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蛋白質簡介
暨南大學資訊工程系
2003/05/06
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蛋白質是由 20 種胺基酸所組成
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胺基酸
中心碳 胺基（ NH2） COOH 氫（ H ） 側鏈（ side chain, R ）
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同分異構物
自然界中只發現 L- 型的胺基酸異構物，原因不明。
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除了脯胺酸（ Proline ）是環狀，其餘 19 種皆可以前述通式表示。
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一級結構（ Primary Structure ） 將兩個胺基酸分子脫水後，形成 peptide bond
s ，而成的鏈狀物。
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雙硫鍵（ disulfide bond ）
某些蛋白質中，會用雙硫鍵將 polypeptide chain 橫結起來。
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Conformation of Polypeptide Chain
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Phi 與 Psi 角的範圍
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二級結構（ Secondary Structure ） Alpha helix
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Beta sheet
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Beta turn
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Loop
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三級結構（ tertiary structure ）
折疊成立體的形狀
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四級結構（ quaternary structure ） 數個三級結構結合成具
有功能的大分子
人類的血球蛋白
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一級結構決定了三級結構
牛的核糖核酸酶
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如何由一級結構預測三級結構？
藉由對胺基酸的知識，去猜測 親水性、疏水性、所帶電荷……
Knowledge-based method 先建立龐大的資料庫，儲存蛋白質的一級結構與所對應的三級結構，然後運用序列比對的方式去預測新的蛋白質的結構。
一項大挑戰
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蛋白質的修飾
雖然蛋白質是由 20 種胺基酸所組成，但是許多蛋白質要發揮應有的功能前，必需要經過適當的化學修飾。
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蛋白質的定序
Edman degradation
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蛋白質與 DNA
Genetic code
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Genetic code 並非唯一
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