Analiza danych z technik sekwencjonowania

nowej generacji

Krzysztof Chojnowski

Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba

DNA

● Kwas deoksyrybonukleinowy

● Biopolimer złożony z nukleotydów

DNA

● Kwas deoksyrybonukleinowy

● Biopolimer złożony z nukleotydów

DNA

Chromatyna

ChIP-Seq

ChIP-Seq

● Sekwencjonowanie nowej generacji

ChIP-Seq

● Mapowanie do genomu referencyjnego

ChIP-Seq

● Mapowanie do genomu referencyjnego

ChIP-Seq

● Wykrywanie pików

WTD

Window Tag Density

MSP

Matching Strand Peaks

Mirror Tag Correlation

MTC

ChIP-Seq

● Tworzenie profilu wiązania

jChIP

jChIP

jChIP

jChIP

Dziękuję za uwagę!