Upload
sahkyo
View
133
Download
0
Embed Size (px)
DESCRIPTION
Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund. Proteiner. Aminosyror. Enklaste. Aminogrupp -NH 3 + Karboxylsyragrupp -COO - Väte Variabel sidogrupp 20 olika. Primärstruktur Vilka aminosyror och vilken ordning. Peptidbindning. Dipeptid. Aminosyror. Kovalent bindning - PowerPoint PPT Presentation
Citation preview
Biokemi MNXA10/12Hans-Erik Åkerlund
Proteiner
Aminosyror
Aminogrupp -NH3+
Karboxylsyragrupp -COO-
VäteVariabel sidogrupp 20 olika
Enklaste
PeptidbindningDipeptid
Kovalent bindningSpecialfall av Amidbindning
PrimärstrukturVilka aminosyror och vilken ordning
N - C - C
Riktning Amminoterminal / N-terminalKarboxyterminal / C-terminal
Stommen
Aminosyror
a-helix (Sekundärstruktur)erVätebindningar
Vätebindning
Vätebindning
b-veckstruktur (Sekundärstruktur)
Utsträckt strukturVätebindnigar mellan kedjorAntiparalella eller paralellaR-grupper upp och ner
TertiärstrukturTrediminsionell veckning
Ferritin
FA binding protein Lysozym
Opolära grupper innePolära grupper på ytan
Den hydrofoba effekten
Vattenstruktur
Störande molekyleropolära
Cysteinbryggor = SS Bryggor = DisulfidbryggorStabiliserar tertiärstrukturen
KvartärstrukturAntal och arrangeman av subenheter
Ex. Hemoglobin från människafyra subenheter
HastighetPåskyndar reaktioner utan att själv förbrukas. Kan ingå i delreaktioner men återbildas alltidPåverkar inte jämvikten, K lika som utan enzym.Påskyndar att jämvikten ställer in sig
SpecificitetReglerbarhet
Enzymer, Katalys och Kinetik
Varför påskyndas reaktioner?Aktiveringsenergi
Enzymer
-gör att det krävs mindre aktiveringsenergi.
-påverkar inte energiskillnadenmellan substrat och produkt
Enzymkatalyserad reaktionUpvisar mättnad Karaktäristiskt för enzymkatalyserad reaktion.
Avsätt v0 som funktion av [S]
Michaelis-Menten
v = Vmax*[S]/(KM+[S])
Ex. KarboanhydrasZn2+ prostetisk gruppMetalljonkatalysAktivering av vatten
pKa=7 (jfrt med 15.7 för fritt vatten)
ca 7 miljoner ggr snabbare än utan katalys
Nukleinsyror: DNA och RNA
Nukleotider som byggstenar
Fosfat – Socker -Kvävebas
Sockret
R i RNA D i DNA
Syre saknasDeoxy
Kvävebaser:
Adenin Guanin Cytosin Uracil (i RNA)/Thymin (i DNA)
5´
5´
3´
3´
A G C T C
T C G A G
5´
3´3´5´
DNA struktur.1) polynukleotid, kvävebaser A,G,C,T2) har polaritet: 5´ o 3´ ändar3) basparning mellan två antiparella strängar4) H-bindingar, 2 st mellan A o T, 3 st mellan G o C
DNA dubbelhelix
Stor fåra (major groove)
Liten fåra (minor groove)
Mörk färg: fosfodiester o socker(huvudkedja)Ljus färg: basparade kvävebaser
10 nukleotider
eller
Baspar (bp)
5´ 3´
3´ 5´
Cellulära processer
DNA RNA PROTEIN
Replikation Transkription Translation
Process Huvudsaklig funktionell enhet/ enzymReplikation DNA polymeras. (DNA templat, mall)Transkription RNA polymeras. (DNA templat eller )Translation Ribosom, består av rRNA, protein. (mRNA templat)