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蛋白質簡介

暨南大學資訊工程系

2003/05/06

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蛋白質是由 20 種胺基酸所組成

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胺基酸

中心碳 胺基（ NH2） COOH 氫（ H ） 側鏈（ side chain, R ）

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同分異構物

自然界中只發現 L- 型的胺基酸異構物，原因不明。

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除了脯胺酸（ Proline ）是環狀，其餘 19 種皆可以前述通式表示。

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一級結構（ Primary Structure ） 將兩個胺基酸分子脫水後，形成 peptide bond

s ，而成的鏈狀物。

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雙硫鍵（ disulfide bond ）

某些蛋白質中，會用雙硫鍵將 polypeptide chain 橫結起來。

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Conformation of Polypeptide Chain

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Phi 與 Psi 角的範圍

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二級結構（ Secondary Structure ） Alpha helix

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Beta sheet

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Beta turn

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Loop

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三級結構（ tertiary structure ）

折疊成立體的形狀

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四級結構（ quaternary structure ） 數個三級結構結合成具

有功能的大分子

人類的血球蛋白

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一級結構決定了三級結構

牛的核糖核酸酶

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如何由一級結構預測三級結構？

藉由對胺基酸的知識，去猜測 親水性、疏水性、所帶電荷……

Knowledge-based method 先建立龐大的資料庫，儲存蛋白質的一級結構與所對應的三級結構，然後運用序列比對的方式去預測新的蛋白質的結構。

一項大挑戰

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蛋白質的修飾

雖然蛋白質是由 20 種胺基酸所組成，但是許多蛋白質要發揮應有的功能前，必需要經過適當的化學修飾。

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蛋白質的定序

Edman degradation

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蛋白質與 DNA

Genetic code

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Genetic code 並非唯一