• Amino Acidos: Sillares de las Proteínas

• Química Acido-Base de Amino Acidos

• Separación y Análisis de mezcla de a.a.

• Enlace peptídico

L-Amino ácido

COO-

H3N+ C H

R

CHO

HO C H

CH2OH

L-Gliceraldehído

COO-

H3N+ C H

H

L-Glicina (Gly, G)

Estructuras, valores de pKa, abreviaturas

• Aminoácidos No polares• Aminoácidos Polares, sin carga

• Aminoácidos Acídicos• Aminoácidos Básicos

Propiedades Espectroscópicas• Todos los aas absorben luz en

region I.R.• Sólo Phe, Tyr, y Trp absorben

luz UV• Absorbancia a 280 nm es buen

diagnóstico de la presencia de aminoácidos

Estereoquímica de los Aminoácidos

• Todos quirales EXCEPTO Glicina (Gly)• L-aminoácidos predominan en naturaleza• Nomenclatura D,L basada L-gliceraldehido

Propiedades de los Aminoácidos

Aminoácido Abreviatura PM % prot

Grupo R No polarGlicina Gly G 75 7.2Alanina Ala A 89 7.8Valina Val V 117 6.6 Leucina Leu L 131 9.1Isoleucina Ile I 131 5.3Metionina Met M 149 2.3R aromáticoFenilalanina Phe F 165 3.9Tirosina Tyr Y 181 3.2Triptofano Trp W 204 1.4

R polar sin cargaSerina Ser S 105 6.8Prolina Pro P 115 5.2Treonina Thr T 119 5.9Cisteina Cys C 121 1.9Asparagina Asn N 132 4.3Glutamina Gln Q 146 4.2

R carga positivaLisina Lys K 146 5.9Histidina His H 155 2.3Arginina Arg R 174 5.1

R carga negativaAspartato Asp D 133 5.3Glutamato Glu E 147 6.3

Aminoácido Abreviatura PM % prot

No en proteínas, parte del metabolismo

Qué es el Aspartame?Qué relación tiene con los aminoácidos y con la Fenilcetonuria?

COO-

H3N+ C H

R

COO-

H2N C H + H+

R

á c i d o (donador)

COO-

H3N+ C H

R H+

COOH

H3N+ C H

R

b a s e(aceptor)

Propiedades Acido-BaseAminoácidos son Acidos Polipróticos Débiles

• H2A+ + H2O HA0 + H+

• COOH-CH-R-NH3++ H2O -COO-CH-R-NH3

+ + H+

• COOH-CH-R-NH3+ = H2A+

• Ka1 = [ HA0 ] [ H+ ] [-COO-CH-R-NH3+ ] [ H+ ] __________ = ____________________

[H2A+ ] [COOH-CH-R-NH3+ ]

Propiedades Acido-BaseLa segunda disociación ( grupo amino):

• HA0 + H2O A¯ + H+

• COO--CH-R-NH3+ + H2OCOO--CH-R-NH2 + H+

• Ka2 = [ A¯ ] [ H+ ] __________ [ HA0 ]

• Ka2 = [ COO¯ ] [ H+ ] ________________ [ COO-CH-R-NH3

+ ]

Propiedades de los Aminoácidos

Aminoácido Abreviatura PM % prot pK1 pK2 pI

Grupo R No polarGlicina Gly G 75 7.2 2.34 9.60 5.97Alanina Ala A 89 7.8 2.34 9.69 6.01Valina Val V 117 6.6 2.32 9.62 5.97Leucina Leu L 131 9.1 2.36 9.60 5.98Isoleucina Ile I 131 5.3 2.36 9.68 6.02Metionina Met M 149 2.3 2.38 9.21 5.74

R aromáticoFenilalanina Phe F 165 3.9 1.83 9.13 5.48Tirosina Tyr Y 181 3.2 2.20 9.11 5.66Triptofano Trp W 204 1.4 2.38 9.39 5.89

Propiedades de los Aminoácidos

Aminoácido Abreviatura PM % prot pK1 pK2 pIR polar sin cargaSerina Ser S 105 6.8 2.21 9.15 5.68Prolina Pro P 115 5.2 1.99 10.96 6.48Treonina Thr T 119 5.9 2.11 9.62 5.87Cisteina Cys C 121 1.9 1.96 10.28 5.07Asparagina Asn N 132 4.3 2.06 8.80 5.41Glutamina Gln Q 146 4.2 2.17 9.13 5.65

R carga positivaLisina Lys K 146 5.9 2.18 8.95 10.53 9.74Histidina His H 155 2.3 1.82 9.17 6.00 7.59Arginina Arg R 174 5.1 2.17 9.04 12.48 10.76

Aminoácido Abreviatura PM % prot pK1 pK2 pKR pI

R carga negativaAspartato Asp D 133 5.3 1.88 9.60 3.65 2.77Glutamato Glu E 147 6.3 2.19 9.67 4.25 3.22

COOH

H3N+ C H CH3

COO-

H3N+ C H CH3

HH++

pK’1

COO-

H2N C H CH3

HH++

pK’2

pH

0.5 1.0 1.5 2.0

pK1’pI

pK2’

Cuál es el pK del Acido acético, de la metil amina?Es éste diferente al pK1 y pK2 de los aminoácidos?Por qué?

R1

H2N CH C OH

O

H R2

H N CH COOH+

H2O

R1

H2N CH C

O

H R2

N CH COOH

dipéptido

H3C CH3

SH3 CH

CH2OH H H H CH2 H CH3 H CH2

H3N CH C N C C N C C N C C N C COO-

O H O H O H O H

Serilglicilcisteinilalanilleucina Ser.Gly.Cys.Ala.Leu

N-termC-term

El oxígeno carbonílico (C=O) tiene una carga parcial negativa

El nitrógeno amídico (NH) tiene una carga parcial positiva→ se establece pequeño dipolo eléctrico

Enlace peptídico tiene naturaleza parcial de enlace doble, → es menos flexible que un covalente simple convencional

Todos los enlaces peptídicos en proteínas ocurren en trans