Upload
doannga
View
239
Download
4
Embed Size (px)
Citation preview
GLİKOLİZProf.Dr.İzzetHamdiÖğüş[email protected]
YakınDoğuÜniversitesiTıpFakültesiBiyokimyaAnabilimDalı,LeEoşa,KKTC
• Glikoliz, Yunanca glykys (tatlı, şeker) ve lysis(bölünme, parçalanma) ve sözcüklerindenkaynağınıalır.
• Bir molekül glukoz ardışık 10 enzimaNk tepkimesonundaüçkarbonluikiadetpiruvatadönüşür.
• Glikolizin ardışık tepkimleri sonunda elde edilenserbestenerjiATPveNADPHşeklindesaklanır.
• BuolaydaO2harcanmaz.• Glikoliz birçok memeli dokusunun (eritrositler,böbrek medüllası, beyin ve sperm) tek metabolikenerjikaynağıdır.
Glikoliz
1860 Pasteur FermentasyonàVitalisJkgörüş
1905 ArthurHarden&WilliamYoung GlukozàHeksozdifosfat Zimaz (Diyalizeedilemez,ısıVncaakJvite(-) Kozimaz(Diyalizeedilebilir,ısıVncaakJvite(+)
1828 Wöhler Laboratuvardaüresentezi
1897 Hans&EduardBuchner Sukrozunparçalanması (VitalisJkgörüşünyıkılması) (EduardBuchnerà1907NobelKimyaödülü)
1940 Glikolizbütünbasamaklarıylatanımlandı
Embden–MeyerhofMetabolikYolu
Glikoliz-Tarihçe
GLİKOLİZİNÖZELLİKLERİ
• BütünglikoliNkenzimlersitoplazmadadır.• Glikoliz,enerjikaynağıolanevrenselmetabolikbir
yoldur.• Glukozvepiruvatdışındakibütünarabileşiklerfosforile
durumdadır.• Fosfatgrupları,pH=7.4’teiyonizeve(-)yüklüdür.
• Arabileşiklerdışarıkaçamaz• ADP’denATPoluşmasıiçinkullanılır.• EnzimleriçinbirerkimlikkarXgörevinigörürler,
Substratlardahaiyitanınırlar.• HemenbütünenzimleriçinMg++iyonugereklidir.(Bazı
canlılardabazıenzimlerdeMn++).
Mg++
Mg++ - ATP Kompleksi
Glikoliz10tepkimedenoluşur.Butepkimeleriikigruptatoplayabiliriz.A) AkJvasyonbölümü
• İlk(5)tepkimedeATPenerjisiharcanarakmoleküllerakNveedilir.Buaşamadaenerjieldeedilmez.
• Bubölümdekiikitepkimetersinmezdir.B)Fosforilasyonbölümü
• Dahasonraki(5)tepkimedeATPsenteziiçinkullanılır.
• Bubölümdekisontepkimetersinmezdir.
GLİKOLİZİNÖZELLİKLERİ
FosforilasyonGlukoz
Glukoz-6-fosfat
Fruktoz-6-fosfat
Fruktoz-1,6-difosfat
Dihidroksiasetonfosfat
Gliseraldehit-3-fosfat
2x Gliseraldehit-3-fosfat
2x 1,3-difosfogliserat
2x 3-fosfogliserat
2x 2-fosfogliserat
2x PEP
2x Piruvat
1
2
3
4
5
ATPà
ATPà
ADPà
ADPà
AkNvasyon
ATPàà ADPà à
Piàà 6
7
8
9
10 ATPà àADPà à
Glikolizdeilkenzim:HEKZOKİNAZTersinmezbirtepkimedir.
Glukoz Glukoz-6-fosfat
hekzokinaz
İlkbasamakta,ATPfosforilgrubuvericisiolarakkullanılırveglukozakNveedilir.
#1
ΔGo’=-16.7kJ/mol
Hekzokinaz(HK)• Glukozunglikolizegirmesinikatalizeeder.• Dört izozimi vardır (HK I-IV) ve kas dokusunda ilk üç
izozimbulunur(HKI–III).• Kashekzokinazı(HK-II)glukozayüksekaffinitegösterirve
Kmdeğeri0.1mM’dır.• Kashekzokinazları (HKIve II)G-6-P taragndanallosterik
olarakinhibeedilirler.• KCvekasdokularındakifarklıhekzokinazlarbuorganların
farklı rollerini yansıXr. Kas dokusu enerji üreNmi içinglukozkullanırkenKCkanglukozhomeostazıiçinçalışır.
• Karaciğerdekibaskınhekzokinaz izozimi Np IV’tür.HK-4glukokinazolarakdaadlandırılır.
GlikolizinDüzenlenmesi:HEKZOKİNAZveGLUKOKİNAZ
Glukozderişimi(mM)
Bağılenzim
akJ
vitesi
Glukozderişimi(mM)
HekzokinazI
HekzokinazIV(glukokinaz)
• HekzokinazIV(Glukokinaz)10mMglukozderişimindeyarıdoymuşdurumdadır.
• GlukokinazG-6-Ptaragndaninhibeedilmezkendiğerizozimler(HK1-3)bumolekültaragndaninhibeedilirler.
• Glukokinazhücreçekirdeğindeyerleşikbirdüzenleyiciproteinintersinirolarakbağlanmasıylainhibeedilir.
GlikolizinDüzenlenmesi:HEKZOKİNAZveGLUKOKİNAZ
GKAKTİVİTESİGLUKOZVEF-6-PİLEDENETLENİR
• GlukokinazınçekirdekteregülatörproteinGKRP’yebağlanmasıileenzimakN-vitesitamameninhibeolur.
• KanglukozdüzeyindekiarXş,enziminçekirdektensitoplazmayaçıkmasınıveakNvitesininartmasınısağlar.
• EğerF-6-Pdüzeyiyüksekse,enziminsitoplazmadannükleusataşınmasınıuyarır.
HekzokinazveGlukokinaz
Hekzokinaz GlukokinazKm 10-4M 10-2M
Substratözgüllüğü
• Glukoz• Mannoz• 2-deoksiglukoz• Glukozamin
• Glukoz
G-6-Pileinhibisyon + -
#1
deBruyn-vanEckensteindönüşümü
O=C-H | H-C-OH | OH-C-H |
Glukoz
OH-C-H || H-C-OH | OH-C-H |
enediol
OH-CH2 | C=O | H-C-H |
Fruktoz
O=C-H | OH-C-H | OH-C-H |
Mannoz
# 2
İkincitepkimebirizomerazilebaşarılır.Aldozfosfatketozfosfataçevrilir.Sorumluenzim:
FOSFOHEKSOZİZOMERAZ
ΔGo’=+1.7kJ/mol
Fosfoheksozizomeraz
Glukoz-6-fosfat Fruktoz-6-fosfat
#2
ATP ADP
Fosfofruktokinaz(PFK-I)
Fruktoz-6-fosfat Fruktoz-1,6-difosfat
Tersinmezbirtepkimedir.
Glikolizinenönemlikontrolbasamağıdır.
FOSFOFRUKTOKİNAZ-I(PFK-I)
ΔGo’=-14.2kJ/mol
#3
Mg2+
+ AkNf(tetramer)
İnakNf(dimer)
F-2,6-difosfatADPAMP
ATPSitratUZYA
AseJl-CoA
% V
m
F-6-P
£ATP %
Vm
F-6-P
¤ATP
GlikolizinAllosterikDüzenlenmesi:PFK-I Fosfofruktokinaz-I (PFK-1) : Dört altbirimden oluşur ve heraltbirimin kendi akNf merkezi, akNvatör ve inhibitörler içindüzenleyicibağlanmabölgelerivardır.
% V
m
F-6-P
¤ATP
£ATP % V
m
F-6-P
F-2,6-DP
F-2,6-DP
% V
m
F-6-P
AMP
AMP+ Sitrat
- AMP
FOSFOFRUKTOKİNAZ–KineJközellikleri# 3
ALDOLAZ• Aldolkırılmasıtepkimesinikatalizeeder.• Fruktoz-1,6-difosfat aldolaz tepkimesi ile 3 karbonlu bir
aldozfosfatve3karbonlubirketozfosfatverir
DHAP
GA3PF-1,6-DP
ΔGo’=+23.9kJ/mol
Adolaz
#4
N
H2N
H2O
N
H2O
E
E
E
Schiffbazı
ALDOLAZTEPKİMESİ-Mekanizma#4
FOSFOTRİOZİZOMERAZ• Enediolaracılıdönüşümükatalizeeder.• Dihidroksiasetonfosfa.an(DHAP)gliseraldehit-3-
fosfat(GA3P)oluşur.
Böylece,glikolizinilkyarısında,(1)molglukozdan(2)molGA3Poluşur.
ΔGo’=+7.6kJ/mol
DHAP Enediol GA3P
#5
FosforilasyonGlukoz
Glukoz-6-fosfat
Fruktoz-6-fosfat
Fruktoz-1,6-difosfat
Dihidroksi-asetonfosfat
Gliseraldehit-3-fosfat
2x Gliseraldehit-3-fosfat
2x 1,3-difosfogliserat
2x 3-fosfogliserat
2x 2-fosfogliserat
2x PEP
2x Piruvat
1
2
3
4
5
ATPà
ATPà
ADPà
ADPà
AkNvasyon
ATPàà ADPà à
Piàà 6
7
8
9
10 ATPà àADPà à
GLİSERALDEHİT-3-FOSFATDEHİDROGENAZ#6
GA3PDehidrogenaztepkimesibirçokyöndenönemlidir:1. Enziminhibisyonmekanizmasıanlaşılanilkenzimdir.2. Tepkimeinorganikfosfatdoğrudankullanılır.Dahasonraki
aşamadaATPsentezindekullanılacakXr.3. Substra.an,NADkullanarakelektronlarıalantektepkimedir.4. Tepkimedeyüksekenerjilibirbileşikortayaçıkar
(1,3-difosfogliseratyada3-fosfogliseroilfosfat).
Pi,NAD+ NADH+H+
ΔGo’=+6.3kJ/molGA3P 1,3-DPGA(3-fosfogliseroilfosfat)
Mg2+
≈
GA3PDTEPKİMESİ-Mekanizma
NAD+
ES
GA3PNAD+
ES
e-
S
NAD+
NADH+H+
1,3-DPG
NADH
E
Pi
NAD+
ESH
#6
GA3PDehidrogenaz-İnhibitörler-SH +Hg+ -S-Hg +H+
CivaA)
-SH + ClHg- -COO- -S-Hg- -COO- +Cl-
Para-kloromerküribenzoat(PCMB)B)
#6
-SH + ICH2CONH2-S- +H++l-CH2CONH2
İyodoasetamid C)
İyodoasetatda–SHgrubunasaldıranbirorganikcivabileşiğidir.
D)
H2AsO3-
NAD+
NADH+H+
GA3P 3-Fosfogliseroilarsenat
Hidroliz
Arsenat
O-AsO3H- H2AsO3
-
3-PGA
GA3PD≈
3-PGA
ADP ATP
1,3-DPGA(3-fosfogliseroilfosfat)
FOSFOGLİSERATKİNAZ
ΔGo’=-18.8kJ/mol
Substratdüzeyindefosforilasyon
#7
Mg2+≈
E
O
P
P PP P
E
OH
E
O
P
3-PGA 2,3-DPGA 2-PGA
FOSFOGLİSEROMUTAZ-TepkimeMekanizması#8
• 2,3-Bisfosfogliserat(2,3-BPG)enziminfosforilasyonuiçingereklidir.• 2,3-BPGhücrelerdekataliNkmiktarlardabulunur.• Eritrositlerdeyüksekderişimdebulunur,çünküakciğerlerdendokularak
oksijentaşınmasındaönemlibirroloynarlar.
3-PGA 2-PGA
#9ENOLAZ
Dehidrasyon
H2O
2-PGA PEPΔGo’=+1.7kJ/mol
Mg2+
F-
#10PİRUVATKİNAZ
Substratdüzeyindefosforilasyon
ΔGo’=-31.4kJ/mol
ADP ATP
Mg2+
PEP keto-Piruvatenol-Piruvat
1. Glikolizinsonbasamağı2. Substratdüzeyindefosforilasyon3. Tersinmezliğienfazlaolantepkime
AkNf(tetramer)
İnakNf(dimer)
F-1,6-difosfatAMP
ATPAlanin
PİRUVATKİNAZINALLOSTERİKKONTROLU#10
İzozim
Doku
KineJk
FDPileakJvasyon
ATPileinhibisyon
Hormonalkontrol
(fosforilasyon)
M1 Kas,Beyin,Kalp Michaelis-Menten - + -
M2(K) Böbrek,KC(%50) Kısmensigmoid + + -+
L KC(%50),Alyuvar Sigmoid + + +
+
GLİKOLİZDETEPKİMEMODELLERİ1. Fosforilgrubuaktarımı
Hekzokinaz Fosfofruktokinaz(PFK)
2. Fosforilgrubukaydırma Fosfoglukomutaz
3. İzomerizasyon Fosfoheksozizomeraz Fosfotriozizomeraz
4. Dehidrasyon Enolaz
5. Aldolkırılması Aldolaz
6. Oksidasyon Gliseraldehit-3-fosfatdehidrogenaz
GLİKOLİZDEENERJİBİLANÇOSUTepkime Harcanan Eldeedilen
1 Hekzokinaz 1ATP -2 Fosfoheksozizomeraz - -3 Fosfofruktokinaz(PFK) 1ATP -4 Aldolaz - -5 Fosfotriozizomeraz - -6 Gliseraldehit-3-fosfatdehidrogenaz 2Pi,2NAD+ 2NADH7 Fosfogliseratkinaz 2ADP 2ATP8 Fosfoglukomutaz - -9 Enolaz - -10 Piruvatkinaz 2ADP 2ATP
NetSonuç 2ADP,2Pi2NAD+
2ATP2NADH
GA3PDehidrogenaztepkimesindeoluşanNADH’ınoksideolabilmesiiçincanlılardaçeşitliyollarkullanılır.
PİRUVATINDÖNÜŞÜMYOLLARI
LDHPiruvat+NADH+H+↔Laktat+NAD+
PiruvatdekarboksilazPiruvat→Asetaldehit+CO2AlkoldehidrogenazAsetaldehit+NADH+H+↔Etanol+NAD+
A) Anaerobikkoşullarda 1.LakNkasitoluşumu
2. Etanololuşumu
B) AerobikkoşullardaNADHüzerindekielektronlar,gliserofosfatyadamalat-aspartatmekikleriaracılığıylamitokondriyeaktarılırveNAD+yenidenkazanılır.