INSTITUTO TECNOLÓGICO DE SONORA

Bioquímica General“CONSTRUCCIÓN DE PÉPTIDOS in silico”

Villa Cárdenas María FernandaIng. Biotecólogo, ID: 108476Maestra: Laura Elisa Gassós Ortega

Ciudad Obregón Sonora Agosto-Diciembre 2012

Introducción

A continuación se presentan tres péptidos construidos con el software Ballview. Se simula la síntesis in silico de la estructura primaria de las proteínas y además se practica la simbología que identifica a los aminoácidos.

Péptido hidrófobo (no polar)

V-L-F-P-W-A-L-I-P-M

Val-Leu-Phe-Pro-Trp-Ala-Leu-Ile-Pro-Met

Péptido hidrófilo (polar)

S-Y-N-G-N-C-S-T-N-G

Ser-Tyr-Asn-Gly-Asn-Cys-Ser-Thr-Asn-Gly

Péptido anfótero (hidrófobo e hidrófilo)

A-Q-V-N-W-P-S-M-Y-F

Ala-Gln-Val-Asn-Trp-Pro-Ser-Met-Tyr-Phe

Dibujo del péptido en papel

Hidrofóbico

V-L-F-P-W-A-L-I-P-MVal-Leu-Phe-Pro-Trp-Ala-Leu-Ile-Pro-Met

Hidrófilico

S-Y-N-G-N-C-S-T-N-GSer-Tyr-Asn-Gly-Asn-Cys-Ser-Thr-Asn-Gly

Hidrofílico e Hidrofóbico

A-Q-V-N-W-P-S-M-Y-FAla-Gln-Val-Asn-Trp-Pro-Ser-Met-Tyr-Phe

Hildebrandt, A., Dehof, A.K., Rurainski, A., Bertsch, A., Schumann, M., Toussaint, N.C., Moll, A., Stockel, D., Nickels,S., Mueller, S.C., Lenhof, H-P., Kohlbacher, O. (2010). "BALL - Biochemical Algorithms Library 1.3", BMC Bioinformatics. 11:531

Moll A, Hildebrandt A, Lenhof HP, Kohlbacher O. (2006). BALLView: A tool for research and education in molecular modeling. Bioinformatics. 22(3):365-366

Campbell, M.K. & Farrell, S.O. Bioquímica. Editorial Cengage Learning. Sexta edición. Pág. 65-86

Referencias: