Genetic and Environmental factor in Thai with familial and non-familal colorectal cancer :

A SNP-panel-based analytic cross-sectional study

1

Reseacher : น.ส.ณฐนนท บรสทธ

Advisor : ดร.ทพ. สทธ เจรญพทกษ

Co-advisor :รศ.นพ. ธนยชย สระ

นพ. จกรกฤษณ เออสนทรวฒนา

พญ. ณฐน จนาวฒน

2 Kory w.Jasperson,et al 2010

Hereditary crc 5 %

familial crc 25-30 %

sporadic crc

65-70 %

3 Kory w.Jasperson,et al 2010

Hereditary Hereditary

Familial colorectal

cancer

Non-Familial colorectal

cancer

4

Familial Colorectal cancer

Genetic -familial crc

Environment

-gender

-education

-sex

-marital status

-age at diagnosis

-BMI

-smoking

-alcohol consumption

-DM -hyperglycemia

• เปรยบเทยบอตราการพบ SNPs ใน cancer SNP panel ระหวาง กลม familial colorectal cancer กบ กลม non- familial colorectal cancer

• เปรยบเทยบอตราการพบปจจยทางดาน environment ระหวาง กลม familial colorectal cancer กบ กลม non- familial colorectal cancer

5

• รปแบบการวจย : analytic cross-sectional study • ประชากรในการศกษา : ประชากรจาก EGAT study1,2 และผปวยรพ.

รามาธบด พ.ศ. 2538-2553 ทปวยดวยโรคมะเรงล าไส • สถต : Fisher exact test, Bonferroni correction, Binary Logistic regression

6

Research Tools

• Genetic part : ขอมล SNPs information ใช BeadChip on GoldenGate technology by Illuminar Inc.

• Environment part ใช แบบสอบถามของ EGAT study ส าหรบประชากรในกลม EGAT และใชขอมลเวชระเบยนส าหรบประชากรในกลมผ ปวยโรงพยาบาลรามาธบด

7

เปนเทคโนโลยทพฒนามาจาก DNA Chip โดย polymer ทม probe ทจ าเพาะกบ SNP ทตองการทดสอบเกาะอย

8

• SNPs (GoldenGate Genotyping Assay by illumina Inc.)

9

ตารางท1 ลกษณะประชากรทวไป

10

Characteristics Familial crc Non-familial

crc P - value

Age at diagnosis

(mean, s.d.) 47.09

(15.56)

53.21

(13.17) 0.089

sex (%,n)

male

female

52.3(23)

45.5(10)

47.7(21)

54.5(12)

0.794

Marital status(%,n)

Married

Divorced

Never married

44.4(24)

50(1)

80(8)

55.6(30)

50(1)

20(2)

0.118

BMI(mean, s.d.) 22.96(4.41) 22.01(2.81) 0.306

Ex-smoker

Yes

No

58.6(17)

42.9(15)

41.4(12)

57.1(20)

0.315

Alcohol consumption

Yes

No

52.9(18)

46.7(14)

47.1(16)

53.3(16)

0.802

ตารางท2 เปรยบเทยบอตราการพบSNPs

11

SNP Gene codominant dominant recessive over-

dominant

log-

additive

rs2066853 AHR 1.24E-06 1.05E-06 0.87 5.04E-07 0.0002

rs2266690 CCNH 1.46E-05 0.0001 7.44E-05 0.04 6.39E-06

rs6948 CASP3 2.24E-07 0.24 7.00E-08 0.01 0.0009

rs9610 IL10RA 2.40E-16 7.45E-15 1.13E-09 0.04 4.27E-17

ตารางท3 เปรยบเทยบอตราการพบความเสยงในกลม familial และ non-familial crc

factor OR 95% CI

lower upper

sex 1.01 0.20 5.039

BMI < 18.5 (reference)

18.5-22.9

≥ 23

0.31

0.43

0.40

0.06

2.33

3.33

Ex-smoker 3.01 0.56 16.28

Alcohol consumption 0.84 0.16 4.34

• คนพบองคความรใหมเกยวกบปจจยทเกยวของกบโรคมะเรงล าไสใหญและทวารหนกในประเทศไทย

• พฒนาระบบคดกรองของโรคมะเรงล าไสใหญชนด familial colorectal cancer เพอปองกนการเพมขนของอตราอบตการณในประเทศไทย

12

13