*** * * * * * * ***

EVROPSKA UNIE Evropske strukturalni a investicni fondy Operacni program Vyzkum, vyvoj a vzdelavani

Priloha c. 1 Technicke parametry predmetu plnenl

TECHNICKY POPIS PRO SYSTEM

LEICA STELLARIS 8 FALCON

Mikroskop Leica DMi8 Pine motorizovany a automatizovany mikroskop Leica DMi8.

MINISH-HS 1 VO SKOi Sl Vi MLADEZE I• TtLOVYCHO'/Y

Pine motorizovany a invertovany mikroskop DMi8 s binokularnfm tubusem pro pripojenf kamery.

Skenovad stolek s mofoostf inzertnfch vlofok, rozsah pohybu stolku 127 x 83mm, Rychlost 10mm/sec, Rozlisenf 0,025 - 0,037µm, Opakovatelnost < 1 a

0,5 µm, Presnost: 0,01 µm. Leica AFC- Pine softwarove integrovany system pro preciznf udrfovanf roviny zaostrenf - hardwarov'{ autofokus - zalozeny na dlouhovlnnem laseru

s Cloosed Loop pro udrfonf stejne Z osy, elektronicky softwarovy fokus BEST Focus. Posun v ose Zs presnostf 20 nm (posun objektivy).

Super Z galvo insertnf vlozky pro rychle 30 rekonstrukce, kabel ke skenovacfmu stolu . Rozsah posunu 1500 µm krok posuvu step size 20 nm, posun pod kroky mensf nez 1.5 nm nebo 0.5 nm die vol by. Reprodukovatelnost 40nm.

Insert Univerzalnl pro skenovacf stul, sklfcka, petriho misky, apod .

Insert pro Multiwell plates. Insert pro Petriho misky 36 mm, pro superZgalvo.

Insert pro Petriho misky 39 mm, pro superZgalvo.

Insert rotacnf pro sklfcka a Petriho misky univerzalnf. Binokularnf ergonomicky tubus s okulary s volnym pruhledem na vzorek.

Ergonomicke Okulary se zvetSenfm 10 x a zornym polem 25 mm, oba s nastavitelnymi dioptriemi a odnfmatelnymi plastovymi ocnicemi. Specialnf

serizovacf objektiv. Transmisnf rameno pro kondenzor a transmisnf TL detektor. Kontrastnf metody FL, BF, DIC. Mikroskop mofoo ovladat pomocf oddeleneho ovladace od antivibracnfho stolu, tak i prfmo se software i na stativu mikroskopu, prepfnanf pro posuv

hrube a jemne. Velmi rychle prepfnanf mezi hrubym a jemnym fokusem. Smart Move.

17

*** * * * * * * ***

EVROPSKA UNIE Evropske strukturalni a investicni fondy Operacni program Vyzkum, vyvoj a vzdelavani lvllNIS IFRS; VO Sl

*** * * * * * * ***

EVROPSKA UNIE Evropske strukturalnf a investicni fondy Operacni program Vyzkum, vyYoj a vzdelavani

• Filtracn f kostka YS

Objektivy: HC PL FLUOTAR 10x/0.30 CS2

• Semiapochromaticky objektiv, suchy

• barevna korekce, optimalizovany pro konfokalnf mikroskopii

• standartnf korekce objektivu

• vybfrany objektiv

• mofoost pouzitf pro AFC

• FWD= 11.0 mm

HC PL APO 20x/0.75 IMM CORR CS2

lvllNISTI RSTVO SK01..s·1 vi \.'.L/.DELE /:... TELOVYCHOV'i

• planapochromaticky objektiv, multiimerznf (voda, glycerol, olej)

• barevna korekce, optimalizovany pro konfokalnf mikroskopii

• vsechny korekce objektivu, vybfrany objektiv

• korekcnf kroufok pro krycf skla #1,5

• FWD = 0.67 mm.

HC PL APO 86x/1.20 W CS2 • planapochromaticky objektiv, vodnf imerze

• barevna korekce, optimalizovany pro konfokalnf mikroskopii

• standartnf korekce objektivu, vybfrany objektiv

• motorizovana korekce

• FWD = 0.30 mm.

• specialnf korekcnf krouzek pro nastavenf RF (refractive index)

• s motorickou korekcf na krycf sklo a nehomogenity vzorku, pro optimalnf nastavenf optickych parametru, objektiv vhodny pro gSTED, STED

3X, pine integrovany v LAS X sofware

19

*** * * * * * * ***

EVROPSKA UNIE Evropske strukturalnf a investicni fondy Operacni program Vyzkum, vyvoj a vzdelavani

HC PL APO 63x/1.40 OIL CS2 • planapochromaticky objektiv, olejova imerze

• barevna korekce, optimalizovany pro konfokalnf mikroskopii

• standartnf korekce objektivu, vybfrany objektiv

• FWD= 0.14 mm

• pro pro kryd skla #1,5

HC PL APO 93x/1.30 GLY CS2 • planapochromatitky objektiv, glycerolovova imerze

• barevna korekce, optimalizovany pro konfokalnf mikroskopii

• standartnf korekce objektivu, vybf rany objektiv

• motorizovana korekce

• FWD = 0.30 mm

• specialnf korekcnf krouzek pro nastavenf RF (refractive index)

rvJINISTERSTVO SKOl_STVi MLADELE A Ti:LOVYCHOVY

• s motorickou korekd na kryd sklo a nehomogenity vzorku, pro optima Inf nastavenf optickych parametru, objektiv vhodny pro gSTED, STED

3X, pine integrovany v LAS X sofware

lmerznf olej, 10ml, OILNON-FLUORESCING MotCORR deska do CTR boxu pro ovladanf fund mot. Korekce pro objektivy 2ks. Pro vsechny objektivy pine motorizovany a automatizovany DIC. Prismy pro objektivy E,D a objektivove prismy K3,K10.

STELLARIS 8 balfcek s PP (Pulse Picker): Obsahuje bfly laser WLL PP, AOBS, AOBM, SP - spektralnf detekci.

Konfokalnf nastavec: WLL PP - Pulznf sirokospektralnf laserovy zdroj . HIVISR sestava s optickou rotad 400-850 nm

*** * * * * * * ***

EVROPSKA UNIE Evropske strukturalnf a investicnf fondy Operacni program Vyzkum, vyvoj a vzdelavani

Mofoost az 8 vi. delek soucasne z bfleho laseru.

lv11NISTEf1STVO SKOl_STVi fv1LAOE2E /\ T~L.OVYCt-IOVY

AOBS - Akustickoopticky laditelny filtr pro navazanf laseru a vyber vlnove delky a intenzity u vsech pouzitych laseru. Maxima Inf flexibilita pro nastavenf excitace a detekce. Rychle prepfnanf emisnfch spekter. Opticke prvky systemu prizpusobene pro vlnove delky od 400 nm do 850 nm s prostupnostf svetla 99%.

LAS X Lightning - Super-rezolucnf modul pro konfokalnf snfmanf umoznujfd rozlisenf 120 nm v osach xy, 200nm v ose Z, nezavisle snfmanf pro 3 konfokalnf kanaly soucasne vcetne rychlych 3D z-stacku. Softwarovy modul pro snadne snfmanf, LAS X Lightning Expert systems 120nm rozlisenfm. Rozklad svetla na optickem hranolu pro zajistenf maximalnf propustnosti systemu. Skenovad mody xy, xyz, xyt, xyzt, xz, xzt, xzyt spektralnf skeny pro zjistenf aktualnf odezvy vzorku na excitacnf vlnovou delku pres cele mofoe emisnf spektrum v kombinaci s prostorovymi a casovymi skeny. Software umoznuje intuitivnf prfme ovlivnenf nastavenf parametru snfmanf v zavislosti na pofadovanem rozlisenf.

Skener- Mofoost libovolneho prepfnanf on line mezi FOV skenerem a rezonancnfm skenerem bez nutnosti restartovanf software.

Konvencnf skener FOV pro STELLARIS

• nastavitelna rychlost snfmanf

• prav'{ konfokalnf skenovad system

• volitelna rychlost v rozsahu od 1 - 5200Hz (bidirectional)

• X2YScanner design pro velke zorne pole

• az 10 snf mku/vterinu , 512 x 512 pixelu

• az 131 snfmku/vterinu, 512 x 16 pixelu

• Max. Image rozlisenf 8192 x 8192 pixelu nebo 64 Mpixelu

• radkova frekvence az 5200 Linek I vterinu • velikost skenovadho pole 22 mm (SFZ} diagonalne

• hardware zoom, krok od 0. 75x - 48x

21

*** * * * * * * ***

EVROPSKA UNIE Evropske strukturalni a investicni fondy Operacni program Vyzkum, vyvoj a vzdelavani l'vllNISTI .RSI VO SKOL s·1 vi

rviLADEZE /\ TEL.OVYCHOVY

• Rychlost skenovanf pro konvenenf skener min.7 snfmku/vterinu pri rozlisenf 512x512 pixelu (FOV scanner SP8}, mofoost bi-dedirectional

skenovanf - rychlost pro 20fps pro 256x256 pixelu .

• Zorne pole 22mm se zoomem v rozsahu 0.75 - 48x.

• Maximalnf rozlisenf 8192x8192 pixelu.

• Mofoost provadet scany xyz,xzy,xt,xyt,xzt, xyzt, xzyt, x{/I., xzA.,xyA.t, xzA.t, xyA.z, xyzA.t. (t-time, A.-lambda scan, xyz - posuv v osach)

Rezonancnf skener pro STELLARIS • Aktivne chlazeny skener.

• Rychlost skenovanf radku az 16000 Hz (bidirectional)

• Az 28 snfmku I sekundu pri 512 x 512 bodu (full frame) • Az 290 snfmku / sekundu pri 512 x 16 bodu

• Max. skenovacf format: 2496 x 2496 pixelu pro 3 kanaly simultalne

• Skenovacf format min. 16 x 16 pixelu

• Zoom: 1.25x - 48x

• Mofoost pouzitf pro FRAP

• Velikost skenovacfho pole 13 mm diagonalne

Lasery v systemu: Bfly laser WLL s PP (Pulse Pickerem) Umoznuje vfce nez 200 bilionu kombinacf budicfch linek ve spojenf s AOBS

• Umoznuje funkce TauSense: TauGating, TauContrast, TauSeparation, TauScan, GateScan

• Poskytuje pulznf buzenf pro FALCON (Fast Lifetime Imaging Contrast}, volitelne

• Umoznuje zaznam dvojrozmernych excitacnfch a emisnfch spekter podporovanych softwarem pro nastavenf a zobrazenf 20 spekter

Pulznf budicf zdroj svetla od 440 do 790 nm, az 8 samostatnych radku lze libovolne vybrat a pouzft soucasne

• Vaine laditelny v krocfch po 1 nm

22

*** * * * * * * ***

EVROPSKA UNIE Evropske strukturalnf a investicni fondy Operacni program Vyzkum, vyvoj a vzdelavani

• vykon laseru:> 0,9 mW 440-485 nm,> 1,8 mW 485-790 nm

MINISTERSTVO SKOLSTVi ''lli•DEZE I• TELOVYCHO\•Y

• Pulzni frekvence 80 MHZ, variabilni pomoci integrovaneho snimaee pulsu: 80, 40, 20, 10, 5, 2,5 MHz

• 8 kanalovy AOTF (Acousto-Optical-Tunable-Filter) pro rychlou modulaci intenzity laseru, zejmena pro ROI (zajmova oblast) a skenovani

excitace

Port pro UV laser405. Prvky pro pripojenf IR laseru . Laserova dioda s vlnovou delkou 405 nm cw pro fluorescencnf zobrazovanf barvivy jako DAPI nebo Hoechst. lntenzita laseru je modulovana pomoci akusticko-optickeho laditelneho filtru (AOTF), vhodneho pro zobrazovanf v oblasti zajmu (ROI), podrobne:

• Vlnova delka 405 ± 3 nm • Laserov'/ vystupnf v'/kon 100 mW

• Modulace intenzity laseru pomoci AOTF

• Vhodne pro zobrazovanf, fotografovani a fotoaktivaci

Detekce systemu STELLARIS 6 detektoru: • lx TLD detektor pro transmisnf svetlo - prochazejici soucane s DIC. Mofoost nastavenf offset a gain, s QE 30% pro

pozorovanf v prochazejfcim svetle, detektor soucasne pouzitelny s konfokalnfmi detektory. Detektory musi byt

pouzitelne soucasne a musf umoznovat libovolne nastavenf vlnov'/ch delek v detekcnf oblasti .

• 2x HyD-S detektory Power Hybrid Detector HyD S: Nov'/ standard pro detekci. Vsestranny detektor, vysoky vykon v celem spektru,

dvakrat vyssf ucinnost detekce fotonu v modrozelene oblasti ve srovnani se standardnfm multialkalickym

fotonasobicem. Technologie zalozena na Leica Silikon based .

o Typicka ucinnost detekce fotonu> 58% pri 500 nm

o Multi-pixelove kremfkove foto multiplikatorove pole

o Nfzky temny sum, mofoost reflexnfho modu i fluorescence

o Rozsfreny dynamicky rozsah pro maxima Inf kontrast a flexibilitu

23

*** * * * * * * ***

EVROPSKA UNIE Evropske strukturalnf a investicnf fondy Operacnf program Vyzkum, vyvoj a vzdelavanf

o Detekcnf rezimy pro analog, odraz a pocftanf fotonu

o Pocftanf energie: lze identifikovat 0,1,2 (dvojf) fotony

o TauSense mofoosti:

rv11NtSTEf-1STVO Sl

*** * * * * * * ***

EVROPSKA UNIE Evropske strukturalnf a investicnf fondy Operacnf program Vyzkum, vyvoj a vzdelavanf rvllNISTl:RSTVO SKO i s·1 vi

~ .. ·:LA.DELE A T~LOVYCHOVY

o Velmi nfzky temny sum pro kvantitativnf metody merenf jako FLIM a FCS.

o Vynikajfcf dynamicky rozsah pro maximalnf kontrast a flexibilitu.

o Rezimy detekce digitalnfho a fotonoveho poCftanf.

o PoCftanf energie: lze identifikovat 0,1,2 (dvojf) fotony

o TauSense mofoosti:

o TauGating: AZ 16 laditelnych timegates, soucasne. TauContrast: Prumerna doba prfjezdu fotonu. TauSeparation: Oddelenf soucastf

zalozene na zivotnosti.

25

*** * * * * * * ***

STELLARIS FALCON:

EVROPSKA UNIE Evropske strukturalni a investicni fondy Operacni program Vyzkum, vyvoj a vzdelavani MINISTFRSTVO SKO L STVi,

:vili1DEZE 1~ T~LOVYCHOVY

FAST Lifetime CONtrast (FALCON) je reseni FLIM s rychlym ziskanim, zpracovanfm a analyzou obrazu FLIM. Akvizienf software, pine integrovany do LAS X, umoznuje FLIM s jakymkoli zobrazovacfm workflow (casova prodleva, 3D, lambda skenovanf, kombinace s mozaikov'{m zobrazovanfm (LAS X Navigator), 3D prohlfzec). Pro zv'{senf rychlosti snfmanf je mofoe kombinovat vfce detektoru. Tento software zobrazuje v realnem case obraz fastFLIM. Analyzu lze provest na ROI i na serii obrazu (casova prodleva, z-stack, mozaika), ktere lze analyzovat jako kompletnf datov'{ soubor nebo rozdelit na obrazy. LAS X FLIM zahrnuje FLIM-FRET. Analyticky software poskytuje mapu ucinnosti FLIM-FRET, obraz ucinnosti FRET. FALCON zahrnuje analyzu FLIM Phasors, ktera poskytuje 2D graficke zobrazenf pro rozlisenf a oddelenf ruznych druhu zivota v obraze. Phasor FLIM se zfskavajf jiz behem akvizice a lze je prfmo na obrazovce mapovat, aby se zv'{raznilo prostorove rozlozenf doby zivota . Phasor FLIM muze byt automaticky kalibrovan pro kazdou harmonickou nebo lze provest kalibraci . Kalibrovat lze vfce souboru najednou . Phasor FLIM je idealnf zobrazenf pro kombinaci FLIM-FRET. FLIM modul lze ovladat pomocf

tohoto software LAS X bez nutnosti exportu dat do softwaru tretfch stran.

• FLIM modul je pouzitelny soucasne pro 2 vysoce citlive detektory HyD X.

• V'{stupnf data jsou pouzitelna pro FRET analyzu, FRET-FLIM a pod.

• Mofoost oddelenf spekter fluoroforu (spectral unmixing) na zaklade lifetime snfmanych fluoroforu jako zakladnf funce FALCON .

• Mofoost nasledneho zpracovanf nasnfmaneho obrazu na zaklade informace casu prfletu jednotliv'{ch fotonu a identifikace a oddelenf

autofluorescence od signalu fluoroforu na zaklade informace casu prfletu jednotliv'{ch fotonu jako jedna ze zakladnfch fund FALCON.

• Mofoost vizualizace a intuitivnfho zobrazovanf, vyhodnocenf a zpracovanf obrazu pomocf pomocf LAS X Phasor. - fazoroveho diagramu

implementovaneho prfmo do software mikroskopu.

Software LAS X: Leica LAS X bal(cek softwaru, 64 bit verze LAS X STELLARIS Control Software- pro ovladanf mikroskopu a vsech jeho prvku. Pro ovladanf vesker'{ch funkcf mikroskopu a kamery a krome jineho umoznuje nasledujfcf funkce:

• autofokus, snfmanf obrazu v ruznych optickych rovinach (Z-stack)

• automaticke snfmanf a ukladanf obrazu

• Image Campas- pro snadne nastavenf celeho systemu

26

*** * * * * * * ***

EVROPSKA UNIE Evropske strukturalni a investicni fondy Operacni program Vyzkum, vyvoj a vzdelavani MINISTf'RSTVO Sl

*** * * * * * * ***

EVROPSKA UNIE Evropske strukturalni a investicni fondy Operacni program Vyzkum, vyvoj a vzdelavani rv!INISTH1STVO SKOLS i Vi,

~v1LADE2E A T~LOVYCHOVY

HP Z6G4 with pro budoucf upgrade, pine kompatibilnf pro {DIVE, DLS, FALCON, STED) .

• Intel Xeon Gold 6244 processor (8 jader I 16 via ken). • 192 GB RAM .

• Nvidia Quadro RTX 6000 graficka karta s 24 GB RAM a 4608 CUDA procesory.

• Rychly disk 256 GB SATA SSD system drive {Windows, LAS X), rychly 2 TB M.2 SSD hard disk. Daisi hard disk 6 TB HDD pro ukladanf dat.

• Intel X710 adapter.

• HP 9.5mm Slim SuperMulti DVD vypalovacka.

• Windows 10 loT Enterprise LTSC 2019.

• Klavesnice, mys.

• 2 Thunderbolt porty {TB3).

Display 31,8" 2ks o 4K UHD {3840 x 2160 @ 60 Hz)

o Kontrast 1300:1 static, 5000000:1 dynamic

o I PS s LED-Backlight

o Uhel: 178° horizontal, 178° vertical

o Rozmer: 16:9

o Kontrast: 350 cd/m 2

o Konektivita: 1DisplayPort,1 mini DisplayPort, 1HDMI,1 USB Type-C

o Reakcnf doba : 14 ms z sedive do sedive

Remote care jako vhodna sluzba pro monitorovanf celeho systemu a predchazenf porucham systemu a kontrola parametru uzivatelu . Vzdalena techn icka kontrola 24h 7 dnf v tydnu z dohledoveho centra .

Zaskolenf a zaruka: 2 {16h) Dny profesionalnfho skolenf od aplikaenfho specialisty.

lnstalace a doprava v cene.

28

*** * * * * * * ***

EVROPSKA UNIE Evropske strukturalnf a investicnf fondy Operacni program Vyzkum, vyvoj a vzdelavanf

Na cely system se vztahuje 2 roky

Naroky na provoz jsou standartnf.

MINIS I f.RSTVO Sl