27
Ефекти на разтворителя, отчитани в квантово-химичните изчисления. Солватационни модели.

Ефекти на разтворителя, отчитани в квантово-химичните изчисления. Солватационни модели

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Ефекти на разтворителя, отчитани в квантово-химичните изчисления. Солватационни модели. - PowerPoint PPT Presentation

Citation preview

Page 1: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Ефекти на разтворителя,

отчитани в квантово-химичните изчисления.

Солватационни модели.

Page 2: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

При обичайните методи за изследване на електронната структура

уравнението на Шрьодингер се решава за изолирана молекула или за

молекули, отдалечени на безкрайно разстояние една от друга.

Физически това съответства на ситуация в газова фаза при ниско

налягане (вакуум). Експериментално обаче множеството химични

реакции се провеждат в разтвор.

Някои характеристики на молекулите (геометрия, вибрационни

честоти, електронен спектър) зависят от вида на разтворителя

поради взаимодействието между разтвореното вещество и

разтворителя. Наличието на разтворител, в частност на полярен

разтворител, може да промени разпределението на зарядите в

молекулата. Това води до промяна на енергията и електронната

плътност и свързаните с тях свойства.

Page 3: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Ефектът на разтворителя може да бъде разделен на 2 важни части:

-ефекти на специфична солватация (“short-range” effects), например

водородно свързване или предпочетена ориентация на молекулите на

разтворителя близо до молекулата на разтвореното вещество;

-„макроскопски” ефекти (“long-range” effects), включващи поляризация

на разтворителя. Тази long-range част е отговорна за генерирането на

(макроскопска) диелектрична константа различна от 1.

-Ефектът на специфичната солватация е концентриран главно върху

първата солватационна сфера, а „макроскопския” (long-range) ефект

изисква разглеждане на голям брой молекули.

Page 4: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Методите за оценка на ефекта на разтворителя могат да бъдат

разделени най-общо на 2 типа:

1. Методи, които описват индивидуалните молекули на разтворителя;

2. Методи, които разглеждат разтворителя като непрекъсната среда

(continuous medium).

Solute SolventSolvent

Dielectric continuum;

Solute

Page 5: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Възможна е комбинация от двата типа:

при разглеждане на първата солватационна сфера се включват

молекули на разтворителя, а останалата част се разглежда като

непрекъсната среда (непрекъснат модел; continuum mоdel).

Solute SolventSolvent

Page 6: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Моделите на реактивното поле разглеждат разтворителя като

еднородна поляризуема среда с диелектрична константа ε, а

молекулата на разтвореното вещество М е поставена в кухина с

подходяща форма, намираща се в тази среда.

Dielectric continuum;

М

Page 7: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Свободна енергия на солватацияСвободна енергия на солватация

Свободната енергия се променя при преминаване на молекулата от вакуум в разтвор

ΔGsоlvation = ΔGcavity + ΔGdispersion + ΔGelectrostatic

енергията, необходима енергията, необходима за образуване на за образуване на кухината, в която е кухината, в която е разположена разположена разтворената молекула разтворената молекула

дисперсиондисперсионна енергияна енергия

електростатична енергия на електростатична енергия на взаимодействие на постоянния и взаимодействие на постоянния и индуцирания дипол на разтворената индуцирания дипол на разтворената молекула с разтворителямолекула с разтворителя

Page 8: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Моделите на реактивното поле се различават по 5 аспекта:

1. Как се дефинират размера и формата на кухината;

2. Как се изчисляват дисперсионните приноси;

3. Как се представя разпределението на заряда на молекулата;

4. Как се описва молекулата М на разтвореното вещество:

- класически (силово поле)

- изразява се количествено (с полуемпирични или ab initio методи)

5. Как се описва диелектричната среда.

Page 9: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

The Born ModelThe Born Model

Born, 1920: електростатичната компонента на свободната енергия на солватация за заряд поставен в сферична кухина, намираща се в разтворителя.

Солватационната енергия е равна на работата за преминаване на йон от вакуум в среда.

Използват се йонни радиуси, определени по кристалографски път. Подходящ само за описание на йони.

aqGelec

q2

2a1

1

Page 10: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Обобщено уравнение на Борн Обобщено уравнение на Борн Generalized Born (GB) EquationGeneralized Born (GB) Equation

Разглежда система от N частици с радиус ai и заряди qi в среда с диелектрична проницаемост .

2

1 1

2

1 1 1

2

1 1

1 11

2

1 1 11 1

2

1 1 11 1

2

N N Ni j i

eli j i iij i

N N N N Ni j i j i

eli j i i j i iij ij i

N N Ni j i

eli j i iij i

q q qG

r a

q q q q qG

r r a

q q qG

r a

Page 11: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

1 1

22 2

2

1 11

2 ( , )

( , ) kъдето and 2

N Ni j

eli j ij ij

ijDij ij ij ij ij i j

ij

q qG

f r a

rf r a r a e a a a D

a

когато i = j този израз преминава в уравнението на Born; for two charges close together the expression returns the Onsager result (ie. a dipole where rij ai, aj); for two charges very far apart (rij ai, aj)) it is close to sum of Coulomb and Born expressions.Предимство: изразът може да се диференцира аналитично; затова е възможна бърза оптимизация!

Приложение на обобщеното уравнение на Приложение на обобщеното уравнение на Борн Борн

Page 12: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Модел на Модел на OnsagerOnsager

Onsager, 1936: разглежда поляризуем дипол с поляризуемост

в центъра на сфера.

Разтворената молекула индуцира реактивно поле в околната

среда. Тя от своя страна индуцира електрично поле в кухината,

което взаимодейства с дипола.

a

Page 13: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

3

RF RF

2RF

3

2 1

2 1

Eнергията на дипола в електрично поле = -

1

2 2 1

RF

elec

a

E

Ga

ккласическиласически Onsager Onsager

Ако структурата е заредена, трябва да се добави съответен член от модела на Born.

Други модели: точков дипол в центъра на сфера (Bell), квадрупол в центъра на сфера (Abraham), мултиполно разширение за да се представи разтворената молекула, елипсоидална кухина.

Page 14: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

квантовквантов Onsager Onsager самосъгласовано реактивно поле самосъгласовано реактивно поле ((Self-Consistent Reaction FieldSelf-Consistent Reaction Field))

Реактивното поле е пертурбация от първи порядък на

Хамилтониана.

Htot H0 HRF

HRF ˆ 2 1 2 1 a3 ˆ

Gelec Htot 0 H0 0 2 1

2 2 1 a3 2

Корекционен фактор за извършената работа при създаване на зарядовото разпределение на разтворената молекула в кухината от средата.

Page 15: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Модел на Модел на Onsager Onsager

Могат да се използват сферични и елипсовидни кухини предимство: могат да се получат аналитични изрази за първите и вторите

производни недостатък: рядко това е истина! Как се определя радиуса?

За сферична молекула може да се намери от молекулния обем, Vm :

Определя се от най-голямото междуатомно разстояние Използват се радиусите от контура на електронните плътности Често получените по горните процедури радиуси се завишават за да се

отчете факта, че молекулите на разтворителя не могат да се приближат толкова близо до разтворената молекула.

a3 3Vm

4NA

; Vm MW

Page 16: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

The Polarizable Continuum Method (PCM)The Polarizable Continuum Method (PCM)

van der Waals радиуси на атомите се използват за да се определи повърхнината от кухините.

Повърхнината се разделя на голям бой малки повърхнинни елементи с област S.

ако Ei е градиента на електричното поле в точка i на молекулата то тогава първоначалния заряд qi се присвоява на всеки елемент като:

Намира се потенциала, дължащ се на точковите заряди, (r), получава се нов градиент на електричното поле. Зарядите се модифицират докато се достигне конвергенция.

Хамилтониана, описващ разтворената молекула се модифицира:

След всяка SCF процедура се изчисляват нови qi и (r).

qi

1

4

E iS

H Ho (r )

Page 17: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

The PCM ApproachThe PCM Approach

Gel H d 0 H00 d 1

2(r)(r)dr

Извършената работа при създаването на зарядовото разпределение вътре в кухината на диелектричната среда.

Page 18: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Ефект на разтворителя върху енергетиката и тавтомерното равновесие при 2-пиридин:

Изчислените разлики в свободните енергии са: Газова фаза: -0.64 kcal/mol, Циклохексан (неполярен): 0.36 kcal/mol Ацетонитрил (полярен): 2.32 kcal/mol в добро съгласие с експеримента.

Намерено е, че средата има по-силно влияние върху кето формата, отколкото върху енолната форма, понеже кето тавтомера е по-полярен

Малко приложенияМалко приложения

N O

H

H

H

H

H

NH

H

H

H

O

H

2-Pyridone 2-Hydroxypyridone

Page 19: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

N N

H

H

O

H

H

A

N N

H

H

H

O

H

B

N N

H

H

H

OH

B1

N N

HO

H

H

F

N N

H

H

H

O

H

G

N N

O

H

H

H

H

Газова фаза F (0.0) > B1(3.3) > B (4.0) > A (4.3) > G (9.6) > H (15.0) Хлороформ F (0.0) > B1(1.9) > B (4.0) > A (4.3) > G (7.8) > H (13.5) Тетрахидрофуран F (0.0) > B1(1.8) > B (2.8) > A (3.6) > G (6.8) > H (13.4) Вода F (0.0) > B (0.7) > B1 (1.3) > A (1.6) > G (4.1) > H (14.5)

Тавтомерни форми на Тавтомерни форми на NN-незаместен -незаместен пиразолон и техни потенциални пиразолон и техни потенциални

тавтомерни превръщаниятавтомерни превръщания

Тавтомерни форми на Тавтомерни форми на NN-незаместен -незаместен пиразолон и техни потенциални пиразолон и техни потенциални

тавтомерни превръщаниятавтомерни превръщания

PCM/MP4/6-31+G(d,p)//MP2/6-31+G(d,p)

Page 20: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

TS

TS

O N

OH

O N

O

O N

O

O NO

H

H

H

0.691.64

7.578.56

10.96

A2 A1 B1A3

монооксим на 9,10-фенантренхинона

MP4/6-311G(d)//MP2/6-31G(d,p)

Page 21: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Solvent A1 A2 A3

CHCl3 0.00 2.82

1.58

DMSO 0.00 2.20

0.79

DMSO (PQM + DMSO) 6.99 3.94

0.00

експеримент ( 1H NMR): CHCl3 A1 : A3 = 1 : 0.1 DMSO A3 : A2 = 1 : 0.35

A1+DMSO A2+DMSO A3+DMSO

ET = -1291.099235 a.u. ET = -1291.106592 a.u. ET = -1291.113704 a.u. Eint = 3.20 kcal/mol Eint = 12.34 kcal/mol Eint = 15.77 kcal/mol (oxim)OH…O(DMSO) = 2.1756 Å (oxim)OH…O(DMSO) = 1.8436 Å (oxim)OH…O(DMSO) = 1.7544 Å

Page 22: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Разгледаните до сега модели

Разглеждат разтворителя като поляризуема среда вместо точно отчитане на молекулите на разтворителя

Зарядовото рапределение на разтворената молекула поляризира разтворителя пораждайки реакционно поле

Реакционното поле на разтворителя променя разтворената молекула

Взаимодействията трябва да се изчисляват самосъгласовано

Тези методи са известни като методи на самосъгласованото реактивно поле – SCRF

Не могат да отчитат специфични взаимодействия, такива като водородни връзки

Page 23: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Модел на Онзагер

сферична кухина

непрекъснатадиелектрична среда

Page 24: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Модел на Томази

кухината заема формата на молекулата

Page 25: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

Молекули на разтворителя се добавят около тази на разтвореното вещество и цялата система се третира с избрания квантово-химичен метод – подход на “супермолекулата”’

Експлицитни Експлицитни моделимодели

Page 26: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

МоМодел надел на супермолекулатасупермолекулата

Не изисква специални входни данни; изходните данни са стандартни.

Предимства:• възможност за отчитане на специфични взаимодействия с молекулите на разтворителя, например водородни връзки;• получават се и МО на разтворителя;• по-точна структура.

Недостатъци:• по-трудно се разграничават приносите на разтворителя и на разтвореното вещество;•изисква огромни компютърни ресурси;• обикновено се работи с методи от ниско ниво.

Page 27: Ефекти на разтворителя,  отчитани в квантово-химичните изчисления.  Солватационни модели

За да могат да се отчитат специфични взаимодействия, като водородни връзки се използва метода на супермолекулата

В + 3H2O

TS + 3H2O

А + 3H2O В + 3H2O

TS + 3H2O

А + 3H2O

25.8724.30

12.5413.89