Unité de Recherche et de Biotechnologie Microbienne /Bactériologie-Virologie
FMPOS/UCAD/DAKAR
RESISTANCE BACTERIENNEAU SENEGAL
Pr Cheikh Saad Bouh BOYE
M I C R O C SB Sy st em
. Fréquence des Infections. Surveillance de la Résistance
. Efficacité thérapeutique
M I C R O C SB Sy st em
Cytologie ColorationFlore bactérienne
- Isolement , Identification
- Etude de la Sensibilite( ABG , CMI… )
- Contrôle Qualité ( Références ATCC )
Isolement Bactérien
IRBC
IRH ( OTITES ET SINUSITES AIGUES)
Unité de Recherche et de Biotechnologie Microbienne /Bactériologie-Virologie
FMPOS/UCAD/DAKAR
Streptococcus pneumoniae Haemophilus influenzae , Moraxella catarrhalis
Bactéries Atypiques
à Dakar ( SENEGAL) ( 1996-2007)M I C R O C SB Sy st em
Observatoire Sénégalais pour l ’Antibiothérapie dans les
Infections Respiratoires de Ville
PROJET OBSAIRV
M I C R O C SB Sy st em
07/05/23
ETIOLOGIE BACTERIENNE CAP
S. pneumoniae
Bacteries atypiques:Legionella sppChlamydia sppMycoplasma spp
S. aureus
Autres
BGN
H. influenzae et M. catarrhalis
22%
6%
15%
8%15%
34%
(OMA) (n = 113 souches)
15
32
17 36
Enfants n= 63 souches
31
13
21
35
Adultes n= 50 souches
Haemophilus
S.pneumoniae
Moraxella
Autres
S.pneumoniae
Haemophilus
Moraxella
Autres
(Sinusites Aigues) (n = 66 souches)
48
35
107
Enfants n= 42 souches
38
29
18
17
Adultes n= 24 souches
Haemophilus
Haemophilus
S.pneumoniaeS.pneumoniae
Moraxella
Moraxella
AutresAutres
Profil des Souches isolées
Souches % % Afrique % Monde
S.pneumoniae (DRSP) 32 15-50 > 50
S.pneumoniae (DSSP) 68
H.influenzae (Ampi S) 32
H.influenzae(AmpiR/BL+ 26 25-40 30-80
H.influenzae(Ampi R/BL- 02 1-5 2-4
M.catarrhalis ( BL+) 70 70-90M.catarrhalis ( BL-) 30
Profil des Souches isolées
Souches % IRB IRH
S.pneumoniae (DRSP) 32 23 35
S.pneumoniae (DSSP) 68
H.influenzae (Ampi S) 72
H.influenzae(AmpiR/BL+ 26 35 28
H.influenzae(Ampi R/BL- 02
M.catarrhalis ( BL+) 70 68 75M.catarrhalis ( BL-) 30
Penicillin-nonsusceptible S. pneumoniae
Egypt29.1% 0.0%
South Africa20.9% 51.0%
Kenya41.2% 1.8%
Senegal2% 30%
Ghana17.0% 0.0%
Tunisia24.0% 11.0%
Algeria11.4% 5.7%
Penicillin-intermediate (MIC 0.12–1 µg/mL)Penicillin-resistant (MIC 2 µg/mL)
Ethiopia17% 0.0%
Namibia21% 9%
Botswana25% 0.0%
Zimbabwe7%
Zambia14% 0.0%
Rwanda21.0% 0.0%
INSPIRATION , BASKETT
Streptococcus pneumoniae
0%10%20%30%40%50%60%70%80%90%
100%
Penicil
lin
Amox/cl
av
Cefurox
ime
Cefaclo
r
Ceftria
xone
Azithro
mycin
Clarithrom
ycin
Ofloxa
cin
Co-trim
oxaz
ole
Tetrac
yclin
e
Chloram
phen
icol
Resistant
Intermediate
Susceptible
S.pneumoniae
ATB PSSP(68%) PISP(30%) PRSP(2%)
AminoPeni S S(60%) R
AminoP+Inhib S S(98%) R
CSP1,2,3 S S(93%) R
Macrolides S S S(87%)
Tetracycline S R(72%) R
Vancomycin S S S
Macrolide-resistant S. pneumoniae
Egypt2.5%
South Africa52.7%
Tunisia28.0%
Algeria21.7%
Erythromycin-resistant (MIC 1 µg/mL)
Senegal 4%
INSPIRATION , BASKETT
Haemophilus influenzae
Important pathogène dans IRA
Plus de 30% -lactamasepositive4
Haemophilus influenzae
07/05/23
Senegal. Antimicrobial Resistance TrendsAmong Respiratory Tract Pathogens
0
25
50
75
100
1960 1970 1980 1990 2000 2010
% R
esis
tant
Resistancemechanism:
Beta-lactamase
Altered PBPs
Beta-lactamase
Altered PBPs
M. catarrhalis
H. influenzae
S. pneumoniae
M.catarrhalis
ATB BL+ ( 70%) BL-(30%)
Aminopenicilline R S
AminoP+Inhib S S
CEFADROXIL S S
CSP2,3 S S
Macrolides S S
Tetracycline S S
INFECTIONS NOSOCOMIALES
Bactériémies : ……………………………15% Pneumonie post ventilation :…………… 21% Infection urinaire (UTI) : …………………38% Infection respiratoire basse : ……………..4% Infections gastro intestinales , cutanées,
cardiovasculaires : ………………………10% Infections du site opératoire : …………..10% Infections respiratoires hautes : ………….2%
INFECTIONS URINAIRES
Enterobactéries : …………….50%
GNNF : ……………………….35%
Enterocoques : ……………...10%
Autres : ……………………….5%
BACTERIEMIES NOSOCOMIALES Enterobacteries : ………………..50% Enterocoques : ………………….11% Staphylococcus aureus : ………12% Staphylocoques CN : …………..10% Pseudomonas : ………………….11% Acinetobacter : …………………...5% Autres : ……………………………1%
INFECTIONS DU SITE OPERATOIRE
S aureus : ………………………………20% Pseudomonas : ………………………..16% Staphylocoques CN : ………………….15% Enterobacteries : ……………………… 25 Enterocoques: ………………………….12 Autres BGN : …………………………...12
Staphylococcus aureus
ATB MehiR 43%) Methi S(57%)
Aminopenicilline R S
AminoP+Inhib R S
CSP2,3 R S
Macrolides S S
Tetracycline S S
Aminosides S/R S
Streptocoques
ATB Enterococcus(84) Streptococcus(359)
Aminopenicilline S(63%) S
AminoP+Inhib S(72%) S
CSP1,2,3 S( 76%) S
Macrolides S S
Tetracycline S S
Klebsiella pneumoniae
ATB Souches Klebsielles
Béta-lactamines Aminosides Quinolones Cotrimoxazole
Sauvages (12%) S S S R
PHN ( 22%) MS S S R
BLSE (63%) S MS S R
ATBSouches
Béta-lactamines
Aminosides Quinolones Sulfa- triméto
Sauvages (40%) R S S R
Pénicillinase Haut niveau (28%)
R S S R
Céphalosporinase (16%) R/MS S S R
Pseudomonas aeruginosa
Données sur les bactéries entéropathogènes: Tendances et Antibiorésistance
Les données sur les les bactéries entéropathogènes proviennentdu Centre National Sénégalais des Entérobactéries (CNSE) sis à l’Institut Pasteur de Dakar.
Missions du CNSE:
•Assurer pour l’ensemble des structures sanitaires du Sénégal l’identification complète et l’antibiogramme des souches d’entérobactéries, en particulier les salmonelles et les shigelles, •Suivre l’évolution épidémiologique des souches et de leur résistance aux antimicrobiens
Salmonella:
Entre 1999 et 2007, le CNSE a collecté 1426 souches de salmonelles dont 985 d’origine humaine et 441 d’origine alimentaire.Quatre nouveaux sérotypes ont été identifiés : Salmonella Keurmassar, Salmonella Ketiabargny, Salmonella Yombesali, Salmonella Yagounasally. Tous ces nouveaux sérotypes ont été isolés exclusivement de l’alimentation, à l’exception de Salmonella Keurmassar présent également dans des prélèvements d’origine humaine.
•Grande sensibilité des souches aux antibiotiques testés. Cependant des résistances inquiétantes ont été notées chez les souches de Salmonella Agona, Kentucky et Keurmassar isolées d’aliments: •production d’une BLSE : le typage moléculaire a révélé la circulation au Sénégal de BLSE de type CTX-M15, SHV-12•d’intégrons: éléments génétiques mobiles porteurs de facteurs de résistance et capables de les disséminer au sein du monde bactérien et portant des cassettes. Des intégrons de classe 1 ont été détectés chez S. Keurmassar avec des cassettes codant la résistance à la streptomycine (gènes de résistance aadA) et la cassette codant la codant la résistance à l’érythromycine (gène de résistance ereA2), une macrolide largement utilisée en antibioprophylaxie dans les élevages de poulets de chair au Sénégal.
Shigella:
Entre 1999 et 2007, le CNSE a reçu 538 souches de shigelles, toute d’origine humaine.La tendance au niveau des sérotypes montre un recul de flexneri . Le sérotype sonnei prend la place de leader.
L’épidémiologie de la résistance aux antibiotiques est caractérisée par une résistance importante vis-à-vis des cyclines et du cotrimoxazole, pour l’ensemble des espèces et une circulation de souches avec une diminution de la sensibilité aux quinolones.