UNIVERSIDAD TECNICA PARTICULAR DE LOJA

GENETICA CLINICA Y PATOLOGIA MOLECULAR

POLIMORFISMOS

un polimorfismo es una variación en la secuencia de un lugar determinado del ADN entre los individuos de una población.

los polimorfismos se distinguen terminológicamente de las mutaciones porsu frecuencia.

Un polimorfismo puede consistir en la sustitución de una simple base nitrogenada(por ejemplo, la sustitución

de una A (adenina) por una C (citosina)

afectan nuestro fenotipo (Estatura: alta/baja; Cabello: claro/oscuro; Color de ojos

Tipos de polimorfismo

Polimorfismos en el número de repetición en tandem VNTR

Polimorfismo de nucleótido simple SNP

Polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción RFLP

POLIMORFISMO DE NUCLEÓTIDO SIMPLE SNP

Los SNP constituyen hasta el 90% de todas las variaciones genómicas humanas, y aparecen cada 1,300 bases , a lo largo del genoma humano

Dos tercios de los SNP corresponden a la sustitución de una citosina (C) por una

timina (T).

Estas variaciones en la secuencia del ADN pueden afectar a la respuesta de los individuos a enfermedades, bacterias, virus, productos químicos, fármacos

Clasificación de los SNPs

Los SNP que tienen implicaciones funcionales sobre los niveles de expresión génica se denominan SNP reguladores (rSNP)

los que alteran la traducción de los ARN mensajeros (ARNm), el corte y empalme, la eficiencia para potenciar o inhibir el corte y empalme, la estabilidad de los ARNm y la función de las proteínas (sin alterar su estructura) se denominan SNP ARN estructurales (srSN

la importancia funcional de los rSNP y srSNP en el desarrollo de enfermedades comunes como hipertensión arterial (HTA), obesidad, artritis reumatoide, enfermedad arterial corona

Algunos SNPs están localizados en zonas que codifican proteínas y otros en zonas no

codificantes.

Los SNPs ofrecen análisis genéticos basados en el análisis de SNPs, que puedan revelar información acerca del riesgo de padecer ciertas enfermedades, como Parkinson,

diabetes, trastorno bipolar, etc

DETECCIÓN

Polimorfismo en la longitud de fragmentos de restricción (SNP-RFLP),

electroforesis en gel para

visualizar fragmentos de

ADN

HPLCPCR

• Electroforesis capilar

• Polimorfismo de conformación de cadena simple.

Existen una gran variedad de métodos analíticos que permiten descubrir nuevos SNP e identificar SNP conocidos en las secuencias de ADN. Entre los

más destacados, podemos encontrar los siguientes

Nomenclatura

Entre la gran variedad de SNP que existen, mostraremos algunos a modo de ejemplo para luego mostrar la asociación entre una patología y numerosos SNPs lo cual nos indica que puede haber multitud de SNPsasociados a una misma enfermedad:

rs6311 y rs6313, SNP

en el gen HTR2A

(receptor de serotonina)

del cromosoma 13 humano

rs3091244 es un ejemplo de SNP trialélicoen el gen CRP(relacionado con procesos

de inflamación) del cromosoma 1 en humanos

Un SNP en el gen F5 es

responsable de un tipo de

trombosis debido a la

presencia del factor V Leiden

El gen TAS2R38determina la

percepción del sabor de la

feniltiocarbamida y tiene

descritos hasta seis SNP

Dentro de diversas patologías ,como es el Cáncer de páncreas, pueden existir numerosos SNPs que se consideran factores de

riesgo para padecer la enfermedad

Rs1561927 en una región no génica entre PVT1 and

LINC00977. Pero su desequilibrio de ligamiento esta

asociado con otro SNPs implicado en

cáncer ovárico

Rs7190458 en el ultimo exón de

BCAR1. La proteinaadaptadora BCAR1

coordina el ciclo celular, organización del citoesqueleto y migración celular.

PCR en tiempo real

Método basado en la aplicación de la técnica dePCR y en la creación de dos sondas alelo específicas, las cuales emiten una señal fluorescente al unirse al templado. Este tipo de análisis es más utilizado hoy en día porque ya existen sondas prediseñadas para un sinnúmero de polimorfismos.

• Bibliografia:

• (bustin SA, 2005; 34: 597-601.10 FOY)Bustin SA, Benes V, Nolan T, Pfaffl MW. Quantitative real-time RT-PCR-a perspective. J Mol Endocrinol. 2005; 34: 597-601.10. Foy