Upload
others
View
10
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
jMorp: ⽇本⼈多層オミクス参照パネル田高周、小柴生造、三枝大輔、加藤恭丈、井上仁、元池育子、城田松之、青木裕一、木下賢吾、山本雅之
東北メディカル・メガバンク機構、東北大学大学院医学系研究科、東北大学大学院情報科学研究科
s ⼿法
血液中の代謝物やタンパク質の中には、種類や濃度が個人間で異なるものや、また、個人内においても加齢や疾患の有無で濃度が変化するようなものがある。そのような血液中の化合物は疾患バイオマーカーと呼ばれることがあり、疾患予防や早期診断を行う際に有用な情報源になり得る。東北メディカル・メガバンク機構(ToMMo)では東北メディカル・メガバンク事業における地域住民コホート調査に参加いただいた日本人5093人(男性
2077人、女性5093人)の血漿サンプルの統合解析を行い、日本人集団における血漿中の代謝物の濃度分布やタンパク質の頻度分布を明らかにした。この解析結果はjMorp(JapaneseMultiOmicsReferencePanel;https://jmorp.megabank.tohoku.ac.jp)にて公開している。2017年6月現在では、NMRで同定された37化合物の濃度分布、LC-MSで検出された257代謝物のピーク強度分布、加えて256タンパク質(男性190人,女性 311人)の測定頻度を公開している。今後、解析サンプル数の増加や同定物質の種類を増加することでパネルの精度を目指し、また、ゲノム情報等との関連解析を行うことでデータベースコンテンツの拡充を図る。
Metabolomics東北メディカルメガバンク計画による地域住民コホートの協力者からご提供いただいた日本人1008人の血漿サンプルのメタボローム・プロテーム統
合解析を行った
東北大学東北メディカル・メガバンク機構(ToMMo)は、未来型医療を築いて東日本大震災被災地の復興に取り組むために作られました。バイオバンクを作り、そこへ集まる試料や医療情報とゲノム情報などから遺伝子の研究を発展させ、未来型医療を支える人々を育て、世界にさきがけた新世代の医療を創り出そうとしています。
東北メディカル・メガバンク機構
検体データ
今後の展望
jMorp Webサイト
化合物相関ネットワーク (New)
トップページ 代謝物ページ タンパク質ページ
年齢分布
BMI分布
epidemiologic study Genome Analysis
Omics Analysis
BiomarkerDetection
Gene FunctionAnalysis
Omics Reference Panel
GenomeReference Panel
Health Examination
personalized medicine
GWAS
化合物ID化合物名
カテゴリ
化合物カテゴリ
基本的な統計量
化合物ID
化合物名
実験情報
外部DBリンク
検索バー
外部DBリンク
化合物相関テーブル相関ランクプロット
(全検体, 男性のみ, 女性のみ)
UPLC-QTOF/MS(Synapt G2Si)
LC-FT/MS(QExactive)
Bruker 600 MHz
nanoLC-FT/MS(Orbitrap Fusion)(Orbitrap Elite)
NMR(5093) MassSpectrometry (1312) MassSpectrometry
UPLC-QTOF/MS(Synapt G2Si)
LC-FT/MS(QExactive)Bruker 600 MHz nanoLC-FT/MS(Orbitrap Fusion)
(Orbitrap Elite)
ProteomicsToMMoBiobank・Serum・Plasma・Urine・Mononuclear cell・Buffy Coat
・Serum・Plasma・Urine・Mononuclear cell・DNA
data ItemsBasicinformation
Sex,Age,BMI
NMRmetabolome
37metabolites
MSmetabolome 257metabolites
MSproteome 256 proteins
category informationAllcompounds basicstatistics
metabolites
disgtibution (male,female)
Correlation info.
proteinsdetection ratepeptideinformationwithvariants
2015 2017
2015 2017
Genomics(WGS:5093)
◎ 個別化医療・予防を目指したゲノム情報等との統合解析各代謝物やタンパク質の個人差(体質)に影響を与えている環境・遺伝要因の解析を行う。そして様々な疾患関連(予防)マーカーの確立を目指す。
◎ 解析対象の拡張今後のコホート研究においてオミックス解析を時系列で行うことにより、例えば、服薬状況とその影響や効果を調査する
https://ijgvd.megabank.tohoku.ac.jp
ペプチド情報
検出レート化合物強度分布
(全体・年齢別)
ゲノムワイド関連解析結果 (New)
化合物相関テーブルをネットワークとして可視化するビューワーを実装。血液中の代謝物間の関係性が捉えや
すくなった。
今回新にゲノム上の遺伝子多型との関連を解析するMGWAS解析で、特定の遺伝子の多型との関連が明らかになった代謝物に関して、詳細な関連解析情報を初めて
jMorpで閲覧できるようになった
CompoundA
Ref Homo Hetero
(501)
LicensedunderaCreativeCommons表示4.0国際ライセンス(c) 2017東北メディカル・メガバンク機構