Enterobakterie, pseudomonády, acinetobakte ři, aj.utv.lf1.cuni.cz/Data/.../2.-enterobakterie...acinetobakteri-aj..pdf · Enterobacteriaceae – Virulence Factors-Endotoxin-Pouzdro-Antigenní

Enterobakterie, pseudomonády, acinetobakteři, aj.

Jaroslav Hrabák

Ústav mikrobiologie LF UK a FN v Plzni

[email protected]

Enterobakterie – čeleď Enterobacteriaceae

- Gramnegativní, nesporulující, fakultativněanaerobní tyčky

Celosvětové rozšíření:

- Půda- Voda- Normální flóra:

- člověka- zvířat

Enterobakterie

Virulence bakteriíP

očet

pot

enci

ální

ch p

atog

enů

Úrove

ňim

unity

Fakultativní patogeny

„nepatogenní“mikrobi

Obligátnípatogeny

Enterobakterie

Klinicky nejvýznamn ější enterobakterie- Escherichia coli

- Klebsiella pneumoniae (K. oxytoca)

- Enterobacter cloacae (E. aerogenes)

- Citrobacter freundii

- Morganella morganii

- Proteus mirabilis (P. vulgaris)

- Salmonella enterica

- Shigella sonnei (S. dysenteriae, S. flexneri)

- Yersinia pestis

- Yersinia enterocolitica, (Y. pseudotuberculosis)

Enterobakterie

Enterobacteriaceae– Virulence Factors

- Endotoxin- Pouzdro- Antigenní mimikry- Imunomodulace

- Rezistence k antibiotikům- Klebsiella pneumoniae- Escherichia coli- Serratia marcescens

Enterobakterie

Enterobacteriaceae– Onemocnění

Centrální nervový systém:- E. coli (meningitidy novorozenců)

- M. morganii- Klebsiella spp.

Netypické infekce: – problém neurochirurgických oddělení– nosokomiální infekce

Enterobakterie


Dolní cesty dýchací:- Klebsiella spp.- Escherichiaspp.- Enterobacterspp.

Gastrointestinální trakt:- Salmonella enterica- Shigellaspp.- Escherichia coli- Yersinia enterocolitica- Y. pseudotuberculosis

Enterobakterie


Močové infekce:- Escherichia coli !!!- Proteusspp.- Klebsiella spp.- Morganella morganii

Infekce krevního řečiště:- Escherichia coli- Klebsiella spp.- Enterobacterspp.

Enterobakterie

Enterobacteriaceae– OnemocněníEPEC – EnteropatogenníE. coli

- novorozenecké průjmy

ETEC – EnterotoxigenníE. coli- průjmy (inkubační doba 24-48 hodin)- nausea- zvracení

- A-B toxiny (teplotně labilní i stabilní)- nutnost vysokého inokula pro infekci

- endemické v oblastech s nižšími hygienickými návyky

Enterobakterie

Enterobacteriaceae– OnemocněníEHEC – EnterohemoragickáE.coli

- hemoragické kolitidy- bolesti břicha- krvavá stolice- horečka

- hemolyticko-uremický syndrom (HUS)- renální selhání- trombocytopenie

- velmi nízká infekční dávka

- často v mase

Enterobakterie


EIEC – Enteroinvazivní E. coli- příbuzná s rodem Shigella

- vodnaté stolice- křeče, krvavá stolice- horečka

EAEC – EnteroagregativníE. coli - chronické průjmy

Enterobakterie

Salmonella enterica– Onemocnění

- Enteritida- horečka- průjem (může být i krvavý), křeče- bolesti hlavy- nausea- zvracení

- Bakteriemie

- Hnisavý zánět v kloubech

Enterobakterie

Salmonella typhi, paratyphi– Onemocnění

- Břišní tyfus (angl. typhoid fever)- Paratyfus

- bakterie rozšířeny do jater, sleziny, kostní dřeně- inkubační doba: 10-14 dní

- horečka- bolesti hlavy- myalgie- anorexie

- kolonizace žlučníku

Enterobakterie

Salmonella typhi, paratyphi– Léčba

První volba:

- fluorochinolony- ceftriaxon

Alternativa:

- chloramfenicol

Očkování

Enterobakterie

Shigellaspp. – Onemocnění

Bacilární dysenterie:

- křeče

- průjem (stolice může obsahovat krev,hnis, hlen)

- horečka

Enterobakterie

Yersinia pestis– Onemocnění

- Typická zoonóza

- Sídlištní mor- Rezervoár: krysy

- Lesní mor- Rezervoár: myši, kočky,

prasata, potkani

- Vektor: krysí blecha Xenopsylla cheopis

Enterobakterie

Yersinia pestis– Onemocnění

Bubonický mor:- po kousnutí infikovanou blechou- bolestivé „bubo“ – lymfatické uzliny- horečka- bakteriemie se 75% úmrtností

Pneumonie- vdechnutím původce- horečka, malátnost, pneumonie- vysoká mortalita - 90%

Enterobakterie

Yersinia pestis– Léčba

První volba:

- gentamicin- streptomycin

Alternativa:

- doxycycline

Enterobakterie

Enterobacteriaceae– Diagnostické metodyKultivace:

- stolice- krev- likvor- sputum- …

- použití selektivních médií

- detekce toxinů

- serotypizace (salmonely: O-antigen, H-antigen, Vi-antigen)

Serologické testy:- Widalova reakce(Salmonellaspp.)

Enterobakterie

Nefermentující gramnegativní tyčky

- Oportunní patogeny rostlin, zvířat a lidí

- Složitá taxonomie

- Pouze omezený počet klinicky významných druhů:

- Pseudomonas aeruginosa- Acinetobacter baumannii- Stenotrophomonas maltophilia- Burkholderia cepacia

Gramnegativní nefermentující tyčky


Pseudomonasspp.– taxonomie, fyziologie

- Striktn ě aerobní gramnegativní nesporulující tyčka

- Obvykle pohyblivá

- Oxidáza pozitivní (kromě P. luteola, P. oryzihabitans)

- Běžně rozšířena v prostředí (růstová teplota 4 – 36 °C)

- Např. P. putida v půdě, vodě, na květinách, …


P. aeruginosa –epidemiologické charakteristiky

- Hydrofilní povrch – afinita nap ř. k:- umyvadlům (nemocniční prostředí)- zelenině

- Může přežívat v desinfekčních prostředcích!

- Požití bakterií nevede u zdravých jedinců ke kolonizaci GIT


P. aeruginosa –epidemiologické charakteristikyKolonizace jedince

- P. aeruginosanení považována za součást normálníflóry (Pouhá kolonizace však nesmí být důvodem k eliminaci a zahájení ATB terapie!)

- Ke kolonizaci dochází tehdy, pokud je normální flóra poškozena antibiotiky (např. neutropeničtí pacienti)

- Díky alteraci epiteliálních buněk může kolonizovat:- horní cesty dýchací(u pacientů s umělou plicní ventilací)

- močové cesty


P. aeruginosa –epidemiologické charakteristikyNejvíce ohrožení jedinci

- Neutropeničtí pacienti (hematoonkologická onemocnění)

- Ventilovaní pacienti

- Pacienti s popáleninami

- Pacienti s cystickou fibrózou


P. aeruginosa –faktory patogenity

- Pouzdro -adheze, ATB rezistence, inhibice fagocytózy- Pili - adheze- Lipopolysacharid - endotoxin- Pyocyanin - imunomodulace, poškození tkání

- Exotoxin A - inhibuje syntézu proteinů (poškození tkání)- Exotoxin S - atakuje membrány eukaryotických buněk- Elastáza - destrukce tkání- Proteáza - destrukce tkání

- Antibiotická rezistence


Onemocnění způsobenáP. aeruginosa

- Pneumonie (nekróza parenchymu)

- Močové infekce (v souvislosti s katetrizací a poškozením epitelu)

- Kožní infekce (popáleniny)

- Otitidy (různý stupeň závažnosti infekce)

- Bakteriémie

- Infekce očí (poškození rohovky)


Onemocnění způsobená ostatními pseudomonádami

- P. fluorescens - izolovaná od pacientů s cystickou fibrózou, septikémie

- P. putida - nosokomiální infekce – pneumonie, bakteriémie, močové infekce, atd.

- P. veronii, P. monteilii, P. stutzeri, P. pseudoalkaligenes, P. luteola, P. oryzihabitans


Diagnostika Pseudomonasspp.

- Kultivace


Identifikace Pseudomonasspp.- Produkce pigmentů:

- pyoverdin (fluorescein)- pyocyanin- pyorubrin- pyomelanin

(v současnosti nepříliš významné)


Pseudomonas aeruginosau pacientů s CF- Adaptace kmene na chronickou kolonizaci plic

- ztráta faktor ů patogenity- rezistence k antibiotikům

Mutátory:S

chop

nost

přeži

tí

Frekvence mutací


Pseudomonasspp. - shrnutí

- Významný nemocniční patogen

- Vysoký stupeň rezistence k antibiotikům

- Infekce jím způsobené jsou velmi závažné

- Zdraví jedinci nejsou takřka vůbec ohroženi


Stenotrophomonas maltophilia

- Pro zdravého člověka nepatogenní

- Při nálezu v klinickém materiálu velmi obtížnáinterpretace klinického významu

- Kataláza pozitivní, oxidáza negativní, nepohyblivétyčky, schopné růst v širokém spektru teplot (i při 42°C)


S. maltophilia- infekce

- Infekce ran ???

- Pneumonie ???

- Bakteriemie

- Močové infekce

- Kolonizace dýchacích cest u pacientů s cystickou fibrózou.


S. maltophilia- diagnostika

- Kultivace


Burkholderia cepacia

- Dříve řazeny k rodu Pseudomonas

- Příbuzné druhy zahrnují B. mallei, B. pesudomallei, B. multivorans, …

- Aerobní, nesporulující gramnegativní tyčky


Burkholderia cepacia- epidemiologie

- Nalézány na rostlinách (cibule), ale i v půdě

- Některé kmeny mají antifungální, antiparazitární účinky

- Vysoký epidemiologický potenciál:- umyvadla- plavecké bazény- lázně- salátové bary

- nebulizéry


Burkholderia cepacia– klinické aspekty

- Bakteriemie- Močové infekce- Septické artritidy- Pneumonie

Nejvíce ohrožená skupina:

- pacienti s cystickou fibrózou- pacienti s defektem imunity


Ostatní rody příbuznéB. cepacia

- Ralstoniaspp.

- Pandoraeaspp.

- Cupriavidusspp.- Comamonasspp. - Delftia spp.- Acidovoraxspp.- Brevundimonasspp.

Velmi obtížnáidentifikace !!!


Acinetobacterspp.– taxonomie, fysiologie

- Striktn ě aerobní, oxidáza negativní, gramnegativnínepohyblivé kokobacily

- Popsáno jejich grampozitivní charakter při přímém barvení z hemokultivačních lahviček

- Některé druhy jsou obtížně kultivovatelné

- Nejčastějším izolovaným druhem je A. baumannii


Acinetobacterspp.– epidemiologie

- Běžně se vyskytuje v přírodě

- Významný nosokomiální patogen

- Druhá nejčastěji izolovaná gramnegativnínefermentující tyčka v klinickém materiálu

- Považován za nepatogenní u zdravých jedinců

Acinetobacterspp.– klinické aspekty

Nosokomiální infekce:

- infekce dýchacích cest- močové infekce

- endokarditidy- meningitidy- osteomyelitidy- artritidy


Kazuistika I.

- 25letá žena přichází na ambulanci s:- bolestí v podbřišku,- udává pálení při močení, - moč červeně zabarvena.

1. Jaké mikroorganizmy mohou připadat v úvahu?

2. Jaké mikrobiologické testy budete indikovat?

3. Budete pacientku léčit empiricky nebo čekat na výsledek mikrobiologického vyšetření?

Kazuistiky

Kazuistika I.

Escherichia coli, kvantita >106 CFU/ml

Kazuistiky

Kazuistika II.

- 45letý muž přichází ráno na ambulanci s:- průjmem,- večer požil tatarský biftek.

1. Jaké mikroorganizmy mohou připadat v úvahu?

2. Jaké mikrobiologické testy budete indikovat?

3. Bude pacient léčen antibiotiky?

Kazuistiky

Kazuistika II.

Salmonella enetericaser. enteritidis

Kazuistiky

Documents

Enterobakterie, pseudomonády, acinetobakte ři, aj.utv.lf1.cuni.cz/Data/.../2.-enterobakterie...acinetobakteri-aj..pdf · Enterobacteriaceae – Virulence Factors-Endotoxin-Pouzdro-Antigenní