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Sûreté alimentaire Quelles innovations pour la maîtrise des contaminants et l' authentification des produits agricoles et alimentaires ? > 13 & 14 novembre 2013 > Montpellier SupAgro INRA www.rencontres-qualimediterranee.fr

Les outils de la biologie moléculaire appliqués à la recherche d’OGM. Authentification des espèces et variétés végétales, et recherche d’OGM, par les outils de biologie

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Authentification des espèces et variétés végétales, et recherche d’OGM, par les outils de biologie moléculaire. Karine LACOTTE‐BOTELHO (Laboratoire Phytocontrol)

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Sûreté alimentaireQuelles innovations pour

la maîtrise des contaminants et l'authentification des produits

agricoles et alimentaires ?

> 13 & 14 novembre 2013 > Montpellier SupAgro INRA

www.rencontres-qualimediterranee.fr

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Les outils de la biologie moléculaire appliqués à la recherche d’OGM

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Nom Prénom Intervenant / Organisme

Le génie génétique

Définition:Méthode qui permet d'introduire dans une

cellule un gène (étranger) qu'elle ne possède pas.Le fonctionnement de ce gène (son

expression) dans la cellule receveuse aboutit à la production d'une protéine qui n'est pas normalement fabriquée par cette cellule.

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L’Union Européenne a mis en place une réglementation, afin de donner aux consommateurs européens le libre choix de consommer ou non des OGM, imposant que les produits contenant des OGM fassent l’objet d’un étiquetage spécifique et a fixé le seuil de détection de ces OGM à 0,9 %. La mise en oeuvre de cette politique n’est possible que s’il existe des méthodes de détection fiables et validées des OGM et que les OGM non autorisés soient détectables.

REGLEMENT CE n°1829/1830/2003 du 22 septembre 2003

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Le principe de base de la PCR est l’amplification génique, après extraction d’ADN ou d’ARN. La PCR en temps réel utilise le principe de base de la PCR classique (amplification cyclique d’un fragment d’ADN, basée sur une réaction enzymologique) avec pour différence une amplification mesurée non pas en final mais tout au long de la réaction, donc en temps réel.

PCR (Polymerase Chain Reaction)

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PCR (Polymerase Chain Reaction)

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Le résultat d’une PCR en temps réel est représenté graphiquement sous forme de courbes sigmoïdes.

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A chaque cycle d’amplification, la quantité d’ADN est mesurée grâce à un marqueur fluorescent dont l’émission est directement proportionnelle à la quantité d’amplicons produits. Ceci permet d’obtenir une cinétique de la réaction et donc la quantification de l’ADN alors que la PCR classique ne donne que la mesure finale.

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Promoteur(P35S)

Terminateur(Tnos)

Gène codant pour le caractère désiré

Méthode de criblage (screening)

Méthode spécifique

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Date de mise à jour: 26/03/13

EspècesAutorisé en UE pour la

culture

Autorisé en UE dans l'alimentation

humaine / animaleRèglementation UE Multiscreening

Espèce plante Soja P35S Tnos FMV Bar NptII Patsoja OGM RRS (MON GTS40-3-2) - X 2012/82/UE + + - - - -soja OGM A5547-127 - X 2012/81/UE + - - - - +soja OGM A 2704-12 - X 2008/730/CE + - - - - +soja OGM MON 89788 - X 2008/933/CE - - + - - -soja OGM DP-305423-1 - En attente - - - - - - -soja OGM DP356043-5 - X 2012/84/UE + - - - - -soja OGM MON87705 - En attente - - - + - - -soja OGM MON87708 - En attente - - - - - - -soja OGM MON87701 - X 2012/83/UE - - - - - -Espèce plante Maïs P35S Tnos FMV Bar NptII Patmaïs OGM MON 810 X X 98/294/CE + - - - - -maïs OGM MON 863 - X 2005/608/CE + + - - + -maïs OGM Bt11 - X 2010/419/UE + + - - - +maïs OGM Bt10 - - 2007/157/CE + + - - - -maïs OGM MON88017 - X 2009/814/CE + + - - - -maïs OGM Bt176 - Retiré 2007/304/CE + - - + - -maïs OGM GA21 - X 2008/280/CE - + - - - -maïs OGM MIR 604 - X 2009/866/CE - + - - - -maïs OGM NK 603 - X 2004/643/CE + + - - - -maïs OGM Herculex 1507 - X 2005/772/CE + - - - - +maïs OGM DAS 59122 - X 2007/702/CE + - - - - +maïs OGM T25 - X 2008/470/CE + - - - - +maïs OGM Starlink CBH 351 - - - + + - + - -maïs OGM MIR 162 - X 2012/651/UE - + - - - -maïs OGM MON 89034 - X 2009/813/CE + + + - - -maïs OGM EVENT 3272 - En attente - - + - - - -Espèce plante colza P35S Tnos FMV Bar NptII Patcolza OGM RT/GT 73 - X 2005/635/CE - - + - - -colza OGM MS8/ RF3 - X 2007/232/CE - + - + - -colza OGM TOPAS 19/2 - Retiré 2007/307/CE + - - - + +colza OGM T45 - X 2009/184/CE + - - - - +colza OGM MS1/ RF1 - Retiré 2007/305/CE - + - + + -Espèce plante riz P35S Tnos FMV Bar NptII Patriz OGM LL62 - - - + - - + - -riz OGM LL601 - - - + - - + - -riz OGM BT63 - - - - + - - - -riz OGM KMD 1 - - - + + - - - -riz OGM Kefeng 6 - - - + + - - - -Espèce plante pomme de terre P35S Tnos FMV Bar NptII PatAMFLORA EH92-527-1 X X 2010/135/UE - + - - + -Espèce plante lin P35S Tnos FMV Bar NptII Patlin OGM Triffid FP967 - - - - + - - + -Espèce plante papaye P35S Tnos FMV Bar NptII Pat63-1 - - - + + - - + -X17-2 - - - + + - - + -

Tableau identification OGM

Identification espèces OGM

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Si le résultat est supérieur à la limite de détection (0,01% ) et inférieur à la LQ (0,1%) le résultat est rendu positif <0,1 %

Si le résultat est > LQ la teneur en OGM peut être quantifiée:

Calcul de la teneur en ADN de végétaux génétiquement modifiés:Teneur: (nb de copies ADN OGM/nb de copies ADN de l ’espèce ) x 100La teneur est exprimée par rapport à l’espèce végétale ce qui signifie qu’il faut passer par l ’identification si mélanges de plusieurs espèces dans l’échantillon

Expression des résultats

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Les équipements- Spectrophotomètre (quantification de l’ADN) : Nanodrop

- Centrifugeuse réfrigérée

- Bain-marie

- Vortex

- Robot Epmotion (préparation et distribution des plaques PCR)

- Thermocycleur (amplification de l’ADN – RT PCR)

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