Fehérjeszerkezet, és tekeredésfolding_FK.pdf · utolsó alfa-szénatom távolsága 7...

Fehérjeszerkezet, és tekeredés

Futó Kinga

Polimerek Polimer: hasonló alegységekből (monomer)

felépülő makromolekulák

Alegységek száma: tipikusan 102-104

Titin: 3,435*104 aminosav C132983H211861N36149O40883S693

Humán kromoszóma 1: 2,25*108 nukleotid Biopolimer Alegység Kötés

Nukleinsav

(RNS, DNS)

Nukleotid

(CTUGA)

Kovalens

(foszfodiészter)

Poliszacharid

(pl. glikogén)

Cukor

(pl. glukóz)

Kovalens

(pl. -glikozid)

Fehérje Aminosav

Kovalens

(peptidkötés)

Fehérjepolimer

(pl. mikrotubulus)

Fehérje

(pl. tubulin)

Másodlagos (Hidrogén kötés, ionos kötés,stb)

Fehérje (protein)

• Elnevezés: 1838 – Jöns Jakob Berzelius (Svéd kémikus)

• „Elsődleges fontosságú” • 1926 – James B. Sumner (biokémikus,USA):

ureáz egy fehérje • 1953 - Frederich Sanger : Kémiai Nobel-díj:

Inzulin aminósav szekvenciájának meghatározása

• 1962 - Max F. Perutz-t és John C. Kendrew :

Kémiai Nobel-díj : hemoglobin és mioglobin kémiai szerkezetének feltérképezése (Röntgen krisztallográfia)

Frederick Sanger

Fehérje (protein)

• Fehérjék: Peptidkötésekkel összekapcsolt aminosavakból álló lineáris polimerek

Feladataik: szerkezeti vagy vázfehérjék (kollagének) szállító funkció (miozin) biokémiai folyamatok szereplői (enzimek) immunológiai folyamatok szereplői (antitestek) jelátvitel,információtovábbítás (hormonok)

Fehérjék szerkezete:

Elsődleges szerkezet: aminosav sorrend

Peptid kötés kialakulása

Fehérjék másodlagos szerkezete

α-hélix

β-redő

Másodlagos szerkezeti elemek hidrogén

kötéseken keresztül stabilizálódnak.

• Béta-kanyar: olyan, nemhelikális tetrapeptid, amelynél az első és az utolsó alfa-szénatom távolsága 7 angströmnél kisebb.

• Gamma-kanyar: olyan tripeptid, melyben az első és az utolsó peptidcsoport között hidrogénkötés van.

• Számos kanyartípust definiáltak a szögek alapján: 7-féle béta kanyar (+ háromnak a tükörképe is), 2-féle gamma-kanyar

Fehérjék harmadlagos és negyedleges szerkezete

Hemoglobin α-alegysége

Hemoglobin A (2α és 2β alegység)

Másodlagos strukturális elemek 3-dimenziós elrendeződése.

Több alegység összekapcsolódásából létrejött szerveződési szint.

Fehérjeszerkezetet összetartó erők:

• Diszulfid híd : cisztein as.-ak között

• Hidrogén híd : megosztott proton

• Sókötés : ellentétesen töltött részecskék között

• Hidrofób kh. : hidrofób molekularészek között (molekula belsejében)

Fehérjék feltekeredésének hajtóereje

Hidrofób mag

Hidrofil aminosavak

Fehérjék feltekeredése (folding)

Anfisen kísérlet

Anfinsen - féle dogma: A fehérjék 3D szerkezetét az aminosav sorrendjük határozza meg. A felgombolyodás termodinamikai kontroll alatt áll: a natív szerkezet a termodinamikailag legstabilisabb állapot.

Levinthal paradoxon

Cyrius Levinthal-elméleti biokémikus

100 aminosavból álló peptid

2 konformációs lehetőség aminosavanként

2100 variáció

1 konformációs állapot 1ps

1010 év szükséges a natív állapot eléréséhez.

Cyrius Levinthal munka közben

A valóságban 1 másodpercen belül

felgombolyodik!

En

erg

ia

Szerkezet

A folyamat nem véletlenszerű, a kialalkuló kötések és szerkezeti elemek meghatározzák a köv. lépést.

A feltekeredés tölcsér elmélete

Függőleges tengely: a molekula ún. szabad energiája. Vízszintes: fehérjéhez tartozó konfromációs szabadségi fok. A felület minden egyes pontja a fehérje 1 konformációjának felel meg. Az egyes molekulák a globális energiaminimumot, azaz a natív állapotot keresik (legmélyebb pont).

Kétállapotú rendszer Általános eset

Molten globule („olvadt gombóc”)

Energia tölcsér elmélet

Nem megfelelően feltekeredett (misfolded) proteinek

Prion: hibás térszerkezetű fehérjék, melyek fertőző ágensként viselkednek -Kuru („nevető halál”) Daniel Carleton Gajdusek – 1976 Nobel díj -Creutzfeldt-Jakob szindróma -Kergemarha kór

Kuru-ban szenvedő őslakosok

β-amiloid felhalmozódása – Alzheimer’s kór

Amiloid plakkok kialakulása az agyban

Molekuláris chaperonok

Segítik a fehérje folding-ot meggátolva a nem megfelelő kölcsönhatásokat,

szétszedve a tiltott összekapcsolódásokat.

Minden sejtkompartmentben jelen vannak.

Olyan fehérjék, amelyek kötik és stabilizálják más fehérjék egyébként nem

stabil alakjait, azok kontrollált kötésével és elengedésével elősegítik az

előírt in vivo sorsuk beteljesedését, legyen az folding, oligomerizáció,

komplexek kialakítása, transzport egy sejtkompartmentbe vagy éppen

eliminálás.

Legtöbbjük ATP-t igényel funkciója végzéséhez.Elrontott fehérje megjavítása:

100 ATP.

Összefoglaló

KÖSZÖNÖM A FIGYELMET!