Atelier bases de donnees et RefWorks - UMoncton

Bases de données et Refworks

Sylvain Fiset

Bases de données et RefWorksSylvain Fiset - Automne 2008

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Plan de l’atelier

• Démontrer l’utilisation des bases de données dans un contexte pédagogique.• Démontrer l’utilisation des bases de données et de RefWorks dans un contexte de recherche.• Initiation pratique à l’utilisation des bases de données et à RefWorks.

Objectifs spécifique de l’atelier

• Susciter un intérêt pour l’utilisation des bases de données (et de RefWorks) dans un contexte pédagogique et de recherche.

• Procurer un cadre de référence pour l’élaboration de projets pédagogiques de niveau universitaire qui nécessitent l’utilisation des bases de données.

• Développer une connaissance pratique dans l’utilisation des bases de données et de RefWorks.


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1. Contexte pédagogique

Dans quels cours mes étudiants utilisent les bases de données ?

• PSYC2100 Psychobiologie• PSYC2610 Développement de l’enfant• PSYC2050 Méthodes et statistiques en psychologie II (parfois)

• Donc, normalement, les étudiants sont en deuxième année du baccalauréat en psychologie. Par ailleurs, l’année dernière (hiver 2008), PSYC2610 fut aussi offert aux étudiants de première année en psychologie et ils ont tous très bien réussit à utiliser les bases de données.

Types de travaux

• Présentation orale (et résumé de lecture) du contenu d’un article scientifique empirique traitant de l’un des thèmes abordés dans ces cours.

Objectifs recherchés

• Obliger l’étudiante et l’étudiant à consulter les bases de données;• Initier l’étudiante et l’étudiant à une lecture scientifique;• Développer une capacité de synthèse et de vulgarisation chez l’étudiante et l’étudiant;• Développer les habiletés verbales et écrites de l’étudiante et l’étudiant.


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Exemple d’utilisation des bases de données dans le cadre du cours PSYC2100 - Psychobiologie (extrait tiré de mon plan de cours PSYC2100)

Présentation orale d'un article scientifique traitant de la psychobiologie

L'objectif de ce travail est de familiariser l'étudiant avec la lecture et la présentation du contenu d'un article scientifique empirique traitant de la psychobiologie. Vous devez présenter le contenu d'un article scientifique empirique (avec des données, des résultats et des analyses) au reste du groupe. Vous disposerez de 15 minutes (pas une seconde de plus). Une période de questions (de la part du professeur et des autres étudiants) de 5 à 10 minutes suivra votre présentation. Vous devez présenter les éléments de l'article qui permettent de comprendre le problème à l'étude et rendre le tout compréhensible. Votre présentation doit être faite à l'aide du logiciel Powerpoint et une copie papier doit être remise au professeur avant votre présentation.

Sélection de l'article

L'étudiant devra choisir un article scientifique empirique (avec une ou plusieurs expériences et des données) traitant de l'un des sujets abordés dans le volume Cerveau et comportement. L'article doit avoir été publié entre 1998 et 2008 et avoir un nombre maximum de 15 pages. Le thème choisi peut être :

• le neurone (la neurotransmission)• le développement du cerveau (neurogénèse, synaptogénèse, période critique)• sensation et perception (vision, audition, goût, toucher, douleur)• apprentissage, mémoire, langage (troubles de langage, trouble de mémoire)• émotions• le vieillissement• les hormones• les psychopathologies (hyperactivité, dépression, schizophrénie, phobies, etc..)• la psychopharmacologie (addiction, drogues, médicaments)• etc...

Pour vous aidez dans la sélection d’un thème, vous pouvez consulter le document “Brain facts” disponible sous l’onglet Contenu sur CLIC pour le cours PSYC2100. N'oubliez pas: votre sélection doit se faire en fonction de vos intérêts sinon, vous n'éprouverez aucun plaisir à faire le travail.


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Où trouver les bases de données à la bibliothèque ?

Sur le site web de l’UMCE, dans le menu Accès rapide, sélectionnez ¨bibliothèques¨. Ensuite, choisissez ¨Bibliothèque Rhéa-Larose¨ et l’onglet ¨Je cherche des...¨. Finalement, sélectionnez “Articles de périodiques (Bases de données)¨ pour accéder aux différentes banques de références de la bibliothèque de l’UMCE.

L'article doit être sélectionnés parmi les périodiques nommés ci-dessous (tous en langue anglaise), lesquels sont disponibles en format pdf sur le web de la bibliothèque de l'UMCE.

Note : Pour obtenir l’article en version pdf, il faut le faire à partir d’un ordinateur situé sur le campus de l’UMCE ou à l’aide d’une connexion hors campus en suivant les instructions accompagnant les différentes bases de données sur le site web de la bibliothèque.


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Liste des revues disponibles en psychobiologie

Liste des revues disponibles à partir de différentes bases de données disponibles à partir du site web de la bibliothèque de l’UMCE :

• Behavioural Brain Research• Biological Psychiatry• Biological Psychology• Brain and Cognition• Brain and Development• Brain and Language• Brain, Behavior and Immunity• Cognitive Brain Research• Developmental Brain Research• Electroencephalography and Clinical Neurophysiology• Electroencephalography and Clinical Neurophysiology/Electromyography and motor control• Electroencephalography and Clinical Neurophysiology/Evoked Potential Section• Evolution and Human Behavior• Hormones and Behavior• International Journal of Developmental Neurosciences• International Journal of Psychophysiology• Neuroimaging• Pharmacology Biochemistry and Behavior• Physiology and Behavior• Schizophrenia Research• Sleep Medecine• Thalamus & Related Systems


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• Behavioral Neuroscience (APA)• Journal of Psychobiology• Neuropsychology (APA)• Psychology of Addictive Behaviors (APA)

• Behavior genetics• Human evolution • Human genetics• Human physiology• Neurochemical journal• Neurochemical research• Neurogenetics• Neurological sciences• Neurophysiology• Neuroscience and behavioral physiology• Psychopharmacology

Description des revues

Une liste de ces revues (et d’autres reliées à la psychobiologie) et leur description est disponible au site web suivant http://www.psychology.org/links/Publications/Psychobiology/ ou en sélection le document “Publications en Psychobiologie” dans l’onglet Contenu sur CLIC du cours PSYC2100.


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http://www.psychology.org/links/Publications/Psychobiology/

http://www.psychology.org/links/Publications/Psychobiology/

Approbation de l'article sélectionné :

Chaque étudiant devra faire approuver son choix d'article par le professeur avant la date précisée dans le plan de cours. Sinon il se verra enlever 1 point sur 10. Puisque les refus sont fréquents (de la part du professeur), il est préférable de commencer immédiatement la recherche de l'article. Pour ce faire, faite parvenir une copie électronique (en format pdf) au professeur via le portait CLIC de l’université. Déposez l’article dans la boîte de dépôt sous le module Articles. Vous pouvez soumettre simultanément 5 articles à la fois si vous n’êtes pas certain de votre choix. Le professeur va récupérer les articles soumis, les évaluer et contacter l’étudiant par courriel pour lui indiquer s’il approuve ou non l’article soumis. Lorsque l'article sera accepté et que vous l'aurez entre les mains, il faudra en remettre une copie papier au professeur. ATTENTION, un même article ne peut pas être utilisé par deux équipes.

Modalités

Cette présentation se fait seule ou en équipe de 2. Les deux membres de l'équipe doivent participer à part égale et cela doit être attesté par une feuille signée par les deux membres de l'équipe remise à la fin de la présentation. Sans cette feuille, la note 0 sera attribué. La présentation compte pour 10% de la note finale. Voir le programme de cours pour connaître les dates de présentation. Le professeur établira une liste de présentation de façon aléatoire en fonction du nombre de présentations.


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Éléments à présenter dans votre présentation orale.

1- Résumer le contexte théorique de l'article (importance du problème, les connaissances à ce jour sur ce problème, les travaux antérieures, etc.).

2- Identifier clairement l'objectif de l'article.3- Décrire de façon détaillée la méthode utilisée dans chacune des expériences (s’il y en a plus qu’une) :

a) Les sujetsb) Le matérielc) La procédured) Les résultatse) La discussion des résultats de l'expérience.

4- Analyser la discussion générale de l'article en faisant ressortir les éléments suivants:a) Les conclusions majeures des diverses expériences décrites par l'auteur dans la discussion.b) La concordance ou la discordance de ces résultats avec les résultats de d'autres recherches citées

dans la discussion et dans l'introduction.c) Les faiblesses de l'expérience (présentées ou non par le ou les auteurs).

5- Apporter une ou plusieurs critiques personnelles d'ordre méthodologique ou théorique sur le contenu de l'article analysé (et non sur votre difficulté à lire le texte et à le comprendre !).

*** Il est important de comprendre que ce travail est un exercice de compréhension et de communication. Les étudiants doivent très bien comprendre leur texte avant d’en faire la présentation. Puisque les articles sont de nature très technique, ce travail doit débuter plusieurs semaines avant la date de présentation. Aussi, dans la présentation, il faut s’assurer que les autres étudiants de la classe, qui n’ont pas lu l’article, soient en mesure de comprendre le contenu présenté par l’étudiant ou l’équipe.

Critères de d'évaluation

Points Contenu

/6,5 Présentation adéquate et précise des éléments présentés ci-dessus pour bien comprendre le contenu de l’article.

/1,0 Vulgarisation et capacité à capter l’intérêt de l’audience (les autres étudiants et le professeur)./0,5 Utilisation d'un support visuel (acétate électronique)./1,0 Expression verbale./1,0 Réponse aux questions.

(/-10) Le jour de votre présentation, vous devez obligatoirement remettre une copie papier de votre présentation Powerpoint au professeur. Sinon, la note 0 sera attribuée pour la présentation.

(/-10) Le jour de votre présentation, si vous avez travaillé en équipe de deux, vous devez obligatoirement remettre une feuille signée par les deux membres de l'équipe attestant que chaque membre a travaillé à part égale. En l'absence de cette feuille, la note 0 sera attribuée pour la présentation.

(/-10) Le jour de votre présentation, si vous êtes absents, vous obtiendrez la note 0 pour l’ensemble du travail. Il sera impossible de présenter votre travail à une date ultérieur.


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2.Contexte de recherche

Utilisation des bases de données et de RefWorks dans le cadre de mes travaux de recherche.

Objectifs de RefWorks

• Gérer une ou plusieurs bases de données personnalisées (i.e. selon différents dossiers).• Créer une bibliographie (liste de références) rapidement, selon différents formats de présentation

(ex: APA, Chicago, etc.).• Insertion de références dans le corps du texte (formater automatiquement articles et références).

Différences et similitudes avec Endnote

• Les bibliographies personnalisées créées avec RefWorks sont disponibles à partir de n’importe quel ordinateur connecté à internet (ex: laboratoire, bureau, maison, à l’étranger).

• Tout comme Endnotes, RefWorks peut aussi être utilisé même lorsque vous n’êtes pas connecté à internet.


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Objectifs de la présentation

Notions de base

• Créer un compte individuel RefWorks.• Créer un dossier de références.• Importer des références dans RefWorks à partir de différentes banques de références (Science

Direct, Web of Science [ISI web of knowledge], EbscoHost, ProQuest).• Doublons (références en double, en triple, etc..).• Sélectionner (ou vérifier) un style de présentation.• Formater une bibliographie selon un style de présentation (ex: APA, Chicago).• Récupérer une bibliographie dans un logiciel de traitement de texte (ex: Word).• Insérer des références dans le corps d’un texte.• Aide (didacticiels).

Notions avancées

• Insérer des références dans le corps d’un texte sans connexion internet.• Créer son propre style de présentation.


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Créer un compte individuel RefWorks

Étape supplémentaire ...


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Créer un nouveau dossier dans RefWorks

L’étape la plus importante dans RefWorks consiste à créer des dossiers afin d’organiser vos références selon différents dossiers. Par exemple, si vous travailler sur 2 articles simultanément, chaque article possède ses propres références. Il est donc possible de créer 2 dossiers différents en fonction de chacun des 2 articles. Dans mon cas, je nomme les dossiers en fonction des articles sur lesquels je travaille.

Il est aussi possible de nommer les dossiers en fonction des subventions, ou des domaines de recherche, etc.

Pour créer un dossier, il suffit de sélectionner le menu “Dossiers” et l’option “créer”. Par la suite, vous pourrez facilement déplacer vos références dans leurs dossiers respectifs.


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Importer des références dans RefWorks à partir de différentes banques de données

Effectuer la recherche de références à l’aide de la banque de données ScienceDirect.Sélectionner les références désirées (crochet dans la petite case située à la gauche du titre de la référence).Sélectionner “Export Citations” au haut de la page

Dans la page d’exportation de citations, sélectionnez “RefWorks Direct Export” comme format d’exportation. Par magie, les références se trouvent maintenant dans votre compte Refworks et il ne vous reste qu’à déplacer ces nouvelles références dans le dossier de votre choix.


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Effectuer la recherche de références dans la banque de données Web of Science.Sélectionner les références désirées (crochet dans la petite case située à la gauche du titre de la référence).

Choisir, au bas de la page, l’option “Save to other Reference Software” afin de créer un document .txt (savedrecs.txt).


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Ensuite, ouvrir Refworks et sélectionner Importer dans le menu Références. Sauvegarder les références dans le dossier qui vous intéresse en sélectionnant “Choisir le fichier” et ensuite “Importer”.


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Effectuer la recherche de référencesSélectionner les références désirées en sélectionnant “Ajouter au dossier”.

Ensuite, dans “Vue des dossiers”, sélectionner les références désirées et choisir l’option “Exporter”


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Dans le Gestionnaire d’exportation, sélectionnez l’option Direct Export vers RefWorks avant de sélectionner Sauvegarder.


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Effectuer la recherche de référencesSélectionner les références désirées en sélectionnant la case appropriée.Par la suite, sélectionner “Export” dans le menu


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Finalement, sélectionner l’option “Export directly to RefWorks” pour exporter les références vers RefWorks.

Il est aussi possible de sauvegarder un fichier .txt (pqdweb.txt) et de l’importer à l’aide de Refworks (comme c’est le cas pour la banque de données ISI Web of Knowledge).


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Doublons (références en double, en triple, etc..)

Lorsqu’on visite plusieurs banques de références, il nous arrive de sélectionner deux fois (ou plus) la même référence et de l’importer à plusieurs reprises dans notre compte RefWorks.

Pour remédier au problème, il suffit de sélectionner le menu “Afficher”, l’option “Doublons” et ensuite sélectionner “Analogie Exacte” (ou “similitude”).


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Sélectionner (ou vérifier) un style de présentation

Dans le menu “Bibliographie”, sélectionner le “Style de présentation” de vos références selon l’un des modèles proposés (ex: APA, Chicago, Nature, Science, PNAS, etc.).


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Utilitaire de prévisualisation des styles de présentation des références.

L’un des outils les plus intéressants de RefWorks. Vous pouvez vérifier le style de présentation des références avant de les exporter sous forme de bibliographie vers votre logiciel de traitement de texte.

Dirigez vous vers le menu “Outils” de RefWorks et sélectionnez “Utilitaire de prévisualisation des styles de présentation”.


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Formater une bibliographie selon un style de présentation (ex: APA, Chicago) et la récupérer avec un logiciel de traitement de texte (ex: Word pour Windows)

Rien de plus plaisant que de créer une bibliographie (liste de références) à partir de RefWorks. Sélectionner le style de présentation (APA, Chicago, etc.).

Si vous désirez créer une simple bibliographie (liste de références), sélectionnez l’option “Formater une bibliographie à l’aide d’une liste de références”.

Ensuite, précisez le “Types de fichier à créer” (ex: Word pour Windows) et à partir de quel dossier.

Il ne reste qu’à sélectionner “Créer une bibliographie”.


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Télécharger le fichier (votre nom -Reflist.doc) dans un répertoire sur votre ordinateur et récupérez le avec votre logiciel de traitement de texte. Voici un exemple du résultat avec le style APA :


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Insérer des références dans le corps d’un texte (formater automatiquement article et références)

Communément appelé Write-N-Cite, cette option permet de formater un document texte en y incluant directement les références.

Notez qu’il existe quelques procédures différentes et je vous encourage fortement à consulter la documentation de Refworks (qui est très bien faite, mais en langue anglaise). Pour ce faire, sélectionner l’option “Procédure de saisie des citations dans vos documents” à partir du menu “Bibliographie”.


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Pour les curieux, sachez qu’il faut se diriger dans le dossier qui contient les références qui seront utilisées dans votre texte. Par la suite, passez à une vue par ligne (voir à la droite du nom du dossier), sélectionnez Cite à la gauche de la référence que vous désirez insérer.

Une petite boîte s’ouvre avec votre référence et il suffit de la sélectionner (“sélectionner une référence”) pour ensuite copier coller celle-ci dans votre texte (déjà ouvert dans votre traitement de texte). Ensuite, dans le menu Bibliographie, sélectionnez “Formater l’article et la bibliographie”,


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Aide (didacticiel) pour RefWorks

N’hésitez pas à consulter la section Aide de RefWorks pour tout apprendre sur RefWorks. Il y a une multitudes de documents écrits et audio (en langue anglaise) pour vous aider à comprendre rapidement le fonctionnement de RefWorks.

Sélectionnez le menu “Aide”.

Formation avancée avec RefWorks

Lorsque vous serez à l’aise avec RefWorks, je vous invite à consulter les différents didacticiels pour les options suivantes :

• Insérer des références dans le corps d’un texte sans connexion internet• Créer son propre style de présentation


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Documents

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