Biometria, alapozó...

Biometria, alapozó biostatisztika

Könnyű BalázsELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai és Elméleti Biológiai Tsz.

BEVEZETŐ

Előadás (biometb17va) Déli Tömb, 0-822 Mogyoródi József terem Kedd: 10.00-11.00

Gyakorlatok (biometb17va) Déli tömb, 7-424 (BI számítógépes labor)

Szerda 10.00-11.00 - Paczkó Mátyás Szerda 11.00-12.00 - Hubai AndrásSzerda 12.00-13.00 - Hubai AndrásSzerda 14.00-15.00 - Vörös DánielCsütörtök 8.00- 9.00 - Könnyű BalázsCsütörtök 9.00-10.00 - Radványi ÁdámPéntek 10.00-11.00 - Konrád KrisztinaPéntek 11.00-12.00 - Kovács Bálint

TananyagKombinatorika

Valószínűségszámítás

Valószínűségi változók(2-3. hét)

R

Leíró statisztika(4-5. hét)

Hipotézisvizsgálat(6-7. hét)

Egymintás próbák (8-9. hét)

Kétmintás próbák(10.hét)

ANOVA(11. hét)

Függetlenség, korreláció(12.hét)

Lineáris regresszió(13. hét)

Előfeltételek, irodalom

Solt György: Valószínűségszámítás (Bólyai sorozat)

● Reiczigel-Harnos-Solymosi: Biostatisztika, nem statisztikusoknak● Könyv (+ ebook + gyf)

4000 Ft (ELTE-s ár)● ebook+gyakorló

feladatok https://e-akademia.hu/ féléves előfizetés!!!2000 Ft

● A honlapról letölthető előadás, feladatsor

Előfeltételek● Matematika (kombinatorika,

valószínűségszámítás )● Informatika (R)Irodalom:

http://plantsys.elte.hu/drupal/hu/oktatas/biometria

Gyakorlat● Kötelező a részvétel (max. 3 hiányzás)● Két sikeres (>50%) évközi ZH

KövetelményekElőadás

● Elméleti kérdések a gyakorlati ZH-ban (>80% → GY jegy előfeltétel)

I. ZH: 6-7. hét II. ZH: 15. hét (Vizsgaidőszak 1. hét)

március 18. 18.00-20.00 – Hubai András május 18. 16.00-18.00 – Könnyű Balázs

március 19. 18.00-20.00 – Hubai András május 18. 18.00-20.00 – Radványi Ádám

március 20. 18.00-20.00 – Konrád Krisztina május 19. 16.00-18.00 – Konrád Krisztina

Március 23. 19.00-21.00 – Radványi Ádám május 19. 18.00-20.00 – Kovács Bálint

március 24. 19.00-21.00 május 20. 16.00-18.00 – Hubai András

március 25. 18.00-20.00 – Könnyű Balázs május 20. 18.00-20.00 – Hubai András

március 26. 18.00-20.00 – Vörös Dániel május 21. 18.00-20.00

március 27. 18.00-20.00 – Kovács Bálint május 22. 18.00-20.00 – Vörös Dániel

Déli tömb, 7-424 (BI számítógépes labor)

Gyakorlat● Kötelező a részvétel (max. 3 hiányzás)● Két sikeres (>50%) évközi ZH

I. ZH: 6-7. hét II. ZH: 15. hét (vizsgaidőszak 1. hete)

● Házi feladatok:● A rész: adott heti anyagrészből● B rész: következő heti anyagrészből

● Pótolási lehetőségA vizsga időszak 2. hetében elméletből is, és gyakorlatból is

JegyZH1 + ZH2 + HF

pl. 40% + 40% + 20% → Pont → ponthatárok → Jegy

KövetelményekElőadás

● Elméleti kérdések a gyakorlati ZH-ban (>80% → GY jegy előfeltétel)

Gyakorlatra

OlvasniTK: 6-12. oldal

Miért érdemes statisztikát tanulni?egy szubjektív válasz

A cikk főszereplője: anticianidok

Bevezető:Anticiánok szerepe a növényi stresszben

Stressz indukált antocianidokKépzése (hipotézis:

reaktív oxigén gyökök semlegesítése)

Felhalmozódása különböző szövetekben

Cél:

„do different anthocyanins accumulate in response to different stress conditions?”

Antocián ujjlenyomat

Eredmények

Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?

AnthocyaninInductiveCondition

Eredmények

Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?

0.11

0.04 0.060.1 0.12 0.15

0.28

0.49 0.560.11 =?= 0.100.11 =?= 0.120.11 =?= 0.15

Eredmények

Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?

0.11

0.04 0.060.1 0.12 0.15

0.28

0.49 0.560.11 =?= 0.040.11 =?= 0.06

Eredmények

Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?

0.11

0.04 0.060.1 0.12 0.15

0.28

0.49 0.560.11 =?= 0.280.11 =?= 0.490.11 =?= 0.56

Eredmények

Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?

Antocianid tartalom(statisztika)

Kontroll vs. Kezelés

0.11 < 0.04*

0.11 < 0.06*

0.11 = 0.100.11 = 0.120.11 = 0.150.11 > 0.28*

0.11 > 0.49*

0.11 > 0.56*

* szignifikáns különbség ~ sztochasztikus (véletlen) ingadozásnál nagyobb eltérés

„2x2 néha 5”avagy miért

van sztochasztikus

ingadozás?

mérési korlátok

Kutatástervezés

Kutatástervezés

● Kérdés → alapkutatás (ismeretszerzés), alkalmazott kutatás (az ismeretek alkalmazhatóságának felderítése)

● A rendszer megismerése, elővizsgálatok, alapos irodalmazás● Kérdés pontosítás, tudományos hipotézis(ek) („prekoncepció”)● Statisztika megválasztása és a statisztikai hipotézisek felállítása

● Válaszváltozók, háttérváltozók, becslés, kontroll● Megfelelő mérési technika kiválasztása● Következetesség● Adatminőség● Közlés formája: ábrák, táblázatok, statisztikai vizsgálatok

tudományos hipotézis ≠ statisztikai hipotézis

Mintavétel

Hányféleképpen vehető ki n elemű halmazból k elem?

kombináció

Figyelem! A minta jelentése a

statisztikában eltér a biológiai kíséreltekben

megszokottól: 1 mérés ↔ az

objektumok egy csoportja

Mintavétel

● Reprezentativitás

● Randomitás

● Elemszám

● Variancia

Gyakorlatra

OlvasniTK: 13-32. oldal

Gyakorlathttp://plantsys.elte.hu/drupal/hu/oktatas/biometriaFeladatsor:● Bevezető gyakorlatok