqueal, sólo 43 reportan la edad en días, las
edades están entre 3 y 48 días, el promedio corresponde a 31,88 días, la desviación
típica es de 11,41 días y el coeficiente de variación equivale a 35,80%, siendo el valor
más bajo hallado en el análisis de los distintos tipos de muestras, lo que indica que la
muestra de hisopo traqueal en días es la que presenta menor variabilidad en las
edades (Tabla 38).Por el contrario, el reporte por semanas se puede observar un valor
extremo (156) que se encuentra muy distante del valor promedio lo cual genera grana
dispersión (81.30%) de esta información.
Tabla 38. Descripción de edades en las muestras de hisopos traqueales.
EDAD EN MUESTRAS DE HISOPOS TRAQUEALES
Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación
típica
Coef.
Variación
DIA 43 3 48 31,884 11,415 0,358
SEM 146 4 156 25,798 20,981 0,813
Fuente. El autor
Aunque este valor de variabilidad es similar al de hisopo cloacal en semanas, se decide
revisar las frecuencias presentes para los datos en busca de posibles valores atípicos
antes de presentar los histogramas presentados en la tabla 39.
Tabla 39. Intervalos para la edad en semanas de hisopo traqueal.
INTERVALO EDAD EN SEMANAS
Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa Densidad
1 27,5 92 0,630 0,024
27,5 54 41 0,281 0,011
54 80,5 12 0,082 0,003
80,5 107 0 0,000 0,000
107 133,5 0 0,000 0,000
133,5 160 1 0,007 0,000
Fuente. El autor
87
Como se puede observar, existe un vacío de información entre 80 y 133 semanas
generado por un dato atípico que debe ser el valor extremo para esta variable.
Extrayendo el dato y revisando la distribución de la edad en semanas se observa lo
siguiente.
Tabla 40. Descripción de edades en las muestras de hisopos cloacales.
EDAD EN MUESTRAS DE HISOPO TRAQUEAL
Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación
típica
Coef.
Variación
SEM 145 4 80 24,900 18,020 0,724
Fuente. El autor
La máxima edad encontrada es de 80 semanas no muy lejano del promedio (25 sem
aprox) lo que reduce considerablemente la dispersión. Para concluir si el promedio es
un buen representante o no de la variable se puede analizar los Figuras16 y
17(histogramas) de distribución de frecuencias:
Figura 13. Distribución de la edad en días para hisopo traqueal.
Fuente. El autor
0
0,05
0,1
0,15
0,2
0,25
0,3
0,35
0 10 20 30 40 50
Frec
uen
cia
rela
tiva
DIA
Edad de Hisopo Traqueal en dias
88
Figura 14. Distribución de la edad en semanas para hisopo traqueal
Fuente. El autor
A diferencia que las muestras anteriores, las edades por día aumentan su frecuencia a
medida que aumenta la edad de las aves a las cuales se les toman hisopos traqueales.
En cambio, la edad en semanas mantiene su estructura descendente con la diferencia
de que en este caso la disminución no es exponencial sino lineal.
3.6 AVE
El total de casos que contenían como muestra aves completas es de 153. La mayor
representación es de las hembras con que corresponde al 57% de los casos y la menor
cantidad fueron las muestras de mixtos con 20 casos que es el 14% del total. (Tabla
41)
0
0,05
0,1
0,15
0,2
0,25
0,3
0,35
0 20 40 60 80
Frec
uen
cia
rela
tiva
SEM
Edad de Hisopo traqueal en semanas (sin dato atípico)
89
Tabla 41. Relación del sexo en las muestras de ave.
AVE
SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE
HEMBRA 87 56,86
MACHO 21 13,73
MIXTO 20 13,07
NR 25 16,34
Total 153 100,00
Fuente. El autor
Tabla 42. Descripción de edades en las muestras de ave.
EDAD EN MUESTRAS DE AVES
Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación
típica
Coeficiente
variación
DIA 44 1,00 98,00 28,95 18,70 64,58
SEM 96 2 82 29,156 18,733 64.20
Fuente. El autor
El promedio de días fue de 29 días y 29 semanas (aprox) sin embargo, no se podría
referenciar el conjunto total de individuos con estos valores ya que existe una
dispersión grande de los datos la cual se puede medir observando el coeficiente de
variación que representa variabilidad del 64% en ambos casos. Con esta información
no es suficiente leer el comportamiento de las edades de estas muestras, por lo cual se
revisaran los histogramas. (Figuras 15 y 16)
90
Figura 15. Distribución de la edad en días para ave
Fuente. El autor
Figura 16. Distribución de la edad en semanas para ave.
Fuente. El autor
0
0,05
0,1
0,15
0,2
0,25
0,3
0,35
0,4
0 20 40 60 80 100 120
Frec
uen
cia
rela
tiva
DIA
Edad de Aves por dia
0
0,05
0,1
0,15
0,2
0,25
0,3
0,35
0,4
0 20 40 60 80
Frec
uen
cia
rela
tiva
SEM
Edad de Aves por semana
91
Tabla 43. Intervalos para la edad en días de ave.
INTERVALOS EDADES EN DÍAS
Límite
inferior
Límite
superior
Frecuencia Frecuencia
relativa
1 18 12 0,27
18 35 17 0,39
35 52 11 0,25
52 69 3 0,07
69 86 0 0,00
86 103 1 0,02
Fuente. El autor
Tabla 44. Intervalos para la edad en semanas de ave.
INTERVALOS EDADES EN SEMANAS
Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa
1,00 14,67 22 0,23
14,67 28,33 37 0,39
28,33 42,00 17 0,18
42,00 55,67 8 0,08
55,67 69,33 7 0,07
69,33 83,00 5 0,05
Fuente. El autor
Ambas mediciones (días y semanas) muestran una fuerte acumulación de edades en
los valores más pequeños, lo que explica la posición de la media respecto a los valores
extremos (sesgo) y los altos coeficientes de variación. Además la disminución de casos
con edades más grandes de forma progresiva (parte derecha del histograma) permite
92
deducir que es normal que las muestras de aves sean más comunes las jóvenes que
de altas edades.
3.7 HECES
Las muestras de heces enviadas a los laboratorios del ICA correspondieron a 146
casos. (El 85,6% hace referencia a las muestras provenientes de las hembras, que
corresponde a 125 casos, el 8,9% pertenece a los casos en los cuales no se reportó el
sexo, el 4,2% corresponde a los 6 casos de mixtos y sólo se presentaron 2 casos de
machos con el 4% (Tabla 45).
Tabla 45. Relación del sexo en las muestras de heces.
HECES
SEXO FRECUENCIA PORCENTAJE
HEMBRA 125 85,62%
MACHO 2 1,37%
MIXTO 6 4,11%
NR 13 8,90%
Total 146 100,00%
Fuente. El autor
Las edades se presentaron entre 1 y 56 días y de 2 a 36 semanas respectivamente y
con promedios de 29,3 días y 8.2 semanas. Pero se puede ver que la dispersión no es
coherente para las semanas. Observando el coeficiente de variación para este caso, es
superior a 1 (100%) que indica una dispersión total de los datos. De esta forma no es
posible tener en cuenta que las muestras son en promedio de 8.2 semanas (Tabla 46).
93
Tabla 46. Descripción de edades en las muestras de heces.
EDAD EN MUESTRAS DE HECES
Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación
típica
Coeficiente
variación
DIA 122 1,00 56,00 29,33 12,02 0,4098
SEM 15 2 36 8,200 8,809 1,074
Fuente. El autor
Como se observa en los histogramas (Figuras 17 y 18), en el caso de semanas tiene
un “bache” lo que puede estar ocasionando la dispersión tan grande que se observa en
el coeficiente. La causa de esto puede ser la existencia de datos atípicos en el conjunto
de edades que, aunque solo son 15, deben presentar este tipo de datos.
Figura 17. Distribución de la edad en días para heces.
Fuente. El autor
0
0,05
0,1
0,15
0,2
0,25
0,3
0,35
0,4
0,45
0 10 20 30 40 50 60 70
Frec
uen
cia
rela
tiva
DIA
Edad de heces por dias
94
Figura 18. Distribución de la edad en semanas para heces.
Fuente. El autor
Observemos la tabla de frecuencia:
Tabla 47. Intervalos para la edad en semanas para heces.
INTERVALOS EDAD EN SEMANAS
Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa Densidad
1 8 11 0,733 0,105
8 15 2 0,133 0,019
15 22 1 0,067 0,010
22 29 0 0,000 0,000
29 36 0 0,000 0,000
36 43 1 0,067 0,010
Fuente. El autor
La tabla muestra que es existe un bache entre 22 y 36 semanas generado por un dato
que se encuentra entre 36 y 43 semanas. El análisis realizado extrayendo dicho dato
del conjunto mejoraría significativamente la descripción de los mismos. A continuación
se presentara el análisis sin este dato.
0
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
0,6
0,7
0,8
0 10 20 30 40 50
Frec
uen
cia
rela
tiva
SEM
Edad de Heces por semana
95
Tabla 48. Descripción de edades en las muestras de heces.
EDAD EN MUESTRAS DE HECES
Variable Observaciones Mínimo Máximo Media Desviación
típica
Coeficiente
Variación
SEM
14
2
20
6,214
4,458
0,717
Fuente. El autor
Extrayendo un dato correspondiente a 36 semanas se puede observar que los datos,
aun bien dispersos, mejoran considerablemente su distribución. Por esto se decide
describir la variable de esta forma pues existen pocos datos para realizar ajustes más
detallados (extraer más datos).
Figura 19. Distribución de la edad en semanas para heces.
Fuente. El autor
0
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
0,6
0,7
0 5 10 15 20 25 30
Frec
uen
cia
rela
tiva
SEM
Edad de Heces por semanas
96
La nueva media es de 6 semanas aproximadamente con una variabilidad de 71% sobre
los datos (Figura 19).
3.8 LABORATORIO DE ENVÍO
La tabla 49 muestra la participación de los laboratorios en el ingreso de los casos que
se recopilaron para este estudio. Los casos que llegan con remisión al CEISA incluyen
muestras para efectuar pruebas que en los laboratorios regionales no se realizan.
Tabla 49. Participación de los departamentos en el ingreso de casos a los LDV – ICA.
LABORATORIOS DE ENVÍO
LABORATORIO FRECUENCIA PORCENTAJE
La Dorada 1 0,05%
Aguachica 3 0,14%
Sogamoso 6 0,27%
Sincelejo 7 0,32%
Arauca 10 0,45%
Cartagena 11 0,50%
Cúcuta 19 0,86%
Florencia 19 0,86%
Manizales 24 1,09%
Pasto 25 1,13%
Popayán 25 1,13%
Valledupar 27 1,23%
Montería 28 1,27%
Bello 35 1,59%
Villavicencio 36 1,63%
Yopal 36 1,63%
Bucaramanga 46 2,09%
97
LABORATORIOS DE ENVÍO
LABORATORIO FRECUENCIA PORCENTAJE
Barranquilla 47 2,13%
Neiva 71 3,22%
Armenia 75 3,40%
Cali 134 6,08%
Ibagué 239 10,84%
Bogotá 479 21,73%
Tuluá 801 36,34%
Total 2204 100,00%
Fuente. El autor
El caso debe llegar con toda la información manifiesta en el FURM y es foliado de
acuerdo a la gestión de las tablas de retención documental ordenada por la ley.
El laboratorio que recibe la mayor cantidad de muestras es el de Tuluá, ya que recopiló
el 36,34% del total de los casos, le sigue CEISA - Bogotá con 21,73% e Ibagué
10,84%. Los demás laboratorios hicieron un aporte menor al 10% a la casuística en el
período 2009 – 2011.
Figura 20. Porcentaje de muestras procesadas por LDV – ICA.
Fuente. El autor
77,17%
0,18%
22,66%
Pruebas realizadas por laboratorio
CEISA IBAGUE TULUA
98
El laboratorio que procesó mayor cantidad de muestras fue el CEISA con el 77,17%, le
sigue el laboratorio de Tuluá con 22,66% y en tercer lugar está Ibagué con sólo el
0,18% (Figura 20).
3.9 TRATAMIENTO
Los resultados del análisis de la aplicabilidad y la implementación de tratamientos en
las distintas explotaciones aviares durante el período en estudio se aprecian en la tabla
50.
Tabla 50. Implementación de tratamientos.
TRATAMIENTO
FRECUENCIA PORCENTAJE
NO APLICA 501 22,73%
SI 164 7,44%
NO 1539 69,83%
Total 2204 100,00%
Fuente. El autor
Para 501 casos del total (22,73%) no aplica la variable tratamiento por estar ligada al
motivo de solicitud. En el resto de casos que corresponde al77,27% los cuales
presentaban signos clínicos, sólo un 7,44% fueron tratados con medicamentos,
mientras que la mayoría de ellos (69,83%) no tuvieron ningún tipo de tratamiento.
Queda claro que no existe una información completa y veraz en el tema de la
formulación de fármacos. Es posible que sea un fenómeno cultural ligado a que es un
ente de control sanitario quien solicita esta información y los usuarios no admitan el uso
de medicamentos que deben tener registro y tiempo de retiro.
99
3.10 POBLACIÓN
La variable población total de aves de las granjas u otros sitios de donde provienen las
muestras durante los años 2009 – 2011 se muestra en la Tabla 51. De los 2204 casos
incluidos en el estudio solamente 1639 debían reportar el total de la población del lugar
de procedencia y1090 casos correspondientes al 66,50% lo hicieron y los que no, es
decir, el 33,50% aparece en blanco la casilla correspondiente en el FURM.
Tabla 51. Reporte de población total de los lugares de procedencia.
POBLACIÓN
FRECUENCIA PORCENTAJE
REPORTA 1090 66,50%
NO REPORTA 549 33,50%
Total 1639 100,00%
Fuente. El autor
Figura 21. Distribución de la población total de aves.
Fuente. El autor
0
0,000002
0,000004
0,000006
0,000008
0,00001
0,000012
0,000014
0,000016
0 50000 100000 150000 200000 250000 300000 350000
Frec
uen
cias
TOTAL
Poblaciòn de aves
100
Tabla 52. Intervalos de la población total.
INTERVALOS POBLACIÓN TOTAL
Límite inferior Límite superior Frecuencia Frecuencia relativa
1 55.000 912 0,84
55.000 110.000 127 0,12
110.000 165.000 32 0,03
165.000 220.000 11 0,01
220.000
275.000 2 0,00
275.000 330.000 6 0,01
Fuente. El autor
En el Figura 21 se observa que la mayoría de los datos de la población total se
concentran en el primer intervalo, que corresponde poblaciones entre 1 y 55.000 aves,
el número de casos es de 912 y el porcentaje respectivo es 84% (Tabla 52). Granjas
con población mayor a 50.000 aves son poco comunes como se demuestra con el
análisis.
Este estudio se puede hacer más estricto si se logran separar las granjas registradas,
el tipo de explotación y solicitudes de particulares que tienen aves como mascotas
entre otras.
3.11 PRUEBAS DE LABORATORIO
Las pruebas de laboratorio fueron catalogadas por enfermedad para su análisis. De
esta manera se hallaron las frecuencias, porcentajes y resultados arrojados en cuanto
a si fue identificado el agente o no.
101
3.12 NEWCASTLE -ENC
El examen para la ENC solicitado con mayor frecuencia es la inhibición de la
hemaglutinación (HI) con 1012 casos, le siguen las pruebas moleculares con 725 casos
y por último el aislamiento viral con 700 casos. El número total de pruebas realizadas
para esta enfermedad fue de 2437. El laboratorio que procesó mayor cantidad de
muestras fue CEISA- Bogotá con 2010 casos (Tabla 53).
Tabla 53. Laboratorios y pruebas realizadas para ENC.
PRUEBAS PARA ENC
PRUEBA CEISA TULUÁ TOTAL
FREC.
TOTAL %
FREC. % FREC. %
Molecular 721 29,59% 4 0,16% 725 29,75%
Serología HI 597 24,50% 415 17,03% 1012 41,53%
Virología -
Aislamiento
692 28,40% 8 0,33% 700 28,72%
Total 2010 82,48% 427 17,52% 2437 100,00%
Fuente. El autor
De las 2437 muestras procesadas para ENC el 82,48% se realizó en CEISA- Bogotá y
el 17,52% restante se procesó en el laboratorio de Tuluá. El porcentaje de HI
solicitados fue 41,53%, las pruebas moleculares tuvieron el 39,75% y el aislamiento
28,72%.
Las pruebas realizadas para ENC tuvieron 1885 resultados negativos, de los cuales
919 correspondieron a la serología, 521 a virología y 445 a pruebas moleculares. De
los 552 resultados positivos, 280 son de pruebas moleculares, 179 de aislamiento viral
y 93 de serología HI (Tabla 54).
102
Tabla 54. Resultados de las pruebas realizadas para ENC.
FRECUENCIA DE CASOS DE ENC POR PRUEBA
DIAGNÓSTICA
PRUEBA N P TOTAL
Molecular 445 280 725
Serología HI 919 93 1012
Virología-Aislamiento 521 179 700
Total 1885 552 2437
Fuente. El autor
Con estos resultados vemos que la incidencia de la ENC es baja si observamos que
solo el 22.7% de los resultados de los exámenes son positivos. Esto coincide con los
resultados del estudio de prevalencia realizado por el ICA en este mismo periodo,
demostrando que esta enfermedad está siendo controlada y que son otros los agentes
causantes del síndrome respiratorio.
3.13 BRONQUITIS INFECCIOSA AVIAR – IBV
Para Bronquitis Infecciosa (IBV) se realizaron 490 pruebas en total. La prueba más
realizada fue ELISA con 254 casos, le siguen las pruebas moleculares con 227 casos,
inhibición de la hemaglutinación y el aislamiento viral tuvieron 7 y 2 casos
respectivamente. El laboratorio que más procesó muestras fue el CEISA con 363
pruebas y Tuluá realizó 127 pruebas.
103
Tabla 55. Laboratorios y pruebas realizadas para IBV.
PRUEBAS PARA IBV
PRUEBA CEISA TULUÁ TOTAL
FREC.
TOTAL
% FREC. % FREC. %
Virología - Aislamiento 2 0,41% 0 0,00% 2 0,41%
Molecular 226 46,12% 1 0,20% 227 46,33%
Serología HI 6 1,22% 1 0,20% 7 1,43%
Serología ELISA 129 26,33% 125 25,51% 254 51,84%
Total 363 74,08% 127 25,92% 490 100,00%
Fuente. El autor
El CEISA- Bogotá procesó el 74,08% de las muestras y el laboratorio de Tuluá el
25,92%. El porcentaje de ELISA corresponde al 51,84% de los casos, las pruebas
moleculares son el 46,33%, HI el 1,43% y el aislamiento viral el 0,41% (Tabla 55). Las
pruebas negativas para IBV fueron 165, las que tuvieron resultado positivo
corresponden a 325, de las cuales 238 fueron de ELISA, 82 de pruebas moleculares y
5 de serología HI (Tabla 56).
Tabla 56. Resultados de las pruebas realizadas para IBV.
FRECUENCIA DE CASOS DE IBV POR PRUEBA DIAGNÓSTICA
PRUEBA N P TOTAL
Virología - Aislamiento 2 0 2
Molecular 145 82 227
Serología HI 2 5 7
Serología ELISA 16 238 254
Total 165 325 490
Fuente. El autor
104
El 66.3% de resultados positivos revelan la magnitud de esta enfermedad en Colombia.
Esto es revelador si tenemos en cuenta que muchos de los exámenes provienen de
diagnósticos diferenciales cuyo costo es asumido por los usuarios y muchos de ellos
son pequeños productores (como se vio anteriormente en la variable identificación del
usuario) que no tienen la capacidad económica para solicitar este examen.
3.14 LARINGOTRAQUEITIS INFECCIOSA AVIAR – ILT
Del total de muestras procesadas para ILT el 51,37% fueron serologías, el 30,49%
correspondió a pruebas moleculares y el 18,13% a virología. El 96,43% de las
muestras fueron procesadas en el CEISA- Bogotá y solamente el 3,57% en el
laboratorio de Tuluá (Tabla 57).
Tabla 57. Laboratorios y pruebas realizadas para ILT.
PRUEBAS PARA ILT
PRUEBA CEISA TULUÁ TOTAL
FREC.
TOTAL
% FREC. % FREC. %
Molecular 109 29,95% 2 0,55% 111 30,49%
Serología ELISA 177 48,63% 10 2,75% 187 51,37%
Virología - Aislamiento 65 17,86% 1 0,27% 66 18,13%
Total 351 96,43% 13 3,57% 364 100,00%
Fuente. El autor
Las pruebas para ILT cuyo resultado fue negativo fueron 149 y las positivas 215. Para
ELISA el número de negativas fue 22 y positivas 165, de las pruebas moleculares 66
fueron negativas y 45 positivas, el aislamiento viral dio 61 resultados negativos y 5
positivos (Tabla 58).
105
Tabla 58. Resultados de las pruebas realizadas para ILT.
FRECUENCIADE CASOS DE ILT POR PRUEBA
DIAGNÓSTICA
PRUEBA N P TOTAL
Molecular 66 45 111
Serología ELISA 22 165 187
Virología - Aislamiento 61 5 66
Total 149 215 364
Fuente. El autor
Los resultados positivos fueron el 59% de las muestras examinadas, quiere decir esto
que no es una enfermedad fácilmente identificable y que su sintomatología no
presenta indicios concluyentes que permitan un diagnóstico presuntivo certero.
3.15 GUMBORO – BURSITIS INFECCIOSA AVIAR – IBD
Las pruebas para IBD fueron realizadas únicamente en el CEISA- Bogotá y
corresponden a 110 casos, 62 de ellos son pruebas moleculares, 42 son ELISAs y sólo
se realizó un aislamiento viral. El porcentaje de pruebas moleculares corresponde al
60,91% de los casos, sigue ELISA con 38,18% y por último el aislamiento viral con el
0,91% (Tabla 59).
106
Tabla 59. Laboratorios y pruebas realizadas para Gumboro.
PRUEBAS PARA GUMBORO
PRUEBA CEISA TOTAL FREC. TOTAL %
FREC. %
Virología – Aislamiento 1 0,91% 1 0,91%
Molecular 67 60,91% 67 60,91%
Serología ELISA 42 38,18% 42 38,18%
Total 110 100,00% 110 100,00%
Fuente. El autor
Las pruebas negativas son 37 y las positivas son 73, de estas 38 corresponden a
ELISA y 35 a pruebas moleculares (Tabla 60).
Tabla 60. Resultados de las pruebas realizadas para Gumboro.
FRECUENCIA DE CASOS DE GUMBORO POR PRUEBA DIAGNÓSTICA
PRUEBA N P TOTAL
Virología – Aislamiento 1 0 1
Molecular 32 35 67
Serología ELISA 4 38 42
Total 37 73 110
Fuente. El autor
Esta enfermedad tiene control vacunal y es costumbre entre los productores
suministrarla en las diferentes explotaciones. La prueba de ELISA se usa para
establecer los perfiles de anticuerpos y aunque es la prueba más solicitada su
demanda de servicio al ICA no es tan alta para satisfacer el gran número de usuarios
registrados. Es posible que estos estudios sean realizados en otros laboratorios, dato
que se podrá obtener cuando estos reporten sus resultados.
107
3.16 INFLUENZA AVIAR – IA
El porcentaje correspondiente a las pruebas realizadas en el CEISA - Bogotá es de
80,51% y en Tuluá es de 19,43%. La virología tuvo una participación del 31,93% del
total de las pruebas, ELISA el 28,28%, las pruebas moleculares se realizaron en un
22,32% y HI en el 17,41% (Tabla 61).
Tabla 61. Laboratorios y pruebas realizadas para Influenza.
PRUEBAS PARA INFLUENZA
PRUEBA CEISA TULUÁ TOTAL
FREC.
TOTAL %
FREC. % FREC. %
Molecular 465 22,32% 0 0,00% 465 22,32%
Serología 555 26.65% 398 19.11% 953 45.75%
Virología - Aislamiento 657 31,54% 8 0,38% 665 31,93%
Total 1677 80,51% 406 19,49% 2083 100,00%
Fuente. El autor
El total de las 2083 muestras procesadas para Influenza tuvieron resultado negativo
(Tabla 62).
Tabla 62. Resultados de las pruebas realizadas para Influenza.
FRECUENCIA DE CASOS DE INFLUENZA POR PRUEBA DIAGNÓSTICA
PRUEBA N TOTAL
Molecular 465 465
Serología ELISA 589 589
Serología HI 364 364
Virología - Aislamiento 665 665
Total 2083 2083
Fuente. El autor
108
Aunque fue diagnosticada presuntivamente en unos cuantos casos (70), la gran
cantidad de pruebas reportadas en este estudio corresponde a políticas de control
oficial ligadas a la estricta vigilancia de esta enfermedad. Cuando ingresa una serología
asociada a ENC se corre paralela la prueba de IA para aprovechar la muestra y el
recurso de laboratorio.
3.17 MYCOPLASMA
El número de pruebas realizadas para Micoplasma fue 93, de las cuales 87 fueron
pruebas moleculares y sólo 6 cultivos. El total de muestras se procesaron en el CEISA-
Bogotá (Tabla 63).El porcentaje de pruebas moleculares realizadas para el diagnóstico
de Micoplasma fue 93,55% y los cultivos corresponden al 6,45%
Tabla 63. Laboratorios y pruebas realizadas para Micoplasma.
PRUEBAS PARA MICOPLASMA
PRUEBA CEISA TOTAL FREC. TOTAL %
FREC. %
Cultivo 6 6,45% 6 6,45%
Molecular 87 93,55% 87 93,55%
Total 93 100,00% 93 100,00%
Fuente. El autor
Los resultados negativos para Micoplasma fueron 83, de estos 6 corresponden a
cultivos y 77 a pruebas moleculares, los 10 resultados positivos fueron de pruebas
moleculares (Tabla 64).
109
Tabla 64. Resultados de las pruebas realizadas para Micoplasma.
FRECUENCIA DE CASOS DE MICOPLASMA POR
PRUEBA DIAGNÓSTICA
PRUEBA N P TOTAL
CULTIVO 6 0 6
MOLECULAR 77 10 87
Total 83 10 93
Fuente. El autor
La frecuencia positiva de este patógeno es baja. Este agente no es muy común
encontrarlo como causa primaria de enfermedad y su efecto no es de alta
patogenicidad, estas razones influyen en las pocas solicitudes de identificación por los
usuarios corrientes. Sin embargo, para las importaciones de material genético y las
exportaciones de productos avícolas es un requisito y aquí se ve reflejada esa
actividad.
3.18 SALMONELLA
El total de muestras procesadas para Salmonella es de 315, de ellas 312 corresponden
a cultivos y sólo 3 a tipificación. El CEISA – Bogotá fue el laboratorio que más recibió
muestras para su procesamiento, 224 fue el número correspondiente, mientras que el
laboratorio de Tuluá sólo procesó 91 (Tabla 65).
110
Tabla 65. Laboratorios y pruebas realizadas para Salmonella.
PRUEBAS PARA SALMONELLA
PRUEBA CEISA TULUÁ TOTAL
FREC.
TOTAL %
FREC. % FREC. %
Cultivos 222 70,48% 90 28,57% 312 99,05%
Tipificación 2 0,63% 1 0,32% 3 0,95%
Total 224 71,11% 91 28,89% 315 100,00%
Fuente. El autor
El porcentaje de cultivos realizados para Salmonella fue 99,05%, mientras que la
tipificación fue solamente el 0,95%. Las pruebas realizadas en el CEISA- Bogotá
corresponden al 77,11% y las realizadas en Tuluá al 28,89% (Tabla 65).
Los resultados negativos para Salmonella fueron 304, de estos 303 corresponden a los
cultivos y sólo 1 a tipificación, los resultados positivos fueron solamente 11, de los
cuales 9 eran de cultivos y 2 de tipificación (Tabla 66).
Tabla 66. Resultados de las pruebas realizadas para Salmonella.
FRECUENCIA DE CASOS DE SALMONELLA POR PRUEBA DIAGNÓSTICA
PRUEBA N P TOTAL
CULTIVOS 303 9 312
TIPIFICACIÓN 1 2 3
Total 304 11 315
Fuente. El autor
111
Aunque las pruebas de identificación de salmonella son comunes y se deberían realizar
en todos los LDV por su importancia en la salud pública, se ven pocos casos que estén
por fuera de los controles a que son sometidos los procesos de importaciones y
exportaciones, al igual que toda la gama de explotaciones de genética.
3.19 PASTEURELLA
Para Pasteurella únicamente se realizaron 68 cultivos, de ellos 48 se realizaron en el
CEISA - Bogotá, 19 en el laboratorio de Tuluá y en Ibagué se realizó un solo cultivo
(Tabla 67).
Tabla 67. Laboratorios y pruebas realizadas para Pasteurella.
PRUEBAS PARA PASTEURELLA
PRUEBA CEISA IBAGUÉ TULUÁ TOTAL
FREC.
TOTAL
% FREC. % FREC. % FREC. %
Cultivos 48 70,59% 1 1,47% 19 27,94% 68 100,00%
Total 48 70,59% 1 1,47% 19 27,94% 68 100,00%
Fuente. El autor
El porcentaje correspondiente a cada laboratorio es de 70,59% para el CEISA, 27,94%
para Tuluá y el 1,47% para Ibagué (Tabla 67).
De los 68 cultivos realizados para Pasteurella tuvieron resultado negativo 58 casos y
positivo en 10 casos (Tabla 68).
112
Tabla 68. Resultados de las pruebas realizadas para Pasteurella.
FRECUENCIA DE CASOS DE PASTEURELLA POR PRUEBA DIAGNÓSTICA
PRUEBA N P TOTAL
CULTIVOS 58 10 68
Total 58 10 68
Fuente. El autor
Se realizaron 22 cultivos para Haemophilus, de estos 10 se efectuaron en el CEISA y
12 en Tuluá (Tabla 68).
Estas pruebas son económicas y ayudan a identificar la asociación del patógeno en el
síndrome respiratorio. La baja positividad en los resultados revela que no es tan
incidente y por su condición de bacteria puede ser controlada con antibióticos
3.20 AEMOPHILUS GALLINARUM – CORIZA
El 54,55% de los cultivos para Haemophilus se practicaron en el laboratorio de Tuluá y
el 45,45% en el CEISA (Tabla 69).
Tabla 69. Laboratorios y pruebas realizadas para Haemophilus.
PRUEBAS PARA HAEMOPHILUS
PRUEBA CEISA TULUÁ TOTAL
FREC.
TOTAL %
FREC. % FREC. %
Cultivos 10 45,45% 12 54,55% 22 100,00%
Total 10 45,45% 12 54,55% 22 100,00%
Fuente. El autor
113
Los cultivos dieron resultado negativo en 21 casos y positivo en sólo un caso (Tabla
70).
Tabla 70. Resultados de las pruebas realizadas para Haemophilus.
FRECUENCIA DE CASOS DE HAEMOPHILUS POR
PRUEBA DIAGNÓSTICA
PRUEBA N P TOTAL
CULTIVOS 21 1 22
Total 21 1 22
Fuente. El autor
Esta enfermedad tiene varios subtipos y existe vacuna para el caso de H Sinoviae que
en las explotaciones de reproductoras son de obligada administración dentro del plan
de manejo. Estos resultados reflejan que no es del usuario común solicitar este
examen.
3.21 E. COLI
Para la identificación de E. Coli se realizaron en total 268 pruebas, de estas 266
corresponden a cultivos y 2 a tipificación. La mayor cantidad de pruebas se hizo en el
CEISA con 198, le sigue Tuluá con 69 y por último está Ibagué con un solo caso.
(Tabla 71).
114
Tabla 71. Laboratorios y pruebas realizadas para E. Coli.
PRUEBAS PARA E. COLI
PRUEBA CEISA IBAGUÉ TULUÁ TOTAL
FREC.
TOTAL
% FREC. % FREC. % FREC. %
CULTIVOS 197 73,51% 1 0,37% 68 25,37% 266 99,25%
TIPIFICACIÓN 1 0,37% 0 0,00% 1 0,37% 2 0,75%
Total 198 73,88% 1 0,37% 69 25,75% 268 100,00%
Fuente. El autor
El porcentaje de cultivos para E. Coli es de 99,25% y de tipificación el 0,75%. El
73,88% de las pruebas se realizaron en el CEISA, el 25,75% en Tuluá y el restante
0,37% en Ibagué (Tabla 71).
Los resultados negativos para E. Coli son 76 y los resultados positivos son 192 (Tabla
72).
Tabla 72. Resultados de las pruebas realizadas para E. Coli.
FRECUENCIA DE CASOS DE E. COLI POR
PRUEBA DIAGNÓSTICA
PRUEBA N P TOTAL
CULTIVOS 75 191 266
TIPIFICACIÓN 1 1 2
Total 76 192 268
Fuente. El autor
Generalmente la E. Coli está asociada a otros agentes y se considera oportunista de
las infecciones primarias. Por lo tanto es común encontrar diagnósticos de esta bacteria
sin que su presencia diga mucho respecto al verdadero agente causal.
115
3.22 ASPERGILLUS
El total de pruebas realizadas para Aspergillus es 197, de las cuales en 196 casos
corresponden a cultivos y en un solo caso a tipificación. En el CEISA se procesaron
140 pruebas, en Tuluá 52 y en Ibagué 5 pruebas (Tabla 73).
Tabla 73. Laboratorios y pruebas realizadas paraAspergillus.
PRUEBAS PARA ASPERGILLUS
PRUEBA CEISA IBAGUÉ TULUÁ TOTAL
FREC.
TOTAL
% FREC. % FREC. % FREC. %
Cultivos 139 70,56% 5 2,54% 52 26,40% 196 99,49%
Tipificación 1 0,51% 0 0,00% 0 0,00% 1 0,51%
Total 140 71,07% 5 2,54% 52 26,40% 197 100,00%
Fuente. El autor
El porcentaje de cultivos es del 99,49% y de tipificación es el 0,51%. El porcentaje de
pruebas realizadas en el CEISA es 71,07%, en Tuluá el 26,40% y en Ibagué el 2,54%
(Tabla 73). De las 197 pruebas realizadas para Aspergillus 173 fueron negativos y 24
positivos (Tabla 74).
Tabla 74. Resultados de las pruebas realizadas para Aspergillus.
FRECUENCIA DE CASOS DE ASPERGILLUS POR
PRUEBA DIAGNÓSTICA
PRUEBA N P TOTAL
CULTIVOS 172 24 196
TIPIFICACIÓN 1 0 1
Fuente. El autor
116
3.23 ANTIBIOGRAMA
Se realizaron 61 antibiogramas de los cuales 39 se practicaron en Tuluá, 21 en el
CEISA y uno en el laboratorio de Ibagué (Tabla 74).
El porcentaje correspondiente de antibiogramas realizados en Tuluá es del 63,93%, en
el CEISA fue 34,43% y en Ibagué 1,64% (Tabla 75).
Tabla 75. Relación de antibiogramas realizados en los LDV – ICA.
LABORATORIO ANTIBIOGRAMA
PRUEBA CEISA IBAGUÉ TULUÁ TOTAL
FREC.
TOTAL
% FREC. % FREC. % FREC. %
CULTIVOS 21 34,43% 1 1,64% 39 63,93% 61 100,00%
Total 21 34,43% 1 1,64% 39 63,93% 61 100,00%
Fuente. El autor
Los antibiogramas son un recurso importante en la elección de los antibióticos efectivos
para el control de las infecciones, sobre todo cuando en una explotación se ha
formulado reiteradamente una base activa o que el agente a atacar presente
resistencia. La baja frecuencia en las solicitudes del CEISA-Bogotá e Ibagué denota la
baja cultura de los profesionales y usuarios a utilizar este recurso.
117
3.24 PARASITOLOGÍA
Se realizaron en total 307 pruebas para parasitología, de las cuales 152 corresponden
a parásitos gastrointestinales (PGI) y 155 a Eimeria. El laboratorio donde se procesaron
mayor cantidad de muestras es Tuluá con 289, le sigue el CEISA con 14 muestras y
por último fue Ibagué con sólo 4 muestras.
El porcentaje correspondiente a las pruebas realizadas en Tuluá es 94,13%, en CEISA
4,56% y en Ibagué 1,28%. Las pruebas de PGI fueron el 59,51% y de Eimeria el
50,49% (Tabla 76).
Tabla 76. Laboratorios y pruebas realizadas para parasitología.
PRUEBAS PARA PARASITOLOGÍA
PRUEBA CEISA IBAGUÉ TULUÁ TOTAL
FREC.
TOTAL
% FREC. % FREC. % FREC. %
PGI 7 2,28% 2 0,64% 143 46,57% 152 49,51%
EIMERIA 7 2,28% 2 0,64% 146 47,56% 155 50,49%
Total 14 4,56% 4 1,28% 289 94,13% 307 100,00%
Fuente. El autor
De las 307 pruebas realizadas para parasitología dieron resultado negativo 160 y
positivo 147, de ellas 7 muestras corresponden a PGI y 140 a Eimeria (Tabla 77).
118
Tabla 77. Resultados de las pruebas realizadas para parasitología.
FRECUENCIA RESULTADOS PRUEBAS PARA PARASITOLOGÍA
N P TOTAL
PGI 145 7 152
EIMERIA 15 140 155
Total 160 147 307
Fuente. El autor
Los resultados revelan la incidencia de coccidia como una de las enfermedades de baja
manifestación clínica que tiende a ser crónica en detrimento económico de las
explotaciones. Aunque la vacunación está en proceso evaluativo, se debe actuar sobre
el manejo de la implementación de las buenas prácticas avícolas sobre la base de su
carácter zoonótico y que el apoyo farmacológico está a disposición en el balance costo-
beneficio.
3.25 HISTOPATOLOGÍA
El número de casos en donde no aplica la realización de estudios histopatológicos
corresponde a 1503 casos pues esta variable depende del motivo de la solicitud, el
total de casos donde se observan lesiones es de 536 y donde no se observan lesiones
165 casos (Tabla 78).
119
Tabla 78. Realización de estudios de histopatología.
HISTOPATOLOGÍA
CATEGORÍA FRECUENCIA PORCENTAJE
NO APLICA 1503 68,19%
NO SE OBSERVA LESIONES 165 7,49%
SE OBSERVA LESIONES 536 24,32%
Total 2204 100,00%
Fuente. El autor
El porcentaje correspondiente de los casos en donde no aplica la histopatología es de
68%, del restante 32% en donde se realizó este estudio, se observó lesiones en el 24%
y no se observaron en el 8%.
El Figura 22 muestra los tipos de lesiones encontradas en los tejidos enviados a los
LNDV durante el período 2009 – 2011 para su respectivo procesamiento.
Figura 22. Lesiones encontradas en la histopatología.
Fuente. El autor
75,56 7,65
52,80 22,20
6,34
2,43
1,68 0,37
27,05
0,37
24,44 92,35
47,20 77,80
93,66
97,57
98,32
99,63
72,95
99,63
SISTEMA RESPIRATORIO
SISTEMA CARDIOVASCULAR
SISTEMA DIGESTIVO
SISTEMA NERVIOSO
SISTEMA URINARIO
SISTEMA REPRODUCTIVO
PIEL
SISTEMA OSEO
SISTEMA HEMATOPOYETICO
EDEMA
Histopatología
SIN LESION CON LESION
120
Las lesiones más frecuentes son las del sistema respiratorio (75,56%), sistema
digestivo (52,80%), sistema hematopoyético (27,05%) y sistema nervioso (22,20%). En
menor proporción se encontraron lesiones en los sistemas cardiovascular, urinario y
reproductivo con 7,65%, 6,34% y 1,68%, respectivamente. Las lesiones menos
encontradas fueron en piel con 1,68%, las óseas y el edema con 0,37% igualmente
(Figura 25).
La histopatología es una herramienta que sigue estando vigente a pesar del tiempo de
instauración como técnica de ayuda diagnostica dentro de la patología clínica. Se
deben aprovechar la gran cantidad de tejidos enviados al laboratorio (que son en
volumen el segundo lugar de muestras enviadas) para su tradicional proceso que
entrega un resultado rápido y económico, o también utilizar las placas una vez leídas y
archivadas para correr novedosas pruebas moleculares como técnica de respaldo en
casos que lo ameriten.
3.26 ESTADÍSTICA ANALÍTICA
El uso de la estadística cualitativa basada en la comparación permite determinar los
modelos que explican estadísticamente cuál de las metodologías de diagnóstico es
más eficiente. Para lograr este objetivo se elaboraron tablas de contingencia y pruebas
estadísticas de riesgo a partir de las cuales se generaron los modelos de regresión
logística con el fin de establecer la asociación de variables cualitativas y determinar su
inferencia referidas al valor P. Sin embargo, cuando las valores de las casillas cruzadas
de las tablas de contingencia, no superan más de cinco unidades como valor
consolidado el software sugiere tomar el valor del test exacto de Fisher para interpretar
la respuesta.
Los resultados del análisis de asociación provienen de la comparación de los
resultados a los que fueron sometidas muestras enviadas al laboratorio; ENC, IBV,
GUMBORO, ILT, SALMONELLA Y COLI, en cada uno de los niveles diagnósticos. En
121
el caso de la variable INFLUENZA AVIAR no se encontraron resultados positivos por lo
cual es imposible establecer comparaciones y utilizarlas en este análisis.
Las tablas que representan las salidas arrojadas por el software utilizado en este
estudio, están contenidas en el Anexo 2 y son el soporte de los valores P. resumidos
en tablas presentadas a continuación por tipo de enfermedad.
3.27 NEWCASTLE – ENC
Virología. Al consolidar los valores P en la Tabla 79, vemos que hay asociación entre
las muestras; sueros, hisopos cloacales y tejidos con el resultado de las pruebas
virológicas realizadas para diagnóstico de ENC.
Tabla 79. Resumen de valores de las tablas de contingencia para virología ENC
Fuente. El autor
VIROLOGÍA VS ENC
VARIABLES VALOR P
Suero 0.0162753880
Ave 0.0879842018
Hisopo Cloacal 0.0242463355
Hisopo Traqueal 0.0800627198
Tejidos 0.0001373424
Pollito 0.1252185663*
*Valor Test exacto de Fisher
122
Para explicar el modelo de probabilidad de estimar cuál es la mejor muestra para las
pruebas virológicas de Newcastle se ejecuta el análisis de regresión logística para
variables categóricas.
Tabla 80. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a las
pruebas virológicas para ENC en función de sus resultados
Fuente. El autor
El resultado obtenido como valor P en la tabla 80, indica que la muestra suero no
explica el modelo probabilístico y debe ser excluida, por lo tanto se volverá correr para
una nueva observación.
Término Odds
Ratio 95% I.C. Coeficiente S. E. Valor de z Valor p
Mhclocal
(Yes/No) 1.5294 1.0618 2.2029 0.4249 0.1862 2.2822 0.0225
Msuero
(Yes/No) 1.2547 0.8801 1.7889 0.2269 0.1810 1.2540 0.2098
Mtejido
(Yes/No) 2.1804 1.4338 3.3158 0.7795 0.2139 3.6447 0.0003
CONSTANT * * * -1.9029 0.2141 -8.8867 0.0000
123
Tabla 81. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a las
pruebas virológicas para ENC en función de sus resultados excluyendo el suero
Fuente. El autor
Con los nuevos resultados estadísticos de esta prueba se observa en la tabla 81 que
para obtener certeza en las pruebas virológicas en el diagnóstico de la enfermedad de
Newcastle las muestras más recomendadas son los hisopos cloacales y los tejidos con
valores P= 0.0093 y 0.0001 respectivamente.
Molecular. Al consolidar los valores P en la Tabla 82, vemos que hay asociación
entre los sueros, hisopos traqueales y tejidos con el resultado de las pruebas
moleculares.
Término Odds
Ratio 95% I.C. Coeficiente S. E. Valor de z Valor p
Mhclocal
(Yes/No) 1.6059 1.1237 2.2950 0.4737 0.1822 2.6003 0.0093
Mtejido
(Yes/No) 2.2643 1.4942 3.4312 0.8173 0.2121 3.8535 0.0001
CONSTANT * * * -1.8472 0.2092 -8.8291 0.0000
124
Tabla 82. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas
Moleculares ENC
Fuente. El autor
Con estos datos procedemos a la ejecución de análisis de regresión logística para
estas variables y explicar el modelo de probabilidad para establecer cuál es la mejor
muestra para las pruebas moleculares en el diagnóstico de Newcastle.
MOLECULARES VS ENC
VARIABLES VALOR P
Suero 0.0181767069
Ave 0.2925808183
Hisopo Cloacal 0.0705228781
Hisopo Traqueal 0.0108570536
Tejidos 0.0227024514
Pollito 0.1201882944*
*Valor Test exacto de Fisher
125
Tabla 83. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a las
pruebas moleculares para ENC en función de sus resultados
Fuente. El autor
El resultado estadístico mostrado en la Tabla 83 determina que la muestra más
recomendada para optimizar el diagnóstico de la prueba molecular para ENC son los
hisopos traqueales con un valor P = 0.0372.
Serología. Al consolidar los valores P de las tablas de contingencia aplicadas a
las muestras respecto a las pruebas serológicas, procedemos a la ejecución de
análisis de regresión logística para variables categóricas de las muestras suero y
pollito por estar en el rango de asociación e intentar explicar el modelo de
probabilidad de cuál es mejor muestra para las pruebas serológicas en el
diagnóstico de Newcastle. (Tabla 84)
Término Odds
Ratio 95% I.C. Coeficiente S. E. Valor de z Valor p
Mhtraq
(Yes/No) 1.4967 1.0243 2.1869 0.4033 0.1935 2.0841 0.0372
Msuero
(Yes/No) 1.2286 0.8959 1.6848 0.2059 0.1611 1.2777 0.2014
Mtejido
(Yes/No) 1.3883 0.9937 1.9395 0.3281 0.1706 1.9230 0.0545
CONSTANT * * * -0.8622 0.1546 -5.5771 0.0000
126
Tabla 84. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Serológicas
ENC
Fuente. El autor
Tabla 85. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a las
pruebas serológicas para ENC en función de sus resultados.
Fuente. El autor
Los resultados de las pruebas estadísticas reflejados en la tabla 85 indican que los
sueros son las muestras indicadas para explicar el modelo de predicción, sin embargo,
el valor P está muy cerca del límite de aceptación de la aseveración por lo tanto, la
construcción de mapeos probabilísticos sobre posible presentación de ENC contarán
SEROLOGÍA VS ENC
VARIABLES VALOR P
Suero 0.0024601773
Ave 0.1700340936
Pollito 0.0026738664
Término Odds
Ratio 95% I.C. Coeficiente S. E. Valor de z Valor p
Mave (SI/NO) 0.4661 0.1635 1.3285 -0.7634 0.5344 -1.4285 0.1532
Mpolllito
(SI/NO) 1.1617 0.5762 2.3423 0.1499 0.3578 0.4189 0.6753
Msuero (SI/NO) 0.5223 0.2760 0.9885 -0.6494 0.3254 -1.9955 0.0460
CONSTANT * * * -1.8824 0.2935 -6.4129 0.0000
127
con pocas bases de confiabilidad si se toma como referencia esta variable. Puede
tenerse en cuenta como apoyo para generalizar y ajustar los resultados arrojados por
las variables que se asocian a las pruebas gold estándar encontradas en los anteriores
ítems de este capítulo.
3.28 BRONQUITIS INFECCIOSA - IBV
Molecular. Los datos utilizados para el presente estudio son la filtración de la base
de datos de los resultados de las pruebas moleculares enfrentados a las muestras
enviadas al laboratorio. Se excluyen la Heces por no ser componente para estas
pruebas.
Los resultados consolidados en la tabla 86 no muestran asociación por métodos
estadísticos convencionales utilizados, la razón es que esta enfermedad se diagnostica
por método diferencial y las solicitudes directas son escasas. Es decir que los datos no
están ligados como tal a la búsqueda directa del agente viral.
Tabla 86.Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Moleculares
IBV
Fuente. El autor
BRONQUITIS VS MOLECULAR
VARIABLES VALOR P
Suero 0.0851658297
Ave 0.2873059467
Hisopo Cloacal 0.2201196799
Hisopo Traqueal 0.1349816862
Tejidos 0.3458174009
Pollito 0.6387665198*
*Valor Test exacto de Fisher
128
Serología. Los resultados de la asociación serológica de las variables involucradas
se obtienen de filtrar en la base de datos los resultados del laboratorio para las
pruebas que en serología comprenden la inmunofluorescencia y la prueba de
ELISA.
Los resultados obtenidos y consolidados en la tabla 87 muestran la asociación de las
muestras de tejidos y los sueros sanguíneos como las muestras que determinan la
eficacia de las pruebas para el diagnóstico de la bronquitis infecciosa.
Tabla 87. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Serológicas
IBV
Fuente. El autor
A continuación se presenta el resultado de la regresión logística ejecutado para el
cruce de las variables Muestra tejido y Muestra suero involucradas con los resultados
de las pruebas serológicas para detectar el IBV.
BRONQUITIS VS SEROLOGÍA
VARIABLES VALOR P
Suero 0.0080359170*
Ave 0.5642472124*
Hisopo Cloacal 0.3580028148*
Hisopo Traqueal 0.4830226292*
Tejidos 0.0006817670
Pollito 0.1297071990*
*Valor Test exacto de Fisher
129
Tabla 88. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a las
pruebas serológicos para IBV en función de sus resultados
Fuente. El autor
Los resultados de la Tabla 88 muestran la íntima relación de las muestras de suero y
tejidos en el diagnóstico de la bronquitis infecciosa con valores P muy por debajo de
0.05 aun cuando las pruebas no están dirigidas a la identificación directa del agente
viral.
3.29 GUMBORO
Molecular. Las pruebas virológicas para este agente infeccioso solo arrojan
resultados negativos. Por lo tanto no se puede correr una prueba comparativa a este
nivel que determine algún tipo de asociación con validez estadística. Se establecen
entonces las pruebas moleculares y serológicas para este análisis bajo la
advertencia de que por la razón expuesta en el encabezado del presente párrafo los
resultados no tendrán la fuerza para apoyar hipótesis las cuales se muestran a
continuación.
Los valores P consolidados en la Tabla 89 muestran que ninguna muestra puede
ofrecer garantías de éxito en el diagnóstico de la enfermedad de Gumboro.
Término Odds
Ratio 95% I.C. Coeficiente S. E. Valor de z Valor p
Msuero
(Yes/No) 3.8134 1.2389 11.7376 1.3385 0.5736 2.3335 0.0196
Mtejido
(Yes/No) 0.1978 0.0701 0.5581 -1.6204 0.5292 -3.0621 0.0022
CONSTANT * * * 1.9411 0.5421 3.5810 0.0003
130
Tabla 89.Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Moleculares
Gumboro
Fuente. El autor
Serología. Los resultados consolidados en la tabla 90 muestran que no hay
asociación en una prueba tan rutinaria como es la ELISA. Esto demuestra que la
falta de datos es de crucial importancia en estudios de este tipo.
Tabla 90.Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Moleculares
Gumboro
Fuente. El autor
MOLECULAR
VARIABLES VALOR MEDIO
Suero 0.0588758197
Ave 0.7308909995*
Hisopo Cloacal 0.2454668968
Hisopo Traqueal 0.2207411415
Tejidos 0.0683122847*
*Valor Test exacto de Fisher
SEROLOGÍA
VARIABLES VALOR MEDIO
Suero 0.3405253283*
Ave 0.9047619048*
Hisopo Cloacal 0.2651567944*
Hisopo Traqueal 0.8164924506*
Tejidos 0.3634146341*
131
3.30 LARINGOTRAQUEITIS INFECCIOSA – ILT
Virología. Los resultados de las pruebas virológicas para ILT arrojan datos con
valores menor a cinco en casi todas las variables por lo tanto se toma el dato del test
exacto de Fischer para su análisis.
Los resultados consolidados en la Tabla 91, indican que ninguna muestra está
asociada con el diagnostico por pruebas virológicas. Este resultado puede deberse a
los escasos datos reportados y de ninguna manera puede ser concluyente.
Tabla 91.Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Virológicas
ILT.
Fuente. El autor
Molecular. Los resultados consolidados en la tabla 92 muestran que la única
asociación estadísticamente significativa está entre los hisopos cloacales y los
resultados de las pruebas diagnósticas moleculares. Esto permite hacer una
observación importante respecto a que las muestras fundamentales para efectos de
detección del ILT deberían ser los hisopos traqueales. Este resultado inesperado
puede atribuirse entre otros factores al grado de dificultad en la ejecución de
acceder a la tráquea de las aves.
LARINGOTRAQUEITIS VS VIROLOGÍA
VARIABLES TEST EXACTO FISHER
Suero 0.1909562212
Ave 0.7240745366
Hisopo Cloacal 0.3177118580
Hisopo Traqueal 0.2214861751
Tejidos 0.4274193548
132
Tabla 92. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas
Moleculares ILT.
Fuente. El autor
Serología. El análisis de resultados consolidados en la tabla 93 indica asociación
entre las muestras, pollito, suero y los hisopos traqueales en las pruebas
serológicas.
Tabla 93. Resumen de valores de las tablas de contingencia para pruebas Serológicas
ILT
Fuente. El autor
LARINGOTRAQUEITIS VS MOLECULAR
VARIABLES VALOR P
Suero 0.1395226694
Ave 0.5337926842*
Hisopo Cloacal 0.0056173363
Hisopo Traqueal 0.1401341821
Tejidos 0.3744250132
*Valor Test exacto de Fisher
LARINGOTRAQUEITIS VS SEROLOGÍA
VARIABLES VALOR P
Suero 0.0158520662
Ave 0.4690408672
Hisopo Cloacal 0.3331513361*
Hisopo Traqueal 0.0489089693*
Tejidos 0.5318106071*
Pollito 0.0257558373
*Valor Test exacto de Fisher
133
Para establecer si la conexión de estas muestras está relacionada con el resultado de
la prueba se corre una prueba de regresión logística cuyo resultado es el siguiente.
Tabla 94. Regresión Logística para las variables tipo de muestra asociadas a las
pruebas serológicos para ILT en función de sus resultados.
Fuente. El autor
Los resultados presentados en la Tabla 94 indican que la única muestra que explica el
modelo para el resultado valedero son los hisopos traqueales.
Salmonella. Estadísticamente no se encuentra asociación entre las variables
confrontadas como lo muestra el consolidado de la Tabla 95. Buena parte de este
resultado puede estar soportada en el escaso aporte de datos si se tiene en cuenta
que la determinación de la salmonella en la vigilancia pasiva por parte del ICA utiliza
muestras diferentes a la vigilancia activa.
Término Odds
Ratio 95% I.C. Coeficiente S. E. Valor de z Valor p
Mhtraq
(Yes/No) 0.1185 0.0235 0.5968 -2.1329 0.8248 -2.5858 0.0097
MPolllito
(Yes/No) 0.6437 0.1118 3.7078 -0.4405 0.8934 -0.4931 0.6220
Msuero
(Yes/No) 2.3757 0.4127 13.6752 0.8653 0.8930 0.9690 0.3326
CONSTANT * * * 1.8927 0.8282 2.2854 0.0223
134
Tabla 95. Resumen de valores de las tablas de contingencia para cultivo bacteriológico
de Salmonella
Fuente. El autor
E. Coli. El consolidado de la tabla 96 muestra que la única muestra asociada con el
diagnóstico acertado para E. COLI es la muestra POLLITO. Este resultado es
ongruente al motivo de solicitud que aportan las importaciones de aves y al control
de calidad de las plantas de incubación.
Tabla 96. Resumen de valores de las tablas de contingencia para cultivo bacteriológico
de Salmonella
Fuente. El autor
SALMONELLA
VARIABLES VALOR P
Hisopo Cloacal 0.1779535839*
Heces 0.8890008280*
Pollito 0.0618238556*
*Valor Test exacto de Fisher
E. COLI
VARIABLES VALOR P
Hisopo Cloacal 0.4519043018 *
Heces 0.7180451128 *
Pollito 0.0302729310 *
*Valor Test exacto de Fisher
135
Distribución Geográfica. Los resultados positivos obtenidos en las pruebas de
laboratorio analizadas en este estudio fueron ubicados en mapas del territorio
nacional para observar su distribución espacial y definir cómo se distribuyen cada
una de las enfermedades seleccionadas comparándolas regionalmente.
A continuación se presentarán los mapas que representan la distribución de la
casuística de enfermedades de origen viral y bacteriano diagnosticada en los
laboratorios del ICA durante los años 2009, 2010 y 2011.
Newcastle. Resultados positivos a las pruebas de virología, moleculares y
serológicas.
Figura 23. Distribución de los Resultados positivos a ENC en las pruebas de virología,
moleculares y serológicas.
Fuente. El autor
136
El mapa muestra la presencia de esta enfermedad en casi todas las regiones y no
puede descartarse que en la zona de los llanos orientales, orinoquia y amazonia exista
dado que los laboratorios que cubren estas sedes no son de alto impacto avícola y las
notificaciones pudieran no tener la atención por falta de recurso humano. Lo relevante
del Figura es que si hay confirmación por pruebas virologías de la prevalencia de la
enfermedad en variadas condiciones topoFiguras donde las condiciones climáticas
varían ostensiblemente.
Bronquitis Infecciosa. Resultados positivos a las pruebas moleculares y serológicas.
Figura 24. Distribución de los Resultados positivos a IBV en las pruebas moleculares y
serológicas.
Fuente. El autor
137
A esta enfermedad no se le corren pruebas virológicas y por lo tanto no hay resultados
para mostrar, sin embargo, las pruebas moleculares determinadas por el diagnóstico
diferencial con ENC indican la alta incidencia respecto al número de casos y las
escasas pruebas en relación a la alta tasa de vacunación y el reporte de estudios sobre
este virus en Colombia.
Laringotraqueitis Infecciosa. Resultados positivos a las pruebas de virología,
moleculares y serológicas.
Figura 25. Distribución de los Resultados positivos a ILT en las pruebas de virología,
moleculares y serológicas.
Fuente. El autor
138
Esta enfermedad si representa un problema de evidente esparcimiento. El ICA solo
autoriza la vacunación para el departamento del Valle del Cauca y como muestra el
mapa, va colonizando regiones de alta concentración de aves comerciales como son
Cundinamarca y Santander que aunque no hay resultados de pruebas virológicas, el
hallazgo de anticuerpos por serología es suficiente factor de riesgo que propone mayor
investigación epidemiológica.
Gumboro. Resultados positivos a las pruebas moleculares y serológicas.
Figura 26. Distribución de los Resultados positivos a Gumboro en las pruebas
moleculares y serológicas.
Fuente. El autor
139
Para esta enfermedad las pruebas son muy específicas dado que el control vacunal es
rutinario en todo tipo de granjas comerciales y por supuesto en el material genético. Lo
que muestra el mapa es interesante desde el punto de vista geoFigura pues es en
Nariño y Magdalena los departamentos donde hubo mayor resultado positivo a las
pruebas moleculares.
Salmonella. Resultados positivos al cultivo bacteriológico.
Figura 27. Distribución de los resultados positivos al cultivo bacteriológico de
Salmonella.
Fuente. El autor
140
El solo cultivo no dice mucho de esta enfermedad, pero si los escasos resultados. Se
debe poner mucha atención y mayor recurso en la recolección de muestras para la
identificación de Salmonella dado que es una enfermedad de control oficial cuyo
impacto en la salud humana es de interés global.
E. Coli. Resultados positivos al cultivo bacteriológico.
Figura 28. Distribución de los resultados positivos al cultivo bacteriológico de E. Coli.
Fuente. El autor
Es de esperar que este agente oportunista y además normal dentro de la flora
bacteriana y ambientes de confinamiento de los animales este presente. Sin embargo
la distribución geográfica está muy ligada a las altas concentraciones avícolas del país.
141
Mapas Predictivos. El valor de la informática aplicada a la dinámica de la salud
pública ha tenido altísima relevancia pues alimentados los programas con nutridas
bases de datos, las cuales, son el eslabón débil en las comunidades que
culturalmente no registran actividades rutinarias o cuando se limitan a acumular
archivos. La predicción del clima y su pertinencia en la toma de decisiones son
ejemplos de la importancia a la que una consolidada y validada base de datos es la
herramienta eficaz para identificar la dirección correcta hacia donde se deben dirigir
los esfuerzos para la escogencia de estrategias y aplicación de programas de
acción.
Los factores de riesgo son las variables que se deben identificar para controlar, reducir
y finalmente conducir a la erradicación de una enfermedad determinada. A continuación
se presentan mapas predictivos que DIVA-GIS ofrece como salida al procesar las
variables ENFERMEDADES relacionando los resultados positivos de los niveles de
pruebas diagnósticas. La manera cómo interpreta las convenciones este software es
colorimétrica. De tal manera que los verdes van de intenso a claro representando
zonas de baja hacia moderada probabilidad, los armarillos y naranjas las zonas de
media y alta probabilidad. El rojo representa las zonas de mayor riesgo y el gris
ninguno.
142
Mapa predictivo de aparición de ENC en el diagnostico positivo por pruebas de
virología.
Figura 29. Predicción del riesgo a ENC por pruebas virológicas.
Fuente. El autor
143
Mapa predictivo de aparición de ENC en el diagnostico positivo por pruebas
moleculares.
Figura 30. Predicción del riesgo a ENC por pruebas moleculares.
Fuente. El autor
144
Mapa predictivo de aparición de ENC en el diagnostico positivo por pruebas
serológicas.
Figura 31. Predicción del riesgo a ENC por pruebas serológicas.
Fuente. El autor
145
4. CONCLUSIONES Y RECOMENDACIONES
El diseño del FURM limita la clasificación de variables y su diligenciamiento es el
resultado de una transcripción manual realizada en cada recepción donde se
identifican varios motivos por lo cual se presenta pérdida de información valiosa. La
alta proporción de errores (23%), en la calidad del diligenciamiento de los datos
reafirma la urgencia en el cambio del FURM, Es imperante la recolección de
muestras en tiempo real buscando adoptar recursos tecnológicos modernos para
garantizar el consecuente diagnóstico oportuno y veraz. Por lo tanto, la base de
datos utilizada en el presente estudio no es óptima para respaldar conclusiones de
este tipo debido a que hace falta información en casillas claves para que los
valores arrojados por los aplicativos que procesan estos algoritmos, certifiquen su
confianza. Para lograrlo, hay que recurrir a La información existente, incluyendo la
sancionada en la resolución 1599 la cual se debe incorporar a una matriz uniforme
en todos los centros de recepción de muestras veterinarias de ICA y reprocesar
con aplicativos adecuados.
Los diagnósticos están centralizados en el LNDV CEISA Bogotá. Esto condiciona la
calidad de las muestras por el tiempo del recorrido al laboratorio, condiciones de
temperatura y gestión para garantizar resultados óptimos y oportunos de las
pruebas.
La gran mayoría de los usuarios que utilizan el servicio de los laboratorios de ICA
hacen solicitud única y su distribución geográfica abarca el territorio nacional. Esto
quiere decir que cualquier ciudadano en cualquier parte del país puede contactar
los servicios de diagnóstico veterinario como apoyo a sus explotaciones pecuarias
sin importar el tamaño de estas.
El mayor motivo de solicitud del servicio es el diagnóstico. Esta casilla del
formulario limita la amplia gama de propósitos que se deben especificar al
146
momento de la recepción de la muestra dado que los antecedentes son variables
que afectan el enfoque del análisis en la interpretación de los resultados.
Los síntomas reportados con mayor frecuencia comprometen al sistema
respiratorio como objeto de diagnóstico de la problemática sanitaria. El resultado
está ligado a la campaña de control oficial de Newcastle y la gratuidad de las
pruebas es un factor que favorece esta conducta.
El reporte de necropsias es bajo y esta es una herramienta que aporta información
valiosa para lograr en congruencia con el diagnóstico presuntivo una conclusión y
cerrar los casos de manera satisfactoria.
Los planes vacunales tienen poco reporte en este formato al igual que los datos
poblacionales. Se deben corregir estos aspectos porque la base del control y
erradicación de enfermedades como Newcastle y el aumento en la incidencia de la
Laringotraqueitis están soportados en la estrategia de aplicación de biológicos. El
FURM no contempla el reporte de vacunas recombinantes que ya son una realidad
en el país.
En el FURM es imposible clasificar el sexo de las aves en las granjas de engorde y
en las de material genético, por lo tanto en este estudio se tomó como mixto para la
base de datos cuando la información provenía de estas granjas. El resultado fue
una tercera categoría que dificultó el procesamiento de datos en el software
utilizado y no se logró lanzar respuestas solidas a las preguntas de investigación
proyectadas. Otro ejemplo de esto es la variable otras especies que constituyó una
categoría inmanejable por el tamaño y la dispersión de los datos en cuanto a la
clasificación etaria y la identificación del sexo.
El reporte de tratamientos con antimicrobianos es de escasa factura, la mayoría de
los datos provienen del traspatio. Este dato es valioso para estimar el correcto uso
de antimicrobianos en el tema de resistencia que presentan los gérmenes.
147
La magnitud del Newcastle respecto a la relación del diagnóstico presuntivo y los
resultados no es dramática según los índices obtenidos en este estudio. El
complejo respiratorio aviar es de amplio repertorio causal y aunque el ICA
establece el análisis diferencial para Bronquitis de los resultados negativos de
Newcastle e Influenza, no es posible lanzar una conclusión respecto a cuál de
todos estos agentes involucrados es el mayor responsable de la sinología en los
predios avícolas.
Laringotrateitis es una enfermedad emergente que se está distribuyendo en nuevas
áreas de la geografía nacional donde tradicionalmente no se reportaban casos.
Según los resultados obtenidos no es fácil de diagnosticar y no se tiene una
estrategia clara para su contingencia aparte del control sobre la vacunación en las
aves en el departamento del valle de cauca.
Salmonella fue tipificada en solo un caso, pero es preocupante porque no refleja la
realidad si tenemos en cuenta el número de solicitudes, envío de muestras y los
diagnósticos presuntivos contra los resultados de las pruebas.
La histopatología es una herramienta que sigue estando vigente a pesar del tiempo
de instauración como técnica de ayuda diagnostica dentro de la patología clínica.
Sin embargo las pruebas gold standard son como algunos otros datos, muy
importantes en el análisis que deben estratificarse en el rediseño del FURM.
la variable muestras se constituye como el referente del presente estudio para
procesar el análisis estadístico del cual se obtuvo resultados que confirman la alta
asociación entre los hisopos cloacales y los tejidos con los resultados en las
pruebas virológicas para el diagnóstico concluyente de Newcastle. Al momento de
instaurar un programa de acción que involucre la identificación de la Bronquitis
Infecciosa, se deben tener en cuenta los resultados de este estudio para ajustar el
protocolo pues no hubo ningún tipo de muestra que presentará asociación para las
pruebas diagnósticas del laboratorio.
148
Se pueden solicitar diferentes Figuras a los aplicativos que procesan bases de
datos geo referenciadas, ubicando espacialmente mapeos de puntos como
herramienta de análisis epidemiológico que respalden hipótesis para decidir incluir
o descartar variables como factores de riesgo en la presentación y diseminación de
enfermedades.
149
REFERENCIAS
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from a natural case in indonesia. Journal Veterinary Medicine Science. Recuperado de:
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157
ANEXOS
158
Anexo A. Formato único de recepción de muestras
159
160
Anexo B. Newcastle – Enc
VIROLOGÍA
Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas de
virología
Tabla 1. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las pruebas
de virología ENC.
RVIRENC
Msuero NO YES TOTAL
Yes
% Fila
% Columna
211
70.3
40.5
89
29.7
49.7
300
100.0
42.9
No
% Fila
% Columna
310
77.5
59.5
90
22.5
50.3
400
100.0
57.1
TOTAL
% Fila
% Columna
521
74.4
100.0
179
25.6
100.0
700
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 4.6262
0.0314886469
Chi-square - Mantel-Haenszel 4.6196
0.0316101907
Chi-square - corrected (Yates) 4.2573
0.0390831870
P-media exacta
0.0162753880
Test exacto de Fisher
0.0197675507
161
Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas de
virología.
Tabla 2. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas de
virología ENC.
RVIRENC
Mave NO YES TOTAL
Yes
% Fila
% Columna
56
81.2
10.7
13
18.8
7.3
69
100.0
9.9
No
% Fila
% Columna
465
73.7
89.3
166
26.3
92.7
631
100.0
90.1
TOTAL
% Fila
% Columna
521
74.4
100.0
179
25.6
100.0
700
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 1.8221 0.1770691769
Chi-square - Mantel-Haenszel 1.8195 0.1773788300
Chi-square - corrected (Yates) 1.4509 0.2283915610
P-media exacta 0.0879842018
Test exacto de Fisher 0.1122010860
162
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las
pruebas de virología
Tabla 3. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las
pruebas de
RVIRENC
Mhclocal NO YES TOTAL
Yes
% Fila
% Columna
178
70.1
34.2
76
29.9
42.5
254
100.0
36.3
No
% Fila
% Columna
343
76.9
65.8
103
23.1
57.5
446
100.0
63.7
TOTAL
% Fila
% Columna
521
74.4
100.0
179
25.6
100.0
700
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 3.9632 0.0465060660
Chi-square - Mantel-Haenszel 3.9575 0.0466627430
Chi-square - corrected (Yates) 3.6126 0.0573438728
P-media exacta 0.0242463355
Test exacto de Fisher 0.0292559471
163
Virología ENC. Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los
resultados de las pruebas de virología
Tabla 4. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas de Virología ENC.
RVIRENC
Mhtraq NO YES TOTAL
Yes
% Fila
% Columna
102
69.9
19.6
44
30.1
24.6
146
100.0
20.9
No
% Fila
% Columna
419
75.6
80.4
135
24.4
75.4
554
100.0
79.1
TOTAL
% Fila
% Columna
521
74.4
100.0
179
25.6
100.0
700
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 2.0204 0.1552007756
Chi-square - Mantel-Haenszel 2.0175 0.1554960843
Chi-square - corrected (Yates) 1.7287 0.1885841081
P-media exacta 0.0800627198
Test exacto de Fisher 0.0953871423
164
Prueba de asociación entre la muestra TEJIDOS y los resultados de las pruebas de
virología
Tabla 5. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas
de Virología ENC.
RVIRENC
Mtejido NO YES TOTAL
Yes
% Fila
% Columna
342
70.5
65.6
143
29.5
79.9
485
100.0
69.3
No
% Fila
% Columna
179
83.3
34.4
36
16.7
20.1
215
100.0
30.7
TOTAL
% Fila
% Columna
521
74.4
100.0
179
25.6
100.0
700
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 12.7043 0.0003659876
Chi-square - Mantel-Haenszel 12.6861 0.0003695456
Chi-square - corrected (Yates) 12.0437 0.0005208456
P-media exacta 0.0001373424
Test exacto de Fisher 0.0001882603
165
Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de las pruebas de
virología.
Tabla 6. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de las
pruebas de Virología ENC.
RVIRENC
Mpolllito NO YES TOTAL
Yes
% Fila
% Columna
7
100.0
1.3
0
0.0
0.0
7
100.0
1.0
No
% Fila
% Columna
514
74.2
98.7
179
25.8
100.0
693
100.0
99.0
TOTAL
% Fila
% Columna
521
74.4
100.0
179
25.6
100.0
700
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 2.4293 0.1190883696
Chi-square - Mantel-Haenszel 2.4258 0.1193523492
Chi-square - corrected (Yates) 1.2617 0.2613329336
P-media exacta 0.0626092832
Test exacto de Fisher 0.1252185663
166
MOLECULAR
Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas
Moleculares.
Tabla 7. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas
moleculares. ENC.
RMOLENC
Mave NO YES TOTAL
NO
% Fila
% Columna
398
61.0
89.4
254
39.0
90.7
652
100.0
89.9
SI
% Fila
% Columna
47
64.4
10.6
26
35.6
9.3
73
100.0
10.1
TOTAL
% Fila
% Columna
445
61.4
100.0
280
38.6
100.0
725
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi
cuadrado
p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.3091 0.5782576550
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.3086 0.5785198823
Chi-square - corrected (Yates) 0.1842 0.6677877497
P-media exacta 0.2925808183
Test exacto de Fisher 0.3363274835
167
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las
pruebas Moleculares.
Tabla 8. Tabla de contingencia para la muestra H CLOACAL y los resultados de las
pruebas Moleculares ENC.
RMOLENC
Mhclocal NO YES TOTAL
NO
% Fila
% Columna
285
63.5
64.0
164
36.5
58.6
449
100.0
61.9
SI
% Fila
% Columna
160
58.0
36.0
116
42.0
41.4
276
100.0
38.1
TOTAL
% Fila
% Columna
445
61.4
100.0
280
38.6
100.0
725
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 2.1839 0.1394614290
Chi-square - Mantel-Haenszel 2.1809 0.1397346013
Chi-square - corrected (Yates) 1.9579 0.1617376848
P-media exacta 0.0705228781
Test exacto de Fisher 0.0810379804
168
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas Moleculares
Tabla 9. Tabla de contingencia para la muestra H TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas Moleculares ENC.
RMOLENC
Mhtraq NO YES TOTAL
NO
% Fila
% Columna
367
63.5
82.5
211
36.5
75.4
578
100.0
79.7
SI
% Fila
% Columna
78
53.1
17.5
69
46.9
24.6
147
100.0
20.3
TOTAL
% Fila
% Columna
445
61.4
100.0
280
38.6
100.0
725
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 5.3819 0.0203483376
Chi-square - Mantel-Haenszel 5.3744 0.0204351013
Chi-square - corrected (Yates) 4.9507 0.0260809941
P-media exacta 0.0108570536
Test exacto de Fisher 0.0134914748
169
Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de las pruebas
Moleculares.
Tabla 10. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de las
pruebas Moleculares ENC.
RMOLENC
Mpolllito NO YES TOTAL
NO % Fila % Columna
438 61.1 98.4
279 38.9 99.6
717 100.0 98.9
SI % Fila % Columna
7 87.5 1.6
1 12.5 0.4
8 100.0
1.1
TOTAL % Fila % Columna
445 61.4 100.0
280 38.6 100.0
725 100.0 100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 2.3283 0.1270428185
Chi-square - Mantel-Haenszel 2.3251 0.1273052449
Chi-square - corrected (Yates) 1.3474 0.2457361437
P-media exacta 0.0699228389
Test exacto de Fisher 0.1201882944
170
Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas
Moleculares
Tabla 11. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las
pruebas Moleculares ENC.
RMOLENC
Msuero NO YES TOTAL
NO % Fila % Columna
272 64.6 61.1
149 35.4 53.2
421 100.0 58.1
SI % Fila % Columna
173 56.9 38.9
131 43.1 46.8
304 100.0 41.9
TOTAL % Fila % Columna
445 61.4 100.0
280 38.6
100.0
725 100.0 100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 4.4155 0.0356154658
Chi-square - Mantel-Haenszel 4.4094 0.0357428347
Chi-square - corrected (Yates) 4.0966 0.0429701968
P-media exacta 0.0181767069
Test exacto de Fisher 0.0215865556
171
Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas
Moleculares
Tabla 12. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las
pruebas Moleculares ENC.
RMOLENC
Mtejido NO YES TOTAL
NO % Fila % Columna
154 66.7 34.6
77 33.3 27.5
231 100.0 31.9
SI % Fila % Columna
291 58.9 65.4
203 41.1 72.5
494 100.0 68.1
TOTAL % Fila % Columna
445 61.4 100.0
280 38.6
100.0
725 100.0 100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 3.9981 0.0455515788
Chi-square - Mantel-Haenszel 3.9926 0.0457008802
Chi-square - corrected (Yates) 3.6775 0.0551527408
P-media exacta 0.0227024514
Test exacto de Fisher 0.0271198738
172
SEROLOGÍA
Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas
serológicas
Tabla 13. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas
Serológicas ENC.
RSERHIENC
Mave Yes No TOTAL
NO
% Fila
% Columna
88
9.4
94.6
845
90.6
91.7
933
100.0
92.0
SI
% Fila
% Columna
5
6.2
5.4
76
93.8
8.3
81
100.0
8.0
TOTAL
% Fila
% Columna
93
9.2
100.0
921
90.8
100.0
1014
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.9503 0.3296455078
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.9494 0.3298840997
Chi-square - corrected (Yates) 0.5993 0.4388342224
P-media exacta 0.1700340936
Test exacto de Fisher 0.2251026565
173
Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de las pruebas
serológicas
Tabla 14. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de las
pruebas Serológicas ENC.
RSERHIENC
Mpolllito Yes No TOTAL
NO % Fila % Columna
66 7.9
71.0
767 92.1 83.3
833 100.0 82.1
SI % Fila % Columna
27 14.9 29.0
154 85.1 16.7
181 100.0 17.9
TOTAL % Fila % Columna
93 9.2
100.0
921 90.8
100.0
1014 100.0 100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 8.7310 0.0031295805
Chi-square - Mantel-Haenszel 8.7224 0.0031443896
Chi-square - corrected (Yates) 7.9116 0.0049129522
P-media exacta 0.0026738664
Test exacto de Fisher 0.0036806740
174
Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas
SEROLÓGICAS
Tabla 15. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las
pruebas Serológicas ENC.
RSERHIENC
Msuero Yes No TOTAL
NO % Fila % Columna
44 12.8 47.3
299 87.2 32.5
343 100.0 33.8
SI % Fila % Columna
49 7.3
52.7
622 92.7 67.5
671 100.0 66.2
TOTAL % Fila % Columna
93 9.2
100.0
921 90.8
100.0
1014 100.0 100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 8.3186 0.0039253695
Chi-square - Mantel-Haenszel 8.3104 0.0039431335
Chi-square - corrected (Yates) 7.6685 0.0056204976
P-media exacta 0.0024601773
Test exacto de Fisher 0.0032784699
175
BRONQUITIS INFECCIOSA - IBV
MOLECULAR
Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas
moleculares
Tabla 16. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas
moleculares IBV.
RMOLIBV
Mave Yes No TOTAL
NO
% Fila
% Columna
74
35.6
90.2
134
64.4
92.4
208
100.0
91.6
SI
% Fila
% Columna
8
42.1
9.8
11
57.9
7.6
19
100.0
8.4
TOTAL
% Fila
% Columna
82
36.1
100.0
145
63.9
100.0
227
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.3216 0.5706701714
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.3201 0.5715199843
Chi-square - corrected (Yates) 0.1009 0.7507881736
P-media exacta 0.2873059467
Test exacto de Fisher 0.3691498286
176
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las
pruebas moleculares
Tabla 17. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las
pruebas Moleculares IBV
RMOLIBV
Mhclocal Yes No TOTAL
NO
% Fila
% Columna
46
34.1
56.1
89
65.9
61.4
135
100.0
59.5
SI
% Fila
% Columna
36
39.1
43.9
56
60.9
38.6
92
100.0
40.5
TOTAL
% Fila
% Columna
82
36.1
100.0
145
63.9
100.0
227
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.6062 0.4362092268
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.6036 0.4372215782
Chi-square - corrected (Yates) 0.4069 0.5235450908
P-media exacta 0.2201196799
Test exacto de Fisher 0.2613600762
177
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas moleculares.
Tabla 18. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas Moleculares IBV
RMOLIBV
Mhtraq Yes No TOTAL
NO
% Fila
% Columna
56
33.9
68.3
109
66.1
75.2
165
100.0
72.7
SI
% Fila
% Columna
26
41.9
31.7
36
58.1
24.8
62
100.0
27.3
TOTAL
% Fila
% Columna
82
36.1
100.0
145
63.9
100.0
227
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 1.2487
0.2637925043
Chi-square - Mantel-Haenszel 1.2432
0.2648469777
Chi-square - corrected (Yates) 0.9263
0.3358388442
P-media exacta
0.1349816862
Test exacto de Fisher
0.1677955308
178
Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de las pruebas
moleculares
Tabla 19. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de las
pruebas Moleculares IBV
RMOLIBV
Mpolllito Yes No TOTAL
NO
% Fila
Columna
82
36.3
100.0
144
63.7
99.3
226
100.0
99.6
SI
% Fila
% Columna
0
0.0
0.0
1
100.0
0.7
1
100.0
0.4
TOTAL
% Fila
% Columna
82
36.1
100.0
145
63.9
100.0
227
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.5680
0.4510476193
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.5655
0.4520464051
Chi-square - corrected (Yates) 0.0838
0.7721838632
P-media exacta
0.3193832599
Test exacto de Fisher
0.6387665198
179
Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas
moleculares.
Tabla 20. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las
pruebas Moleculares IBV
RMOLIBV
Msuero Yes No TOTAL
NO
% Fila
% Columna
42
32.3
51.2
88
67.7
60.7
130
100.0
57.3
SI
% Fila
% Columna
40
41.2
48.8
57
58.8
39.3
97
100.0
42.7
TOTAL
% Fila
% Columna
82
36.1
100.0
145
63.9
100.0
227
100.0
100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 1.9196
0.1659041968
Chi-square - Mantel-Haenszel 1.9111
0.1668397176
Chi-square - corrected (Yates) 1.5521
0.2128269909
P-media exacta
0.0851658297
Test exacto de Fisher
0.1065386325
180
Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas
moleculares.
Tabla 21. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las
pruebas Moleculares IBV
2 RMOLIBV
Mtejido Yes No TOTAL
NO % Fila % Columna
25 34.2 30.5
48 65.8 33.1
73 100.0 32.2
SI % Fila % Columna
57 37.0 69.5
97 63.0 66.9
154 100.0 67.8
TOTAL % Fila % Columna
82 36.1
100.0
145 63.9
100.0
227 100.0 100.0
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.1643
0.6852683514
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.1635
0.6859253044
Chi-square - corrected (Yates) 0.0662
0.7968891025
P-media exacta
0.3458174009
Test exacto de Fisher
0.4002928078
181
SEROLOGÍA
Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas
serológicas.
Tabla 22. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas
Serológicas. IBV
SER_IBV
Mave N P TOTAL
NO
% Fila
% Columna
17
7.1
94.4
223
92.9
91.8
240
100.0
92.0
SI
% Fila
% Columna
1
4.8
5.6
20
95.2
8.2
21
100.0
8.0
TOTAL
% Fila
% Columna
18
6.9
100.0
243
93.1
100.0
261
100.0
100.0
182
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las
pruebas serológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.1621
0.6872580940
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.1614
0.6878261765
Chi-square - corrected (Yates) 0.0022
0.9629504653
P-media exacta
0.3868050774
Test exacto de Fisher
0.5642472124
SER_IBV
Mhclocal N P TOTAL
NO % Fila % Columna
18 7.3
100.0
229 92.7 94.2
247 100.0 94.6
SI % Fila % Columna
0 0.0 0.0
14 100.0
5.8
14 100.0
5.4
TOTAL % Fila % Columna
18 6.9
100.0
243 93.1
100.0
261 100.0 100.0
183
Tabla 23. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las
pruebas Serológicas. IBV
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas serológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 1.0958
0.2951868763
Chi-square - Mantel-Haenszel 1.0916
0.2961138280
Chi-square - corrected (Yates) 0.2547
0.6137607527
P-media exacta
0.1790014074
Test exacto de Fisher
0.3580028148
SER_IBV
Mhtraq N P TOTAL
NO
% Fila
% Columna
18
7.2
100.0
233
92.8
95.9
251
100.0
96.2
SI
% Fila
% Columna
0
0.0
0.0
10
100.0
4.1
10
100.0
3.8
TOTAL
% Fila
% Columna
18
6.9
100.0
243
93.1
100.0
261
100.0
100.0
184
Tabla 24. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas Serológicas. IBV
Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de las pruebas
serológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.7703
0.3801397300
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.7673
0.3810539791
Chi-square - corrected (Yates) 0.0583
0.8092832666
P-media exacta
0.2415113146
Test exacto de Fisher
0.4830226292
SER_IBV
Mpolllito N P TOTAL
NO
% Fila
% Columna
16
6.2
88.9
242
93.8
99.6
258
100.0
98.9
SI
% Fila
% Columna
2
66.7
11.1
1
33.3
0.4
3
100.0
1.1
TOTAL
% Fila
% Columna
18
6.9
100.0
243
93.1
100.0
261
100.0
100.0
185
Tabla 25. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de las
pruebas Serológicas. IBV
Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas
serológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 16.8854
0.0000408741
Chi-square - Mantel-Haenszel 16.8207
0.0000422508
Chi-square - corrected (Yates) 8.7815
0.0030441873
P-media exacta
0.0066246428
Test exacto de Fisher
0.1297071990
SER_IBV
Mtejido N P TOTAL
NO
% Fila
% Columna
10
4.5
55.6
214
95.5
88.1
224
100.0
85.8
SI
% Fila
% Columna
8
21.6
44.4
29
78.4
11.9
37
100.0
14.2
TOTAL
% Fila
% Columna
18
6.9
100.0
243
93.1
100.0
261
100.0
100.0
186
Tabla 26. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las
pruebas Serológicas. IBV
Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas
serológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 14.5583
0.0001370565
Chi-square - Mantel-Haenszel 14.5025
0.0001411399
Chi-square - corrected (Yates) 12.0088
0.0005306586
P-media exacta
0.0006817670
Test exacto de Fisher
0.0011912677
SER_IBV
Msuero N P TOTAL
NO
% Fila
% Columna
6
20.7
33.3
23
79.3
9.5
29
100.0
11.1
SI
% Fila
% Columna
12
5.2
66.7
220
94.8
90.5
232
100.0
88.9
TOTAL
% Fila
% Columna
18
6.9
100.0
243
93.1
100.0
261
100.0
100.0
187
27. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las pruebas
Serológicas. IBV
GUMBORO
MOLECULAR
Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas
moleculares.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 9.6667
0.0018775816
Chi-square - Mantel-Haenszel 9.6296
0.0019157992
Chi-square - corrected (Yates) 7.4010
0.0065197736
P-media exacta
0.0047028432
Test exacto de Fisher
0.0080359170
RMOLGUM
Mave Yes No TOTAL
Yes
% Fila
% Columna
1
50.0
2.9
1
50.0
3.1
2
100.0
3.0
No
% Fila
% Columna
34
52.3
97.1
31
47.7
96.9
65
100.0
97.0
TOTAL
% Fila
% Columna
35
52.2
100.0
32
47.8
100.0
67
100.0
100.0
188
Tabla 28. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas
Moleculares GUMBORO
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las
pruebas moleculares.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.0041
0.9486881309
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.0041
0.9490719705
Chi-square - corrected (Yates) 0.4281
0.5129388802
P-media exacta
0.4776119403
Test exacto de Fisher
0.7308909995
RMOLGUM
Mhclocal Yes No TOTAL
Yes
% Fila
% Columna
15
57.7
42.9
11
42.3
34.4
26
100.0
38.8
No
% Fila
% Columna
20
48.8
57.1
21
51.2
65.6
41
100.0
61.2
TOTAL
% Fila
% Columna
35
52.2
100.0
32
47.8
100.0
67
100.0
100.0
189
Tabla 29. Tabla de contingencia para la muestra H CLOACAL y los resultados de las
pruebas Moleculares GUMBORO
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas moleculares.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.5065
0.4766751056
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.4989
0.4799832389
Chi-square - corrected (Yates) 0.2123
0.6450091769
P-media exacta
0.2454668968
Test exacto de Fisher
0.3229754270
RMOLGUM
Mhtraq Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
5 41.7 14.3
7 58.3 21.9
12 100.0 17.9
No % Fila % Columna
30 54.5 85.7
25 45.5 78.1
55 100.0 82.1
TOTAL % Fila % Columna
35 52.2 100.0
32 47.8 100.0
67 100.0 100.0
190
Tabla 30. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas Moleculares GUMBORO
Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas
moleculares.
Tabla 31. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las
pruebas Moleculares GUMBORO
Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas
moleculares
RMOLGUM
Msuero Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
20 62.5 57.1
12 37.5 37.5
32 100.0 47.8
No % Fila % Columna
15 42.9 42.9
20 57.1 62.5
35 100.0 52.2
TOTAL % Fila % Columna
35 52.2 100.0
32 47.8 100.0
67 100.0 100.0
RMOLGUM
Mtejido Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
31 49.2 88.6
32 50.8
100.0
63 100.0 94.0
No % Fila % Columna
4 100.0 11.4
0 0.0 0.0
4 100.0 6.0
TOTAL % Fila % Columna
35 52.2
100.0
32 47.8
100.0
67 100.0 100.0
191
Tabla 32. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas
Moleculare GUMBORO
SEROLOGÍA
Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas serológicas
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 3.8893
0.0485945592
Chi-square - Mantel-Haenszel 3.8313
0.0503052375
Chi-square - corrected (Yates) 2.1199
0.1453949598
P-media exacta
0.0341561424
Test exacto de Fisher
0.0683122847
RSERELIGUMB
Mave Yes No TOTAL
Yes
% Fila
% Columna
1
100.0
2.6
0
0.0
0.0
1
100.0
2.4
No
% Fila
% Columna
37
90.2
97.4
4
9.8
100.0
41
100.0
97.6
TOTAL
% Fila
% Columna
38
90.5
100.0
4
9.5
100.0
42
100.0
100.0
192
Tabla 33. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas
Serológicas GUMBORO
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las
pruebas serológicas
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.1078
0.7426279704
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.1053
0.7456030864
Chi-square - corrected (Yates) 1.9477
0.1628370425
P-media exacta
0.4523809524
Test exacto de Fisher
0.9047619048
RSERELIGUMB
Mhclocal Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
2 66.7 5.3
1 33.3 25.0
3 100.0
7.1
No % Fila % Columna
36 92.3 94.7
3 7.7
75.0
39 100.0 92.9
TOTAL % Fila % Columna
38 90.5
100.0
4 9.5
100.0
42 100.0 100.0
193
Tabla 34. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las
pruebas Serológicas GUMBORO
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas serológicas
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 2.1255
0.1448659259
Chi-square - Mantel-Haenszel 2.0749
0.1497408673
Chi-square - corrected (Yates) 0.1913
0.6618409212
P-media exacta
0.1426829268
Test exacto de Fisher
0.2651567944
RSERELIGUMB
Mhtraq Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
2 100.0
5.3
0 0.0 0.0
2 100.0
4.8
No % Fila % Columna
36 90.0 94.7
4 10.0
100.0
40 100.0 95.2
TOTAL % Fila % Columna
38 90.5
100.0
4 9.5
100.0
42 100.0 100.0
194
Tabla 35. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas Serológicas GUMBORO
Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas
serológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.2211
0.6382394568
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.2158
0.6422674463
Chi-square - corrected (Yates) 0.5837
0.4448596607
P-media exacta
0.4082462253
Test exacto de Fisher
0.8164924506
RSERELIGUMB
Mtejido Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
11 84.6 28.9
2 15.4 50.0
13 100.0 31.0
No % Fila % Columna
27 93.1 71.1
2 6.9
50.0
29 100.0 69.0
TOTAL % Fila % Columna
38 90.5
100.0
4 9.5
100.0
42 100.0 100.0
195
Tabla 36. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las
pruebas Serológicas GUMBORO
Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas
serológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.7505
0.3863112483
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.7327
0.3920250122
Chi-square - corrected (Yates) 0.0887
0.7658560005
P-media exacta
0.2219512195
Test exacto de Fisher
0.3634146341
RSERELIGUMB
Msuero Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
35 92.1 92.1
3 7.9 75.0
38 100.0 90.5
No % Fila % Columna
3 75.0 7.9
1 25.0 25.0
4 100.0 9.5
TOTAL % Fila % Columna
38 90.5 100.0
4 9.5 100.0
42 100.0 100.0
196
Tabla 37. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las
pruebas Serológicas GUMBORO.
LARINGOTRAQUEITIS INFECCIOSA – ILT
VIROLOGÍA
Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas
virológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 1.2289
0.2676261853
Chi-square - Mantel-Haenszel 1.1996
0.2733986683
Chi-square - corrected (Yates) 0.0454
0.8311850022
P-media exacta
0.1897882605
Test exacto de Fisher
0.3405253283
RVIRILT
Msuero Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
2 18.2 40.0
9 81.8 14.8
11 100.0 16.7
No % Fila % Columna
3 5.5
60.0
52 94.5 85.2
55 100.0 83.3
TOTAL % Fila % Columna
5 7.6
100.0
61 92.4
100.0
66 100.0 100.0
197
Tabla 38. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las
pruebas Virológicas ILT
Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas
virológicas
.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 2.1207
0.1453253112
Chi-square - Mantel-Haenszel 2.0885
0.1484103338
Chi-square - corrected (Yates) 0.6925
0.4053299307
P-media exacta
0.1102279777
Test exacto de Fisher
0.1909562212
RVIRILT
Mtejido Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
5 8.9 100.0
51 91.1 83.6
56 100.0 84.8
No % Fila % Columna
0 0.0 0.0
10 100.0 16.4
10 100.0 15.2
TOTAL % Fila % Columna
5 7.6 100.0
61 92.4 100.0
66 100.0 100.0
198
Tabla 39. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las
pruebas Virológicas ILT
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las
pruebas virológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.9660
0.3256700301
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.9514
0.3293626698
Chi-square - corrected (Yates) 0.1117
0.7382460724
P-media exacta
0.2137096774
Test exacto de Fisher
0.4274193548
RVIRILT
Mhclocal Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
2 13.3 40.0
13 86.7 21.3
15 100.0 22.7
No % Fila % Columna
3 5.9
60.0
48 94.1 78.7
51 100.0 77.3
TOTAL % Fila % Columna
5 7.6
100.0
61 92.4
100.0
66 100.0 100.0
199
Tabla 40. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las
pruebas Virológicas ILT
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas virológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.9190
0.3377290730
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.9051
0.3414157484
Chi-square - corrected (Yates) 0.1629
0.6864721089
P-media exacta
0.1953753572
Test exacto de Fisher
0.3177118580
RVIRILT
Mhtraq Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
2 16.7 40.0
10 83.3 16.4
12 100.0 18.2
No % Fila % Columna
3 5.6
60.0
51 94.4 83.6
54 100.0 81.8
TOTAL % Fila % Columna
5 7.6
100.0
61 92.4
100.0
66 100.0 100.0
200
Tabla 41. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas Virológicas ILT
Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas virológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 1.7311
0.1882653614
Chi-square - Mantel-Haenszel 1.7049
0.1916470048
Chi-square - corrected (Yates) 0.5079
0.4760397552
P-media exacta
0.1298963134
Test exacto de Fisher
0.2214861751
RVIRILT
Mave Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
0 0.0 0.0
4 100.0 6.6
4 100.0
6.1
No % Fila % Columna
5 8.1
100.0
57 91.9 93.4
62 100.0 93.9
TOTAL % Fila % Columna
5 7.6
100.0
61 92.4 100.0
66 100.0 100.0
201
Tabla 42. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas
Virológicas ILT
MOLECULAR
Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas
moleculares.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.3490
0.5546679761
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.3437
0.5576825937
Chi-square - corrected (Yates) 0.1475
0.7009733344
P-media exacta
0.3620372683
Test exacto de Fisher
0.7240745366
RMOLILT
Msuero Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
10 32.3 22.2
21 67.7 31.8
31 100.0 27.9
No % Fila % Columna
35 43.8 77.8
45 56.3 68.2
80 100.0 72.1
TOTAL % Fila % Columna
45 40.5 100.0
66 59.5 100.0
111 100.0 100.0
202
Tabla 43. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las
pruebas Moleculares ILT
Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas
moleculares.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 1.2241
0.2685651736
Chi-square - Mantel-Haenszel 1.2130
0.2707322125
Chi-square - corrected (Yates) 0.7937
0.3729712759
P-media exacta
0.1395226694
Test exacto de Fisher
0.1869483387
RMOLILT
Mtejido Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
35 39.8 77.8
53 60.2 80.3
88 100.0 79.3
No % Fila % Columna
10 43.5 22.2
13 56.5 19.7
23 100.0 20.7
TOTAL % Fila % Columna
45 40.5
100.0
66 59.5
100.0
111 100.0 100.0
203
Tabla 44. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las
pruebas Moleculares ILT
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las
pruebas moleculares
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.1039
0.7472375515
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.1029
0.7483399903
Chi-square - corrected (Yates) 0.0070
0.9332203427
P-media exacta
0.3744250132
Test exacto de Fisher
0.4631432444
RMOLILT
Mhclocal Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
5 19.2 11.1
21 80.8 31.8
26 100.0 23.4
No % Fila % Columna
40 47.1 88.9
45 52.9 68.2
85 100.0 76.6
TOTAL % Fila % Columna
45 40.5 100.0
66 59.5 100.0
111 100.0 100.0
204
Tabla 45. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las
pruebas Moleculares ILT
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas moleculares
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 6.3962
0.0114374130
Chi-square - Mantel-Haenszel 6.3386
0.0118148821
Chi-square - corrected (Yates) 5.2939
0.0214015814
P-media exacta
0.0056173363
Test exacto de Fisher
0.0091236863
RMOLILT
Mhtraq Yes No TOTAL
Yes
% Fila
% Columna
7
30.4
15.6
16
69.6
24.2
23
100.0
20.7
No
% Fila
% Columna
38
43.2
84.4
50
56.8
75.8
88
100.0
79.3
TOTAL
% Fila
% Columna
45
40.5
100.0
66
59.5
100.0
111
100.0
100.0
205
Tabla 46. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas Moleculares ILT
Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas
moleculares
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 1.2291
0.2675784698
Chi-square - Mantel-Haenszel 1.2181
0.2697445212
Chi-square - corrected (Yates) 0.7572
0.3842093976
P-media exacta
0.1401341821
Test exacto de Fisher
0.1929261269
RMOLILT
Mave Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
4 44.4 8.9
5 55.6 7.6
9 100.0 8.1
No % Fila % Columna
41 40.2 91.1
61 59.8 92.4
102 100.0 91.9
TOTAL % Fila % Columna
45 40.5
100.0
66 59.5
100.0
111 100.0 100.0
206
Tabla 47. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas
Moleculares ILT
SEROLOGÍA
Prueba de asociación entre la muestra SUERO y los resultados de las pruebas
serológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.0619
0.8034819689
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.0614
0.8043511469
Chi-square - corrected (Yates) 0.0111
0.9161537320
P-media exacta
0.4020345102
Test exacto de Fisher
0.5337926842
RSERELIILT
Msuero Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
108 92.3 65.5
9 7.7
40.9
117 100.0 62.6
No % Fila % Columna
57 81.4 34.5
13 18.6 59.1
70 100.0 37.4
TOTAL % Fila % Columna
165 88.2
100.0
22 11.8
100.0
187 100.0 100.0
207
Tabla 48. Tabla de contingencia para la muestra SUERO y los resultados de las
pruebas Serológicas. ILT
Prueba de asociación entre la muestra TEJIDO y los resultados de las pruebas
serológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 4.9935
0.0254435941
Chi-square - Mantel-Haenszel 4.9668
0.0258393510
Chi-square - corrected (Yates) 4.0005
0.0454883348
P-media exacta
0.0158520662
Test exacto de Fisher
0.0241857268
RSERELIILT
Mtejido Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
12 92.3 7.3
1 7.7 4.5
13 100.0 7.0
No % Fila % Columna
153 87.9 92.7
21 12.1 95.5
174 100.0 93.0
TOTAL % Fila % Columna
165 88.2 100.0
22 11.8 100.0
187 100.0 100.0
208
Tabla 49. Tabla de contingencia para la muestra TEJIDO y los resultados de las
pruebas Serológicas. ILT
Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de las pruebas
serológicas
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.2232
0.6366056347
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.2220
0.6375085904
Chi-square - corrected (Yates) 0.0007
0.9790601498
P-media exacta
0.3585784503
Test exacto de Fisher
0.5318106071
RSERELIILT
MPolllito Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
47 81.0 28.5
11 19.0 50.0
58 100.0 31.0
No % Fila % Columna
118 91.5 71.5
11 8.5 50.0
129 100.0 69.0
TOTAL % Fila % Columna
165 88.2 100.0
22 11.8 100.0
187 100.0 100.0
209
Tabla 50. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de las
pruebas Serológicas. ILT
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de las
pruebas serológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 4.1997
0.0404320050
Chi-square - Mantel-Haenszel 4.1773
0.0409711997
Chi-square - corrected (Yates) 3.2543
0.0712357739
P-media exacta
0.0257558373
Test exacto de Fisher
0.0386326776
RSERELIILT
Mhclocal Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
8 80.0 4.8
2 20.0 9.1
10 100.0 5.3
No % Fila % Columna
157 88.7 95.2
20 11.3 90.9
177 100.0 94.7
TOTAL % Fila % Columna
165 88.2 100.0
22 11.8 100.0
187 100.0 100.0
210
Tabla 51. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de las
pruebas Serológicas. ILT
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas serológicas
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.6902
0.4060818149
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.6866
0.4073397770
Chi-square - corrected (Yates) 0.1065
0.7441299496
P-media exacta
0.2157253322
Test exacto de Fisher
0.3331513361
RSERELIILT
Mhtraq Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
5 62.5 3.0
3 37.5 13.6
8 100.0
4.3
No % Fila % Columna
160 89.4 97.0
19 10.6 86.4
179 100.0 95.7
TOTAL % Fila % Columna
165 88.2
100.0
22 11.8
100.0
187 100.0 100.0
211
Tabla 52. Tabla de contingencia para la muestra H. TRAQUEAL y los resultados de las
pruebas Serológicas. ILT
Prueba de asociación entre la muestra AVE y los resultados de las pruebas
serológicas.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 5.3323
0.0209350571
Chi-square - Mantel-Haenszel 5.3038
0.0212804524
Chi-square - corrected (Yates) 3.0568
0.0804002223
P-media exacta
0.0306420316
Test exacto de Fisher
0.0489089693
RSERELIILT
Mave Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
4 80.0 2.4
1 20.0 4.5
5 100.0 2.7
No % Fila % Columna
161 88.5 97.6
21 11.5 95.5
182 100.0 97.3
TOTAL % Fila % Columna
165 88.2
100.0
22 11.8
100.0
187 100.0 100.0
212
Tabla 53. Tabla de contingencia para la muestra AVE y los resultados de las pruebas
Serológicas. ILT.
SALMONELLA
Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de cultivo
bacteriológico.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.3356
0.5623566882
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.3338
0.5634035725
Chi-square - corrected (Yates) 0.0154
0.9012002435
P-media exacta
0.2876573125
Test exacto de Fisher
0.4690408672
RBACCULTSALM
Mhclocal Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
2 7.4
22.2
25 92.6 8.3
27 100.0
8.7
No % Fila % Columna
7 2.5
77.8
278 97.5 91.7
285 100.0 91.3
TOTAL % Fila % Columna
9 2.9
100.0
303 97.1 100.0
312 100.0 100.0
213
Tabla 54. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de
Cultivos bacteriológicos
SALMONELLA
Prueba de asociación entre la muestra HECES y los resultados de cultivo
bacteriológico
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 2.1583
0.1418029716
Chi-square - Mantel-Haenszel 2.1514
0.1424430637
Chi-square - corrected (Yates) 0.7527
0.3856212955
P-media exacta
0.1060984476
Test exacto de Fisher
0.1779535839
RBACCULTSALM
Mheces Yes No TOTAL
Yes % Fila % Columna
0 0.0 0.0
4 100.0 1.3
4 100.0 1.3
No % Fila % Columna
9 2.9 100.0
299 97.1 98.7
308 100.0 98.7
TOTAL % Fila % Columna
9 2.9 100.0
303 97.1 100.0
312 100.0 100.0
214
Tabla 55. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de
Cultivos bacteriológicos
SALMONELLA
Prueba de asociación entre la muestra HECES y los resultados de cultivo
bacteriológico
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.1204
0.7286502155
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.1200
0.7290682791
Chi-square - corrected (Yates) 1.3373
0.2475156994
P-media exacta
0.4445004140
Test exacto de Fisher
0.8890008280
RBACCULTSALM
Mpolllito Yes No TOTAL
NO % Fila % Columna
7 4.8
77.8
140 95.2 46.2
147 100.0 47.1
SI % Fila % Columna
2 1.2
22.2
163 98.8 53.8
165 100.0 52.9
TOTAL % Fila % Columna
9 2.9
100.0
303 97.1 100.0
312 100.0 100.0
215
Tabla 56. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de Cultivos
bacteriológicos
SALMONELLA
E. Coli. Prueba de asociación entre la muestra HISOPO CLOACAL y los resultados de
cultivo bacteriológico
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 3.4968
0.0614875263
Chi-square - Mantel-Haenszel 3.4856
0.0619051946
Chi-square - corrected (Yates) 2.3445
0.1257285848
P-media exacta
0.0367612985
Test exacto de Fisher
0.0618238556
RBACCULTCOLI
Mhclocal N P TOTAL
NO % Fila % Columna
71 28.0 94.7
183 72.0 95.8
254 100.0 95.5
SI % Fila % Columna
4 33.3 5.3
8 66.7 4.2
12 100.0 4.5
TOTAL % Fila % Columna
75 28.2 100.0
191 71.8 100.0
266 100.0 100.0
216
Tabla 57. Tabla de contingencia para la muestra H. CLOACAL y los resultados de
Cultivos bacteriológicos COLI
Prueba de asociación entre la muestra HECES y los resultados de cultivo
bacteriológico.
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.1639
0.6856321827
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.1632
0.6861921373
Chi-square - corrected (Yates) 0.0059
0.9390092932
P-media exacta
0.3389145135
Test exacto de Fisher
0.4519043018
RBACCULTCOLI
Mheces N P TOTAL
NO % Fila % Columna
75 28.3
100.0
190 71.7 99.5
265 100.0 99.6
SI % Fila % Columna
0 0.0 0.0
1 100.0
0.5
1 100.0 0.4
TOTAL % Fila % Columna
75 28.2
100.0
191 71.8
100.0
266 100.0 100.0
217
Tabla 58.Tabla de contingencia para la muestra HECES y los resultados de Cultivos
bacteriológicos E. COLI
Prueba de asociación entre la muestra POLLITO y los resultados de cultivo
bacteriológico
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 0.3942
0.5301255539
Chi-square - Mantel-Haenszel 0.3927
0.5308997312
Chi-square - corrected (Yates) 0.2357
0.6273147553
P-media exacta
0.3590225564
Test exacto de Fisher
0.7180451128
RBACCULTCOLI
Mpolllito N P TOTAL
NO % Fila % Columna
30 22.9 40.0
101 77.1 52.9
131 100.0 49.2
SI % Fila % Columna
45 33.3 60.0
90 66.7 47.1
135 100.0 50.8
TOTAL % Fila % Columna
75 28.2
100.0
191 71.8
100.0
266 100.0 100.0
218
Tabla 154. Tabla de contingencia para la muestra POLLITO y los resultados de
Cultivos bacteriológico E. COLI
(T=Series Taylor;C=Cornfield;M=P-Media;F=Fisher)
TEST ESTADÍSTICOS Chi cuadrado p de 1 cola p de 2 colas
Chi-square - uncorrected 3.5742
0.0586860216
Chi-square - Mantel-Haenszel 3.5607
0.0591628520
Chi-square - corrected (Yates) 3.0774
0.0793865099
P-media exacta
0.0302729310
Test exacto de Fisher
0.0394502378