Upload
tranhanh
View
216
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
18 oct. 2017Institut Curie – Biobanking dynamique en oncologie – Julien Guérin / Thomas Balezeau
Partage de données cliniques
pour la recherche sur le cancer
Biobanking dynamique
en oncologie
ATGCACGACAGU UGCTTGUGCATCGAUTGCA
TUCGAUCGATCACGACGATCGATCGACAGCATGCATCGAGTCGATGCACGA
GTCGATCAGCATCGTGGTCTCTGACTAGTCTATCATGCATCGACTAGCTACGATCGACTAGCTA
GCTACGATCGATCGATCGCTATCGACAGCGACGGFCGTACGCTACGATCGACTAGCATGCTGACTAGCTACGATCGATCAGCTATCGGTACAGCGGA
AGTCCGCGCGCGCGTAACAGTCAGCTAACTGCATCATATCAGCATAGCATCATCC
TCAGCATCAGCATCAGTAGCTCTAGCATCAGCAG
Clinique et recherche : rassembler 2 mondes
Hôpital Centre de Recherche
Institut Curie
Cancer du sein carcinocanalaire inf. RO+ RP- HER2
trastuzumab bevacizumab nivADN ARN 4 tubes de tissus tumpatiente ayant une sœur atteintsans récidive à 5 ans pneumop
mastectomie totale le 18/10patiente incluse dans l’
essai SHIVA
18 oct. 2017Institut Curie – Biobanking dynamique en oncologie – Julien Guérin / Thomas Balezeau
Tube de tissu
Tumoral(Prélevé le 10/10/2013, 2mg)
Patient(e)
53 ans
67 kgs / 1,65m
Vivante
Diabétique
Caractéristiques tumorales
Cancer du sein
Carcinome canalaire infiltrant
Taille : 4 cm
75% de cellules tumorales
Analyses
RO-
RP-
HER2-
Ki67 (%)
Mutation exon 12
Chirurgie
Tumorectomie + CA
Chimiothérapie adjuv.
TAXOTERE /
HERCEPTIN
Radiothérapie
Oui
L’échantillon : lien entre clinique et recherche
Evénements pathologiques
Tumeur primitive en 2013
Récidive en 2015
Métastases hépatiques en 2016
Un échantillon biologique
18 oct. 2017Institut Curie – Biobanking dynamique en oncologie – Julien Guérin / Thomas Balezeau
Biobanque virtuelle(MBioLIMS® / Modul-Bio)
CRB
> Tumorothèque Paris
55.000 prélèvements
soit 180.000 échantillons
> Sérothèque Paris
160.000 échantillons
Génétique somatique
et constitutionnelle
67.000 prélèvements
soit 230.000 échantillons
Pharmaco
Génomique
15.000 prélèvements
soit 25.000 échantillons
Tumorothèque
St-Cloud
25.000 prélèvements
Sérothèque
St-Cloud
160.000 prélèvements
soit 320.000 échantillons
Rassembler le patrimoine virtuellement
18 oct. 2017Institut Curie – Biobanking dynamique en oncologie – Julien Guérin / Thomas Balezeau
Annoter cliniquement les échantillons
Patient
Traitements
Echantillonbiologique
AltérationsgénomiquesPMSI
Résultatsexamenscliniques
Orbis PMSI
Elios NGFilemaker Pro
Chimio
Biothèque
ARIANE
18 oct. 2017Institut Curie – Biobanking dynamique en oncologie – Julien Guérin / Thomas Balezeau
Images
ConSoRe
Le dossier médical : pivot de l’annotation
18 oct. 2017Institut Curie – Biobanking dynamique en oncologie – Julien Guérin / Thomas Balezeau
Aujourd’hui
Méta.
2013
Diagnostic
Première
consultation
Traitement
MAJ
annotations
2015
Rechute
MAJ
annotations
Dossier médical
BioMEDICS
Osiris: Un modèle commun
• Proposition de 2 modèles : un clinique et un « omique »• Présentés par l’équipe du SIRIC Curie et validés par le groupe OSIRIS en 2014• Promouvoir le partage de données en cancérologie• Financement d’une preuve de concept en cours par l’INCa
Neoplasm
PrimaryNeoplasm
Relapse Metastaticrelapse
Co-morbidity and Adverse Events
Related diseases
Antecedents and Risk Factors
T0
Patient history
18 oct. 2017Institut Curie – Biobanking dynamique en oncologie – Julien Guérin / Thomas Balezeau
BIOMEDICS : visualisation des données
18 oct. 2017Institut Curie – Biobanking dynamique en oncologie – Julien Guérin / Thomas Balezeau
BIOMEDICS : visualisation des données
18 oct. 2017Institut Curie – Biobanking dynamique en oncologie – Julien Guérin / Thomas Balezeau
Anonymisation
Question scientifique ?
BIOMEDICS : APIs vers les équipes de recherche
Données cliniques
Résultats d’analyses :(genomique, immunologie, micro environnement tumoral)
18 oct. 2017Institut Curie – Biobanking dynamique en oncologie – Julien Guérin / Thomas Balezeau
Hôpital
Centre de
Recherche
BIOMEDICS : APIs pour les collaborations externes
Dénombrements
18 oct. 2017Institut Curie – Biobanking dynamique en oncologie – Julien Guérin / Thomas Balezeau
CLCCConSoRe
Direction des Données – Institut Curie
CDO
Xosé Fernandez
Adjoints
Alain Livartowski
Emmanuel Barillot
Team « Intégration »
Julien Guérin
Thomas Balezeau
Team « Bases de données »
Marie-Christine Falcou
Mari-George Christophe
PMSI
Julie Perlbarg-Samson
Florence Bachelot
CRB
Odette Mariani
U900
Laetitia Chanas
Julien Roméjon
Philippe Hupé
Sponsors
DSI
Philippe Rizand
Christophe Mattler
Maël Priour
18 oct. 2017Institut Curie – Biobanking dynamique en oncologie – Julien Guérin / Thomas Balezeau