Филогенетични връзки и генетично разнообразие на някои местни (отечествени) породи кучета (Според анализа на митохондрийната ДНК) Обща характеристика на работата Актуални теми. Произходът на домашните кучета, филогенетичните връзки на отделните породи, също така и генетичното разнообразие и структурата на породите, представляват интерес за света на научните изследвания. Данните получени от генетици, археолози и биолози са взаимно допълващи се, и позволяват да бъде възстановена схемата на филогения при кучето. Секвениране на генома (определяне на първичната структура, последователност) на домашните кучета за връзка на отделните породи и техните генетични структури, а така също и направлението молекулярна медицина към хуманитарната медицина, използващи кучета като модели при изучаването на наследствените заболявания, позволи процъвтяването на ветеринарната медицина. Изследванията на филогенетичните връзки при породите кучета се провеждат в цял свят, но в Русия и бившите съветски републики, вкл. и евразийските; както и някои региони, разполажени на пътя на човешките миграции - в близост до териториите, където се предполага , че е одомашено кучето – остават почти неизследвани. Един от най – широко използваните ДНК маркери във филогенетичните изследвания се явява този на хипервариабилността на района, контролираната зона на митохондриалната ДНК. Този тип маркер ни позволява да се проследи генофонда на животните по майчина линия, поради снижената интензивност на рекомбинацията предавана по майчина линия. Цели и задачи на изследването. Изследване на филогенетичните връзки и генетичното разнообразие на породите кучета, зародили се на териториите на Кавказ, Сибир и Централна Азия. Поставени са следните задачи: 1.Изследване на полиморфизма на нуклеотидните последователности на левия хипервариабилен фрагмент от контролираната зона на митохондрийната ДНК у представителите на избраните породи; 2.Сравнителен филогенетичен анализ на получените резултати за местните (отечествени) породи кучета и публикуваните резултати от други автори отнасящи 1

Филогенетични връзки и генетично разнообразие на някои местни (отечествени)породи кучета

Download PDF Report

Upload
ivan-rogachev
View
237
Download
4

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Филогенетични връзки и генетично разнообразие на някои местни (отечествени) породи кучета

Citation preview

() ( )

. , , , . , , . ( , ) , , , . , , . ; , - , , . , . , .

. , , .

:1. ;2. ()

1
;3. ;4 , , , , .

. , ( , , ) , . . , . , , .

. , , , .

. : (, 2007.) (, 2006.) (, 2007.) 40 - .. (, 2006.)6 (, 2007.)10 50 (, 2006.)3 (, 2002.)

. 8 .

2
. 117 : , , , , , ( 44 169 ) . 16 13 ( ), 3 4 (). . , , . : ; ; ; , ; . (Vila et al., 1997, Savolainen et al., 2002, van Ash et al., 2005), . , GenBank, , .( 1.) - , GenBank; , (Savolainen et al., 2002).

3
. . PCR , . PCR ABI-Prism 3100-Avant (Applied Biosystems, USA). , , .(GenBank accession number NC_002008) , , GenBank, BLAST( NCBI, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST )

, , , (AMOVA)

4
rlequin v.3.0 (Excoffier et al., 2005). () TCS v.1.21 (Clement et al., 2002). , - A, B, C, D, E (Savolainen et al., 2002), , - ( ) . (neighbor-joining) Mega v.2.1 (Kumar et al., 2001,) UPGMA Phylip 3.65 (Felsenstein, 2004). FST (Fixation index), ( -) 6.0 (StatSoft, 2001). 321 , 15459-15779 (GenBank accession number NC_002008). GenBank : DQ403817, DQ403818, DQ403819, DQ403820, DQ403821, DQ403822, DQ403823, DQ403824, DQ403825, FJ392757, FJ392758, FJ392759, FJ392760, FJ392761.

1. (S = 48) .RH . , , ( ) , (Savolainen et

5
al.,2002), . 321 28 .( 1.) 14 , , . 7 , D, 2 , C . , (la5) , , . la5 GenBank, , , Canis, .

( ), , ( ) . (Posada & Crandal, 2001).

, (Savolainen et al.,2002). 2.

(Savolainen et al., 2002). .

, , , . , , .

D RH 24, . , D, , RH 26.

6
2 , . , (Savolainen et al. 2002). , . RH . , , - , , (Savolainen et al., 2002) , . , , , 2. , ( ) E/W, . , D, , .

2 - , , .

7
1. ;2. , (van Ash et al., 2005). 321 .3. , (Savolainen et al., 2002). 321 . D .

RH 24 (.2), , , D. 27 11=12=13=14=54, ( /, ). D 5, D, RH 24 .

RH 26, , D RH 24 .

, ( ) D , .

D 6, , D 5. , , D1, D2, D3, D4, . D 5,

8
, , D 6 . D 6, (van Asch et al., 2005) , , .. . , D 5, D 6 D, .

, , D.

(. 2.), D . RH 24, , , . D .

D .

( ) , , W . (RH 2, RH 14), . . 1, . 1 . , , , 29, (Savolainen et al., 2004) (Savolainen et al., 2002) (, , ), . , , , , W .

FST (Fixation index) - FST ( 3.) FST = 0.00 : . FST = 0.08 , ,

9
. , , , , , , .

3. FST . , p>0.05.

.1. .2. , (van Asch et al., 2005). 321 .3. , (Savolainen et al., 2002). 321 .

.

/ , , (-

10
). , , . , , (UPGMA) . (.3.)

, , , , , , .

. /: , : , . : , . , ( ), , .

3. , , UPGMA , . , , . , . , , . , ,

11
, , . , , , , : (.4) FST (. 5)

4. . , .

(): 1. , 2. , 3. , 4. -, 5. , 6. , 7. (, ), 8. , 9. , 10. , 11. , 12.

FST, () , 70 % , 21 %. , , / , , , , . ( ( . 3 4), FST (. 5).

12
5. , FST.(): 1. , 2. , 3. , 4. -, 5. , 6. , 7. (, ), 8. , 9. , 10. , 11. , 12.

, , , .

(AMOVA), , ( ) . , , , . (1. , , 2. , 3. , 4. ) , . , . ( ) ,

13
. . , 75 85 % .

, , , , . , , , , . ( .3 .3, ( D 6 ) ), (Pereire et al., 2006), , , . , , , . , , , ( ) , - .

. /, ( 4): (S) ; (/L) ; () ; (H).

14
4 ..1. ;2. , (van Ash et al., 2005). 321 ;3. , (Savolainen et al., 2002). 321 4 , , , , . , , , . () . , /. , ,

15
, . , , () , , , . , , - . , , , , ( - ).

.

1. , (, ) .

2. , , , .

3. ( ) , .

4. , , .

5. .

6. , D . D, .

16