Genética Microbiana

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Mecanismos moleculares empleados por los microorganismos para la transferencia de información genética. Conceptos básicos acerca de genética y los genes de importancia en la transferencia de resistencias baterianas

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  • MICROBIOLOGA GENERAL

    CARRERA DE QUMICA FARMACETICA

    Sergio Rodrigo Quisberth Barrera M.Sc.

    [email protected]

    La Paz Bolivia

    16 de marzo del 2015

  • Conjunto de reacciones o transformaciones qumicas que tienen lugar en un microorganismo para mantener su viabilidad

    Procesos o reacciones Catablicas Degradan nutrientes

    Liberan energa

    Procesos o reacciones Anablicas Tienden a unir molculas

    Reacciones de sntesis que consumen energa

    Metabolismo Microbiano

  • Excepto algunos tomos de C de los nucletidos, la asimilacin del C deriva de 8

    intermediarios: glucosa-6-P, triosa-P, 3-fosfoglicerato, fosfoenolpiruvato, piruvato,

    acetil-CoA, oxalacetato, -cetoglutarato.

    Metabolismo Microbiano

  • Aumento de nmero (no de tamao)

    Multiplicacin bacteriana: fisin simple o binaria

    Elongacin

    Auto duplicacin de ADN cromosmico

    Tabicado central

    Invaginacin membrana celular

    Sntesis de pared

    Crecimiento Bacteriano

  • Tiempo necesario para la duplicacin celular

    Distintiva de cada especie

    Puede influirse por factores estimulantes

    Varan de 20 minutos (Escherichia coli) hasta 24 horas

    Tiempo de generacin

  • Tiempo de generacin

    Bacteria Medio Tiempo de Generacin (minutos)

    Escherichia coli Glucose-salts 17

    Bacillus megaterium Sucrose-salts 25

    Streptococcus lactis Milk 26

    Streptococcus lactis Lactose broth 48

    Staphylococcus aureus Heart infusion broth 27-30

    Lactobacillus acidophilus Milk 66-87

    Rhizobium japonicum Mannitol-salts-yeast extract 344-461

    Mycobacterium tuberculosis Synthetic 792-932

    Treponema pallidum Rabbit testes 1980

  • Curva de Crecimiento Bacteriano

    Bacteria en medio adecuado

    Grfico de coordenadas: nmero de bacterias (logaritmo) versus lapso de tiempo.

    Distinta para cada bacteria

    En todas se identifican cuatro etapas:

    Fase Lag

    Fase Log

    Fase estacionaria

    Fase de muerte

  • El nmero de microorganismos no vara

    Adaptacin al medio, produccin de enzimas

    Tiempo variable: entre una hora a das.

    Tamao relativo aumentado por divisin

    Fase de Latencia

  • Relacin casi lineal entre el tiempo y el nmero de elementos.

    Actividad metablica incrementada

    Depende del tiempo de generacin de cada bacteria

    Los antimicrobianos son mas activos

    Puede haber variaciones entre el crecimiento in vitro e in vivo.

    Fase exponencial o de crecimiento logartmico

  • Fase exponencial o de crecimiento logartmico

    =

    =

    =

    Ecuacin Cintica de

    crecimiento en funcin al

    numero de generaciones

    Clculo del nmero de

    generaciones

  • Fase exponencial o de crecimiento logartmico

    =

    =

    = []

    +

    =

    Ecuacin Cintica de

    crecimiento en funcin a

    la tasa de crecimiento

    Clculo de la tasa de

    crecimiento

  • Si partimos de 104 ufc/ml en un cultivo que tiene un tiempo de generacin de 2 h, cuntas clulas tendremos al cabo de 4, 24 y 48 h de cultivo?

    Fase exponencial o de crecimiento logartmico

  • La tasa de crecimiento de un cultivo bacteriano es = 1.5 h-1. Si partimos de una poblacin inicial de 102 ufc/ml, Qu nmero de bacterias por mililitro (ufc/ml) habr despus de un cultivo de 10 h?. Cunto es el tiempo de generacin del cultivo?.

    Fase exponencial o de crecimiento logartmico

  • En determinado punto el crecimiento disminuye

    La poblacin no aumenta

    Clulas nuevas reemplazan a las clulas muertas

    Actividad metablica mas lenta

    Produccin de metabolitos secundarios

    Antibioticos

    Toxinas

    Fase de Esporogenesis para las especies productoras de esporas

    Fase Estacionaria

  • Recuento de clulas disminuye sensiblemente

    El numero de clulas muertas supera al nmero de clulas vivas

    Acumulacin de productos txicos

    Disminucin de nutrientes

    Aparicin rpida : autolimitar diseminacin infecciones

    Fase de declinacin o muerte

  • Qumicos

    Carbono

    Nitrgeno

    Oxigeno

    Azufre

    Factores de crecimiento

    Iones

    Factores relacionados al Crecimiento

    Fsicos

    Temperatura

    pH

    Actividad Agua aW Potencial redox

    Presin Osmtica

  • Todos los microorganismos tienen una temperatura ptima de crecimiento.

    Esto significa que a determinada temperatura la velocidad de duplicacin o la velocidad de crecimiento poblacional de los microorganismos es mayor.

    Efecto de la Temperatura

    Clasificacin Rango Optima

    Termfilos 25 - 80 C 50 - 60 C

    Mesfilos 10 - 45 C 20 - 40 C

    Psicrfilo -5 - 30 C 10-20 C

  • Temperatura mnima de crecimiento

    Temperatura ptima de crecimiento

    Temperatura mxima de crecimiento

    Efecto de la Temperatura

  • Efecto de la Temperatura

    Bacteria T Mnima T Optima T Mxima

    Listeria monocytogenes 1 30-37 45

    Vibrio marinus 4 15 30

    Pseudomonas maltophilia 4 35 41

    Thiobacillus novellus 5 25-30 42

    Staphylococcus aureus 10 30-37 45

    Escherichia coli 10 37 45

    Clostridium kluyveri 19 35 37

    Streptococcus pyogenes 20 37 40

    Streptococcus pneumoniae 25 37 42

    Bacillus flavothermus 30 60 72

    Thermus aquaticus 40 70-72 79

    Methanococcus jannaschii 60 85 90

    Sulfolobus acidocaldarius 70 75-85 90

    Pyrobacterium brockii 80 102-105 115

  • La mayora de los microorganismos crecen en pH cercanos a la neutralidad, entre 5 y 9, cosa que no excluye que existan microorganismos que puedan soportar pH extremos y se desarrollen.

    Condiciones de pH

    Clasificacin pH externo pH interno

    Acidfilos 1.0 - 5.0 6.5

    Neutrfilos 5.5 - 8.5 7.5

    Alcalfilos 9.0 - 10.0 9.5

  • pH < 6,5 cido

    pH > 8,5 bsico o alcalino

    pH 6,5 8,5 neutro Mas adecuado para crecimiento bacteriano

    Condiciones de pH

  • Condiciones de pH

    Organismo pH Mnimo pH Optimo pH Mximo

    Thiobacillus thiooxidans 0.5 2.0-2.8 4.0-6.0

    Sulfolobus acidocaldarius 1.0 2.0-3.0 5.0

    Bacillus acidocaldarius 2.0 4.0 6.0

    Zymomonas lindneri 3.5 5.5-6.0 7.5

    Lactobacillus acidophilus 4.0-4.6 5.8-6.6 6.8

    Staphylococcus aureus 4.2 7.0-7.5 9.3

    Escherichia coli 4.4 6.0-7.0 9.0

    Clostridium sporogenes 5.0-5.8 6.0-7.6 8.5-9.0

    Erwinia caratovora 5.6 7.1 9.3

    Pseudomonas aeruginosa 5.6 6.6-7.0 8.0

    Thiobacillus novellus 5.7 7.0 9.0

    Streptococcus pneumoniae 6.5 7.8 8.3

    Nitrobacter sp 6.6 7.6-8.6 10.0

  • Los solutos disueltos se desplazan a zonas de menor concentracin.

    El agua se desplaza a zonas de mayor concentracin de solutos

    Una presin osmtica alta causa prdida de agua y plasmlisis de la clula

    Halfilas: bacterias que toleran altas concentraciones salinas.

    Halfilas facultativas: toleran hasta un 5 % de sales.

    Presin Osmtica

  • La disponibilidad de agua se mide por un parmetro llamado actividad de agua o potencial de agua, indicativo del agua libre, y que se expresa como

    aW= PS/PW

    donde PS es la presin parcial de vapor de agua en la solucin problema y PW es la presin parcial de vapor del agua destilada.

    Actividad Agua aW

  • Actividad Agua aW

    Organismo aw mnima para crecer

    Caulobacter 1.00

    Spirillum 1.00

    Pseudomonas 0.91

    Salmonella/E. coli 0.91

    Lactobacillus 0.90

    Bacillus 0.90

    Staphylococcus 0.85

    Halococcus 0.75

  • Presin Osmtica y Actividad Agua aW

  • El Potencial de Oxido-Reduccin es una medida de la tendencia del medio a donar o recibir electrones.

    Es crtico para el crecimiento de los microorganismos generalmente asociado con la presencia de oxgeno disuelto en el medio.

    En medios con oxgeno, el potencial redox vara entre 0,2 y 0,4 Voltios.

    Los anaerobios estrictos necesitan una atmsfera sin oxgeno, deben crecer en medios reductores donde el potencial no sea mayor a -0,2 Voltios.

    Potencial de Oxido-Reduccin

  • Potencial de xido-reduccin o Redox (Eh)

    Respiracin bacteriana : reacciones de xido-reduccin, en cadena

    El aceptor final de electrones o hidrogeniones es variable

    Condiciones atmsfricas

  • Requieren oxgeno, aceptor final de hidrgeno

    Formacin de H2O y CO2

    Produccin de enzima Catalasa : desdoblamiento del Perxido de hidrgeno (H2O2) en H2O y oxgeno

    Prueba de Catalasa para diferenciar microroganismos (Staphylococcus de Streptococcus)

    Aerobios

  • Viven en ausencia de oxgeno atmosfrico

    Aceptor final de hidrgeno : compuesto inorgnico (NO3 o SO4)

    Fermentacin: la fuente de carbono provee energa, el donador de hidrgeno y el aceptor final (un compuesto orgnico como cidos o alcoholes)

    Muy frecuente en microorganismos orales

    Anaerobios

  • Anaerobios obligados: no utilizan O2

    Anaerobios moderados: toleran de un 2 a un 8 % de O2

    Anaerobios aerotolerantes: sobreviven un tiempo en presencia de O2

    Anaerobios facultativos: aceptan indistintintamente una situacin u otra

    Anaerobios

  • Requieren bajas concentraciones de O2 para crecer

    Utilizan el O2 como fuente de energa pero a concentraciones < 15 %

    Susceptibles a radicales superxido

    Enzima Superxido Dismutasa (SOD) : transforma radicales superxido en H2O2

    Capnofilas: desarrollan mejor con concentraciones de CO2 elevadas

    La cavidad oral presenta todas estas variantes

    Las especies capnfilas aumentan en personas con alteraciones periodontales.

    Microaerfilos

  • MTODOS DIRECTOS

    Recuento en cmara

    Determinacin del peso hmedo

    Determinacin del peso seco

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Recuento en cmara

    Es una tcnica comn, rpida y barata que utiliza un equipamiento fcilmente disponible en un laboratorio de microbiologa.

    Para estos recuentos se utilizan generalmente cmaras de recuentos

    Las cmaras ms utilizadas son las de Hawksley y la de Petroff-Hausser.

    La primera tiene la ventaja que puede ser utilizada con objetivos de inmersin, aunque la mayora de los recuentos se realizan con objetivos secos.

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Recuento en cmara

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

    Tipo de cuadro Area [cm2] Volumen [ml] Factor [1/Volumen]

    Cuadrado total 1.00 x 10-2 2.00 x 10-5 5.00 x 104

    Cuadrado grande 4.00 x 10-4 8.00 x 10-7 1.25 x 106

    Cuadrado pequeo 2.50 x 10-5 5.00 x 10-8 2.00 x 107

  • Determinacin del peso hmedo

    Se tara un tubo de centrfuga

    Se centrifuga el cultivo y se elimina el sobrenadante

    se determina el peso del sedimento

    Inconvenientes: Grandes errores, debido al lquido intercelular retenido, cuya cuanta depende a su vez de la forma y tipo de agrupaciones de la cepa, intensidad del empaquetamiento, etc.

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Determinacin del peso seco

    Como el anterior, pero el sedimento se seca antes de ser pesado (105C, toda la noche), hasta peso constante.

    Las medidas de peso seco suelen representar el 10-15% de los valores de peso hmedo.

    Inconvenientes: Mtodo tedioso y con bastantes errores:

    Difcil pesar menos de 1 mg con exactitud.

    1 mg de peso seco equivale a unas 5x109 bacterias.

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Determinacin del peso hmedo y seco

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • MTODOS INDIRECTOS

    Recuento en placa

    Recuento en filtro

    Determinacin del nitrgeno total

    Mtodos turbidimtricos (pticos)

    Espectrofotmetro

    Nefelmetro

    Escala de Mac. Farland

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Recuento en placa

    Los mtodos de recuento directos no distinguen entre clulas vivas y muertas.

    En muchos casos conviene contar las clulas vivas.

    El mtodo habitual de lograr esto es sembrar pequeas alcuotas de diluciones adecuadas de un cultivo original sobre placas de Petri con medio slido.

    Cada clula viable dar origen a una colonia visible despus del tiempo adecuado de incubacin.

    Contando las colonias visibles, teniendo en cuenta la dilucin de la que proceden y el volumen de alcuota utilizado, es fcil deducir el nmero de clulas viables en la suspensin original.

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Recuento en placa

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Recuento en Filtro

    Se usa para suspensiones diluidas de bacterias.

    Se hace pasar un gran volumen de suspensin a travs de una membrana de nitrocelulosa o de nylon estriles.

    Posteriormente, el filtro se deposita sobre la superficie de un medio de cultivo slido.

    Las colonias se forman sobre el filtro a partir de las clulas retenidas.

    Dichas colonias se cuentan, deducindose la concentracin original de viables en funcin del volumen de suspensin que se hizo pasar por el filtro.

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Recuento en Filtro

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Determinacin del nitrgeno total

    Permite determinar indirectamente la masa de una poblacin bacteriana.

    Existen distintas tcnicas para determinar la cantidad de nitrgeno.

    Puede analizarse: El nitrgeno no proteico mediante

    el NO2-, NO3

    -, NH4+

    El nitrgeno proteico mediante absorcin en UV, Reaccin de Biuret, Reaccin de Lowry, o el nitrgeno total mediante Kjeldahl.

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Mtodos turbidimtricos (pticos)

    Muy usados en la prctica cotidiana del laboratorio.

    La base comn de estos mtodos consiste en la medicin de la cantidad de luz dispersada o transmitida a travs de un cultivo bacteriano.

    Recordemos que las suspensiones bacterianas dispersan la luz, al igual que cualquier partcula pequea suspendida en agua (efecto Tyndall).

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Mtodos turbidimtricos (pticos)

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Espectrofotmetro

    Equipo de uso habitual en laboratorio de Microbiologa o Bioqumica.

    Mide la densidad ptica (D.O.).

    Por supuesto, hay que realizar una curva estndar para relacionar los valores de Absorbancia con la masa bacteriana en una muestra problema.

    Comentarios: La proporcionalidad entre Absorbancia y masa bacteriana slo es vlida para >107cls/ml.

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Nefelmetro

    Es un aparato similar al anterior, pero el dispositivo sensor est situado en ngulo recto respecto de la direccin de la luz incidente, y se mide la luz dispersada directamente por la preparacin.

    Posee mayor sensibilidad que el espectrofotmetro.

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Escala de Mac Farland

    Los estndares de turbidez de Mac Farland se usan como referencia para saber el nmero de bacterias por mililitro, segn una escala que va de 0.5 a 10.

    Estos estndares son creados al mezclar soluciones de cloruro de bario al 1% con cido sulfrico al 1% en volmenes especficos.

    Los estndares pueden ser visualmente comparados con suspensiones de bacterias en salina estril o en caldos.

    La desventaja de este mtodo es que no discrimina bacterias vivas o muertas en la solucin, por lo que se puede sobreestimar la poblacin de bacterias.

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

  • Escala de Mac Farland

    Tcnicas para determinar el nmero y viabilidad de las clulas

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