View
238
Download
0
Category
Preview:
Citation preview
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
1/35
LOGO
HETEROPOLİSAKKARİTLER
FEYZA ÇUBUK
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
2/35
LOGO
Heteropolisakkaritler; glikozi!a"lar# ile !a"la$%#&%o$osakkaritler 'e %o$osakkarit
t(re'leri$i$ )a$#$a s(l*at+ *os*atgi!i !az# ek gr,plar i-ere$ )(ksek%olek(l a"#rl#kl# poli%erlerir.
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
3/35
LOGO
Heteropolisakkaritleri$s#$#*la$#r#l%alar#
Glikozaminoglikanlar/
Proteoglikanlar
Glikoproteinler
Glikolipitler
0
1
2
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
4/35
LOGO
Ko$*or%as)o$
Her bir atomun bir moleküldekiuzaysal durumunu gösterir.
Değiik kon!ormasyonlardaki
moleküller"kon!ormerler aras#ndaki
dönüüm$ ko%alent bağ y#k#m#
olmaks#n#z#n tek bağlar#n etra!#nda
dönme ile ger&ekleir.
Protei$leri$ *o$ksi)o$lar#$#*or%lar# !elirler.
Ko$*ig(ras)o$
'ir grup atomun
geometrik ilikisini i!ade
eder. ()" %e D"
aminoasitleri gibi*
Değiik
kon!igürasyonlar#nbirbirine dönümesi$
ko%alent bağlar#n y#k#m
%e yap#m#n# gerektirir.
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
5/35
LOGO
3)4le 5iagra%
Üçüncülyapı İkincil
yapı
Birincilyapı
Text
PolipeptitPolipeptit
Gen kodlaması
Dördüncülyapı
A%i$oasitleri$
izili%i
.
Polipeptitleri$6iro7e$ !a"l#%oti*lerekatla$%as#$a$
ol,&,r
İki$4il )ap#sal!8lgeler aras# ili&kileri
kapsar.
5e"i&ik tiptepolipeptitleri$
,za)sal ili&kileri$ita$#%lar.
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
6/35
LOGO
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
7/35
LOGO +++.t,emegallery.-om
BİRİ93İL YAP:
Ko'ale$t peptit !a"lar# ile kararl# ,r,%at,t,l,rlar. 5a6a )(ksek )ap# (ze)leri+a6a za)#* !a"lara -ok sa)#a 6iro7e$!a"lar#+ elektrostatik !a"lar# 'e 6iro*o!ik
gr,plar#$ !irle&%esi ile kararl# 6ale gelirler.
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
8/35
LOGO
İKİ93İL YAP:
Peptit !a"lar# %(%k($ ola$ iki$4ilko$*or%as)o$lar# s#$#rla$#r%akta#r. erbest dönü polipeptit iskeletinin ü&
ko%alent bağ#ndan sade-e ikisinin
&e%resinde mümkündür. Karbonil karbon (Co) ve alfa karbon
(Cα) arasındaki arasındaki açı (ψ) psi,alfa karbon ve azot bağı arasındaki
açı (ϕ) phi olarak adlandırılır. Glisin dışındaki ainoasitler için phi
ve psi açılarının kobinas!onlarınınçoğ" sterik en#ellee nedeni ile
$k$n değildir.
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
9/35
LOGO
İKİ93İL YAP:
E$ s#k g8r(le$ iki$4il )ap# t(rleri
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
10/35
LOGO
İKİ93İL YAP:
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
11/35
LOGO
İKİ93İL YAP:
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
12/35
LOGO
Kar!o$il ato%, 'e 6iro7e$ ato%,aras#$aki !a"
Peptit !a"# azot, 'e 6iro7e$ ato%,aras#$aki !a"
>aksi%,% sa)#a 6iro7e$
ol,&t,r%a kapasitesi
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
13/35
LOGO
İKİ93İL YAP:
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
14/35
LOGO
İKİ93İL YAP:
=
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
15/35
LOGO
İKİ93İL YAP:
=
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
16/35
LOGO
İKİ93İL YAP:
İl%ik 'e k#'r#%lar İl%ikler+ !ir-ok e$zi%e s(!stratlar#$
!a"la$%as#$a$ sor,%l, ola$ !8lgeleraras#$a k8pr( k,rar. S#kl#kla katalize kat#la$a%i$oast kal#$t#lar# i-erir.
Helezo$
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
17/35
LOGO
?Ç?93?L YAP:
İki$4il )ap#lar#$ !ir!iri$e ola$ ,r,%lar# 'eol,&t,r,klar# !8lgeleri$ ta%a%#$# kapsar. 5o%ai$+ protei$ )ap#s#$#$ !ir s,!strat 'e)a !a&ka
!ir liga$t !a"la$%a gi!i !elirli ki%)asal )a a*iziksel i&le'i )eri$e getir%e)e )eterli ola$
!8l(%(r. 5(ze$le)i4i o%ai$ler+ ko'ale$te"i&iklikler )a a allosterik ele%e$tleri$!a"la$%as#$a )a$#t olarak protei$leri$ i&le'leri$ee"i&iklikler !a&lat#rlar. Her o%ai$ s,!strat!a"la%az.
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
18/35
LOGO
5@R5?93?L YAP:
Bir protei$i$ polipeptit !ile&i%i$i 'e!ir oligo%er protei$ i-i$ proto%er'e)a alt !iri%leri aras#$aki ,za)salili&kileri ta$#%lar.
5o%ai$+ protei$ )ap#s#$#$ !ir s,!strat'e)a !a&ka !ir liga$t !a"la$%a gi!i!elirli ki%)asal )a a *iziksel i&le'i)eri$e getir%e)e )eterli ola$ !8l(%(r.5(ze$le)i4i o%ai$ler+ ko'ale$t
e"i&iklikler )a a allosterikele%e$tleri$ !a"la$%as#$a )a$#t olarakprotei$leri$ i&le'leri$e e"i&iklikler!a&lat#rlar. Her o%ai$ s,!strat!a"la%az.
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
19/35
LOGO
?Ç?93?L E 5@R5?93?L YAP:LAR5A KARARL:L:K
Nonkovalent etkileşimler
Hidrojen baları
Disül!id baları
"an der #alls etkileşimleri
Hidro!obik etkileşimler$%idro!obik aminoasitlerin yan&incirlerini proteinin iç kısmınaiterek s'dan kor'rlar(
)i&il* ar+inil ve %istidil
kalıntılarının &ıt yüklü yan&incirleri arasındaki%idrojen baları
,istein kalıntılarınınsül!%idril +r'plarınıbalarlar(
B' &ayı! etkileşimler-./0 kj1mol ileyıkılabilir ancakyekünleri önemli
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
20/35
LOGO
?Ç?93?L E 5@R5?93?L YAP:LAR5A KARARL:L:K
Nonkovalent etkileşimler
Hidrojen bağları ve tuz köprüleri
Disülfid bağları
Hidro!obik etkileşimler$%idro!obik aminoasitlerin yan&incirlerini proteinin iç kısmınaiterek s'dan kor'rlar(
)i&il* ar+inil ve %istidil
kalıntılarının &ıt yüklü yan&incirleri arasındaki%idrojen baları
,istein kalıntılarınınsül!%idril +r'plarınıbalarlar(
B' &ayı! etkileşimler-./0 kj1mol ileyıkılabilir ancakyekünleri önemli
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
21/35
LOGO
?Ç BOYUTLU YAP:
1 !o),tl,)ap#
sapta$%as#
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
22/35
LOGO
?Ç BOYUTLU YAP:
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
23/35
LOGO
?Ç BOYUTLU YAP:
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
24/35
LOGO
?Ç BOYUTLU YAP:
LAUE
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
25/35
LOGO
?Ç BOYUTLU YAP:
9?KLEER >A9YETİK REZO9A9SSPEKTROSKOPİSİ 9>RG 9>R spektroskopisi+ C
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
26/35
LOGO
?Ç BOYUTLU YAP:
>OLEK?L >O5ELLE>E Protei$i$ ko$*or%as)o$el i$a%i"i$i$ 'e #s#
ere4esi+ pH+ i)o$ik g(- 'e)a a%i$o asit )ere"i&tir%eleri$i$ !, 6areketleri $as#letkilei"i$i$ si%(las)o$, i-i$ %olek(ler
i$a%ik progra%lar# k,lla$#l#r. Bir protei$ s,!strat#+ i$6i!it8r( 'e)a !a&kaliga$t# ile !,l,&t,",$a ol,&a$ etkile&i%leri$si%(las)o$, i-i$ %olek(ler )erle&tir%eprogra%lar# k,lla$#l#r.
Bi)olo7ik 8$e%i ola$ !ir protei$i$ kilit !8lgeleriile etkile&i%e gire!ile$ %olek(lleri$ sa$al olaraktara$%as#+ )e$i ila-lar#$ !,l,$%as#$#kola)la&t#r%ak a-#s#$a$ )a)g#$ olarakk,lla$#l%akta#r.
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
27/35
LOGO
PROTEİ9LERİ9 KATLA9>AS:
İlk !asa%akta+ )e$i se$tezle$e$ polipeptiri!ozo%a$ a-#"a -#k%akta ol,",$a$+ k#sa!8l(%ler+ )erel (ze$li )ap#lar# sa"la)a$ iki$4il)ap#sal !iri%lere katla$#rlar.
İki$4i !asa%akta+ 6iro*o!ik !8lgeler -8z(4(e$
,zakta+ protei$i$ i- k#s%#$a topla$arak eri%i& !irglo!(l ol,&t,r,r. B,+ k#s%i olarak katla$%#& !irpolipepti ol,p+ protei$i$ olg,$ ko$*or%as)o$,$a,lal#$4a)a kaar )e$ie$ (ze$le$ir.
e$ele+ seko$er )ap#$#$ 6er !ir ele%e$ti katla$%a
s(re4i$i o"al ko$*or%as)o$a o"r,+ 'eri%liol%a)a$ se-e$ekleri$ ,za"#$a g8t(r%ekteir.
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
28/35
LOGO
PROTEİ9LERİ9 KATLA9>AS:
Katla$%a)# kola)la&t#ra$ protei$lerProtei$ is(l*i izo%erazProli$e%eli protei$leri$i$ )ar#s#$a$ *azlas#$#$
katla$%as#$a g8re' ala$ &apero$lar+ )e$i se$tezle$e$polipeptileri -8z(4( etkisi$e$ kor,)arak+ iki$4il )ap#ele%a$lar#$a ol,&%a 'e eri)e$ glo!(llere 8$(&%e&a$s# sa"la%akta#r.
Katla$%as# !oz,l%,& protei$ler iki$4il )ap#lar#$atekrar katla$%a)# kola)la&t#ra$ !8lgeler 'e e"%e$oktalar# !ar#$#r#rlar.
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
29/35
LOGO
PROTEİ9LERİ9 KATLA9>AS:
Dapero$ protei$ler+ katla$%as#!oz,l%,&+ ter%oi$a%ik olarak)a$l#& katla$%#& 8l( $okta)a ,la&%#&protei$leri+ 6iro*o!ik !8lgeleri$ia-#"a -#kar#p 'eri%li !i-i%e tekrar
katla$%alar#$a ola$ak sa"la)arako$ar#rlar. So$,-ta katla$%a$#$a-#l%as# ile geli&ig(zel !ir )ap# orta)a-#k%a%#& ol,r.
l,tat)o$+ oksi7e$+ 6iro7e$ peroksi
'e)a s(peroksi gi!i oksitle)i4iele%e$tlere %ar,z kalarak ol,&a$,)g,$ ol%a)a$ is(l*i !a"lar#$#i$irge)e!ilir.
İ
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
30/35
LOGO
PROTEİ9 KO9FOR>ASYO9U9U9BOZUL>AS:9:9 PATOLOİKSO9UÇLAR:
PRİO9LAR
İ$sa$ prio$ ili&kili protei$ PrPG+ 0I.kro%ozo%,$ k#sa kol,$a kola$%#&+$or%al olarak %o$o%er )ap#a 'e al*a
6elezo$ ora$# )(ksek !ir glikoprotei$ir.Patolo7ik prio$ protei$leri PrPJ$i$ PrPs4J)e8$(&(%($e kal#p g8re'i g8r(r.
PrPs4+ !eta 6elezo$ )8$($e$ ze$gi$ ol,p+!ir-ok 6iro*o!ik a%i$o a-il )a$ zi$4iri ilete%asta#r. Bir!irleri ile a-#kta !,l,$a$6iro*o!ik !8lgeleri )ol,)la k,''etleetkile&tikleri$e$ !irike$ PrPs4 !iri%leri!irle&erek -8z($%ez 8zellikte 'e proteza
ire$-li topaklar ol,&t,r,r.
PROTEİ9 KO9FOR>ASYO9U9U9
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
31/35
LOGO
PROTEİ9 KO9FOR>ASYO9U9U9BOZUL>AS:9:9 PATOLOİKSO9UÇLAR:
ALZHEİ>ER Be)i$ ok,s,$a !,l,$a$ =
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
32/35
LOGO
PROTEİ9 KO9FOR>ASYO9U9U9BOZUL>AS:9:9 PATOLOİKSO9UÇLAR:
BETAİLER Talase%iler+ 6e%oglo!i$i$ polipepti alt
!iri%leri$e$ !ir ta$esi$i$ se$tezi$e )ol a-a$ ge$etike*ektlerle ol,&t,r,l,rlar.
Eritrosit geli&i%i s#ras#$a ol,&a$ 6e%oglo!i$ se$tezpatla%as# s#ras#$a al*a 6e%oglo!i$ sta!ilize ei4iprotei$ AHSPG a# 'erile$ !elirli !ir &apero$+6e%oglo!i$ %,lti%er )ap#s#$a gir%e)i !ekle)e$ser!est al*a alt !iri%leri$e !a"la$#r.
B, &apero$,$ )okl,",$a ser!est al*a 6e%oglo!i$alt !iri%leri topaklar 'e ol,&a$ -8kelti$i$geli&%ekte ola$ eritrosit (zeri$e sitotoksik etkisi'ar#r.
PROTEİ9 KO9FOR>ASYO9U9U9
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
33/35
LOGO
PROTEİ9 KO9FOR>ASYO9U9U9BOZUL>AS:9:9 PATOLOİKSO9UÇLAR:
KOLLAE9 Kolla7e$+ i$sa$ '(4,,$aki protei$ kitlesi$i$ 0Ji$i
ol,&t,r,r. 5eri$i$ k,''et 'e es$ekli"i !ir!iri i-i$e8r(l%(& kolla7e$ 'e elasti$ e%etleri$e$ ka)$akla$#r.
A)$# za%a$a liga%e$t 'e te$o$ gi!i !a" ok,lar#$aa !,l,$,r. Kolla7e$ !i)ose$tezi$e e$ i)i !ili$e$ e*ekt+ prolil 'e
lizi$ kal#$t#lar tara*#$a$ gereksi$i% ,),la$ 3'ita%i$i$ i)etsel eksikli"i$e ol,&a$ skor!(t
6astal#"##r. So$,4,$a g8r(le$ eksik (ze)e6iroksiproli$ 'e 6iroksilizi$ kal#$t#lar+ kolo7e$ li*leri$kararl#l#"#$# !ozarak+ i& eti ka$a%alar#+ ekle%&i&%eleri+ za)#* )ara i)ile&%esi$e )ol a-a!ilir.
PROTEİ9 KO9FOR>ASYO9U9U9
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
34/35
LOGO
PROTEİ9 KO9FOR>ASYO9U9U9BOZUL>AS:9:9 PATOLOİKSO9UÇLAR:
KOLLAE9 >e$ke se$ro%,+ -atalla$%#& sa-
telleri 'e !()(%e gerili"i ileta$#%la$%#& ol,p+ kolla7e$ li*leri$sa"la%l#"#$# g(-le$ire$ ko'ale$t-apraz !a"lar#$ ol,&,%,$akia$a6tar !asa%a"# katalizle)e$ liziloksiaz e$zi%i$i$ getiri"i i)etsel!ak#r eksikli"i$i )a$s#t%akta#r.
E6lers
8/18/2019 Proteıṅlerıṅ Üst Yapi Düzeylerı ̇
35/35
LOGO
2%ank 3o' 4
Recommended