Upload
bojan-kusar
View
1.007
Download
2
Embed Size (px)
Citation preview
BiokemijaUvod u biokemiju
Dr. sc. Ivica Strelec, docent
BiokemijaBiokemija je znanost o molekulskim temeljima ivota!
Kontinuirano praenje nastave, nain polaganja ispita i formiranja ocjene
Vrste provjere Parcijalni pismeni Domaa zadaa Prisustvo predavanjima Laboratorijske vjebe
Broj 4 4 12(15) 6
Bodovi 25 5 1 1
Ukupno 100 20 12 6
% ocjene 66,7 13,3 8 4
Rad na vjebama
6
2
12150
8100 %3
Ukupno bodovaUvod u biokemiju
Kontinuirano praenje nastave, nain polaganja ispita i formiranja ocjeneCiljevi Odsluan predmet Vrsta provjerePrisustvovanje nastavi Prisustvo vjebama Aktivnost na vjebama
Bodovi6 6 3
Osloboenje od pismenog dijela ispita
Prisustvovanje nastavi Domaa zadaa Prisustvo vjebama Aktivnost na vjebama Parcijalni ispitiPrisustvovanje nastavi Domaa zadaa Prisustvo vjebama Aktivnost na vjebama Parcijalni ispitiUvod u biokemiju
6 8 6 6 526 8 6 6 724
Poloen ispit
Literatura
Preporuena literatura
Lubert Stryer: Biokemija, kolska knjiga, Zagreb, 1991 Lubert Stryer: Biochemistry (4 Ed), W. H. Freeman and Company, USA, 1999 Peter Karlson: Biokemija, kolska knjiga, Zagreb, 1993 Trudy McKee, James R. McKee: Biochemistry, The McGraw-Hill Companies Inc., USA, 1996 Praktikum iz Biokemije, interna skripta, PTF Osijek, 2009 dostupno na webuUvod u biokemiju 5
Literatura
Dodatna literatura dostupna u knjinici PTF-a
Geoffrey Zubay: Biochemistry, Wm. C. Brown Communications, Inc., USA, 1993 Christopher K. Mathews, K. E. Van Holde: Biochemistry, The Benjamin/Cummings Publishing Company, Inc., USA, 1996 Donald Voet, Judith G. Voet, Charlotte W. Prat: Fundamentals of Biochemistry, John Wiley and Sons, Inc., USA, 1999
Uvod u biokemiju
6
Laboratorijske vjebe
Vjebe se odravaju u 6 termina
Za svaku pojedinu vjebu treba se pripremiti prouiti pokuse u praktikumu
Za vjebe potrebno:
Laboratorijski mantil Kalkulator Radni listovi iz biokemije Praktikum iz biokemije kare, ljepilo za papirUvod u biokemiju 7
to emo danas nauiti?
Funkcionalne skupine biomolekula Glavne vrste biomolekula Kljune reakcije u biolokim sustavima Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj sredini Struktura i graa stanica
Uvod u biokemiju
8
Funkcionalne skupine biomolekula
ivi organizmi su izgraeni od tisua razliitih vrsta anorganskih i organskih molekula (biomolekula)!
Anorganske molekule
Voda ini 50 95 % stanine mase Ioni (Na+, K+, Mg2+, Ca2+) oko 1 %
Organske molekule (biomolekule) ine 4 49 % stanine mase
Biomolekule su u principu izgraene od 6 osnovnih elemenata: C, H, O, N, P, S Veinu biomolekula moemo smatrati derivatima ugljikovodika
Uvod u biokemiju
9
Funkcionalne skupine biomolekula
Ugljikovodici su hidrofobne molekule sastavljene od ugljika i vodika (hidrofobno = netopljivo u vodi).
Metan
Etan
Heksan
Cikloheksan
Ukoliko na C-atom/e ugljikovodika dodamo neke druge atome ili grupe atoma nastaju novi organski spojevi (biomolekule) drugaijih svojstava.Uvod u biokemiju 10
Funkcionalne skupine biomolekula
Svojstva tih novih organskih spojeva (biomolekula) odreena su rasporedom dodanih atoma koje nazivamo funkcionalnim skupinama. Primjer dodatka grupe atoma na ugljikovodik dolazi do promjene svojstava (metan je plin, metanol je tekuina)
OH
Metan
Metanol
Uvod u biokemiju
11
Funkcionalne skupine biomolekulaVrsta spojaAlkoholi Aldehidi Ketoni Karboksilne kiseline Amini Amidi Tioli Esteri Alkeni
Struktura
SkupinaHidroksilna Karbonilna Karbonilna Karboksilna Amino Amido Tiolna Esterska Alkenska
SvojstvaPolarna, stvara vodikove veze Polarna, stvara vodikove veze Polarna, stvara vodikove veze Slabo kisela, nosi negativan naboj kada disociraSlabo bazina, nosi pozitivan kada protonira
Polarna, stvara vodikove vezeLako oksidira, stvara disulfidne veze S-S-
Polarna, nalazi se u nekim lipidima Strukturni element u nekim lipidima
Uvod u biokemiju
12
Funkcionalne skupine biomolekula
Zadatak: Oznaite i imenujte funkcionalne skupine u prikazanim biomolekulama.
Uvod u biokemiju
13
Glavne vrste biomolekula
Stanice sadre 4 glavne vrste biomolekula: aminokiseline, eere, masne kiseline i nukleotide!Biomolekule Aminokiseline eeri (monosaharidi) Masne kiseline Polimer Proteini Ugljikohidrati (polisaharidi) Opa funkcija biomolekule Graevni elementi proteina Izvor energije i graevni elementi
Izvor energije i graevni elementi lipida
Nukleotidi
DNA RNA
Genetska informacija (DNA) Sinteza proteina (RNA)
Uvod u biokemiju
14
Glavne vrste biomolekulaAminokiseline
Aminokiseline su male organske molekule (biomolekule) koje sadre karboksilnu i amino skupinu. U prirodi postoji 100-tinjak razliitih aminokiselina koje se dijele na , ili -aminokiseline obzirom na poloaj amino skupine u odnosu na karboksilnu skupinu.
Glutamin
-alanin
-aminobutirina kiselina (GABA)15
Uvod u biokemiju
Glavne vrste biomolekulaAminokiseline
20 standardnih -aminokiselina se ugrauje u proteine peptidnom vezom.
Osnovna funkcija -aminokiselina je izgradnja polimernih struktura (proteina) Neke -aminokiseline imaju i fizioloke funkcije (neurotransmiteri-prijenosnici ivanih signala- Gly, Glu)
Peptidna veza
Uvod u biokemiju
16
Glavne vrste biomolekulaeeri
eeri su organske molekule koji sadre karbonilnu i hidroksilne skupine.
Glukoza (aldoheksoza)
Fruktoza (ketoheksoza)
Riboza (aldopentoza)Uvod u biokemiju
2-deoksiriboza (aldoheksoza)17
Glavne vrste biomolekulaeeri
Jednostavni eeri (monosaharidi) izgrauju sloene eere (polisaharide) poput celuloze, amiloze i amilopektina, glikogena. Glavne funkcije eera su:
Graevni blokovi sloenih ugljikohidrata (polisaharida) Izvor energije Graevni elementi nukleinskih kiselina, glikolipida glikoproteina
i
Uvod u biokemiju
18
Glavne vrste biomolekulaMasne kiseline
Masne kiseline su monokarboksilne kiseline koje najee sadre paran broj ugljikovih atoma (4 - 24).
Palmitinska kiselina (zasiena, C16)
Oleinska kiselina (nezasiena, C16)Uvod u biokemiju 19
Glavne vrste biomolekulaMasne kiseline
Masne kiseline se u slobodnom obliku u organizmu nalaze samo u tragovima.
U naem organizmu slue kao izvor energije. Lipidi su netopljivi u vodi.
Ugrauju se u lipide strukturni elementi su lipida.
Triacilglicerol (lipid)
Fosfatidilkolin (fosfolipid)Uvod u biokemiju 20
Glavne vrste biomolekulaNukleotidi
Nukleotidi su sloene molekule izgraene od:
eera (deoksiriboze ili riboze) Duine baze Fosfatne grupe (jedne ili vie)Adenin
NukleotidAdenozin-trifosfat
ATP3 fosfatne skupine
Riboza
Uvod u biokemiju
21
Glavne vrste biomolekulaNukleotidi
Duine baze su heterocikliki aromatski prstenovi. Postoje 2 grupe duinih baza
Bicikliki purini (A, G)
Adenin (A) Bicikliki purini
Gvanin (G)
Adenin (A) Gvanin (G)Timin (T) Citozin (C) Uracil (U)
Monocikliki pirimidini
Timin (T)
Citozin (C)
Uracil (U)22
Monocikliki pirimidiniUvod u biokemiju
Glavne vrste biomolekulaNukleotidi
Glavne funkcije nukleotida su:
Graevni blokovi za izgradnju nukleinskih kiselina
DNA (deoksiribonukleinske kiseline) RNA (ribonukleinske kiseline)
Sudjeluju u brojnim biosintetskim putevima (UDP-glukoza) Slue za pohranu energije (ATP)
Uvod u biokemiju
23
Glavne vrste biomolekulaNukleotidi i nukleinske kiseline
DNA je nositelj genetske informacijeGen je dio DNA koji kodira slijed aminokiselina u proteinu
Fosfodiesterska veza
Dvostruka uzvojnica
Vodikova vezaUvod u biokemiju 24
Glavne vrste biomolekulaNukleotidi i nukleinske kiseline
RNA je posrednik u prijenosu genetske informacije! Razlikuje se od DNA u nekoliko svojstava:
Jednolanana je molekula Sadri eer ribozu Umjesto duine baze timina (T) sadri uracil (U)
Postoje tri tipa RNA
Glasnika RNA (mRNA) nosi informaciju prepisanu sa molekule DNA Ribosomska RNA (rRNA) sastavni dio ribosoma (ribosomi su organele za sintezu proteina) Transportna RNA (tRNA) koja nosi aminokiseline
Uvod u biokemiju
25
Glavne vrste biomolekulaNukleotidi i nukleinske kiselinePrijenos genetske informacije
Transkripcija (prepisivanje)
Informacija sa molekule DNA se prepisuje u molekulu mRNA Molekula mRNA se vee na ribosom Ribosom se pomie po mRNA od poetnog (start) kodona za duinu od tri baze (kodon) tRNA (koja nosi specifinu aminokiselinu) se svojim antikodonom vee na kodon. Aminokiseline se spajaju. Ribosom se ponovo pomie za tri baze.
Translacija (prevoenje)
Uvod u biokemiju
26
Glavne vrste biomolekulaZadatakPrikazane strukture pridruite odreenoj grupi biomolekula!
Uvod u biokemiju
27
Kljune reakcije u biolokim sustavima
Osnovne bioloke funkcije naeg i svih ostalih ivih organizama su:
Rast Razvoj Razmnoavanje (davanje potomstva)
Da bi to mogao provesti na organizam crpi hranu (energiju) iz okoline i pretvara je u energiju i graevne blokove potrebne za izgradnju organizma (rast i razvoj) i reprodukciju (davanje potomstva).Uvod u biokemiju 28
Kljune reakcije u biolokim sustavima
Suma svih biokemijskih reakcija u organizmu kojima se energija iz okoline (pohranjena u obliku makromolekula hrane) pretvara u energiju neophodnu za odravanje i izgradnju biomolekula organizma ini metabolizam. Osnovne funkcije metabolizma su:
Koritenje i stvaranje energije (energija hrane ATP) Sinteza biomolekula neophodnih za strukturu i funkcioniranje stanica (proteini, ugljikohidrati, lipidi, nukleinske kiseline) Rast i razvoj Uklanjanje otpadnih produkata (NH3, CO2, H2O)Uvod u biokemiju 29
Kljune reakcije u biolokim sustavima
U organizmu se odvijaju tisue razliitih biokemijskih reakcija koje su katalizirane djelovanjem specifinih molekula - biokatalizatora (enzima)! Sve te biokemijske reakcije moemo ugrubo svrstati u 5 osnovnih tipova kemijskih reakcija:
Reakcije nukleofilne supstitucije Reakcije eliminacije Reakcije adicije Reakcije izomerizacije Reakcije oksido-redukcije (redoks reakcije)Uvod u biokemiju 30
Kljune reakcije u biolokim sustavimaReakcije nukleofilne supstitucije
U reakcijama nukleofilne supstitucije (supstitucija = zamjena) jedan se atom ili grupa zamjenjuje drugim.
Nukleofil(voli jezgru)
Elektrofil(voli elektrone)
Nukleofili su anioni ili grupe koje sadre slobodan elektronski par. Elektrofili su atomi ili grupe koje su siromane u elektronskoj gustoi (nose parcijalno pozitivan naboj).Uvod u biokemiju 31
Kljune reakcije u biolokim sustavimaReakcije nukleofilne supstitucijeNukleofil(voli jezgru)
Elektrofil(voli elektrone)
Glukoza
Adenozin-trifosfat
Glukoza-6-fosfat
Adenozin-difosfat
Uvod u biokemiju
32
Kljune reakcije u biolokim sustavimaReakcije nukleofilne supstitucije
Reakcije hidrolize su oblik nukleofilne supstitucije.
Nukleofil(voli jezgru)
Elektrofil(voli elektrone)
Uvod u biokemiju
33
Kljune reakcije u biolokim sustavimaReakcije nukleofilne supstitucijeNukleofil(voli jezgru)
Elektrofil(voli elektrone)Adenozin-trifosfat
Hidroliza ATP
Energija
Adenozin-difosfat
Anorganski fosfatUvod u biokemiju 34
Kljune reakcije u biolokim sustavimaReakcije eliminacije
U reakcijama eliminacije (eliminacija = uklanjanje) uklanjaju se atomi iz molekule i nastaje dvostruka veza.
dehidracija
2-fosfogliceratUvod u biokemiju
Fosfoenolpiruvat35
Kljune reakcije u biolokim sustavimaReakcije adicije
U reakcijama adicije (adicija = dodavanje) dvije se molekule kombiniraju te nastaje nova molekula.
Hidracija
Dehidracija (eliminacija)
Uvod u biokemiju
36
Fumarat
Malat
Kljune reakcije u biolokim sustavimaReakcije izomerizacije
Izomerizacija je reakcija unutarmolekularne preraspodjele atoma ili grupa.
Izomeri su spojevi iste kemijske formule i iste molekularne mase koji se meusobno razlikuju u rasporedu atoma unutar molekule.
AldozaUvod u biokemiju
Ketoza37
Kljune reakcije u biolokim sustavimaReakcije oksido-redukcije
Oksidacija = otputanje elektrona Redukcija = primanje elektrona U reakcijama oksido-redukcije dolazi do prijenosa elektrona sa elektron-donora (reducensa) na elektronakceptor (oksidans).
Kada elektron donor (reducens) preda svoje elektrone on postaje oksidiran Kada elektron akceptor (oksidans) primi elektrone on postaje reduciran.
Uvod u biokemiju
38
Kljune reakcije u biolokim sustavimaReakcije oksido-redukcije
Postoje 2 jednostavna pravila koja moemo uporabiti za redoks reakcije u biokemijskim reakcijama kako bismo shvatili da li je dolo do oksidacije ili redukcije molekule:
Molekula je oksidirana ukoliko je primila kisik ili izgubila vodik
Molekula je reducirana ukoliko je izgubila kisik ili dobila vodik
Uvod u biokemiju
39
Kljune reakcije u biolokim sustavimaReakcije oksido-redukcije
Molekula je oksidirana - primila kisik ili izgubila vodik Molekula je reducirana - izgubila kisik ili primila vodik Koja je molekula reducirana, a koja oksidirana na prikazanoj reverzibilnoj enzimskoj reakciji pretvorbe piruvata u laktat?
Laktat dehidrogenaza
Piruvat
Laktat
Uvod u biokemiju
40
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj sredini
Jedan od najvanijih imbenika evolucije ivota na zemlji je izobilje tekue vode koja postoji na povrini planeta ZemljeTrudy McKee, James R. McKee: Biochemistry, The McGraw-Hill Companies Inc., USA, 1996
Uvod u biokemiju
41
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniKada se pojavila tekua voda na Zemlji?
Prije 13,7 milijardi godina Nastanak svemira Veliki prasak
Prije 4,6 milijardi godina Kontrakcija solarne nebule Formiranje naeg sunevog sustava - sunca i planetaUvod u biokemiju 42
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniKada je nastala voda?
Prije 4,54 milijardi godina Formiranje planeta zemlje Protoplanet Hadsko doba Prije 4, 53 milijardi godina Veliko bombardiranje meteoritima Sudar s Theia-om Nastanak mjesecaUvod u biokemiju 43
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniKada je nastala voda?
Prije 4,5 4,2 milijardi godina Formiranje atmosfere Pojava vodene pare Hlaenje zemlje
Prije 4, 2 milijardi godina Prve kie trajale 60 000 godina Nastanak oceanaUvod u biokemiju 44
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniStruktura molekule vode
Molekula vode je sastavljena od jednog atoma kisika i dva atoma vodika. Tetraedarske je strukture zbog sp3 hibridizacije kisikova atoma.
Uvod u biokemiju
45
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniSvojstva molekule vode
Kisik je elektronegativniji od vodika (vie privlai elektrone iz kovalentne veze sa vodikom)
Elektroni iz kovalentnih veza sa vodikom su vie pomaknuti ka kisiku (distribucija elektronskog oblaka je vie pomaknuta ka kisiku) Kisik nosi parcijalno negativan naboj Vodik nosi parcijalno pozitivan naboj +
Molekula vode je polarna! Molekula vode je dipol!Uvod u biokemiju 46
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniSvojstva molekule vode
Voda stvara vodikove veze!
Parcijalno negativno nabijen kisik (-) jedne molekule vode privlai parcijalno pozitivno nabijen (+) vodikov atom druge molekule vode. Vodikova veza nije kovalentna veza nego je nekovalentna molekulska interakcija! Zbog sposobnosti stvaranja vodikovih veza izmeu svojih molekula, voda ima visoku temperaturu ledita i visoku temperaturu vrelita.Uvod u biokemiju 47
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniSvojstva molekule vode
Zbog sposobnosti stvaranja vodikovih veza izmeu molekula vode, voda ima visoku temperaturu ledita i visoku temperaturu vrelita.Spoj CH4 NH3 H2O H2S Mm 16,04 17,03 18,02 34,08 Temperatura ledita (C) -182 -78 0 -86 Temperatura vrelita (C) -164 -33 +100 -61
Uvod u biokemiju
48
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniSvojstva molekule vode
Voda je polarno otapalo!
Otapa soli stvarajui hidratacijski ovoj oko iona soli (vodikova veza)! U vodi se otapaju sve tvari koje s vodom mogu stvoriti vodikovu vezu!
Uvod u biokemiju
49
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniTipovi nekovalentnih molekulskih interakcija
Jakosti veza koje moemo pronai u ivim organizmimaVrsta veze Kovalentna Nekovalentna Elektrostatska interakcija Vodikova veza van der Wallsove sile Hidrofobna interakcija 4-80 12-30 0,3-9 3-12 Jakost veze (kJ/mol) 150-950
Uvod u biokemiju
50
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniElektrostatska interakcija (ionska interakcija)
Ionska (elektrostatska) interakcija nastaje izmeu suprotno nabijenih atoma (Na+, Cl-) ili grupa (NH3+, COO-). Jakost ionske interakcije (Q) definirana je Coulombovim zakonom
q1 q 2 Q Dr2
q1 i q2 naboji grupa r udaljenost izmeu grupa D dielektrina konstanta medijaUvod u biokemiju 51
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniElektrostatska interakcija (ionska interakcija)
Dielektrina konstanta (D) medija (otapala) je mjera kapaciteta medija (otapala) da smanji privlane sile meu ionima. Voda ima vrlo visoku dielektrinu kostantu (D)!
Otapalo Voda Metanol Etanol Aceton Octena kiselina Benezen
Dielektrina konstanta (D) 78,5 32,6 24,3 20,7 6,2 2,3
to to znai? Kako voda djeluje na jakost ionske interakcije? Kako organska otapala djeluju na jakost ionske interakcije?
q1 q 2 Q Dr2Uvod u biokemiju 52
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniVodikova veza
Kovalentna veza vodika sa kisikom, duikom ili sumporom u veini biomolekula je dovoljno polarna da bi vodik poprimio parcijalno pozitivan naboj (+) i bio privuen parcijalno negativnom naboju (-) na drugoj molekuli nastaje vodikova veza.
Vodikova veza izmeu hidroksilne skupine alkohola i vode
Vodikova veza izmeu karbonilne grupe ketona i vode
Vodikova veza izmeu karbonilne i amino skupine u peptidu
Vodikova veza izmeu nukleotida u molekuli DNAUvod u biokemiju 53
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniVan der Wallsove sile
Van der Wallsove sile su relativno slabe kratkotrajne elektrostatske interakcije. Mogu biti privlane ili odbojne to ovisi o udaljenosti atoma ili grupa ukljuenih u interakciju. Najjae privlane sile izmeu molekula su pri van der Wallsovom radijusu. van der Wallsov radijus je najmanja dozvoljena udaljenost izmeu dviju molekula
Uvod u biokemiju
54
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniVan der Wallsove sile
Tri su osnovna tipa van der Wallsovih interakcija:Dipol-dipol interakcije se pojavljuju izmeu molekula koje sadre elektronegativni atom. Molekule se okreu jedna prema drugoj tako da pozitivan kraj jedne molekule stupa u interakciju sa negativnim krajem druge molekule. Dipol-inducirani dipol interakcije. Molekula dipol svojim nabojem utjee na drugu molekulu i uzrokuje promjenu u razdiobi elektronskog oblaka (inducira parcijalne naboje na drugoj molekuli) i dolazi do interakcije. Inducirani dipol inducirani dipol interakcija. Kretanje naboja u blizini nepolarne molekule moe uzrokovati blagu promjenu u razdiobi elektronskog oblaka te nastajanje kratkotrajnog dipola. Kratkotrajni dipol polarizira susjedne nepolarne molekule (nastaje jo jedan inducirani dipol) i dolazi do interakcije.Uvod u biokemiju
(a) Dipol dipol interakcije
(b) Dipol inducirani dipol interakcije
(c) Inducirani dipol inducirani dipol interakcije
55
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniVan der Wallsove sileVan der Wallsove interakcije inducirani dipol - inducirani dipol nazivaju se jo i Londonovim silama!
Pozitivno nabijeni ion u blizini molekule benzena utjee na promjenu razdiobe naboja nastaje dipol
Primjer van der Wallsove interakcijeinducirani dipol-inducirani dipol
Inducirani dipol benzena utjee na promjenu razdiobe naboja u drugoj molekuli bezena56
Uvod u biokemiju
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniHidrofobne interakcije
Hidrofobne interakcije nisu u pravom smislu interakcije budui ne nastaju zbog privlanih sila izmeu hidrofobnih molekula. Hidrofobne interakcije nastaju zato to okolne molekule vode guraju hidrofobne molekule zajedno. Kad se hidrofobne molekule nau zgurane jedna uz drugu, tada izmeu njih mogu nastati slabe van der Wallsove interakcije tipa inducirani dipol inducirani dipol.Uvod u biokemiju 57
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniHidrofobne interakcijeto se zapravo dogaa?
Kada se nepolarna (hidrofobna) molekula doda u vodenu sredinu molekule vode oko nje stvaraju klatrinsku (kavezastu) strukturu Ukoliko je vie nepolarnih molekula prisutno u vodenoj sredini, tada ih molekule vode guraju zajedno u jednu veu kavezastu strukturu. Zato? Zato to je to energetski povoljnije. Za jednu veu kavezastu strukturu potrebno je manje molekula vode nego za svaku pojedinanu kavezastu strukturu! to je vie molekula vode slobodno vea je entropija sustava!Uvod u biokemiju 58
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniHidrofobne interakcijeShematski prikaz hidrofobne interakcije
1 4 5 3 11 3 8 7 9 2 2
1
6
5
6
10
4
Uvod u biokemiju
59
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniZADATAK
Na prikazanim strukturama biomolekula oznaite parcijalne naboje na atomima koji sudjeluju u stvaranju vodikove veze.
Uvod u biokemiju
60
Nekovalentne molekulske interakcije u vodenoj srediniZADATAK
Koje od prikazanih molekula mogu stvarati vodikove veze sa molekulom poput vode?
Uvod u biokemiju
61
Struktura i graa stanica
Sve ive stanice se mogu ugrubo svrstati u dvije kategorije: prokariotske i eukariotske. Glavna razlika izmeu prokariotskih i eukariotskih stanica je u tome to prokariotske stanice ne sadre jezgru.
Svojstvo Veliina
Prokariotske stanice d = 0,2 5 m
Eukariotske stanice d = 10-50 m (veina)
OrganeleLokalizacija DNA
NemaSlobodna u citoplazmi kao nukleoid
ImaSmjetena u jezgri, kondenzirana s proteinima u kromosome
Detaljnije o strukturi i grai stanica moete pronai u popratnim materijalima!Uvod u biokemiju 62
Struktura i graa stanicaProkariotske stanice
Uvod u biokemiju
63
Struktura i graa stanicaEukariotske animalne stanice
Uvod u biokemiju
64
Struktura i graa stanicaEukariotske biljne stanice
Uvod u biokemiju
65
Struktura i graa stanicaStanina membrana
Stanina membrana je fosfolipidni dvosloj koji titi unutranjost stanice od okoline. Uvod u biokemiju
66
Struktura i graa stanicaStanina membrana
Stanina membrana je visoko selektivna polupropusna barijera koja kontrolira ulazak i izlazak molekula u stanicu ili izvan stanice.Uvod u biokemiju 67
Struktura i graa stanicaJezgra i jezgrica
Jezgra je organela. U jezgri je sadrana nasljedna informacija stanice, DNA, odvojena od ostatka stanice jezgrinom membranom!
Jezgrica je gusta nakupina rRNA i proteina za sintezu rRNA.Uvod u biokemiju 68
Struktura i graa stanicaEndoplazmatski retikulum
Endoplazmatski retikulum (ER) je opsean sustav meusobno povezanih membranskih kanala, mjeinica i velikih spljotenih vreica nastao viestrukim uvijanjem membrane.
Uvod u biokemiju
69
Struktura i graa stanicaEndoplazmatski retikulum
Postoje 2 osnovna tipa ER-a:Hrapavi ER (RER) vezani ribosomi biosinteza proteina procesiranje (obrada) u ER umatanje, modifikacije proteina Glatki ER (SER) biosinteza lipida
Uvod u biokemiju
70
Struktura i graa stanicaGolgijev aparat, vezikule Golgijev
aparat je nakupina relativno velikih, spoljtenih, vreastih mjeinica. Svaka je od tih spljotenih mjeinica (cisterni) odvojena membranom od druge spljotene mjeinice .
Primarna uloga daljnja modifikacija i sortiranje proteina i lipida iz ER-a, te odailjanje u druge organele ili izvan stanice. Proteini i lipidi iz ER-a dolaze vezikularnim transportom.Uvod u biokemiju 71
Struktura i graa stanica EgzocitozaEgzocitoza je proces izvanstaninog izluivanja (sekrecije) molekula!Uvod u biokemiju 72
Struktura i graa stanica Lizosomi i endocitozaEndocitoza je proces staninog gutanja molekula!Uvod u biokemiju 73
Struktura i graa stanicaMitohondriji
Mitohondriji su organele. To su stanine elektrane koje oksidiraju ugljikohidrate, lipide i aminokiseline. Energija osloboena oksidacijom molekula pohranjuje se u obliku energetske valute stanice ATP-a.
Uvod u biokemiju
74
Struktura i graa stanicaKloroplasti
Kloroplasti su organele u kojima se provodi pretvorba svjetlosne u kemijsku energiju procesom fotosinteze.
Uvod u biokemiju
75
Struktura i graa stanicaCitoskelet
Stanini citoskelet je trodimenzionalna mrea proteinskih vlakana koja stanici daje mehaniku vrstou!Filmi put kroz stanicuUvod u biokemiju 76
Struktura i graa stanicaIzvanstanini matriks
Izvanstanini matriks je ljepljiva elatinozna masa sastavljena od proteina i ugljikohidrata koja povezuje stanice u tkiva.
Uvod u biokemiju
77