Keberadaan ekosistem terumbu karang menjadi salah satu habitat utama penentu kelangsungan siklus hidup ikan di alam, dimulai dari fase telur, larva, juvenil, sampai dengan ikan dewasa. Larva invertebrata planktonik membutuhkan sustrat yang stabil untuk melakukan penempelan dan akan melekat pada permukaan substrat apabila substrat dan lingkungannya sesuai. Informasi tentang komposisi jenis dan penyebaran larva ikan sangat diperlukan untuk mendukung pemanfaatan sumberdaya perikanan. Tujuan dari penelitian ini untuk mengetahui komposisi jenis dan sebaran larva ikan berdasarkan musim di Kepulauan Karimunjawa. Penelitian dilakukan pada tahun 2012-2013 dengan waktu penelitian pada musim timur, peralihan dan barat di Kawasan Pulau Parang dan Kawasan Pulau Karimunjawa, Kepulauan Karimunjawa. Hasil yang didapatkan selama penelitian menunjukkan bahwa komposisi dan jenis larva ditemukan komposisi dan kelimpahan larva ikan sebanyak 1444 ind/m3 terdiri dari 33 famili, yang didominasi oleh apogonidae, gobiidae, pomacentridae, priacanthidae dan serranidae. Dengan hubungan keeratan dari kemunculan larva berdasarkan musim memperlihatkan adanya dua musim yang memilki kesamaan jenis larva yaitu musim timur dan peralihan, sedangkan musim barat memiliki jumlah jenis larva yang lebih banyak. Famili yang ditemukan pada musim timur dan peralihan adalah chaetodontidae, mullidae, monacantidae dan serranidae. Analisis tingkat kesamaan antar stasiun setiap musimnya menunjukkan kesamaan kelompok stasiun yang memiliki kesamaan jenis setiap musim adalah stasiun Pulau Kembar dan Pulau Nyamuk (Kawasan Pulau Parang), kemudian Pulau Cemara kecil dan Batu Lawang (Kawasan Pulau Karimunjawa) dengan nilai kesamaan > 80 % dari keseluruhan musim.
