טעם של כימיה פרק ד' 1 – חלבונים – חלק 2 מחומצות...

טעם של כימיה טעם של כימיה

22 – חלבונים – חלק – חלבונים – חלק 11פרק ד' פרק ד' מחומצות אמיניות לחלבוןמחומצות אמיניות לחלבון

דנה יצקוביץ

המצגת מבוססת על מצגות מהטכניון מהמבנית ביוכימיה

וכן מגב' ענבל גבע-דותן.

סוגים שונים20•

קבוצות הצד הן שונות•

OHC

CNH2

O

R

H

הקשר הפפטידי )אמידי(הקשר הפפטידי )אמידי(

NH3+C

CH

R1

O

NC

C

HR2

H

O

O

קצה אמיניקשר פפטידיN - terminus

קצה קרבוקסילי

C - terminus

הקשר הפפטידי: יחידה הקשר הפפטידי: יחידה מישורית קשיחהמישורית קשיחה

דבר זה יוצר מישורים קשיחים יחסית בשרשרת הפפטידית:

קשר פפטידי

הקשר הפפטידי הוא כלומר כמעט מישורי

C וה-C,O,N,Hהאטומים של החומצה האמינית הבאה נמצאים כמעט

באותו מישור.

המבנה הראשוני: שרשרת המבנה הראשוני: שרשרת פוליפפטידיתפוליפפטידית

האטומים סביב - C ו - N - Cהקשרים

Cסובבים חופשי

קשיחC - Nהקשר

Ala-Cys-Gly-His-Val-Glu-Lys-Met-Cys-Gly-Val-Pro-Asn-Asp-Val-His…-

המבנה השניוניהמבנה השניוני

סידור מרחבי של קטעים בשרשרת החומצותהאמיניות והוא מוחזק ע"י קשרי מימן.

? מי יכול ליצור קשרי מימן

N – C – C – N – C – C – N – C – C – N – C – C – N – C – C-

H R1 0 R2 H R3 O R4 H R5 O

H H H O H H H O H

המבנה השניוניהמבנה השניוניקשרי מימן – תוך שרשרתיםקשרי מימן – תוך שרשרתים

בסליליα קשרי המימןנוצרים בין מימן

הקשור לחנקן של הקשר הפפטידי

וקבוצת קרבוניל של החומצה אמינית הרביעית לאחריו

+

-

המבנה השניוניהמבנה השניונימשטחי משטחי קשרי מימן – קשרי מימן –

אנטי-מקבילמקבילCOOH NH2

COOHNH2

COOHNH2

COOH NH2

COOHNH2

COOH NH2

מבנה שלישוני

ארגון המרחבי של השרשרת הפולי פפטידיתכולה.

: המבנה יכול להיות אחד משתי הצורות - מאורגנים במרחב סביב ציר אורך דמיוני. סיבי◦

הקוטר שלהם יחסית לאורך זניח.חלבוני המבנה )שיער, שרירים, גידים, ציפורניים( הם ◦

בדרך כלל חלבונים סיביים.

- מאורגנים ככדור וניתן לתאר אותם על ידי כדורי◦הרדיוס או הקוטר שלהם

חלבוני הפונקציה )כדוריות דם, אנזימים, הורמונים( ◦הם בדרך כלל חלבונים כדוריים.

מבנה שלישוני

דוגמאות לחלבונים

כדוריים:

מבנה רביעוני

קיים בחלבונים בהם יש כמה שרשראותפוליפפטידיות.

לדוגמה המוגלוביןארבע שרשרות של החלבון גלובין.◦

כל אחת מכילה קבוצת הם ◦

חלבון גלובין

תצמיד של קבוצת הם: ארבעה פירולים ויון

++Feברזל

סיכום המבנה המרחבי של החלבון

דנטורציהדנטורציה

שינוי במבנה החלבון, הפוגם בפעילותו הביולוגית, ומפחית.דנטורציהבד”כ את מסיסותו, נקרא

לבצע דנטורציה ע"י הפעולות:הבאות

חימום שינויpH הוספת גורמים המנטרלים את מייצבי המבנה

:המרחבי ,אוריאה, הפותחת קשרי מימן מרקפתואתנול, הפותח קשריS-S.

השפעת הטמפרטורה על המבנה השפעת הטמפרטורה על המבנה המרחבי של החלבוןהמרחבי של החלבון

חימום או קירור החלבון עלול לשנות את קשרי •המשיכה בין החומצות האמינות. כלומר לשנות את

המבנה המרחבי של החלבון. הוא: המקורי לדוגמא: אם המבנה של החלבון

אז חימום החלבון עלול לגרום

לפתיחת השרשרת

( . ובמקרה של קירור לסגירתה דנטורציה)

)רנטורציה(.

23

5

7

4

1 6

76543211

234

56

7

תרגולתרגול

101עמ5, 4, 3, 1שאלות ◦

(260 )עמ 8 שאלה 2006בגרות (281ח )עמ 1 שאלה 2007בגרות (27 ה )עמ1 – שאלה 1מתכונת (27 ה )עמ1 – שאלה 1מתכונת (143 ז )עמ 1 – שאלה 4מתכונת (177 ה )עמ 1 – שאלה 5מתכונת (177 ה )עמ 6 – שאלה 5מתכונת