Upload
chancellor-rodrigo
View
197
Download
0
Embed Size (px)
DESCRIPTION
第七章 细菌和病毒的遗传. 第一节 导论 合适材料的选用 遗传学的发展 一、微生物遗传学 1. 概念 2. 发展 1940 年下列 5 个方面的工作使之成为独立学科 1 ) 1941 年 Beadle 营养缺陷型突变体的发现 2 ) 抗性突变 3 ) 细菌重组的发现: 1947 , Leaderberg , J. ( E.coli ) Tatum , E.L. 4 ) 转化子化学本质的鉴定: 1928 : Griffith :肺炎双球菌转化 - PowerPoint PPT Presentation
Citation preview
第七章 细菌和病毒的遗传第七章 细菌和病毒的遗传第一节 导论第一节 导论 合适材料的选用合适材料的选用遗传学的发展遗传学的发展一、微生物遗传学一、微生物遗传学 1. 1. 概念概念 2. 2. 发展发展 19401940 年下列年下列 55 个方面的工作使之成为独立学科个方面的工作使之成为独立学科 11 ) ) 19411941 年年 Beadle Beadle 营养缺陷型突变体的发现营养缺陷型突变体的发现 22 ) 抗性突变) 抗性突变 33 ) 细菌重组的发现:) 细菌重组的发现: 19471947 ,, LeaderbergLeaderberg ,, J. J. ( ( E.coli E.coli ) ) TatumTatum ,, E.L. E.L. 44 ) 转化子化学本质的鉴定:) 转化子化学本质的鉴定: 19281928 :: GriffithGriffith :肺炎双球菌转化:肺炎双球菌转化 19441944 :: AveryAvery :转化子是:转化子是 DNADNA 55 ) 噬菌体遗传学研究的发展。) 噬菌体遗传学研究的发展。
二、微生物作为遗传学研究材料的优越性生物学特性单细胞生物,易受环境影响 N 世代为主容易培养、繁殖、代谢旺盛
优越性易诱发突变:营养缺陷,抗性基因功能基因突变杂交、转导、转化基因细微结构模型生物
第二节 噬菌体的遗传分析
一、噬菌体是一类病毒一、噬菌体是一类病毒 病毒(病毒( VirusVirus ):超显微、无细胞、活细胞专 ):超显微、无细胞、活细胞专 性寄生的大分子(微生物)性寄生的大分子(微生物)1.1. 特点:特点:
a.a. 个体小:通过个体小:通过 DavisDavis 滤器滤器b.b. 专性寄生:脱离活体无生命,无代谢专性寄生:脱离活体无生命,无代谢c.c. 无细胞:蛋白质+无细胞:蛋白质+ DNADNA (( RNARNA ))d.d. 繁殖方式简单繁殖方式简单
2.2. 分类:分类: 动物:球形、卵圆形动物:球形、卵圆形 寄主: 植物:杆状、丝状寄主: 植物:杆状、丝状 细菌:蝌蚪状细菌:蝌蚪状 双链双链 DNADNA:: λλ,, T2T2、、 44、、 66 单链单链 DNADNA:: ΦΦX X 类,动物病 类,动物病 毒、噬菌体毒、噬菌体 单链单链 RNARNA 双链双链 RNARNA
植物病毒、艾滋病毒植物病毒、艾滋病毒
遗传物质:遗传物质:
烟草花叶病毒 腺病毒 烟草花叶病毒 腺病毒 TT4 4 噬菌体 噬菌体 爱滋病病毒 爱滋病病毒 RNA DNA DNA RNARNA DNA DNA RNA
二、噬菌体分类二、噬菌体分类
概念:概念:原指细菌为寄主,后来推广 原指细菌为寄主,后来推广 到真菌的病毒。到真菌的病毒。
1.1. 烈性噬菌体:烈性噬菌体: P2P2 、、 P4P4 、、 P6P6 、、 TT系系列列(( T1-T7T1-T7 ))
2. 2. 温和性噬菌体: 温和性噬菌体: λλ 和和 PP11
1. 1. 烈性噬菌体烈性噬菌体
(( 11 )形态结构()形态结构( TT 偶列)偶列)
(( 22 )) . . 繁殖和感染周期繁殖和感染周期(营养繁殖:噬菌体(营养繁殖:噬菌体 DNADNA 不整合;不整合; 150 150 噬菌体噬菌体 /Cell/Cell ))
吸附吸附
细菌裂解细菌裂解
释放出子代噬菌体颗粒释放出子代噬菌体颗粒
细菌染色体降解细菌染色体降解
蛋白质外壳包蛋白质外壳包装装 DNADNA 成 成 子代噬菌体颗子代噬菌体颗粒粒
2. 温和噬菌体 :
(( 11 )形态结构)形态结构
(( 22 )繁殖和感染周期)繁殖和感染周期 :
吸附吸附 溶菌周期溶菌周期UV UV 诱导诱导
细菌裂解细菌裂解
溶源周期溶源周期
噬菌体噬菌体
(原噬菌体)(原噬菌体)
PP11噬菌体噬菌体
几个相关的概念几个相关的概念
溶原性:噬菌体外壳蛋白的合成以及溶菌溶原性:噬菌体外壳蛋白的合成以及溶菌功能受到抑制。功能受到抑制。
溶原性细菌:“携带”原噬菌体的细菌。溶原性细菌:“携带”原噬菌体的细菌。
原噬菌体:溶原性细菌中的噬菌体原噬菌体:溶原性细菌中的噬菌体 DNADNA 分分子。无外壳;无侵染能力。子。无外壳;无侵染能力。
λ噬菌体 DNA的插入
attλ
三、噬菌体遗传的研究方法三、噬菌体遗传的研究方法
1.1. 获得突变株:处理营养期细菌或者游离噬菌体获得突变株:处理营养期细菌或者游离噬菌体 四类突变株:四类突变株: 11 ))寄主范围突变株(( host range mutanthost range mutant )) 22 ))噬菌斑(( plaque mutantplaque mutant )) 33 )温度敏感性:)温度敏感性: 野生型:野生型: 3737CC 、、 43 43 CC 均可繁殖均可繁殖 突变型:突变型: 4343tsts ::仅仅 37 37 CC 繁殖繁殖 44 )溶菌酶:)溶菌酶: ee ++ ee
11 )寄主范围突变株()寄主范围突变株( host range mutanthost range mutant ))
寄主范围:寄主范围: 指噬菌体感染和裂解的菌株范围 。 指噬菌体感染和裂解的菌株范围 。 某种噬菌体只能侵染某一种菌的个别菌系,某种噬菌体只能侵染某一种菌的个别菌系,
突变后寄主范围变宽或变窄。突变后寄主范围变宽或变窄。
T2 :h+ 噬菌体: 只侵染 只侵染 E.coli B 株株;
h 突变株: E.coli B & B/2
22 )噬菌斑突变株()噬菌斑突变株( plaque mutantplaque mutant ))
噬菌斑形状:噬菌斑的大小、边缘噬菌斑形状:噬菌斑的大小、边缘清晰度、透明程清晰度、透明程度。度。
例如:例如: TT 噬菌体噬菌体 rrAA r r11
rr + + rr (( rapid lysisrapid lysis )) rB rrB r1313
( ( 噬菌斑小、边缘模糊) (速溶型,噬菌斑大、边缘清晰噬菌斑小、边缘模糊) (速溶型,噬菌斑大、边缘清晰 ) ) rC rrC r77
mm + + m m 小型(小型( minuteminute )) cc + + c c 透明(透明( clearclear )) tt + + t t 半透明(半透明( turbidturbid ))
2 、杂交试验- 双重感染
( 1)
E.Coli BE.Coli B
E.Coli BE.Coli B ++ B/2B/2
二点测验
基因型 噬菌斑基因型 噬菌斑
1.1. hh++rr+ + 半透明、小半透明、小
2.2. hh--rr-- 透明、大透明、大• hh++rr-- 半透明、大半透明、大
1.1. hh--rr+ + 透明、小透明、小
重组值重组值
= = ×100% ×100%
重组型重组型
亲型亲型
1+21+2
1+2+3+41+2+3+4
rb - rc
rb - h h 在中间
rc - h
( 2 )三点测验
第三节 细菌的遗传分析一、细菌遗传的研究方法二、遗传分析
1.转化( Transformation )2.接合( Conjunction )3.性导( Sexduction )4.转导( Transduction )
一、细菌遗传的研究方法
理化诱变:1. 生化突变: lac + lac -(乳糖) gal + gal - (半乳糖)2. 抗药性: str + str - (链霉素) azi + azi - (叠氮化物)(叠氮化物)3. 抗噬菌体: T2
s(+) T2r(-)
tonAs tonAr (T1)
4. 营养缺陷型: ade + ade -
试验方法:
细菌生活条件:基本培养基( Basal Medium ):
无机盐: SO42- 、 NO3
- 、 Ca2+ 、 Mg2+
糖 :葡萄糖、蔗糖 维生素:生物素、 Vbs
完全培养基: BM +全部营养物质选择培养基: BM +某一种(营养)物质
二、遗传分析
1. 转化( Transformation )( 1 )发现: 1928 , Griffith :肺炎双球菌转化实验 1944 , Avery :转化子- DNA
转化是细菌基因重组的方法之一。
( 2 )概念: 细菌吸附游离态的双链 DNA ,将单链 DNA 分子吸
收进入细胞后,不经过复制整合到细菌染色体中,并发生遗传重组。
( 3 )转化 DNA (转化子)的特点: a. DNA 浓度与转化子数目的关系 饱和: 50/cell, 原因:在细菌的 细胞壁或细胞膜上有固定 数量的 DNA 接受座位,故 一般细菌摄取的 DNA 分子 数小于 10 个。 b. DNA 片段大小: 不能太小: 肺炎双球菌转化: DNA 片断至少有 800 个碱基对; 枯草杆菌的转化: DNA 片断至少有 16000 个碱基对。 c. 双链吸附:单链 DNA 不被转化 d. 单链进入细菌。
DNA 浓度
转化子数
目
( 4 )受体细胞的特点 a. 感受态: DNA 合成刚刚停止、蛋白质合成继续活跃,活跃合
成的蛋白质可使细菌细胞壁易于接受转化 DNA 。只有感受态的受体细胞才能摄取并转化外源 DNA ,而这种感受态也只能发生在细菌生长周期的某一时间范围内。
b. 感受态的本质: 部分原生质化: 10/cell
酶受体:
( 5 )转化过程:① .双链结合与单链穿入: 双链 DNA分子结合在接受座位上。可逆,可被 DNA酶降解,接受座位饱和性;
单链 DNA摄取,不可逆,不受 DNA 酶破坏。穿入后,由外切酶或 DNA 移位酶降解其中一条链。
② .联会: DNA 片段与细菌染色体部分联会。亲缘关系越远,联会越小、转化可能性越小。
③.整合 (重组 ):单链的转化 DNA与受体DNA对应位点的置换,从而稳定地参入到受体 DNA中。
( 6 )转化成功: 感受态、吸附、整合。
( 7 )转化与基因重组作图:
2 、接合( Conjugation )( 1 )概念:
♂♂ ♀♀
(供体 donor ) (受体 receptor)
DNA
接触
( 2 )发现与证实:
a. 发现:发现:
J. Leaderberg & E.L. Tatum ( 1946 )
(营养缺陷型)
b. 证实 转化作用的排除: A (杀死)+ B 或者 A + B (杀死) Davis U 型管试验 DNase 处理
回复突变突变的排除: 单个基因回复突变频率= 10-6
两个基因同时回复突变的频率 = 10-6×10-6 = 10-12< 10-8
A B
可通过:生物大分子、噬菌体不能通过:细菌
( 3 ) F 因子:a. 发现1952 年: W. Hayes 试验证明: 接合过程中,遗传物质单向转移, 供体( donor )-♂
受体( receptor )-♀
1953 年: Hayes, Leaderberg & Cavalli: ♂有 F因子 ♀ 无 F因子
b. F 因子的遗传结构质粒:旧称附加体,是指 独立于细菌染色体的 可以独立、整合、环出、丢失 含有少量基因的 双链 DNA 环状分子
F 因子 ( 致育因子、性因子 ) :是一种感染性质粒,由于 F
因子存在与否决定是否接合,又称为致育因子。F 因子的遗传结构:图 7-12
根据 F 因子存在的方式, E.Coli 可以分为 4 种菌株
F+
HfrF+
整合
准确环出
配对、交换
准确环出
丢失
不准确环出
F’F-
携 带 1 个 基因~半 条 染 色体
c. 接合过程
i. F+×F - F++F+
ii. Hfr×F - Hfr+F -
复制:滚环模式
d. 部分二倍体、交换与遗传重组
cb+
a+
c+b
a
单交换单交换
II
降解降解
( 4 ) . E.coli 染色体的遗传作图a.a. 中断杂交实验法:(中断杂交实验法:( Wollman & JacobWollman & Jacob ,, 19501950 ))
ab
d
hg f
c
e
1 2
3
c
d
efg
h
a
b
1 2
3c
d ef
gha
b
e
f
g
hab
c
d
3 2
1
gh
abc
d
ef
f
e
d
c b
a
h
g
F +
Hfr
I IIIII
b
h
g
ae
f
g
h
d
c
e
f
横座标:接合时间(分钟)
纵座标:重组体中 Hfr 基因的频率。
I II III
根据上图,可以得到直线连锁图; Hfr 菌株足够多,可以获得整个 E.coli 染色体连锁图。例子:
O
thi thr pro lac pur gal his gly thi thr pro lac pur
O
OO
O
小结(作图步骤):( 1 )作直线连锁图,确定基因间距离及其染色体全长(分钟)。
( 2 )画圆,根据染色体全长标示刻度,按照基因间距离标示基因。
( 3 )标示 Hfr 起点、 终点、菌株 号。
HfrAB312
c.c. 重组作图法重组作图法:: 两基因转移时间间距小于两基因转移时间间距小于 22分钟分钟时,中断杂交法的图距不精确,应时,中断杂交法的图距不精确,应采用传统的重组作图法。采用传统的重组作图法。
例:紧密连锁二基例:紧密连锁二基因因 ::
lac-(lac-(乳糖不发酵乳糖不发酵 ))
ade-(ade-(腺嘌呤缺陷型腺嘌呤缺陷型 ))
Hfr lac+ade+(Strs)× F- lac-ade-(Strr)
完全培养基混合培养
基本培养基(无腺嘌呤、加 Str)
F-ade+ 菌落
F-ade+lac- ,则说明基因间发生交
换
F-ade+lac+ ,则说明未发生交换
加乳糖
基因间重组频率
两个位点间的时间约为 1分钟,大约相当于 20%的重组值。
3. 性导( Sexduction )
概念概念:接合以:接合以 F’因子为媒介为媒介将供体菌染色体将供体菌染色体 DNADNA 转移转移到受体细菌,形成部分二倍到受体细菌,形成部分二倍体的过程。体的过程。
F’F’ 菌株的突出特点:菌株的突出特点:
⑴ ⑴ F’F’ 因子转移基因的比率极高,如同因子转移基因的比率极高,如同 FF++ 因子的转移比率;因子的转移比率; ⑵ ⑵ F’F’ 因子的自然整合率极高,但是整合不是随机的,需要因子的自然整合率极高,但是整合不是随机的,需要 经过配对整合到特定的座位上。 经过配对整合到特定的座位上。
应用:应用:
(( 11 )确定基因的显隐性关系(上图)。)确定基因的显隐性关系(上图)。
(( 22 )绘连锁遗传图:)绘连锁遗传图:
原理:原理: FF++ 不同的不同的 Hfr Hfr 不同的不同的 F’ F’ 距离近的基因容距离近的基因容易环易环
出到同一个出到同一个 F’F’ 因子上因子上“并发性导”“并发性导”详尽的连锁图详尽的连锁图 ..
方法:同 “并发转导”方法:同 “并发转导”
4. 转导( Transduction )( 1 )概念:
转导:是指以噬菌体为媒介将供体细菌 DNA 导 入到受体细菌并发生遗传重组的过程。
1/1000
转导颗粒: 溶菌噬菌体末期,噬菌体装配过程中,外壳
蛋白识别一定长度的 DNA 分子,形成成熟的子代噬菌体时,把寄主细菌的 DNA 片段“错误”地组装到外壳蛋白中而形成。由于感染细菌的能力决定于噬菌体外壳蛋白,所以转导颗粒具有和正常噬菌体相同的侵染能力。
转导体: 转导颗粒将供体细菌的染色体片段转移到受
体细菌,重组后的受体细菌叫作转导体。
( 2 )发现与证实: 黎德伯格( Leaderburg )与津德( Zinder )( 1951 )发现: 鼠伤寒沙门氏菌中转导现象: 将两个沙门氏菌的营养缺陷型进行杂交:
phe- try- tyr- met+ his+ × phe+ try+ tyr+ met- his-
混合培养 phe+ try+ tyr+ met+ his+
基本培养基( 10 - 5 )
证实: a. 10 - 5 > 10 - 12 ( 10 - 6× 10 - 6 )排除回复突变。 b. 戴维斯 U 型管试验 (防止细胞直接接触 ) 也获得野生型重组 体。排除由于接合或性导 c. DNase 处理重组体。排除转化。
推测:某种过滤性因子( FA )可以穿过 DavisU 型管滤片。抗血清可
以抑制重组体出现。 P22 噬菌体。
( 3 )普遍性转导:
a. 概念 供体细菌染色体组的任何部分都可以组装到转导颗粒
中,从而可以转移到受体细菌中。( P1 )
b. 并发性导( co-transduction )与细菌作图合转导(并发转导、共转导): 两个基因同时被包装到一个转导颗粒,从而一起
重组到受体细菌的染色体上。二因子作图: 供体 受体 合转导频率 a+ b+ a b 30% ab 近 a+ c+ a c 35% ac 近 a 在 bc 之
间 b+ c+ b c 3% bc 远三因子作图: 供体 受体 合转导频率 leu+ thr+ azi+ leu thr azi
实验 1 :
leu azi thr azi leu thr
实验 2 :
azi leu thr
实验 3 : 最大转导片段
根据合转导频率推导基因之间的物理距离
)(= 3 X-1Ldd -基因之间的物理距离( bp , kbp )
L -转导 DNA 的平均长度 ( bp , kbp )
X -两个基因合转导的频率
( 4 )特殊性转导:温和性噬菌体进行的转导,只能 转导部分基因。
att
att
N
R
J
A
N R A J
NR
RA
JN
RA
J
JA
R
N
J
A
R
Nd gald gal
bio+bio+
I I 噬菌体噬菌体 DNADNA 特异特异性性
整合到细菌染色体。整合到细菌染色体。
II II 噬菌体噬菌体 DNADNA准确 准确
环出。环出。
III III 噬菌体噬菌体 DNADNA 不不准准
确环出确环出特殊性转特殊性转
导噬菌体的形成。导噬菌体的形成。
d gal / d gal / d biod bio
d gald gal + + E.coliE.coli
UV50% + + 50% d galgal
IV 高频转导( HFT )
N
RA
J
NR
J
N R A JN R A