http://targetmine.mizuguchilab.org/

統合データウェアハウスTargetMineの高度化とデータ解析ツール 〇陳怡安, Tripathi Lokesh P., 川島和, 水口賢司

医薬基盤・健康・栄養研究所 バイオインフォマティクスプロジェクト

私たちは国際的に広く使用されている30以上の公共のデータソースを統合し、創薬の初期研究における支援を目的とした統合データウェアハウス

TargetMine（http://targetmine.mizuguchilab.org）を開発、公開している。創薬標的の探索のために、TargetMineはデータモデルを常に改良し、新規

のデータを追加してきている。最近では、特に医薬品に関する情報に力を入れており、本発表では、薬剤の代謝酵素、別名、解剖治療化学分類

（ATC分類）、日本標準商品分類（JSC）などの情報とそれらの統合解析機能を紹介する。さらに、定型的な解析だけでなく、多面的な意思決定を対話

的に支援する補助解析ツール（ワークフロー機能）を開発した[1,2]。これにより、創薬標的の探索のみならず、一般的な創薬支援のデータ解析プラッ

トフォームを提供可能になった。

Abstract

1. Chen YA, Tripathi LP, Mizuguchi K, An integrative data analysis platform for gene set analysis and knowledge discovery in a data warehouse framework. Database, 2016: baw009. 2. Chen YA, Tripathi LP, Mizuguchi K, TargetMine, an integrated data warehouse for candidate gene prioritisation and target discovery. PLoS ONE 6: e17844, 2011.

References

System and Applications

Licensed under a Creative Commons 表示2.1日本 license © 2016 陳 怡安 （医薬基盤・健康・栄養研究所）

国際的に広く使用されている 30 以上の公共のデータソース

興味を持つ医薬品リスト…

• 標的タンパク質に刺激する薬剤（agonist, binder, positive modulator… ）の絞り込み。

Adenosine, Allopurinol, Beraprost, Clotrimazole, Dantrolene, Dexmedetomidine, Epoprostenol, Estradiol, Fluoxetine, Glyburide, Isoflurane, Ketamine, Lamotrigine, …

• ATC / JSC による、共通な特徴を同定。

アカデミック／非アカデミックを問わず、無料で利用可能です。

パスウェイ、相互作用

ドメイン、立体構造

化合物、医薬品

遺伝子、タンパク質

miRNA

転写制御因子

…

解剖治療化学分類（ATC）

日本標準商品分類（JSC） 別名: 一般名、商品名…など

Drug Type: biotech or small molecule

Status: approved, experimental, illicit, investigational, nutraceutical, vet_approved, withdrawn 標的タンパク質

医薬品の検索と解析例

TargetMine にアップロード

エンリッチメント解析

医薬品の詳しい情報：

エンリッチメント解析

オルソログ変換

PPI タンパク質を加え

候補遺伝子リスト

補助解析ツール

医薬品例： Tacrolimus

Clustering & Heat Map

薬剤の代謝酵素

• 異なるタイプの相互作用（PPI、転写因子、化合物、miRNA）をまとめて表示。

• 1-Clickで候補遺伝子リストを変換と分析