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Copyright © 2012 SAS Institute Inc. All rights reserved.
臨床データ統合ツールClinical Data Integrationの発展の方向性2012年8月3日SAS Institute Japan株式会社ビジネス開発本部 ビジネスソリューショングループ角田 亮
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Table of Contents
SAS® CDI(Clinical Data Integration)とは?
CDIの概要
CDIのオプション
CDIの位置付け
CDIユーザー様の導入目的(一例)
CDI導入実績
CDIロードマップ(計画)
CDIデモ
(参考)InForm Integration
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SAS® CDI(Clinical Data Integration)とは?
CDIは、臨床試験データとそのメタデータを統合、標準化、そして管理を行う為のデータ変換ソリューションです。
本ソリューションは、以下を実現します。
異なるソースからのデータの統合
中間データの業界モデルへの標準化
過去データの最新形式への移行
分析や規制当局への提出用のデータを効率的に準備する為の標準化されたデータの活用
CDIは、SASの情報管理(Information Management)プロダクトの一つです。
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CDIの概要汎用データ統合ツールであるSAS® Data Integrationに、CDISC対応機能等を付加したライフサイエンス業界専用データ統合ソリューションです。
データ(例:生データ、SDTMドメイン)やジョブ(例:SQL結合、抽出)を、GUI上でマッピング、設定していくことで、データ統合の為のSASコードを生成
SDTMドメインのCDISC標準適合チェックや、CRT.DDS作成など、充実したCDISC対応支援機能
SAS® Drug Development(SDD)など他のライフサイエンスソリューションとの連携機能
メタデータを集中管理することで、ある生データを変更した際、更新が必要なSDTMドメインの特定など、充実したデータマネジメント機能を提供
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CDIのオプションCDIの無償オプションとして、Medidata Rave Adapterと”Publish to SDD” plug-Inをご提供しております。
Medidata Rave® Adapter• RaveのWebサービスを利用し、
Raveのデータ/メタデータを効率的、セキュアにCDIに取り込み、活用する為のソリューション
“Publish to SDD” Plug-In• CDIで開発したジョブ(SASプログラム)を、
Part 11対応のSDD上で本番実行する為に、SDDにパブリッシュするソリューション
* Statistical Computing EnvironmentClinical Data Environment
** SAS Drug Development
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CDIの位置付けCDIは、オプションを用いてEDCやSDDと連携します。CDIで作成したSDTMドメインに対してJMP Clinicalで安全性分析を行うことが可能です。
EDC(Medidata RaveやOracle Informなど)
& その他のデータソース
EDC(Medidata RaveやOracle Informなど)
& その他のデータソース
EDC(Medidata RaveやOracle Informなど)
& その他のデータソース
データ取得 データ統合 データ分析データ変換 データ探索
CDI•データ統合、変換SASプログラム開発、実行環境(GUIベース)
データ抽出*1
(データ抽出)
SDD(SAS Drug Development: Webベースのクラウドアプリケーション)
•臨床試験データレポジトリ(CDR)
• SASプログラム開発、実行環境(Procedureベース)
• Part 11& MHLW ERES指針準拠機能(監査証跡等)
SASプログラムの生成*2
(データセットの格納)
JMP Clinical•対話型安全性データ探索ツール
データの活用
(データの活用)
*1 Rave Adapter *2 Publish to SDD
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CDIユーザー様の導入目的(一例)
各システム(EDC, CDMS, Lab, etc.)に散在するデータの統合
異なる形式(自社標準, CDISC, 提携企業標準, etc.)のデータの統合
CDISC準拠(SDTMドメイン作成, 標準適合チェック, CRT.DDS, etc.)
データ統合プロセスの品質担保(SDDとの連携によるPart 11対応等)
データ統合業務のCRO委託時の受入検査の効率化
プログラミング非熟練人材の有効活用
規制当局からの照会への対応(迅速なデータの用意等)
EDC(Medidata Rave®)とのシームレスな連携
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CDI導入実績CDIは、2009年11月の発売から、16社以上の製薬企業やCRO様にご導入頂いております。(2011年時点)
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CDIロードマップ(計画:1/2)2013年第一四半期リリース予定の次期バージョン(CDI2.4)においては、CDISCの標準化の進展をフォローします。
既存のCDISC標準のアップデート
CDISC Controlled terms CDISC CAB-VP SDTM check update Add ODM 1.3.1 support SDTM 3.1.3 and maybe 3.1.4
新たなCDISC標準のサポート
ADaMの完全サポート
SEND ※目標(CDI2.5以降にて実装の可能性有)
SDTM extensions for medical devices※目標(CDI2.5以降にて実装の可能性有)
Therapeutic Area (CDISC 55 in 5)※目標(CDI2.5以降にて実装の可能性有)
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CDIロードマップ(計画:2/2)また、CDI2.4においては、Data Integrationに由来するCDI基本機能の操作性の改善やADaM関連機能の強化等も行う予定です。
define.xml/ODMからのスタディの定義
multiple study/submissionテンプレートの提供(フォルダー階層、ライブラリのプレースホルダー)
“Publish to SDD”のアップデート
ジョブの再利用の容易化※目標(CDI2.5以降にて実装の可能性有)
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CDIデモ
1. Raveサーバの登録
2. スタディの設定
3.テーブル定義の取り込み
4. プロパティ確認
5. ジョブ設定
6. SDTM作成
7. トライアル・デザイン・ドメイン作成
8. SDTMコンプライアンスチェック
9. CRT.DDS作成
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1.1. Raveサーバの登録(1/2):SAS管理コンソール
SAS管理コンソール(SAS Management Console)上でRaveサーバを登録することで、サーバ管理を集約化致します。
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1.2. Raveサーバの登録(2/2):SAS管理コンソール
CDIクライアント(SAS Data Integration Studio)のメニュー「Medidata Rave®」の操作により、テスト接続やスタディのマッピング状況を確認可能です。
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2.1. スタディの設定(1/2):通常のスタディ
CDIクライアントのフォルダー表示では通常は水色、Rave関連スタディは群青色のフラスコアイコンで区別されます。通常スタディでは右クリックによりMedidata Rave®への接続設定ウィザードを開始可能です。
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2.2. スタディの設定(2/2):Rave関連スタディ
Rave関連スタディでは右クリックにて、Raveサーバ上のテーブル定義の取り込みや接続解除が可能です。テーブル定義の取り込みはGUI操作が可能です。
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3. テーブル定義の取り込み
以下では、テーブル定義の取り込みにより、「rave001」スタディのソースフォルダー「source」に、raveのテーブル「VS1」が追加されております。
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4.1. プロパティ確認(1/3):接続情報とコードリスト
Rave関連スタディのプロパティには「Medidata Rave®」タブが追加表示され、Raveサーバへの接続情報の確認やコードリストの取得が可能です。
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4.2. プロパティ確認(2/3):ODM文書保管フォルダ
ODM文書保管フォルダ(前頁参照)を実際に確認すると、タイムスタンプが付与された、Raveから抽出されたODMファイルを確認できます。
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4.3. プロパティ確認(3/3):ODM文書保管フォルダ
変換ログテーブル(前頁参照)を実際に確認すると、実行日時や形態(snapshot/transactional)等の各種ログ情報を確認可能です。
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5.1. ジョブ設定(1/2):「抽出(Extract Medidata Rave® Data)」
「Transformations」タブで提供されているジョブ「抽出」を配置、実行することで、対象とするテーブルを選択し、抽出を実行可能です。
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5.2. ジョブ設定(2/2):「更新(Update from Medidata Rave® Data)」
ジョブ「更新」の使用により、テーブルの更新も可能です。なお、「抽出」「更新」とも、ジョブの実行により、SASコードが生成されます。
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6.1. SDTM作成(1/2):ソースデータセット準備済みの場合
前頁までの作業により、ソースのデータセットの準備が終了している為、下図の「DS」等のSDTMドメインの作成が可能です。
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6.2. SDTM作成(2/2):ソースデータセット同時準備の場合
SDTMドメインを作成するジョブの実行時に、Raveサーバに接続し、ソースのデータセットを更新することも可能です。また、下図のジョブでは、SDTMドメインのCDISC適合チェック(後述)も組み込みしております。
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7. トライアル・デザイン・ドメイン作成
トライアル・デザイン・ドメインの作成も可能です。
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8. SDTMコンプライアンスチェック
従来のCDIと同様に、SDTMコンプライアンスチェックを実施し、結果をPDFなどの任意の形式で出力することも可能です。
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9. CRT.DDS作成
従来のCDIと同様に、CRT.DDSの作成も可能です。
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(参考)InForm Integration※サービスとしてのご提供
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1. InForm Integration:全体構成
本件に関する論文は、以下より入手可能です。http://www.pharmasug.org/proceedings/2012/AD/PharmaSUG-2012-AD27-SAS.pdf
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2. InForm Integration:スコープ
本件に関する論文は、以下より入手可能です。http://www.pharmasug.org/proceedings/2012/AD/PharmaSUG-2012-AD27-SAS.pdf
今回のスコープ
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3. InForm Integration:プロセスフロー
本件に関する論文は、以下より入手可能です。http://www.pharmasug.org/proceedings/2012/AD/PharmaSUG-2012-AD27-SAS.pdf
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4. InForm Integration:XML⇒SASデータセット変換
本件に関する論文は、以下より入手可能です。http://www.pharmasug.org/proceedings/2012/AD/PharmaSUG-2012-AD27-SAS.pdf
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5. InForm Integration:GUIでの接続設定
本件に関する論文は、以下より入手可能です。http://www.pharmasug.org/proceedings/2012/AD/PharmaSUG-2012-AD27-SAS.pdf
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6. InForm Integration:GUIでのパラメータ設定
本件に関する論文は、以下より入手可能です。http://www.pharmasug.org/proceedings/2012/AD/PharmaSUG-2012-AD27-SAS.pdf
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