Krajowa Sieć Informacji o Bioróżnorodności ksib.pl

Krajowa Sieć Krajowa Sieć InformacjiInformacji

o Bioróżnorodnościo Bioróżnorodnościwww.ksib.edu.plwww.ksib.edu.pl

Piotr TykarskiPiotr TykarskiUniwersytet WarszawskiUniwersytet Warszawski, , Węzeł Główny Węzeł Główny

KSIBKSIB

http://www.ksib.edu.pl/

HistoriaHistoria

• Marzec 2001 Marzec 2001

Podpisanie przez rząd RP Podpisanie przez rząd RP Memorandum of Memorandum of

UnderstandingUnderstanding::

Polska staje się członkiem sieciPolska staje się członkiem sieci

• 20032003Środki finansowe z KBN naŚrodki finansowe z KBN na infrastru infrastrukkturturęę

((główny serwergłówny serwer)) Decyzja w sprawie finansowania sieciDecyzja w sprawie finansowania sieci

• Styczeń Styczeń 20042004

Powstanie Sieci KrajowejPowstanie Sieci Krajowej

GBIF

Global Biodiversity Information Facility

GLOBALBIODIVERSITY

INFORMATIONFACILITY

WWW.GBIF.ORG

The GBIF Information

System

Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat Slajd pochodzi z prezentacji wykonanej przez Sekretariat GBIFGBIF


GBIF objectiveGBIF objective

GBIF is an international scientific co-operative project based on a multilateral agreement (MoU) between countries, economies and international organisations, dedicated to:

establishing an distributed information infrastructure containing primary biodiversity data, with initial focus on species- and specimen-level data, with links to molecular, genetic and ecosystems levels

in order to make the world’s scientific biodiversity information freely and universally available to all



PARTICIPATIONPARTICIPATION

Australia Feb 2001

Belgium Feb 2001 Canada Mar 2001 Costa Rica May

2001

Denmark Jan 2001

Estonia Sep 2003 Finland Apr 2001 France Mar 2001 Germany Feb 2001

Iceland Jun 2001

Japan Feb 2001 Korea,

Republic of May

2001

Mexico Mar 2001 Netherlands Feb 2001 New Zealand Feb

2001

Nicaragua Jun 2001

Norway Mar 2004 Peru Sep 2002 Portugal Jun 2001 Slovenia Feb 2001 South Africa May 2003

Spain Feb 2001 Sweden Feb 2001

United Kingdom Aug 2001

United States of America Jan 2001

Morocco Jun 2003 Pakistan Aug 2001

Papua New Guinea Mar 2004

Poland Mar 2001

Slovak Republic Aug 2001

Switzerland Feb 2001

Taiwan (Economy) Sep 2002

Tanzania Sep 2002

Argentina Mar 2002

Austria Sep 2001 Bulgaria Aug 2001 Colombia Sep

2003

Czech Republic Oct 2002

Ghana Mar 2001 India Aug 2003

Indonesia Nov 2004

Madagascar Jan 2003

Voting Participants Associate Participants: Countries



ASEAN Regional Centre for Biodiversity Conservation Dec 2003

ASEANET Oct 2002

All Species Foundation Mar 2002

BIOSIS Mar 2002

Botanic Gardens Conservation International Aug 2004

CABI Bioscience Sep 2001

EASIANET Oct 2002

European Commission Feb 2001

Expert Center for Taxonomic Identification Mar 2001

Finding Species Dec 2003

Species 2000 Mar 2001

Taxonomic Databases Working Group Mar 2002

UNESCO, Man and the Biosphere Programme May 2001

United Nations Environment Programme May 2001

Wildscreen Trust Jan 2003

World Federation for Culture Collections Oct 2002

Memorandum of Cooperation:•Convention on Biological Diversity (CHM, GTI, GSPC, GISP)

•Catalogue of Life (ITIS, Sp2000)

•uBio?

Freshwater Biological Association - FreshwaterLife Oct 2003

IUCN Sep 2003

Integrated Taxonomic Information System Mar

2001

International Centre for Insect Physiology and Ecology Mar 2004

Nordic Gene Bank Mar 2004

Ocean Biogeographic Information System Jun

2001

Pacific Biodiversity Information ForumSep 2004

SAFRINET Aug 2003

Société de Bactériologie Systématique et Vétérinaire Dec 2002

Associate Participants: Organizations

PARTICIPATIONPARTICIPATION



GBIF as a global inte-grator

GBIF as a global inte-grator



Data ProvidersData ProvidersData ProvidersData ProvidersSpecimens:Flowering Plants of

Africa

Specimens:Proteaceae of the World

Taxon Names:

Proteaceae of the World

Museum A

Specimens:Mammals of

North Europe

Taxon Names:

Mammals of the World

Further Links:

MammalsMuseum C

Specimens:Bacteria Cultures

Taxon Names:Bacteria

Further Links:

BacteriaUniversity D

Observations:

Birds of Central

America

Observations:

Butterflies of Belize

Observations: Erinaceus of Europe

Observer Network B

GBIF Data Providers install web GBIF Data Providers install web servicesservicesGBIF Data Providers install web GBIF Data Providers install web servicesservices


GBIFNetwork


GBIF deals with 1 biodiversity data

GBIF deals with 1 biodiversity data

Family: Pyralidae

Order: Lepidoptera

Class: Insecta

Genus: Ostrinia Hübner, 1825

Vernacular (FR): Pyrale du maïs

Vernacular (ES): Piral del maíz

Vernacular (DE): Maiszünsler

Vernacular (EN): European Corn-borer

Collection: DGH LepidopteraRecord id: DGHEUR_003217Country: FranceCoordinates: 03.047˚E 48.730˚NDate: 28 June 2003Collector: Donald Hobern

Specimen & Observation Data

DIGIT + DADI

Taxonomic NamesECAT + DADI

Species: Ostrinia nubilalis (Hübner, 1796)

Synonym: Pyralis nubilalis Hübner, 1796

oo

Foodplant: Zea mais L. 1753

Ecological Interactions

Locus: AAL35331Definition: acyl-CoA Z/E11 desaturase

1 mvpyattadg hpekdecfed...

Sequence Data

Average RainfallLocation: 48.82°N 2.29°E Jan Feb Mar Apr ...182.3 120.6 158.1 204.9 ...

Abiotic Data

Diagnosis: Wingspan 26-30mm; sexually dimorphic;male: forewings ochreous to dark brown; female: forewings pale yellow; …

Taxonomic Descriptions

Pheromones of Ostriniahttp://www.nysaes.cornell.edu/fst/faculty/acree/pheronet/phlist/ostrinia.html

Digital Literature and Web Resources



Users and applications need data structured according to standards

Users and applications need data structured according to standards<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><response>

<record><darwin:DateLastModified>2003-06-08</darwin:DateLastModified><darwin:InstitutionCode>DGH</darwin:InstitutionCode><darwin:CollectionCode>DGH Lepidoptera</darwin:CollectionCode><darwin:CatalogNumber>DGHEUR_0002976</darwin:CatalogNumber><darwin:ScientificName>Dichomeris marginella (Fabricius, 1781)</darwin:ScientificName><darwin:BasisOfRecord>O</darwin:BasisOfRecord><darwin:Kingdom>Animalia</darwin:Kingdom><darwin:Order>Lepidoptera</darwin:Order><darwin:Family>Gelechiidae</darwin:Family><darwin:Genus>Dichomeris</darwin:Genus><darwin:Species>marginella</darwin:Species><darwin:ScientificNameAuthor>(Fabricius, 1781)</darwin:ScientificNameAuthor><darwin:IdentifiedBy>Donald Hobern</darwin:IdentifiedBy><darwin:Collector>Donald Hobern</darwin:Collector><darwin:YearCollected>2003</darwin:YearCollected><darwin:MonthCollected>06</darwin:MonthCollected><darwin:DayCollected>08</darwin:DayCollected><darwin:ContinentOcean>Europe</darwin:ContinentOcean><darwin:Country>Denmark</darwin:Country><darwin:County>Gentofte Amt</darwin:County><darwin:Locality>Merianvej, Hellerup</darwin:Locality><darwin:Longitude>12.538</darwin:Longitude><darwin:Latitude>55.737</darwin:Latitude><darwin:CoordinatePrecision>100</darwin:CoordinatePrecision><darwin:IndividualCount>1</darwin:IndividualCount><darwin:Notes>1 in Skinner trap</darwin:Notes>

</record></response>

June 2003 S M T W T F S 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 1415 16 17 18 19 20 2122 23 24 25 26 27 2829 30

Observation record formatted using the Darwin Core



Web services enable the aggregation of structured data

Web services enable the aggregation of structured data

HeterogeneouHeterogeneous s DatabasesDatabases

Web Web ServicServic

eses

StandardisStandardiseded

Structured Structured DataData

UserUser

<response> <record> …



<request>

<request>

<request>



GBIF node responsibilitiesGBIF node responsibilities

GBIFRegistry,

Index, andPortal

Data Node

ParticipantNodePortal

1. Network2. Registry3. Standards4. Tools

1. Encourage participation2. Manage registration of Data Nodes

1. Coordination2. Network3. Registry4. Standards5. Tools6. Consolidated Data

1. Metadata2. Data

1. Identify Data Nodes2. Endorse and quality assure

data nodes3. National Language

Interfaces


Zasady działania Sieci Zasady działania Sieci KrajowejKrajowej

• Ścisła współpraca z siecią GBIFŚcisła współpraca z siecią GBIF• Struktura otwartaStruktura otwarta• Członkowie - Członkowie - 9 9 instytucjiinstytucji• Koordynator Sieci Krajowej: Koordynator Sieci Krajowej:

Wydział Biologii UWWydział Biologii UW - Węzeł Krajowy GBIF- Węzeł Krajowy GBIF• Węzły DanychWęzły Danych - - 6 6 aktywnychaktywnych

– ok. 68ok. 68000 re000 rekkordordówów

• Typy danych:Typy danych:– I: rozmieszczenie gatunkówI: rozmieszczenie gatunków

(wystąpienie w przestrzeni i w czasie: okaz/obserwacja)(wystąpienie w przestrzeni i w czasie: okaz/obserwacja)– II: dane z kolekcji szczepów, kultur, banków nasion etc.II: dane z kolekcji szczepów, kultur, banków nasion etc.

Uczestnicy SieciUczestnicy Sieci

okazyokazy obserwacjeobserwacje mikrobiol.mikrobiol.

Instytut Biochemii i BiofizykiInstytut Biochemii i Biofizyki xx

Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Instytut Hodowli i Aklimatyzacji

RoślinRoślinxx

Instytut Nauk o Środowisku UJInstytut Nauk o Środowisku UJ xx

Instytut Ochrony Przyrody PANInstytut Ochrony Przyrody PAN xx

Instytut Zoologii UJInstytut Zoologii UJ xx xx

Muzeum i Instytut Zoologii PANMuzeum i Instytut Zoologii PAN xx xx

Ogród Botaniczny UWOgród Botaniczny UW xx

Wydział Biologii UWWydział Biologii UW xx xx xx

Zakład Badania Ssaków PANZakład Badania Ssaków PAN xx xx

Plany rozwoju SieciPlany rozwoju Sieci

• Zwiększenie liczby rekordów (Zwiększenie liczby rekordów (250000 250000 ww 2005 2005 r.) r.)

• Przyłączanie nowych uczestnikówPrzyłączanie nowych uczestników

• Digitalizacja informacji o bioróżnorodnościDigitalizacja informacji o bioróżnorodności

• StandarStandaryzacja: ustalenie wspólnych standardów yzacja: ustalenie wspólnych standardów wymiany i organizacji danych wymiany i organizacji danych

• Współpraca z innymi instytucjami i strukturami Współpraca z innymi instytucjami i strukturami związanymi z tematyką bioróżnorodności w związanymi z tematyką bioróżnorodności w PolscePolsce

• Utworzenie wewnętrznego systemu wymiany Utworzenie wewnętrznego systemu wymiany informacjiinformacji

Zadania koordynatoraZadania koordynatora

• Utworzenie i uzupełnianie rejestru instytucji Utworzenie i uzupełnianie rejestru instytucji posiadających wartościowe daneposiadających wartościowe dane

• Poszukiwanie potencjalnych uczestnikówPoszukiwanie potencjalnych uczestników• Kontakt z siecią GBIFKontakt z siecią GBIF• KKoordoordyynanacjacja: : bazy referencyjne dot. taksonomii bazy referencyjne dot. taksonomii

i i GISGIS dla uczestników Sieci dla uczestników Sieci• Rozwijanie funkcji węzła danychRozwijanie funkcji węzła danych

– możliwość udostępniania serwera na potrzeby innych członków siecimożliwość udostępniania serwera na potrzeby innych członków sieci

• Szkolenia i wsparcie techniczne dla członkówSzkolenia i wsparcie techniczne dla członków

• Działania integracyjneDziałania integracyjne– wspólne projekty badawcze i aplikacyjnewspólne projekty badawcze i aplikacyjne– utworzenie wewnętrznego systemu wymiany informacji dla utworzenie wewnętrznego systemu wymiany informacji dla

członków Sieciczłonków Sieci

• Zdobywanie środków na działanie SieciZdobywanie środków na działanie Sieci– wniosek na lata 2005-2008wniosek na lata 2005-2008

Dlaczego warto być w Dlaczego warto być w SieciSieci

• Możliwość prezentacji własnego dorobku w Możliwość prezentacji własnego dorobku w sieci światowejsieci światowej

• Dostęp do danych udostępnionych wewnątrz Dostęp do danych udostępnionych wewnątrz Sieci KrajowejSieci Krajowej

• Dostęp do nowoczesnych technologii Dostęp do nowoczesnych technologii zarządzania i wymiany informacjizarządzania i wymiany informacji

• Możliwość uczestniczenia w projektach Możliwość uczestniczenia w projektach naukowych opartych o dane udostępnione w naukowych opartych o dane udostępnione w Sieci KrajowejSieci Krajowej

Documents

Krajowa Sieć Informacji o Bioróżnorodności ksib.pl