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From Knowledge Generation To Science-based Innovation Research and Technological Development | Technology Transfer and Valorisation | Advanced Training | Consulting Pre-incubation of Technology-based Companies Ricardo Amorim, João Aguiar Castro, Inês Garganta, Artur Rocha, Gabriel David INESC TEC, Faculdade de Engenharia, Universidade do Porto Construção de um repositório de dados oceanográficos CONFOA 7ª Conferência de Acesso Aberto Viseu | 2016-11-03

Construção de um Repositório de Dados Oceanográficos

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Research and Technological Development | Technology Transfer and Valorisation | Advanced Training | ConsultingPre-incubation of Technology-based Companies

Ricardo Amorim, João Aguiar Castro, Inês Garganta, Artur Rocha, Gabriel DavidINESC TEC, Faculdade de Engenharia, Universidade do Porto

Construção de um repositório de dados oceanográficos

CONFOA 7ª Conferência de Acesso Aberto

Viseu | 2016-11-03

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Contexto

Investigação oceanográfica

dados únicos e diversos

custo elevado de produção

dados com potencial….

monitorização e suporte à decisão relativa ao Bom Estado Ambiental das Águas Marinhas Europeias

mas por rentabilizar…

enfâse nas publicações

formatos não interoperáveis

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Projeto

Projeto de grande dimensão de investigação de montes submarinos

Equipas de investigadores marinhos de várias instituições nacionais

Liderado pelo Instituto Português do Mar e da Atmosfera (IPMA)

SeaBioDataEquipas do INESCTEC e do IPMA

Tornar dados acessíveis em suporte digital online (reutilização e processamento)

Repositório que permite aos investigadores:acesso uniforme aos dados, pesquisa, relacionamento;redução do esforço na gestão de dados, fornecimento de serviços;promoção da preservação dos dados

BIOMETORE

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Origem dos dados

-amostras de solo-amostras de água-amostras biológicas-sensores-rotas de navios-fotografias-vídeos-sons-análises laboratoriais

Metadados e dados registados em formulários de papel e folhas de cálculo

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Normas relevantes

Diretiva INSPIRE

• infraestrutura de informação espacial

• 34 temas de dados espaciais

OGC - Sensor Observation Service

• “open standards” para a comunidade geoespacial

• modelos de serviços definem conjunto de requisitos para o acesso e processamento de dados espaciais

• abstrações genéricas úteis a vários domínios: conceito de observação

Implementação em software aberto 52º North do SOS

• API REST

• Serviços Web nativos

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Conceito de observação (INSPIRE, 2011)

Observação

Garantia de interoperabilidade semântica com sistemas baseados no mesmo modelo

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Modelo de dados local - utilizadores

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Rastreabilidade da informação

Registos em papel são transcritos para o repositório

- documentos primários digitalizados e associados aos respetivos ficheiros no repositório

Ficheiros organizados em hierarquia de pastas

-organização por projeto, campanha e procedimento

-ordem cronológica

Metadados relevantes ficam na base de dados

- eliminação do papel sem perda da informação

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Modelo de metadados

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Modelo de metadados

ISO 19115Responsáveis; informação temporal e espacial; palavras-chave; condições de uso…

Ecological Metadata Language | Darwin CoreTaxonomia e metodologia

Vocabulários controlados dão suporte à descrição de dados

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Labtablet

• Caderno de laboratório eletrónico;

• Suporte para metadadosde domínio;

• Aproximação aos formulários utilizados pelos investigadores.

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Interface

registo e pesquisa simples…

interface local sobre dois componentes…

1º base de dados interoperável do SOS da 52º North

2º extensão local específica ao projeto BIOMETORE;

Desenvolvida com técnicas de adaptabilidade adequadas para computadores e tablets.

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Preparação da campanha

• Gestão das organizações, utilizadores, navios, procedimentos, estações

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Campanha ativa

• Permite associar utilizadores, navios, procedimentos, localizações e estações.

• A gestão é feita no início de cada campanha e pode ser atualizada conforme a mesma.

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Consulta de observações registadas

• Vista em tabela semelhante a folha de cálculo com a funcionalidade de associar ficheiros a determinada observação.

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Conclusão

Teste em ambiente de campanha realizado em setembro:

- avaliação do ciclo de vida da produção de dados e utilização a bordo;

Melhorias de usabilidade;

Tablets úteis para cronometrar e tirar fotografias;

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Trabalho futuro

Teste em ambiente laboratorial;

Carregamento sistemático dos dados das campanhas anteriores;

Serviços de visualização.

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Obrigado

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